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Rev Author Line No. Line
1636 raphael 1 
<?php
2 
/**
3 
* @category  PHP
4 
* @package   jrest
5 
* @author    Raphaël Droz <raphael@tela-botania.org>
6 
* @copyright 2013 Tela-Botanica
7 
* @license   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
8 
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
9 
*/
10 
 
11 
/**
12 
 * Service d'import de données d'observation du CEL au format XLS
1649 raphael 13 
 *
14 
 * Sont define()'d commme n° de colonne tous les abbrevs retournés par
1656 raphael 15 
 * FormateurGroupeColonne::nomEnsembleVersListeColonnes() préfixés par C_  cf: detectionEntete()
1649 raphael 16 
 *
17 
 * Exemple d'un test:
18 
 * $ GET "/jrest/ExportXLS/22506?format=csv&range=*&limite=13" \
19 
 *   | curl -F "upload=@-" -F utilisateur=22506 "/jrest/ImportXLS"
20 
 * # 13 observations importées
21 
 * + cf MySQL general_log = 1
22 
 *
23 
 **/
1636 raphael 24 
 
25 
set_include_path(get_include_path() . PATH_SEPARATOR . dirname(dirname(realpath(__FILE__))) . '/lib');
26 
// TERM
27 
error_reporting(-1);
28 
ini_set('html_errors', 0);
29 
ini_set('xdebug.cli_color', 2);
30 
require_once('lib/PHPExcel/Classes/PHPExcel.php');
1656 raphael 31 
require_once('FormateurGroupeColonne.php');
1636 raphael 32 
 
1640 raphael 33 
 
34 
date_default_timezone_set("Europe/Paris");
35 
 
36 
// nombre d'INSERT à cumuler par requête SQL
37 
// (= nombre de lignes XLS à bufferiser)
1648 raphael 38 
//define('NB_LIRE_LIGNE_SIMUL', 30);
39 
define('NB_LIRE_LIGNE_SIMUL', 5);
1640 raphael 40 
 
41 
// Numbers of days between January 1, 1900 and 1970 (including 19 leap years)
42 
// see traiterDateObs()
1675 raphael 43 
// define("MIN_DATES_DIFF", 25569);
1640 raphael 44 
 
45 
 
1636 raphael 46 
class MyReadFilter implements PHPExcel_Reader_IReadFilter {
1640 raphael 47 
	// exclusion de colonnes
1638 raphael 48 
	public $exclues = array();
1640 raphael 49 
 
50 
	// lecture par morceaux
51 
    public $ligne_debut = 0;
52 
    public $ligne_fin = 0;
53 
 
1636 raphael 54 
	public function __construct() {}
1640 raphael 55 
	public function def_interval($debut, $nb) {
56 
		$this->ligne_debut = $debut;
57 
		$this->ligne_fin = $debut + $nb;
58 
	}
1638 raphael 59 
    public function readCell($colonne, $ligne, $worksheetName = '') {
60 
		if(@$this->exclues[$colonne]) return false;
1640 raphael 61 
		// si des n° de morceaux ont été initialisés, on filtre...
62 
		if($this->ligne_debut && ($ligne < $this->ligne_debut || $ligne >= $this->ligne_fin)) return false;
1636 raphael 63 
		return true;
64 
    }
65 
}
66 
 
1675 raphael 67 
// XXX: PHP 5.3
68 
function __anonyme_1($v) {	return !$v['importable']; }
69 
function __anonyme_2(&$v) {	$v = $v['nom']; }
70 
function __anonyme_3($cell) { return !is_null($cell); };
71 
function __anonyme_5($item) { return is_null($item) ? '?' : $item; }
72 
function __anonyme_6() { return NULL; }
73 
 
1636 raphael 74 
class ImportXLS extends Cel  {
1765 raphael 75 
	static function __anonyme_4(&$item, $key) { $item = self::quoteNonNull(trim($item)); }
1636 raphael 76 
 
77 
	static $ordre_BDD = Array(
78 
		"ce_utilisateur",
79 
		"prenom_utilisateur",
80 
		"nom_utilisateur",
81 
		"courriel_utilisateur",
82 
		"ordre",
83 
		"nom_sel",
84 
		"nom_sel_nn",
85 
		"nom_ret",
86 
		"nom_ret_nn",
87 
		"nt",
88 
		"famille",
89 
		"nom_referentiel",
90 
		"zone_geo",
91 
		"ce_zone_geo",
92 
		"date_observation",
93 
		"lieudit",
94 
		"station",
95 
		"milieu",
1649 raphael 96 
		"mots_cles_texte",
1636 raphael 97 
		"commentaire",
98 
		"transmission",
99 
		"date_creation",
100 
		"date_modification",
1649 raphael 101 
		"date_transmission",
1636 raphael 102 
		"latitude",
1648 raphael 103 
		"longitude",
1699 raphael 104 
		"altitude",
1649 raphael 105 
		"abondance",
106 
		"certitude",
1648 raphael 107 
		"phenologie",
108 
		"code_insee_calcule"
109 
	);
1636 raphael 110 
 
1649 raphael 111 
	// cf: initialiser_pdo_ordered_statements()
1648 raphael 112 
	// eg: "INSERT INTO cel_obs (ce_utilisateur, ..., phenologie, code_insee_calcule) VALUES"
113 
	// colonnes statiques d'abord, les autres ensuite, dans l'ordre de $ordre_BDD
114 
	static $insert_prefix_ordre;
115 
	// eg: "(<id>, <prenom>, <nom>, <email>, now(), now(), ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?)"
116 
	// dont le nombre de placeholder dépend du nombre de colonnes non-statiques
117 
	// colonnes statiques d'abord, les autres ensuite, dans l'ordre de $ordre_BDD
118 
	static $insert_ligne_pattern_ordre;
119 
 
1649 raphael 120 
	// seconde (meilleure) possibilité
121 
	// cf: initialiser_pdo_statements()
122 
	// eg: "INSERT INTO cel_obs (ce_utilisateur, ..., date_creation, ...phenologie, code_insee_calcule) VALUES"
123 
	static $insert_prefix;
1648 raphael 124 
	// eg: "(<id>, <prenom>, <nom>, <email>, ?, ?, ?, now(), now(), ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?)"
125 
	// dont le nombre de placeholder dépend du nombre de colonnes non-statiques
126 
	static $insert_ligne_pattern;
127 
 
1640 raphael 128 
	/*
129 
	  Ces colonnes:
1642 raphael 130 
	  - sont propres à l'ensemble des enregistrements uploadés
1640 raphael 131 
	  - sont indépendantes du numéro de lignes
132 
	  - n'ont pas de valeur par défaut dans la structure de la table
133 
	  - nécessitent une initialisation dans le cadre de l'upload
1649 raphael 134 
 
135 
	  initialiser_colonnes_statiques() y merge les données d'identification utilisateur
1640 raphael 136 
	*/
137 
	public $colonnes_statiques = Array(
138 
		"ce_utilisateur" => NULL,
139 
		"prenom_utilisateur" => NULL,
140 
		"nom_utilisateur" => NULL,
141 
		"courriel_utilisateur" => NULL,
142 
 
1642 raphael 143 
		// fixes (fonction SQL)
144 
		// XXX future: mais pourraient varier dans le futur si la mise-à-jour
1640 raphael 145 
		// d'observation est implémentée
1642 raphael 146 
		"date_creation" => "now()",
147 
		"date_modification" => "now()",
1640 raphael 148 
	);
149 
 
1642 raphael 150 
	public $id_utilisateur = NULL;
1649 raphael 151 
 
1642 raphael 152 
	// erreurs d'import
153 
	public $bilan = Array();
154 
 
1649 raphael 155 
 
1732 raphael 156 
	function ImportXLS($config) {
1636 raphael 157 
		parent::__construct($config);
158 
	}
159 
 
160 
	function createElement($pairs) {
161 
		if(!isset($pairs['utilisateur']) || trim($pairs['utilisateur']) == '') {
1770 raphael 162 
			exit('0');
1636 raphael 163 
		}
1649 raphael 164 
 
1640 raphael 165 
		$id_utilisateur = intval($pairs['utilisateur']);
1642 raphael 166 
		$this->id_utilisateur = $id_utilisateur; // pour traiterImage();
1640 raphael 167 
 
1636 raphael 168 
		if(!isset($_SESSION)) session_start();
1640 raphael 169 
        $this->controleUtilisateur($id_utilisateur);
1636 raphael 170 
 
