| 3 |
jpm |
1 |
<?php
|
|
|
2 |
|
|
|
3 |
// declare(encoding='UTF-8');// ou ISO-8859-15
|
|
|
4 |
/**
|
|
|
5 |
* Description :
|
|
|
6 |
* Classe Taxons.php permettant de fournir des informations sur les noms scientifiques retenu.
|
|
|
7 |
* Si l'url finit par /taxons on retourne une liste de noms latin et leurs identifiants (seulement les 100 premeiers noms par défaut).
|
|
|
8 |
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /taxons?param1=val1¶m2=val2&...
|
|
|
9 |
*
|
|
|
10 |
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, recherche, rang, distinct, retour.format, nl.format,
|
|
|
11 |
* nl.structure, navigation.depart et navigation.limite.
|
|
|
12 |
*
|
|
|
13 |
* Encodage en entrée : utf8
|
|
|
14 |
* Encodage en sortie : utf8
|
|
|
15 |
* @package framework-v3
|
|
|
16 |
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
|
|
|
17 |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
|
|
|
18 |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
|
|
|
19 |
* @version 1.0
|
|
|
20 |
* @copyright 1999-${year} Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
|
|
|
21 |
*/
|
|
|
22 |
|
|
|
23 |
|
|
|
24 |
class Taxons extends CommunNomsTaxons {
|
|
|
25 |
|
|
|
26 |
/** Permet de stocker la requete formulée taxons | taxons/#id | taxons/#id/#champ+#champ ...*/
|
|
|
27 |
protected $format_reponse = 'taxons';
|
|
|
28 |
protected $service = 'taxons';
|
|
|
29 |
protected $requete_champ = 'num_nom, nom_sci, num_nom_retenu, num_taxonomique ';
|
|
|
30 |
protected $requete_condition = null;
|
|
|
31 |
protected $requete_group_by = ' ';
|
|
|
32 |
/** Permet de stocker les limite de la requete SQL (par défaut seul les 100 premiers résultats seront retournés).*/
|
|
|
33 |
protected $limite_requete = array('depart' => 0, 'limite' => 100);
|
|
|
34 |
protected $num_nom_taxon; //Stocke le num_nom du nom retenu du num_nom recherché
|
|
|
35 |
protected $presence_num_tax = true;
|
|
|
36 |
|
|
|
37 |
|
|
|
38 |
public function consulter($ressources, $parametres) {
|
|
|
39 |
return parent::consulter($ressources, $parametres);
|
|
|
40 |
}
|
|
|
41 |
|
|
|
42 |
public function traiterParametresSpecifiques() {
|
|
|
43 |
$this->requete_condition[] = 'num_nom = num_nom_retenu';
|
|
|
44 |
|
|
|
45 |
foreach ($this->parametres as $param => $val) {
|
|
|
46 |
switch ($param) {
|
|
|
47 |
case 'masque' :
|
|
|
48 |
$this->ajouterFiltreMasque('nom_sci', $val);
|
|
|
49 |
break;
|
|
|
50 |
case 'masque.nt' :
|
|
|
51 |
$this->requete_condition[] = "num_taxonomique IN ($val)";
|
|
|
52 |
$this->masque[] = "num_tax=$val";
|
|
|
53 |
break;
|
|
|
54 |
case 'masque.rg':
|
|
|
55 |
$this->requete_condition[] = 'rang = '.$this->getBdd()->proteger($val);
|
|
|
56 |
$this->masque[] = "rang=$val";
|
|
|
57 |
break;
|
|
|
58 |
}
|
|
|
59 |
}
|
|
|
60 |
}
|
|
|
61 |
|
|
|
62 |
//------------------------------------------Fonction ressources---------------------------------------------------------------------
|
|
|
63 |
|
|
|
64 |
public function gererNumTax() {
|
|
|
65 |
if (!in_array('num_taxonomique', $this->champs_table)) {
|
|
|
66 |
$this->presence_num_tax = false;
|
|
|
67 |
$this->requete_champ = str_replace(', num_taxonomique ', '', $this->requete_champ);
|
|
|
68 |
} else {
|
|
|
69 |
$this->presence_num_tax = true;
|
|
|
70 |
}
|
|
|
71 |
}
|
|
|
72 |
|
|
|
73 |
public function traiterRessourcesIdentifiant() {
|
|
|
74 |
$this->format_reponse = 'taxons/id';
|
|
|
75 |
$this->traiterRessourceNtId();
|
|
|
76 |
$this->num_nom_taxon = $this->recupererNumNomTaxon(); //on recupere le taxon correspondant au num_nom recherché
|
|
|
77 |
if ($this->entete_http == '') {
|
|
|
78 |
$this->requete_condition[0] = 'num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($this->num_nom_taxon);
|
|
|
79 |
if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {
