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Rev Author Line No. Line
1636 raphael 1
<?php
2
/**
1929 raphael 3
 * @category  PHP
4
 * @package   jrest
5
 * @author    Raphaël Droz <raphael@tela-botania.org>
6
 * @copyright 2013 Tela-Botanica
7
 * @license   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
8
 * @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
9
 */
1636 raphael 10
 
11
/**
12
 * Service d'import de données d'observation du CEL au format XLS
1649 raphael 13
 *
14
 * Sont define()'d commme n° de colonne tous les abbrevs retournés par
1656 raphael 15
 * FormateurGroupeColonne::nomEnsembleVersListeColonnes() préfixés par C_  cf: detectionEntete()
1649 raphael 16
 *
17
 * Exemple d'un test:
18
 * $ GET "/jrest/ExportXLS/22506?format=csv&range=*&limite=13" \
19
 *   | curl -F "upload=@-" -F utilisateur=22506 "/jrest/ImportXLS"
20
 * # 13 observations importées
21
 * + cf MySQL general_log = 1
22
 *
23
 **/
1636 raphael 24
 
25
set_include_path(get_include_path() . PATH_SEPARATOR . dirname(dirname(realpath(__FILE__))) . '/lib');
26
// TERM
27
error_reporting(-1);
28
ini_set('html_errors', 0);
29
ini_set('xdebug.cli_color', 2);
30
require_once('lib/PHPExcel/Classes/PHPExcel.php');
1656 raphael 31
require_once('FormateurGroupeColonne.php');
1636 raphael 32
 
1640 raphael 33
 
34
date_default_timezone_set("Europe/Paris");
35
 
36
// nombre d'INSERT à cumuler par requête SQL
37
// (= nombre de lignes XLS à bufferiser)
1648 raphael 38
//define('NB_LIRE_LIGNE_SIMUL', 30);
39
define('NB_LIRE_LIGNE_SIMUL', 5);
1640 raphael 40
 
1933 raphael 41
// en cas d'import d'un fichier CSV, utilise fgetcsv() plutôt
42
// que PHPExcel ce qui se traduit par un gain de performances très substanciel
43
define('QUICK_CSV_IMPORT', TRUE);
44
 
1640 raphael 45
// Numbers of days between January 1, 1900 and 1970 (including 19 leap years)
46
// see traiterDateObs()
1675 raphael 47
// define("MIN_DATES_DIFF", 25569);
1640 raphael 48
 
49
 
1636 raphael 50
class MyReadFilter implements PHPExcel_Reader_IReadFilter {
1929 raphael 51
    // exclusion de colonnes
52
    public $exclues = array();
1640 raphael 53
 
1929 raphael 54
    // lecture par morceaux
1640 raphael 55
    public $ligne_debut = 0;
56
    public $ligne_fin = 0;
2055 aurelien 57
 
58
    public static $gestion_mots_cles = null;
1640 raphael 59
 
1929 raphael 60
    public function __construct() {}
61
    public function def_interval($debut, $nb) {
62
	$this->ligne_debut = $debut;
63
	$this->ligne_fin = $debut + $nb;
64
    }
1638 raphael 65
    public function readCell($colonne, $ligne, $worksheetName = '') {
1929 raphael 66
	if(@$this->exclues[$colonne]) return false;
67
	// si des n° de morceaux ont été initialisés, on filtre...
68
	if($this->ligne_debut && ($ligne < $this->ligne_debut || $ligne >= $this->ligne_fin)) return false;
69
	return true;
1636 raphael 70
    }
71
}
72
 
1675 raphael 73
// XXX: PHP 5.3
74
function __anonyme_1($v) {	return !$v['importable']; }
75
function __anonyme_2(&$v) {	$v = $v['nom']; }
76
function __anonyme_3($cell) { return !is_null($cell); };
77
function __anonyme_5($item) { return is_null($item) ? '?' : $item; }
78
function __anonyme_6() { return NULL; }
79
 
1636 raphael 80
class ImportXLS extends Cel  {
1929 raphael 81
    static function __anonyme_4(&$item, $key) { $item = self::quoteNonNull(trim($item)); }
1636 raphael 82
 
1929 raphael 83
    static $ordre_BDD = Array(
84
	"ce_utilisateur",
85
	"prenom_utilisateur",
86
	"nom_utilisateur",
87
	"courriel_utilisateur",
88
	"ordre",
89
	"nom_sel",
90
	"nom_sel_nn",
91
	"nom_ret",
92
	"nom_ret_nn",
93
	"nt",
94
	"famille",
95
	"nom_referentiel",
96
	"zone_geo",
97
	"ce_zone_geo",
98
	"date_observation",
99
	"lieudit",
100
	"station",
101
	"milieu",
102
	"mots_cles_texte",
103
	"commentaire",
104
	"transmission",
105
	"date_creation",
106
	"date_modification",
107
	"date_transmission",
108
	"latitude",
109
	"longitude",
110
	"altitude",
111
	"abondance",
112
	"certitude",
113
	"phenologie",
114
	"code_insee_calcule"
115
    );
1636 raphael 116
 
1929 raphael 117
    // cf: initialiser_pdo_ordered_statements()
118
    // eg: "INSERT INTO cel_obs (ce_utilisateur, ..., phenologie, code_insee_calcule) VALUES"
119
    // colonnes statiques d'abord, les autres ensuite, dans l'ordre de $ordre_BDD
120
    static $insert_prefix_ordre;
121
    // eg: "(<id>, <prenom>, <nom>, <email>, now(), now(), ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?)"
122
    // dont le nombre de placeholder dépend du nombre de colonnes non-statiques
123
    // colonnes statiques d'abord, les autres ensuite, dans l'ordre de $ordre_BDD
124
    static $insert_ligne_pattern_ordre;
1648 raphael 125
 
1929 raphael 126
    // seconde (meilleure) possibilité
127
    // cf: initialiser_pdo_statements()
128
    // eg: "INSERT INTO cel_obs (ce_utilisateur, ..., date_creation, ...phenologie, code_insee_calcule) VALUES"
129
    static $insert_prefix;
130
    // eg: "(<id>, <prenom>, <nom>, <email>, ?, ?, ?, now(), now(), ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?)"
131
    // dont le nombre de placeholder dépend du nombre de colonnes non-statiques
132
    static $insert_ligne_pattern;
1648 raphael 133
 
1929 raphael 134
    /*
135
      Ces colonnes:
136
      - sont propres à l'ensemble des enregistrements uploadés
137
      - sont indépendantes du numéro de lignes
138
      - n'ont pas de valeur par défaut dans la structure de la table
139
      - nécessitent une initialisation dans le cadre de l'upload
1649 raphael 140
 
1929 raphael 141
      initialiser_colonnes_statiques() y merge les données d'identification utilisateur
142
    */
143
    public $colonnes_statiques = Array(
144
	"ce_utilisateur" => NULL,
145
	"prenom_utilisateur" => NULL,
146
	"nom_utilisateur" => NULL,
147
	"courriel_utilisateur" => NULL,
1640 raphael 148
 
1929 raphael 149
	// fixes (fonction SQL)
150
	// XXX future: mais pourraient varier dans le futur si la mise-à-jour
151
	// d'observation est implémentée
152
	"date_creation" => "now()",
153
	"date_modification" => "now()",
154
    );
1640 raphael 155
 
1929 raphael 156
    public $id_utilisateur = NULL;
1649 raphael 157
 
1929 raphael 158
    // erreurs d'import
159
    public $bilan = Array();
1642 raphael 160
 
1929 raphael 161
    // cache (pour traiterLocalisation() pour l'instant)
162
    static $cache = Array('geo' => array());
1649 raphael 163
 
1929 raphael 164
    function ImportXLS($config) {
165
	parent::__construct($config);
166
    }
167
 
168
    function createElement($pairs) {
169
	if(!isset($pairs['utilisateur']) || trim($pairs['utilisateur']) == '') {
170
	    exit('0');
1636 raphael 171
	}
172
 
1929 raphael 173
	$id_utilisateur = intval($pairs['utilisateur']);
174
	$this->id_utilisateur = $id_utilisateur; // pour traiterImage();
1649 raphael 175
 
1929 raphael 176
	if(!isset($_SESSION)) session_start();
177
	$this->controleUtilisateur($id_utilisateur);
1640 raphael 178
 
1929 raphael 179
	$this->utilisateur = $this->getInfosComplementairesUtilisateur($id_utilisateur);
2034 aurelien 180
 
1636 raphael 181
 
2034 aurelien 182
 
1929 raphael 183
	$this->initialiser_colonnes_statiques($id_utilisateur);
1649 raphael 184
 