1640 raphael 171 
        $this->utilisateur = $this->getInfosComplementairesUtilisateur($id_utilisateur);
1649 raphael 172 
 
1640 raphael 173 
		$this->initialiser_colonnes_statiques($id_utilisateur);
1636 raphael 174 
 
1648 raphael 175 
		// initialisation du statement PDO/MySQL
1649 raphael 176 
		// première version, pattern de requête pas génial
177 
		/* list(self;;$insert_prefix_ordre, self::$insert_ligne_pattern_ordre) =
178 
		   $this->initialiser_pdo_ordered_statements($this->colonnes_statiques); */
179 
		list(self::$insert_prefix, self::$insert_ligne_pattern) =
180 
			$this->initialiser_pdo_statements($this->colonnes_statiques);
1640 raphael 181 
 
1636 raphael 182 
		$infos_fichier = array_pop($_FILES);
183 
 
184 
		/*$objPHPExcel = PHPExcel_IOFactory::load($infos_fichier['tmp_name']);
1638 raphael 185 
		  $donnees = $objPHPExcel->getActiveSheet()->toArray(NULL,FALSE,FALSE,TRUE);*/
1636 raphael 186 
 
187 
		/*$objReader = PHPExcel_IOFactory::createReader("Excel5");
188 
		$objReader->setReadDataOnly(true);
189 
		$objPHPExcel = $objReader->load($infos_fichier['tmp_name']);*/
190 
 
1638 raphael 191 
		//var_dump($donnees);
1636 raphael 192 
 
1642 raphael 193 
		// renomme le fichier pour lui ajouter son extension initiale, ce qui
194 
		// permet (une sorte) d'autodétection du format.
195 
		$fichier = $infos_fichier['tmp_name'];
196 
		$extension = pathinfo($infos_fichier['name'], PATHINFO_EXTENSION);
197 
		if( (strlen($extension) == 3 || strlen($extension) == 4) &&
1747 raphael 198 
			(@rename($fichier, $fichier . '.' . $extension))) { // XXX: @ safe-mode
1642 raphael 199 
			$fichier = $fichier . '.' . $extension;
200 
		}
201 
 
202 
		$objReader = PHPExcel_IOFactory::createReaderForFile($fichier);
1818 raphael 203 
		// TODO: check if compatible with toArray(<1>,<2>,TRUE,<4>)
1636 raphael 204 
		$objReader->setReadDataOnly(true);
1640 raphael 205 
 
1698 raphael 206 
		// TODO: is_a obsolete entre 5.0 et 5.3, retirer le @ à terme
207 
		if(@is_a($objReader, 'PHPExcel_Reader_CSV')) {
1642 raphael 208 
			$objReader->setDelimiter(',')
209 
				->setEnclosure('"')
210 
				->setLineEnding("\n")
211 
				->setSheetIndex(0);
212 
		}
213 
 
1640 raphael 214 
		// on ne conserve que l'en-tête
215 
		$filtre = new MyReadFilter();
216 
		$filtre->def_interval(1, 2);
217 
		$objReader->setReadFilter($filtre);
218 
 
1642 raphael 219 
		$objPHPExcel = $objReader->load($fichier);
220 
		$obj_infos = $objReader->listWorksheetInfo($fichier);
1640 raphael 221 
		// XXX: indépendant du readFilter ?
222 
		$nb_lignes = $obj_infos[0]['totalRows'];
1636 raphael 223 
 
1818 raphael 224 
		$donnees = $objPHPExcel->getActiveSheet()->toArray(NULL, FALSE, TRUE, TRUE);
1640 raphael 225 
		$filtre->exclues = self::detectionEntete($donnees[1]);
1636 raphael 226 
 
1640 raphael 227 
		$obs_ajouts = 0;
228 
		$obs_maj = 0;
1677 raphael 229 
		$nb_images_ajoutees = 0;
230 
		$nb_mots_cle_ajoutes = 0;
231 
 
1765 raphael 232 
		$dernier_ordre = Cel::db()->requeter("SELECT MAX(ordre) AS ordre FROM cel_obs WHERE ce_utilisateur = $id_utilisateur");
1640 raphael 233 
		$dernier_ordre = intval($dernier_ordre[0]['ordre']) + 1;
234 
		if(! $dernier_ordre) $dernier_ordre = 0;
235 
 
1642 raphael 236 
		// on catch to les trigger_error(E_USER_NOTICE);
237 
		set_error_handler(array($this, 'erreurs_stock'), E_USER_NOTICE);
238 
 
1640 raphael 239 
		// lecture par morceaux (chunks), NB_LIRE_LIGNE_SIMUL lignes à fois
240 
		// pour aboutir des requêtes SQL d'insert groupés.
241 
		for($ligne = 2; $ligne < $nb_lignes + NB_LIRE_LIGNE_SIMUL; $ligne += NB_LIRE_LIGNE_SIMUL) {
242 
			$filtre->def_interval($ligne, NB_LIRE_LIGNE_SIMUL);
243 
			$objReader->setReadFilter($filtre);
244 
 
245 
			/* recharge avec $filtre actif (filtre sur lignes colonnes):
246 
			   - exclue les colonnes inutiles/inutilisables)
247 
			   - ne selectionne que les lignes dans le range [$ligne - $ligne + NB_LIRE_LIGNE_SIMUL] */
1818 raphael 248 
			$objPHPExcel = $objReader->load($fichier)->getActiveSheet();
1640 raphael 249 
 
1818 raphael 250 
			// set col typing
251 
			if(C_CE_ZONE_GEO != 'C_CE_ZONE_GEO')
252 
				$objPHPExcel->getStyle(C_CE_ZONE_GEO . '2:' . C_CE_ZONE_GEO . $objPHPExcel->getHighestRow())->getNumberFormat()->setFormatCode('00000');
253 
 
254 
			// TODO: set to string type
255 
			if(C_ZONE_GEO != 'C_ZONE_GEO')
256 
				$objPHPExcel->getStyle(C_ZONE_GEO . '2:' . C_ZONE_GEO . $objPHPExcel->getHighestRow())->getNumberFormat()->setFormatCode('00000');
257 
 
258 
			$donnees = $objPHPExcel->toArray(NULL, FALSE, TRUE, TRUE);
259 
 
1640 raphael 260 
			// ici on appel la fonction qui fera effectivement l'insertion multiple
261 
			// à partir des (au plus) NB_LIRE_LIGNE_SIMUL lignes
262 
 
1677 raphael 263 
			// TODO: passer $this, ne sert que pour appeler des méthodes publiques qui pourraient être statiques
1640 raphael 264 
			// notamment dans RechercheInfosTaxonBeta.php
1677 raphael 265 
			list($enregistrements, $images, $mots_cle) =
1642 raphael 266 
				self::chargerLignes($this, $donnees, $this->colonnes_statiques, $dernier_ordre);
267 
			if(! $enregistrements) break;
268 
 
1648 raphael 269 
			self::trierColonnes($enregistrements);
270 
			// normalement: NB_LIRE_LIGNE_SIMUL, sauf si une enregistrement ne semble pas valide
271 
			// ou bien lors du dernier chunk
272 
 
273 
			$nb_rec = count($enregistrements);
274 
			$sql_pattern = self::$insert_prefix .
275 
				str_repeat(self::$insert_ligne_pattern_ordre . ', ', $nb_rec - 1) .
276 
				self::$insert_ligne_pattern_ordre;
277 
 
278 
			$sql_pattern = self::$insert_prefix .
279 
				str_repeat(self::$insert_ligne_pattern . ', ', $nb_rec - 1) .
280 
				self::$insert_ligne_pattern;
281 
 
1765 raphael 282 
			Cel::db()->beginTransaction();
283 
			$stmt = Cel::db()->prepare($sql_pattern);
1648 raphael 284 
			$donnees = array();
285 
			foreach($enregistrements as $e) $donnees = array_merge($donnees, array_values($e));
286 
 
1678 raphael 287 
			/* debug ici: echo $sql_pattern . "\n"; var_dump($enregistrements, $donnees); die;*/
1648 raphael 288 
 
289 
			$stmt->execute($donnees);
290 
 
291 
			// $stmt->debugDumpParams(); // https://bugs.php.net/bug.php?id=52384
1765 raphael 292 
			$dernier_autoinc = Cel::db()->lastInsertId();
293 
			Cel::db()->commit();
1648 raphael 294 
 
