76 |
delphine |
1 |
<?php
|
|
|
2 |
/**
|
|
|
3 |
* Service fournissant des données de la table contenant le référentiel de travail.
|
|
|
4 |
* Encodage en entrée : utf8
|
|
|
5 |
* Encodage en sortie : utf8
|
|
|
6 |
*
|
|
|
7 |
* @category Php 5.2
|
|
|
8 |
* @package Referentiel
|
|
|
9 |
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
|
|
|
10 |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
|
|
|
11 |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
|
|
|
12 |
* @copyright 2010 Tela-Botanica
|
|
|
13 |
* @version $Id$
|
|
|
14 |
*/
|
|
|
15 |
class FicheTaxon extends Ref {
|
86 |
delphine |
16 |
private $resultat = '';
|
76 |
delphine |
17 |
/**
|
|
|
18 |
* Méthode principale appelée avec une requête de type GET.
|
|
|
19 |
*/
|
|
|
20 |
public function getElement($params_url = array()) {
|
|
|
21 |
// Initialisation des variables
|
|
|
22 |
$info = array();
|
|
|
23 |
|
|
|
24 |
// Nour recherchons le type de requête demandé
|
|
|
25 |
$p = $this->traiterParametresUrl(array('type'), $params_url, false);
|
|
|
26 |
extract($p);
|
|
|
27 |
|
|
|
28 |
if (!is_null($type)) {
|
|
|
29 |
$methode = 'getElement'.$type;
|
|
|
30 |
if (method_exists($this, $methode)) {
|
|
|
31 |
array_shift($params_url);
|
86 |
delphine |
32 |
$ref = $params_url[0];
|
|
|
33 |
$num_nom = $params_url[1];
|
|
|
34 |
$info = $this->$methode($ref, $num_nom);
|
76 |
delphine |
35 |
} else {
|
|
|
36 |
$this->messages[] = "Le type d'information demandé '$type' n'est pas disponible.";
|
|
|
37 |
}
|
|
|
38 |
} else {
|
|
|
39 |
$this->messages[] = "Veuillez préciser le type de requête.";
|
|
|
40 |
}
|
|
|
41 |
|
|
|
42 |
// Envoie sur la sortie standard
|
|
|
43 |
$this->envoyer($info);
|
|
|
44 |
}
|
|
|
45 |
|
79 |
delphine |
46 |
/* Méthode pour récupérer les infos sur le taxon sélectionné (appelée une fois au chargement de la page
|
|
|
47 |
* Appelée avec les paramètres d'url suivant : /Taxon/ref/num_nom */
|
86 |
delphine |
48 |
public function getElementTaxon($ref, $num_nom) {
|
|
|
49 |
$requete = "SELECT * FROM {$ref} WHERE num_nom = {$num_nom};";
|
76 |
delphine |
50 |
|
|
|
51 |
// Récupération des résultats
|
|
|
52 |
try {
|
|
|
53 |
$info = '';
|
|
|
54 |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
|
|
|
55 |
|
|
|
56 |
if ($donnees === false) {
|
|
|
57 |
$this->messages[] = "La requête n'a retourné aucun résultat.";
|
|
|
58 |
} else {
|
|
|
59 |
$info = $donnees;
|
|
|
60 |
}
|
|
|
61 |
} catch (PDOException $e) {
|
|
|
62 |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
|
|
|
63 |
}
|
|
|
64 |
return $info;
|
|
|
65 |
}
|
|
|
66 |
|
79 |
delphine |
67 |
/* Méthode pour récupérer les infos sur un taxon (retourne seulement les champs affichés)
|
|
|
68 |
* Appelée avec les paramètres d'url suivant : /TaxonAffichage/ref/num_nom */
|
86 |
delphine |
69 |
public function getElementTaxonAffichage($ref, $num_nom) {
|
149 |
jpm |
70 |
$requete = "SELECT num_nom_retenu, num_nom, num_tax_sup, nom_sci, auteur, annee, biblio_origine, ".
|
86 |
delphine |
71 |
" nom_addendum, nom_francais FROM {$ref} WHERE num_nom = {$num_nom};";
|
79 |
delphine |
72 |
|
|
|
73 |
// Récupération des résultats
|
|
|
74 |
try {
|
|
|
75 |
$info = '';
|
|
|
76 |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
|
|
|
77 |
if ($donnees === array()) {
|
|
|
78 |
$this->messages[] = "La requête n'a retourné aucun résultat.";
|
|
|
79 |
} else {
|
|
|
80 |
$info = $donnees;
|
|
|
81 |
}
|
|
|
82 |
} catch (PDOException $e) {
|
|
|
83 |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
|
|
|
84 |
}
|
|
|
85 |
return $info;
|
|
|
86 |
}
|
|
|
87 |
|
|
|
88 |
/* Méthode pour récupérer les infos sur un taxon et so, basyonyme
|
|
|
89 |
* Appelée avec les paramètres d'url suivant : /Taxon/ref/num_nom */
|
86 |
delphine |
90 |
public function getElementNomenclature($ref, $num_nom) {
|
149 |
jpm |
91 |
$requete = "SELECT s.num_nom_retenu, s.num_nom, s.num_tax_sup, s.nom_sci, s.auteur, s.annee, ".