1929 raphael 185
	// initialisation du statement PDO/MySQL
186
	// première version, pattern de requête pas génial
187
	/* list(self;;$insert_prefix_ordre, self::$insert_ligne_pattern_ordre) =
188
	   $this->initialiser_pdo_ordered_statements($this->colonnes_statiques); */
189
	list(self::$insert_prefix, self::$insert_ligne_pattern) =
190
	    $this->initialiser_pdo_statements($this->colonnes_statiques);
1636 raphael 191
 
1929 raphael 192
	$infos_fichier = array_pop($_FILES);
1636 raphael 193
 
1929 raphael 194
	/*$objPHPExcel = PHPExcel_IOFactory::load($infos_fichier['tmp_name']);
195
	  $donnees = $objPHPExcel->getActiveSheet()->toArray(NULL,FALSE,FALSE,TRUE);*/
1636 raphael 196
 
1929 raphael 197
	/*$objReader = PHPExcel_IOFactory::createReader("Excel5");
198
	  $objReader->setReadDataOnly(true);
199
	  $objPHPExcel = $objReader->load($infos_fichier['tmp_name']);*/
1636 raphael 200
 
1929 raphael 201
	//var_dump($donnees);
1636 raphael 202
 
1929 raphael 203
	// renomme le fichier pour lui ajouter son extension initiale, ce qui
204
	// permet (une sorte) d'autodétection du format.
205
	$fichier = $infos_fichier['tmp_name'];
206
	$extension = pathinfo($infos_fichier['name'], PATHINFO_EXTENSION);
207
	if( (strlen($extension) == 3 || strlen($extension) == 4) &&
208
	    (@rename($fichier, $fichier . '.' . $extension))) { // XXX: @ safe-mode
209
	    $fichier = $fichier . '.' . $extension;
210
	}
1642 raphael 211
 
1929 raphael 212
	$objReader = PHPExcel_IOFactory::createReaderForFile($fichier);
213
	// TODO: check if compatible with toArray(<1>,<2>,TRUE,<4>)
214
	$objReader->setReadDataOnly(true);
1640 raphael 215
 
1929 raphael 216
	// TODO: is_a obsolete entre 5.0 et 5.3, retirer le @ à terme
1933 raphael 217
	$IS_CSV = @is_a($objReader, 'PHPExcel_Reader_CSV') && QUICK_CSV_IMPORT;
218
	// en cas d'usage de fgetcsv, testons que nous pouvons compter les lignes
219
	if($IS_CSV) $nb_lignes = intval(exec("wc -l $fichier"));
220
	// et, le cas échéant, fallback sur PHPExcel à nouveau. La raison de ce test ici est
221
	// l'instabilité du serveur (safe_mode, safe_mode_exec_dir, symlink vers binaires pour exec(), ... multiples points-of-failure)
222
	if($IS_CSV && !$nb_lignes) $IS_CSV = FALSE;
223
 
224
	if($IS_CSV) {
1929 raphael 225
	    $objReader->setDelimiter(',')
226
		->setEnclosure('"')
227
		->setLineEnding("\n")
228
		->setSheetIndex(0);
229
	}
1642 raphael 230
 
1929 raphael 231
	// on ne conserve que l'en-tête
232
	$filtre = new MyReadFilter();
233
	$filtre->def_interval(1, 2);
234
	$objReader->setReadFilter($filtre);
1640 raphael 235
 
1929 raphael 236
	$objPHPExcel = $objReader->load($fichier);
237
	$obj_infos = $objReader->listWorksheetInfo($fichier);
1636 raphael 238
 
1933 raphael 239
	if($IS_CSV) {
240
	    // $nb_lignes est déjà défini ci-dessus
241
	    $csvFileHandler = fopen($fichier, 'r');
242
	    // nous utilisons la valeur de retour dans un but informatif de l'utilisateur à la
243
	    // fin de l'import, *mais aussi* dans un array_diff_key() ci-dessous car bien que dans le
244
	    // fond le "parser" fgetcsv() n'ait pas d'intérêt à connaître les colonnes à ignorer,
245
	    // il se trouve que celles-ci peuvent interférer sur des fonctions comme traiterEspece()
246
	    // cf test "ref-nom-num.test.php" pour lequel l'élément C_NOM_SEL vaudrait 3 et $ligne serait array(3 => -42)
247
	    $filtre->exclues = self::detectionEntete(fgetcsv($csvFileHandler), TRUE);
248
	} else {
249
	    // XXX: indépendant du readFilter ?
250
	    $nb_lignes = $obj_infos[0]['totalRows'];
251
	    $donnees = $objPHPExcel->getActiveSheet()->toArray(NULL, FALSE, TRUE, TRUE);
252
	    $filtre->exclues = self::detectionEntete($donnees[1]);
253
	}
1636 raphael 254
 
1929 raphael 255
	$obs_ajouts = 0;
256
	$obs_maj = 0;
257
	$nb_images_ajoutees = 0;
258
	$nb_mots_cle_ajoutes = 0;
1677 raphael 259
 
1929 raphael 260
	$dernier_ordre = Cel::db()->requeter("SELECT MAX(ordre) AS ordre FROM cel_obs WHERE ce_utilisateur = $id_utilisateur");
261
	$dernier_ordre = intval($dernier_ordre[0]['ordre']) + 1;
262
	if(! $dernier_ordre) $dernier_ordre = 0;
1640 raphael 263
 
1929 raphael 264
	// on catch to les trigger_error(E_USER_NOTICE);
265
	set_error_handler(array($this, 'erreurs_stock'), E_USER_NOTICE);
1933 raphael 266
	$this->taxon_info_webservice = new RechercheInfosTaxonBeta($this->config, NULL);
1642 raphael 267
 
1933 raphael 268
 
1929 raphael 269
	// lecture par morceaux (chunks), NB_LIRE_LIGNE_SIMUL lignes à fois
270
	// pour aboutir des requêtes SQL d'insert groupés.
271
	for($ligne = 2; $ligne < $nb_lignes + NB_LIRE_LIGNE_SIMUL; $ligne += NB_LIRE_LIGNE_SIMUL) {
1933 raphael 272
	    if(!$IS_CSV) {
273
		$filtre->def_interval($ligne, NB_LIRE_LIGNE_SIMUL);
274
		$objReader->setReadFilter($filtre);
1640 raphael 275
 
1933 raphael 276
		/* recharge avec $filtre actif (filtre sur lignes colonnes):
277
		   - exclue les colonnes inutiles/inutilisables)
278
		   - ne selectionne que les lignes dans le range [$ligne - $ligne + NB_LIRE_LIGNE_SIMUL] */
279
		$objPHPExcel = $objReader->load($fichier)->getActiveSheet();
1640 raphael 280
 
1933 raphael 281
		// set col typing
282
		if(C_CE_ZONE_GEO != 'C_CE_ZONE_GEO')
283
		    $objPHPExcel->getStyle(C_CE_ZONE_GEO . '2:' . C_CE_ZONE_GEO . $objPHPExcel->getHighestRow())->getNumberFormat()->setFormatCode('00000');
1818 raphael 284
 
1933 raphael 285
		// TODO: set to string type
286
		if(C_ZONE_GEO != 'C_ZONE_GEO')
287
		    $objPHPExcel->getStyle(C_ZONE_GEO . '2:' . C_ZONE_GEO . $objPHPExcel->getHighestRow())->getNumberFormat()->setFormatCode('00000');
1818 raphael 288
 
1933 raphael 289
		$donnees = $objPHPExcel->toArray(NULL, FALSE, TRUE, TRUE);
290
	    }
291
	    else {
292
		$i = NB_LIRE_LIGNE_SIMUL;
293
		$donnees = array();
294
		while($i--) {
295
		    $tab = fgetcsv($csvFileHandler);
296
		    if(!$tab) continue;
297
		    $donnees[] = array_diff_key($tab, $filtre->exclues);
298
		}
1818 raphael 299
 
1933 raphael 300
	    }
301
 
302
	    // var_dump($donnees, get_defined_constants(true)['user']);die;
1929 raphael 303
	    // ici on appel la fonction qui fera effectivement l'insertion multiple
304
	    // à partir des (au plus) NB_LIRE_LIGNE_SIMUL lignes
1640 raphael 305
 
1929 raphael 306
	    // TODO: passer $this, ne sert que pour appeler des méthodes publiques qui pourraient être statiques
307
	    list($enregistrements, $images, $mots_cle) =
308
		self::chargerLignes($this, $donnees, $this->colonnes_statiques, $dernier_ordre);
309
	    if(! $enregistrements) break;
1642 raphael 310
 
1929 raphael 311
	    self::trierColonnes($enregistrements);
312
	    // normalement: NB_LIRE_LIGNE_SIMUL, sauf si une enregistrement ne semble pas valide
313
	    // ou bien lors du dernier chunk
1648 raphael 314
 
1929 raphael 315
	    $nb_rec = count($enregistrements);
316
	    $sql_pattern = self::$insert_prefix .
317
		str_repeat(self::$insert_ligne_pattern_ordre . ', ', $nb_rec - 1) .
318
		self::$insert_ligne_pattern_ordre;
1648 raphael 319
 
