| 6 |
jpm |
1 |
<?php
|
|
|
2 |
|
|
|
3 |
// declare(encoding='UTF-8');// ou ISO-8859-15
|
|
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4 |
/**
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5 |
* Description :
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|
|
6 |
* Classe Taxons.php permettant de fournir des informations sur les noms scientifiques retenu.
|
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7 |
* Si l'url finit par /taxons on retourne une liste de noms latin et leurs identifiants (seulement les 100 premeiers noms par défaut).
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|
8 |
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /taxons?param1=val1¶m2=val2&...
|
|
|
9 |
*
|
|
|
10 |
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, recherche, rang, distinct, retour.format, nl.format,
|
|
|
11 |
* nl.structure, navigation.depart et navigation.limite.
|
|
|
12 |
*
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|
|
13 |
* Encodage en entrée : utf8
|
|
|
14 |
* Encodage en sortie : utf8
|
|
|
15 |
* @package framework-v3
|
|
|
16 |
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
|
|
|
17 |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
|
|
|
18 |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
|
|
|
19 |
* @version 1.0
|
|
|
20 |
* @copyright 1999-${year} Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
|
|
|
21 |
*/
|
|
|
22 |
|
|
|
23 |
|
|
|
24 |
class Taxons extends CommunNomsTaxons {
|
|
|
25 |
|
|
|
26 |
/**
|
|
|
27 |
* Valeur du paramètre de requete recherche stricte, etendue, floue */
|
|
|
28 |
protected $recherche = false;
|
|
|
29 |
|
|
|
30 |
/** Permet de stocker la requete formulée :
|
|
|
31 |
* - taxons | taxons/#id | taxons/#id/#champ+#champ
|
|
|
32 |
* - taxons/#id/relations | taxons/#id/relations/synonymie | taxons/#id/relations/homonymie
|
|
|
33 |
* | taxons/#id/relations/flores | taxons/#id/relations/superieurs | taxons/#id/relations/inferieurs
|
|
|
34 |
* - taxons/stats/rangs | taxons/stats/annees | taxons/stats/initiales */
|
|
|
35 |
protected $format_reponse = 'taxons';
|
|
|
36 |
|
|
|
37 |
/** Représente la première partie de la requete SQL (entre le SELECT et le WHERE)*/
|
|
|
38 |
protected $requete_champ = 'num_nom, nom_sci, num_nom_retenu, num_tax ';
|
|
|
39 |
|
|
|
40 |
/** Représente la partie de la requete SQL ajoutant une condition (WHERE ...)*/
|
|
|
41 |
protected $requete_condition = 'num_nom = num_nom_retenu ';
|
|
|
42 |
|
|
|
43 |
/** Représente la partie GROUP BY de la requete SQL (GROUP BY ...) */
|
|
|
44 |
protected $requete_group_by = ' ';
|
|
|
45 |
|
|
|
46 |
/** Permet de stocker les limite de la requete SQL (par défaut seul les 100 premiers résultats seront retournés). */
|
|
|
47 |
protected $limite_requete = array('depart' => 0, 'limite' => 100);
|
|
|
48 |
|
|
|
49 |
/** Stocke le num_nom du nom retenu du num_nom recherché */
|
|
|
50 |
protected $num_nom_taxon;
|
|
|
51 |
|
|
|
52 |
protected $service = 'taxons';
|
|
|
53 |
|
|
|
54 |
protected $presence_num_tax = true;
|
|
|
55 |
|
|
|
56 |
|
|
|
57 |
|
|
|
58 |
public function consulter($ressources, $parametres) {
|
|
|
59 |
|
|
|
60 |
$resultat_formate = '';
|
|
|
61 |
|
|
|
62 |
$this->initialiserRestClient(); //création d'un objet RestClient
|
|
|
63 |
$this->traiterParametres($parametres);
|
|
|
64 |
$this->traiterVersionProjet($ressources) ;
|
|
|
65 |
|
|
|
66 |
if ($this->corps_http == '' && $this->entete_http == '') {
|
|
|
67 |
foreach ($this->table_version as $version) {
|
|
|
68 |
$this->table = $version; //on stocke ici la table correspondant à la version du projet analysée
|
|
|
69 |
$this->recupererNomChamp($this->table);
|
|
|
70 |
$this->gererNumTax();
|
|
|
71 |
$this->traiterRessources($ressources);
|
|
|
72 |
|
|
|
73 |
if ($this->corps_http == '' && $this->entete_http == '') {
|
|
|
74 |
$requete = $this->assemblerLaRequete();
|
|
|
75 |
$resultat = $this->getBdd()->recupererTous($requete);
|
|
|
76 |
|
|
|
77 |
