448 |
david |
1 |
<?php
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2462 |
jpm |
2 |
// declare(encoding='UTF-8');
|
448 |
david |
3 |
/**
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2462 |
jpm |
4 |
* Classe abstraite mettant en comun des expressions régulière pour le découpage des noms latins.
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5 |
*
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6 |
* @internal Mininum PHP version : 5.2
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7 |
* @category CEL
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8 |
* @package Services
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9 |
* @subpackage Bibliothèques
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10 |
* @version 0.1
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11 |
* @author Mathias CHOUET <mathias@tela-botanica.org>
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12 |
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
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13 |
* @author Aurelien PERONNET <aurelien@tela-botanica.org>
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14 |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
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15 |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
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16 |
* @copyright 1999-2014 Tela Botanica <accueil@tela-botanica.org>
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17 |
*/
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448 |
david |
18 |
abstract class Decoupage {
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2462 |
jpm |
19 |
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20 |
protected $min = '[a-z\x{E0}-\x{FF}\x{153}]';// Lettres minuscules : a à z et à à ÿ et œ
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448 |
david |
21 |
protected $maj = "[A-Z'\x{C0}-\x{DF}\x{152}]";// Lettres majuscules : A à Z, ' et À à ß et Œ
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22 |
protected $hyb = '[+xX]';
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2462 |
jpm |
23 |
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448 |
david |
24 |
protected $SupraSp;// Nom de type suprasp.
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25 |
protected $GenHy;// Hybride intergénérique
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26 |
protected $Gen;// Genre
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27 |
protected $Dou = '(?:\(\?\)|\?)';// Doute
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28 |
protected $Epi_cv;// Epithete de cultivar
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29 |
protected $Epi_nn_hy = '(?:nsp\.|)';// Epithète non nommé hybride
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30 |
protected $Epi_nn = '(?:sp\.[1-9]?|spp\.|)';// Epithète non nommé
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31 |
protected $Epi;// Epithete
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32 |
//------------------------------------------------------------------------------------------------------------//
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33 |
protected $Ran_ig = '[Ss]ect\.|subg(?:en|)\.|ser\.|subser\.';// Rang taxonomique infragénérique de type : sous-genre
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34 |
protected $Ran_ig_gr = 'gr\.';// Rang taxonomique infragénérique de type : groupe
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35 |
protected $Ran_ig_agg = 'agg\.';// Rang taxonomique infragénérique de type : aggrégat
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|
|
36 |
protected $Ran_bo_i1 = 'subsp\.';// Rang taxonomique infraspécifique de niveau 1
|
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37 |
protected $Ran_bo_i2 = 'var\.|subvar\.';// Rang taxonomique infraspécifique de niveau 2
|
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38 |
protected $Ran_bo_i3 = 'f\.|fa\.|fa|forma';// Rang taxonomique infraspécifique de niveau 3
|
|
|
39 |
protected $Ran_bo_i4 = 'race|prole|proles|prol\.';// Rang taxonomique infraspécifique de niveau 4
|
|
|
40 |
protected $Ran_bo;// Rang taxonomique infraspécifique botanique non hybride
|
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|
41 |
protected $Ran_hy_i1 = 'n-subsp\.|\[subsp\.\]|\[n-subsp\.\]';// Rang taxonomique infraspécifique hybride de niveau 1
|
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|
42 |
protected $Ran_hy_i2 = '\[var\.\]|n-var\.|\[n-var\.\]';// Rang taxonomique infraspécifique hybride de niveau 2
|
|
|
43 |
protected $Ran_hy_i3 = '';// Rang taxonomique infraspécifique hybride de niveau 3
|
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44 |
protected $Ran_hy_i4 = 'n-proles\.';// Rang taxonomique infraspécifique hybride de niveau 4
|
|
|
45 |
protected $Ran_hy;// Rang taxonomique infraspécifique hybridre
|
|
|
46 |
protected $Ran_ht = 'convar\.|[cC]v\.';// Rang taxonomique horticole
|
|
|
47 |
protected $Ran;// Rang taxonomique infraspécifique non hybride, hybride et horticole
|
|
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48 |
//------------------------------------------------------------------------------------------------------------//
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|
|
49 |
protected $Ini;// Initiale de prénoms
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|
50 |
protected $Pre;// Prénoms
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51 |
protected $Par = '(?i:de|des|le|la|de la|von|van|st\.|el)';// Particules
|
|
|
52 |
protected $ParSsEs = "(?i:st\.-|d)";// Particules sans espace après
|
|
|
53 |
protected $Nom; // Abreviation d'un nom d'auteur. Le "f." c'est pour "filius" et c'est collé au nom
|
|
|
54 |
protected $NomSpe = '(?:[A-Z]\. (?:DC\.|St\.-Hil\.))|\(?hort\.\)?|al\.';// Prénom + nom spéciaux : "hort." est utilisé comme un nom d'auteur mais cela signifie "des jardins". "DC." est une exception deux majuscule suivi d'un point.