1929 raphael 320
	    $sql_pattern = self::$insert_prefix .
321
		str_repeat(self::$insert_ligne_pattern . ', ', $nb_rec - 1) .
322
		self::$insert_ligne_pattern;
1648 raphael 323
 
1929 raphael 324
	    Cel::db()->beginTransaction();
325
	    $stmt = Cel::db()->prepare($sql_pattern);
326
	    $donnees = array();
327
	    foreach($enregistrements as $e) $donnees = array_merge($donnees, array_values($e));
1648 raphael 328
 
2034 aurelien 329
	     // echo $sql_pattern . "\n"; var_dump($enregistrements, $donnees); die; // debug ici
1648 raphael 330
 
1929 raphael 331
	    $stmt->execute($donnees);
1648 raphael 332
 
1929 raphael 333
	    // $stmt->debugDumpParams(); // https://bugs.php.net/bug.php?id=52384
334
	    $dernier_autoinc = Cel::db()->lastInsertId();
335
	    Cel::db()->commit();
1648 raphael 336
 
1929 raphael 337
	    if(! $dernier_autoinc) trigger_error("l'insertion semble avoir échoué", E_USER_NOTICE);
1648 raphael 338
 
1929 raphael 339
	    $obs_ajouts += count($enregistrements);
340
	    // $obs_ajouts += count($enregistrements['insert']);
341
	    // $obs_maj += count($enregistrements['update']);
2034 aurelien 342
 
343
	    $ordre_ids = self::chargerCorrespondancesIdOrdre($this, $enregistrements);
344
 
345
	    $nb_images_ajoutees += self::stockerImages($enregistrements, $images, $ordre_ids);
1929 raphael 346
	    $nb_mots_cle_ajoutes += self::stockerMotsCle($enregistrements, $mots_cle, $dernier_autoinc);
347
	}
1642 raphael 348
 
1929 raphael 349
	restore_error_handler();
1642 raphael 350
 
1929 raphael 351
	if($this->bilan) echo implode("\n", $this->bilan) . "\n";
352
	printf('%1$d observation%2$s ajoutée%2$s' . "\n" .
353
	       '%3$d image%4$s attachée%4$s' . "\n" .
354
	       // '%5$d mot%6$c-clef ajouté%6$c [TODO]' . "\n" . // TODO
355
	       (count($filtre->exclues) > 0 ? 'colonne%7$s non-traitée%7$s: %8$s' . "\n" : ''),
1792 raphael 356
 
1929 raphael 357
	       $obs_ajouts,
358
	       $obs_ajouts > 1 ? 's' : '',
359
	       $nb_images_ajoutees,
360
	       $nb_images_ajoutees > 1 ? 's' : '',
361
	       $nb_mots_cle_ajoutes,
362
	       $nb_mots_cle_ajoutes > 1 ? 's' : '',
363
	       count($filtre->exclues) > 1 ? 's' : '',
364
	       implode(', ', $filtre->exclues));
365
	die();
366
    }
1636 raphael 367
 
1933 raphael 368
    /* detectionEntete() sert deux rôles:
369
       1) détecter le type de colonne attendu à partir des textes de la ligne d'en-tête afin de define()
370
       2) permet d'identifier les colonnes non-supportées/inutiles afin d'alléger le processus de parsing de PHPExcel
371
       grace au ReadFilter (C'est le rôle de la valeur de retour)
372
 
373
       La raison de la présence du paramètre $numeric_keys est que pour réussir à identifier les colonnes à exclure nous
374
       devons traiter un tableau représentant la ligne d'en-tête aussi bien:
375
       - sous forme associative pour PHPExcel (les clefs sont les lettres de l'alphabet)
376
       - sous forme de clefs numériques (fgetcsv())
377
       Le détecter après coup est difficile et pourtant cette distinction est importante car le comportement
378
       d'array_merge() (réordonnancement des clefs numérique) n'est pas souhaitable dans le second cas. */
379
    static function detectionEntete($entete, $numeric_keys = FALSE) {
1929 raphael 380
	$colonnes_reconnues = Array();
381
	$cols = FormateurGroupeColonne::nomEnsembleVersListeColonnes('standard,avance');
382
	foreach($entete as $k => $v) {
383
	    // traite les colonnes en faisant fi de la casse et des accents
384
	    $entete_simple = iconv('UTF-8', 'ASCII//TRANSLIT', strtolower(trim($v)));
385
	    foreach($cols as $col) {
386
		$entete_officiel_simple = iconv('UTF-8', 'ASCII//TRANSLIT', strtolower(trim($col['nom'])));
387
		$entete_officiel_abbrev = $col['abbrev'];
388
		if($entete_simple == $entete_officiel_simple || $entete_simple == $entete_officiel_abbrev) {
389
		    // debug echo "define C_" . strtoupper($entete_officiel_abbrev) . ", $k ($v)\n";
390
		    define("C_" . strtoupper($entete_officiel_abbrev), $k);
391
		    $colonnes_reconnues[$k] = 1;
392
		    break;
1636 raphael 393
		}
1929 raphael 394
	    }
395
	}
396
	// défini tous les index que nous utilisons à une valeur d'index de colonne Excel qui n'existe pas dans
397
	// le tableau renvoyé par PHPExcel
398
	// Attention cependant d'utiliser des indexes différenciés car traiterLonLat() et traiterEspece()
399
	// les utilisent
400
	foreach($cols as $col) {
401
	    if(!defined("C_" . strtoupper($col['abbrev'])))
402
		define("C_" . strtoupper($col['abbrev']), "C_" . strtoupper($col['abbrev']));
403
	}
1636 raphael 404
 
1929 raphael 405
	// prépare le filtre de PHPExcel qui évitera le traitement de toutes les colonnes superflues
1640 raphael 406
 
1929 raphael 407
	// eg: diff ( Array( H => Commune, I => rien ) , Array( H => 1, K => 1 )
408
	// ==> Array( I => rien )
409
	$colonnesID_non_reconnues = array_diff_key($entete, $colonnes_reconnues);
1636 raphael 410
 
1929 raphael 411
	// des colonnes de FormateurGroupeColonne::nomEnsembleVersListeColonnes()
412
	// ne retient que celles marquées "importables"
413
	$colonnes_automatiques = array_filter($cols, '__anonyme_1');
1640 raphael 414
 
1929 raphael 415
	// ne conserve que le nom long pour matcher avec la ligne XLS d'entête
416
	array_walk($colonnes_automatiques, '__anonyme_2');
1640 raphael 417
 
1929 raphael 418
	// intersect ( Array ( N => Milieu, S => Ordre ), Array ( ordre => Ordre, phenologie => Phénologie ) )
419
	// ==> Array ( S => Ordre, AA => Phénologie )
420
	$colonnesID_a_exclure = array_intersect($entete, $colonnes_automatiques);
1636 raphael 421
 
1933 raphael 422
	if($numeric_keys) {
423
	    return $colonnesID_non_reconnues + $colonnesID_a_exclure;
424
	}
1929 raphael 425
	// TODO: pourquoi ne pas comparer avec les abbrevs aussi ?
426
	// merge ( Array( I => rien ) , Array ( S => Ordre, AA => Phénologie ) )
427
	// ==> Array ( I => rien, AA => Phénologie )
428
	return array_merge($colonnesID_non_reconnues, $colonnesID_a_exclure);
429
    }
2034 aurelien 430
 
431
    static function chargerCorrespondancesIdOrdre($cel, $lignes) {
432
 
433
    	$ordre_ids = array();
434
 
435
    	$requete_obs_ids = "SELECT id_observation, ordre FROM cel_obs WHERE ordre IN (";
436
    	foreach($lignes as &$ligne) {
437
    		$requete_obs_ids .= $ligne['ordre'].',';
438
    	}
439
    	$requete_obs_ids = rtrim($requete_obs_ids, ',');
440
    	$requete_obs_ids .= ") AND ce_utilisateur = ".Cel::db()->proteger($cel->id_utilisateur);
441
 
442
 
443
    	$obs_ids = Cel::db()->requeter($requete_obs_ids);
444
    	foreach($obs_ids as &$obs) {
445
    		$ordre_ids[$obs['ordre']] = $obs['id_observation'];
446
    	}
447
    	return $ordre_ids;
448
    }
1636 raphael 449
 
1929 raphael 450
    /*
451
     * charge un groupe de lignes
452
     */
453
    static function chargerLignes($cel, $lignes, $colonnes_statiques, &$dernier_ordre) {
454
	$enregistrement = NULL;
455
	$enregistrements = Array();
456
	$toutes_images = Array();
457
	$tous_mots_cle = Array();
1640 raphael 458
 
1929 raphael 459
	foreach($lignes as $ligne) {
1933 raphael 460
	    // dans le cas de fgetcsv, on peut avoir des false additionnel (cf do/while l. 279)
461
	    if($ligne === false) continue;
462
 
