304 |
delphine |
1 |
; Version du référentiel servant de base aux informations ci-dessous
|
|
|
2 |
version = 4.4
|
|
|
3 |
; Extension fichier ref
|
|
|
4 |
suffixe_bdnt = "_ref"
|
|
|
5 |
; Extension fichier meta
|
|
|
6 |
suffixe_meta = "_meta"
|
|
|
7 |
; Extension fichier diff
|
|
|
8 |
suffixe_diff = "_diff"
|
|
|
9 |
; Extension fichier export
|
|
|
10 |
ext_fichier = ".txt"
|
|
|
11 |
; Suffixe pour les fichiers partiel (Taxref)
|
|
|
12 |
suffixe_partiel = "_taxref"
|
|
|
13 |
; Notes ajoutée à l'édition partielle
|
|
|
14 |
notes_partiel = "Édition Taxref."
|
|
|
15 |
; Noms des champs de la bdnt
|
|
|
16 |
champs = "num_nom,num_nom_retenu,num_tax_sup,rang,nom_sci,nom_supra_generique,genre,epithete_infra_generique,epithete_sp,type_epithete,epithete_infra_sp,cultivar_groupe,cultivar,nom_commercial,auteur,annee,biblio_origine,notes,nom_addendum,homonyme,num_type,num_basionyme,synonyme_proparte,synonyme_douteux,synonyme_mal_applique,synonyme_orthographique,orthographe_originelle,hybride_parent_01,hybride_parent_01_notes,hybride_parent_02,hybride_parent_02_notes,nom_francais,presence,statut_origine,statut_introduction,statut_culture,exclure_taxref"
|
|
|
17 |
; Noms des champs de la bdnt partielles
|
324 |
delphine |
18 |
champs_partiel = "num_nom,num_nom_retenu,num_tax_sup,nom_sci,auteur,annee,biblio_origine,nom_addendum,nom_francais,presence,cd_nom"
|
304 |
delphine |
19 |
; Noms des champs du diff de la bdnt
|
|
|
20 |
champs_diff = "modification_type,modification_type_1,modification_type_2,modification_type_3"
|
|
|
21 |
; Noms des champs Taxref
|
|
|
22 |
champs_taxref = "taxref_rang,taxref_statut"
|
|
|
23 |
; Noms, types et nombre de caractères des champs
|
|
|
24 |
champs_type = "num_nom=INT|9,
|
|
|
25 |
num_nom_retenu=VARCHAR|9,
|
|
|
26 |
num_tax_sup=VARCHAR|9,
|
|
|
27 |
rang=INT|4,
|
|
|
28 |
nom_sci=VARCHAR|500,
|
|
|
29 |
nom_supra_generique=VARCHAR|100,
|
|
|
30 |
genre=VARCHAR|100,
|
|
|
31 |
epithete_infra_generique=VARCHAR|100,
|
|
|
32 |
epithete_sp=VARCHAR|100,
|
|
|
33 |
type_epithete=VARCHAR|100,
|
|
|
34 |
epithete_infra_sp=VARCHAR|100,
|
|
|
35 |
cultivar_groupe=VARCHAR|100,
|
|
|
36 |
cultivar=VARCHAR|100,
|
|
|
37 |
nom_commercial=VARCHAR|100,
|
|
|
38 |
auteur=VARCHAR|100,
|
|
|
39 |
annee=VARCHAR|4,
|
|
|
40 |
biblio_origine=VARCHAR|500,
|
|
|
41 |
notes=TEXT|65536,
|
|
|
42 |
nom_addendum=VARCHAR|500,
|
|
|
43 |
homonyme=VARCHAR|1,
|
|
|
44 |
num_type=VARCHAR|9,
|
|
|
45 |
basionyme=VARCHAR|9,
|
|
|
46 |
synonyme_proparte=VARCHAR|100,
|
|
|
47 |
synonyme_douteux=VARCHAR|1,
|
|
|
48 |
synonyme_mal_applique=VARCHAR|1,
|
|
|
49 |
synonyme_orthographique=VARCHAR|9,
|
|
|
50 |
orthographe_originelle=VARCHAR|100,
|
|
|
51 |
hybride_parent_01=VARCHAR|9,
|
|
|
52 |
hybride_parent_01_notes=TEXT|65536,
|
|
|
53 |
hybride_parent_02=VARCHAR|9,
|
|
|
54 |
hybride_parent_02_notes=TEXT|65536,
|
|
|
55 |
nom_francais=VARCHAR|500,
|
|
|
56 |
