| 752 |
raphael |
1 |
/*
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2 |
Objectif: prendre les observations dont nom_sel_nn est défini
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3 |
(et donc dans laquelles les informations générées sont correctes)
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4 |
et mettre à jour ces dernières à partir de la dernière version du référentiel
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5 |
(bdtfx et bdtxa).
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6 |
*/
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7 |
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8 |
--- la requête ---
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9 |
/*
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10 |
-- SELECT id_observation, b.num_nom, CONCAT(b.nom_sci, ' ', b.auteur), b.num_taxonomique, b.famille
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|
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11 |
SELECT id_observation, nom_ret, nom_ret_nn, nt, c.famille
|
| 819 |
raphael |
12 |
FROM `BASEEDIT`.`cel_obs` c, `BASESOURCE`.`bdtfx_v1_01` b
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| 752 |
raphael |
13 |
WHERE (
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|
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14 |
nom_sel_nn IS NOT NULL AND nom_sel_nn != 0
|
|
|
15 |
AND nom_referentiel like 'bdtfx%'
|
|
|
16 |
AND nom_sel_nn = num_nom
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|
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17 |
)
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18 |
ORDER BY id_observation asc;
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19 |
*/
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20 |
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21 |
--- l'update ---
|
| 819 |
raphael |
22 |
UPDATE `BASEEDIT`.`cel_obs` c, `BASESOURCE`.`bdtfx_v1_01` b SET
|
| 752 |
raphael |
23 |
c.nom_ret = CONCAT(b.nom_sci, ' ', b.auteur),
|
|
|
24 |
c.nom_ret_nn = b.num_nom,
|
|
|
25 |
c.nt = b.num_taxonomique,
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|
|
26 |
c.famille = b.famille
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|
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27 |
WHERE (
|
|
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28 |
nom_sel_nn IS NOT NULL AND nom_sel_nn != 0
|
|
|
29 |
AND nom_referentiel like 'bdtfx%'
|
|
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30 |
AND nom_sel_nn = num_nom
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| 760 |
raphael |
31 |
AND LOWER(c.famille) = LOWER(b.famille)
|
|
|
32 |
AND SUBSTRING_INDEX(c.nom_sel, ' ', 1) = SUBSTRING_INDEX(b.nom_sci, ' ', 1)
|
| 752 |
raphael |
33 |
);
|
| 760 |
raphael |
34 |
-- 31739 sans les restrictions sur famille et SUBSTRING_INDEX()
|
|
|
35 |
-- 31524 avec les restrictions sur famille et SUBSTRING_INDEX()
|
| 754 |
raphael |
36 |
|
| 760 |
raphael |
37 |
|
| 819 |
raphael |
38 |
UPDATE `BASEEDIT`.`cel_obs` c, `BASESOURCE`.`bdtxa_v1_00` a SET
|
| 754 |
raphael |
39 |
c.nom_ret = CONCAT(a.nom_sci, ' ', a.auteur),
|
|
|
40 |
c.nom_ret_nn = a.num_nom,
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|
|
41 |
c.nt = a.num_tax,
|
|
|
42 |
c.famille = a.famille
|
|
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43 |
WHERE (
|
|
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44 |
nom_sel_nn IS NOT NULL AND nom_sel_nn != 0
|
|
|
45 |
AND nom_referentiel like 'bdtxa%'
|
|
|
46 |
AND nom_sel_nn = num_nom
|
| 760 |
raphael |
47 |
AND LOWER(c.famille) = LOWER(a.famille)
|
|
|
48 |
AND SUBSTRING_INDEX(c.nom_sel, ' ', 1) = SUBSTRING_INDEX(a.nom_sci, ' ', 1)
|
| 754 |
raphael |
49 |
);
|
| 760 |
raphael |
50 |
-- 49 sans les restrictions sur famille et SUBSTRING_INDEX()
|
|
|
51 |
-- 47 avec les restrictions sur famille et SUBSTRING_INDEX()
|
|
|
52 |
|
| 819 |
raphael |
53 |
UPDATE `BASEEDIT`.`cel_obs` c, `BASESOURCE`.`isfan_v2013` a SET
|
| 760 |
raphael |
54 |
c.nom_ret = CONCAT(a.nom_sci, ' ', a.auteur),
|
|
|
55 |
c.nom_ret_nn = a.num_nom,
|
|
|
56 |
c.nt = a.num_taxonomique,
|
|
|
57 |
c.famille = a.famille
|
|
|
58 |
WHERE (
|
|
|
59 |
nom_sel_nn IS NOT NULL AND nom_sel_nn != 0
|
|
|
60 |
AND nom_referentiel like 'isfan%'
|
|
|
61 |
AND nom_sel_nn = num_nom
|
|
|
62 |
);
|
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63 |
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64 |
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65 |
/*
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66 |
Pour observer les différences:
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67 |
wdiff -w '$(tput bold;tput setaf 1)' -x '$(tput sgr0)' -y '$(tput bold;tput setaf 2)' -z '$(tput sgr0)' pre.log post.log | \
|
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68 |
ansi2html.sh --palette=solarized | \
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69 |
sed '/^[0-9]/{/span/!d}' > diff.html
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70 |
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71 |
# extract les familles ayant changé: sed '/^[0-9]/{/<\/span>$/!d}'
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72 |
# lowercase toutes les familles: awk '{ NF=tolower($NF); print }'
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73 |
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74 |
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75 |
# filtre sed: changements de famille "normaux"
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76 |
/aceraceae.*sapindaceae/d
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77 |
/scrophulariaceae.*plantaginaceae/d
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78 |
/globulariaceae.*plantaginaceae/d
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79 |
/Famille inconnue.*null/d
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80 |
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81 |
# changement "anormaux"
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82 |
/rosaceae.*caprifoliaceae/d
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83 |
/valerianaceae.*caprifoliaceae/d
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84 |
*/
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