1929 raphael 463
	    //$ligne = array_filter($ligne, function($cell) { return !is_null($cell); });
464
	    //if(!$ligne) continue;
465
	    // on a besoin des NULL pour éviter des notice d'index indéfini
466
	    if(! array_filter($ligne, '__anonyme_3')) continue;
1640 raphael 467
 
1929 raphael 468
	    if( ($enregistrement = self::chargerLigne($ligne, $dernier_ordre, $cel)) ) {
469
		// $enregistrements[] = array_merge($colonnes_statiques, $enregistrement);
470
		$enregistrements[] = $enregistrement;
471
		$pos = count($enregistrements) - 1;
472
		$last = &$enregistrements[$pos];
1640 raphael 473
 
1929 raphael 474
		if(isset($enregistrement['_images'])) {
475
		    // ne dépend pas de cel_obs, et seront insérées *après* les enregistrements
476
		    // mais nous ne voulons pas nous priver de faire des INSERT multiples pour autant
477
		    $toutes_images[] = Array("images" => $last['_images'],
478
					     "obs_pos" => $pos);
479
		    // ce champ n'a pas à faire partie de l'insertion dans cel_obs,
480
		    // mais est utile pour cel_obs_images
481
		    unset($last['_images']);
482
		}
1640 raphael 483
 
1929 raphael 484
		if(isset($enregistrement['_mots_cle'])) {
485
		    // ne dépend pas de cel_obs, et seront insérés *après* les enregistrements
486
		    // mais nous ne voulons pas nous priver de faire des INSERT multiples pour autant
487
		    $tous_mots_cle[] = Array("mots_cle" => $last['_mots_cle'],
488
					     "obs_pos" => $pos);
489
		    // la version inlinée des mots est enregistrées dans cel_obs
490
		    // mais cel_mots_cles_obs fait foi.
491
		    // XXX: postponer l'ajout de ces informations dans cel_obs *après* l'insertion effective
492
		    // des records dans cel_mots_cles_obs ?
493
		    unset($last['_mots_cle']);
1636 raphael 494
		}
1640 raphael 495
 
1929 raphael 496
		$dernier_ordre++;
497
	    }
1642 raphael 498
	}
1640 raphael 499
 
1929 raphael 500
	// XXX future: return Array($enregistrements_a_inserer, $enregistrements_a_MAJ, $toutes_images);
501
	return Array($enregistrements, $toutes_images, $tous_mots_cle);
502
    }
1642 raphael 503
 
504
 
1929 raphael 505
    static function trierColonnes(&$enregistrements) {
506
	foreach($enregistrements as &$enregistrement) {
507
	    $enregistrement = self::sortArrayByArray($enregistrement, self::$ordre_BDD);
508
	    //array_walk($enregistrement, function(&$item, $k) { $item = is_null($item) ? "NULL" : $item; });
509
	    //$req .= implode(', ', $enregistrement) . "\n";
1677 raphael 510
	}
1929 raphael 511
    }
1677 raphael 512
 
1642 raphael 513
 
1929 raphael 514
    static function stockerMotsCle($enregistrements, $tous_mots_cle, $lastid) {
515
	$c = 0;
516
	// debug: var_dump($tous_mots_cle);die;
517
	foreach($tous_mots_cle as $v) $c += count($v['mots_cle']['to_insert']);
518
	return $c;
519
    }
1642 raphael 520
 
2034 aurelien 521
    static function stockerImages($enregistrements, $toutes_images, $ordre_ids) {
1929 raphael 522
	$images_insert = 'INSERT INTO cel_obs_images (id_image, id_observation) VALUES %s ON DUPLICATE KEY UPDATE id_image = id_image';
523
	$images_obs_assoc = Array();
1650 raphael 524
 
1929 raphael 525
	foreach($toutes_images as $images_pour_obs) {
526
	    $obs = $enregistrements[$images_pour_obs["obs_pos"]];
2034 aurelien 527
	    $id_obs = $ordre_ids[$obs['ordre']]; // id réel de l'observation correspondant à l'ordre
1929 raphael 528
	    foreach($images_pour_obs['images'] as $image) {
529
		$images_obs_assoc[] = sprintf('(%d,%d)',
530
					      $image['id_image'], // intval() useless
531
					      $id_obs); // intval() useless
532
	    }
1636 raphael 533
	}
534
 
1929 raphael 535
	if($images_obs_assoc) {
536
	    $requete = sprintf($images_insert, implode(', ', $images_obs_assoc));
537
	    // debug echo "$requete\n";
538
	    Cel::db()->requeter($requete);
539
	}
1770 raphael 540
 
1929 raphael 541
	return count($images_obs_assoc);
542
    }
1636 raphael 543
 
1929 raphael 544
    /*
545
      Aucune des valeurs présentes dans $enregistrement n'est quotée
546
      cad aucune des valeurs retournée par traiter{Espece|Localisation}()
547
      car ce tableau est passé à un PDO::preparedStatement() qui applique
548
      proprement les règle d'échappement.
549
    */
550
    static function chargerLigne($ligne, $dernier_ordre, $cel) {
551
	// évite des notices d'index lors des trigger_error()
552
	$ref_ligne = !empty($ligne[C_NOM_SEL]) ? trim($ligne[C_NOM_SEL]) : '';
1636 raphael 553
 
1929 raphael 554
	// en premier car le résultat est utile pour
555
	// * traiter espèce (traiterEspece())
556
	// * traiter longitude et latitude (traiterLonLat())
557
	$referentiel = self::identReferentiel(trim(strtolower(@$ligne[C_NOM_REFERENTIEL])), $ligne, $ref_ligne);
1852 raphael 558
 
1929 raphael 559
	// $espece est rempli de plusieurs informations
560
	$espece = Array(C_NOM_SEL => NULL, C_NOM_SEL_NN => NULL, C_NOM_RET => NULL,
561
			C_NOM_RET_NN => NULL, C_NT => NULL, C_FAMILLE => NULL);
562
	self::traiterEspece($ligne, $espece, $referentiel, $cel->taxon_info_webservice);
1636 raphael 563
 
1929 raphael 564
	if(!$espece[C_NOM_SEL]) $referentiel = Cel::$fallback_referentiel;
565
	if($espece[C_NOM_SEL] && !$espece[C_NOM_SEL_NN]) $referentiel = Cel::$fallback_referentiel;
1649 raphael 566
 
1929 raphael 567
	// $localisation est rempli à partir de plusieurs champs: C_ZONE_GEO et C_CE_ZONE_GEO
568
	$localisation = Array(C_ZONE_GEO => NULL, C_CE_ZONE_GEO => NULL);
569
	self::traiterLocalisation($ligne, $localisation);
1649 raphael 570
 
1929 raphael 571
	// $transmission est utilisé pour date_transmission
572
	// XXX: @ contre "Undefined index"
573
	@$transmission = in_array(strtolower(trim($ligne[C_TRANSMISSION])), array(1, 'oui')) ? 1 : 0;
1640 raphael 574
 
575
 
1929 raphael 576
	// Dans ce tableau, seules devraient apparaître les données variable pour chaque ligne.
577
	// Dans ce tableau, l'ordre des clefs n'importe pas (cf: self::sortArrayByArray())
578
	$enregistrement = Array(
579
	    "ordre" => $dernier_ordre,
1640 raphael 580
 
1929 raphael 581
	    "nom_sel" => $espece[C_NOM_SEL],
582
	    "nom_sel_nn" => $espece[C_NOM_SEL_NN],
583
	    "nom_ret" => $espece[C_NOM_RET],
584
	    "nom_ret_nn" => $espece[C_NOM_RET_NN],
585
	    "nt" => $espece[C_NT],
586
	    "famille" => $espece[C_FAMILLE],
1640 raphael 587
 
1929 raphael 588
	    "nom_referentiel" => $referentiel,
1640 raphael 589
 
1929 raphael 590
	    "zone_geo" => $localisation[C_ZONE_GEO],
591
	    "ce_zone_geo" => $localisation[C_CE_ZONE_GEO],
1642 raphael 592
 
1929 raphael 593
	    // $ligne: uniquement pour les infos en cas de gestion d'erreurs (date incompréhensible)
594
	    "date_observation" => isset($ligne[C_DATE_OBSERVATION]) ? self::traiterDateObs($ligne[C_DATE_OBSERVATION], $ref_ligne) : NULL,
1642 raphael 595
 
1929 raphael 596
	    "lieudit" => isset($ligne[C_LIEUDIT]) ? trim($ligne[C_LIEUDIT]) : NULL,
597
	    "station" => isset($ligne[C_STATION]) ? trim($ligne[C_STATION]) : NULL,
598
	    "milieu" => isset($ligne[C_MILIEU]) ? trim($ligne[C_MILIEU]) : NULL,
1642 raphael 599
 