|
|
|
80 |
//---------------- requete de type taxons/#id/#champ+#champ--------------------------------------
|
|
|
81 |
if ($this->ressources[1] != 'relations') { // SELECT *, nom_sci FROM bftfx_v2_00 WHERE num_nom = X;
|
|
|
82 |
$this->requete_champ = ' *, nom_sci ';
|
|
|
83 |
$this->format_reponse .= '/champ';
|
|
|
84 |
//---------------- requete de type taxons/#id/relations/#relation--------------------------------
|
|
|
85 |
} elseif ($this->ressources[1] == 'relations') {
|
|
|
86 |
$this->traiterRessourceIdRelations();
|
|
|
87 |
} else {
|
|
|
88 |
$e = 'Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : <br/>
|
|
|
89 |
<li> #id/relations </li> <li> #id/#champ+#champ </li> <li> #id/relations </li>
|
|
|
90 |
<li> #id/relations/inferieurs </li> <li> #id/relations/superieurs </li>';
|
|
|
91 |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
|
|
|
92 |
}
|
|
|
93 |
} else { //--------------- requete de type taxons/#id-----------------------------------------------------
|
|
|
94 |
$this->requete_champ = ' *, nom_sci ';
|
|
|
95 |
}
|
|
|
96 |
}
|
|
|
97 |
}
|
|
|
98 |
|
|
|
99 |
public function traiterRessourceNtId() {
|
|
|
100 |
if (strrpos($this->ressources[0], 'nt:') !== false) {
|
|
|
101 |
if ($this->presence_num_tax) {
|
|
|
102 |
// SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = num_nom_retenu AND num_taxonomique = X;
|
| 327 |
delphine |
103 |
$this->requete_condition[0] = ' num_taxonomique = '
|
| 3 |
jpm |
104 |
.str_replace('nt:', '', $this->ressources[0]).' ';
|
|
|
105 |
} else {
|
|
|
106 |
$e = 'Erreur dans votre requête : </br> Le numéro taxonomique n\'existe pas dans ce projet';
|
|
|
107 |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
|
|
|
108 |
}
|
|
|
109 |
} else {
|
|
|
110 |
// SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = (SELECT num_nom_retenu FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
|
| 327 |
delphine |
111 |
$this->requete_condition[0] = 'num_nom = '.$this->ressources[0];
|
| 3 |
jpm |
112 |
}
|
|
|
113 |
}
|
|
|
114 |
|
|
|
115 |
|
|
|
116 |
/** Permet de récupérer le num_nom du taxon recherché. Soit le numéro taxonomique est demandé (avec nt: )
|
|
|
117 |
* soit un num_nom dont on recherche le num_nom_retenu */
|
|
|
118 |
public function recupererNumNomTaxon() {
|
|
|
119 |
$identifiant = '';
|
|
|
120 |
if ($this->entete_http == '') {
|
|
|
121 |
//on récupere l'identifiant du taxon correspondant au num_nom ou num_taxonomique demandé pour pouvoir l'afficher
|
| 327 |
delphine |
122 |
$req_tax = 'SELECT num_nom_retenu FROM '.$this->table.' WHERE '.$this->requete_condition[0];
|
| 740 |
raphael |
123 |
$res_tax = $this->getBdd()->recuperer($req_tax . ' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__ );
|
| 3 |
jpm |
124 |
//on recherche ensuite les identifiants des taxons supérieurs ou inférieurs
|
|
|
125 |
if ($res_tax && $res_tax != '') {
|
| 327 |
delphine |
126 |
$identifiant = $res_tax['num_nom_retenu'];
|
| 3 |
jpm |
127 |
} else {
|
|
|
128 |
$e = 'Le numéro de taxon ou l\'identifiant de nom correspondant au num_nom '
|
|
|
129 |
.$this->ressources[0].' n\'existe pas dans la base.';
|
|
|
130 |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
|
|
|
131 |
Debug::printr($req_tax);
|
|
|
132 |
}
|
|
|
133 |
}
|
|
|
134 |
return $identifiant;
|
|
|
135 |
}
|
|
|
136 |
|
|
|
137 |
public function traiterRessourceIdRelations() {
|
|
|
138 |
//----------------- requete de type taxons/#id/relations-------------------------------------------
|
|
|
139 |
// SELECT *, nom_sci FROM bftfx_v2_00 WHERE num_nom = X;
|
|
|
140 |
$this->format_reponse .= '/relations';
|
|
|
141 |
if (isset($this->ressources[2]) && !empty($this->ressources[2])) {
|
|
|
142 |
//------------- requete de type taxons/#id/relations/#relation--------------------------------