1650 raphael 295 
			if(! $dernier_autoinc) trigger_error("l'insertion semble avoir échoué", E_USER_NOTICE);
1648 raphael 296 
 
1642 raphael 297 
			$obs_ajouts += count($enregistrements);
1648 raphael 298 
			// $obs_ajouts += count($enregistrements['insert']);
299 
			// $obs_maj += count($enregistrements['update']);
1765 raphael 300 
			$nb_images_ajoutees += self::stockerImages($enregistrements, $images, $dernier_autoinc);
301 
			$nb_mots_cle_ajoutes += self::stockerMotsCle($enregistrements, $mots_cle, $dernier_autoinc);
1640 raphael 302 
		}
1642 raphael 303 
 
304 
		restore_error_handler();
305 
 
306 
		if($this->bilan) echo implode("\n", $this->bilan) . "\n";
1792 raphael 307 
 		printf('%1$d observation%2$s ajoutée%2$s' . "\n" .
308 
			   '%3$d image%4$s attachée%4$s' . "\n" .
1781 raphael 309 
			   // '%5$d mot%6$c-clef ajouté%6$c [TODO]' . "\n" . // TODO
1792 raphael 310 
			   (count($filtre->exclues) > 0 ? 'colonne%7$s non-traitée%7$s: %8$s' . "\n" : ''),
311 
 
1781 raphael 312 
			   $obs_ajouts,
1812 raphael 313 
			   $obs_ajouts > 1 ? 's' : '',
1781 raphael 314 
			   $nb_images_ajoutees,
1812 raphael 315 
			   $nb_images_ajoutees > 1 ? 's' : '',
1781 raphael 316 
			   $nb_mots_cle_ajoutes,
1812 raphael 317 
			   $nb_mots_cle_ajoutes > 1 ? 's' : '',
1792 raphael 318 
			   count($filtre->exclues) > 1 ? 's' : '',
1781 raphael 319 
			   implode(', ', $filtre->exclues));
320 
		die();
1636 raphael 321 
	}
322 
 
323 
	static function detectionEntete($entete) {
324 
		$colonnes_reconnues = Array();
1678 raphael 325 
		$cols = FormateurGroupeColonne::nomEnsembleVersListeColonnes('standard,avance');
1636 raphael 326 
		foreach($entete as $k => $v) {
1781 raphael 327 
			// traite les colonnes en faisant fi de la casse et des accents
1636 raphael 328 
			$entete_simple = iconv('UTF-8', 'ASCII//TRANSLIT', strtolower(trim($v)));
329 
			foreach($cols as $col) {
330 
				$entete_officiel_simple = iconv('UTF-8', 'ASCII//TRANSLIT', strtolower(trim($col['nom'])));
1638 raphael 331 
				$entete_officiel_abbrev = $col['abbrev'];
332 
				if($entete_simple == $entete_officiel_simple || $entete_simple == $entete_officiel_abbrev) {
1648 raphael 333 
					// debug echo "define C_" . strtoupper($entete_officiel_abbrev) . ", $k ($v)\n";
1638 raphael 334 
					define("C_" . strtoupper($entete_officiel_abbrev), $k);
1636 raphael 335 
					$colonnes_reconnues[$k] = 1;
336 
					break;
337 
				}
338 
			}
339 
		}
1770 raphael 340 
		// défini tous les index que nous utilisons à une valeur d'index de colonne Excel qui n'existe pas dans
341 
		// le tableau renvoyé par PHPExcel
342 
		// Attention cependant d'utiliser des indexes différenciés car traiterLonLat() et traiterEspece()
343 
		// les utilisent
344 
		foreach($cols as $col) {
345 
			if(!defined("C_" . strtoupper($col['abbrev'])))
346 
				define("C_" . strtoupper($col['abbrev']), "C_" . strtoupper($col['abbrev']));
347 
		}
1636 raphael 348 
 
1640 raphael 349 
		// prépare le filtre de PHPExcel qui évitera le traitement de toutes les colonnes superflues
350 
 
351 
		// eg: diff ( Array( H => Commune, I => rien ) , Array( H => 1, K => 1 )
352 
		// ==> Array( I => rien )
1636 raphael 353 
		$colonnesID_non_reconnues = array_diff_key($entete, $colonnes_reconnues);
354 
 
1656 raphael 355 
		// des colonnes de FormateurGroupeColonne::nomEnsembleVersListeColonnes()
1640 raphael 356 
		// ne retient que celles marquées "importables"
1675 raphael 357 
		$colonnes_automatiques = array_filter($cols, '__anonyme_1');
1640 raphael 358 
 
1636 raphael 359 
		// ne conserve que le nom long pour matcher avec la ligne XLS d'entête
1675 raphael 360 
		array_walk($colonnes_automatiques, '__anonyme_2');
1640 raphael 361 
 
362 
		// intersect ( Array ( N => Milieu, S => Ordre ), Array ( ordre => Ordre, phenologie => Phénologie ) )
363 
		// ==> Array ( S => Ordre, AA => Phénologie )
1636 raphael 364 
		$colonnesID_a_exclure = array_intersect($entete, $colonnes_automatiques);
365 
 
1640 raphael 366 
		// TODO: pourquoi ne pas comparer avec les abbrevs aussi ?
367 
		// merge ( Array( I => rien ) , Array ( S => Ordre, AA => Phénologie ) )
368 
		// ==> Array ( I => rien, AA => Phénologie )
1636 raphael 369 
		return array_merge($colonnesID_non_reconnues, $colonnesID_a_exclure);
370 
	}
371 
 
1640 raphael 372 
	/*
373 
	 * charge un groupe de lignes
374 
	 */
1642 raphael 375 
	static function chargerLignes($cel, $lignes, $colonnes_statiques, &$dernier_ordre) {
1640 raphael 376 
		$enregistrement = NULL;
377 
		$enregistrements = Array();
1642 raphael 378 
		$toutes_images = Array();
1678 raphael 379 
		$tous_mots_cle = Array();
1640 raphael 380 
 
381 
		foreach($lignes as $ligne) {
1642 raphael 382 
			//$ligne = array_filter($ligne, function($cell) { return !is_null($cell); });
383 
			//if(!$ligne) continue;
384 
			// on a besoin des NULL pour éviter des notice d'index indéfini
1675 raphael 385 
			if(! array_filter($ligne, '__anonyme_3')) continue;
1640 raphael 386 
 
1642 raphael 387 
			if( ($enregistrement = self::chargerLigne($ligne, $dernier_ordre, $cel)) ) {
1648 raphael 388 
				// $enregistrements[] = array_merge($colonnes_statiques, $enregistrement);
389 
				$enregistrements[] = $enregistrement;
1677 raphael 390 
				$pos = count($enregistrements) - 1;
391 
				$last = &$enregistrements[$pos];
1640 raphael 392 
 
393 
				if(isset($enregistrement['_images'])) {
394 
					// ne dépend pas de cel_obs, et seront insérées *après* les enregistrements
395 
					// mais nous ne voulons pas nous priver de faire des INSERT multiples pour autant
1642 raphael 396 
					$toutes_images[] = Array("images" => $last['_images'],
397 
											 "obs_pos" => $pos);
1677 raphael 398 
					// ce champ n'a pas à faire partie de l'insertion dans cel_obs,
1640 raphael 399 
					// mais est utile pour cel_obs_images
1642 raphael 400 
					unset($last['_images']);
1640 raphael 401 
				}
402 
 
1677 raphael 403 
				if(isset($enregistrement['_mots_cle'])) {
404 
					// ne dépend pas de cel_obs, et seront insérés *après* les enregistrements
405 
					// mais nous ne voulons pas nous priver de faire des INSERT multiples pour autant
406 
					$tous_mots_cle[] = Array("mots_cle" => $last['_mots_cle'],
407 
											 "obs_pos" => $pos);
408 
					// la version inlinée des mots est enregistrées dans cel_obs
409 
					// mais cel_mots_cles_obs fait foi.
410 
					// XXX: postponer l'ajout de ces informations dans cel_obs *après* l'insertion effective
411 
					// des records dans cel_mots_cles_obs ?
412 
					unset($last['_mots_cle']);
413 
				}
414 
 
1640 raphael 415 
				$dernier_ordre++;
416 
			}
1636 raphael 417 
		}
1640 raphael 418 
 
