<?php
/**
* PHP Version 5
*
* @category  PHP
* @package   jrest
* @author    David Delon <david@tela-botania.org>
* @author    Aurélien Peronnet <aurelien@tela-botania.org>
* @copyright 2010 Tela-Botanica
* @license   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
* @version   SVN: <svn_id>
* @link      /doc/jrest/
*/

/**
 * 
 * Classe de recherche d'informations sur un taxon donné
 * lors de l'évolution d'eflore, devrait être remplacée par 
 * un appel aux nouveaux web services
 */
class RechercheInfosTaxon extends Cel {
	
	public function RechercheInfosTaxon($config) {
		
		parent::__construct($config);	
		// Connection à la base de données spécifique eflore
		$this->bdd = $this->connecterPDO($this->config, 'eflore');	
	}
	
	public function rechercherGenreEspeceSurPrefixe($genre = null, $espece = null) {
		
		$liste_genre_espece = array();	
		
		$requete_recherche = '';
		// Genre et Espece 
		if ($espece != null && $genre != null) {	
            if (strlen($espece) > 0 ) {
				$espece=preg_replace('/\*+/','%',$espece);
    	       	$requete_recherche = "SELECT DISTINCT en_nom_genre, en_epithete_espece, en_nom_supra_generique, en_epithete_infra_generique,". 
    	       			"   auteur_bex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio_ex ".
    	       			" , auteur_b.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio ".
    	       			" , auteur_mex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif_ex ".
    	       			" , auteur_m.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif ".
    	       			" , en_epithete_espece, en_epithete_infra_specifique, enrg_abreviation_rang, en_id_nom, esn_ce_statut" .
    	       			" FROM eflore_nom, eflore_nom_rang, " .
    	       			"  	  eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_bex ".
    	       			"   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_b ".
    	       			"   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_mex ".
    	       			"   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_m ".
    	       	     	"   , eflore_selection_nom".
    	       			" WHERE en_id_version_projet_nom = '25' AND en_nom_genre LIKE ".Cel::db()->proteger($genre.'%').
    	       			" AND en_ce_rang > 160 " .
    	       			" AND en_epithete_espece like ".Cel::db()->proteger($espece.'%')." AND en_ce_rang = enrg_id_rang " .
    	       			" AND en_ce_auteur_basio_ex = auteur_bex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
    	       			" AND en_ce_auteur_basio = auteur_b.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege  ".
    	       			" AND en_ce_auteur_modif_ex = auteur_mex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ". 
    	       			" AND en_ce_auteur_modif = auteur_m.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
    	       			" AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom " . 
    	       			" AND esn_id_nom= en_id_nom ".
    	       			" ORDER BY esn_ce_statut, en_ce_rang, en_epithete_espece, en_nom_genre LIMIT 50";
            }
		}
		else {
			if ($genre != null) {
				$genre=preg_replace('/\*+/','%',$genre);
				//TODO: comprendre pourquoi à l'origine il y avait : (strlen($genre) >= 1) /*&& ($genre != '%')
				// voir avec david
	            if ((strlen($genre) >= 1)) {
				    $requete_recherche = "SELECT DISTINCT en_nom_genre, en_id_nom, 0 as esn_ce_statut FROM  eflore_nom WHERE en_id_version_projet_nom = '25'" .
				    "AND en_ce_rang = 160 " .
				    "AND en_nom_genre LIKE ".Cel::db()->proteger($genre.'%')." ORDER BY esn_ce_statut, en_nom_genre LIMIT 50";
	            }
			}
		}
		
        if ($requete_recherche != '') {
        	$resultat_recherche = Cel::db()->executerRequete($requete_recherche);	
        	
        	if (is_array($resultat_recherche)) {
        		foreach ($resultat_recherche as $ligne) {
        			$liste_genre_espece[] = array($this->formaterNom($ligne),
        										$ligne['en_id_nom'], 
        										$ligne['esn_ce_statut']
        									);
        		}
        	}	
        }
		    
		return $liste_genre_espece;
	}

	function rechercherInformationsComplementairesSurNumNom($numNom) {

		$resultat_infos_complementaires = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom);

