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Rev 1914 | Details | Compare with Previous | Last modification | View Log | RSS feed

Rev Author Line No. Line
1636 raphael 1
<?php
2
/**
1936 raphael 3
 * @category  PHP
4
 * @package   jrest
5
 * @author    Raphaël Droz <raphael@tela-botania.org>
6
 * @copyright 2013 Tela-Botanica
7
 * @license   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
8
 * @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
9
 */
1636 raphael 10
 
11
/**
12
 * Service d'import de données d'observation du CEL au format XLS
1649 raphael 13
 *
14
 * Sont define()'d commme n° de colonne tous les abbrevs retournés par
1656 raphael 15
 * FormateurGroupeColonne::nomEnsembleVersListeColonnes() préfixés par C_  cf: detectionEntete()
1649 raphael 16
 *
17
 * Exemple d'un test:
18
 * $ GET "/jrest/ExportXLS/22506?format=csv&range=*&limite=13" \
19
 *   | curl -F "upload=@-" -F utilisateur=22506 "/jrest/ImportXLS"
20
 * # 13 observations importées
21
 * + cf MySQL general_log = 1
22
 *
23
 **/
1636 raphael 24
 
25
set_include_path(get_include_path() . PATH_SEPARATOR . dirname(dirname(realpath(__FILE__))) . '/lib');
26
// TERM
27
error_reporting(-1);
28
ini_set('html_errors', 0);
29
ini_set('xdebug.cli_color', 2);
30
require_once('lib/PHPExcel/Classes/PHPExcel.php');
1656 raphael 31
require_once('FormateurGroupeColonne.php');
1636 raphael 32
 
1640 raphael 33
 
34
date_default_timezone_set("Europe/Paris");
35
 
36
// nombre d'INSERT à cumuler par requête SQL
37
// (= nombre de lignes XLS à bufferiser)
1648 raphael 38
//define('NB_LIRE_LIGNE_SIMUL', 30);
39
define('NB_LIRE_LIGNE_SIMUL', 5);
1640 raphael 40
 
1936 raphael 41
// en cas d'import d'un fichier CSV, utilise fgetcsv() plutôt
42
// que PHPExcel ce qui se traduit par un gain de performances très substanciel
43
define('QUICK_CSV_IMPORT', TRUE);
44
 
1640 raphael 45
// Numbers of days between January 1, 1900 and 1970 (including 19 leap years)
46
// see traiterDateObs()
1675 raphael 47
// define("MIN_DATES_DIFF", 25569);
1640 raphael 48
 
49
 
1636 raphael 50
class MyReadFilter implements PHPExcel_Reader_IReadFilter {
1936 raphael 51
    // exclusion de colonnes
52
    public $exclues = array();
1640 raphael 53
 
1936 raphael 54
    // lecture par morceaux
1640 raphael 55
    public $ligne_debut = 0;
56
    public $ligne_fin = 0;
57
 
1936 raphael 58
    public function __construct() {}
59
    public function def_interval($debut, $nb) {
60
	$this->ligne_debut = $debut;
61
	$this->ligne_fin = $debut + $nb;
62
    }
1638 raphael 63
    public function readCell($colonne, $ligne, $worksheetName = '') {
1936 raphael 64
	if(@$this->exclues[$colonne]) return false;
65
	// si des n° de morceaux ont été initialisés, on filtre...
66
	if($this->ligne_debut && ($ligne < $this->ligne_debut || $ligne >= $this->ligne_fin)) return false;
67
	return true;
1636 raphael 68
    }
69
}
70
 
1675 raphael 71
// XXX: PHP 5.3
72
function __anonyme_1($v) {	return !$v['importable']; }
73
function __anonyme_2(&$v) {	$v = $v['nom']; }
74
function __anonyme_3($cell) { return !is_null($cell); };
75
function __anonyme_5($item) { return is_null($item) ? '?' : $item; }
76
function __anonyme_6() { return NULL; }
77
 
1636 raphael 78
class ImportXLS extends Cel  {
1936 raphael 79
    static function __anonyme_4(&$item, $key) { $item = self::quoteNonNull(trim($item)); }
1636 raphael 80
 
1936 raphael 81
    static $ordre_BDD = Array(
82
	"ce_utilisateur",
83
	"prenom_utilisateur",
84
	"nom_utilisateur",
85
	"courriel_utilisateur",
86
	"ordre",
87
	"nom_sel",
88
	"nom_sel_nn",
89
	"nom_ret",
90
	"nom_ret_nn",
91
	"nt",
92
	"famille",
93
	"nom_referentiel",
94
	"zone_geo",
95
	"ce_zone_geo",
96
	"date_observation",
97
	"lieudit",
98
	"station",
99
	"milieu",
100
	"mots_cles_texte",
101
	"commentaire",
102
	"transmission",
103
	"date_creation",
104
	"date_modification",
105
	"date_transmission",
106
	"latitude",
107
	"longitude",
108
	"altitude",
109
	"abondance",
110
	"certitude",
111
	"phenologie",
112
	"code_insee_calcule"
113
    );
1636 raphael 114
 
1936 raphael 115
    // cf: initialiser_pdo_ordered_statements()
116
    // eg: "INSERT INTO cel_obs (ce_utilisateur, ..., phenologie, code_insee_calcule) VALUES"
117
    // colonnes statiques d'abord, les autres ensuite, dans l'ordre de $ordre_BDD
118
    static $insert_prefix_ordre;
119
    // eg: "(<id>, <prenom>, <nom>, <email>, now(), now(), ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?)"
120
    // dont le nombre de placeholder dépend du nombre de colonnes non-statiques
121
    // colonnes statiques d'abord, les autres ensuite, dans l'ordre de $ordre_BDD
122
    static $insert_ligne_pattern_ordre;
1648 raphael 123
 
1936 raphael 124
    // seconde (meilleure) possibilité
125
    // cf: initialiser_pdo_statements()
126
    // eg: "INSERT INTO cel_obs (ce_utilisateur, ..., date_creation, ...phenologie, code_insee_calcule) VALUES"
127
    static $insert_prefix;
128
    // eg: "(<id>, <prenom>, <nom>, <email>, ?, ?, ?, now(), now(), ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?)"
129
    // dont le nombre de placeholder dépend du nombre de colonnes non-statiques
130
    static $insert_ligne_pattern;
1648 raphael 131
 
1936 raphael 132
    /*
133
      Ces colonnes:
134
      - sont propres à l'ensemble des enregistrements uploadés
135
      - sont indépendantes du numéro de lignes
136
      - n'ont pas de valeur par défaut dans la structure de la table
137
      - nécessitent une initialisation dans le cadre de l'upload
1649 raphael 138
 
1936 raphael 139
      initialiser_colonnes_statiques() y merge les données d'identification utilisateur
140
    */
141
    public $colonnes_statiques = Array(
142
	"ce_utilisateur" => NULL,
143
	"prenom_utilisateur" => NULL,
144
	"nom_utilisateur" => NULL,
145
	"courriel_utilisateur" => NULL,
1640 raphael 146
 
1936 raphael 147
	// fixes (fonction SQL)
148
	// XXX future: mais pourraient varier dans le futur si la mise-à-jour
149
	// d'observation est implémentée
150
	"date_creation" => "now()",
151
	"date_modification" => "now()",
152
    );
1640 raphael 153
 
1936 raphael 154
    public $id_utilisateur = NULL;
1649 raphael 155
 
1936 raphael 156
    // erreurs d'import
157
    public $bilan = Array();
1642 raphael 158
 
1936 raphael 159
    // cache (pour traiterLocalisation() pour l'instant)
160
    static $cache = Array('geo' => array());
1649 raphael 161
 
1936 raphael 162
    function ImportXLS($config) {
163
	parent::__construct($config);
164
    }
165
 
166
    function createElement($pairs) {
167
	if(!isset($pairs['utilisateur']) || trim($pairs['utilisateur']) == '') {
168
	    exit('0');
1636 raphael 169
	}
170
 
1936 raphael 171
	$id_utilisateur = intval($pairs['utilisateur']);
172
	$this->id_utilisateur = $id_utilisateur; // pour traiterImage();
1649 raphael 173
 
1936 raphael 174
	if(!isset($_SESSION)) session_start();
175
	$this->controleUtilisateur($id_utilisateur);
1640 raphael 176
 
1936 raphael 177
	$this->utilisateur = $this->getInfosComplementairesUtilisateur($id_utilisateur);
1636 raphael 178
 
1936 raphael 179
	$this->initialiser_colonnes_statiques($id_utilisateur);
1649 raphael 180
 