|
|
|
55 |
protected $Int;// Intitulé d'auteurs (Prénom + Nom)
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|
|
56 |
//------------------------------------------------------------------------------------------------------------//
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|
57 |
protected $AutNo;// Intitulé auteur sans "ex", ni "&", ni "et", ni parenthèses
|
|
|
58 |
protected $AutNoTa;// Intitulé auteur sans "ex", ni "&", ni "et" mais avec parenthèses possible pour la nomenclature
|
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59 |
protected $AutEx;// Intitulé auteur avec "ex"
|
|
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60 |
protected $et = '(?:&|et)';
|
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|
61 |
protected $AutExEt;// Intitulé auteur avec "ex" et "&" ou "et"
|
|
|
62 |
protected $AutEt;// Intitulé auteur avec "&" ou "et" et sans parenthèse spécifique à la nomenclature
|
|
|
63 |
protected $AutEtTa;// Intitulé auteur avec "&" ou "et" et avec ou sans parenthèse spécifique à la nomenclature
|
|
|
64 |
protected $AutBib;// Intitulés auteurs pour la biblio
|
|
|
65 |
protected $AutInc = 'AUTEUR\?';// Intitulé auteur spéciaux pouvant être trouvés entre parenthèses
|
|
|
66 |
protected $AutSpe;// Intitulé auteur spéciaux pouvant être trouvés entre parenthèses
|
|
|
67 |
protected $AutSpeSe;// Intitulé auteur spéciaux type "sensu"
|
|
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68 |
protected $AutSpeTa;// Intitulé auteur spéciaux propre à la nomenclature
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69 |
protected $Aut;// Tous les intitulés auteurs possibles
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70 |
protected $Auteur;// Tous les intitulés auteurs possibles
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71 |
//------------------------------------------------------------------------------------------------------------//
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72 |
protected $ComEmend;// Commentaires nomenclaturaux
|
|
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73 |
protected $ComPp = 'p\.p\.';// Commentaires nomenclaturaux
|
|
|
74 |
protected $Com;// Intitulé auteur spéciaux type "sensu"
|
|
|
75 |
protected $ComNom = '\(?(?:hort\. non .*|sensu .*|auct\..*|comb\.\s*(?:nov\.|ined\.)|comb?\.\s*nov\.\s*provis\.|stat\.\s*provis\.|nov\.\s*stat\.|stat\.\s*nov\.|p\.p\.|emend\.)\)?';
|
|
|
76 |
//------------------------------------------------------------------------------------------------------------//
|
|
|
77 |
protected $In;// In auteur
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|
|
78 |
protected $AneMoCo = 'janvier|fevrier|mars|avril|mai|juin|juillet|ao\x{FB}t|septembre|octobre|novembre|decembre'; //Mois devant l'année
|
|
|
79 |
protected $AneMoAb = 'janv\.|f[e\x{E9}]v\.|sept\.|oct\.|d\x{E9}c\.'; //Mois devant l'année
|
|
|
80 |
protected $AneBaSi = '(?:\d{4}|\d{4} ?\?|DATE \?)';// Date
|
|
|
81 |
protected $AneBaCo = '(?:\d{4}-\d{4}|\d{4}-\d{2})';// Date
|
|
|
82 |
protected $AneDo = '\?';// Doute
|
|
|
83 |
protected $AneBa;// Date
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84 |
protected $AneSpe;// Date
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85 |
protected $Ane;// Date
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|
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86 |
//------------------------------------------------------------------------------------------------------------//
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2462 |
jpm |
87 |
// Spécial BDNFF :
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88 |
protected $Date = ' \[.*\]';
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448 |
david |
89 |
protected $Num = '[0-9]|3\*|4\*';# Gestion des numéros de flore
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90 |
protected $NumAuteur;# Gestion des numéros de flore mélangés ou pas au nom d'auteur
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2462 |
jpm |
91 |
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448 |
david |
92 |
//------------------------------------------------------------------------------------------------------------//
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|
|
93 |
protected $BibBa;// Biblio de base : \x{B0} = ° \x{AB}\x{BB} = «» \x{26} = &
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|
|
94 |
protected $Bib;// Biblio de taxon
|
|
|
95 |
protected $BibAu = '.+';// Biblio supplémentaire
|
|
|
96 |
//------------------------------------------------------------------------------------------------------------//
|
|
|
97 |
protected $ErrDet;// Biblio à exclure base
|
|
|
98 |
//------------------------------------------------------------------------------------------------------------//
|
|
|
99 |
protected $HomNon = 'non';// Homonymes à exclure : négation
|
|
|
100 |
protected $HomBa;// Homonymes à exclure base
|
|
|
101 |
protected $Hom;// Homonymes à exclure avec non et nec
|
|
|
102 |
protected $HomCourt;// Homonymes à exclure avec non et nec avec expression régulière plus courte!