|
86 |
delphine |
92 |
" s.biblio_origine, s.nom_addendum, s.nom_francais, b.num_nom AS bas_num, b.num_nom_retenu AS ".
|
149 |
jpm |
93 |
" bas_num_retenu, b.nom_sci AS bas_nom, b.auteur AS bas_auteur, b.annee AS bas_annee, ".
|
86 |
delphine |
94 |
" b.biblio_origine AS bas_bib, b.nom_addendum AS bas_nom_add ".
|
372 |
mathias |
95 |
" FROM {$ref} s, {$ref} b WHERE s.num_basionyme = b.num_nom AND s.num_nom = {$num_nom};";
|
76 |
delphine |
96 |
|
|
|
97 |
// Récupération des résultats
|
|
|
98 |
try {
|
|
|
99 |
$info = '';
|
|
|
100 |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
|
|
|
101 |
if ($donnees === array()) {
|
86 |
delphine |
102 |
$info = $this->getElementTaxonAffichage($ref, $num_nom);
|
76 |
delphine |
103 |
} else {
|
|
|
104 |
$info = $donnees;
|
|
|
105 |
}
|
|
|
106 |
} catch (PDOException $e) {
|
|
|
107 |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
|
|
|
108 |
}
|
|
|
109 |
return $info;
|
|
|
110 |
}
|
|
|
111 |
|
79 |
delphine |
112 |
/* Méthode pour récupérer les infos sur les parents d'un taxon hybride sélectionné
|
|
|
113 |
* Appelée avec les paramètres d'url suivant : /ParentsHybride/ref/num_nom */
|
86 |
delphine |
114 |
public function getElementParentsHybride($ref, $num_nom) {
|
168 |
delphine |
115 |
$requete = "";
|
|
|
116 |
$requete_parents = "SELECT hybride_parent_01, hybride_parent_02 FROM {$ref} WHERE num_nom = {$num_nom};";
|
|
|
117 |
$parents = $this->bdd->query($requete_parents)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
|
|
|
118 |
if ($parents[0]['hybride_parent_01'] != '' && $parents[0]['hybride_parent_02'] != '') {
|
|
|
119 |
$requete = "SELECT p1.num_nom AS p1_num, p1.nom_sci AS p1_nom, p1.auteur AS p1_auteur, p1.annee AS p1_annee,
|
117 |
delphine |
120 |
p1.biblio_origine AS p1_bib, p1.nom_addendum AS p1_nom_add, p1.num_nom AS p1_num_retenu,
|
149 |
jpm |
121 |
p2.num_nom AS p2_num, p2.nom_sci AS p2_nom, p2.auteur AS p2_auteur, p2.annee AS p2_annee,
|
117 |
delphine |
122 |
p2.biblio_origine AS p2_bib, p2.nom_addendum AS p2_nom_add, p2.num_nom AS p2_num_retenu ".
|
86 |
delphine |
123 |
" FROM {$ref} p1, {$ref} p2, {$ref} h ".
|
|
|
124 |
" WHERE p1.num_nom = h.hybride_parent_01 AND p2.num_nom = h.hybride_parent_02 AND h.num_nom = {$num_nom};";
|
168 |
delphine |
125 |
} elseif ($parents[0]['hybride_parent_01'] != '' && $parents[0]['hybride_parent_02'] == '') {
|
|
|
126 |
$requete = "SELECT p1.num_nom AS p1_num, p1.nom_sci AS p1_nom, p1.auteur AS p1_auteur, p1.annee AS p1_annee,
|
|
|
127 |
p1.biblio_origine AS p1_bib, p1.nom_addendum AS p1_nom_add, p1.num_nom AS p1_num_retenu ".
|
|
|
128 |
" FROM {$ref} p1, {$ref} p2, {$ref} h ".