1936 raphael 181
	// initialisation du statement PDO/MySQL
182
	// première version, pattern de requête pas génial
183
	/* list(self;;$insert_prefix_ordre, self::$insert_ligne_pattern_ordre) =
184
	   $this->initialiser_pdo_ordered_statements($this->colonnes_statiques); */
185
	list(self::$insert_prefix, self::$insert_ligne_pattern) =
186
	    $this->initialiser_pdo_statements($this->colonnes_statiques);
1636 raphael 187
 
1936 raphael 188
	$infos_fichier = array_pop($_FILES);
1636 raphael 189
 
1936 raphael 190
	/*$objPHPExcel = PHPExcel_IOFactory::load($infos_fichier['tmp_name']);
191
	  $donnees = $objPHPExcel->getActiveSheet()->toArray(NULL,FALSE,FALSE,TRUE);*/
1636 raphael 192
 
1936 raphael 193
	/*$objReader = PHPExcel_IOFactory::createReader("Excel5");
194
	  $objReader->setReadDataOnly(true);
195
	  $objPHPExcel = $objReader->load($infos_fichier['tmp_name']);*/
1636 raphael 196
 
1936 raphael 197
	//var_dump($donnees);
1636 raphael 198
 
1936 raphael 199
	// renomme le fichier pour lui ajouter son extension initiale, ce qui
200
	// permet (une sorte) d'autodétection du format.
201
	$fichier = $infos_fichier['tmp_name'];
202
	$extension = pathinfo($infos_fichier['name'], PATHINFO_EXTENSION);
203
	if( (strlen($extension) == 3 || strlen($extension) == 4) &&
204
	    (@rename($fichier, $fichier . '.' . $extension))) { // XXX: @ safe-mode
205
	    $fichier = $fichier . '.' . $extension;
206
	}
1642 raphael 207
 
1936 raphael 208
	$objReader = PHPExcel_IOFactory::createReaderForFile($fichier);
209
	// TODO: check if compatible with toArray(<1>,<2>,TRUE,<4>)
210
	$objReader->setReadDataOnly(true);
1640 raphael 211
 
1936 raphael 212
	// TODO: is_a obsolete entre 5.0 et 5.3, retirer le @ à terme
213
	$IS_CSV = @is_a($objReader, 'PHPExcel_Reader_CSV') && QUICK_CSV_IMPORT;
214
	// en cas d'usage de fgetcsv, testons que nous pouvons compter les lignes
215
	if($IS_CSV) $nb_lignes = intval(exec("wc -l $fichier"));
216
	// et, le cas échéant, fallback sur PHPExcel à nouveau. La raison de ce test ici est
217
	// l'instabilité du serveur (safe_mode, safe_mode_exec_dir, symlink vers binaires pour exec(), ... multiples points-of-failure)
218
	if($IS_CSV && !$nb_lignes) $IS_CSV = FALSE;
1642 raphael 219
 
1936 raphael 220
	if($IS_CSV) {
221
	    $objReader->setDelimiter(',')
222
		->setEnclosure('"')
223
		->setLineEnding("\n")
224
		->setSheetIndex(0);
225
	}
1640 raphael 226
 
1936 raphael 227
	// on ne conserve que l'en-tête
228
	$filtre = new MyReadFilter();
229
	$filtre->def_interval(1, 2);
230
	$objReader->setReadFilter($filtre);
1636 raphael 231
 
1936 raphael 232
	$objPHPExcel = $objReader->load($fichier);
233
	$obj_infos = $objReader->listWorksheetInfo($fichier);
1636 raphael 234
 
1936 raphael 235
	if($IS_CSV) {
236
	    // $nb_lignes est déjà défini ci-dessus
237
	    $csvFileHandler = fopen($fichier, 'r');
238
	    // nous utilisons la valeur de retour dans un but informatif de l'utilisateur à la
239
	    // fin de l'import, *mais aussi* dans un array_diff_key() ci-dessous car bien que dans le
240
	    // fond le "parser" fgetcsv() n'ait pas d'intérêt à connaître les colonnes à ignorer,
241
	    // il se trouve que celles-ci peuvent interférer sur des fonctions comme traiterEspece()
242
	    // cf test "ref-nom-num.test.php" pour lequel l'élément C_NOM_SEL vaudrait 3 et $ligne serait array(3 => -42)
243
	    $filtre->exclues = self::detectionEntete(fgetcsv($csvFileHandler), TRUE);
244
	} else {
245
	    // XXX: indépendant du readFilter ?
246
	    $nb_lignes = $obj_infos[0]['totalRows'];
247
	    $donnees = $objPHPExcel->getActiveSheet()->toArray(NULL, FALSE, TRUE, TRUE);
248
	    $filtre->exclues = self::detectionEntete($donnees[1]);
249
	}
1677 raphael 250
 
1936 raphael 251
	$obs_ajouts = 0;
252
	$obs_maj = 0;
253
	$nb_images_ajoutees = 0;
254
	$nb_mots_cle_ajoutes = 0;
1640 raphael 255
 
1936 raphael 256
	$dernier_ordre = Cel::db()->requeter("SELECT MAX(ordre) AS ordre FROM cel_obs WHERE ce_utilisateur = $id_utilisateur");
257
	$dernier_ordre = intval($dernier_ordre[0]['ordre']) + 1;
258
	if(! $dernier_ordre) $dernier_ordre = 0;
1642 raphael 259
 
1936 raphael 260
	// on catch to les trigger_error(E_USER_NOTICE);
261
	set_error_handler(array($this, 'erreurs_stock'), E_USER_NOTICE);
262
	$this->taxon_info_webservice = new RechercheInfosTaxonBeta($this->config, NULL);
1640 raphael 263
 
264
 
1936 raphael 265
	// lecture par morceaux (chunks), NB_LIRE_LIGNE_SIMUL lignes à fois
266
	// pour aboutir des requêtes SQL d'insert groupés.
267
	for($ligne = 2; $ligne < $nb_lignes + NB_LIRE_LIGNE_SIMUL; $ligne += NB_LIRE_LIGNE_SIMUL) {
268
	    if(!$IS_CSV) {
269
		$filtre->def_interval($ligne, NB_LIRE_LIGNE_SIMUL);
270
		$objReader->setReadFilter($filtre);
1818 raphael 271
 
1936 raphael 272
		/* recharge avec $filtre actif (filtre sur lignes colonnes):
273
		   - exclue les colonnes inutiles/inutilisables)
274
		   - ne selectionne que les lignes dans le range [$ligne - $ligne + NB_LIRE_LIGNE_SIMUL] */
275
		$objPHPExcel = $objReader->load($fichier)->getActiveSheet();
1818 raphael 276
 
1936 raphael 277
		// set col typing
278
		if(C_CE_ZONE_GEO != 'C_CE_ZONE_GEO')
279
		    $objPHPExcel->getStyle(C_CE_ZONE_GEO . '2:' . C_CE_ZONE_GEO . $objPHPExcel->getHighestRow())->getNumberFormat()->setFormatCode('00000');
1818 raphael 280
 
1936 raphael 281
		// TODO: set to string type
282
		if(C_ZONE_GEO != 'C_ZONE_GEO')
283
		    $objPHPExcel->getStyle(C_ZONE_GEO . '2:' . C_ZONE_GEO . $objPHPExcel->getHighestRow())->getNumberFormat()->setFormatCode('00000');
1640 raphael 284
 
1936 raphael 285
		$donnees = $objPHPExcel->toArray(NULL, FALSE, TRUE, TRUE);
286
	    }
287
	    else {
288
		$i = NB_LIRE_LIGNE_SIMUL;
289
		$donnees = array();
290
		while($i--) {
291
		    $tab = fgetcsv($csvFileHandler);
292
		    if(!$tab) continue;
293
		    $donnees[] = array_diff_key($tab, $filtre->exclues);
294
		}
1642 raphael 295
 
1936 raphael 296
	    }
1648 raphael 297
 
1936 raphael 298
	    // var_dump($donnees, get_defined_constants(true)['user']);die;
299
	    // ici on appel la fonction qui fera effectivement l'insertion multiple
300
	    // à partir des (au plus) NB_LIRE_LIGNE_SIMUL lignes
1648 raphael 301
 
1936 raphael 302
	    // TODO: passer $this, ne sert que pour appeler des méthodes publiques qui pourraient être statiques
303
	    list($enregistrements, $images, $mots_cle) =
304
		self::chargerLignes($this, $donnees, $this->colonnes_statiques, $dernier_ordre);
305
	    if(! $enregistrements) break;
1648 raphael 306
 
1936 raphael 307
	    self::trierColonnes($enregistrements);
308
	    // normalement: NB_LIRE_LIGNE_SIMUL, sauf si une enregistrement ne semble pas valide
309
	    // ou bien lors du dernier chunk
1648 raphael 310
 