|
|
|
103 |
//------------------------------------------------------------------------------------------------------------//
|
|
|
104 |
protected $Inf = '.*';// Informations supplémentaires
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2462 |
jpm |
105 |
|
|
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106 |
public function __construct() {
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448 |
david |
107 |
//mb_internal_encoding('UTF-8');
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108 |
//mb_regex_encoding('UTF-8');
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|
|
109 |
//setlocale(LC_ALL, 'fr-fr');
|
2462 |
jpm |
110 |
|
448 |
david |
111 |
$this->SupraSp = '(?:'.$this->maj.$this->min.'+|'.$this->maj.$this->min.'+-'.$this->maj.$this->min.'+)';// Nom de type suprasp.
|
|
|
112 |
$this->GenHy = "[Xx] $this->SupraSp";// Hybride intergénérique
|
|
|
113 |
$this->Gen = "$this->SupraSp|$this->GenHy";
|
|
|
114 |
$this->Epi_cv = "$this->maj.(?:$this->min|-)+";// Epithete de cultivar
|
|
|
115 |
$this->Epi_nn = $this->Epi_nn.$this->Epi_nn_hy;
|
|
|
116 |
$this->Epi = "(?:(?:$this->min|-|')+|$this->Epi_nn)";// Epithete
|
2462 |
jpm |
117 |
|
|
|
118 |
$this->Ran_ig = $this->Ran_ig.'|'.$this->Ran_ig_gr;
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448 |
david |
119 |
$this->Ran_bo = "$this->Ran_bo_i1|$this->Ran_bo_i2|$this->Ran_bo_i3|$this->Ran_bo_i4";// Rang taxonomique infraspécifique botanique non hybride
|
|
|
120 |
$this->Ran_hy = "$this->Ran_hy_i1|$this->Ran_hy_i2|$this->Ran_hy_i3|$this->Ran_hy_i4";// Rang taxonomique infraspécifique hybridre
|
|
|
121 |
$this->Ran = "(?:$this->Ran_ig|$this->Ran_bo|$this->Ran_hy|$this->Ran_ht)";// Rang taxonomique infraspécifique non hybride, hybride et horticole
|
2462 |
jpm |
122 |
|
|
|
123 |
$this->Ini = '(?:'.$this->maj.'[.]|'.$this->maj.$this->min.'+[.]?)';// Initiale de prénoms
|
448 |
david |
124 |
$this->Pre = $this->Ini.'{1,3}|'.$this->Ini.'[\- ]'.$this->Ini;// Prénoms
|
|
|
125 |
$this->Nom = '(?:'.$this->maj."'".$this->maj.'|'.$this->maj.'|'.$this->maj.$this->min."+'".$this->min.'+)'.$this->min.'*[.]?(?: ?f\.|)';
|
|
|
126 |
$this->Int = "(?:(?:$this->Pre ?|)(?:$this->Par |$this->ParSsEs|)(?:$this->Nom|$this->Nom".'[\- .]'."$this->Nom)|$this->NomSpe)";// Intitulé d'auteurs (Prénom + Nom)
|
2462 |
jpm |
127 |
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448 |
david |
128 |
$this->AutNo = "$this->Int";// Intitulé auteur sans "ex", ni "&", ni "et", ni parenthèses
|
|
|
129 |
$this->AutNoTa = "$this->AutNo|$this->NomSpe $this->Int|\($this->Int\) $this->Int";// Intitulé auteur sans "ex", ni "&", ni "et" mais avec parenthèses possible pour la nomenclature
|
|
|
130 |
$this->AutEx = "\($this->Int\) $this->Int ex $this->Int|\($this->Int ex $this->Int\) $this->Int|$this->Int ex $this->Int";// Intitulé auteur avec "ex"
|
|
|
131 |
$this->AutExEt = "$this->Int $this->et $this->Int ex $this->Int|$this->Int $this->et $this->Int ex $this->Int $this->et $this->Int|$this->Int ex $this->Int $this->et $this->Int|\($this->Int ex $this->Int $this->et $this->Int\) $this->Int|\($this->Int ex $this->Int\) $this->Int $this->et $this->Int|\($this->Int $this->et $this->Int\) $this->Int ex $this->Int|$this->NomSpe $this->Int ex $this->Int";// Intitulé auteur avec "ex" et "&" ou "et"