1929 raphael 600
	    "mots_cles_texte" => NULL, // TODO: foreign-key
601
	    // XXX: @ contre "Undefined index"
602
	    "commentaire" => isset($ligne[C_COMMENTAIRE]) ? trim($ligne[C_COMMENTAIRE]) : NULL,
1648 raphael 603
 
1929 raphael 604
	    "transmission" => $transmission,
605
	    "date_transmission" => $transmission ? date("Y-m-d H:i:s") : NULL, // pas de fonction SQL dans un PDO statement, <=> now()
1648 raphael 606
 
1929 raphael 607
	    // $ligne: uniquement pour les infos en cas de gestion d'erreurs (lon/lat incompréhensible)
608
	    "latitude" => isset($ligne[C_LATITUDE]) ? self::traiterLonLat(NULL, $ligne[C_LATITUDE], $referentiel, $ref_ligne) : NULL,
609
	    "longitude" => isset($ligne[C_LONGITUDE]) ? self::traiterLonLat($ligne[C_LONGITUDE], NULL, $referentiel, $ref_ligne) : NULL,
610
	    "altitude" => isset($ligne[C_ALTITUDE]) ? intval($ligne[C_ALTITUDE]) : NULL, // TODO: guess alt from lon/lat
1642 raphael 611
 
1929 raphael 612
	    // @ car potentiellement optionnelles ou toutes vides => pas d'index dans PHPExcel (tableau optimisé)
613
	    "abondance" => @$ligne[C_ABONDANCE],
614
	    "certitude" => @$ligne[C_CERTITUDE],
615
	    "phenologie" => @$ligne[C_PHENOLOGIE],
1642 raphael 616
 
1929 raphael 617
	    "code_insee_calcule" => substr($localisation[C_CE_ZONE_GEO], -5) // varchar(5)
618
	);
1677 raphael 619
 
1929 raphael 620
	// passage de $enregistrement par référence, ainsi ['_images'] n'est défini
621
	// que si des résultats sont trouvés
622
	// "@" car PHPExcel supprime les colonnes null sur toute la feuille (ou tout le chunk)
623
	if(@$ligne[C_IMAGES]) self::traiterImage($ligne[C_IMAGES], $cel->id_utilisateur, $enregistrement);
1636 raphael 624
 
1929 raphael 625
	if(@$ligne[C_MOTS_CLES_TEXTE]) self::traiterMotsCle($ligne[C_MOTS_CLES_TEXTE], $cel->id_utilisateur, $enregistrement);
1675 raphael 626
 
1929 raphael 627
	return $enregistrement;
628
    }
1640 raphael 629
 
1929 raphael 630
    static function traiterImage($str, $id_utilisateur, &$enregistrement) {
631
	$liste_images = array_filter(explode("/", $str));
1640 raphael 632
 
1929 raphael 633
	//array_walk($liste_images, '__anonyme_4');
634
	array_walk($liste_images, array(__CLASS__, '__anonyme_4'));
635
	$requete = sprintf(
636
	    "SELECT id_image, nom_original FROM cel_images WHERE ce_utilisateur = %d AND nom_original IN (%s)",
637
	    $id_utilisateur,
638
	    implode(',', $liste_images));
1642 raphael 639
 
1929 raphael 640
	$resultat = Cel::db()->requeter($requete);
1678 raphael 641
 
1929 raphael 642
	if($resultat) $enregistrement['_images'] = $resultat;
643
    }
1642 raphael 644
 
1929 raphael 645
    static function traiterMotsCle($str, $id_utilisateur, &$enregistrement) {
646
	$liste_mots_cle = $liste_mots_cle_recherche = array_map("trim", array_unique(array_filter(explode(",", $str))));
647
	array_walk($liste_mots_cle_recherche, array(__CLASS__, '__anonyme_4'));
1677 raphael 648
 
2055 aurelien 649
	if(self::$gestion_mots_cles == null) {
650
		$gestion_mots_cles = new GestionMotsCles($this->config, 'obs');
651
	}
652
	$mots_cles_ids = $gestion_mots_cles->obtenirIdsMotClesPourMotsCles($liste_mots_cle, $id_utilisateur);
653
	foreach($mots_cles_ids as $mot_cle) {
654
		$resultat[$mot_cle['id_mot_cle']] = $mot_cle['mot_cle'];
655
	}
1677 raphael 656
 
1929 raphael 657
	$enregistrement['mots_cles_texte'] = implode(',', $liste_mots_cle);
658
	$enregistrement['_mots_cle'] = array("existing" => $resultat,
659
					     "to_insert" => array_diff($liste_mots_cle, $resultat));
660
    }
1640 raphael 661
 
1770 raphael 662
 
1929 raphael 663
    /* FONCTIONS de TRANSFORMATION de VALEUR DE CELLULE */
1640 raphael 664
 
1929 raphael 665
    // TODO: PHP 5.3, utiliser date_parse_from_format()
666
    // TODO: parser les heures (cf product-owner)
667
    // TODO: passer par le timestamp pour s'assurer de la validité
668
    static function traiterDateObs($date, $ref_ligne) {
669
	// TODO: see https://github.com/PHPOffice/PHPExcel/issues/208
670
	// TODO: PHPExcel_Shared_Date::ExcelToPHP()
671
	if(is_double($date)) {
672
	    if($date > 0)
673
		return PHPExcel_Style_NumberFormat::toFormattedString($date, PHPExcel_Style_NumberFormat::FORMAT_DATE_YYYYMMDD2) . " 00:00:00";
674
	    trigger_error("ligne \"{$ref_ligne}\": " .
675
			  "Attention: date antérieure à 1970 et format de cellule \"DATE\" utilisés ensemble",
676
			  E_USER_NOTICE);
1640 raphael 677
 
1929 raphael 678
	    // throw new Exception("erreur: date antérieure à 1970 et format de cellule \"DATE\" utilisés ensemble");
1640 raphael 679
 
1929 raphael 680
	    // attention, UNIX timestamp, car Excel les décompte depuis 1900
681
	    // cf http://fczaja.blogspot.fr/2011/06/convert-excel-date-into-timestamp.html
682
	    // $timestamp = ($date - MIN_DATES_DIFF) * 60 * 60 * 24 - time(); // NON
1636 raphael 683
 
1929 raphael 684
	    // $timestamp = PHPExcel_Calculation::getInstance()->calculateFormula("=" . $date . "-DATE(1970,1,1)*60*60*24"); // NON
1642 raphael 685
 
1929 raphael 686
	    // echo strftime("%Y/%m/%d 00:00:00", $timestamp); // NON
687
	}
688
	else {
689
	    // attend l'un des formats de
690
	    // http://www.php.net/manual/fr/datetime.formats.date.php
691
	    // le plus simple: YYYY/MM/DD (utilisé à l'export), mais DD-MM-YYYY est aussi supporté
692
	    $matches = NULL;
693
	    // et on essaie d'être sympa et supporter aussi DD/MM/YYYY
694
	    if(preg_match(';^([0-3]?\d)/([01]\d)/([12]\d\d\d)$;', $date, $matches)) {
695
		$date = $matches[3] . '/' . $matches[2] . '/' . $matches[1];
696
	    }
697
	    $timestamp = strtotime($date);
698
	    if(! $timestamp || $timestamp > time() + 3600 * 24 * 1) { // une journée d'avance maxi autorisée (décallage horaire ?)
699
		if($date) trigger_error("ligne \"{$ref_ligne}\": Attention: date erronée ($date)", E_USER_NOTICE);
1640 raphael 700
		return NULL;
1929 raphael 701
	    }
702
	    return strftime("%Y-%m-%d 00:00:00", $timestamp);
1636 raphael 703
	}
1929 raphael 704
    }
1636 raphael 705
 
1929 raphael 706
    static function identReferentiel($referentiel, $ligne, $ref_ligne) {
707
	// SELECT DISTINCT nom_referentiel, COUNT(id_observation) AS count FROM cel_obs GROUP BY nom_referentiel ORDER BY count DESC;
708
	if(strpos($referentiel, 'bdtfx') !== FALSE) return 'bdtfx'; //:v1.01';
709
	if(strpos($referentiel, 'bdtxa') !== FALSE) return 'bdtxa'; //:v1.00';
710
	//if(strpos($referentiel, 'bdnff') !== FALSE) return 'bdnff'; //:4.02';
711
	if(strpos($referentiel, 'bdnff') !== FALSE) return 'bdtfx';
712
	if(strpos($referentiel, 'isfan') !== FALSE) return 'isfan'; //:v1.00';
713
	if(strpos($referentiel, 'autre') !== FALSE) return 'autre';
1640 raphael 714
 