1936 raphael 311
	    $nb_rec = count($enregistrements);
312
	    $sql_pattern = self::$insert_prefix .
313
		str_repeat(self::$insert_ligne_pattern_ordre . ', ', $nb_rec - 1) .
314
		self::$insert_ligne_pattern_ordre;
1648 raphael 315
 
1936 raphael 316
	    $sql_pattern = self::$insert_prefix .
317
		str_repeat(self::$insert_ligne_pattern . ', ', $nb_rec - 1) .
318
		self::$insert_ligne_pattern;
1648 raphael 319
 
1936 raphael 320
	    Cel::db()->beginTransaction();
321
	    $stmt = Cel::db()->prepare($sql_pattern);
322
	    $donnees = array();
323
	    foreach($enregistrements as $e) $donnees = array_merge($donnees, array_values($e));
1648 raphael 324
 
1936 raphael 325
	    // echo $sql_pattern . "\n"; var_dump($enregistrements, $donnees); die; // debug ici
1648 raphael 326
 
1936 raphael 327
	    $stmt->execute($donnees);
1642 raphael 328
 
1936 raphael 329
	    // $stmt->debugDumpParams(); // https://bugs.php.net/bug.php?id=52384
330
	    $dernier_autoinc = Cel::db()->lastInsertId();
331
	    Cel::db()->commit();
1642 raphael 332
 
1936 raphael 333
	    if(! $dernier_autoinc) trigger_error("l'insertion semble avoir échoué", E_USER_NOTICE);
1792 raphael 334
 
1936 raphael 335
	    $obs_ajouts += count($enregistrements);
336
	    // $obs_ajouts += count($enregistrements['insert']);
337
	    // $obs_maj += count($enregistrements['update']);
338
	    $nb_images_ajoutees += self::stockerImages($enregistrements, $images, $dernier_autoinc);
339
	    $nb_mots_cle_ajoutes += self::stockerMotsCle($enregistrements, $mots_cle, $dernier_autoinc);
1636 raphael 340
	}
341
 
1936 raphael 342
	restore_error_handler();
343
 
344
	if($this->bilan) echo implode("\n", $this->bilan) . "\n";
345
	printf('%1$d observation%2$s ajoutée%2$s' . "\n" .
346
	       '%3$d image%4$s attachée%4$s' . "\n" .
347
	       // '%5$d mot%6$c-clef ajouté%6$c [TODO]' . "\n" . // TODO
348
	       (count($filtre->exclues) > 0 ? 'colonne%7$s non-traitée%7$s: %8$s' . "\n" : ''),
349
 
350
	       $obs_ajouts,
351
	       $obs_ajouts > 1 ? 's' : '',
352
	       $nb_images_ajoutees,
353
	       $nb_images_ajoutees > 1 ? 's' : '',
354
	       $nb_mots_cle_ajoutes,
355
	       $nb_mots_cle_ajoutes > 1 ? 's' : '',
356
	       count($filtre->exclues) > 1 ? 's' : '',
357
	       implode(', ', $filtre->exclues));
358
	die();
359
    }
360
 
361
    /* detectionEntete() sert deux rôles:
362
       1) détecter le type de colonne attendu à partir des textes de la ligne d'en-tête afin de define()
363
       2) permet d'identifier les colonnes non-supportées/inutiles afin d'alléger le processus de parsing de PHPExcel
364
       grace au ReadFilter (C'est le rôle de la valeur de retour)
365
 
366
       La raison de la présence du paramètre $numeric_keys est que pour réussir à identifier les colonnes à exclure nous
367
       devons traiter un tableau représentant la ligne d'en-tête aussi bien:
368
       - sous forme associative pour PHPExcel (les clefs sont les lettres de l'alphabet)
369
       - sous forme de clefs numériques (fgetcsv())
370
       Le détecter après coup est difficile et pourtant cette distinction est importante car le comportement
371
       d'array_merge() (réordonnancement des clefs numérique) n'est pas souhaitable dans le second cas. */
372
    static function detectionEntete($entete, $numeric_keys = FALSE) {
373
	$colonnes_reconnues = Array();
374
	$cols = FormateurGroupeColonne::nomEnsembleVersListeColonnes('standard,avance');
375
	foreach($entete as $k => $v) {
376
	    // traite les colonnes en faisant fi de la casse et des accents
377
	    $entete_simple = iconv('UTF-8', 'ASCII//TRANSLIT', strtolower(trim($v)));
378
	    foreach($cols as $col) {
379
		$entete_officiel_simple = iconv('UTF-8', 'ASCII//TRANSLIT', strtolower(trim($col['nom'])));
380
		$entete_officiel_abbrev = $col['abbrev'];
381
		if($entete_simple == $entete_officiel_simple || $entete_simple == $entete_officiel_abbrev) {
382
		    // debug echo "define C_" . strtoupper($entete_officiel_abbrev) . ", $k ($v)\n";
383
		    define("C_" . strtoupper($entete_officiel_abbrev), $k);
384
		    $colonnes_reconnues[$k] = 1;
385
		    break;
1636 raphael 386
		}
1936 raphael 387
	    }
388
	}
389
	// défini tous les index que nous utilisons à une valeur d'index de colonne Excel qui n'existe pas dans
390
	// le tableau renvoyé par PHPExcel
391
	// Attention cependant d'utiliser des indexes différenciés car traiterLonLat() et traiterEspece()
392
	// les utilisent
393
	foreach($cols as $col) {
394
	    if(!defined("C_" . strtoupper($col['abbrev'])))
395
		define("C_" . strtoupper($col['abbrev']), "C_" . strtoupper($col['abbrev']));
396
	}
1636 raphael 397
 
1936 raphael 398
	// prépare le filtre de PHPExcel qui évitera le traitement de toutes les colonnes superflues
1640 raphael 399
 
1936 raphael 400
	// eg: diff ( Array( H => Commune, I => rien ) , Array( H => 1, K => 1 )
401
	// ==> Array( I => rien )
402
	$colonnesID_non_reconnues = array_diff_key($entete, $colonnes_reconnues);
1636 raphael 403
 
1936 raphael 404
	// des colonnes de FormateurGroupeColonne::nomEnsembleVersListeColonnes()
405
	// ne retient que celles marquées "importables"
406
	$colonnes_automatiques = array_filter($cols, '__anonyme_1');
1640 raphael 407
 
1936 raphael 408
	// ne conserve que le nom long pour matcher avec la ligne XLS d'entête
409
	array_walk($colonnes_automatiques, '__anonyme_2');
1640 raphael 410
 
1936 raphael 411
	// intersect ( Array ( N => Milieu, S => Ordre ), Array ( ordre => Ordre, phenologie => Phénologie ) )
412
	// ==> Array ( S => Ordre, AA => Phénologie )
413
	$colonnesID_a_exclure = array_intersect($entete, $colonnes_automatiques);
1636 raphael 414
 
1936 raphael 415
	if($numeric_keys) {
416
	    return $colonnesID_non_reconnues + $colonnesID_a_exclure;
1636 raphael 417
	}
1936 raphael 418
	// TODO: pourquoi ne pas comparer avec les abbrevs aussi ?
419
	// merge ( Array( I => rien ) , Array ( S => Ordre, AA => Phénologie ) )
420
	// ==> Array ( I => rien, AA => Phénologie )
421
	return array_merge($colonnesID_non_reconnues, $colonnesID_a_exclure);
422
    }
1636 raphael 423
 
1936 raphael 424
    /*
425
     * charge un groupe de lignes
426
     */
427
    static function chargerLignes($cel, $lignes, $colonnes_statiques, &$dernier_ordre) {
428
	$enregistrement = NULL;
429
	$enregistrements = Array();
430
	$toutes_images = Array();
431
	$tous_mots_cle = Array();
1640 raphael 432
 
1936 raphael 433
	foreach($lignes as $ligne) {
434
	    // dans le cas de fgetcsv, on peut avoir des false additionnel (cf do/while l. 279)
435
	    if($ligne === false) continue;
1640 raphael 436
 
1936 raphael 437
	    //$ligne = array_filter($ligne, function($cell) { return !is_null($cell); });
438
	    //if(!$ligne) continue;
439
	    // on a besoin des NULL pour éviter des notice d'index indéfini
440
	    if(! array_filter($ligne, '__anonyme_3')) continue;
1640 raphael 441
 
1936 raphael 442
	    if( ($enregistrement = self::chargerLigne($ligne, $dernier_ordre, $cel)) ) {
443
		// $enregistrements[] = array_merge($colonnes_statiques, $enregistrement);
444
		$enregistrements[] = $enregistrement;
445
		$pos = count($enregistrements) - 1;
446
		$last = &$enregistrements[$pos];
1640 raphael 447
 
