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737 raphael 1
-- TODO:
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-- fix référentiel: suppression n° de version et uniformisation
3
-- SELECT DISTINCT nom_referentiel, COUNT(id_observation) AS count FROM cel_obs GROUP BY nom_referentiel ORDER BY count DESC;
4
 
5
-- fix date: NULL pour les dates dans le futur
6
-- SELECT courriel_utilisateur, id_observation, date_observation FROM cel_obs WHERE date_observation > NOW();
7
 
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9
 
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DROP TABLE IF EXISTS `cel_references`;
11
 
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CREATE TABLE `cel_references` (
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       `referentiel` CHAR(5) NOT NULL, -- ENUM ("bdtfx", "bdtfx", "bdtxa", ...),
14
 
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       -- bdtfx
16
       `num_nom` INT(9) NOT NULL DEFAULT '0',
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       `num_nom_retenu` VARCHAR(9) DEFAULT NULL,
18
 
19
       `nom_sci` VARCHAR(500) NOT NULL,
20
       `auteur` VARCHAR(100) DEFAULT NULL,
21
 
22
       -- cel_obs
23
       --       `nom_ret_nn` DECIMAL(9,0) DEFAULT NULL COMMENT 'Numéro du nom retenu.',
24
       --       `nom_ret` VARCHAR(255) DEFAULT NULL,
25
 
26
       -- nvjfl_v2007 (`nom_vernaculaire` text NOT NULL)
27
       `nom_commun` VARCHAR(60) NOT NULL,
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PRIMARY KEY (`referentiel`, `num_nom`)
29
) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=utf8;
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33
-- INSERT INTO `cel_references` (`referentiel`, `num_nom`, `num_nom_retenu`, `nom_sci`, `auteur`, `nom_commun`) \
34
--        SELECT "bdtfx", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.nom_sci, b.auteur, n.nom_vernaculaire, MAX(n.num_statut)	FROM bdtfx_v1_01 b LEFT JOIN nvjfl_v2007 n	ON (b.num_taxonomique = n.num_taxon AND n.code_langue = 'fra' )	GROUP BY b.num_nom \
35
--        UNION \
36
--        SELECT "bdtxa", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.nom_sci, b.auteur, n.nom_vernaculaire, NULL				FROM bdtxa_v1_00 b LEFT JOIN nva_v2013_06 n	ON (b.num_tax = n.num_taxon AND n.code_langue = 'fra' )			GROUP BY b.num_nom;
37
-- SELECT "isfan", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.nom_sci, b.auteur, NULL FROM isfan_v2013 b;
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-- déterminé à partir de
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-- SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire, n.num_statut, n2.num_statut FROM nvjfl_v2007 n LEFT JOIN nvjfl_v2007 n2 ON (n.num_taxon = n2.num_taxon) WHERE n.num_taxon < 32 AND n.code_langue = 'fra' GROUP BY n.num_taxon, n.num_statut; -- HAVING n.num_statut = MAX(n2.num_statut) LIMIT 100;
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DROP TEMPORARY TABLE IF EXISTS `T_nvjfl_v2007`;
45
CREATE TEMPORARY TABLE T_nvjfl_v2007 ( INDEX(`num_taxon`) ) AS \
46
       ( SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire FROM nvjfl_v2007 n WHERE n.code_langue = 'fra' GROUP BY n.num_taxon, n.num_statut HAVING n.num_statut = MAX(n.num_statut) );
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48
 
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-- uniquement pour la primary key, autrement le LEFT JOIN suivant est trop long
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DROP TEMPORARY TABLE IF EXISTS `T_nva_v2013_06`;
51
CREATE TEMPORARY TABLE T_nva_v2013_06 ( INDEX(`num_taxon`) ) AS \
52
       ( SELECT n.num_taxon, n.nom_vernaculaire FROM nva_v2013_06 n WHERE n.code_langue = 'fra' GROUP BY n.num_nom); -- aggrégat arbitraire car pas de num_statut
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54
 
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INSERT INTO `cel_references` (`referentiel`, `num_nom`, `num_nom_retenu`, `nom_sci`, `auteur`, `nom_commun`) \
56
       SELECT "bdtfx", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.nom_sci, b.auteur, n.nom_vernaculaire	FROM bdtfx_v1_01 b LEFT JOIN T_nvjfl_v2007 n ON (b.num_taxonomique = n.num_taxon ) \
57
       UNION \
58
       SELECT "bdtxa", b.num_nom, b.num_nom_retenu, b.nom_sci, b.auteur, n.nom_vernaculaire FROM bdtxa_v1_00 b LEFT JOIN T_nva_v2013_06 n ON (b.num_tax = n.num_taxon);
59
DROP TEMPORARY TABLE T_nvjfl_v2007;