|
|
|
143 |
switch ($this->ressources[2]) {
|
|
|
144 |
case 'superieurs' :
|
|
|
145 |
$rel = 'recupererIdSup';
|
|
|
146 |
$this->format_reponse .= '/superieurs';
|
|
|
147 |
$this->traiterRessourceIdRelationInfSup($rel);
|
|
|
148 |
break;
|
|
|
149 |
case 'inferieurs' :
|
|
|
150 |
$rel = 'recupererIdInf';
|
|
|
151 |
$this->format_reponse .= '/inferieurs';
|
|
|
152 |
$this->traiterRessourceIdRelationInfSup($rel);
|
|
|
153 |
break;
|
| 700 |
aurelien |
154 |
case 'hierarchie' :
|
|
|
155 |
$rel = 'recupererIdHierarchie';
|
|
|
156 |
$this->format_reponse .= '/hierarchie';
|
|
|
157 |
$this->traiterRessourceIdRelationHierarchie($rel);
|
|
|
158 |
break;
|
| 3 |
jpm |
159 |
default :
|
|
|
160 |
$e = 'Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : <br/>
|
|
|
161 |
<li> taxons/#id/relations </li><li> #id/relations/inferieurs </li>
|
|
|
162 |
<li> #id/relations/superieurs </li>';
|
|
|
163 |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
|
|
|
164 |
break;
|
|
|
165 |
}
|
|
|
166 |
}
|
|
|
167 |
}
|
|
|
168 |
|
|
|
169 |
public function traiterRessourceIdRelationInfSup($rel) {
|
|
|
170 |
//Appel de la fct récupérerIdSup ou recupererIdInf : retourne les num_nom des noms inferieurs ou superieurs
|
|
|
171 |
$res_relation = $this->$rel();
|
|
|
172 |
//analyse du résultat retourné par la requete de recherche des identifiants correspondant aux taxons inf|sup :
|
|
|
173 |
if ($res_relation == '') { //dans le cas ou la requete comporte des erreurs
|
| 328 |
delphine |
174 |
$e = 'Fct traiterRessourceIdRelationInfSup : La requête forme comporte une erreur!';
|
| 3 |
jpm |
175 |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
|
|
|
176 |
} elseif ($res_relation) {
|
|
|
177 |
//dans le cas ou une ou plusieurs relations est retournée, on récupère les identifiants ss la forme (id, id, id)
|
|
|
178 |
foreach ($res_relation as $ligne) $res[] = $ligne['num_nom'];
|
|
|
179 |
$res = implode(',',$res);
|
|
|
180 |
$this->requete_condition[0] = "num_nom IN ($res)";
|
|
|
181 |
$this->requete_champ .= ', rang, num_tax_sup ';
|
|
|
182 |
} else { //dans le cas ou aucune relation n'existe
|
|
|
183 |
$res = array($this->num_nom_taxon => null);
|
|
|
184 |
$this->corps_http = json_encode($res);
|
|
|
185 |
$this->entete_http = RestServeur::HTTP_CODE_OK;
|
|
|
186 |
}
|
|
|
187 |
}
|
|
|
188 |
|
| 700 |
aurelien |
189 |
public function traiterRessourceIdRelationHierarchie($rel) {
|
|
|
190 |
//Appel de la fct récupérerIdSup ou recupererIdInf : retourne les num_nom des noms inferieurs ou superieurs
|
|
|
191 |
$res_relation = $this->$rel();
|
|
|
192 |
//analyse du résultat retourné par la requete de recherche des identifiants correspondant aux taxons inf|sup :
|
|
|
193 |
if ($res_relation == '') {
|
|
|
194 |
//dans le cas ou la requete comporte des erreurs
|
|
|
195 |
$e = 'Fct traiterRessourceIdRelationInfSup : La requête forme comporte une erreur!';
|
|
|
196 |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
|
|
|
197 |
} elseif ($res_relation) {
|
|
|
198 |
//dans le cas ou une ou plusieurs relations est retournée, on récupère les identifiants ss la forme (id, id, id)
|
|
|
199 |
foreach ($res_relation as $ligne) $res[] = $ligne['num_nom'];
|
|
|
200 |
$res = implode(',',$res);
|
|
|
201 |
$this->requete_condition[0] = "num_nom IN ($res)";
|
|
|
202 |
$this->requete_champ .= ', rang, num_tax_sup ';
|
|
|
203 |
} else { //dans le cas ou aucune relation n'existe
|
|
|
204 |
$res = array($this->num_nom_taxon => null);
|
|
|
205 |
$this->corps_http = json_encode($res);
|
|
|
206 |
$this->entete_http = RestServeur::HTTP_CODE_OK;
|
|
|
207 |
}
|
|
|
208 |
}
|
|
|
209 |
|
|
|
210 |
public function recupererIdHierarchie() {
|
|
|
211 |
$req_relation = 'SELECT num_nom FROM '.$this->table.' '.
