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78 delphine 1
<?php
2
// declare(encoding='UTF-8');
3
/**
4
 * Classe Controleur du module Fiche Taxon.
5
 *
6
 * @category	Php 5.2
7
 * @package		Taxon
8
 * @author		Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
9
 * @copyright	2010 Tela-Botanica
10
 * @license		http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
11
 * @license		http://www.gnu.org/licenses/gpl.html Licence GNU-GPL
12
 * @version		SVN: $Id: Fiche.php 96 2010-06-21 16:46:31Z jpm $
13
 */
14
class FicheTaxon extends AppliControleur {
15
 
16
	private $donnees = array();
17
	protected $taxonDao = null;
85 delphine 18
	private $tableau_manuel = null;
19
	private $num_taxon = array(0=>0,1=>0,2=>0);
78 delphine 20
 
21
	//+----------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
22
	// Méthodes
23
	/**
24
	 * Fonction d'affichage par défaut
25
	 */
26
	public function executerActionParDefaut() {
27
		return $this->afficherTaxon();
28
	}
29
 
30
	// +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
82 delphine 31
	// FICHE CONSULTATION TAXON
78 delphine 32
	public function afficherTaxon() {
33
		// Récupération du référentiel
34
		if (isset($_GET['ref'])) {
35
			$this->referentiel = strtolower($_GET['ref']);
36
		}
37
		// Gestion des actions par défaut
38
		$this->taxonDao = new TaxonDao();
39
		$this->definirCommeModulePrincipal(get_class($this));
40
		$this->construireMenu($this->referentiel);
41
		$this->construireFilAriane($this->referentiel);
134 delphine 42
		$this->executerActionReferentiel('Recherche', 'chargerMoteurRecherche', $this->referentiel, 10);
78 delphine 43
 
44
		// Gestion des données de la requête
45
		if (!isset($_GET['num_nom'])) {
46
 
47
		} else {
48
			// Récupération des données
49
			$this->donnees['referentiel'] = $this->referentiel;
50
			$this->donnees['num_nom'] = $_GET['num_nom'];
82 delphine 51
			$this->donnees['info'] = $this->taxonDao->getTaxon($this->referentiel, $this->donnees['num_nom']);
103 jpm 52
			$this->donnees['num_nom_retenu'] = $this->donnees['info']['num_nom_retenu'];
149 jpm 53
			$this->donnees['nom'] = $this->donnees['info']['nom_sci'];
204 delphine 54
			$this->donnees['exclu_taxref'] = $this->donnees['info']['exclure_taxref'];
78 delphine 55
 
88 delphine 56
			if ($this->donnees['info'] != '') {
57
				// Chargement des données des onglets
58
				$this->chargerNomenclature();
59
				$this->chargerSynonymie();
60
				$this->chargerClassification();
61
				$this->chargerChorologie();
62
				$this->chargerComplements();
63
			}
78 delphine 64
 
65
			$this->setSortie(self::RENDU_CORPS, $this->getVue('fiche_taxon', $this->donnees));
66
		}
67
	}
68
 
82 delphine 69
	private function chargerNomenclature() {
70
		$this->donnees['selectionne'] = $this->taxonDao->getNomenclature($this->referentiel, $this->donnees['num_nom']);
168 delphine 71
		if ($this->donnees['num_nom'] != $this->donnees['num_nom_retenu'] && $this->donnees['num_nom_retenu'] != '') {
72
			$this->donnees['retenu'] = $this->taxonDao->getNomenclature($this->referentiel, $this->donnees['num_nom_retenu']);
73
		}
74
		if ($this->donnees['info']['hybride_parent_01'] != '' && $this->donnees['info']['hybride_parent_02'] != '') {
75
			$this->donnees['parents'] = $this->taxonDao->getParentsHybride($this->referentiel, $this->donnees['num_nom']);
76
		} elseif ($this->donnees['info']['hybride_parent_01'] != '' || $this->donnees['info']['hybride_parent_02'] != ''){
77
			$this->donnees['parents'] = $this->taxonDao->getParentsHybride($this->referentiel, $this->donnees['num_nom']);
82 delphine 78
		}
79
	}
80
 