1936 raphael 448
		if(isset($enregistrement['_images'])) {
449
		    // ne dépend pas de cel_obs, et seront insérées *après* les enregistrements
450
		    // mais nous ne voulons pas nous priver de faire des INSERT multiples pour autant
451
		    $toutes_images[] = Array("images" => $last['_images'],
452
					     "obs_pos" => $pos);
453
		    // ce champ n'a pas à faire partie de l'insertion dans cel_obs,
454
		    // mais est utile pour cel_obs_images
455
		    unset($last['_images']);
456
		}
1677 raphael 457
 
1936 raphael 458
		if(isset($enregistrement['_mots_cle'])) {
459
		    // ne dépend pas de cel_obs, et seront insérés *après* les enregistrements
460
		    // mais nous ne voulons pas nous priver de faire des INSERT multiples pour autant
461
		    $tous_mots_cle[] = Array("mots_cle" => $last['_mots_cle'],
462
					     "obs_pos" => $pos);
463
		    // la version inlinée des mots est enregistrées dans cel_obs
464
		    // mais cel_mots_cles_obs fait foi.
465
		    // XXX: postponer l'ajout de ces informations dans cel_obs *après* l'insertion effective
466
		    // des records dans cel_mots_cles_obs ?
467
		    unset($last['_mots_cle']);
1636 raphael 468
		}
1640 raphael 469
 
1936 raphael 470
		$dernier_ordre++;
471
	    }
1642 raphael 472
	}
1640 raphael 473
 
1936 raphael 474
	// XXX future: return Array($enregistrements_a_inserer, $enregistrements_a_MAJ, $toutes_images);
475
	return Array($enregistrements, $toutes_images, $tous_mots_cle);
476
    }
1642 raphael 477
 
478
 
1936 raphael 479
    static function trierColonnes(&$enregistrements) {
480
	foreach($enregistrements as &$enregistrement) {
481
	    $enregistrement = self::sortArrayByArray($enregistrement, self::$ordre_BDD);
482
	    //array_walk($enregistrement, function(&$item, $k) { $item = is_null($item) ? "NULL" : $item; });
483
	    //$req .= implode(', ', $enregistrement) . "\n";
1677 raphael 484
	}
1936 raphael 485
    }
1677 raphael 486
 
1642 raphael 487
 
1936 raphael 488
    static function stockerMotsCle($enregistrements, $tous_mots_cle, $lastid) {
489
	$c = 0;
490
	// debug: var_dump($tous_mots_cle);die;
491
	foreach($tous_mots_cle as $v) $c += count($v['mots_cle']['to_insert']);
492
	return $c;
493
    }
1642 raphael 494
 
1936 raphael 495
    static function stockerImages($enregistrements, $toutes_images, $lastid) {
496
	$images_insert = 'INSERT INTO cel_obs_images (id_image, id_observation) VALUES %s ON DUPLICATE KEY UPDATE id_image = id_image';
497
	$images_obs_assoc = Array();
1650 raphael 498
 
1936 raphael 499
	foreach($toutes_images as $images_pour_obs) {
500
	    $obs = $enregistrements[$images_pour_obs["obs_pos"]];
501
	    $id_obs = $lastid // dernier autoinc inséré
502
		- count($enregistrements) + 1 // correspondrait au premier autoinc
503
		+ $images_pour_obs["obs_pos"]; // ordre d'insertion = ordre dans le tableau $enregistrements (commence à 0)
504
	    foreach($images_pour_obs['images'] as $image) {
505
		$images_obs_assoc[] = sprintf('(%d,%d)',
506
					      $image['id_image'], // intval() useless
507
					      $id_obs); // intval() useless
508
	    }
1636 raphael 509
	}
510
 
1936 raphael 511
	if($images_obs_assoc) {
512
	    $requete = sprintf($images_insert, implode(', ', $images_obs_assoc));
513
	    // debug echo "$requete\n";
514
	    Cel::db()->requeter($requete);
515
	}
1770 raphael 516
 
1936 raphael 517
	return count($images_obs_assoc);
518
    }
1636 raphael 519
 
1936 raphael 520
    /*
521
      Aucune des valeurs présentes dans $enregistrement n'est quotée
522
      cad aucune des valeurs retournée par traiter{Espece|Localisation}()
523
      car ce tableau est passé à un PDO::preparedStatement() qui applique
524
      proprement les règle d'échappement.
525
    */
526
    static function chargerLigne($ligne, $dernier_ordre, $cel) {
527
	// évite des notices d'index lors des trigger_error()
528
	$ref_ligne = !empty($ligne[C_NOM_SEL]) ? trim($ligne[C_NOM_SEL]) : '';
1636 raphael 529
 
1936 raphael 530
	// en premier car le résultat est utile pour
531
	// * traiter espèce (traiterEspece())
532
	// * traiter longitude et latitude (traiterLonLat())
533
	$referentiel = self::identReferentiel(trim(strtolower(@$ligne[C_NOM_REFERENTIEL])), $ligne, $ref_ligne);
1914 raphael 534
 
1936 raphael 535
	// $espece est rempli de plusieurs informations
536
	$espece = Array(C_NOM_SEL => NULL, C_NOM_SEL_NN => NULL, C_NOM_RET => NULL,
537
			C_NOM_RET_NN => NULL, C_NT => NULL, C_FAMILLE => NULL);
538
	self::traiterEspece($ligne, $espece, $referentiel, $cel->taxon_info_webservice);
1636 raphael 539
 
1936 raphael 540
	if(!$espece[C_NOM_SEL]) $referentiel = Cel::$fallback_referentiel;
541
	if($espece[C_NOM_SEL] && !$espece[C_NOM_SEL_NN]) $referentiel = Cel::$fallback_referentiel;
1649 raphael 542
 
1936 raphael 543
	// $localisation est rempli à partir de plusieurs champs: C_ZONE_GEO et C_CE_ZONE_GEO
544
	$localisation = Array(C_ZONE_GEO => NULL, C_CE_ZONE_GEO => NULL);
545
	self::traiterLocalisation($ligne, $localisation);
1649 raphael 546
 
1936 raphael 547
	// $transmission est utilisé pour date_transmission
548
	// XXX: @ contre "Undefined index"
549
	@$transmission = in_array(strtolower(trim($ligne[C_TRANSMISSION])), array(1, 'oui')) ? 1 : 0;
1640 raphael 550
 
551
 
1936 raphael 552
	// Dans ce tableau, seules devraient apparaître les données variable pour chaque ligne.
553
	// Dans ce tableau, l'ordre des clefs n'importe pas (cf: self::sortArrayByArray())
554
	$enregistrement = Array(
555
	    "ordre" => $dernier_ordre,
1640 raphael 556
 
1936 raphael 557
	    "nom_sel" => $espece[C_NOM_SEL],
558
	    "nom_sel_nn" => $espece[C_NOM_SEL_NN],
559
	    "nom_ret" => $espece[C_NOM_RET],
560
	    "nom_ret_nn" => $espece[C_NOM_RET_NN],
561
	    "nt" => $espece[C_NT],
562
	    "famille" => $espece[C_FAMILLE],
1640 raphael 563
 
1936 raphael 564
	    "nom_referentiel" => $referentiel,
1640 raphael 565
 
1936 raphael 566
	    "zone_geo" => $localisation[C_ZONE_GEO],
567
	    "ce_zone_geo" => $localisation[C_CE_ZONE_GEO],
1642 raphael 568
 
1936 raphael 569
	    // $ligne: uniquement pour les infos en cas de gestion d'erreurs (date incompréhensible)
570
	    "date_observation" => isset($ligne[C_DATE_OBSERVATION]) ? self::traiterDateObs($ligne[C_DATE_OBSERVATION], $ref_ligne) : NULL,
1642 raphael 571
 
1936 raphael 572
	    "lieudit" => isset($ligne[C_LIEUDIT]) ? trim($ligne[C_LIEUDIT]) : NULL,
573
	    "station" => isset($ligne[C_STATION]) ? trim($ligne[C_STATION]) : NULL,
574
	    "milieu" => isset($ligne[C_MILIEU]) ? trim($ligne[C_MILIEU]) : NULL,
1642 raphael 575
 
1936 raphael 576
	    "mots_cles_texte" => NULL, // TODO: foreign-key
577
	    // XXX: @ contre "Undefined index"
578
	    "commentaire" => isset($ligne[C_COMMENTAIRE]) ? trim($ligne[C_COMMENTAIRE]) : NULL,
1648 raphael 579
 
1936 raphael 580
	    "transmission" => $transmission,
581
	    "date_transmission" => $transmission ? date("Y-m-d H:i:s") : NULL, // pas de fonction SQL dans un PDO statement, <=> now()
1648 raphael 582
 