|
|
|
212 |
' WHERE hierarchie LIKE CONCAT('.
|
|
|
213 |
'(SELECT hierarchie FROM '.
|
|
|
214 |
$this->table.' '.
|
|
|
215 |
'WHERE num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($this->num_nom_taxon).')'.
|
|
|
216 |
', '.$this->getBdd()->proteger($this->num_nom_taxon.'-%').
|
|
|
217 |
')';
|
| 740 |
raphael |
218 |
$res_relation = $this->getBdd()->recupererTous($req_relation . ' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__ );
|
| 700 |
aurelien |
219 |
return $res_relation;
|
|
|
220 |
}
|
|
|
221 |
|
| 3 |
jpm |
222 |
public function recupererIdInf() {
|
|
|
223 |
//SELECT num_nom FROM bfdtx_v2_00 WHERE num_tax_sup = (SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
|
|
|
224 |
$req_relation = 'SELECT num_nom FROM '.$this->table
|
| 1039 |
aurelien |
225 |
.' WHERE num_nom = num_nom_retenu AND num_tax_sup = (SELECT num_nom FROM '
|
| 3 |
jpm |
226 |
.$this->table
|
|
|
227 |
.' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition).')';
|
| 740 |
raphael |
228 |
$res_relation = $this->getBdd()->recupererTous($req_relation . ' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__ );
|
| 3 |
jpm |
229 |
return $res_relation;
|
|
|
230 |
}
|
|
|
231 |
|
|
|
232 |
|
|
|
233 |
public function recupererIdSup() {
|
|
|
234 |
//SELECT num_nom FROM bfdtx_v2_00 WHERE num_nom = (SELECT num_tax_sup FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
|
| 1039 |
aurelien |
235 |
$this->requete_condition[] = "num_nom = num_nom_retenu" ;
|
| 327 |
delphine |
236 |
$req_relation = 'SELECT num_tax_sup as num_nom FROM '.$this->table
|
|
|
237 |
.' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
|
| 740 |
raphael |
238 |
$res_relation = $this->getBdd()->recupererTous($req_relation . ' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__ );
|
| 3 |
jpm |
239 |
return $res_relation;
|
|
|
240 |
}
|
|
|
241 |
|
|
|
242 |
|
|
|
243 |
public function traiterRessourceStatsInitiales() {
|
|
|
244 |
// SELECT count(nom_sci) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre FROM bdtfx_v2_00 GROUP BY rang, left(nom_sci, 2);
|
|
|
245 |
$this->format_reponse = 'taxons/stats/initiales';
|
|
|
246 |
$this->requete_champ = 'count(nom_sci) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre ';
|
|
|
247 |
$this->requete_group_by = ' GROUP BY rang, left(nom_sci, 2) ';
|
|
|
248 |
}
|
|
|
249 |
|
|
|
250 |
public function traiterRessourceStatsRangs() {
|
|
|
251 |
// SELECT count(*) as nombre, rang FROM bdtfx_v2_00 [WHERE rang = 290] GROUP BY rang ORDER BY rang;
|
|
|
252 |
$this->format_reponse = 'taxons/stats/rangs';
|
|
|
253 |
$this->requete_champ = 'count(*) as nombre, rang ';
|
|
|
254 |
$this->requete_group_by = ' GROUP BY rang ORDER BY rang ';
|
|
|
255 |
}
|
|
|
256 |
|
|
|
257 |
public function traiterRessourceStatsAnnees() {
|
|
|
258 |
// SELECT count(*) as nombre, annee FROM bdtfx_v2_00 GROUP BY annee ORDER BY annee;
|
|
|
259 |
$this->format_reponse = 'taxons/stats/annees';
|
|
|
260 |
$this->requete_champ = 'count(*) as nombre, annee ';
|
|
|
261 |
$this->requete_group_by = ' GROUP BY annee ORDER BY annee ';
|
|
|
262 |
}
|
|
|
263 |
|
|
|
264 |
|
|
|
265 |