		// Nom retenu, Num Nomen nom retenu, Num Taxon, Famille
		$value=array('Nom_Retenu'=>"",'Num_Nom_Retenu'=>"0",'Num_Taxon'=>"0",'Famille'=>"");
        if (is_array($resultat_infos_complementaires)) {
		    foreach ($resultat_infos_complementaires as $row) {
		        	$fam=$this->rechercherFamille($row['esn_id_taxon']);
	        	while (($fam['en_ce_rang']!='fin') && ($fam['en_ce_rang'] !=120)) {
		        	$fam=$this->rechercherFamille($fam['etr_id_taxon_2']);
	        	}
	        	if ($fam['en_ce_rang']==120) {
	        		$famille=$fam['en_nom_supra_generique'];
	        	}
	        	else {
	        		$famille="Famille inconnue";
	        	}
	        	$value=array('Nom_Retenu'=>$this->formaterNom($row),'Num_Nom_Retenu'=>$row['esn_id_nom'],'Num_Taxon'=>$row['esn_id_taxon'],'Famille'=>$famille);
		    }
        }

	    return $value;

	}
	
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesEtFormaterNom($numNom) {
		
		$resultat_infos_complementaires = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom);
		
		$retour_infos_complementaires = array();
		foreach ($resultat_infos_complementaires as $info) {
           $retour_infos_complementaires=array(($this->formaterNom($info)));
	    }
		
		return $retour_infos_complementaires;
	}
	
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom) {
				
		$requete_infos_complementaires = "SELECT DISTINCT en_nom_genre, en_epithete_espece, en_nom_supra_generique, en_epithete_infra_generique,".
			     	       			"   auteur_bex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio_ex ".
        	       			" , auteur_b.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio ".
        	       			" , auteur_mex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif_ex ".
        	       			" , auteur_m.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif ".
			     " , en_epithete_espece, en_epithete_infra_specifique, enrg_abreviation_rang, b.esn_id_taxon, b.esn_id_nom" .
			     " FROM eflore_nom, eflore_nom_rang," .
			       			"  	  eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_bex ".
        	       			"   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_b ".
        	       			"   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_mex ".
        	       			"   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_m ".
			     " ,eflore_selection_nom a, eflore_selection_nom b".
			     " WHERE a.esn_id_nom= ".Cel::db()->proteger($numNom).
			     " AND a.esn_id_version_projet_taxon = 25 ".
			     " AND a.esn_id_taxon=b.esn_id_taxon ".
			     " AND b.esn_ce_statut=3 ".
			     " AND a.esn_id_version_projet_taxon=b.esn_id_version_projet_taxon" .
			     " AND en_ce_rang = enrg_id_rang" .
			     " AND en_id_nom = b.esn_id_nom" .
			     " AND en_ce_auteur_basio_ex = auteur_bex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
       			 " AND en_ce_auteur_basio = auteur_b.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege  ".
       			 " AND en_ce_auteur_modif_ex = auteur_mex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
        	     " AND en_ce_auteur_modif = auteur_m.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
			     " AND a.esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom ";

		
		$resultat_infos_complementaires = Cel::db()->executerRequete($requete_infos_complementaires);
		return $resultat_infos_complementaires;
	}
	
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumTax($numTax) {
		
		$requete_infos_complementaires = "SELECT DISTINCT en_nom_genre, en_epithete_espece, en_nom_supra_generique, en_epithete_infra_generique,".
                    "   auteur_bex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio_ex ".
                    " , auteur_b.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio ".
                    " , auteur_mex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif_ex ".
                    " , auteur_m.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif ".
                    " , en_epithete_espece, en_epithete_infra_specifique, enrg_abreviation_rang, en_id_nom" .
                    " FROM eflore_nom, eflore_nom_rang," .
                    "     eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_bex ".
                    "   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_b ".
                    "   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_mex ".
                    "   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_m ".
                    " , eflore_selection_nom ".
                    " WHERE esn_id_taxon = '".$numTax. "'".
                    " AND esn_id_version_projet_taxon = 25 ".
                    " AND esn_ce_statut=3 ".
                    " AND en_id_nom = esn_id_nom" .
                    " AND en_ce_rang = enrg_id_rang" .
                    " AND en_ce_auteur_basio_ex = auteur_bex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
                    " AND en_ce_auteur_basio = auteur_b.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege  ".
                    " AND en_ce_auteur_modif_ex = auteur_mex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
                    " AND en_ce_auteur_modif = auteur_m.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
                    " AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom ";
		