if ($resultat == '') { //cas ou la requete comporte des erreurs
|
|
|
78 |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE,
|
|
|
79 |
'Fct consulter() : La requete formée comporte une erreur !!');
|
|
|
80 |
} elseif ($resultat) {
|
|
|
81 |
$res_version[$version] = $resultat;
|
|
|
82 |
} else { //cas ou la requete renvoi un tableau vide
|
|
|
83 |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE,
|
|
|
84 |
'Données introuvables dans la base '.$version.' <br/>
|
|
|
85 |
L\'identifiant demande n\'est pas un taxon et aucun taxon ne lui a ete attribue');
|
|
|
86 |
}
|
|
|
87 |
}
|
|
|
88 |
}
|
|
|
89 |
}
|
|
|
90 |
|
|
|
91 |
if ($this->corps_http == '' && $this->entete_http == '') {
|
|
|
92 |
$resultat_formate = $this->retournerResultatFormate($res_version);
|
|
|
93 |
}
|
|
|
94 |
$this->formerReponseHTTP($resultat_formate);
|
|
|
95 |
}
|
|
|
96 |
|
|
|
97 |
|
|
|
98 |
|
|
|
99 |
|
|
|
100 |
/**
|
|
|
101 |
*
|
|
|
102 |
* Permet d'analyser les paramètres
|
|
|
103 |
* @param array $parametres
|
|
|
104 |
*/
|
|
|
105 |
public function traiterParametres($parametres) {
|
|
|
106 |
|
|
|
107 |
$this->table_param = $parametres;
|
|
|
108 |
if (isset($parametres) && ($parametres)) {
|
|
|
109 |
if (isset($parametres['recherche']) && $parametres['recherche'] != '') {
|
|
|
110 |
$this->recherche = $parametres['recherche'];
|
|
|
111 |
}
|
|
|
112 |
foreach ($parametres as $param => $val) {
|
|
|
113 |
switch ($param) {
|
|
|
114 |
case 'ns_format' : $this->html = $val; break;
|
|
|
115 |
case 'ns_structure' : $this->remplirTableCompositionNom($val);
|
|
|
116 |
$this->requete_champ .= ' ,'.implode(', ',$this->compo_nom); break;
|
|
|
117 |
case 'masque' : $this->ajouterFiltreMasque($val); break;
|
|
|
118 |
case 'masque_nt' : $this->ajouterFiltreMasqueNt($val); break;
|
|
|
119 |
case 'masque_rg' : $this->requete_condition .= ' AND rang = '.$this->getBdd()->proteger($val); break;
|
|
|
120 |
case 'navigation_depart': $this->limite_requete['depart'] = $val; break;
|
|
|
121 |
case 'navigation_limite': $this->limite_requete['limite'] = $val; break;
|
|
|
122 |
case 'retour_format' : $this->retour_format = $val; break;
|
|
|
123 |
case 'recherche' : break;
|
|
|
124 |
default : $this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE,
|
|
|
125 |
'Erreur dans les parametres de recherche de votre
|
|
|
126 |
requete : </br> Le parametre " '.$param.' " n\'existe pas.');
|
|
|
127 |
break;
|
|
|
128 |
}
|
|
|
129 |
}
|
|
|
130 |
}
|
|
|
131 |
}
|
|
|
132 |
|
|
|
133 |
|
|
|
134 |
public function ajouterFiltreMasque($val) {
|
|
|
135 |
|
|
|
136 |
if ($this->recherche == 'etendue') {
|
|
|
137 |
$val = str_replace(' ','%', $val);
|
|
|
138 |
$val .= '%';
|
|
|
139 |
$this->requete_condition .= ' AND nom_sci LIKE '.$this->getBdd()->proteger($val);
|
|
|
140 |
|
|
|
141 |
} elseif ($this->recherche == 'floue') {
|
|
|
142 |
$this->requete_condition .= ' AND (SOUNDEX(nom_sci) = SOUNDEX(\''.$val.'\')'
|
|
|
143 |
.' OR SOUNDEX(REVERSE(nom_sci)) = SOUNDEX(REVERSE(\''
|
|
|
144 |
.$val.'\'))) ';
|
|
|
145 |
} else {
|
|
|
146 |
$this->requete_condition .= ' AND nom_sci LIKE '.$this->getBdd()->proteger($val);
|
|
|
147 |
}
|
|
|
148 |
|
|
|
149 |
}
|
|
|
150 |
|
|
|
151 |
public function ajouterFiltreMasqueNt($val) {
|
|
|
152 |
|
|
|
153 |
if (strrpos($val, ',') !== false) {
|
|
|
154 |
$ids_taxon = explode(",", $val);
|
|
|
155 |
} else {
|
|
|
156 |
$ids_taxon[] = $val;
|
|
|
157 |
}
|
|
|
158 |
foreach ($ids_taxon as $id) {
|
|
|
159 |
$this->requete_condition .= ' OR num_tax = '.$this->getBdd()->proteger($id);
|
|
|
160 |
}
|
|
|
161 |
$this->requete_condition = str_replace('num_nom = num_nom_retenu OR ',
|
|
|
162 |
'num_nom = num_nom_retenu AND (' , $this->requete_condition).')';
|
|
|
163 |
}
|
|
|
164 |
|
|
|
165 |
|
|
|
166 |
/**
|
|
|
167 |
* Permet d'ajouter à la requete_champ les parametres demandés qui composeront le nom_sci.
|
|
|
168 |
* Permet de remplir le tableau compo_nom qui regroupe les parametres demandés qui composeront le nom_sci.