//-----------------------------FONCTIONS DASSEMBLAGE DE LA REQUETE-----------------------------------------------------
|
|
|
266 |
|
| 740 |
raphael |
267 |
public function assemblerLaRequete() {
|
| 3 |
jpm |
268 |
if ($this->format_reponse != 'taxons/stats/initiales') {
|
|
|
269 |
$this->mettreAuFormat(); //on remplace les nom_sci par les nom_sci_html
|
|
|
270 |
}
|
|
|
271 |
$requete = ' SELECT '.$this->requete_champ.
|
|
|
272 |
' FROM '.$this->table
|
|
|
273 |
.$this->retournerRequeteCondition()
|
|
|
274 |
.$this->requete_group_by
|
| 740 |
raphael |
275 |
.$this->formerRequeteLimite() .
|
|
|
276 |
' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__ ;
|
| 3 |
jpm |
277 |
return $requete;
|
|
|
278 |
}
|
|
|
279 |
|
|
|
280 |
public function formerRequeteLimite() {
|
|
|
281 |
if ($this->format_reponse != 'taxons' && $this->format_reponse != 'taxons/id/relations/homonymie') {
|
|
|
282 |
$this->requete_limite = '';
|
|
|
283 |
} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat())) {
|
|
|
284 |
$this->limite_requete['depart'] = (($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']);
|
|
|
285 |
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
|
|
|
286 |
} else {
|
|
|
287 |
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
|
|
|
288 |
}
|
|
|
289 |
return $this->requete_limite;
|
|
|
290 |
}
|
|
|
291 |
|
|
|
292 |
public function retournerRequeteCondition() {
|
|
|
293 |
$condition = '';
|
|
|
294 |
if ($this->requete_condition) {
|
|
|
295 |
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
|
|
|
296 |
}
|
|
|
297 |
return $condition;
|
|
|
298 |
}
|
|
|
299 |
|
|
|
300 |
public function recupererTotalResultat() {
|
|
|
301 |
$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '.$this->table.$this->retournerRequeteCondition().$this->requete_group_by;
|
|
|
302 |
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
|
|
|
303 |
if ($res) {
|
|
|
304 |
$total = $res['nombre'];
|
|
|
305 |
}
|
|
|
306 |
return $total;
|
|
|
307 |
}
|
|
|
308 |
|
|
|
309 |
//-------------------------FONCTIONS DE FORMATION DU RESULTAT-----------------------------------------------------------
|
|
|
310 |
|
|
|
311 |
/** Permet de récupérer le résultat à retourner propre à chaque requete et de l'encoder en json*/
|
|
|
312 |
public function retournerResultatFormate($resultat, $version) {
|
| 990 |
mathias |
313 |
$reponse = null;
|
| 3 |
jpm |
314 |
switch ($this->format_reponse) {
|
|
|
315 |
case 'taxons/id' ://ds CommunNomsTaxons
|
|
|
316 |
$reponse = $this->formaterId($resultat[0]);
|
|
|
317 |
break;
|
|
|
318 |
case 'taxons/id/champ' ://ds CommunNomsTaxons
|
|
|
319 |
$reponse = $this->formaterIdChamp($resultat[0]);
|
|
|
320 |
break;
|
|
|
321 |
case 'taxons/id/relations' :
|
|
|
322 |
$reponse = $this->formaterIdRelations($resultat[0],$version);
|
|
|
323 |
break;
|
|
|
324 |
case 'taxons/id/relations/superieurs' :
|
|
|
325 |
$reponse = $this->formaterIdSuperieur($resultat, $version);
|
|
|
326 |
break;
|
|
|
327 |
case 'taxons/id/relations/inferieurs' :
|
|
|
328 |
$reponse = $this->formaterIdInferieur($resultat);
|
|
|
329 |
break;
|
| 700 |
aurelien |
330 |
case 'taxons/id/relations/hierarchie' :
|
|
|
331 |