1642 raphael 419 
		// XXX future: return Array($enregistrements_a_inserer, $enregistrements_a_MAJ, $toutes_images);
1677 raphael 420 
		return Array($enregistrements, $toutes_images, $tous_mots_cle);
1642 raphael 421 
	}
1640 raphael 422 
 
1642 raphael 423 
 
1648 raphael 424 
	static function trierColonnes(&$enregistrements) {
425 
		foreach($enregistrements as &$enregistrement) {
1642 raphael 426 
			$enregistrement = self::sortArrayByArray($enregistrement, self::$ordre_BDD);
1648 raphael 427 
			//array_walk($enregistrement, function(&$item, $k) { $item = is_null($item) ? "NULL" : $item; });
428 
			//$req .= implode(', ', $enregistrement) . "\n";
1642 raphael 429 
		}
430 
	}
431 
 
432 
 
1765 raphael 433 
	static function stockerMotsCle($enregistrements, $tous_mots_cle, $lastid) {
1678 raphael 434 
		$c = 0;
435 
		// debug: var_dump($tous_mots_cle);die;
436 
		foreach($tous_mots_cle as $v) $c += count($v['mots_cle']['to_insert']);
437 
		return $c;
1677 raphael 438 
	}
439 
 
1765 raphael 440 
	static function stockerImages($enregistrements, $toutes_images, $lastid) {
1650 raphael 441 
		$images_insert = 'INSERT INTO cel_obs_images (id_image, id_observation) VALUES %s ON DUPLICATE KEY UPDATE id_image = id_image';
1642 raphael 442 
		$images_obs_assoc = Array();
443 
 
444 
		foreach($toutes_images as $images_pour_obs) {
445 
			$obs = $enregistrements[$images_pour_obs["obs_pos"]];
1640 raphael 446 
			$id_obs = $lastid // dernier autoinc inséré
1650 raphael 447 
				- count($enregistrements) + 1 // correspondrait au premier autoinc
448 
				+ $images_pour_obs["obs_pos"]; // ordre d'insertion = ordre dans le tableau $enregistrements (commence à 0)
1642 raphael 449 
			foreach($images_pour_obs['images'] as $image) {
450 
				$images_obs_assoc[] = sprintf('(%d,%d)',
451 
											  $image['id_image'], // intval() useless
452 
											  $id_obs); // intval() useless
453 
			}
1640 raphael 454 
		}
1642 raphael 455 
 
456 
		if($images_obs_assoc) {
457 
			$requete = sprintf($images_insert, implode(', ', $images_obs_assoc));
1650 raphael 458 
			// debug echo "$requete\n";
1765 raphael 459 
			Cel::db()->requeter($requete);
1642 raphael 460 
		}
1650 raphael 461 
 
462 
		return count($images_obs_assoc);
1636 raphael 463 
	}
464 
 
1649 raphael 465 
	/*
466 
	  Aucune des valeurs présentes dans $enregistrement n'est quotée
467 
	  cad aucune des valeurs retournée par traiter{Espece|Localisation}()
468 
	  car ce tableau est passé à un PDO::preparedStatement() qui applique
469 
	  proprement les règle d'échappement.
470 
	 */
1642 raphael 471 
	static function chargerLigne($ligne, $dernier_ordre, $cel) {
1770 raphael 472 
		// évite des notices d'index lors des trigger_error()
473 
		$ref_ligne = !empty($ligne[C_NOM_SEL]) ? trim($ligne[C_NOM_SEL]) : '';
474 
 
1636 raphael 475 
		// en premier car le résultat est utile pour
1751 raphael 476 
		// * traiter espèce (traiterEspece())
477 
		// * traiter longitude et latitude (traiterLonLat())
1770 raphael 478 
		$referentiel = self::identReferentiel(trim(strtolower(@$ligne[C_NOM_REFERENTIEL])), $ligne, $ref_ligne);
1636 raphael 479 
 
1640 raphael 480 
		// $espece est rempli de plusieurs informations
1642 raphael 481 
		$espece = Array(C_NOM_SEL => NULL, C_NOM_SEL_NN => NULL, C_NOM_RET => NULL,
482 
						C_NOM_RET_NN => NULL, C_NT => NULL, C_FAMILLE => NULL);
1751 raphael 483 
		self::traiterEspece($ligne, $espece, $referentiel, $cel);
1636 raphael 484 
 
1642 raphael 485 
		// $localisation est rempli à partir de plusieurs champs: C_ZONE_GEO et C_CE_ZONE_GEO
486 
		$localisation = Array(C_ZONE_GEO => NULL, C_CE_ZONE_GEO => NULL);
1765 raphael 487 
		self::traiterLocalisation($ligne, $localisation);
1636 raphael 488 
 
1649 raphael 489 
		// $transmission est utilisé pour date_transmission
1675 raphael 490 
		// XXX: @ contre "Undefined index"
491 
		@$transmission = in_array(strtolower(trim($ligne[C_TRANSMISSION])), array(1, 'oui')) ? 1 : 0;
1649 raphael 492 
 
493 
 
1642 raphael 494 
		// Dans ce tableau, seules devraient apparaître les données variable pour chaque ligne.
495 
		// Dans ce tableau, l'ordre des clefs n'importe pas (cf: self::sortArrayByArray())
496 
		$enregistrement = Array(
497 
			"ordre" => $dernier_ordre,
1640 raphael 498 
 
1642 raphael 499 
			"nom_sel" => $espece[C_NOM_SEL],
500 
			"nom_sel_nn" => $espece[C_NOM_SEL_NN],
501 
			"nom_ret" => $espece[C_NOM_RET],
502 
			"nom_ret_nn" => $espece[C_NOM_RET_NN],
503 
			"nt" => $espece[C_NT],
504 
			"famille" => $espece[C_FAMILLE],
1640 raphael 505 
 
1649 raphael 506 
			"nom_referentiel" => $referentiel,
1640 raphael 507 
 
1642 raphael 508 
			"zone_geo" => $localisation[C_ZONE_GEO],
509 
			"ce_zone_geo" => $localisation[C_CE_ZONE_GEO],
1640 raphael 510 
 
1642 raphael 511 
			// $ligne: uniquement pour les infos en cas de gestion d'erreurs (date incompréhensible)
1770 raphael 512 
			"date_observation" => isset($ligne[C_DATE_OBSERVATION]) ? self::traiterDateObs($ligne[C_DATE_OBSERVATION], $ref_ligne) : NULL,
1640 raphael 513 
 
1747 raphael 514 
			"lieudit" => isset($ligne[C_LIEUDIT]) ? trim($ligne[C_LIEUDIT]) : NULL,
515 
			"station" => isset($ligne[C_STATION]) ? trim($ligne[C_STATION]) : NULL,
516 
			"milieu" => isset($ligne[C_MILIEU]) ? trim($ligne[C_MILIEU]) : NULL,
1642 raphael 517 
 
1649 raphael 518 
			"mots_cles_texte" => NULL, // TODO: foreign-key
1675 raphael 519 
			// XXX: @ contre "Undefined index"
1747 raphael 520 
			"commentaire" => isset($ligne[C_COMMENTAIRE]) ? trim($ligne[C_COMMENTAIRE]) : NULL,
1642 raphael 521 
 
1649 raphael 522 
			"transmission" => $transmission,
523 
			"date_transmission" => $transmission ? date("Y-m-d H:i:s") : NULL, // pas de fonction SQL dans un PDO statement, <=> now()
1642 raphael 524 
 
525 
			// $ligne: uniquement pour les infos en cas de gestion d'erreurs (lon/lat incompréhensible)
1770 raphael 526 
			"latitude" => isset($ligne[C_LATITUDE]) ? self::traiterLonLat(NULL, $ligne[C_LATITUDE], $referentiel, $ref_ligne) : NULL,
527 
			"longitude" => isset($ligne[C_LONGITUDE]) ? self::traiterLonLat($ligne[C_LONGITUDE], NULL, $referentiel, $ref_ligne) : NULL,
1747 raphael 528 
			"altitude" => isset($ligne[C_ALTITUDE]) ? intval($ligne[C_ALTITUDE]) : NULL, // TODO: guess alt from lon/lat
1648 raphael 529 
 
530 
			// @ car potentiellement optionnelles ou toutes vides => pas d'index dans PHPExcel (tableau optimisé)
531 
			"abondance" => @$ligne[C_ABONDANCE],
532 
			"certitude" => @$ligne[C_CERTITUDE],
533 
			"phenologie" => @$ligne[C_PHENOLOGIE],
534 
 