|
|
|
132 |
$this->AutEt = "$this->Int $this->et $this->Int";// Intitulé auteur avec "&" ou "et" et sans parenthèse spécifique à la nomenclature
|
|
|
133 |
$this->AutEtTa = "\($this->Int\) $this->Int $this->et $this->Int|\($this->Int $this->et $this->Int\) $this->Int|$this->AutEt";// Intitulé auteur avec "&" ou "et" et avec ou sans parenthèse spécifique à la nomenclature
|
|
|
134 |
$this->AutBib = "(?:$this->AutNo|$this->AutEt)";// Intitulés auteurs pour la biblio
|
|
|
135 |
$this->AutSpe = "(?:sensu |)auct\.|auct\. mult\.|$this->AutInc";// Intitulé auteur spéciaux pouvant être trouvés entre parenthèses
|
|
|
136 |
$this->AutSpeSe = "sensu $this->AutBib";// Intitulé auteur spéciaux type "sensu"
|
|
|
137 |
$this->AutSpeTa = "$this->AutSpe|\((?:$this->AutSpe)\)|$this->AutSpeSe";// Intitulé auteur spéciaux propre à la nomenclature
|
|
|
138 |
$this->Aut = "(?:$this->AutExEt|$this->AutEx|$this->AutEtTa|$this->AutSpeTa|$this->AutNoTa)";// Tous les intitulés auteurs possibles
|
|
|
139 |
$this->Auteur = $this->Int.'|'.$this->Int.' '.$this->et.' '.$this->Int.'|(?:'.$this->Int.', )+'.$this->Int.' '.$this->et.' '.$this->Int;// Intitulé auteur avec "&" ou "et";
|
2462 |
jpm |
140 |
|
448 |
david |
141 |
$this->ComEmend = "emend\. $this->AutBib";// Commentaires nomenclaturaux
|
|
|
142 |
$this->Com = "$this->ComEmend|$this->ComPp";// Intitulé auteur spéciaux type "sensu"
|
2462 |
jpm |
143 |
|
448 |
david |
144 |
$this->In = "[iI]n $this->AutBib";// In auteur
|
|
|
145 |
$this->AneBa = "$this->AneBaSi|$this->AneBaCo";// Date
|
|
|
146 |
$this->AneSpe = "(?:$this->AneBa ?\[$this->AneBa\]|(?:$this->AneMoCo|$this->AneMoAb) $this->AneBaSi|$this->AneBaSi $this->AneBaSi)";// Date
|
|
|
147 |
$this->Ane = "$this->AneBa||$this->AneDo|$this->AneSpe";// Date
|
2462 |
jpm |
148 |
|
448 |
david |
149 |
$this->BibBa = "(?:$this->maj$this->min*[.]?|in|hort\.)(?:$this->min*[.]?|[\d\/\- ,()'\x{B0}\x{26}\x{AB}\x{BB}[\]?])*";// Biblio de base : \x{B0} = ° \x{AB}\x{BB} = «» \x{26} = &
|
|
|
150 |
$this->Bib = "([^:]+):(.+?)\(($this->Ane)\)";// Biblio de taxon
|
2462 |
jpm |
151 |
|
448 |
david |
152 |
$this->ErrDet = "($this->AutSpe,? non $this->Aut): ($this->Bib;?)+";// Biblio à exclure base
|
2462 |
jpm |
153 |
|
448 |
david |
154 |
$this->HomBa = "$this->Aut \($this->Ane\)";// Homonymes à exclure base
|
|
|
155 |
$this->Hom = "$this->HomNon $this->HomBa(?: nec $this->HomBa)*?";// Homonymes à exclure avec non et nec
|
|
|
156 |
$this->HomCourt = "$this->HomNon .+?(?: nec .+?)*?";// Homonymes à exclure avec non et nec avec expression régulière plus courte!
|
2462 |
jpm |
157 |
|
448 |
david |
158 |
$this->NumAuteur = $this->Num.'|(?:(?:'.$this->Num.'|'.$this->Auteur.'), )+(?:'.$this->Num.'|'.$this->Auteur.')';# Gestion des numéros de flore mélangés ou pas au nom d'auteur
|
|
|
159 |
}
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2462 |
jpm |
160 |
}
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