presence=VARCHAR|100,
|
|
|
57 |
statut_origine=VARCHAR|100,
|
|
|
58 |
statut_introduction=VARCHAR|100,
|
|
|
59 |
statut_culture=VARCHAR|100,
|
|
|
60 |
exclure_taxref=INT|1"
|
|
|
61 |
; Classement des champs dans les différentes classes de modification
|
|
|
62 |
champs_diff_type = "num_nom=1,
|
|
|
63 |
num_nom_retenu=1,
|
|
|
64 |
num_tax_sup=1,
|
|
|
65 |
rang=1,
|
|
|
66 |
nom_sci=2,
|
|
|
67 |
nom_supra_generique=2,
|
|
|
68 |
genre=2,
|
|
|
69 |
epithete_infra_generique=2,
|
|
|
70 |
epithete_sp=2,
|
|
|
71 |
type_epithete=2,
|
|
|
72 |
epithete_infra_sp=2,
|
|
|
73 |
cultivar_groupe=2,
|
|
|
74 |
cultivar=2,
|
|
|
75 |
nom_commercial=2,
|
|
|
76 |
auteur=3,
|
|
|
77 |
annee=3,
|
|
|
78 |
biblio_origine=3,
|
|
|
79 |
notes=3,
|
|
|
80 |
nom_addendum=3,
|
|
|
81 |
homonyme=3,
|
|
|
82 |
num_type=3,
|
|
|
83 |
num_basionyme=3,
|
|
|
84 |
synonyme_proparte=3,
|
|
|
85 |
synonyme_douteux=3,
|
|
|
86 |
synonyme_mal_applique=3,
|
|
|
87 |
synonyme_orthographique=3,
|
|
|
88 |
biblio_statut=3,
|
|
|
89 |
orthographe_originelle=3,
|
|
|
90 |
hybride_parent_01=3,
|
|
|
91 |
hybride_parent_01_notes=3,
|
|
|
92 |
hybride_parent_02=3,
|
|
|
93 |
hybride_parent_02_notes=3,
|
|
|
94 |
nom_francais=3,
|
|
|
95 |
presence=3,
|
|
|
96 |
statut_origine=3,
|
|
|
97 |
statut_introduction=3,
|
|
|
98 |
statut_culture=3,
|
|
|
99 |
exclure_taxref=3"
|
|
|
100 |
; Valeurs numériques des rangs
|
|
|
101 |
rangs = "3,10,20,30,33,36,40,42,45,47,50,53,56,60,70,80,90,100,110,120,130,140,150,160,170,180,190,193,196,200,210,215,220,230,235,240,250,260,270,275,280,290,300,310,320,330,340,350,360,370,380,390,400,410,420,430,440"
|
|
|
102 |
; Correspondance Rang BDNT/Taxref (Format : code_numerique_rang_bdnt:code_taxref)
|
|
|
103 |
rangs_bdnt_taxref = "3:DUMM,10:SPRG,20:KD,30:SSRG,33:IFRG,36:?,40:PH,42:SBPH,45:IFPH,47:?,50:DV,53:SBDV,56:?,60:SPCL,70:CLAD,80:CL,90:SBCL,100:IFCL,110:LEG,120:SPOR,130:COH,140:OR,150:SBOR,160:IFOR,170:SPFM,180:FM,190:SBFM,193:?,196:?,200:TR,210:SSTR,215:?,220:GN,230:SSGN,235:?,240:SC,250:SBSC,260:SER,270:SSER,275:?,280:AGES,290:ES,300:SMES,310:MES,320:SSES,330:?,340:VAR,350:SVAR,360:FO,370:SSFO,380:FOES,390:LIN,400:CLO,410:RACE,420:MO,430:AB,440:CAR"
|
|
|
104 |
; Valeur numérique indiquant le rang du genre
|
|
|
105 |
rang_genre="220"
|
|
|
106 |
; Valeur numérique indiquant le rang de l'espèce
|
|
|
107 |
rang_sp="290"
|
|
|
108 |
; Signification des valeurs numériques des rangs
|
|
|
109 |
signification_rang = "3=Domaine,
|
|
|
110 |
10=Super-Règne,
|
|
|
111 |
20=Règne,
|
|
|
112 |
30=Sous-Règne,
|
|
|
113 |
33=Infra-Règne,
|
|
|
114 |
36=Super-Phylum,
|
|
|
115 |
40=Phylum,
|
|
|
116 |
42=Sous-Phylum,
|
|
|
117 |
45=Infra-Phylum,
|
|
|
118 |
47=Super-Division,
|
|
|
119 |
50=Division,
|
|
|
120 |
53=Sous-Division,
|
|
|
121 |
56=Infra-Division,
|
|
|
122 |
60=Super-Classe,
|
|
|
123 |
70=Cladus,
|
|
|
124 |
80=Classe,
|
|
|
125 |
90=Sous-Classe,