1936 raphael 583
	    // $ligne: uniquement pour les infos en cas de gestion d'erreurs (lon/lat incompréhensible)
584
	    "latitude" => isset($ligne[C_LATITUDE]) ? self::traiterLonLat(NULL, $ligne[C_LATITUDE], $referentiel, $ref_ligne) : NULL,
585
	    "longitude" => isset($ligne[C_LONGITUDE]) ? self::traiterLonLat($ligne[C_LONGITUDE], NULL, $referentiel, $ref_ligne) : NULL,
586
	    "altitude" => isset($ligne[C_ALTITUDE]) ? intval($ligne[C_ALTITUDE]) : NULL, // TODO: guess alt from lon/lat
1642 raphael 587
 
1936 raphael 588
	    // @ car potentiellement optionnelles ou toutes vides => pas d'index dans PHPExcel (tableau optimisé)
589
	    "abondance" => @$ligne[C_ABONDANCE],
590
	    "certitude" => @$ligne[C_CERTITUDE],
591
	    "phenologie" => @$ligne[C_PHENOLOGIE],
1642 raphael 592
 
1936 raphael 593
	    "code_insee_calcule" => substr($localisation[C_CE_ZONE_GEO], -5) // varchar(5)
594
	);
1677 raphael 595
 
1936 raphael 596
	// passage de $enregistrement par référence, ainsi ['_images'] n'est défini
597
	// que si des résultats sont trouvés
598
	// "@" car PHPExcel supprime les colonnes null sur toute la feuille (ou tout le chunk)
599
	if(@$ligne[C_IMAGES]) self::traiterImage($ligne[C_IMAGES], $cel->id_utilisateur, $enregistrement);
1636 raphael 600
 
1936 raphael 601
	if(@$ligne[C_MOTS_CLES_TEXTE]) self::traiterMotsCle($ligne[C_MOTS_CLES_TEXTE], $cel->id_utilisateur, $enregistrement);
1675 raphael 602
 
1936 raphael 603
	return $enregistrement;
604
    }
1640 raphael 605
 
1936 raphael 606
    static function traiterImage($str, $id_utilisateur, &$enregistrement) {
607
	$liste_images = array_filter(explode("/", $str));
1640 raphael 608
 
1936 raphael 609
	//array_walk($liste_images, '__anonyme_4');
610
	array_walk($liste_images, array(__CLASS__, '__anonyme_4'));
611
	$requete = sprintf(
612
	    "SELECT id_image, nom_original FROM cel_images WHERE ce_utilisateur = %d AND nom_original IN (%s)",
613
	    $id_utilisateur,
614
	    implode(',', $liste_images));
1642 raphael 615
 
1936 raphael 616
	$resultat = Cel::db()->requeter($requete);
1678 raphael 617
 
1936 raphael 618
	if($resultat) $enregistrement['_images'] = $resultat;
619
    }
1642 raphael 620
 
1936 raphael 621
    static function traiterMotsCle($str, $id_utilisateur, &$enregistrement) {
622
	$liste_mots_cle = $liste_mots_cle_recherche = array_map("trim", array_unique(array_filter(explode(",", $str))));
623
	array_walk($liste_mots_cle_recherche, array(__CLASS__, '__anonyme_4'));
1677 raphael 624
 
1936 raphael 625
	// TODO!!!! remplace > (pour les tests uniquement) par un = et supprimer le group by mot_cle
626
	$requete = sprintf("SELECT id_mot_cle_obs, mot_cle FROM cel_mots_cles_obs WHERE id_utilisateur > %d ".
627
			   "AND mot_cle IN (%s) ".
628
			   "GROUP BY mot_cle",
629
			   $id_utilisateur,
630
			   implode(',', $liste_mots_cle_recherche));
1677 raphael 631
 
1936 raphael 632
	$resultat_sql = Cel::db()->requeter($requete);
633
	if(!$resultat_sql) return;
1677 raphael 634
 
1936 raphael 635
	$resultat = array();
636
	foreach($resultat_sql as $v) $resultat[$v['id_mot_cle_obs']] = $v['mot_cle'];
1677 raphael 637
 
1936 raphael 638
	$enregistrement['mots_cles_texte'] = implode(',', $liste_mots_cle);
639
	$enregistrement['_mots_cle'] = array("existing" => $resultat,
640
					     "to_insert" => array_diff($liste_mots_cle, $resultat));
641
    }
1640 raphael 642
 
1770 raphael 643
 
1936 raphael 644
    /* FONCTIONS de TRANSFORMATION de VALEUR DE CELLULE */
1640 raphael 645
 
1936 raphael 646
    // TODO: PHP 5.3, utiliser date_parse_from_format()
647
    // TODO: parser les heures (cf product-owner)
648
    // TODO: passer par le timestamp pour s'assurer de la validité
649
    static function traiterDateObs($date, $ref_ligne) {
650
	// TODO: see https://github.com/PHPOffice/PHPExcel/issues/208
651
	// TODO: PHPExcel_Shared_Date::ExcelToPHP()
652
	if(is_double($date)) {
653
	    if($date > 0)
654
		return PHPExcel_Style_NumberFormat::toFormattedString($date, PHPExcel_Style_NumberFormat::FORMAT_DATE_YYYYMMDD2) . " 00:00:00";
655
	    trigger_error("ligne \"{$ref_ligne}\": " .
656
			  "Attention: date antérieure à 1970 et format de cellule \"DATE\" utilisés ensemble",
657
			  E_USER_NOTICE);
1640 raphael 658
 
1936 raphael 659
	    // throw new Exception("erreur: date antérieure à 1970 et format de cellule \"DATE\" utilisés ensemble");
1640 raphael 660
 
1936 raphael 661
	    // attention, UNIX timestamp, car Excel les décompte depuis 1900
662
	    // cf http://fczaja.blogspot.fr/2011/06/convert-excel-date-into-timestamp.html
663
	    // $timestamp = ($date - MIN_DATES_DIFF) * 60 * 60 * 24 - time(); // NON
1636 raphael 664
 
1936 raphael 665
	    // $timestamp = PHPExcel_Calculation::getInstance()->calculateFormula("=" . $date . "-DATE(1970,1,1)*60*60*24"); // NON
1642 raphael 666
 
1936 raphael 667
	    // echo strftime("%Y/%m/%d 00:00:00", $timestamp); // NON
668
	}
669
	else {
670
	    // attend l'un des formats de
671
	    // http://www.php.net/manual/fr/datetime.formats.date.php
672
	    // le plus simple: YYYY/MM/DD (utilisé à l'export), mais DD-MM-YYYY est aussi supporté
673
	    $matches = NULL;
674
	    // et on essaie d'être sympa et supporter aussi DD/MM/YYYY
675
	    if(preg_match(';^([0-3]?\d)/([01]\d)/([12]\d\d\d)$;', $date, $matches)) {
676
		$date = $matches[3] . '/' . $matches[2] . '/' . $matches[1];
677
	    }
678
	    $timestamp = strtotime($date);
679
	    if(! $timestamp || $timestamp > time() + 3600 * 24 * 1) { // une journée d'avance maxi autorisée (décallage horaire ?)
680
		if($date) trigger_error("ligne \"{$ref_ligne}\": Attention: date erronée ($date)", E_USER_NOTICE);
1640 raphael 681
		return NULL;
1936 raphael 682
	    }
683
	    return strftime("%Y-%m-%d 00:00:00", $timestamp);
1636 raphael 684
	}
1936 raphael 685
    }
1636 raphael 686
 
1936 raphael 687
    static function identReferentiel($referentiel, $ligne, $ref_ligne) {
688
	// SELECT DISTINCT nom_referentiel, COUNT(id_observation) AS count FROM cel_obs GROUP BY nom_referentiel ORDER BY count DESC;
689
	if(strpos($referentiel, 'bdtfx') !== FALSE) return 'bdtfx'; //:v1.01';
690
	if(strpos($referentiel, 'bdtxa') !== FALSE) return 'bdtxa'; //:v1.00';
691
	//if(strpos($referentiel, 'bdnff') !== FALSE) return 'bdnff'; //:4.02';
692
	if(strpos($referentiel, 'bdnff') !== FALSE) return 'bdtfx';
693
	if(strpos($referentiel, 'isfan') !== FALSE) return 'isfan'; //:v1.00';
694
	if(strpos($referentiel, 'autre') !== FALSE) return 'autre';
1640 raphael 695
 
1936 raphael 696
	if($referentiel && isset($ligne[C_NOM_SEL]) && $ligne[C_NOM_SEL]) {
697
	    trigger_error("ligne \"{$ref_ligne}\": Attention: référentiel \"{$referentiel}\" inconnu", E_USER_NOTICE);
698
	    return 'autre';
699
	}
1642 raphael 700
 