1649 raphael 535 
			"code_insee_calcule" => substr($localisation[C_CE_ZONE_GEO], -5) // varchar(5)
1642 raphael 536 
		);
537 
 
538 
		// passage de $enregistrement par référence, ainsi ['_images'] n'est défini
539 
		// que si des résultats sont trouvés
540 
		// "@" car PHPExcel supprime les colonnes null sur toute la feuille (ou tout le chunk)
1765 raphael 541 
		if(@$ligne[C_IMAGES]) self::traiterImage($ligne[C_IMAGES], $cel->id_utilisateur, $enregistrement);
1642 raphael 542 
 
1765 raphael 543 
		if(@$ligne[C_MOTS_CLES_TEXTE]) self::traiterMotsCle($ligne[C_MOTS_CLES_TEXTE], $cel->id_utilisateur, $enregistrement);
1677 raphael 544 
 
1642 raphael 545 
		return $enregistrement;
1636 raphael 546 
	}
547 
 
1765 raphael 548 
	static function traiterImage($str, $id_utilisateur, &$enregistrement) {
1642 raphael 549 
		$liste_images = array_filter(explode("/", $str));
1675 raphael 550 
 
1765 raphael 551 
		//array_walk($liste_images, '__anonyme_4');
552 
		array_walk($liste_images, array(__CLASS__, '__anonyme_4'));
1642 raphael 553 
		$requete = sprintf(
1756 raphael 554 
			"SELECT id_image, nom_original FROM cel_images WHERE ce_utilisateur = %d AND nom_original IN (%s)",
1765 raphael 555 
			$id_utilisateur,
1756 raphael 556 
			implode(',', $liste_images));
1640 raphael 557 
 
1765 raphael 558 
		$resultat = Cel::db()->requeter($requete);
1640 raphael 559 
 
1642 raphael 560 
		if($resultat) $enregistrement['_images'] = $resultat;
561 
	}
562 
 
1765 raphael 563 
	static function traiterMotsCle($str, $id_utilisateur, &$enregistrement) {
1678 raphael 564 
		$liste_mots_cle = $liste_mots_cle_recherche = array_map("trim", array_unique(array_filter(explode(",", $str))));
1765 raphael 565 
		array_walk($liste_mots_cle_recherche, array(__CLASS__, '__anonyme_4'));
1678 raphael 566 
 
1677 raphael 567 
		// TODO!!!! remplace > (pour les tests uniquement) par un = et supprimer le group by mot_cle
568 
		$requete = sprintf("SELECT id_mot_cle_obs, mot_cle FROM cel_mots_cles_obs WHERE id_utilisateur > %d ".
1678 raphael 569 
						   "AND mot_cle IN (%s) ".
1677 raphael 570 
						   "GROUP BY mot_cle",
1765 raphael 571 
						   $id_utilisateur,
1678 raphael 572 
						   implode(',', $liste_mots_cle_recherche));
1642 raphael 573 
 
1765 raphael 574 
		$resultat_sql = Cel::db()->requeter($requete);
1677 raphael 575 
		if(!$resultat_sql) return;
576 
 
577 
		$resultat = array();
578 
		foreach($resultat_sql as $v) $resultat[$v['id_mot_cle_obs']] = $v['mot_cle'];
579 
 
1678 raphael 580 
		$enregistrement['mots_cles_texte'] = implode(',', $liste_mots_cle);
581 
		$enregistrement['_mots_cle'] = array("existing" => $resultat,
582 
											 "to_insert" => array_diff($liste_mots_cle, $resultat));
1677 raphael 583 
	}
584 
 
585 
 
1640 raphael 586 
	/* FONCTIONS de TRANSFORMATION de VALEUR DE CELLULE */
587 
 
588 
	// TODO: PHP 5.3, utiliser date_parse_from_format()
589 
	// TODO: parser les heures (cf product-owner)
590 
	// TODO: passer par le timestamp pour s'assurer de la validité
1770 raphael 591 
	static function traiterDateObs($date, $ref_ligne) {
1640 raphael 592 
		// TODO: see https://github.com/PHPOffice/PHPExcel/issues/208
1818 raphael 593 
		// TODO: PHPExcel_Shared_Date::ExcelToPHP()
1640 raphael 594 
		if(is_double($date)) {
595 
			if($date > 0)
596 
				return PHPExcel_Style_NumberFormat::toFormattedString($date, PHPExcel_Style_NumberFormat::FORMAT_DATE_YYYYMMDD2) . " 00:00:00";
1770 raphael 597 
			trigger_error("ligne \"{$ref_ligne}\": " .
1642 raphael 598 
						  "Attention: date antérieure à 1970 et format de cellule \"DATE\" utilisés ensemble",
599 
						  E_USER_NOTICE);
1770 raphael 600 
 
1642 raphael 601 
			// throw new Exception("erreur: date antérieure à 1970 et format de cellule \"DATE\" utilisés ensemble");
1640 raphael 602 
 
603 
			// attention, UNIX timestamp, car Excel les décompte depuis 1900
604 
			// cf http://fczaja.blogspot.fr/2011/06/convert-excel-date-into-timestamp.html
605 
			// $timestamp = ($date - MIN_DATES_DIFF) * 60 * 60 * 24 - time(); // NON
606 
 
607 
			// $timestamp = PHPExcel_Calculation::getInstance()->calculateFormula("=" . $date . "-DATE(1970,1,1)*60*60*24"); // NON
608 
 
609 
			// echo strftime("%Y/%m/%d 00:00:00", $timestamp); // NON
610 
		}
611 
		else {
1698 raphael 612 
			// attend l'un des formats de
613 
			// http://www.php.net/manual/fr/datetime.formats.date.php
1760 raphael 614 
			// le plus simple: YYYY/MM/DD (utilisé à l'export), mais DD-MM-YYYY est aussi supporté
615 
			$matches = NULL;
616 
			// et on essaie d'être sympa et supporter aussi DD/MM/YYYY
617 
			if(preg_match(';^([0-3]?\d)/([01]\d)/([12]\d\d\d)$;', $date, $matches)) {
618 
				$date = $matches[3] . '/' . $matches[2] . '/' . $matches[1];
619 
			}
1640 raphael 620 
			$timestamp = strtotime($date);
1779 raphael 621 
			if(! $timestamp || $timestamp > time() + 3600 * 24 * 1) { // une journée d'avance maxi autorisée (décallage horaire ?)
1770 raphael 622 
				if($date) trigger_error("ligne \"{$ref_ligne}\": Attention: date erronée ($date)", E_USER_NOTICE);
1642 raphael 623 
				return NULL;
624 
			}
1698 raphael 625 
			return strftime("%Y-%m-%d 00:00:00", $timestamp);
1640 raphael 626 
		}
1636 raphael 627 
	}
628 
 
1770 raphael 629 
	static function identReferentiel($referentiel, $ligne, $ref_ligne) {
1640 raphael 630 
		// SELECT DISTINCT nom_referentiel, COUNT(id_observation) AS count FROM cel_obs GROUP BY nom_referentiel ORDER BY count DESC;
1814 raphael 631 
		if(strpos($referentiel, 'bdtfx') !== FALSE) return 'bdtfx'; //:v1.01';
632 
		if(strpos($referentiel, 'bdtxa') !== FALSE) return 'bdtxa'; //:v1.00';
633 
		//if(strpos($referentiel, 'bdnff') !== FALSE) return 'bdnff'; //:4.02';
634 
		if(strpos($referentiel, 'bdnff') !== FALSE) return 'bdtfx';
635 
		if(strpos($referentiel, 'isfan') !== FALSE) return 'isfan'; //:v1.00';
1751 raphael 636 
		if(strpos($referentiel, 'autre') !== FALSE) return 'autre';
1642 raphael 637 
 
1770 raphael 638 
		if($referentiel && isset($ligne[C_NOM_SEL]) && $ligne[C_NOM_SEL]) {
639 
			trigger_error("ligne \"{$ref_ligne}\": Attention: référentiel inconnu", E_USER_NOTICE);
1760 raphael 640 
			return 'autre';
1642 raphael 641 
		}
1770 raphael 642 
 