81
	// recherche les synonymes (à compléter)
82
	private function chargerSynonymie() {
83
		$rechercheDao = new RechercheDao();
84
		// recherche des synonymes nomenclaturaux et taxonomiques
85
		$parametres = $this->parserChaineDeRecherche('nn:'.$this->donnees['num_nom'].' tax:1');
86
		$parametres['ref']= $this->referentiel;
85 delphine 87
		$synonymes = $rechercheDao->chercher('ParTaxon', $parametres);
88
		if ($synonymes != '') {
89
			foreach ($synonymes as $synonyme) {
104 delphine 90
				$this->trierSynonymesNomenclaturauxTaxonomiques($synonyme);
91
				$this->trierSynonymesMalAppliques($synonyme);
92
				$this->trierSynonymesOrthographiques($synonyme);
82 delphine 93
			}
104 delphine 94
		}
95
		// synonyme proparte
96
		if ($this->donnees['info']['synonyme_proparte'] != ''){
260 delphine 97
			$propartes = explode(',', $this->donnees['info']['synonyme_proparte']);
98
			foreach ($propartes as $proparte) {
99
				$this->donnees['pp'][] = $this->taxonDao->getTaxonAffichage($this->referentiel, trim($proparte));
85 delphine 100
			}
104 delphine 101
		}
102
		// homonymie
149 jpm 103
		$nom = $this->encodeChaine($this->donnees['info']['nom_sci']);
110 jpm 104
		$homonymes = $this->taxonDao->getHomonyme($this->referentiel, $nom);
105
		if (count($homonymes) > 1) {
106
			foreach ($homonymes as $id => &$homonyme) {
107
				$homonyme['statut'] = $homonyme['homonyme'];
108
			}
109
 
117 delphine 110
			$this->donnees['h'] = $homonymes;
104 delphine 111
		}
112
	}
110 jpm 113
 
104 delphine 114
	private function trierSynonymesNomenclaturauxTaxonomiques($synonyme) {
115
		if ($this->donnees['num_nom'] != $synonyme['num_nom'] && $synonyme['basionyme'] != null) {
116
			if (($this->donnees['num_nom'] != $synonyme['num_nom']) && ($synonyme['basionyme'] ==
117
					$this->donnees['num_nom'] || $this->donnees['info']['basionyme'] == $synonyme['num_nom'] ||
118
					$this->donnees['info']['basionyme'] == $synonyme['basionyme'])) {
117 delphine 119
				$this->donnees['n'][] = $synonyme;
104 delphine 120
			} elseif ($this->donnees['num_nom'] != $synonyme['num_nom'] && $synonyme['basionyme'] != null &&
121
					$this->donnees['info']['basionyme'] != null) {
117 delphine 122
				$this->donnees['t'][] = $synonyme;
204 delphine 123
			} else {
124
				$this->donnees['i'][] = $synonyme;
125
			}
104 delphine 126
		} elseif ($this->donnees['num_nom'] != $synonyme['num_nom']) {
117 delphine 127
			$this->donnees['i'][] = $synonyme;
104 delphine 128
		}
129
	}
110 jpm 130
 
104 delphine 131
	private function trierSynonymesMalAppliques($synonyme) {
132
		if ($synonyme['synonyme_mal_applique'] == 1) {
133
			if ($synonyme['num_nom'] == $synonyme['num_nom_retenu']) {
134
				$synonyme['statut'] = 'posséde des synonymes mal appliqués';
135
			} else {
136
				$synonyme['statut'] = 'est synonyme mal appliqué du num_nom '.$synonyme['num_nom_retenu'];
88 delphine 137
			}
117 delphine 138
			$this->donnees['ma'][] = $synonyme;
104 delphine 139
		}
82 delphine 140
	}
110 jpm 141
 
104 delphine 142
	private function trierSynonymesOrthographiques($synonyme) {
143
		if (isset($synonyme['synonyme_orthographique']) && $synonyme['synonyme_orthographique'] != '') {
144
			if ($synonyme['synonyme_orthographique'] == $synonyme['num_nom']) {
145
				$synonyme['statut'] = 'posséde des synonymes orthographiques';
146
			} else {
147
				$synonyme['statut'] = 'est synonyme orthographique du num_nom '.$synonyme['synonyme_orthographique'];
148
			}
117 delphine 149
			$this->donnees['o'][] = $synonyme;
104 delphine 150
		}
151
	}
82 delphine 152
 