		$resultat_infos_complementaires = Cel::db()->executerRequete($requete_infos_complementaires);
		
		return $resultat_infos_complementaires;
	}
	
	public function rechercherInformationsComplementairesSurNom($nom_saisi) {
				
		$value = array();
		
		if ($nom_saisi != null && $nom_saisi != "") { 
		
			$requete_infos_comp_sur_nom = 'SELECT * FROM eflore_nom_intitule '.
			'WHERE eni_id_categorie_format = 3 AND '.
			'eni_id_version_projet_nom = 25 AND '.
			'(eni_id_valeur_format = 3 OR eni_id_valeur_format = 4) AND '.
			'eni_intitule_nom LIKE "'.$nom_saisi.'%" '.
			'ORDER BY LENGTH(eni_intitule_nom)';
			
			$resultat_infos_comp_sur_nom = Cel::db()->executerRequete($requete_infos_comp_sur_nom);
			    
	        if (is_array($resultat_infos_comp_sur_nom)) {        	
		        foreach ($resultat_infos_comp_sur_nom as $ligne) {
		        	$value[]=array($ligne['eni_id_nom'], $ligne['eni_intitule_nom']); 	    
		        }
	        }
		}
	                
		return $value;
	}

	public function rechercherFamille($taxon) {
	
		$row = array();
	
		$requete_famille = "SELECT DISTINCT en_ce_rang, etr_id_taxon_2, en_id_nom, en_nom_supra_generique ".
		" FROM eflore_taxon_relation, ".
		" eflore_selection_nom, ".
		" eflore_nom ".
		" WHERE etr_id_taxon_1 = ".$taxon.
		" AND etr_id_version_projet_taxon_1 = 25 ".
		" AND etr_id_categorie_taxon = 3 ".
		" AND etr_id_valeur_taxon = 3 ".
		" AND esn_id_taxon =  etr_id_taxon_2 ".
		" AND esn_ce_statut = 3 ".
		" AND esn_id_version_projet_taxon = etr_id_version_projet_taxon_1 ".
		" AND en_id_nom = esn_id_nom ".
		" AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom  ";
				
		$resultat_recherche_famille = Cel::db()->executerRequete($requete_famille);
		
		if (!is_array($resultat_recherche_famille) || count($resultat_recherche_famille) == 0) {	
	    	$resultat_recherche_famille = array('en_ce_rang' => 'fin');
	    } else {
	    	$resultat_recherche_famille = $resultat_recherche_famille[0];
	    }
	
		return $resultat_recherche_famille;
	}
	
	public function rechercherNumTaxSurNumNom($num_nom) {
		
		$requete_num_tax = "SELECT DISTINCT b.esn_id_taxon FROM eflore_nom, eflore_nom_rang," .
		" eflore_selection_nom a, eflore_selection_nom b".
		" WHERE a.esn_id_nom= ".Cel::db()->proteger($num_nom). 
		" AND a.esn_id_version_projet_taxon = 25 ".
		" AND a.esn_id_taxon=b.esn_id_taxon ".
		" AND b.esn_ce_statut=3 ".
		" AND a.esn_id_version_projet_taxon=b.esn_id_version_projet_taxon" .
		" AND en_ce_rang = enrg_id_rang" .
		" AND en_id_nom = b.esn_id_nom" .
		" AND a.esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom ";
	     
	    $res_num_nom = Cel::db()->executerRequete($requete_num_tax);
		