|
|
|
169 |
* (parametres à ajouter aux nom_sci sous la forme : Auteur [annee, biblio] [addendum])
|
|
|
170 |
* @param la valeur du parametre nl.structure
|
|
|
171 |
*/
|
|
|
172 |
public function recupererParametreNom($valeur) {
|
|
|
173 |
|
|
|
174 |
$structure_nom = explode(",",$valeur);
|
|
|
175 |
foreach ($structure_nom as $structure) {
|
|
|
176 |
switch ($structure) {
|
|
|
177 |
case 'au' : $this->compo_nom['au'] = 'auteur'; break;
|
|
|
178 |
case 'an' : $this->compo_nom['an'] = 'annee'; break;
|
|
|
179 |
case 'bib' : $this->compo_nom['bib'] = 'biblio_origine'; break;
|
|
|
180 |
case 'ad' : $this->compo_nom['ad'] = 'nom_addendum'; break;
|
|
|
181 |
default : $this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE,
|
|
|
182 |
'Erreur : Le parametre "'.$structure.'" n\'existe pas. <br/><br/>
|
|
|
183 |
Les parametres du nom possibles sont :
|
|
|
184 |
<li> au (auteur)</li><li> an (annee)</li>
|
|
|
185 |
<li> bib (bibliographie)</li><li> ad (nom_addendum)</li>');
|
|
|
186 |
break;
|
|
|
187 |
}
|
|
|
188 |
}
|
|
|
189 |
if (isset($this->compo_nom)) {
|
|
|
190 |
$this->requete_champ .= ' ,'.implode(', ',$this->compo_nom);
|
|
|
191 |
}
|
|
|
192 |
}
|
|
|
193 |
|
|
|
194 |
//------------------------------------------Fonction ressources---------------------------------------------------------------------
|
|
|
195 |
|
|
|
196 |
public function gererNumTax() {
|
|
|
197 |
|
|
|
198 |
if (!in_array('num_tax', $this->champs_table)) {
|
|
|
199 |
$this->presence_num_tax = false;
|
|
|
200 |
$this->requete_champ = str_replace(', num_tax ', '', $this->requete_champ);
|
|
|
201 |
} else {
|
|
|
202 |
$this->presence_num_tax = true;
|
|
|
203 |
}
|
|
|
204 |
}
|
|
|
205 |
|
|
|
206 |
|
|
|
207 |
|
|
|
208 |
public function traiterRessourcesIdentifiant() {
|
|
|
209 |
|
|
|
210 |
$this->format_reponse = 'taxons/id';
|
|
|
211 |
$this->num_nom_taxon = $this->recupererNumNomTaxon(); //on recupere le taxon correspondant au num_nom recherché
|
|
|
212 |
|
|
|
213 |
if ($this->entete_http == '') {
|
|
|
214 |
$this->requete_condition = ' num_nom = '.$this->num_nom_taxon;
|
|
|
215 |
|
|
|
216 |
if (isset($this->table_ressources[1]) && !empty($this->table_ressources[1])) {
|
|
|
217 |
//---------------- requete de type taxons/#id/#champ+#champ--------------------------------------
|
|
|
218 |
if ($this->table_ressources[1] != 'relations') {
|
|
|
219 |
// SELECT *, nom_sci FROM bftfx_v2_00 WHERE num_nom = X;
|
|
|
220 |
$this->requete_champ = ' *, nom_sci ';
|
|
|
221 |
$this->format_reponse .= '/champ';
|
|
|
222 |
//---------------- requete de type taxons/#id/relations/#relation--------------------------------
|
|
|
223 |
} elseif ($this->table_ressources[1] == 'relations') {
|
|
|
224 |
$this->traiterRessourceIdRelations();
|
|
|
225 |
} else {
|
|
|
226 |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE,
|
|
|
227 |
'Erreur dans votre requete </br> Ressources disponibles : <br/>
|
|
|
228 |
<li> #id/relations </li> <li> #id/#champ+#champ </li> <li> #id/relations </li>
|
|
|
229 |
<li> #id/relations/inferieurs </li> <li> #id/relations/superieurs </li>');
|
|
|
230 |
}
|
|
|
231 |
} else {
|
|
|
232 |
//--------------- requete de type taxons/#id-----------------------------------------------------
|
|
|
233 |
$this->requete_champ = ' *, nom_sci ';
|
|
|
234 |
}
|
|
|
235 |
}
|
|
|
236 |
}
|
|
|
237 |
|
|
|
238 |
|
|
|
239 |
/**
|
|
|
240 |
* Permet de récupérer le num_nom du taxon recherché. Soit le numéro taxonomique est demandé (avec nt: )
|
|
|
241 |
* soit un num_nom dont on recherche le num_nom_retenu
|
|
|
242 |
*/
|
|
|
243 |
public function recupererNumNomTaxon() {
|
|
|
244 |
|
|
|
245 |
$identifiant = '';
|
|
|
246 |
if (strrpos($this->table_ressources[0], 'nt:') !== false) {
|
|
|
247 |
if ($this->presence_num_tax) {
|
|
|
248 |
// SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = num_nom_retenu AND num_tax = X;
|
|
|
249 |
$this->requete_condition = ' num_nom = num_nom_retenu AND num_tax = '
|
|
|
250 |
.str_replace('nt:', '', $this->table_ressources[0]).' ';
|
|
|
251 |
} else {
|
|
|
252 |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE,
|
|
|
253 |
'Erreur dans votre requete : </br> Le numero taxonomique n\'existe pas dans ce projet' );
|
|
|
254 |
}
|
|
|
255 |
} else {
|
|
|
256 |
// SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = (SELECT num_nom_retenu FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
|
|
|
257 |
$this->requete_condition = ' num_nom = (SELECT num_nom_retenu FROM '
|
|
|
258 |
.$this->table.' WHERE num_nom = '.$this->table_ressources[0].')';
|
|
|
259 |
}
|
|
|
260 |
if ($this->entete_http == '') {
|
|
|
261 |
//on récupere l'identifiant du taxon correspondant au num_nom ou num_tax demandé pour pouvoir l'afficher
|
|
|
262 |
$res = '';
|
|
|
263 |
$req_tax = 'SELECT num_nom FROM '.$this->table.' WHERE '.$this->requete_condition;
|
|
|
264 |
$res_tax = $this->getBdd()->recuperer($req_tax);
|
|
|
265 |
|
|
|
266 |