153
	private function chargerChorologie() {
85 delphine 154
		$this->chargerTableauManuel('presence');
155
		$this->chargerTableauManuel('statuts_origine');
156
		$this->chargerTableauManuel('statuts_introduction');
157
		$this->chargerTableauManuel('statuts_culture');
82 delphine 158
		foreach ($this->donnees['info'] as $param => $valeur) {
159
			if ($param == 'presence') {
160
				$this->donnees['chorologie']['Présence']['France']['code'] = $valeur;
85 delphine 161
				$this->donnees['chorologie']['Présence']['France']['valeur'] = $this->tableau_manuel['presence'][$valeur];
82 delphine 162
			} elseif (preg_match('/presence_(.*)/', $param, $lieu)) {
163
				$this->donnees['chorologie']['Présence'][$lieu['1']]['code'] = $valeur;
85 delphine 164
				$this->donnees['chorologie']['Présence'][$lieu['1']]['valeur'] = $this->tableau_manuel['presence'][$valeur];
82 delphine 165
			} elseif ($param == 'statut_origine') {
166
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine']['France']['code'] = $valeur;
85 delphine 167
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine']['France']['valeur'] =
168
					$this->tableau_manuel['statuts_origine'][$valeur];
82 delphine 169
			} elseif (preg_match('/statut_origine_(.*)/', $param, $lieu)) {
170
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine'][$lieu['1']]['code'] = $valeur;
85 delphine 171
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine'][$lieu['1']]['valeur'] =
172
					$this->tableau_manuel['statuts_origine'][$valeur];
82 delphine 173
			} elseif ($param == 'statut_introduction') {
174
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction']['France']['code'] = $valeur;
85 delphine 175
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction']['France']['valeur'] =
176
					$this->tableau_manuel['statuts_introduction'][$valeur];
82 delphine 177
			} elseif (preg_match('/statut_introduction_(.*)/', $param, $lieu)) {
178
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction'][$lieu['1']]['code'] = $valeur;
85 delphine 179
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction'][$lieu['1']]['valeur'] =
180
					$this->tableau_manuel['statuts_introduction'][$valeur];
82 delphine 181
			} elseif ($param == 'statut_culture') {
182
				$this->donnees['chorologie']['Statut de culture']['France']['code'] = $valeur;
85 delphine 183
				$this->donnees['chorologie']['Statut de culture']['France']['valeur'] =
184
					$this->tableau_manuel['statuts_culture'][$valeur];
82 delphine 185
			} elseif (preg_match('/statut_culture_(.*)/', $param, $lieu)) {
186
				$this->donnees['chorologie']['Statut de culture'][$lieu['1']]['code'] = $valeur;
85 delphine 187
				$this->donnees['chorologie']['Statut de culture'][$lieu['1']]['valeur'] =
188
					$this->tableau_manuel['statuts_culture'][$valeur];
82 delphine 189
			}
190
		}
110 jpm 191
		foreach ($this->donnees['chorologie']['Présence'] as $lieu => $valeur) {
82 delphine 192
			if (!isset($this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine'][$lieu])) {
193
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine'][$lieu]['code'] = '';
194
			}
195
			if (!isset($this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction'][$lieu])) {
196
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction'][$lieu]['code'] = '';
197
			}
198
			if (!isset($this->donnees['chorologie']['Statut de culture'][$lieu])) {
199
				$this->donnees['chorologie']['Statut de culture'][$lieu]['code'] = '';
200
			}
201
		}
202
	}
203
 