		$nt = null;	    
		if (is_array($res_num_nom) && count($res_num_nom) > 0) {
			$nt=$res_num_nom[0]['esn_id_taxon'];
		}
		
		return $nt;
	}
	
	public function taxonEstPresentDansDepartement($num_taxon,$code_departement) {
		
		$requete_presence_taxon = "SELECT ecd_ce_taxon FROM eflore_zg, eflore_chorologie_donnee ".
								  "WHERE ecd_ce_taxon = ".Cel::db()->proteger($num_taxon)." ".
								  "AND ezg_code = ".Cel::db()->proteger($code_departement)." ".
								  "AND ecd_ce_zone_geo = ezg_id_zone_geo ". 
								  "AND ezg_id_projet_zg = ecd_ce_version_projet_zg ".
								  "AND ecd_ce_version_projet_taxon=25";	
								  
		$resultat_presence_taxon = Cel::db()->executerRequete($requete_presence_taxon);
		
		$presence_taxon = (is_array($resultat_presence_taxon) && count($resultat_presence_taxon) > 0);
		
		return $presence_taxon;
	}
	
	private function decouperNomEtRechercheEspeceOuSousEspece($identifiant_espece) {
		$nameparser=new NameParser();
		$nom_latin_decoupe=$nameparser->parse($identifiant_espece);
		// requete sous espece (on privilegie les noms retenu cf tri par esn_ce_statut)
		if (isset($nom_latin_decoupe['infra']) && $nom_latin_decoupe['infra']!="") {
			$requete="SELECT DISTINCT en_id_nom, esn_ce_statut" .
            	" FROM eflore_nom, eflore_nom_rang, eflore_selection_nom " .
            	" WHERE en_id_version_projet_nom = '25' AND en_nom_genre = ".Cel::db()->proteger($nom_latin_decoupe['genus'])." " .
                " AND enrg_abreviation_rang = ".Cel::db()->proteger($nom_latin_decoupe['infra_type'])." " .
                " AND en_epithete_infra_specifique = ".Cel::db()->proteger($nom_latin_decoupe['infra'])." " .
                " AND esn_id_nom= en_id_nom ".
                " AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom " .
                " AND en_epithete_espece =  ".Cel::db()->proteger($nom_latin_decoupe['species'])." AND en_ce_rang = enrg_id_rang " .
                " ORDER BY esn_ce_statut ".
                " LIMIT 1";
		}
		else { // espece  (on privilegie les noms retenu cf tri par esn_ce_statut)
			$requete="SELECT DISTINCT en_id_nom, esn_ce_statut" .
				" FROM eflore_nom, eflore_nom_rang, eflore_selection_nom " .
				" WHERE en_id_version_projet_nom = '25' AND en_nom_genre = ".Cel::db()->proteger($nom_latin_decoupe['genus'])." " .
				" AND enrg_abreviation_rang = 'sp.' " .
				" AND esn_id_nom= en_id_nom ".
				" AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom " .
				" AND en_epithete_espece =  ".Cel::db()->proteger($nom_latin_decoupe['species'])." AND en_ce_rang = enrg_id_rang " .
				" ORDER BY esn_ce_statut ".
				" LIMIT 1";
		
		}
		
		$resultat = Cel::db()->executerRequete($requete);
		
		$retour = array();
		if (is_array($resultat) && count($resultat) > 0) {
			$retour = $resultat[0];
		}
		
		return $retour;
	}
	
	private function formaterNom($rawnom) {

        // Constitution du nom:
        $nom = '';

        if (isset($rawnom['en_nom_supra_generique']) && $rawnom['en_nom_supra_generique'] != '') {
            $nom .= $rawnom['en_nom_supra_generique'];
        } else if (isset($rawnom['en_epithete_infra_generique']) && $rawnom['en_epithete_infra_generique'] != '') {
            $nom .= $rawnom['en_epithete_infra_generique'];
        } else {
            if (isset($rawnom['en_nom_genre']) &&  $rawnom['en_nom_genre'] != '') {
                $nom .=  $rawnom['en_nom_genre'];
            }
            if (isset($rawnom['en_epithete_espece']) &&  $rawnom['en_epithete_espece']!= '') {
                $nom .= ' '.$rawnom['en_epithete_espece'];
            }
            if (isset($rawnom['en_epithete_infra_specifique']) &&  $rawnom['en_epithete_infra_specifique'] != '') {
                if (!empty($rawnom['enrg_abreviation_rang'])) {
                        $nom .= ' '.$rawnom['enrg_abreviation_rang'].'';
                }
                $nom .= ' '.$rawnom['en_epithete_infra_specifique'];
            }
        }

