78 |
delphine |
1 |
<?php
|
|
|
2 |
// declare(encoding='UTF-8');
|
|
|
3 |
/**
|
|
|
4 |
* Classe Controleur du module Fiche Taxon.
|
|
|
5 |
*
|
|
|
6 |
* @category Php 5.2
|
|
|
7 |
* @package Taxon
|
|
|
8 |
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
|
|
|
9 |
* @copyright 2010 Tela-Botanica
|
|
|
10 |
* @license http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
|
|
|
11 |
* @license http://www.gnu.org/licenses/gpl.html Licence GNU-GPL
|
|
|
12 |
* @version SVN: $Id: Fiche.php 96 2010-06-21 16:46:31Z jpm $
|
|
|
13 |
*/
|
|
|
14 |
class FicheTaxon extends AppliControleur {
|
|
|
15 |
|
|
|
16 |
private $donnees = array();
|
|
|
17 |
protected $taxonDao = null;
|
85 |
delphine |
18 |
private $tableau_manuel = null;
|
|
|
19 |
private $num_taxon = array(0=>0,1=>0,2=>0);
|
78 |
delphine |
20 |
|
|
|
21 |
//+----------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
|
|
|
22 |
// Méthodes
|
|
|
23 |
/**
|
|
|
24 |
* Fonction d'affichage par défaut
|
|
|
25 |
*/
|
|
|
26 |
public function executerActionParDefaut() {
|
|
|
27 |
return $this->afficherTaxon();
|
|
|
28 |
}
|
|
|
29 |
|
|
|
30 |
// +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
|
82 |
delphine |
31 |
// FICHE CONSULTATION TAXON
|
78 |
delphine |
32 |
public function afficherTaxon() {
|
|
|
33 |
// Récupération du référentiel
|
|
|
34 |
if (isset($_GET['ref'])) {
|
|
|
35 |
$this->referentiel = strtolower($_GET['ref']);
|
|
|
36 |
}
|
|
|
37 |
// Gestion des actions par défaut
|
|
|
38 |
$this->taxonDao = new TaxonDao();
|
|
|
39 |
$this->definirCommeModulePrincipal(get_class($this));
|
|
|
40 |
$this->construireMenu($this->referentiel);
|
|
|
41 |
$this->construireFilAriane($this->referentiel);
|
|
|
42 |
$this->executerActionReferentiel('Recherche', 'chargerMoteurRecherche', $this->referentiel);
|
|
|
43 |
|
|
|
44 |
// Gestion des données de la requête
|
|
|
45 |
if (!isset($_GET['num_nom'])) {
|
|
|
46 |
|
|
|
47 |
} else {
|
|
|
48 |
// Récupération des données
|
|
|
49 |
$this->donnees['referentiel'] = $this->referentiel;
|
|
|
50 |
$this->donnees['num_nom'] = $_GET['num_nom'];
|
|
|
51 |
$this->donnees['num_nom_retenu'] = $_GET['num_nom_retenu'];
|
|
|
52 |
$this->donnees['nom'] = $_GET['nom'];
|
82 |
delphine |
53 |
$this->donnees['info'] = $this->taxonDao->getTaxon($this->referentiel, $this->donnees['num_nom']);
|
78 |
delphine |
54 |
|
|
|
55 |
// Chargement des données des onglets
|
|
|
56 |
$this->chargerNomenclature();
|
82 |
delphine |
57 |
$this->chargerSynonymie();
|
85 |
delphine |
58 |
$this->chargerClassification();
|
78 |
delphine |
59 |
$this->chargerChorologie();
|
85 |
delphine |
60 |
$this->chargerComplements();
|
78 |
delphine |
61 |
|
|
|
62 |
$this->setSortie(self::RENDU_CORPS, $this->getVue('fiche_taxon', $this->donnees));
|
|
|
63 |
}
|
|
|
64 |
}
|
|
|
65 |
|
82 |
delphine |
66 |
private function chargerNomenclature() {
|
|
|
67 |
$this->donnees['selectionne'] = $this->taxonDao->getNomenclature($this->referentiel, $this->donnees['num_nom']);
|
|
|
68 |
if (strpos($this->donnees['nom'], ' x ') ) {
|
85 |
delphine |
69 |
if ($this->donnees['num_nom'] != $this->donnees['num_nom_retenu'] && $this->donnees['num_nom_retenu'] != '') {
|
82 |
delphine |
70 |
$this->donnees['retenu'] = $this->taxonDao->getNomenclature($this->referentiel, $this->donnees['num_nom_retenu']);
|
|
|
71 |
$this->donnees['parents'] = $this->taxonDao->getParentsHybride($this->referentiel, $this->donnees['num_nom_retenu']);
|
|
|
72 |
} else {
|
|
|
73 |
$this->donnees['parents'] = $this->taxonDao->getParentsHybride($this->referentiel, $this->donnees['num_nom']);
|
|
|
74 |
}
|
|
|
75 |
} else {
|
85 |
delphine |
76 |
if ($this->donnees['num_nom'] != $this->donnees['num_nom_retenu'] && $this->donnees['num_nom_retenu'] != '') {
|
82 |
delphine |
77 |
$this->donnees['retenu'] = $this->taxonDao->getNomenclature($this->referentiel, $this->donnees['num_nom_retenu']);
|
|
|
78 |
}
|
|
|
79 |
}
|
|
|
80 |
}
|
|
|
81 |
|
|
|
82 |
// recherche les synonymes (à compléter)
|
|
|
83 |
private function chargerSynonymie() {
|
|
|
84 |
$rechercheDao = new RechercheDao();
|
|
|
85 |
// recherche des synonymes nomenclaturaux et taxonomiques
|
|
|
86 |
$parametres = $this->parserChaineDeRecherche('nn:'.$this->donnees['num_nom'].' tax:1');
