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Rev Author Line No. Line
1425 aurelien 1
<?php
2
/**
3
* PHP Version 5
4
*
5
* @category  PHP
6
* @package   jrest
7
* @author    David Delon <david@tela-botania.org>
8
* @author    Aurélien Peronnet <aurelien@tela-botania.org>
9
* @copyright 2010 Tela-Botanica
10
* @license   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
11
* @version   SVN: <svn_id>
12
* @link      /doc/jrest/
13
*/
14
 
15
/**
16
 *
17
 * La classe appelle les web service d'eflore pour éviter que le code client
18
 * ne soit dépendant de la version d'eflore
19
 */
20
class RechercheInfosTaxonBeta extends Cel {
21
 
1427 aurelien 22
	private $url_service_nom = null;
23
	private $url_service_taxon = null;
24
	private $url_service_chorologie = null;
25
 
1487 aurelien 26
	private $masque_recherche = null;
1527 aurelien 27
	private $code_referentiel = 'bdtfx';
1784 raphael 28
 
29
	// initialisé à TRUE par rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax()
30
	// si l'espèce passée a le motif <ref>:(nt|nn):<num>, eg: isfan:nt:1591
31
	public $is_notation_spe = FALSE;
32
 
1527 aurelien 33
	public function RechercheInfosTaxonBeta($config, $code_referentiel = 'bdtfx') {
34
		parent::__construct($config);
35
		$this->code_referentiel = $code_referentiel;
36
		$this->formaterUrlsServices($config);
37
	}
1487 aurelien 38
 
1527 aurelien 39
	private function formaterUrlsServices($config) {
40
		$this->url_service_nom = str_replace('{referentiel}', $this->code_referentiel ,$config['eflore']['url_service_nom']);
41
		$this->url_service_taxon = str_replace('{referentiel}', $this->code_referentiel ,$config['eflore']['url_service_taxon']);
1427 aurelien 42
		$this->url_service_chorologie_obs = $config['eflore']['url_service_chorologie_obs'];
1425 aurelien 43
	}
44
 
45
	public function rechercherGenreEspeceSurPrefixe($genre = null, $espece = null) {
46
 
47
		$liste_genre_espece = array();
1487 aurelien 48
		$this->masque_recherche = trim(trim($genre).' '.trim($espece,' *'));
49
		$masque = urlencode($this->masque_recherche);
1427 aurelien 50
		$requete = @file_get_contents($this->url_service_nom.'?masque='.$masque.'&recherche=etendue&retour.format=min&navigation.limite=50&ns.structure=au');
1425 aurelien 51
		if($requete != '') {
52
			$requete = json_decode($requete);
53
			if(is_object($requete) && isset($requete->resultat)) {
54
				foreach ($requete->resultat as $id => $res) {
1427 aurelien 55
					$retenu = ($res->retenu == "true") ? '3' : '4';
1425 aurelien 56
					$liste_genre_espece[] = array($res->nom_sci_complet, $id, $retenu);
57
				}
58
			}
1427 aurelien 59
			usort($liste_genre_espece, array($this, 'comparerParRetenuPuisNom'));
1425 aurelien 60
		}
61
		return $liste_genre_espece;
62
	}
63
 
1427 aurelien 64
	function comparerParRetenuPuisNom($a, $b) {
65
		if($a[2] == 3 && $b[2] != 3) {
66
			return -1;
67
		} elseif($a[2] != 3 && $b[2] == 3) {
68
			return 1;
69
		} else {
1487 aurelien 70
			return levenshtein($this->masque_recherche, $a[0]) >= levenshtein($this->masque_recherche, $b[0]);
1427 aurelien 71
		}
1425 aurelien 72
	}
73
 
74
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesEtFormaterNom($numNom) {
75
		$resultat_infos_complementaires = (array)$this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom);
76
		$retour_infos_complementaires = array();
1780 raphael 77
		if (isset($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet']) && $resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet']) {
78
           	$retour_infos_complementaires=array((self::supprimerBiblio($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet'])));
1425 aurelien 79
	    }
80
 
81
		return $retour_infos_complementaires;
82
	}
83
 
84
	public function rechercherInformationsComplementairesSurNom($nom_saisi) {
1487 aurelien 85
		$nom_saisi = trim($nom_saisi);
1486 aurelien 86
		// Essai de recherche sur le nom saisi tel quel
87
		$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, true);
88
		if(empty($liste_genre_espece)) {
89
			// Essai de recherche stricte en tentant de supprimer le nom d'auteur
1833 raphael 90
			$nom_saisi_sans_auteur = self::supprimerAuteur($nom_saisi);
1787 raphael 91
			if($nom_saisi_sans_auteur) { // ne pas faire la requête sur un mot vide
92
				$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi_sans_auteur, true);
93
			}
1486 aurelien 94
			if(empty($liste_genre_espece)) {
95
				// Dernière tentative : essai de recherche étendue
96
				$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, false);
97
			}
98
		}
99
		return $liste_genre_espece;
100
	}
101
 
102
	private function effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, $stricte = true) {
1787 raphael 103
		$res = @json_decode(file_get_contents(sprintf('%1$s?masque=%2$s&recherche=%3$s&ns.format=txt&retour.champs=%4$s&navigation.limite=1',
104
													  $this->url_service_nom,
105
													  urlencode($nom_saisi),
106
													  ($stricte ? 'stricte' : 'etendue'),
107
													  implode(',', array("id","nom_sci","auteur","nom_retenu.id","famille","num_taxonomique","nom_retenu_complet")))));
1780 raphael 108
		if(!$res) return NULL;
109
		$resultat = (array)$res->resultat;
110
		return array_pop($resultat);
1486 aurelien 111
	}
112
 