        return $nom.$this->retournerAuteur($rawnom) ;
 	}

	private function retournerAuteur($rawnom) {
		$auteurs = '';
		$auteur_basio = '';
		$auteur_modif = '';
		if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_basio_ex']) && $rawnom['abreviation_auteur_basio_ex']!='-' )  {
		    $auteur_basio .= $rawnom['abreviation_auteur_basio_ex'];
		    if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_basio']) && $rawnom['abreviation_auteur_basio']!='-') {
		        $auteur_basio .= ' ex '.$rawnom['abreviation_auteur_basio'];
		    }
		} else if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_basio']) && $rawnom['abreviation_auteur_basio']!='-') {
		    $auteur_basio .= $rawnom['abreviation_auteur_basio'];
		}

		if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_modif_ex']) && $rawnom['abreviation_auteur_modif_ex']!='-') {
		    $auteur_modif .= $rawnom['abreviation_auteur_modif_ex'];
		    if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_modif']) && $rawnom['abreviation_auteur_modif']!='-') {
		        $auteur_modif .= ' ex '.$rawnom['abreviation_auteur_modif'];
		    }
		} else if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_modif']) && $rawnom['abreviation_auteur_modif']!='-')  {
		    $auteur_modif .= $rawnom['abreviation_auteur_modif'];
		}

		if (!empty($auteur_modif)) {
		    $auteurs = ' ('.$auteur_basio.') '.$auteur_modif;
		} elseif (!empty($auteur_basio)) {
		    $auteurs = ' '.$auteur_basio;
		}

		return $auteurs ;
	}
	
	function rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax($identifiant_espece) {
		// texte libre, nom scientifique, 
		// ou code nomenclatural (format BDNFFnn999999) 
		// ou code taxonomique (format BDNFFnt999999)
		$identifiant_espece=trim($identifiant_espece);
		$identifiant_espece=utf8_encode($identifiant_espece);
	
		$retour = array();
		
		preg_match('/BDNFFnn([0-9][0-9]*)/',$identifiant_espece, $elements);
		if (isset($elements[1])) {
			// Numero nomenclatural
			$infos_taxon = $this->rechercherInformationsComplementairesSurNumNom($elements[1]);
			$retour = array("nom_sel" => $this->formaterNom($infos_taxon), "en_id_nom" => $elements[1]);
		} else { 
			//  Numero taxonomique ou nom scientifique
			preg_match('/BDNFFnt([0-9][0-9]*)/', $identifiant_espece, $elements);
	
			if (isset($elements[1])) {
				// Numero taxonomique
				$infos_taxon = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumTax($elements[1]);
				$infos_taxon = $infos_taxon[0];
				$retour = array("nom_sel" => $this->formaterNom($infos_taxon), "en_id_nom" => $infos_taxon['en_id_nom']);
			} else { 
				// Nom scientifique
				$id_nom = $this->decouperNomEtRechercheEspeceOuSousEspece($identifiant_espece);	
				// Recherche du nom associe
				$retour = array("nom_sel" => $identifiant_espece);
				if(is_array($id_nom) && isset($id_nom['en_id_nom'])) {
					$infos_nom = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($id_nom['en_id_nom']);
					if (is_array($infos_nom) && !empty($infos_nom)) {
						$infos_nom = $infos_nom[0];
						$retour = array("nom_sel" => $this->formaterNom($infos_nom), "en_id_nom" => $id_nom['en_id_nom']);
					}
				}
			}
		}
		
		return $retour;
	}
}
?>