|
|
|
129 |
" WHERE p1.num_nom = h.hybride_parent_01 AND h.num_nom = {$num_nom};";
|
|
|
130 |
} elseif ($parents[0]['hybride_parent_01'] == '' && $parents[0]['hybride_parent_02'] != '') {
|
|
|
131 |
$requete = "SELECT p2.num_nom AS p2_num, p2.nom_sci AS p2_nom, p2.auteur AS p2_auteur, p2.annee AS p2_annee,
|
|
|
132 |
p2.biblio_origine AS p2_bib, p2.nom_addendum AS p2_nom_add, p2.num_nom AS p2_num_retenu ".
|
|
|
133 |
" FROM {$ref} p1, {$ref} p2, {$ref} h ".
|
|
|
134 |
" WHERE p2.num_nom = h.hybride_parent_02 AND h.num_nom = {$num_nom};";
|
|
|
135 |
}
|
76 |
delphine |
136 |
$donnees = array();
|
|
|
137 |
|
|
|
138 |
// Récupération des résultats
|
|
|
139 |
try {
|
|
|
140 |
$info = '';
|
|
|
141 |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
|
|
|
142 |
if ($donnees === array()) {
|
|
|
143 |
$this->messages[] = "La requête n'a retourné aucun résultat.";
|
|
|
144 |
} else {
|
|
|
145 |
$info = $donnees;
|
|
|
146 |
}
|
|
|
147 |
} catch (PDOException $e) {
|
|
|
148 |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
|
|
|
149 |
}
|
|
|
150 |
return $info;
|
|
|
151 |
}
|
|
|
152 |
|
86 |
delphine |
153 |
/* Méthode pour récupérer les infos sur les taxons de rang supérieur(retourne seulement les champs affichés)
|
|
|
154 |
* Appelée avec les paramètres d'url suivant : /TaxonSuperieur/ref/num_nom */
|
|
|
155 |
public function getElementTaxonSuperieur($ref, $num_nom) {
|
|
|
156 |
$taxonSuperieur = $num_nom;
|
|
|
157 |
$info = '';
|
|
|
158 |
while ($taxonSuperieur != null) {
|
149 |
jpm |
159 |
$requete = "SELECT num_nom, rang, num_tax_sup, nom_supra_generique, nom_sci, auteur, annee, "
|
243 |
delphine |
160 |
." biblio_origine, presence, nom_addendum FROM {$ref} WHERE num_nom = {$taxonSuperieur};";
|
86 |
delphine |
161 |
|
|
|
162 |
// Récupération des résultats
|
|
|
163 |
try {
|
|
|
164 |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
|
168 |
delphine |
165 |
if ($donnees === array() || isset($info[$donnees[0]['num_nom']])) {
|
86 |
delphine |
166 |
$taxonSuperieur = null;
|
|
|
167 |
} else {
|
|
|
168 |
$taxonSuperieur = $donnees[0]['num_tax_sup'];
|
|
|
169 |
$info[$donnees[0]['num_nom']] = $donnees[0];
|
|
|
170 |
}
|
|
|
171 |
} catch (PDOException $e) {
|
|
|
172 |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
|
|
|
173 |
}
|
|
|
174 |
}
|
|
|
175 |
return $info;
|
|
|
176 |
}
|
|
|
177 |
|
|
|
178 |
public function getElementTaxonInferieur($ref, $num_nom, $niveau = 1) {
|
149 |
jpm |
179 |
$requete = 'SELECT num_nom, rang, num_tax_sup, nom_supra_generique, nom_sci, auteur, annee, '.
|
243 |
delphine |
180 |
' biblio_origine, presence, nom_addendum '.
|
86 |
delphine |
181 |
"FROM {$ref} ".
|
|
|
182 |
'WHERE num_tax_sup = '.$num_nom.";";
|
|
|
183 |
// Récupération des résultats
|
|
|
184 |
try {
|
|
|
185 |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
|
|
|
186 |
if ($donnees === array()) {
|
168 |
delphine |
187 |
} elseif (isset($niveau) && $niveau >= 6) {
|
|
|
188 |
if ((isset($this->resultat['niveau']) && $niveau > $this->resultat['niveau']) || !isset($this->resultat['niveau'])) {
|
|
|
189 |
$this->resultat['niveau'] = $niveau;
|
|
|
190 |
}
|
|
|
191 |
foreach ($donnees as $donnee) {
|
|
|
192 |
$this->resultat['inf'][$donnee['num_nom']] = $donnee;
|
|
|
193 |
$this->resultat['inf'][$donnee['num_nom']]['niveau'] = $niveau;
|
241 |
delphine |
194 |
$this->resultat['nb_par_rang'][$donnee['rang']] =
|
|
|
195 |
(isset($this->resultat['nb_par_rang'][$donnee['rang']])) ?