1936 raphael 701
	// pas de référentiel ou pas de NOM_SEL: NULL
702
	return NULL;
703
	/* TODO: cf story,
704
	   En cas de NULL faire une seconde passe de détection à partir du nom saisi
705
	   + accepter les n° de version */
706
    }
1642 raphael 707
 
1936 raphael 708
    static function traiterLonLat($lon = NULL, $lat = NULL, $referentiel = 'bdtfx', $ref_ligne) {
709
	// en CSV ces valeurs sont des string, avec séparateur en français (","; cf défauts dans ExportXLS)
710
	if($lon && is_string($lon)) $lon = str_replace(',', '.', $lon);
711
	if($lat && is_string($lat)) $lat = str_replace(',', '.', $lat);
1640 raphael 712
 
1936 raphael 713
	// sprintf applique une précision à 5 décimale (comme le ferait MySQL)
714
	// tout en uniformisant le format de séparateur des décimales (le ".")
715
	if($lon && is_numeric($lon) && $lon >= -180 && $lon <= 180) return sprintf('%.5F', $lon);
716
	if($lat && is_numeric($lat) && $lat >= -90 && $lat <= 90) return sprintf('%.5F', $lat);
717
 
718
	if($lon || $lat) {
719
	    trigger_error("ligne \"{$ref_ligne}\": " .
720
			  "Attention: longitude ou latitude erronée",
721
			  E_USER_NOTICE);
1636 raphael 722
	}
1936 raphael 723
	return NULL;
1636 raphael 724
 
1936 raphael 725
	/* limite france métropole si bdtfx ? ou bdtxa ? ...
726
	   NON!
727
	   Un taxon d'un référentiel donné peut être théoriquement observé n'importe où sur le globe.
728
	   Il n'y a pas lieu d'effectuer des restriction ici.
729
	   Cependant des erreurs fréquentes (0,0 ou lon/lat inversées) peuvent être détectés ici.
730
	   TODO */
731
	$bbox = self::getReferentielBBox($referentiel);
732
	if(!$bbox) return NULL;
1642 raphael 733
 
1936 raphael 734
	if($lon) {
735
	    if($lon < $bbox['EST'] && $lon > $bbox['OUEST']) return is_numeric($lon) ? $lon : NULL;
736
	    else return NULL;
737
	}
738
	if($lat) {
739
	    if($lat < $bbox['NORD'] && $lat > $bbox['SUD']) return is_numeric($lat) ? $lat : NULL;
740
	    return NULL;
741
	}
742
    }
1651 raphael 743
 
1936 raphael 744
    /*
745
      TODO: s'affranchir du webservice pour la détermination du nom scientifique en s'appuyant sur cel_references,
746
      pour des questions de performances
747
    */
748
    static function traiterEspece($ligne, Array &$espece, &$referentiel, $taxon_info_webservice) {
749
	if(empty($ligne[C_NOM_SEL])) {
750
	    // TODO: nous ne déclarons pas "Numéro nomenclatural" comme colonne importable
751
	    // Nous ne pouvons donc pas tenter d'être sympa sur la détermination par num_nom
752
	    /* if(!empty($ligne[C_NOM_SEL_NN]) && $referentiel != Cel::$fallback_referentiel)
753
	       $ligne[C_NOM_SEL] = $referentiel . ':nn:' . $ligne[C_NOM_SEL_NN];
754
	       else */
755
	    return;
756
	}
1651 raphael 757
 
1936 raphael 758
	// nom_sel reste toujours celui de l'utilisateur
759
	$espece[C_NOM_SEL] = trim($ligne[C_NOM_SEL]);
1640 raphael 760
 
1936 raphael 761
	// XXX/attention, nous ne devrions pas accepter un référentiel absent !
762
	if(!$referentiel) $referentiel = 'bdtfx';
763
	$taxon_info_webservice->setReferentiel($referentiel);
764
	$ascii = iconv('UTF-8', 'ASCII//TRANSLIT', $ligne[C_NOM_SEL]);
1688 raphael 765
 
1936 raphael 766
	// TODO: si empty(C_NOM_SEL) et !empty(C_NOM_SEL_NN) : recherche info à partir de C_NOM_SEL_NN
767
	// echo "rechercherInformationsComplementairesSurNom()\n";
768
	/*
769
	  SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu ,auteur, annee, biblio_origine, nom_sci,auteur  FROM bdtfx_v1_01  WHERE (nom_sci LIKE 'Heliotropium europaeum')  ORDER BY nom_sci ASC	  LIMIT 0, 1
770
	  #
771
	  SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu ,auteur, annee, biblio_origine, nom_sci,auteur  FROM bdtfx_v1_01  WHERE (nom_sci LIKE 'eliotropium euro')  ORDER BY nom_sci ASC   LIMIT 0, 1
772
	  SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu ,auteur, annee, biblio_origine, nom_sci,auteur  FROM bdtfx_v1_01  WHERE (nom_sci LIKE 'eliotropium')	ORDER BY nom_sci ASC   LIMIT 0, 1
773
	  SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu ,auteur, annee, biblio_origine, nom_sci,auteur  FROM bdtfx_v1_01  WHERE (nom_sci LIKE 'eliotropium% euro%')  ORDER BY nom_sci ASC   LIMIT 0, 1
774
	  #
1640 raphael 775
 
1936 raphael 776
	  SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html, auteur, annee, biblio_origine FROM bdtfx_v1_01 WHERE num_nom = 31468
777
	*/
778
	// $determ = $taxon_info_webservice->rechercherInformationsComplementairesSurNom($ligne[C_NOM_SEL]);
779
	// permet une reconnaissance de bdtfx:nn:XXXX
780
	$determ = $taxon_info_webservice->rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax(trim($ligne[C_NOM_SEL]));
1640 raphael 781
 
1936 raphael 782
	// note: rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax peut ne retourner qu'une seule clef "nom_sel"
783
	if (! $determ) {
784
	    // on supprime les noms retenus et renvoi tel quel
785
	    // on réutilise les define pour les noms d'indexes, tant qu'à faire
786
	    // XXX; tout à NULL sauf C_NOM_SEL ci-dessus ?
787
	    $espece[C_NOM_SEL_NN] = @$ligne[C_NOM_SEL_NN];
788
	    $espece[C_NOM_RET] = @$ligne[C_NOM_RET];
789
	    $espece[C_NOM_RET_NN] = @$ligne[C_NOM_RET_NN];
790
	    $espece[C_NT] = @$ligne[C_NT];
791
	    $espece[C_FAMILLE] = @$ligne[C_FAMILLE];
1781 raphael 792
 
1936 raphael 793
	    return;
794
	}
1781 raphael 795
 
1936 raphael 796
	// succès de la détection, mais résultat partiel
797
	if(!isset($determ->id))
798
	    $determ = $taxon_info_webservice->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($determ->{"nom_retenu.id"});
1784 raphael 799
 
1936 raphael 800
	// ne devrait jamais arriver !
801
	if(!$determ) die("erreur critique: " . __FILE__ . ':' . __LINE__);
1784 raphael 802
 
1936 raphael 803
	// un schéma <ref>:(nt|nn):<num> (ie: bdtfx:nt:8503) a été passé
804
	// dans ce cas on met à jour le référentiel avec celui passé dans le champ espèce
805
	if(isset($determ->ref)) {
806
	    $referentiel = $determ->ref;
1640 raphael 807
	}
808
 
1936 raphael 809
	// succès de la détection
810
	// nom_sel est remplacé, mais seulement si un motif spécial à été utilisé (bdtfx:nn:4567)
811
	if($taxon_info_webservice->is_notation_spe) {
812
	    $espece[C_NOM_SEL] = $determ->nom_sci;
1688 raphael 813
	}
814
 
1936 raphael 815
	// écrasement des numéros (nomenclatural, taxonomique) saisis...
816
	$espece[C_NOM_SEL_NN] = $determ->id;
817
	$espece[C_NOM_RET] = RechercheInfosTaxonBeta::supprimerBiblio($determ->nom_retenu_complet);
818
	$espece[C_NOM_RET_NN] = $determ->{"nom_retenu.id"};
819
	$espece[C_NT] = $determ->num_taxonomique;
820
	$espece[C_FAMILLE] = $determ->famille;
821
	return;
822
	// et des info complémentaires
1697 raphael 823
 
1797 raphael 824
	/*
1936 raphael 825
	// GET /service:eflore:0.1/bdtfx/noms/31468?retour.champs=nom_sci,auteur,id,nom_retenu_complet,nom_retenu.id,num_taxonomique,famille
826
	/home/raphael/eflore/projets/services/modules/0.1/bdtfx/Noms.php:280
827
	SELECT  *, nom_sci   FROM bdtfx_v1_01	 WHERE num_nom = '31468'
828
	SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html, auteur, annee, biblio_origine FROM bdtfx_v1_01 WHERE num_nom = 31468
829
	SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html, auteur, annee, biblio_origine FROM bdtfx_v1_01 WHERE num_nom = 86535
1797 raphael 830
	*/
1770 raphael 831
 