1833 raphael 113
	static function supprimerAuteur($nom_saisi) {
1486 aurelien 114
		// TODO: gérer les hybrides
1833 raphael 115
		if(self::estUnHybride($nom_saisi) || self::estUneFormuleHybridite($nom_saisi)) {
1486 aurelien 116
			$nom_decoupe = explode(' ', $nom_saisi);
117
			$derniere_position_hybride = end(array_keys($nom_decoupe, 'x'));
118
			$nom_saisi_sans_auteur = implode(' ',array_slice($nom_decoupe, 0, $derniere_position_hybride + 2));
119
		} else {
1833 raphael 120
			/* Attention le parseur de nom n'est pas fiable à 100%
121
			   mais ça marche dans la plupart des cas
122
			   à part les formules d'hybridité saisies avec un auteur */
123
			$nameparser = new NameParser();
1486 aurelien 124
			$auteur = $nameparser->parse_auth($nom_saisi);
125
			$nom_saisi_sans_auteur = str_replace($auteur, '', $nom_saisi);
126
		}
127
 
1833 raphael 128
		return trim($nom_saisi_sans_auteur);
1486 aurelien 129
	}
130
 
1833 raphael 131
	static function estUneFormuleHybridite($nom_saisi) {
1486 aurelien 132
		return strpos($nom_saisi,' x ') !== false;
133
	}
134
 
1833 raphael 135
	static function estUnHybride($nom_saisi) {
1486 aurelien 136
		return strpos($nom_saisi,'x ') === 0;
137
	}
138
 
1425 aurelien 139
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num_nom) {
1780 raphael 140
		return @json_decode(file_get_contents($this->url_service_nom.'/'.$num_nom.'?retour.champs=nom_sci,auteur,id,nom_retenu_complet,nom_retenu.id,num_taxonomique,famille'));
1425 aurelien 141
	}
1780 raphael 142
 
143
	static function supprimerBiblio($nom) {
1805 raphael 144
		return trim(preg_replace('/ \[.*\]/','',$nom));
1425 aurelien 145
	}
146
 
147
	public function rechercherNumTaxSurNumNom($num_nom) {
148
		$nt = null;
1427 aurelien 149
		$url = $this->url_service_nom."/".$num_nom.'?retour.champs=num_taxonomique';
1425 aurelien 150
		$resultat = @file_get_contents($url);
151
		if($resultat != '') {
152
			$infos = json_decode($resultat);
153
			$nt = $infos->num_taxonomique;
154
		}
155
 
156
		return $nt;
157
	}
158
 
159
	public function taxonEstPresentDansDepartement($num_taxon,$code_departement) {
160
		$presence_taxon = false;
1427 aurelien 161
		$url = $this->url_service_chorologie_obs.'?masque.departement='.$code_departement.'&masque.determination.nt='.$num_taxon.'&navigation.limite=1';
1425 aurelien 162
		$resultat = @file_get_contents($url);
163
		if($resultat != '') {
164
			$resultat = json_decode($resultat);
165
			if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat) && count($resultat->resultat) > 0) {
166
				$presence_taxon = true;
167
			}
168
		}
169
		return $presence_taxon;
170
	}
171
 
1780 raphael 172
	/* texte libre, nom scientifique,
1784 raphael 173
	   ou code nomenclatural (format bdtfx:nn:999999)
174
	   ou code taxonomique (format bdtfx:nt:999999)
1780 raphael 175
	   TODO: voir ce qu'on fait pour l'import de différent référentiels */
1425 aurelien 176
	function rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax($identifiant_espece) {
1784 raphael 177
		preg_match('/(' . implode('|', Cel::$referentiels_valides) .'):(nn|nt):(\d+)/i', $identifiant_espece, $elements);
178
		if($elements) {
179
			$this->is_notation_spe = TRUE;
180
			list(, $ref, $type, $num) = $elements;
1796 raphael 181
 
182
			if($ref != $this->code_referentiel) {
183
				// TODO: ignorer la colonne référentiel, et utiliser le référentiel donné
184
				// mais il faut alors avertir le service (d'import/modif) d'utiliser le référentiel
185
				// passé au nom d'espèce
186
			}
1784 raphael 187
			// Numero nomenclatural
188
			if ($type == 'nn') {
189
				$obj = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num);
190
			}
191
			// Numero taxonomique
192
			else {
193
				//TODO: retourner moins de champs grâce au paramètre retour.champs
194
				$obj = @json_decode(file_get_contents($this->url_service_taxon."/nt:".$num));
195
			}
1796 raphael 196
			if($obj) $obj->ref = $ref;
1784 raphael 197
			return $obj;
198
		}
1746 raphael 199
 
1780 raphael 200
		// Nom scientifique
201
		return $this->rechercherInformationsComplementairesSurNom($identifiant_espece);
1425 aurelien 202
	}
1591 aurelien 203
 
204
	public function rechercherSynonymesSurNumNom($num_nom) {
205
		$retour = array();
1780 raphael 206
		$resultat = @file_get_contents($this->url_service_nom.'/'.$num_nom.'/relations/synonymie/?retour.format=min');
1591 aurelien 207
		if($resultat != '') {
208
			$resultat = json_decode($resultat);
209
			if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat) && count($resultat->resultat) > 0) {
210
				$retour = $resultat->resultat;
211
			}
212
		}
213
		return $retour;
214
	}
1425 aurelien 215
}
216
?>