|
|
|
196 |
$this->resultat['nb_par_rang'][$donnee['rang']] + 1
|
|
|
197 |
: 1;
|
168 |
delphine |
198 |
}
|
|
|
199 |
} elseif (count($donnees) >= 100 ||
|
|
|
200 |
(isset($this->resultat['inf']) && count($this->resultat['inf'])+count($donnees) >= 100)) {
|
|
|
201 |
if ((isset($this->resultat['niveau']) && $niveau > $this->resultat['niveau']) || !isset($this->resultat['niveau'])) {
|
|
|
202 |
$this->resultat['niveau'] = $niveau;
|
241 |
delphine |
203 |
$this->resultat['nb_niveau'][$niveau] = count($donnees);
|
168 |
delphine |
204 |
}
|
|
|
205 |
foreach ($donnees as $donnee) {
|
|
|
206 |
$this->resultat['inf'][$donnee['num_nom']] = $donnee;
|
241 |
delphine |
207 |
$this->resultat['nb_par_rang'][$donnee['rang']] =
|
|
|
208 |
(isset($this->resultat['nb_par_rang'][$donnee['rang']])) ?
|
|
|
209 |
$this->resultat['nb_par_rang'][$donnee['rang']] + 1
|
|
|
210 |
: 1;
|
168 |
delphine |
211 |
}
|
86 |
delphine |
212 |
} else {
|
|
|
213 |
if ((isset($this->resultat['niveau']) && $niveau > $this->resultat['niveau']) || !isset($this->resultat['niveau'])) {
|
|
|
214 |
$this->resultat['niveau'] = $niveau;
|
|
|
215 |
}
|
|
|
216 |
$niveau ++;
|
|
|
217 |
foreach ($donnees as $donnee) {
|
|
|
218 |
$this->resultat['inf'][$donnee['num_nom']] = $donnee;
|
|
|
219 |
$this->resultat['inf'][$donnee['num_nom']]['niveau'] = $niveau - 1;
|
|
|
220 |
$this->getElementTaxonInferieur($ref, $donnee['num_nom'], $niveau);
|
241 |
delphine |
221 |
$this->resultat['nb_par_rang'][$donnee['rang']] =
|
|
|
222 |
(isset($this->resultat['nb_par_rang'][$donnee['rang']])) ?
|
|
|
223 |
$this->resultat['nb_par_rang'][$donnee['rang']] + 1
|
|
|
224 |
: 1;
|
86 |
delphine |
225 |
}
|
|
|
226 |
}
|
|
|
227 |
} catch (PDOException $e) {
|
|
|
228 |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
|
|
|
229 |
}
|
|
|
230 |
return $this->resultat;
|
|
|
231 |
}
|
|
|
232 |
|
149 |
jpm |
233 |
public function getElementHomonyme($ref, $nom_sci) {
|
|
|
234 |
$requete = "SELECT num_nom_retenu, num_nom, nom_sci, auteur, annee, biblio_origine, homonyme, ".
|
207 |
delphine |
235 |
" nom_addendum, nom_francais FROM {$ref} WHERE nom_sci = '{$this->bdd->proteger($nom_sci)}';";
|
88 |
delphine |
236 |
|
|
|
237 |
// Récupération des résultats
|
|
|
238 |
try {
|
|
|
239 |
$info = '';
|
|
|
240 |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
|
|
|
241 |
if ($donnees === array()) {
|
|
|
242 |
$this->messages[] = "La requête n'a retourné aucun résultat.";
|
|
|
243 |
} else {
|
|
|
244 |
$info = $donnees;
|
|
|
245 |
}
|
|
|
246 |
} catch (PDOException $e) {
|
|
|
247 |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
|
|
|
248 |
}
|
|
|
249 |
return $info;
|
104 |
delphine |
250 |
}
|
|
|
251 |
|
|
|
252 |
public function getElementBasionyme($ref, $basionyme) {
|
149 |
jpm |
253 |
$requete = "SELECT num_nom_retenu, num_nom, nom_sci, auteur, annee, biblio_origine, homonyme, ".
|
372 |
mathias |
254 |
" nom_addendum, nom_francais FROM {$ref} WHERE num_basionyme = '{$basionyme}';";
|
104 |
delphine |
255 |
|
|
|
256 |
// Récupération des résultats
|
|
|
257 |
try {
|
|
|
258 |
$info = '';
|
|
|
259 |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
|
|
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260 |
if ($donnees === array()) {
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261 |
$this->messages[] = "La requête n'a retourné aucun résultat.";
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262 |
} else {
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263 |
$info = $donnees;
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264 |
}
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265 |
} catch (PDOException $e) {
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266 |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
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267 |
}
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268 |
return $info;
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88 |
delphine |
269 |
}
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270 |
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76 |
delphine |
271 |
}
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272 |
?>
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