//on recherche ensuite les identifiants des taxons supérieurs ou inférieurs
|
|
|
267 |
if ($res_tax == '') {
|
|
|
268 |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE,
|
|
|
269 |
'Le numéro de taxon ou l\'identifiant de nom correspondant au num_nom '
|
|
|
270 |
.$this->table_ressources[0].' n\'existe pas dans la table '.$this->table);
|
|
|
271 |
|
|
|
272 |
} elseif ($res_tax) {
|
|
|
273 |
$identifiant = $res_tax['num_nom'];
|
|
|
274 |
|
|
|
275 |
} else {
|
|
|
276 |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE,
|
|
|
277 |
'Le numéro de taxon ou l\'identifiant de nom correspondant au num_nom '
|
|
|
278 |
.$this->table_ressources[0].' n\'existe pas dans la table '.$this->table);
|
|
|
279 |
}
|
|
|
280 |
}
|
|
|
281 |
|
|
|
282 |
return $identifiant;
|
|
|
283 |
}
|
|
|
284 |
|
|
|
285 |
|
|
|
286 |
public function traiterRessourceIdRelations() {
|
|
|
287 |
|
|
|
288 |
//----------------- requete de type taxons/#id/relations-------------------------------------------
|
|
|
289 |
// SELECT *, nom_sci FROM bftfx_v2_00 WHERE num_nom = X;
|
|
|
290 |
$this->format_reponse .= '/relations';
|
|
|
291 |
|
|
|
292 |
if (isset($this->table_ressources[2])) {
|
|
|
293 |
//------------- requete de type taxons/#id/relations/#relation--------------------------------
|
|
|
294 |
switch ($this->table_ressources[2]) {
|
|
|
295 |
case 'superieurs' : $rel = 'recupererIdSup';
|
|
|
296 |
$this->format_reponse .= '/superieurs';
|
|
|
297 |
$this->traiterRessourceIdRelationInfSup($rel); break;
|
|
|
298 |
case 'inferieurs' : $rel = 'recupererIdInf';
|
|
|
299 |
$this->format_reponse .= '/inferieurs';
|
|
|
300 |
$this->traiterRessourceIdRelationInfSup($rel); break;
|
|
|
301 |
default : $this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE,
|
|
|
302 |
'Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : <br/>
|
|
|
303 |
<li> taxons/#id/relations </li> <li> taxons/#id/relations/flores </li>
|
|
|
304 |
<li> taxons/#id/relations/homonymie </li> <li> #id/relations/inferieurs </li>
|
|
|
305 |
<li> #id/relations/superieurs </li>'); break;
|
|
|
306 |
}
|
|
|
307 |
}
|
|
|
308 |
}
|
|
|
309 |
|
|
|
310 |
|
|
|
311 |
|
|
|
312 |
public function traiterRessourceIdRelationInfSup($rel) {
|
|
|
313 |
|
|
|
314 |
//Appel de la fct récupérerIdSup ou recupererIdInf : retourne les num_nom des noms inferieurs ou superieurs
|
|
|
315 |
$res_relation = $this->$rel();
|
|
|
316 |
|
|
|
317 |
//analyse du résultat retourné par la requete de recherche des identifiants correspondant aux taxons inf|sup :
|
|
|
318 |
if ($res_relation == '') { //dans le cas ou la requete comporte des erreurs
|
|
|
319 |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE,
|
|
|
320 |
'Fct traiterRessourceIdHomonymie : La requete forme comporte une erreur !!');
|
|
|
321 |
|
|
|
322 |
} elseif ($res_relation) {
|
|
|
323 |
//dans le cas ou une ou plusieurs relations est retournée, on récupère les identifiants ss la forme (id, id, id)
|
|
|
324 |
foreach ($res_relation as $ligne) $res[] = $ligne['num_nom'];
|
|
|
325 |
|
|
|
326 |
$res = implode(',',$res);
|
|
|
327 |
$this->requete_condition = ' num_nom IN ('.$res.')';
|
|
|
328 |
$this->requete_champ .= ', rang, num_tax_sup ';
|
|
|
329 |
|
|
|
330 |
} else { //dans le cas ou aucune relation n'existe
|
|
|
331 |
$res = array($this->num_nom_taxon => null);
|
|
|
332 |
$this->corps_http = json_encode($res);
|
|
|
333 |
$this->entete_http = RestServeur::HTTP_CODE_OK;
|
|
|
334 |
}
|
|
|
335 |
|
|
|
336 |
}
|
|
|
337 |
|
|
|
338 |
|
|
|
339 |
public function recupererIdInf() {
|
|
|
340 |
//SELECT num_nom FROM bfdtx_v2_00 WHERE num_tax_sup = (SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
|
|
|
341 |
$req_relation = 'SELECT num_nom FROM '.$this->table
|
|
|
342 |
.' WHERE num_tax_sup = (SELECT num_nom FROM '
|
|
|
343 |
.$this->table
|
|
|
344 |
.' WHERE '.$this->requete_condition.')';
|
|
|
345 |
$res_relation = $this->getBdd()->recupererTous($req_relation);
|
|
|
346 |
return $res_relation;
|
|
|
347 |
}
|
|
|
348 |
|
|
|
349 |
|
|
|
350 |
public function recupererIdSup() {
|
|
|
351 |
//SELECT num_nom FROM bfdtx_v2_00 WHERE num_nom = (SELECT num_tax_sup FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
|
|
|
352 |
$req_relation = 'SELECT num_nom FROM '.$this->table
|
|
|
353 |
.' WHERE num_nom = (SELECT num_tax_sup FROM '
|
|
|
354 |
.$this->table
|
|
|
355 |
.' WHERE '.$this->requete_condition.')';
|
|
|
356 |
|
|
|
357 |
$res_relation = $this->getBdd()->recupererTous($req_relation);
|
|
|
358 |
return $res_relation;
|
|
|
359 |
}
|
|
|
360 |
|
|
|
361 |
|
|
|
362 |
public function traiterRessourceStatsInitiales() {
|
|
|
363 |
// SELECT count(nom_sci) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre FROM bdtfx_v2_00 GROUP BY rang, left(nom_sci, 2);
|
|
|
364 |
$this->format_reponse = 'taxons/stats/initiales';
|
|
|
365 |
$this->requete_champ = 'count(nom_sci) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre ';
|
|
|
366 |