643 
		// pas de référentiel ou pas de NOM_SEL: NULL
1640 raphael 644 
		return NULL;
645 
		/* TODO: cf story,
1642 raphael 646 
		   En cas de NULL faire une seconde passe de détection à partir du nom saisi
647 
		   + accepter les n° de version */
1636 raphael 648 
	}
649 
 
1814 raphael 650 
	static function traiterLonLat($lon = NULL, $lat = NULL, $referentiel = 'bdtfx', $ref_ligne) {
1642 raphael 651 
		// en CSV ces valeurs sont des string, avec séparateur en français (","; cf défauts dans ExportXLS)
652 
		if($lon && is_string($lon)) $lon = str_replace(',', '.', $lon);
653 
		if($lat && is_string($lat)) $lat = str_replace(',', '.', $lat);
1640 raphael 654 
 
1642 raphael 655 
		// sprintf applique une précision à 5 décimale (comme le ferait MySQL)
656 
		// tout en uniformisant le format de séparateur des décimales (le ".")
657 
		if($lon && is_numeric($lon) && $lon >= -180 && $lon <= 180) return sprintf('%.5F', $lon);
658 
		if($lat && is_numeric($lat) && $lat >= -90 && $lat <= 90) return sprintf('%.5F', $lat);
659 
 
660 
		if($lon || $lat) {
1770 raphael 661 
			trigger_error("ligne \"{$ref_ligne}\": " .
1642 raphael 662 
						  "Attention: longitude ou latitude erronée",
663 
						  E_USER_NOTICE);
664 
		}
665 
		return NULL;
666 
 
667 
		/* limite france métropole si bdtfx ? ou bdtxa ? ...
668 
		   NON!
669 
		   Un taxon d'un référentiel donné peut être théoriquement observé n'importe où sur le globe.
670 
		   Il n'y a pas lieu d'effectuer des restriction ici.
671 
		   Cependant des erreurs fréquentes (0,0 ou lon/lat inversées) peuvent être détectés ici.
672 
		   TODO */
1640 raphael 673 
		$bbox = self::getReferentielBBox($referentiel);
674 
		if(!$bbox) return NULL;
675 
 
676 
		if($lon) {
677 
			if($lon < $bbox['EST'] && $lon > $bbox['OUEST']) return is_numeric($lon) ? $lon : NULL;
678 
			else return NULL;
679 
		}
680 
		if($lat) {
681 
			if($lat < $bbox['NORD'] && $lat > $bbox['SUD']) return is_numeric($lat) ? $lat : NULL;
682 
			return NULL;
683 
		}
1636 raphael 684 
	}
685 
 
1698 raphael 686 
	/*
687 
	  TODO: s'affranchir du webservice pour la détermination du nom scientifique en s'appuyant sur cel_references,
688 
	  pour des questions de performances
689 
	*/
1784 raphael 690 
	static function traiterEspece($ligne, Array &$espece, &$referentiel, $cel) {
1770 raphael 691 
		if(empty($ligne[C_NOM_SEL])) return;
1642 raphael 692 
 
1651 raphael 693 
		// nom_sel reste toujours celui de l'utilisateur
694 
		$espece[C_NOM_SEL] = trim($ligne[C_NOM_SEL]);
695 
 
1778 raphael 696 
		// XXX/attention, nous ne devrions pas accepter un référentiel absent !
697 
		if(!$referentiel) $referentiel = 'bdtfx';
1751 raphael 698 
		$taxon_info_webservice = new RechercheInfosTaxonBeta($cel->config, $referentiel);
1640 raphael 699 
		$ascii = iconv('UTF-8', 'ASCII//TRANSLIT', $ligne[C_NOM_SEL]);
1651 raphael 700 
 
701 
		// TODO: si empty(C_NOM_SEL) et !empty(C_NOM_SEL_NN) : recherche info à partir de C_NOM_SEL_NN
1698 raphael 702 
		// echo "rechercherInformationsComplementairesSurNom()\n";
1688 raphael 703 
		/*
704 
		  SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu ,auteur, annee, biblio_origine, nom_sci,auteur  FROM bdtfx_v1_01  WHERE (nom_sci LIKE 'Heliotropium europaeum')  ORDER BY nom_sci ASC   LIMIT 0, 1
705 
		  #
706 
		  SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu ,auteur, annee, biblio_origine, nom_sci,auteur  FROM bdtfx_v1_01  WHERE (nom_sci LIKE 'eliotropium euro')  ORDER BY nom_sci ASC   LIMIT 0, 1
707 
		  SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu ,auteur, annee, biblio_origine, nom_sci,auteur  FROM bdtfx_v1_01  WHERE (nom_sci LIKE 'eliotropium')  ORDER BY nom_sci ASC   LIMIT 0, 1
708 
		  SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu ,auteur, annee, biblio_origine, nom_sci,auteur  FROM bdtfx_v1_01  WHERE (nom_sci LIKE 'eliotropium% euro%')  ORDER BY nom_sci ASC   LIMIT 0, 1
709 
		  #
1640 raphael 710 
 
1688 raphael 711 
		  SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html, auteur, annee, biblio_origine FROM bdtfx_v1_01 WHERE num_nom = 31468
712 
		*/
1781 raphael 713 
		// $determ = $taxon_info_webservice->rechercherInformationsComplementairesSurNom($ligne[C_NOM_SEL]);
1784 raphael 714 
		// permet une reconnaissance de bdtfx:nn:XXXX
1781 raphael 715 
		$determ = $taxon_info_webservice->rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax(trim($ligne[C_NOM_SEL]));
1688 raphael 716 
 
1747 raphael 717 
		// note: rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax peut ne retourner qu'une seule clef "nom_sel"
1781 raphael 718 
		if (! $determ) {
1747 raphael 719 
			// on supprime les noms retenus et renvoi tel quel
720 
			// on réutilise les define pour les noms d'indexes, tant qu'à faire
1651 raphael 721 
			// XXX; tout à NULL sauf C_NOM_SEL ci-dessus ?
1778 raphael 722 
			$espece[C_NOM_SEL_NN] = @$ligne[C_NOM_SEL_NN];
723 
			$espece[C_NOM_RET] = @$ligne[C_NOM_RET];
724 
			$espece[C_NOM_RET_NN] = @$ligne[C_NOM_RET_NN];
725 
			$espece[C_NT] = @$ligne[C_NT];
726 
			$espece[C_FAMILLE] = @$ligne[C_FAMILLE];
1640 raphael 727 
 
728 
			return;
729 
		}
730 
 
1781 raphael 731 
		// succès de la détection, mais résultat partiel
732 
		if(!isset($determ->id))
733 
			$determ = $taxon_info_webservice->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($determ->{"nom_retenu.id"});
734 
 
735 
		// ne devrait jamais arriver !
736 
		if(!$determ) die("erreur critique: " . __FILE__ . ':' . __LINE__);
737 
 
1784 raphael 738 
		// un schéma <ref>:(nt|nn):<num> (ie: bdtfx:nt:8503) a été passé
739 
		// dans ce cas on met à jour le référentiel avec celui passé dans le champ espèce
740 
		if(isset($determ->ref)) {
741 
			$referentiel = $determ->ref;
742 
		}
743 
 
744 
		// succès de la détection
745 
		// nom_sel est remplacé, mais seulement si un motif spécial à été utilisé (bdtfx:nn:4567)
746 
		if($taxon_info_webservice->is_notation_spe) {
747 
			$espece[C_NOM_SEL] = $determ->nom_sci;
748 
		}
749 
 
750 
		// écrasement des numéros (nomenclatural, taxonomique) saisis...
1781 raphael 751 
		$espece[C_NOM_SEL_NN] = $determ->id;
752 
		$espece[C_NOM_RET] = RechercheInfosTaxonBeta::supprimerBiblio($determ->nom_retenu_complet);
753 
		$espece[C_NOM_RET_NN] = $determ->{"nom_retenu.id"};
754 
		$espece[C_NT] = $determ->num_taxonomique;
755 
		$espece[C_FAMILLE] = $determ->famille;
756 
		return;
1651 raphael 757 
		// et des info complémentaires
1698 raphael 758 
 