// le formatage de la hiérarchie est identique aux relations inférieures
|
|
|
332 |
$reponse = $this->formaterIdInferieur($resultat);
|
|
|
333 |
break;
|
| 3 |
jpm |
334 |
case 'taxons/stats/annees' : //ds CommunNomsTaxons
|
|
|
335 |
$reponse = $this->formaterStatsAnnee($resultat);
|
|
|
336 |
break;
|
|
|
337 |
case 'taxons/stats/rangs' ://ds CommunNomsTaxons
|
|
|
338 |
$reponse = $this->formaterStatsRang($resultat);
|
|
|
339 |
break;
|
|
|
340 |
case 'taxons/stats/initiales' ://ds CommunNomsTaxons
|
|
|
341 |
$reponse = $this->formaterStatsInitiales($resultat);
|
|
|
342 |
break;
|
|
|
343 |
case 'taxons' :
|
|
|
344 |
$reponse = $this->formatertaxons($resultat);
|
|
|
345 |
break;
|
|
|
346 |
}
|
|
|
347 |
return $reponse;
|
|
|
348 |
}
|
|
|
349 |
|
|
|
350 |
|
|
|
351 |
//----------------------concerne les resultats pour des requetes de type /noms avec ou sans paramètres--------------
|
|
|
352 |
|
|
|
353 |
public function formaterTaxons($resultat) {
|
|
|
354 |
if ($this->parametres['retour.format'] == 'oss') {
|
|
|
355 |
$reponse = $this->formaterEnOss($resultat);
|
|
|
356 |
} else {
|
|
|
357 |
$reponse = $this->formaterEnJsonMax($resultat);
|
|
|
358 |
}
|
|
|
359 |
return $reponse;
|
|
|
360 |
}
|
|
|
361 |
|
|
|
362 |
public function formaterEnJsonMax($resultat) {
|
|
|
363 |
//print_r($resultat);
|
|
|
364 |
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
|
|
|
365 |
$masque = $this->recupererMasquePrincipal();
|
|
|
366 |
if (isset($masque)) $resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres[$masque[0]], $resultat, $masque[1]);
|
| 963 |
raphael |
367 |
$table_retour_json['entete'] = $this->afficherEnteteResultat('/'.$this->service);
|
| 3 |
jpm |
368 |
//on remplit la table $table_retour_json['resultat']
|
|
|
369 |
$tab_tax_inf = $this->recupererListeTaxonInf($resultat);
|
|
|
370 |
foreach ($resultat as $tab) {
|
|
|
371 |
$num = $tab['num_nom'];
|
| 158 |
delphine |
372 |
if (isset($this->parametres['masque.nt'])) $this->afficherDonnees('num_taxonomique', $tab['num_taxonomique']);
|
| 3 |
jpm |
373 |
$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num);
|
|
|
374 |
$this->afficherTaxonInfNb($num, $tab_tax_inf);
|
|
|
375 |
$resultat_json[$num] = $this->table_retour;
|
|
|
376 |
$this->table_retour = array(); //on vide le tableau table_retour
|
|
|
377 |
}
|
|
|
378 |
$table_retour_json['resultat'] = $resultat_json;
|
|
|
379 |
return $table_retour_json;
|
|
|
380 |
}
|
|
|
381 |
|
|
|
382 |
|
|
|
383 |
//--------------------concerne les resultats pour des requetes de type noms/id----------------------------------------
|
|
|
384 |
|
|
|
385 |
public function formaterIdRelations($resultat, $version) {
|
|
|
386 |
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
|
|
|
387 |
$this->resultat_req = $resultat;
|
|
|
388 |
$retour_id_rel = array ('entete' => array()); //on initialise pr que l'entete apparaisse en premier
|
|
|
389 |
|
|
|
390 |
$superieurs = $this->ajouterRelations('superieurs'); //, $version);
|
|
|
391 |
if (isset($superieurs)) $retour_id_rel['resultat']['superieurs'] = $superieurs;
|
|
|
392 |
$inferieurs = $this->ajouterRelations('inferieurs', $version);
|
|
|
393 |