|
|
|
126 |
100=Infra-classe,
|
|
|
127 |
110=Legio,
|
|
|
128 |
120=Super-Ordre,
|
|
|
129 |
130=Cohorte,
|
|
|
130 |
140=Ordre,
|
|
|
131 |
150=Sous-Ordre,
|
|
|
132 |
160=Infra-Ordre,
|
|
|
133 |
170=Super-Famille,
|
|
|
134 |
180=Famille,
|
|
|
135 |
190=Sous-Famille,
|
|
|
136 |
193=Infra-Famille,
|
|
|
137 |
196=Super-Tribu,
|
|
|
138 |
200=Tribu,
|
|
|
139 |
210=Sous-Tribu,
|
|
|
140 |
215=Infra-Tribu,
|
|
|
141 |
220=Genre,
|
|
|
142 |
230=Sous-Genre,
|
|
|
143 |
235=Infra-Genre,
|
|
|
144 |
240=Section,
|
|
|
145 |
250=Sous-Section,
|
|
|
146 |
260=Série/Stirpe,
|
|
|
147 |
270=Sous-Série/Sous-Stirpe,
|
|
|
148 |
275=Groupe,
|
|
|
149 |
280=Agrégat,
|
|
|
150 |
290=Espèce,
|
|
|
151 |
300=Semi-Espèce,
|
|
|
152 |
310=Micro-Espèce,
|
|
|
153 |
320=Sous-Espèce,
|
|
|
154 |
330=Infra-Espèce,
|
|
|
155 |
340=Variété,
|
|
|
156 |
350=Sous-Variété,
|
|
|
157 |
360=Forme,
|
|
|
158 |
370=Sous-Forme,
|
|
|
159 |
380=Forma species,
|
|
|
160 |
390=Linea,
|
|
|
161 |
400=Clône,
|
|
|
162 |
410=Race/prole,
|
|
|
163 |
420=Morpha,
|
|
|
164 |
430=Abberatio,
|
|
|
165 |
440=Plantes cultivées (cultivars/groupe cultivar/convariété...)"
|
|
|
166 |
|
|
|
167 |
; TOUTES LES LISTES séparées par | sont insérées dans la regexp suivante : /^(?:$liste)$/ VOUS DEVEZ SI NÉCESSAIRE
|
|
|
168 |
; ANTISLASHER LES CARACTÈRES : . \ + * ? [ ^ ] $ ( ) { } = ! < > : -
|
|
|
169 |
; Liste de types d'épithète à rejeter. Séparation : ,. Insensible à la casse.
|
|
|
170 |
type_epithete_rejetes="cv[.]?|convar[.]?"
|
|
|
171 |
; Liste de mots de noms de cultivar qui doivent être rejetés. Séparation : |. Insensible à la casse.
|
|
|
172 |
cultivar_mots_rejetes="cv[.]?|convar[.]?"
|
|
|
173 |
; Liste de noms de cultivar acceptés faisant exception à la règle de la majuscule pour la 1ère lettre de chaque mot. Séparation : |. Senssible à la casse.
|
|
|
174 |
cultivar_acceptes="s-Hertogenbosch|IJsselham"
|
|
|
175 |
; Liste de mots de noms de groupe de cultivar qui doivent être rejetés. Séparation : |. Insensible à la casse.
|
|
|
176 |
cultivar_gp_mots_rejetes="gp|grex|group|gruppe|groupe|grupo|gruppen"
|
|
|
177 |
; Liste de mots de noms de groupe de cultivar à accepter. Séparation : |. Sensible à la casse.
|
|
|
178 |
cultivar_gp_mots_acceptes="gx"
|
|
|
179 |
; Liste de noms de groupe de cultivar à accepter. Séparation : |. Sensible à la casse.
|
|
|
180 |
cultivar_gp_acceptes=""
|
|
|
181 |
;Liste des mots mineurs (conjonctions et prépositions). Séparation : |. Sensible à la casse.
|
|
|
182 |
mots_mineurs = "mais|ou|et|donc|or|ni|car|and|but|or|nor|de|à|pour|en|dans|avec|sur|par|sans|of|to|in|for|with|on"
|
|
|
183 |
; Liste des intitulés auteur faisant exception aux règles mais acceptés. Séparation : |
|
|
|
184 |
auteur_acceptes=""
|
|
|
185 |
; Liste des mots composant un intitulés auteur qui sont rejetés. Séparation : |
|
|
|
186 |
auteur_mots_rejetes="et|and|[(]?(?:p\.){2}[)]?"