1929 raphael 715
	if($referentiel && isset($ligne[C_NOM_SEL]) && $ligne[C_NOM_SEL]) {
716
	    trigger_error("ligne \"{$ref_ligne}\": Attention: référentiel \"{$referentiel}\" inconnu", E_USER_NOTICE);
717
	    return 'autre';
718
	}
1642 raphael 719
 
1929 raphael 720
	// pas de référentiel ou pas de NOM_SEL: NULL
721
	return NULL;
722
	/* TODO: cf story,
723
	   En cas de NULL faire une seconde passe de détection à partir du nom saisi
724
	   + accepter les n° de version */
725
    }
1642 raphael 726
 
1929 raphael 727
    static function traiterLonLat($lon = NULL, $lat = NULL, $referentiel = 'bdtfx', $ref_ligne) {
728
	// en CSV ces valeurs sont des string, avec séparateur en français (","; cf défauts dans ExportXLS)
729
	if($lon && is_string($lon)) $lon = str_replace(',', '.', $lon);
730
	if($lat && is_string($lat)) $lat = str_replace(',', '.', $lat);
1640 raphael 731
 
1929 raphael 732
	// sprintf applique une précision à 5 décimale (comme le ferait MySQL)
733
	// tout en uniformisant le format de séparateur des décimales (le ".")
734
	if($lon && is_numeric($lon) && $lon >= -180 && $lon <= 180) return sprintf('%.5F', $lon);
735
	if($lat && is_numeric($lat) && $lat >= -90 && $lat <= 90) return sprintf('%.5F', $lat);
736
 
737
	if($lon || $lat) {
738
	    trigger_error("ligne \"{$ref_ligne}\": " .
739
			  "Attention: longitude ou latitude erronée",
740
			  E_USER_NOTICE);
1636 raphael 741
	}
1929 raphael 742
	return NULL;
1636 raphael 743
 
1929 raphael 744
	/* limite france métropole si bdtfx ? ou bdtxa ? ...
745
	   NON!
746
	   Un taxon d'un référentiel donné peut être théoriquement observé n'importe où sur le globe.
747
	   Il n'y a pas lieu d'effectuer des restriction ici.
748
	   Cependant des erreurs fréquentes (0,0 ou lon/lat inversées) peuvent être détectés ici.
749
	   TODO */
750
	$bbox = self::getReferentielBBox($referentiel);
751
	if(!$bbox) return NULL;
1642 raphael 752
 
1929 raphael 753
	if($lon) {
754
	    if($lon < $bbox['EST'] && $lon > $bbox['OUEST']) return is_numeric($lon) ? $lon : NULL;
755
	    else return NULL;
756
	}
757
	if($lat) {
758
	    if($lat < $bbox['NORD'] && $lat > $bbox['SUD']) return is_numeric($lat) ? $lat : NULL;
759
	    return NULL;
760
	}
761
    }
1651 raphael 762
 
1929 raphael 763
    /*
764
      TODO: s'affranchir du webservice pour la détermination du nom scientifique en s'appuyant sur cel_references,
765
      pour des questions de performances
766
    */
767
    static function traiterEspece($ligne, Array &$espece, &$referentiel, $taxon_info_webservice) {
768
	if(empty($ligne[C_NOM_SEL])) {
769
	    // TODO: nous ne déclarons pas "Numéro nomenclatural" comme colonne importable
770
	    // Nous ne pouvons donc pas tenter d'être sympa sur la détermination par num_nom
771
	    /* if(!empty($ligne[C_NOM_SEL_NN]) && $referentiel != Cel::$fallback_referentiel)
772
	       $ligne[C_NOM_SEL] = $referentiel . ':nn:' . $ligne[C_NOM_SEL_NN];
773
	       else */
774
	    return;
775
	}
1651 raphael 776
 
1929 raphael 777
	// nom_sel reste toujours celui de l'utilisateur
778
	$espece[C_NOM_SEL] = trim($ligne[C_NOM_SEL]);
1640 raphael 779
 
1929 raphael 780
	// XXX/attention, nous ne devrions pas accepter un référentiel absent !
781
	if(!$referentiel) $referentiel = 'bdtfx';
782
	$taxon_info_webservice->setReferentiel($referentiel);
783
	$ascii = iconv('UTF-8', 'ASCII//TRANSLIT', $ligne[C_NOM_SEL]);
1688 raphael 784
 
1929 raphael 785
	// TODO: si empty(C_NOM_SEL) et !empty(C_NOM_SEL_NN) : recherche info à partir de C_NOM_SEL_NN
786
	// echo "rechercherInformationsComplementairesSurNom()\n";
787
	/*
788
	  SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu ,auteur, annee, biblio_origine, nom_sci,auteur  FROM bdtfx_v1_01  WHERE (nom_sci LIKE 'Heliotropium europaeum')  ORDER BY nom_sci ASC	  LIMIT 0, 1
789
	  #
790
	  SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu ,auteur, annee, biblio_origine, nom_sci,auteur  FROM bdtfx_v1_01  WHERE (nom_sci LIKE 'eliotropium euro')  ORDER BY nom_sci ASC   LIMIT 0, 1
791
	  SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu ,auteur, annee, biblio_origine, nom_sci,auteur  FROM bdtfx_v1_01  WHERE (nom_sci LIKE 'eliotropium')	ORDER BY nom_sci ASC   LIMIT 0, 1
792
	  SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu ,auteur, annee, biblio_origine, nom_sci,auteur  FROM bdtfx_v1_01  WHERE (nom_sci LIKE 'eliotropium% euro%')  ORDER BY nom_sci ASC   LIMIT 0, 1
793
	  #
1640 raphael 794
 
1929 raphael 795
	  SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html, auteur, annee, biblio_origine FROM bdtfx_v1_01 WHERE num_nom = 31468
796
	*/
797
	// $determ = $taxon_info_webservice->rechercherInformationsComplementairesSurNom($ligne[C_NOM_SEL]);
798
	// permet une reconnaissance de bdtfx:nn:XXXX
799
	$determ = $taxon_info_webservice->rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax(trim($ligne[C_NOM_SEL]));
1640 raphael 800
 
1929 raphael 801
	// note: rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax peut ne retourner qu'une seule clef "nom_sel"
802
	if (! $determ) {
803
	    // on supprime les noms retenus et renvoi tel quel
804
	    // on réutilise les define pour les noms d'indexes, tant qu'à faire
805
	    // XXX; tout à NULL sauf C_NOM_SEL ci-dessus ?
806
	    $espece[C_NOM_SEL_NN] = @$ligne[C_NOM_SEL_NN];
807
	    $espece[C_NOM_RET] = @$ligne[C_NOM_RET];
808
	    $espece[C_NOM_RET_NN] = @$ligne[C_NOM_RET_NN];
809
	    $espece[C_NT] = @$ligne[C_NT];
810
	    $espece[C_FAMILLE] = @$ligne[C_FAMILLE];
1781 raphael 811
 
1929 raphael 812
	    return;
813
	}
1781 raphael 814
 
1929 raphael 815
	// succès de la détection, mais résultat partiel
816
	if(!isset($determ->id))
817
	    $determ = $taxon_info_webservice->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($determ->{"nom_retenu.id"});
1784 raphael 818
 
1929 raphael 819
	// ne devrait jamais arriver !
820
	if(!$determ) die("erreur critique: " . __FILE__ . ':' . __LINE__);
1784 raphael 821
 
1929 raphael 822
	// un schéma <ref>:(nt|nn):<num> (ie: bdtfx:nt:8503) a été passé
823
	// dans ce cas on met à jour le référentiel avec celui passé dans le champ espèce
824
	if(isset($determ->ref)) {
825
	    $referentiel = $determ->ref;
1640 raphael 826
	}
827
 
1929 raphael 828
	// succès de la détection
829
	// nom_sel est remplacé, mais seulement si un motif spécial à été utilisé (bdtfx:nn:4567)
830
	if($taxon_info_webservice->is_notation_spe) {
831
	    $espece[C_NOM_SEL] = $determ->nom_sci;
1688 raphael 832
	}
833
 
1929 raphael 834
	// écrasement des numéros (nomenclatural, taxonomique) saisis...
835
	$espece[C_NOM_SEL_NN] = $determ->id;
836
	$espece[C_NOM_RET] = RechercheInfosTaxonBeta::supprimerBiblio($determ->nom_retenu_complet);
837
	$espece[C_NOM_RET_NN] = $determ->{"nom_retenu.id"};
838
	$espece[C_NT] = $determ->num_taxonomique;
839
	$espece[C_FAMILLE] = $determ->famille;
840
	return;
841
	// et des info complémentaires
1697 raphael 842
 