1697 raphael 832
 
1936 raphael 833
	//var_dump($complement, $espece);die;
834
    }
1697 raphael 835
 
1936 raphael 836
    static function detectFromNom($nom) {
837
	$r = Cel::db()->requeter(sprintf("SELECT num_nom, num_tax_sup FROM bdtfx_v1_01 WHERE (nom_sci LIKE '%s') ".
838
					 "ORDER BY nom_sci ASC LIMIT 0, 1",
839
					 Cel::db()->proteger($nom)));
840
	if($r) return $r;
1697 raphael 841
 
1936 raphael 842
	Cel::db()->requeter(sprintf("SELECT num_nom, num_tax_sup FROM bdtfx_v1_01 WHERE (nom_sci LIKE '%s' OR nom LIKE '%s') ".
843
				    "ORDER BY nom_sci ASC LIMIT 0, 1",
844
				    Cel::db()->proteger($nom),
845
				    Cel::db()->proteger(str_replace(' ', '% ', $nom))));
846
	return $r;
847
    }
1697 raphael 848
 
849
 
1936 raphael 850
    /*
851
     * TODO: analyse rigoureuse:
852
     * == Identifiant Commune
853
     * - INSEE-C:\d{5}
854
     * - \d{5}
855
     * - \d{2}
856
     * == Commune
857
     * - \w+ (\d{2})
858
     * - \w+ (\d{5})
859
     * - \w+
860
     *
861
     */
862
    static function traiterLocalisation($ligne, Array &$localisation) {
863
	if(empty($ligne[C_ZONE_GEO])) $ligne[C_ZONE_GEO] = NULL;
864
	if(empty($ligne[C_CE_ZONE_GEO])) $ligne[C_CE_ZONE_GEO] = NULL;
1697 raphael 865
 
1936 raphael 866
	$identifiant_commune = trim($ligne[C_ZONE_GEO]);
867
	if(!$identifiant_commune) {
868
	    $departement = trim($ligne[C_CE_ZONE_GEO]);
869
 
870
	    if(strpos($departement, "INSEE-C:", 0) === 0) {
871
		$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = trim($ligne[C_CE_ZONE_GEO]);
872
		if(array_key_exists($localisation[C_CE_ZONE_GEO], self::$cache['geo'])) {
873
		    $localisation[C_ZONE_GEO] = self::$cache['geo'][$localisation[C_CE_ZONE_GEO]];
1697 raphael 874
		}
875
		else {
1936 raphael 876
		    $nom = Cel::db()->requeter(sprintf("SELECT nom FROM cel_zones_geo WHERE code = %s LIMIT 1",
877
						       self::quoteNonNull(substr($localisation[C_CE_ZONE_GEO], strlen("INSEE-C:")))));
878
		    if($nom) $localisation[C_ZONE_GEO] = $nom[0]['nom'];
879
		    self::$cache['geo'][$localisation[C_CE_ZONE_GEO]] = @$nom[0]['nom'];
1697 raphael 880
		}
1936 raphael 881
		return;
882
	    }
1697 raphael 883
 
1936 raphael 884
	    if(!is_numeric($departement)) {
885
		$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $ligne[C_CE_ZONE_GEO];
886
		return;
887
	    }
888
 
889
	    $cache_attempted = FALSE;
890
	    if(array_key_exists($departement, self::$cache['geo'])) {
891
		$cache_attempted = TRUE;
892
		if(self::$cache['geo'][$departement][0] && self::$cache['geo'][$departement][1]) {
893
		    $localisation[C_ZONE_GEO] = self::$cache['geo'][$departement][0];
894
		    $localisation[C_CE_ZONE_GEO] = self::$cache['geo'][$departement][1];
895
		    return;
1697 raphael 896
		}
1936 raphael 897
	    }
1697 raphael 898
 
1936 raphael 899
	    if(! $cache_attempted && ($resultat_commune = Cel::db()->requeter(sprintf("SELECT DISTINCT nom, CONCAT('INSEE-C:', code) AS code FROM cel_zones_geo WHERE code = %s LIMIT 1",
900
										      self::quoteNonNull($departement)))) ) {
901
		$localisation[C_ZONE_GEO] = $resultat_commune[0]['nom'];
902
		$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $resultat_commune[0]['code'];
903
		self::$cache['geo'][$departement] = array($resultat_commune[0]['nom'], $resultat_commune[0]['code']);
904
		return;
905
	    }
906
	    ;
907
	    // if(strlen($departement) == 4) $departement = "INSEE-C:0" . $departement;
908
	    // if(strlen($departement) == 5) $departement = "INSEE-C:" . $departement;
909
	    // if(strlen($departement) <= 9) return "INSEE-C:0" . $departement; // ? ... TODO
1697 raphael 910
 
1936 raphael 911
	    $departement = trim($departement); // TODO
1697 raphael 912
 
1936 raphael 913
	    $localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $ligne[C_CE_ZONE_GEO];
914
	    return;
915
	}
1697 raphael 916
 
917
 
1936 raphael 918
	$select = "SELECT DISTINCT nom, code FROM cel_zones_geo";
919
 
920
	if (preg_match('/(.+) \((\d{1,5})\)/', $identifiant_commune, $elements)) {
921
	    // commune + departement : montpellier (34)
922
	    $nom_commune=$elements[1];
923
	    $code_commune=$elements[2];
924
	    if(strlen($code_commune) <= 2) {
925
		$requete = sprintf("%s WHERE nom = %s AND code LIKE %s",
926
				   $select, self::quoteNonNull($nom_commune),
927
				   self::quoteNonNull($code_commune.'%'));
928
	    }
929
	    else {
930
		$requete = sprintf("%s WHERE nom = %s AND code = %d",
931
				   $select, self::quoteNonNull($nom_commune),
932
				   $code_commune);
933
	    }
934
	}
935
	elseif (preg_match('/^(\d+|(2[ab]\d+))$/i', $identifiant_commune, $elements)) {
936
	    // Code insee seul
937
	    $code_insee_commune=$elements[1];
938
	    $requete = sprintf("%s WHERE code = %s", $select, self::quoteNonNull($code_insee_commune));
939
	}
940
	else {
941
	    // Commune seule (le departement sera recupere dans la colonne departement si elle est presente)
942
	    // on prend le risque ici de retourner une mauvaise Commune
943
	    $nom_commune = str_replace(" ", "%", iconv('UTF-8', 'ASCII//TRANSLIT', $identifiant_commune));
944
	    $requete = sprintf("%s WHERE nom LIKE %s", $select, self::quoteNonNull($nom_commune.'%'));
945
	}
1697 raphael 946
 
947
 
1936 raphael 948
	if(array_key_exists($identifiant_commune, self::$cache['geo'])) {
949
	    $resultat_commune = self::$cache['geo'][$identifiant_commune];
1697 raphael 950
	}
1936 raphael 951
	else {
952
	    $resultat_commune = Cel::db()->requeter($requete);
953
	    self::$cache['geo'][$identifiant_commune] = $resultat_commune;
954
	}
955
	// TODO: levenstein sort ?
956
	// TODO: count résultat !
1697 raphael 957
 
1936 raphael 958
	// cas de la commune introuvable dans le référentiel
959
	// réinitialisation aux valeurs du fichier XLS
960
	if(! $resultat_commune) {
961
	    $localisation[C_ZONE_GEO] = trim($ligne[C_ZONE_GEO]);
962
	    $localisation[C_CE_ZONE_GEO] = trim($ligne[C_CE_ZONE_GEO]);
963
	} else {
964
	    $localisation[C_ZONE_GEO] = $resultat_commune[0]['nom'];
965
	    $localisation[C_CE_ZONE_GEO] = "INSEE-C:" . $resultat_commune[0]['code'];
966
	    return;
967
	}
1642 raphael 968
 
1936 raphael 969
	$departement = &$localisation[C_CE_ZONE_GEO];
1642 raphael 970
 
1936 raphael 971
	if(strpos($departement, "INSEE-C:", 0) === 0) {
972
	    $localisation[C_ZONE_GEO] = $localisation[C_ZONE_GEO];
973
	    $localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $localisation[C_CE_ZONE_GEO];
974
	}
975
 
976
 
977
	if(!is_numeric($departement)) {
978
	    $localisation[C_ZONE_GEO] = $localisation[C_ZONE_GEO];
979
	    $localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $localisation[C_CE_ZONE_GEO];
980
	}
981
 