if (isset($inferieurs)) $retour_id_rel['resultat']['inferieurs'] = $inferieurs;
|
|
|
394 |
|
|
|
395 |
if (!isset($retour_id_rel['resultat'])) { //on renvoit un tableau null si il n'existe aucune relations
|
|
|
396 |
$retour_id_rel = 'null';
|
|
|
397 |
} else { //on rajoute l'entete si des relations existent
|
|
|
398 |
$this->afficherDonnees('num_nom', $this->num_nom_taxon); //$this->afficherEnteteResultat($resultat, '/'.$this->service.'/'.$this->ressources[0].'/relations/synonymie');
|
|
|
399 |
$retour_id_rel['entete'] = $this->table_retour;
|
|
|
400 |
$this->table_retour = array();
|
|
|
401 |
}
|
|
|
402 |
return $retour_id_rel;
|
|
|
403 |
}
|
|
|
404 |
|
|
|
405 |
public function ajouterRelations($relation, $version) {
|
|
|
406 |
$version = str_replace(Config::get('bdd_table').'_', '', $version);
|
|
|
407 |
$res = null;
|
|
|
408 |
$taxon = $this->num_nom_taxon;
|
|
|
409 |
$parametres_url = '';
|
|
|
410 |
if ($this->parametres != array()) $parametres_url = '?'.http_build_query($this->parametres, '', '&');
|
|
|
411 |
$url = Config::get('url_service').'/'
|
|
|
412 |
.$this->service.'/'.$version.'/'
|
|
|
413 |
.$this->ressources[0].'/relations/'
|
|
|
414 |
.$relation.$parametres_url;
|
|
|
415 |
$relation = $this->consulterHref($url);
|
|
|
416 |
if (isset($relation->resultat)) {
|
|
|
417 |
$res = $relation->resultat;
|
|
|
418 |
} elseif (isset($relation->$taxon)) { //pour les relations inf et sup
|
|
|
419 |
$res = $relation->$taxon;
|
|
|
420 |
}
|
|
|
421 |
return $res;
|
|
|
422 |
}
|
|
|
423 |
|
|
|
424 |
public function formaterIdSuperieur($resultat, $version) {
|
|
|
425 |
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
|
|
|
426 |
$tab_relation = null; //si il n'existe aucune relation
|
| 295 |
aurelien |
427 |
$taxon_sup_traites = array();
|
| 3 |
jpm |
428 |
if (($resultat) != '' ) {
|
|
|
429 |
//on recupere d'abord les rangs supérieurs
|
|
|
430 |
$sup = $resultat[0];
|
|
|
431 |
do {
|
|
|
432 |
$sup = $this->recupererIdSuperieur($sup['num_tax_sup'], $version);
|
| 295 |
aurelien |
433 |
if(!in_array($sup['num_nom'], $taxon_sup_traites)) {
|
|
|
434 |
$taxon_sup_traites[] = $sup['num_nom'];
|
|
|
435 |
} else {
|
|
|
436 |
$sup = null;
|
|
|
437 |
}
|
| 3 |
jpm |
438 |
if ($sup['rang'] == '0') $sup['rang'] = '10'; //erreur dans la base
|
|
|
439 |
if (isset($sup)) $resultat[] = $sup;
|
|
|
440 |
} while ($sup != null);
|
|
|
441 |
krsort($resultat);
|
|
|
442 |
//on les affiche ensuite
|
|
|
443 |
foreach ($resultat as $tab) {
|
|
|
444 |
$this->resultat_req = $tab;
|
|
|
445 |
$num = $tab['num_nom'];
|
|
|
446 |
$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num);
|
|
|
447 |
$this->afficherDonnees('rang', $tab['rang']);
|
|
|
448 |
$tab_inf[$num] = $this->table_retour;
|
| 295 |
aurelien |
449 |
$tab_inf[$num]['num_nom'] = $tab['num_nom'];
|
| 3 |
jpm |
450 |
$this->table_retour = array();
|
|
|
451 |
}
|
| 295 |
aurelien |
452 |
|
| 3 |
jpm |
453 |
$tab_relation[$this->num_nom_taxon] = $tab_inf;
|
| 295 |
aurelien |
454 |
}
|
| 3 |
jpm |
455 |
return $tab_relation;
|
|
|
456 |
}
|
|
|
457 |
|
|
|
458 |
|
|
|
459 |
public function recupererIdSuperieur($id, $version) {
|
| 295 |