1688 raphael 759 
		/*
760 
		  // GET /service:eflore:0.1/bdtfx/noms/31468?retour.champs=nom_sci,auteur,id,nom_retenu_complet,nom_retenu.id,num_taxonomique,famille
761 
		  /home/raphael/eflore/projets/services/modules/0.1/bdtfx/Noms.php:280
762 
		  SELECT  *, nom_sci   FROM bdtfx_v1_01  WHERE num_nom = '31468'
763 
		  SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html, auteur, annee, biblio_origine FROM bdtfx_v1_01 WHERE num_nom = 31468
764 
		  SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html, auteur, annee, biblio_origine FROM bdtfx_v1_01 WHERE num_nom = 86535
765 
		*/
1781 raphael 766 
 
767 
 
1770 raphael 768 
		//var_dump($complement, $espece);die;
1640 raphael 769 
	}
770 
 
1765 raphael 771 
	static function detectFromNom($nom) {
772 
		$r = Cel::db()->requeter(sprintf("SELECT num_nom, num_tax_sup FROM bdtfx_v1_01 WHERE (nom_sci LIKE '%s') ".
1688 raphael 773 
									"ORDER BY nom_sci ASC LIMIT 0, 1",
1765 raphael 774 
									Cel::db()->proteger($nom)));
1688 raphael 775 
		if($r) return $r;
1640 raphael 776 
 
1765 raphael 777 
		Cel::db()->requeter(sprintf("SELECT num_nom, num_tax_sup FROM bdtfx_v1_01 WHERE (nom_sci LIKE '%s' OR nom LIKE '%s') ".
1688 raphael 778 
							   "ORDER BY nom_sci ASC LIMIT 0, 1",
1765 raphael 779 
							   Cel::db()->proteger($nom),
780 
							   Cel::db()->proteger(str_replace(' ', '% ', $nom))));
1688 raphael 781 
		return $r;
782 
	}
783 
 
1697 raphael 784 
 
1797 raphael 785 
	/*
786 
	 * TODO: analyse rigoureuse:
787 
	 * == Identifiant Commune
788 
	 * - INSEE-C:\d{5}
789 
	 * - \d{5}
790 
	 * - \d{2}
791 
	 * == Commune
792 
	 * - \w+ (\d{2})
793 
	 * - \w+ (\d{5})
794 
	 * - \w+
795 
	 *
796 
	*/
1765 raphael 797 
	static function traiterLocalisation($ligne, Array &$localisation) {
1770 raphael 798 
		if(empty($ligne[C_ZONE_GEO])) $ligne[C_ZONE_GEO] = NULL;
799 
		if(empty($ligne[C_CE_ZONE_GEO])) $ligne[C_CE_ZONE_GEO] = NULL;
800 
 
1642 raphael 801 
	    $identifiant_commune = trim($ligne[C_ZONE_GEO]);
802 
		if(!$identifiant_commune) {
803 
			$departement = trim($ligne[C_CE_ZONE_GEO]);
1697 raphael 804 
			if(strpos($departement, "INSEE-C:", 0) === 0) {
1797 raphael 805 
				$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = trim($ligne[C_CE_ZONE_GEO]);
806 
				$nom = Cel::db()->requeter(sprintf("SELECT nom FROM cel_zones_geo WHERE code = %s LIMIT 1",
807 
																		self::quoteNonNull(substr($localisation[C_CE_ZONE_GEO], strlen("INSEE-C:")))));
808 
				if($nom) $localisation[C_ZONE_GEO] = $nom[0]['nom'];
809 
				return;
1697 raphael 810 
			}
811 
 
812 
			if(!is_numeric($departement)) {
1797 raphael 813 
				$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $ligne[C_CE_ZONE_GEO];
814 
				return;
1697 raphael 815 
			}
816 
 
1818 raphael 817 
			if( ($resultat_commune = Cel::db()->requeter(sprintf("SELECT DISTINCT nom, CONCAT('INSEE-C:', code) AS code FROM cel_zones_geo WHERE code = %s LIMIT 1",
818 
																 self::quoteNonNull($departement)))) ) {
819 
				$localisation[C_ZONE_GEO] = $resultat_commune[0]['nom'];
820 
				$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $resultat_commune[0]['code'];
821 
				return;
822 
			}
823 
;
824 
			// if(strlen($departement) == 4) $departement = "INSEE-C:0" . $departement;
825 
			// if(strlen($departement) == 5) $departement = "INSEE-C:" . $departement;
1697 raphael 826 
			// if(strlen($departement) <= 9) return "INSEE-C:0" . $departement; // ? ... TODO
827 
 
828 
			$departement = trim($departement); // TODO
829 
 
1797 raphael 830 
			$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $ligne[C_CE_ZONE_GEO];
1756 raphael 831 
			return;
1697 raphael 832 
		}
833 
 
834 
 
1818 raphael 835 
		$select = "SELECT DISTINCT nom, code FROM cel_zones_geo";
1697 raphael 836 
 
1797 raphael 837 
		if (preg_match('/(.+) \((\d{1,5})\)/', $identifiant_commune, $elements)) {
1697 raphael 838 
			// commune + departement : montpellier (34)
839 
			$nom_commune=$elements[1];
840 
			$code_commune=$elements[2];
1797 raphael 841 
			if(strlen($code_commune) <= 2) {
842 
				$requete = sprintf("%s WHERE nom = %s AND code LIKE %s",
843 
								   $select, self::quoteNonNull($nom_commune),
844 
								   self::quoteNonNull($code_commune.'%'));
845 
			}
846 
			else {
847 
				$requete = sprintf("%s WHERE nom = %s AND code = %d",
848 
								   $select, self::quoteNonNull($nom_commune),
849 
								   $code_commune);
850 
			}
1697 raphael 851 
		}
852 
		elseif (preg_match('/^(\d+|(2[ab]\d+))$/i', $identifiant_commune, $elements)) {
853 
			// Code insee seul
854 
			$code_insee_commune=$elements[1];
1765 raphael 855 
	 	    $requete = sprintf("%s WHERE code = %s", $select, self::quoteNonNull($code_insee_commune));
1697 raphael 856 
		}
857 
		else {
858 
			// Commune seule (le departement sera recupere dans la colonne departement si elle est presente)
859 
			// on prend le risque ici de retourner une mauvaise Commune
860 
			$nom_commune = str_replace(" ", "%", iconv('UTF-8', 'ASCII//TRANSLIT', $identifiant_commune));
1765 raphael 861 
	 	    $requete = sprintf("%s WHERE nom LIKE %s", $select, self::quoteNonNull($nom_commune.'%'));
1697 raphael 862 
		}
863 
 
1765 raphael 864 
		$resultat_commune = Cel::db()->requeter($requete);
1697 raphael 865 
		// TODO: levenstein sort ?
1797 raphael 866 
		// TODO: count résultat !
1697 raphael 867 
 
868 
		// cas de la commune introuvable dans le référentiel
869 
		// réinitialisation aux valeurs du fichier XLS
870 
		if(! $resultat_commune) {
871 
			$localisation[C_ZONE_GEO] = trim($ligne[C_ZONE_GEO]);
872 
			$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = trim($ligne[C_CE_ZONE_GEO]);
873 
		} else {
874 
			$localisation[C_ZONE_GEO] = $resultat_commune[0]['nom'];
1797 raphael 875 
			$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = "INSEE-C:" . $resultat_commune[0]['code'];
876 
			return;
1697 raphael 877 
		}
878 
 
879 
		$departement = &$localisation[C_CE_ZONE_GEO];
880 
 
881 
		if(strpos($departement, "INSEE-C:", 0) === 0) {
882 
			$localisation[C_ZONE_GEO] = $localisation[C_ZONE_GEO];
883 
			$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $localisation[C_CE_ZONE_GEO];
884 
		}
885 
 
886 
 
887 
		if(!is_numeric($departement)) {
888 
			$localisation[C_ZONE_GEO] = $localisation[C_ZONE_GEO];
889 
			$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $localisation[C_CE_ZONE_GEO];
890 
		}
891 
 
892 
		if(strlen($departement) == 4) $departement = "INSEE-C:0" . $departement;
893 
		if(strlen($departement) == 5) $departement = "INSEE-C:" . $departement;
894 
		// if(strlen($departement) <= 9) return "INSEE-C:0" . $departement; // ? ... TODO
895 
 
896 
		$departement = trim($departement); // TODO
897 
 
898 
		$localisation[C_ZONE_GEO] = $localisation[C_ZONE_GEO];
899 
		$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $localisation[C_CE_ZONE_GEO];
900 
	}
901 
 