$this->requete_group_by = ' GROUP BY rang, left(nom_sci, 2) ';
|
|
|
367 |
}
|
|
|
368 |
|
|
|
369 |
public function traiterRessourceStatsRangs() {
|
|
|
370 |
// SELECT count(*) as nombre, rang FROM bdtfx_v2_00 [WHERE rang = 290] GROUP BY rang ORDER BY rang;
|
|
|
371 |
$this->format_reponse = 'taxons/stats/rangs';
|
|
|
372 |
$this->requete_champ = 'count(*) as nombre, rang ';
|
|
|
373 |
$this->requete_group_by = ' GROUP BY rang ORDER BY rang ';
|
|
|
374 |
}
|
|
|
375 |
|
|
|
376 |
public function traiterRessourceStatsAnnees() {
|
|
|
377 |
// SELECT count(*) as nombre, annee FROM bdtfx_v2_00 GROUP BY annee ORDER BY annee;
|
|
|
378 |
$this->format_reponse = 'taxons/stats/annees';
|
|
|
379 |
$this->requete_champ = 'count(*) as nombre, annee ';
|
|
|
380 |
$this->requete_group_by = ' GROUP BY annee ORDER BY annee ';
|
|
|
381 |
}
|
|
|
382 |
|
|
|
383 |
|
|
|
384 |
|
|
|
385 |
|
|
|
386 |
//-----------------------------FONCTIONS DASSEMBLAGE DE LA REQUETE-----------------------------------------------------
|
|
|
387 |
|
|
|
388 |
public function assemblerLaRequete() {
|
|
|
389 |
|
|
|
390 |
if ($this->format_reponse != 'taxons/stats/initiales') {
|
|
|
391 |
$this->mettreAuFormat(); //on remplace les nom_sci par les nom_sci_html
|
|
|
392 |
}
|
|
|
393 |
|
|
|
394 |
if ($this->requete_condition != '') {
|
|
|
395 |
$this->requete_condition = ltrim($this->requete_condition, ' AND, WHERE');
|
|
|
396 |
$this->requete_condition = ' WHERE '.$this->requete_condition;
|
|
|
397 |
}
|
|
|
398 |
if ($this->format_reponse != 'taxons' && $this->format_reponse != 'taxons/id/relations/homonymie') {
|
|
|
399 |
$this->requete_limite = '';
|
|
|
400 |
} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat())) {
|
|
|
401 |
$this->limite_requete['depart'] = (($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']);
|
|
|
402 |
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
|
|
|
403 |
} else {
|
|
|
404 |
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
|
|
|
405 |
}
|
|
|
406 |
$requete = ' SELECT '.$this->requete_champ.
|
|
|
407 |
' FROM '.$this->table
|
|
|
408 |
.$this->requete_condition
|
|
|
409 |
.$this->requete_group_by
|
|
|
410 |
.$this->requete_limite;
|
|
|
411 |
|
|
|
412 |
return $requete;
|
|
|
413 |
}
|
|
|
414 |
|
|
|
415 |
|
|
|
416 |
/**
|
|
|
417 |
* Recupere le nombre total de résultat d'une requete lancée.
|
|
|
418 |
* Est utilisée lors de l'affichage du total dans le résultat retourné
|
|
|
419 |
* @return Le nombre total de résultat
|
|
|
420 |
*/
|
|
|
421 |
public function recupererTotalResultat() {
|
|
|
422 |
|
|
|
423 |
$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '.$this->table.$this->requete_condition.$this->requete_group_by;
|
|
|
424 |
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
|
|
|
425 |
if ($res) {
|
|
|
426 |
$total = $res['nombre'];
|
|
|
427 |
} else {
|
|
|
428 |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE,
|
|
|
429 |
'Fct recupererTotalResultat() : <br/>Données introuvables dans la base');
|
|
|
430 |
}
|
|
|
431 |
return $total;
|
|
|
432 |
}
|
|
|
433 |
|
|
|
434 |
//-------------------------FONCTIONS DE FORMATION DU RESULTAT-----------------------------------------------------------
|
|
|
435 |
|
|
|
436 |
/**
|
|
|
437 |
* Permet de récupérer le résultat à retourner propre à chaque requete et de l'encoder en json
|
|
|
438 |
* @param array $resultat
|
|
|
439 |
* @param array $ressources
|
|
|
440 |
* @return le résultat encoder en json
|
|
|
441 |
*/
|
|
|
442 |
public function retournerResultatFormate($resultat) {
|
|
|
443 |
|
|
|
444 |
switch ($this->format_reponse) {
|
|
|
445 |
case 'taxons/id' : $reponse = $this->formaterId($resultat); break; //ds CommunNomsTaxons
|
|
|
446 |
case 'taxons/id/champ' : $reponse = $this->formaterIdChamp($resultat); break; //ds CommunNomsTaxons
|
|
|
447 |
case 'taxons/id/relations' : $reponse = $this->formaterIdRelations($resultat); break;
|
|
|
448 |
case 'taxons/id/relations/superieurs' : $reponse = $this->formaterIdSuperieur($resultat); break;
|
|
|
449 |
case 'taxons/id/relations/inferieurs' : $reponse = $this->formaterIdInferieur($resultat); break;
|
|
|
450 |
case 'taxons/stats/annees' : $reponse = $this->formaterStatsAnnee($resultat); break; //ds CommunNomsTaxons
|
|
|
451 |
case 'taxons/stats/rangs' : $reponse = $this->formaterStatsRang($resultat); break; //ds CommunNomsTaxons
|
|
|
452 |
case 'taxons/stats/initiales' : $reponse = $this->formaterStatsInitiales($resultat); break; //ds CommunNomsTaxons
|
|
|
453 |
case 'taxons' : $reponse = $this->formatertaxons($resultat); break;
|
|
|
454 |
default : break;
|
|
|
455 |
}
|
|
|
456 |
return json_encode($reponse);
|
|
|
457 |
}
|
|
|
458 |
|
|
|
459 |
|
|
|
460 |
//----------------------concerne les resultats pour des requetes de type /noms avec ou sans paramètres--------------
|
|
|
461 |
/**
|
|
|
462 |
*
|
|
|
463 |
* Est utilisée pour les requetes de type /noms avec ou sans parametres. Détermine le format json ou oss.