|
|
|
187 |
|
|
|
188 |
|
|
|
189 |
; Liste abréviations des rangs infra spécifique
|
|
|
190 |
abbr_rangs_infra_specifique="/^(subsp|infra-sp|var|subvar|f|subf)([.]?)|f[.]? sp[.]?|race|prole$/"
|
|
|
191 |
|
|
|
192 |
; Liste des codes de présence
|
|
|
193 |
codes_presence = "PSDEFA"
|
|
|
194 |
; signification code PSDEFA
|
|
|
195 |
presence = "P=Présent,
|
|
|
196 |
S=Supposé présent (présence à confirmer),
|
|
|
197 |
D=Présence douteuse,
|
|
|
198 |
E=Éteint,
|
|
|
199 |
F=Cité par erreur comme présent,
|
|
|
200 |
A=Absent,
|
|
|
201 |
=Pas d'information,
|
|
|
202 |
-=Autre statut de présence,
|
|
|
203 |
E-W=Disparu,
|
|
|
204 |
P-B=Présence accidentelle (Taxon « visiteur »),
|
|
|
205 |
E-F=Trouvé en fouille"
|
|
|
206 |
; Liste des statuts d'origine
|
|
|
207 |
codes_statuts_origine = "NSDEFAX"
|
|
|
208 |
; signification code NSDEFAX
|
|
|
209 |
statuts_origine = "N=Natif (=indigène),
|
|
|
210 |
S=Supposé natif,
|
|
|
211 |
D=Origine douteuse,
|
|
|
212 |
E=Anciennement natif (éteint),
|
|
|
213 |
F=Cité par erreur comme natif,
|
|
|
214 |
A=Non natif,
|
|
|
215 |
=Pas d'information,
|
|
|
216 |
X=Inapplicable,
|
|
|
217 |
-=Autre statut d'origine,
|
|
|
218 |
N-E=Endémique,
|
|
|
219 |
N-S=Sub-Endémique,
|
|
|
220 |
E-Z=Endémique éteinte,
|
|
|
221 |
S-F=Supposé natif cryptogène"
|
|
|
222 |
; Liste des statuts d'introduction
|
|
|
223 |
codes_statuts_introduction = "ISDEFAX"
|
|
|
224 |
; signification code ISDEFAX
|
|
|
225 |
statuts_introduction = "I=Introduit,
|
|
|
226 |
S=Supposé introduit,
|
|
|
227 |
D=Introduction douteuse,
|
|
|
228 |
E=Anciennement introduit (éteint),
|
|
|
229 |
C=Cité par erreur comme introduit,
|
|
|
230 |
A=Non introduit,
|
|
|
231 |
=Pas d'information,
|
|
|
232 |
X=Inapplicable,
|
|
|
233 |
-=Autre notion d'introduction,
|
|
|
234 |
I-J=Introduit envahissant,
|
|
|
235 |
I-M=Domestique / Introduit non établi,
|
|
|
236 |
S-F=Supposé introduit cryptogène"
|
|
|
237 |
; Liste des statuts de culture
|
|
|
238 |
codes_statuts_culture = "CISDEFXA"
|
|
|
239 |
; signification code CISDECX
|
|
|
240 |
statuts_culture = "C=Cultivé en extérieur,
|
|
|
241 |
I=Cultivé en intérieur,
|
|
|
242 |
S=Supposé cultivé,
|
|
|
243 |
D=Culture douteuse,
|
|
|
244 |
E=Anciennement cultivé (éteint),
|
|
|
245 |
F=Cité par erreur comme cultivé,
|
|
|
246 |
=Pas d'information,
|
|
|
247 |
X=Inapplicable,
|
|
|
248 |
-=Autre notion de culture,
|
|
|
249 |
A=Non cultivé"
|
|
|
250 |
; Correspondance entre les codes de statut de Taxref et les champs et code de statut des BDNT (Format : code_taxref=nom_champ_bdnt:code_statut_bdnt)
|
|
|
251 |
statuts_bdnt_taxref = "P=presence:P,A=presence:A,D=presence:D,X=presence:E,B=presence:P-B,W=presence:E-W,F=presence:E-F,C=statut_origine:S-F,E=statut_origine:N-E,S=statut_origine:N-S,Z=statut_origine:E-Z,I=statut_introduction:I,J=statut_introduction:I-J,M=statut_introduction:I-M,Y=statut_introduction:E"
|
|
|
252 |
|
|
|
253 |
; MÉTADONNÉES
|
|
|
254 |
; Liste des domaines géographiques
|
|
|
255 |
domaine_geo="France métro & Corse;Océan Indien;Martinique;Guadeloupe;Guyane;Nouvelle-Calédonie;Polynésie française;St Martin & St Barth;St Pierre et Miquelon;Terres Australes"
|
|
|
256 |
; Liste des domaines taxonomiques
|
|
|
257 |
domaine_taxo="Trachéophytes;Bryophytes;Champignons;Lichens;Algues"
|
|
|
258 |
; Liste des codes de nomenclatures
|
|
|
259 |
domaine_code="CINB;CINPC"
|
|
|
260 |
; Liste des licences proposées pour les référentiels
|
|
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261 |
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