902 
	/*
1765 raphael 903 
	static function traiterLocalisation($ligne, Array &$localisation) {
1697 raphael 904 
	    $identifiant_commune = trim($ligne[C_ZONE_GEO]);
905 
		if(!$identifiant_commune) {
906 
			$departement = trim($ligne[C_CE_ZONE_GEO]);
1642 raphael 907 
			goto testdepartement;
908 
		}
909 
 
910 
 
911 
		$select = "SELECT DISTINCT nom, code  FROM cel_zones_geo";
912 
 
913 
		if (preg_match('/(.*) \((\d+)\)/', $identifiant_commune, $elements)) {
914 
			// commune + departement : montpellier (34)
915 
			$nom_commune=$elements[1];
916 
			$code_commune=$elements[2];
917 
	 	    $requete = sprintf("%s WHERE nom = %s AND code LIKE %s",
1765 raphael 918 
							   $select, self::quoteNonNull($nom_commune), self::quoteNonNull($code_commune.'%'));
1642 raphael 919 
		}
920 
		elseif (preg_match('/^(\d+|(2[ab]\d+))$/i', $identifiant_commune, $elements)) {
921 
			// Code insee seul
922 
			$code_insee_commune=$elements[1];
1765 raphael 923 
	 	    $requete = sprintf("%s WHERE code = %s", $select, self::quoteNonNull($code_insee_commune));
1642 raphael 924 
		}
925 
		else {
926 
			// Commune seule (le departement sera recupere dans la colonne departement si elle est presente)
927 
			// on prend le risque ici de retourner une mauvaise Commune
928 
			$nom_commune = str_replace(" ", "%", iconv('UTF-8', 'ASCII//TRANSLIT', $identifiant_commune));
1765 raphael 929 
	 	    $requete = sprintf("%s WHERE nom LIKE %s", $select, self::quoteNonNull($nom_commune.'%'));
1642 raphael 930 
		}
931 
 
1765 raphael 932 
		$resultat_commune = Cel::db()->requeter($requete);
1642 raphael 933 
		// TODO: levenstein sort ?
934 
 
935 
		// cas de la commune introuvable dans le référentiel
936 
		// réinitialisation aux valeurs du fichier XLS
937 
		if(! $resultat_commune) {
938 
			$localisation[C_ZONE_GEO] = trim($ligne[C_ZONE_GEO]);
939 
			$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = trim($ligne[C_CE_ZONE_GEO]);
940 
		} else {
941 
			$localisation[C_ZONE_GEO] = $resultat_commune[0]['nom'];
942 
			$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $resultat_commune[0]['code'];
943 
		}
944 
 
945 
		$departement = &$localisation[C_CE_ZONE_GEO];
946 
 
947 
	testdepartement:
948 
		if(strpos($departement, "INSEE-C:", 0) === 0) goto protectloc;
949 
 
950 
		if(!is_numeric($departement)) goto protectloc; // TODO ?
951 
		if(strlen($departement) == 4) $departement = "INSEE-C:0" . $departement;
952 
		if(strlen($departement) == 5) $departement = "INSEE-C:" . $departement;
1640 raphael 953 
		// if(strlen($departement) <= 9) return "INSEE-C:0" . $departement; // ? ... TODO
1642 raphael 954 
 
955 
		$departement = trim($departement); // TODO
956 
 
957 
	protectloc:
1649 raphael 958 
		$localisation[C_ZONE_GEO] = $localisation[C_ZONE_GEO];
959 
		$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $localisation[C_CE_ZONE_GEO];
1640 raphael 960 
	}
1697 raphael 961 
*/
1640 raphael 962 
 
963 
 
964 
	/* HELPERS */
965 
 
1636 raphael 966 
	// http://stackoverflow.com/questions/348410/sort-an-array-based-on-another-array
1741 raphael 967 
	// XXX; utilisé aussi (temporairement ?) par FormateurGroupeColonne.
1640 raphael 968 
	static function sortArrayByArray($array, $orderArray) {
1636 raphael 969 
		$ordered = array();
970 
		foreach($orderArray as $key) {
971 
			if(array_key_exists($key, $array)) {
972 
				$ordered[$key] = $array[$key];
973 
				unset($array[$key]);
974 
			}
975 
		}
976 
		return $ordered + $array;
977 
	}
1640 raphael 978 
 
979 
	// retourne une BBox [N,S,E,O) pour un référentiel donné
980 
	static function getReferentielBBox($referentiel) {
1814 raphael 981 
		if($referentiel == 'bdtfx') return Array(
1640 raphael 982 
			'NORD' => 51.2, // Dunkerque
983 
			'SUD' => 41.3, // Bonifacio
984 
			'EST' => 9.7, // Corse
985 
			'OUEST' => -5.2); // Ouessan
986 
		return FALSE;
987 
	}
988 
 
1649 raphael 989 
	// ces valeurs ne sont pas inséré via les placeholders du PDO::preparedStatement
990 
	// et doivent donc être échappées correctement.
1642 raphael 991 
	public function initialiser_colonnes_statiques() {
1640 raphael 992 
		$this->colonnes_statiques = array_merge($this->colonnes_statiques,
993 
												Array(
1812 raphael 994 
													"ce_utilisateur" => self::quoteNonNull($this->id_utilisateur), // peut-être un hash ou un id
1765 raphael 995 
													"prenom_utilisateur" => self::quoteNonNull($this->utilisateur['prenom']),
996 
													"nom_utilisateur" => self::quoteNonNull($this->utilisateur['nom']),
997 
													"courriel_utilisateur" => self::quoteNonNull($this->utilisateur['courriel']),
1640 raphael 998 
												));
999 
 
1000 
	}
1642 raphael 1001 
 
1649 raphael 1002 
	static function initialiser_pdo_ordered_statements($colonnes_statiques) {
1003 
		return Array(
1004 
			// insert_ligne_pattern_ordre
1005 
			sprintf('INSERT INTO cel_obs (%s, %s) VALUES',
1006 
					implode(', ', array_keys($colonnes_statiques)),
1007 
					implode(', ', array_diff(self::$ordre_BDD, array_keys($colonnes_statiques)))),
1008 
 
1009 
			// insert_ligne_pattern_ordre
1010 
			sprintf('(%s, %s ?)',
1011 
					implode(', ', $colonnes_statiques),
1012 
					str_repeat('?, ', count(self::$ordre_BDD) - count($colonnes_statiques) - 1))
1013 
		);
1648 raphael 1014 
	}
1015 
 
1649 raphael 1016 
	static function initialiser_pdo_statements($colonnes_statiques) {
1017 
		return Array(
1018 
			// insert_prefix
1019 
			sprintf('INSERT INTO cel_obs (%s) VALUES ',
1020 
					implode(', ', self::$ordre_BDD)),
1021 
 
1650 raphael 1022 
 
1023 
			// insert_ligne_pattern, cf: self::$insert_ligne_pattern
1649 raphael 1024 
			'(' .
1650 raphael 1025 
			// 3) créé une chaîne de liste de champ à inséré en DB
1026 
			implode(', ', array_values(
1027 
				// 2) garde les valeurs fixes (de $colonnes_statiques),
1028 
				// mais remplace les NULL par des "?"
1675 raphael 1029 
				array_map('__anonyme_5',
1650 raphael 1030 
						  // 1) créé un tableau genre (nom_sel_nn => NULL) depuis self::$ordre_BDD
1031 
						  // et écrase certaines valeurs avec $colonnes_statiques (initilisé avec les données utilisateur)
1675 raphael 1032 
						  array_merge(array_map('__anonyme_6', array_flip(self::$ordre_BDD)), $colonnes_statiques
1649 raphael 1033 
				)))) .
1034 
			')'
1035 
		);
1036 
	}
1037 
 
1765 raphael 1038 
	// équivalent à Bdd2->proteger() (qui wrap PDO::quote),
1642 raphael 1039 
	// sans transformer NULL en ""
1765 raphael 1040 
	static function quoteNonNull($chaine) {
1642 raphael 1041 
		if(is_null($chaine)) return "NULL";
1812 raphael 1042 
		if(!is_string($chaine) && !is_integer($chaine)) {
1043 
			die("erreur: " . __FILE__ . ':' . __LINE__);
1044 
		}
1765 raphael 1045 
		return Cel::db()->quote($chaine);
1642 raphael 1046 
	}
1047 
 
1048 
	public function erreurs_stock($errno, $errstr) {
1049 
		$this->bilan[] = $errstr;
1050 
	}
1636 raphael 1051 
}