|
|
|
464 |
* @param retourne le résultat sous forme de tableau, à encoder en json.
|
|
|
465 |
*/
|
|
|
466 |
public function formaterTaxons($resultat) {
|
|
|
467 |
|
|
|
468 |
if ($this->retour_format == 'oss') {
|
|
|
469 |
$reponse = $this->formaterEnOss($resultat);
|
|
|
470 |
} else {
|
|
|
471 |
$reponse = $this->formaterEnJsonMax($resultat);
|
|
|
472 |
}
|
|
|
473 |
return $reponse;
|
|
|
474 |
}
|
|
|
475 |
|
|
|
476 |
|
|
|
477 |
/**
|
|
|
478 |
*
|
|
|
479 |
* Permet de créer un tableau ($table_retour_json) au format defaut puis de l'encoder en json (json_encode).
|
|
|
480 |
* Le format comprend deux parties, une partie entete (contenu dans le tableau $entete_json) et une partie
|
|
|
481 |
* resultat (contenu dans le tableau $resultat_json).
|
|
|
482 |
* @param string $resultat : résultat de la requete (liste des noms et leur identifiant)
|
|
|
483 |
* @return une chaine encodé json (format par default)
|
|
|
484 |
*/
|
|
|
485 |
public function formaterEnJsonMax($resultat) {
|
|
|
486 |
|
|
|
487 |
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
|
|
|
488 |
$res = array();
|
|
|
489 |
|
|
|
490 |
foreach ($resultat as $version => $res_version) {
|
|
|
491 |
//on remplit la table $table_retour_json['entete']
|
|
|
492 |
if (isset($this->table_param['masque'])) $this->afficherDonnees('masque', $this->table_param['masque']);
|
|
|
493 |
if (isset($this->table_param['masque_nt'])) $this->afficherDonnees('masque.nt', $this->table_param['masque_nt']);
|
|
|
494 |
$this->afficherEnteteRangBorneTotalUrls($res_version, '/'.$this->service);
|
|
|
495 |
$table_retour_json['entete'] = $this->table_retour;
|
|
|
496 |
$this->table_retour = array();
|
|
|
497 |
|
|
|
498 |
//on remplit la table $table_retour_json['resultat']
|
|
|
499 |
$tab_tax_inf = $this->recupererListeTaxonInf($res_version);
|
|
|
500 |
|
|
|
501 |
foreach ($res_version as $tab) {
|
|
|
502 |
$this->resultat_req = $tab;
|
|
|
503 |
if (isset($this->table_param['masque_nt'])) $this->afficherDonnees('num_tax', $tab['num_tax']);
|
|
|
504 |
|
|
|
505 |
foreach ($tab as $key => $val) {
|
|
|
506 |
if ($val != '') {
|
|
|
507 |
switch ($key) {
|
|
|
508 |
case 'num_nom' : $num = $val;
|
|
|
509 |
$this->afficherDonnees($key, $val); break;
|
|
|
510 |
case 'num_nom_retenu' : $retenu = ($val == $num) ? 'true' : 'false';
|
|
|
511 |
$this->table_retour['retenu'] = $retenu; break;
|
|
|
512 |
default : break;
|
|
|
513 |
}
|
|
|
514 |
}
|
|
|
515 |
}
|
|
|
516 |
$this->afficherTaxonInfNb($num, $tab_tax_inf);
|
|
|
517 |
unset($this->table_retour['id']);
|
|
|
518 |
|
|
|
519 |
$resultat_json[$num] = $this->table_retour;
|
|
|
520 |
$this->table_retour = array(); //on vide le tableau table_retour
|
|
|
521 |
}
|
|
|
522 |
$table_retour_json['resultat'] = $resultat_json;
|
|
|
523 |
$res = $this->afficherVersionOuPas($version, $table_retour_json, $res);
|
|
|
524 |
}
|
|
|
525 |
|
|
|
526 |
return $res;
|
|
|
527 |
}
|
|
|
528 |
|
|
|
529 |
|
|
|
530 |
//--------------------concerne les resultats pour des requetes de type noms/id----------------------------------------
|
|
|
531 |
|
|
|
532 |
public function formaterIdRelations($resultat) {
|
|
|
533 |
|
|
|
534 |
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
|
|
|
535 |
$res = array();
|
|
|
536 |
|
|
|
537 |
foreach ($resultat as $version => $res_version) {
|
|
|
538 |
$this->resultat_req = $res_version;
|
|
|
539 |
$retour_id_rel = array ('entete' => array()); //on initialise pr que l'entete apparaisse en premier
|
|
|
540 |
|
|
|
541 |
//on affiche le resultat
|
|
|
542 |
$superieurs = $this->ajouterRelations('superieurs', $version);
|
|
|
543 |
if (isset($superieurs)) $retour_id_rel['resultat']['superieurs'] = $superieurs;
|
|
|
544 |
$inferieurs = $this->ajouterRelations('inferieurs', $version);
|
|
|
545 |
if (isset($inferieurs)) $retour_id_rel['resultat']['inferieurs'] = $inferieurs;
|
|
|
546 |
|
|
|
547 |
//on renvoit un tableau null si il n'existe aucune relations
|
|
|
548 |
if (!isset($retour_id_rel['resultat'])) {
|
|
|
549 |
$retour_id_rel = null;
|
|
|
550 |
|
|
|
551 |
//on rajoute l'entete si des relations existent
|
|
|
552 |
} else {
|
|
|
553 |
$this->afficherDonnees('num_nom', $this->num_nom_taxon); //$this->afficherEnteteRangBorneTotalUrls($resultat, '/'.$this->service.'/'.$this->table_ressources[0].'/relations/synonymie');