982
	if(strlen($departement) == 4) $departement = "INSEE-C:0" . $departement;
983
	if(strlen($departement) == 5) $departement = "INSEE-C:" . $departement;
984
	// if(strlen($departement) <= 9) return "INSEE-C:0" . $departement; // ? ... TODO
985
 
986
	$departement = trim($departement); // TODO
987
 
988
	$localisation[C_ZONE_GEO] = $localisation[C_ZONE_GEO];
989
	$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $localisation[C_CE_ZONE_GEO];
990
    }
991
 
992
    /*
993
      static function traiterLocalisation($ligne, Array &$localisation) {
994
      $identifiant_commune = trim($ligne[C_ZONE_GEO]);
995
      if(!$identifiant_commune) {
996
      $departement = trim($ligne[C_CE_ZONE_GEO]);
997
      goto testdepartement;
998
      }
999
 
1000
 
1001
      $select = "SELECT DISTINCT nom, code  FROM cel_zones_geo";
1642 raphael 1002
 
1936 raphael 1003
      if (preg_match('/(.*) \((\d+)\)/', $identifiant_commune, $elements)) {
1004
      // commune + departement : montpellier (34)
1005
      $nom_commune=$elements[1];
1006
      $code_commune=$elements[2];
1007
      $requete = sprintf("%s WHERE nom = %s AND code LIKE %s",
1008
      $select, self::quoteNonNull($nom_commune), self::quoteNonNull($code_commune.'%'));
1009
      }
1010
      elseif (preg_match('/^(\d+|(2[ab]\d+))$/i', $identifiant_commune, $elements)) {
1011
      // Code insee seul
1012
      $code_insee_commune=$elements[1];
1013
      $requete = sprintf("%s WHERE code = %s", $select, self::quoteNonNull($code_insee_commune));
1014
      }
1015
      else {
1016
      // Commune seule (le departement sera recupere dans la colonne departement si elle est presente)
1017
      // on prend le risque ici de retourner une mauvaise Commune
1018
      $nom_commune = str_replace(" ", "%", iconv('UTF-8', 'ASCII//TRANSLIT', $identifiant_commune));
1019
      $requete = sprintf("%s WHERE nom LIKE %s", $select, self::quoteNonNull($nom_commune.'%'));
1020
      }
1642 raphael 1021
 
1936 raphael 1022
      $resultat_commune = Cel::db()->requeter($requete);
1023
      // TODO: levenstein sort ?
1642 raphael 1024
 
1936 raphael 1025
      // cas de la commune introuvable dans le référentiel
1026
      // réinitialisation aux valeurs du fichier XLS
1027
      if(! $resultat_commune) {
1028
      $localisation[C_ZONE_GEO] = trim($ligne[C_ZONE_GEO]);
1029
      $localisation[C_CE_ZONE_GEO] = trim($ligne[C_CE_ZONE_GEO]);
1030
      } else {
1031
      $localisation[C_ZONE_GEO] = $resultat_commune[0]['nom'];
1032
      $localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $resultat_commune[0]['code'];
1033
      }
1642 raphael 1034
 
1936 raphael 1035
      $departement = &$localisation[C_CE_ZONE_GEO];
1642 raphael 1036
 
1936 raphael 1037
      testdepartement:
1038
      if(strpos($departement, "INSEE-C:", 0) === 0) goto protectloc;
1642 raphael 1039
 
1936 raphael 1040
      if(!is_numeric($departement)) goto protectloc; // TODO ?
1041
      if(strlen($departement) == 4) $departement = "INSEE-C:0" . $departement;
1042
      if(strlen($departement) == 5) $departement = "INSEE-C:" . $departement;
1043
      // if(strlen($departement) <= 9) return "INSEE-C:0" . $departement; // ? ... TODO
1642 raphael 1044
 
1936 raphael 1045
      $departement = trim($departement); // TODO
1642 raphael 1046
 
1936 raphael 1047
      protectloc:
1048
      $localisation[C_ZONE_GEO] = $localisation[C_ZONE_GEO];
1049
      $localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $localisation[C_CE_ZONE_GEO];
1050
      }
1051
    */
1640 raphael 1052
 
1053
 
1936 raphael 1054
    /* HELPERS */
1640 raphael 1055
 
1936 raphael 1056
    // http://stackoverflow.com/questions/348410/sort-an-array-based-on-another-array
1057
    // XXX; utilisé aussi (temporairement ?) par FormateurGroupeColonne.
1058
    static function sortArrayByArray($array, $orderArray) {
1059
	$ordered = array();
1060
	foreach($orderArray as $key) {
1061
	    if(array_key_exists($key, $array)) {
1062
		$ordered[$key] = $array[$key];
1063
		unset($array[$key]);
1064
	    }
1636 raphael 1065
	}
1936 raphael 1066
	return $ordered + $array;
1067
    }
1640 raphael 1068
 
1936 raphael 1069
    // retourne une BBox [N,S,E,O) pour un référentiel donné
1070
    static function getReferentielBBox($referentiel) {
1071
	if($referentiel == 'bdtfx') return Array(
1072
	    'NORD' => 51.2, // Dunkerque
1073
	    'SUD' => 41.3, // Bonifacio
1074
	    'EST' => 9.7, // Corse
1075
	    'OUEST' => -5.2); // Ouessan
1076
	return FALSE;
1077
    }
1640 raphael 1078
 
1936 raphael 1079
    // ces valeurs ne sont pas inséré via les placeholders du PDO::preparedStatement
1080
    // et doivent donc être échappées correctement.
1081
    public function initialiser_colonnes_statiques() {
1082
	$this->colonnes_statiques = array_merge($this->colonnes_statiques,
1083
						Array(
1084
						    "ce_utilisateur" => self::quoteNonNull($this->id_utilisateur), // peut-être un hash ou un id
1085
						    "prenom_utilisateur" => self::quoteNonNull($this->utilisateur['prenom']),
1086
						    "nom_utilisateur" => self::quoteNonNull($this->utilisateur['nom']),
1087
						    "courriel_utilisateur" => self::quoteNonNull($this->utilisateur['courriel']),
1088
						));
1640 raphael 1089
 
1936 raphael 1090
    }
1642 raphael 1091
 
1936 raphael 1092
    static function initialiser_pdo_ordered_statements($colonnes_statiques) {
1093
	return Array(
1094
	    // insert_ligne_pattern_ordre
1095
	    sprintf('INSERT INTO cel_obs (%s, %s) VALUES',
1096
		    implode(', ', array_keys($colonnes_statiques)),
1097
		    implode(', ', array_diff(self::$ordre_BDD, array_keys($colonnes_statiques)))),
1649 raphael 1098
 
1936 raphael 1099
	    // insert_ligne_pattern_ordre
1100
	    sprintf('(%s, %s ?)',
1101
		    implode(', ', $colonnes_statiques),
1102
		    str_repeat('?, ', count(self::$ordre_BDD) - count($colonnes_statiques) - 1))
1103
	);
1104
    }
1648 raphael 1105
 
1936 raphael 1106
    static function initialiser_pdo_statements($colonnes_statiques) {
1107
	return Array(
1108
	    // insert_prefix
1109
	    sprintf('INSERT INTO cel_obs (%s) VALUES ',
1110
		    implode(', ', self::$ordre_BDD)),
1649 raphael 1111
 
1650 raphael 1112
 
1936 raphael 1113
	    // insert_ligne_pattern, cf: self::$insert_ligne_pattern
1114
	    '(' .
1115
	    // 3) créé une chaîne de liste de champ à inséré en DB
1116
	    implode(', ', array_values(
1117
		// 2) garde les valeurs fixes (de $colonnes_statiques),
1118
		// mais remplace les NULL par des "?"
1119
		array_map('__anonyme_5',
1120
			  // 1) créé un tableau genre (nom_sel_nn => NULL) depuis self::$ordre_BDD
1121
			  // et écrase certaines valeurs avec $colonnes_statiques (initilisé avec les données utilisateur)
1122
			  array_merge(array_map('__anonyme_6', array_flip(self::$ordre_BDD)), $colonnes_statiques
1123
			  )))) .
1124
	    ')'
1125
	);
1126
    }
1649 raphael 1127
 
1936 raphael 1128
    // équivalent à Bdd2->proteger() (qui wrap PDO::quote),
1129
    // sans transformer NULL en ""
1130
    static function quoteNonNull($chaine) {
1131
	if(is_null($chaine)) return "NULL";
1132
	if(!is_string($chaine) && !is_integer($chaine)) {
1133
	    die("erreur: " . __FILE__ . ':' . __LINE__);
1642 raphael 1134
	}
1936 raphael 1135
	return Cel::db()->quote($chaine);
1136
    }
1642 raphael 1137
 
1936 raphael 1138
    public function erreurs_stock($errno, $errstr) {
1139
	$this->bilan[] = $errstr;
1140
    }
1636 raphael 1141
}