1797 raphael 843
	/*
1929 raphael 844
	// GET /service:eflore:0.1/bdtfx/noms/31468?retour.champs=nom_sci,auteur,id,nom_retenu_complet,nom_retenu.id,num_taxonomique,famille
845
	/home/raphael/eflore/projets/services/modules/0.1/bdtfx/Noms.php:280
846
	SELECT  *, nom_sci   FROM bdtfx_v1_01	 WHERE num_nom = '31468'
847
	SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html, auteur, annee, biblio_origine FROM bdtfx_v1_01 WHERE num_nom = 31468
848
	SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html, auteur, annee, biblio_origine FROM bdtfx_v1_01 WHERE num_nom = 86535
1797 raphael 849
	*/
1770 raphael 850
 
1697 raphael 851
 
1929 raphael 852
	//var_dump($complement, $espece);die;
853
    }
1697 raphael 854
 
1929 raphael 855
    static function detectFromNom($nom) {
856
	$r = Cel::db()->requeter(sprintf("SELECT num_nom, num_tax_sup FROM bdtfx_v1_01 WHERE (nom_sci LIKE '%s') ".
857
					 "ORDER BY nom_sci ASC LIMIT 0, 1",
858
					 Cel::db()->proteger($nom)));
859
	if($r) return $r;
1697 raphael 860
 
1929 raphael 861
	Cel::db()->requeter(sprintf("SELECT num_nom, num_tax_sup FROM bdtfx_v1_01 WHERE (nom_sci LIKE '%s' OR nom LIKE '%s') ".
862
				    "ORDER BY nom_sci ASC LIMIT 0, 1",
863
				    Cel::db()->proteger($nom),
864
				    Cel::db()->proteger(str_replace(' ', '% ', $nom))));
865
	return $r;
866
    }
1697 raphael 867
 
868
 
1929 raphael 869
    /*
870
     * TODO: analyse rigoureuse:
871
     * == Identifiant Commune
872
     * - INSEE-C:\d{5}
873
     * - \d{5}
874
     * - \d{2}
875
     * == Commune
876
     * - \w+ (\d{2})
877
     * - \w+ (\d{5})
878
     * - \w+
879
     *
880
     */
881
    static function traiterLocalisation($ligne, Array &$localisation) {
882
	if(empty($ligne[C_ZONE_GEO])) $ligne[C_ZONE_GEO] = NULL;
883
	if(empty($ligne[C_CE_ZONE_GEO])) $ligne[C_CE_ZONE_GEO] = NULL;
1697 raphael 884
 
1929 raphael 885
	$identifiant_commune = trim($ligne[C_ZONE_GEO]);
886
	if(!$identifiant_commune) {
887
	    $departement = trim($ligne[C_CE_ZONE_GEO]);
888
 
889
	    if(strpos($departement, "INSEE-C:", 0) === 0) {
890
		$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = trim($ligne[C_CE_ZONE_GEO]);
891
		if(array_key_exists($localisation[C_CE_ZONE_GEO], self::$cache['geo'])) {
892
		    $localisation[C_ZONE_GEO] = self::$cache['geo'][$localisation[C_CE_ZONE_GEO]];
1697 raphael 893
		}
894
		else {
1929 raphael 895
		    $nom = Cel::db()->requeter(sprintf("SELECT nom FROM cel_zones_geo WHERE code = %s LIMIT 1",
896
						       self::quoteNonNull(substr($localisation[C_CE_ZONE_GEO], strlen("INSEE-C:")))));
897
		    if($nom) $localisation[C_ZONE_GEO] = $nom[0]['nom'];
898
		    self::$cache['geo'][$localisation[C_CE_ZONE_GEO]] = @$nom[0]['nom'];
1697 raphael 899
		}
1929 raphael 900
		return;
901
	    }
1697 raphael 902
 
1929 raphael 903
	    if(!is_numeric($departement)) {
904
		$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $ligne[C_CE_ZONE_GEO];
905
		return;
906
	    }
907
 
908
	    $cache_attempted = FALSE;
909
	    if(array_key_exists($departement, self::$cache['geo'])) {
910
		$cache_attempted = TRUE;
911
		if(self::$cache['geo'][$departement][0] && self::$cache['geo'][$departement][1]) {
912
		    $localisation[C_ZONE_GEO] = self::$cache['geo'][$departement][0];
913
		    $localisation[C_CE_ZONE_GEO] = self::$cache['geo'][$departement][1];
914
		    return;
1697 raphael 915
		}
1929 raphael 916
	    }
1697 raphael 917
 
1929 raphael 918
	    if(! $cache_attempted && ($resultat_commune = Cel::db()->requeter(sprintf("SELECT DISTINCT nom, CONCAT('INSEE-C:', code) AS code FROM cel_zones_geo WHERE code = %s LIMIT 1",
919
										      self::quoteNonNull($departement)))) ) {
920
		$localisation[C_ZONE_GEO] = $resultat_commune[0]['nom'];
921
		$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $resultat_commune[0]['code'];
922
		self::$cache['geo'][$departement] = array($resultat_commune[0]['nom'], $resultat_commune[0]['code']);
923
		return;
924
	    }
925
	    ;
926
	    // if(strlen($departement) == 4) $departement = "INSEE-C:0" . $departement;
927
	    // if(strlen($departement) == 5) $departement = "INSEE-C:" . $departement;
928
	    // if(strlen($departement) <= 9) return "INSEE-C:0" . $departement; // ? ... TODO
1697 raphael 929
 
1929 raphael 930
	    $departement = trim($departement); // TODO
1697 raphael 931
 
1929 raphael 932
	    $localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $ligne[C_CE_ZONE_GEO];
933
	    return;
934
	}
1697 raphael 935
 
936
 
1929 raphael 937
	$select = "SELECT DISTINCT nom, code FROM cel_zones_geo";
938
 
939
	if (preg_match('/(.+) \((\d{1,5})\)/', $identifiant_commune, $elements)) {
940
	    // commune + departement : montpellier (34)
941
	    $nom_commune=$elements[1];
942
	    $code_commune=$elements[2];
943
	    if(strlen($code_commune) <= 2) {
944
		$requete = sprintf("%s WHERE nom = %s AND code LIKE %s",
945
				   $select, self::quoteNonNull($nom_commune),
946
				   self::quoteNonNull($code_commune.'%'));
947
	    }
948
	    else {
949
		$requete = sprintf("%s WHERE nom = %s AND code = %d",
950
				   $select, self::quoteNonNull($nom_commune),
951
				   $code_commune);
952
	    }
953
	}
954
	elseif (preg_match('/^(\d+|(2[ab]\d+))$/i', $identifiant_commune, $elements)) {
955
	    // Code insee seul
956
	    $code_insee_commune=$elements[1];
957
	    $requete = sprintf("%s WHERE code = %s", $select, self::quoteNonNull($code_insee_commune));
958
	}
959
	else {
960
	    // Commune seule (le departement sera recupere dans la colonne departement si elle est presente)
961
	    // on prend le risque ici de retourner une mauvaise Commune
962
	    $nom_commune = str_replace(" ", "%", iconv('UTF-8', 'ASCII//TRANSLIT', $identifiant_commune));
963
	    $requete = sprintf("%s WHERE nom LIKE %s", $select, self::quoteNonNull($nom_commune.'%'));
964
	}
1697 raphael 965
 
966
 
1929 raphael 967
	if(array_key_exists($identifiant_commune, self::$cache['geo'])) {
968
	    $resultat_commune = self::$cache['geo'][$identifiant_commune];
1697 raphael 969
	}
1929 raphael 970
	else {
971
	    $resultat_commune = Cel::db()->requeter($requete);
972
	    self::$cache['geo'][$identifiant_commune] = $resultat_commune;
973
	}
974
	// TODO: levenstein sort ?
975
	// TODO: count résultat !
1697 raphael 976
 
1929 raphael 977
	// cas de la commune introuvable dans le référentiel
978
	// réinitialisation aux valeurs du fichier XLS
979
	if(! $resultat_commune) {
980
	    $localisation[C_ZONE_GEO] = trim($ligne[C_ZONE_GEO]);
981
	    $localisation[C_CE_ZONE_GEO] = trim($ligne[C_CE_ZONE_GEO]);
982
	} else {
983
	    $localisation[C_ZONE_GEO] = $resultat_commune[0]['nom'];
984
	    $localisation[C_CE_ZONE_GEO] = "INSEE-C:" . $resultat_commune[0]['code'];
985
	    return;
986
	}
1642 raphael 987
 
1929 raphael 988
	$departement = &$localisation[C_CE_ZONE_GEO];
1642 raphael 989
 
1929 raphael 990
	if(strpos($departement, "INSEE-C:", 0) === 0) {
991
	    $localisation[C_ZONE_GEO] = $localisation[C_ZONE_GEO];
992
	    $localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $localisation[C_CE_ZONE_GEO];
993
	}
994
 
995
 
996
	if(!is_numeric($departement)) {
997
	    $localisation[C_ZONE_GEO] = $localisation[C_ZONE_GEO];
998
	    $localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $localisation[C_CE_ZONE_GEO];
999
	}
1000
 