|
|
|
554 |
$retour_id_rel['entete'] = $this->table_retour;
|
|
|
555 |
$this->table_retour = array();
|
|
|
556 |
}
|
|
|
557 |
//recuperation du resultat de chaque version
|
|
|
558 |
$res = $this->afficherVersionOuPas($version, $retour_id_rel, $res);
|
|
|
559 |
}
|
|
|
560 |
return $res;
|
|
|
561 |
|
|
|
562 |
}
|
|
|
563 |
|
|
|
564 |
|
|
|
565 |
public function ajouterRelations($relation, $version) {
|
|
|
566 |
|
|
|
567 |
$version = str_replace(Config::get('bdd_table').'_v', '', $version);
|
|
|
568 |
$res = null;
|
|
|
569 |
$taxon = $this->num_nom_taxon;
|
|
|
570 |
$parametres_url = '';
|
|
|
571 |
if ($this->table_param != array()) $parametres_url = '?'.http_build_query($this->table_param, '', '&');
|
|
|
572 |
$url = Config::get('url_service').'/'.$version.'/'
|
|
|
573 |
.$this->service.'/'.$this->table_ressources[0].'/relations/'
|
|
|
574 |
.$relation.$parametres_url;
|
|
|
575 |
|
|
|
576 |
$relation = $this->rest_client->consulter($url);
|
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577 |
$entete = $this->rest_client->getReponseEntetes();
|
|
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578 |
|
|
|
579 |
//Si le service meta-donnees fonctionne correctement, l'entete comprend la clé wrapper_data
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580 |
if (isset($entete['wrapper_data'])) {
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|
|
581 |
$relation = json_decode($relation);
|
|
|
582 |
if (isset($relation->resultat)) {
|
|
|
583 |
$res = $relation->resultat;
|
|
|
584 |
} elseif (isset($relation->$taxon)) { //pour les relations inf et sup
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|
|
585 |
$res = $relation->$taxon;
|
|
|
586 |
}
|
|
|
587 |
} else {
|
|
|
588 |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE,
|
|
|
589 |
'Le service '.$this->service.' de ce projet comporte des erreurs. url lancée : '.$url);
|
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590 |
}
|
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591 |
|
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592 |
return $res;
|
|
|
593 |
}
|
|
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594 |
|
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595 |
|
|
|
596 |
public function formaterIdSuperieur($resultat) {
|
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597 |
|
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598 |
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
|
|
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599 |
$res = array();
|
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600 |
|
|
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601 |
foreach ($resultat as $version => $res_version) {
|
|
|
602 |
//on remplit le tableau de formatage
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603 |
if (($res_version) != '' ) {
|
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604 |
//on recupere d'abord les rangs supérieurs
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605 |
$sup = $res_version[0];
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606 |
do {
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607 |
$sup = $this->recupererIdSuperieur($sup['num_tax_sup'], $version);
|
|
|
608 |
if ($sup['rang'] == '0') $sup['rang'] = '10'; //erreur dans la base
|
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609 |
if (isset($sup)) $res_version[] = $sup;
|
|
|
610 |
} while ($sup != null);
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611 |
krsort($res_version);
|
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612 |
|
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613 |
//on les affiche ensuite
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614 |
foreach ($res_version as $tab) {
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|
615 |
$this->resultat_req = $tab;
|
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616 |
foreach ($tab as $key => $val) {
|
|
|
617 |
if ($val != '') {
|
|
|
618 |
switch ($key) {
|
|
|
619 |
case 'num_nom' : $num = $val;
|
|
|
620 |
$this->afficherDonnees($key, $num); break;
|
|
|
621 |
case 'num_nom_retenu' : $retenu = ($val == $num) ? 'true' : 'false';
|
|
|
622 |
$this->table_retour['retenu'] = $retenu; break;
|
|
|
623 |
case 'rang' : $this->afficherDonnees($key, $val); break;
|
|
|
624 |
