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raphael |
1 |
/*
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2 |
Cleanup des observation ayant un nom_ret_nn à 0 (mais un nom_ret défini...):
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3 |
En effet, on peut pour l'instant POSTer $nom_ret, d'où bien souvent nom_sel == nom_ret, cependant nom_ret_nn = 0
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4 |
(pas d'autodétection).
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5 |
Nous pourrions donc les nullifier sans remord, ... mais ...
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890 |
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6 |
nom_ret_nn == 0 est VALIDE (car bdtfx.num_nom_retenu == 0 est "valide", 3960 taxons sont "orphelins" de nom_retenu)
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8 |
1) créer un index pour les jointures:
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828 |
raphael |
9 |
CREATE INDEX i_nom_ret ON `BASESOURCE`.`TABLEBDTFX` (`nom_sci`(8))
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755 |
raphael |
10 |
2) regarder les num_nom_ret orphelins de taxon en BDTFX:
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828 |
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11 |
SELECT * FROM `BASESOURCE`.`TABLEBDTFX` WHERE num_nom_retenu = 0; # 3960
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821 |
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12 |
3) regarder les num_nom_ret orphelins de taxon en BDTXA:
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828 |
raphael |
13 |
SELECT * FROM `BASESOURCE`.`TABLEBDTXA` WHERE num_nom_retenu = 0; # 0
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819 |
raphael |
14 |
4) regarder les orphelins équivalents dans `BASEEDIT`.`cel_obs`:
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828 |
raphael |
15 |
SELECT date_observation, SUBSTRING(nom_sel, 1, 50), nom_ret_nn, nom_ret, b.nom_sci FROM `BASEEDIT`.`cel_obs` c LEFT JOIN `BASESOURCE`.`TABLEBDTFX` b on (c.nom_ret = b.nom_sci) WHERE nom_ret_nn = 0; # 7740
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755 |
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17 |
Donc ceux dont le nom_ret à été POSTé manuellement et qui matchent le nom_sci de BDTFX : on les conserve.
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890 |
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Mais les autres, qui ont un nom_ret probablement erroné et un nom_ret_nn à 0, on NULLify les données car elles seront théoriquement correctement autoregénérées !
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19 |
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20 |
Cela concerne:
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890 |
raphael |
21 |
SELECT date_observation, SUBSTRING(nom_sel, 1, 50), nom_ret_nn, nom_ret, b.nom_sci FROM `BASEEDIT`.`cel_obs` c LEFT JOIN `BASESOURCE`.`TABLEBDTFX` b ON (c.nom_ret = b.nom_sci) WHERE nom_ret_nn = 0
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828 |
raphael |
22 |
AND c.nom_ret != '' AND id_observation NOT IN ( SELECT id_observation FROM `BASEEDIT`.`cel_obs` c, `BASESOURCE`.`TABLEBDTFX` b WHERE c.nom_ret = b.nom_sci AND c.nom_ret_nn = 0 ); # 960
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755 |
raphael |
23 |
*/
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24 |
-- D'où la requête :
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819 |
raphael |
25 |
UPDATE `BASEEDIT`.`cel_obs` SET nom_sel_nn = NULL, nom_ret = NULL, nom_ret_nn = NULL, nt = NULL, famille = NULL WHERE id_observation IN
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828 |
raphael |
26 |
( SELECT id_observation FROM `BASEEDIT`.`cel_obs` c LEFT JOIN `BASESOURCE`.`TABLEBDTFX` b on (c.nom_ret = b.nom_sci) WHERE nom_ret_nn = 0
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27 |
AND c.nom_ret != '' AND id_observation NOT IN ( SELECT id_observation FROM `BASEEDIT`.`cel_obs` c, `BASESOURCE`.`TABLEBDTFX` b WHERE c.nom_ret = b.nom_sci AND c.nom_ret_nn = 0 ) );
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755 |
raphael |
28 |
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29 |
-- TODO
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819 |
raphael |
30 |
-- UPDATE `BASEEDIT`.`cel_obs` SET nom_ret_nn = NULL WHERE nom_ret_nn = 0;
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31 |
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32 |
/*
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819 |
raphael |
33 |
UPDATE `BASEEDIT`.`cel_obs` SET nom_sel = NULL, nom_sel_nn = NULL, nom_ret = NULL, nom_ret_nn = NULL, nt = NULL, famille = NULL,
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34 |
FROM `BASEEDIT`.`cel_obs`
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890 |
raphael |
35 |
WHERE nom_sel IS NULL AND
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raphael |
36 |
(
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37 |
(nom_ret IS NOT NULL AND nom_ret != '') OR
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38 |
(nt IS NOT NULL AND nt != 0 AND nt != '') OR
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39 |
(famille IS NOT NULL AND famille != '')
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40 |
)
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890 |
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42 |
-- pas de test de nullité sur nom_ret_nn qui peut légitimement être NULL
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43 |
(nom_ret_nn IS NOT NULL AND nom_ret_nn != 0 AND nom_ret_nn != '') OR
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755 |
raphael |
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*/
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45 |
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