85 delphine 204
	private function chargerClassification() {
113 delphine 205
		$this->chargerTableauManuel('signification_rang');
243 delphine 206
		$this->chargerTableauManuel('presence');
113 delphine 207
		$this->donnees['valeur_rang'] = $this->tableau_manuel['signification_rang'];
243 delphine 208
		$this->donnees['valeur_presence'] = $this->tableau_manuel['presence'];
168 delphine 209
		if ($this->donnees['info']['num_tax_sup'] != '' && $this->donnees['info']['num_tax_sup'] !== "0") {
210
			$this->donnees['classification']['supérieurs'] = array_reverse($this->taxonDao->getClassification
211
				('Superieur', $this->referentiel, $this->donnees['info']['num_tax_sup']));
212
		} elseif (isset($this->donnees['retenu']['num_tax_sup']) && ($this->donnees['retenu']['num_tax_sup'] != '')) {
213
			$this->donnees['classification']['supérieurs'] = array_reverse($this->taxonDao->getClassification
85 delphine 214
				('Superieur', $this->referentiel, $this->donnees['retenu']['num_tax_sup']));
215
		}
216
		if ($this->donnees['num_nom_retenu'] != '') {
217
			$class_inf = $this->taxonDao->getClassification
218
				('Inferieur', $this->referentiel, $this->donnees['num_nom_retenu']);
168 delphine 219
			if ($class_inf != '') {
88 delphine 220
				$this->donnees['classification']['inférieurs'] = $class_inf['inf'];
221
				$this->donnees['niveau'] = $class_inf['niveau'];
241 delphine 222
				arsort($class_inf['nb_par_rang']);
223
				$this->donnees['noms_rang'] = $class_inf['nb_par_rang'];
224
			}
85 delphine 225
		}
226
	}
227
 
104 delphine 228
	private function chargerComplements() {
85 delphine 229
		$champs_manuel_technique = explode(',', $this->manuel['champs']);
230
		$champs_base_donnees = key($this->donnees['info']);
231
		$champs_supp_base = array_diff_key($this->donnees['info'], array_flip($champs_manuel_technique));
232
		foreach ($champs_supp_base as $champ=>$valeur) {
233
			if (!(preg_match('/presence_(.*)/',$champ) || preg_match('/statut_origine_(.*)/', $champ) ||
234
				 preg_match('/statut_introduction_(.*)/', $champ) || preg_match('/statut_culture_(.*)/', $champ))) {
235
				$this->donnees['complement'][$champ] = $valeur;
236
			}
237
		}
238
	}
239
 
82 delphine 240
	private function parserChaineDeRecherche($chaine) {
241
		$mots = preg_split('/ /i', $chaine, -1, PREG_SPLIT_NO_EMPTY);
242
		$parametres = array('mots' => '');
243
		$cle_precedente = null;
244
		foreach ($mots as $mot) {
245
			if (preg_match('/^(sg|gen|sp|ssp|au|an|nn|bib|nr|tax):(.*)$/', $mot, $match)) {
246
				$cle = $match[1];
247
				$cle_precedente = $cle;
248
				$valeur = $match[2];
249
				$parametres[$cle] = $valeur;
250
			} else if (!is_null($cle_precedente)) {
251
				$parametres[$cle_precedente] .= ' '.$mot;
252
			} else if (is_null($cle_precedente)) {
253
				if (empty($parametres['mots'])) {
254
					$parametres['mots'] = $mot;
255
				} else {
256
					$parametres['mots'] .= ' '.$mot;
257
				}
258
			}
259
		}
260
		return $parametres;
261
	}
262
 
88 delphine 263
	public function encodeChaine($chaine) {
264
		if (Config::get('sortie_encodage') != Config::get('appli_encodage')) {
265
			$chaine = mb_convert_encoding($chaine, Config::get('sortie_encodage'), Config::get('appli_encodage'));
266
		}
267
		$chaine = urlencode($chaine);
268
		return $chaine;
269
	}
270
 
82 delphine 271
	// retourne l'url de la fiche taxon pour les liens
78 delphine 272
	public static function getUrlFicheTaxon($params, $type) {
273
		$taxon = null;
274
		switch ($type) {
275
			case 'bas' :
276
				$taxon['num_nom'] = $params['bas_num'];
277
				break;
278
			case 'p1' :
279
				$taxon['num_nom'] = $params['p1_num'];
280
				break;
281
			case 'p2' :
282
				$taxon['num_nom'] = $params['p2_num'];
283
				break;
245 delphine 284
			default : $taxon['num_nom'] = $params;
110 jpm 285
				break;
78 delphine 286
		}
287
		return Recherche::getUrlFicheTaxon($taxon);
288
	}
289
 
85 delphine 290
	// charger tableau de $this->manuel
291
	private function chargerTableauManuel($titreTableau) {
292
		$champs = explode(',', $this->manuel[$titreTableau]);
293
		foreach ($champs as $champ) {
294
			list($champ_nom, $type) = explode('=', trim($champ));
295
			$this->tableau_manuel[$titreTableau][$champ_nom] = $type;
296
		}
297
	}
298
 
78 delphine 299
 
300
}