1001
	if(strlen($departement) == 4) $departement = "INSEE-C:0" . $departement;
1002
	if(strlen($departement) == 5) $departement = "INSEE-C:" . $departement;
1003
	// if(strlen($departement) <= 9) return "INSEE-C:0" . $departement; // ? ... TODO
1004
 
1005
	$departement = trim($departement); // TODO
1006
 
1007
	$localisation[C_ZONE_GEO] = $localisation[C_ZONE_GEO];
1008
	$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $localisation[C_CE_ZONE_GEO];
1009
    }
1010
 
1011
    /*
1012
      static function traiterLocalisation($ligne, Array &$localisation) {
1013
      $identifiant_commune = trim($ligne[C_ZONE_GEO]);
1014
      if(!$identifiant_commune) {
1015
      $departement = trim($ligne[C_CE_ZONE_GEO]);
1016
      goto testdepartement;
1017
      }
1018
 
1019
 
1020
      $select = "SELECT DISTINCT nom, code  FROM cel_zones_geo";
1642 raphael 1021
 
1929 raphael 1022
      if (preg_match('/(.*) \((\d+)\)/', $identifiant_commune, $elements)) {
1023
      // commune + departement : montpellier (34)
1024
      $nom_commune=$elements[1];
1025
      $code_commune=$elements[2];
1026
      $requete = sprintf("%s WHERE nom = %s AND code LIKE %s",
1027
      $select, self::quoteNonNull($nom_commune), self::quoteNonNull($code_commune.'%'));
1028
      }
1029
      elseif (preg_match('/^(\d+|(2[ab]\d+))$/i', $identifiant_commune, $elements)) {
1030
      // Code insee seul
1031
      $code_insee_commune=$elements[1];
1032
      $requete = sprintf("%s WHERE code = %s", $select, self::quoteNonNull($code_insee_commune));
1033
      }
1034
      else {
1035
      // Commune seule (le departement sera recupere dans la colonne departement si elle est presente)
1036
      // on prend le risque ici de retourner une mauvaise Commune
1037
      $nom_commune = str_replace(" ", "%", iconv('UTF-8', 'ASCII//TRANSLIT', $identifiant_commune));
1038
      $requete = sprintf("%s WHERE nom LIKE %s", $select, self::quoteNonNull($nom_commune.'%'));
1039
      }
1642 raphael 1040
 
1929 raphael 1041
      $resultat_commune = Cel::db()->requeter($requete);
1042
      // TODO: levenstein sort ?
1642 raphael 1043
 
1929 raphael 1044
      // cas de la commune introuvable dans le référentiel
1045
      // réinitialisation aux valeurs du fichier XLS
1046
      if(! $resultat_commune) {
1047
      $localisation[C_ZONE_GEO] = trim($ligne[C_ZONE_GEO]);
1048
      $localisation[C_CE_ZONE_GEO] = trim($ligne[C_CE_ZONE_GEO]);
1049
      } else {
1050
      $localisation[C_ZONE_GEO] = $resultat_commune[0]['nom'];
1051
      $localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $resultat_commune[0]['code'];
1052
      }
1642 raphael 1053
 
1929 raphael 1054
      $departement = &$localisation[C_CE_ZONE_GEO];
1642 raphael 1055
 
1929 raphael 1056
      testdepartement:
1057
      if(strpos($departement, "INSEE-C:", 0) === 0) goto protectloc;
1642 raphael 1058
 
1929 raphael 1059
      if(!is_numeric($departement)) goto protectloc; // TODO ?
1060
      if(strlen($departement) == 4) $departement = "INSEE-C:0" . $departement;
1061
      if(strlen($departement) == 5) $departement = "INSEE-C:" . $departement;
1062
      // if(strlen($departement) <= 9) return "INSEE-C:0" . $departement; // ? ... TODO
1642 raphael 1063
 
1929 raphael 1064
      $departement = trim($departement); // TODO
1642 raphael 1065
 
1929 raphael 1066
      protectloc:
1067
      $localisation[C_ZONE_GEO] = $localisation[C_ZONE_GEO];
1068
      $localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $localisation[C_CE_ZONE_GEO];
1069
      }
1070
    */
1640 raphael 1071
 
1072
 
1929 raphael 1073
    /* HELPERS */
1640 raphael 1074
 
1929 raphael 1075
    // http://stackoverflow.com/questions/348410/sort-an-array-based-on-another-array
1076
    // XXX; utilisé aussi (temporairement ?) par FormateurGroupeColonne.
1077
    static function sortArrayByArray($array, $orderArray) {
1078
	$ordered = array();
1079
	foreach($orderArray as $key) {
1080
	    if(array_key_exists($key, $array)) {
1081
		$ordered[$key] = $array[$key];
1082
		unset($array[$key]);
1083
	    }
1636 raphael 1084
	}
1929 raphael 1085
	return $ordered + $array;
1086
    }
1640 raphael 1087
 
1929 raphael 1088
    // retourne une BBox [N,S,E,O) pour un référentiel donné
1089
    static function getReferentielBBox($referentiel) {
1090
	if($referentiel == 'bdtfx') return Array(
1091
	    'NORD' => 51.2, // Dunkerque
1092
	    'SUD' => 41.3, // Bonifacio
1093
	    'EST' => 9.7, // Corse
1094
	    'OUEST' => -5.2); // Ouessan
1095
	return FALSE;
1096
    }
1640 raphael 1097
 
1929 raphael 1098
    // ces valeurs ne sont pas inséré via les placeholders du PDO::preparedStatement
1099
    // et doivent donc être échappées correctement.
1100
    public function initialiser_colonnes_statiques() {
1101
	$this->colonnes_statiques = array_merge($this->colonnes_statiques,
1102
						Array(
1103
						    "ce_utilisateur" => self::quoteNonNull($this->id_utilisateur), // peut-être un hash ou un id
1104
						    "prenom_utilisateur" => self::quoteNonNull($this->utilisateur['prenom']),
1105
						    "nom_utilisateur" => self::quoteNonNull($this->utilisateur['nom']),
1106
						    "courriel_utilisateur" => self::quoteNonNull($this->utilisateur['courriel']),
1107
						));
1640 raphael 1108
 
1929 raphael 1109
    }
1642 raphael 1110
 
1929 raphael 1111
    static function initialiser_pdo_ordered_statements($colonnes_statiques) {
1112
	return Array(
1113
	    // insert_ligne_pattern_ordre
1114
	    sprintf('INSERT INTO cel_obs (%s, %s) VALUES',
1115
		    implode(', ', array_keys($colonnes_statiques)),
1116
		    implode(', ', array_diff(self::$ordre_BDD, array_keys($colonnes_statiques)))),
1649 raphael 1117
 
1929 raphael 1118
	    // insert_ligne_pattern_ordre
1119
	    sprintf('(%s, %s ?)',
1120
		    implode(', ', $colonnes_statiques),
1121
		    str_repeat('?, ', count(self::$ordre_BDD) - count($colonnes_statiques) - 1))
1122
	);
1123
    }
1648 raphael 1124
 
1929 raphael 1125
    static function initialiser_pdo_statements($colonnes_statiques) {
1126
	return Array(
1127
	    // insert_prefix
1128
	    sprintf('INSERT INTO cel_obs (%s) VALUES ',
1129
		    implode(', ', self::$ordre_BDD)),
1649 raphael 1130
 
1650 raphael 1131
 
1929 raphael 1132
	    // insert_ligne_pattern, cf: self::$insert_ligne_pattern
1133
	    '(' .
1134
	    // 3) créé une chaîne de liste de champ à inséré en DB
1135
	    implode(', ', array_values(
1136
		// 2) garde les valeurs fixes (de $colonnes_statiques),
1137
		// mais remplace les NULL par des "?"
1138
		array_map('__anonyme_5',
1139
			  // 1) créé un tableau genre (nom_sel_nn => NULL) depuis self::$ordre_BDD
1140
			  // et écrase certaines valeurs avec $colonnes_statiques (initilisé avec les données utilisateur)
1141
			  array_merge(array_map('__anonyme_6', array_flip(self::$ordre_BDD)), $colonnes_statiques
1142
			  )))) .
1143
	    ')'
1144
	);
1145
    }
1649 raphael 1146
 
1929 raphael 1147
    // équivalent à Bdd2->proteger() (qui wrap PDO::quote),
1148
    // sans transformer NULL en ""
1149
    static function quoteNonNull($chaine) {
1150
	if(is_null($chaine)) return "NULL";
1151
	if(!is_string($chaine) && !is_integer($chaine)) {
1152
	    die("erreur: " . __FILE__ . ':' . __LINE__);
1642 raphael 1153
	}
1929 raphael 1154
	return Cel::db()->quote($chaine);
1155
    }
1642 raphael 1156
 
1929 raphael 1157
    public function erreurs_stock($errno, $errstr) {
1158
	$this->bilan[] = $errstr;
1159
    }
1636 raphael 1160
}