aurelien |
460 |
$req = 'SELECT num_nom, num_nom_retenu, num_tax_sup, rang, nom_sci FROM '
|
| 740 |
raphael |
461 |
.$version.' WHERE num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($id);
|
|
|
462 |
$res = $this->getBdd()->recupererTous($req . ' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__ );
|
| 3 |
jpm |
463 |
if ($res) {
|
|
|
464 |
$resultat = $res[0];
|
|
|
465 |
} else {
|
| 295 |
aurelien |
466 |
$resultat = null; //on return null si il n'y a pas de taxon superieur
|
| 3 |
jpm |
467 |
}
|
|
|
468 |
return $resultat;
|
|
|
469 |
}
|
|
|
470 |
|
|
|
471 |
public function formaterIdInferieur($resultat) {
|
| 295 |
aurelien |
472 |
// Attention à l'ordre, on doit d'abord récupérer correpondance_champs avant champs_api
|
|
|
473 |
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
|
| 3 |
jpm |
474 |
$tab_relation = null;
|
| 295 |
aurelien |
475 |
if (($resultat) != array()) {
|
| 3 |
jpm |
476 |
foreach ($resultat as $tab) {
|
|
|
477 |
$this->resultat_req = $tab;
|
| 295 |
aurelien |
478 |
$num = $tab['num_nom'];
|
|
|
479 |
$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num);
|
| 718 |
aurelien |
480 |
if(!empty($tab['rang'])) {
|
|
|
481 |
$this->afficherDonnees('rang', $tab['rang']);
|
|
|
482 |
}
|
| 3 |
jpm |
483 |
$tab_inf[$num] = $this->table_retour;
|
| 295 |
aurelien |
484 |
$tab_inf[$num]['nom_sci'] = $tab['nom_sci'];
|
|
|
485 |
$tab_inf[$num]['num_nom'] = $tab['num_nom'];
|
|
|
486 |
$this->table_retour = array();
|
| 3 |
jpm |
487 |
}
|
|
|
488 |
$tab_relation[$this->num_nom_taxon] = $tab_inf;
|
|
|
489 |
}
|
|
|
490 |
return $tab_relation;
|
|
|
491 |
}
|
|
|
492 |
|
|
|
493 |
public function afficherTaxonInfNb($num, $tab_tax_inf) {
|
|
|
494 |
foreach ($tab_tax_inf as $taxNb) {
|
|
|
495 |
if ($taxNb['num_tax_sup'] == $num) {
|
|
|
496 |
$this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'] = $taxNb['nb'];
|
|
|
497 |
}
|
|
|
498 |
}
|
|
|
499 |
if (!isset($this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'])) {
|
|
|
500 |
$this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'] = '0';
|
|
|
501 |
}
|
|
|
502 |
}
|
|
|
503 |
|
|
|
504 |
public function recupererListeTaxonInf($resultat) {
|
|
|
505 |
// SELECT num_tax_sup, count(*) as nb FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_tax_sup IN (id, id, id) AND num_nom = num_nom_retenu GROUP BY num_tax_sup';
|
|
|
506 |
foreach ($resultat as $tab) {
|
|
|
507 |
$tab_num[] = $tab['num_nom']; //on regroupe ici les id des taxons dont on cherche le nb de taxon inf
|
|
|
508 |
}
|
|
|
509 |
$req = 'SELECT num_tax_sup, count(*) as nb FROM '.$this->table
|
|
|
510 |
.' WHERE num_tax_sup IN ('.implode(',',$tab_num)
|
|
|
511 |
.') AND num_nom = num_nom_retenu GROUP BY num_tax_sup';
|
| 740 |
raphael |
512 |
$res = $this->getBdd()->recupererTous($req . ' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__ );
|
| 3 |
jpm |
513 |
if ($res) {
|
|
|
514 |
$resultat = $res;
|
|
|
515 |
} else {
|
| 295 |
aurelien |
516 |
$resultat = array(); //on retourne un tableau vide s'il n'y a pas de taxon inférieurs
|
| 3 |
jpm |
517 |
}
|
|
|
518 |
return $resultat;
|
|
|
519 |
}
|
|
|
520 |
}
|
|
|
521 |
|
|
|
522 |
?>
|