default : break;
|
|
|
625 |
}
|
|
|
626 |
}
|
|
|
627 |
}
|
|
|
628 |
unset($this->table_retour['id']);
|
|
|
629 |
$tab_inf[$num] = $this->table_retour;
|
|
|
630 |
$this->table_retour = array();
|
|
|
631 |
}
|
|
|
632 |
$tab_relation[$this->num_nom_taxon] = $tab_inf;
|
|
|
633 |
} else { //si il n'existe aucune relation
|
|
|
634 |
$tab_relation = null;
|
|
|
635 |
}
|
|
|
636 |
//recuperation du resultat de chaque version
|
|
|
637 |
$res = $this->afficherVersionOuPas($version, $tab_relation, $res);
|
|
|
638 |
}
|
|
|
639 |
|
|
|
640 |
return $res;
|
|
|
641 |
}
|
|
|
642 |
|
|
|
643 |
|
|
|
644 |
public function recupererIdSuperieur($id, $version) {
|
|
|
645 |
|
|
|
646 |
$req = 'SELECT num_nom, num_nom_retenu, num_tax_sup, rang FROM '
|
|
|
647 |
.$version.' WHERE num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($id);
|
|
|
648 |
$res = $this->getBdd()->recupererTous($req);
|
|
|
649 |
if ($res) {
|
|
|
650 |
$resultat = $res[0];
|
|
|
651 |
} else {
|
|
|
652 |
$resultat = null; //on return null si il n'y a pas de taxon superieur
|
|
|
653 |
}
|
|
|
654 |
|
|
|
655 |
return $resultat;
|
|
|
656 |
}
|
|
|
657 |
|
|
|
658 |
|
|
|
659 |
public function formaterIdInferieur($resultat) {
|
|
|
660 |
|
|
|
661 |
$this->recupererTableSignification('champs_api,champs_comp,correspondance_champs');
|
|
|
662 |
$res = array();
|
|
|
663 |
foreach ($resultat as $version => $res_version) {
|
|
|
664 |
//on veut récupérer pour chacun des taxons inférieur le nb de taxons inf :
|
|
|
665 |
$tab_tax_inf = $this->recupererListeTaxonInf($res_version);
|
|
|
666 |
//on commence le formatage
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667 |
if (($res_version) != '' ) {
|
|
|
668 |
foreach ($res_version as $tab) {
|
|
|
669 |
$this->resultat_req = $tab;
|
|
|
670 |
foreach ($tab as $key => $val) {
|
|
|
671 |
if ($val != '') {
|
|
|
672 |
switch ($key) {
|
|
|
673 |
case 'num_nom' : $num = $val;
|
|
|
674 |
$this->afficherDonnees($key, $num); break;
|
|
|
675 |
case 'num_nom_retenu' : $retenu = ($val == $num) ? 'true' : 'false';
|
|
|
676 |
$this->table_retour['retenu'] = $retenu; break;
|
|
|
677 |
default : break;
|
|
|
678 |
}
|
|
|
679 |
}
|
|
|
680 |
}
|
|
|
681 |
$this->afficherTaxonInfNb($num, $tab_tax_inf);
|
|
|
682 |
unset($this->table_retour['id']);
|
|
|
683 |
$tab_inf[$num] = $this->table_retour;
|
|
|
684 |
$this->table_retour = array(); //on vide le tableau table_retour
|
|
|
685 |
}
|
|
|
686 |
$tab_relation[$this->num_nom_taxon] = $tab_inf;
|
|
|
687 |
} else {
|
|
|
688 |
$tab_relation = null;
|
|
|
689 |
}
|
|
|
690 |
//recuperation du resultat de chaque version
|
|
|
691 |
$res = $this->afficherVersionOuPas($version, $tab_relation, $res);
|
|
|
692 |
}
|
|
|
693 |
|
|
|
694 |
return $res;
|
|
|
695 |
}
|
|
|
696 |
|
|
|
697 |
|
|
|
698 |
public function afficherTaxonInfNb($num, $tab_tax_inf) {
|
|
|
699 |
|
|
|
700 |
foreach ($tab_tax_inf as $taxNb) {
|
|
|
701 |
if ($taxNb['num_tax_sup'] == $num) {
|
|
|
702 |
$this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'] = $taxNb['nb'];
|
|
|
703 |
}
|
|
|
704 |
}
|
|
|
705 |
if (!isset($this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'])) {
|
|
|
706 |
$this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'] = '0';
|
|
|
707 |
}
|
|
|
708 |
}
|
|
|
709 |
|
|
|
710 |
|
|
|
711 |
public function recupererListeTaxonInf($resultat) {
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|
|
712 |
|
|
|
713 |
// SELECT num_tax_sup, count(*) as nb FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_tax_sup IN (id, id, id) AND num_nom = num_nom_retenu GROUP BY num_tax_sup';
|
|
|
714 |
foreach ($resultat as $tab) {
|
|
|
715 |
$tab_num[] = $tab['num_nom']; //on regroupe ici les id des taxons dont on cherche le nb de taxon inf
|
|
|
716 |
}
|
|
|
717 |
$req = 'SELECT num_tax_sup, count(*) as nb FROM '.$this->table
|
|
|
718 |
.' WHERE num_tax_sup IN ('.implode(',',$tab_num)
|
|
|
719 |
.') AND num_nom = num_nom_retenu GROUP BY num_tax_sup';
|
|
|
720 |
$res = $this->getBdd()->recupererTous($req);
|
|
|
721 |
if ($res) {
|
|
|
722 |
$resultat = $res;
|
|
|
723 |
} else {
|
|
|
724 |
$resultat = array(); //on return un tableau vide s'il n'y a pas de taxon inférieurs
|
|
|
725 |
}
|
|
|
726 |
|
|
|
727 |
return $resultat;
|
|
|
728 |
}
|
|
|
729 |
|
|
|
730 |
}
|
|
|
731 |
|
|
|
732 |
?>
|