|
|
|
87 |
$parametres['ref']= $this->referentiel;
|
85 |
delphine |
88 |
$synonymes = $rechercheDao->chercher('ParTaxon', $parametres);
|
|
|
89 |
if ($synonymes != '') {
|
|
|
90 |
foreach ($synonymes as $synonyme) {
|
|
|
91 |
if ($this->donnees['num_nom'] != $synonyme['num_nom'] && $synonyme['basionyme'] != null) {
|
|
|
92 |
if (($this->donnees['num_nom'] != $synonyme['num_nom']) && ($synonyme['basionyme'] == $this->donnees['num_nom'] ||
|
|
|
93 |
$this->donnees['info']['basionyme'] == $synonyme['num_nom'] || $this->donnees['info']['basionyme'] == $synonyme['basionyme'])) {
|
|
|
94 |
$this->donnees['fiche_synonymie']['nomenclaturale'][] = $synonyme;
|
|
|
95 |
} elseif ($this->donnees['num_nom'] != $synonyme['num_nom'] && $synonyme['basionyme'] != null &&
|
|
|
96 |
$this->donnees['info']['basionyme'] != null) {
|
|
|
97 |
$this->donnees['fiche_synonymie']['taxonomique'][] = $synonyme;
|
|
|
98 |
}
|
|
|
99 |
} elseif ($this->donnees['num_nom'] != $synonyme['num_nom']) {
|
|
|
100 |
///nom est synonyme mal applique de num_nom_retenu
|
|
|
101 |
if ($synonyme['synonyme_mal_applique'] == 1) {
|
|
|
102 |
$this->donnees['fiche_synonymie']['mal appliquée'][] = $synonyme;
|
|
|
103 |
} else {
|
|
|
104 |
$this->donnees['fiche_synonymie']['indéterminée (pas de basionyme)'][] = $synonyme;
|
|
|
105 |
}
|
82 |
delphine |
106 |
}
|
|
|
107 |
}
|
85 |
delphine |
108 |
// recherche synonyme proparte
|
|
|
109 |
if ($this->donnees['info']['synonyme_proparte'] != ''){
|
|
|
110 |
$this->donnees['fiche_synonymie']['pro parte']['num_nom'] = $this->donnees['info']['synonyme_proparte'];
|
|
|
111 |
/* à modifier qd base corrigée ajouter split ";"
|
|
|
112 |
* si 1 fusion de ce nom pour donner synonyme proparte
|
|
|
113 |
* sinon division
|
|
|
114 |
*/
|
|
|
115 |
}
|
|
|
116 |
// recherche si taxon est un synonyme douteux
|
|
|
117 |
if ($this->donnees['info']['synonyme_douteux'] == 1) {
|
|
|
118 |
$this->donnees['fiche_synonymie']['douteux']['num_nom'] = $this->donnees['info'];
|
|
|
119 |
}
|
|
|
120 |
/* si $this->donnees['info']['synonyme_mal_applique'] == 1 et $this->donnees['num_nom'] == $this->donnees['num_nom_retenu']
|
|
|
121 |
* nom possede des synonymes mal appliquees
|
|
|
122 |
* sinon si $this->donnees['info']['synonyme_mal_applique'] == 1 et $this->donnees['num_nom'] != $this->donnees['num_nom_retenu']
|
|
|
123 |
* nom est synonyme mal applique de num_nom_retenu
|
|
|
124 |
* si $this->donnees['info']['synonyme_orthographique'] == $this->donnees['num_nom']
|
|
|
125 |
* nom possede des synonymes orthographiques
|
|
|
126 |
* sinon $this->donnees['info']['synonyme_orthographique'] != ''
|
|
|
127 |
* nom est synonyme mal applique de $this->donnees['info']['synonyme_orthographique']
|
|
|
128 |
* si $this->donnees['info']['synonyme_proparte'] != ''
|
|
|
129 |
*
|
|
|
130 |
* si $this->donnees['info']['homonyme'] == 1 recherche sur nom
|
|
|
131 |
*/
|
|
|
132 |
}
|
82 |
delphine |
133 |
}
|
|
|
134 |
|
|
|
135 |
private function chargerChorologie() {
|
85 |
delphine |
136 |
$this->chargerTableauManuel('presence');
|
|
|
137 |
$this->chargerTableauManuel('statuts_origine');
|
|
|
138 |
$this->chargerTableauManuel('statuts_introduction');
|
|
|
139 |
$this->chargerTableauManuel('statuts_culture');
|
82 |
delphine |
140 |
foreach ($this->donnees['info'] as $param => $valeur) {
|
|
|
141 |
if ($param == 'presence') {
|
|
|
142 |
$this->donnees['chorologie']['Présence']['France']['code'] = $valeur;
|
85 |
delphine |
143 |
$this->donnees['chorologie']['Présence']['France']['valeur'] = $this->tableau_manuel['presence'][$valeur];
|
82 |
delphine |
144 |
} elseif (preg_match('/presence_(.*)/', $param, $lieu)) {
|
|
|
145 |
$this->donnees['chorologie']['Présence'][$lieu['1']]['code'] = $valeur;
|
85 |
delphine |
146 |
$this->donnees['chorologie']['Présence'][$lieu['1']]['valeur'] = $this->tableau_manuel['presence'][$valeur];
|
82 |
delphine |
147 |
} elseif ($param == 'statut_origine') {
|
|
|
148 |
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine']['France']['code'] = $valeur;
|
85 |
delphine |
149 |
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine']['France']['valeur'] =
|
|
|
150 |
$this->tableau_manuel['statuts_origine'][$valeur];
|
82 |
delphine |
151 |
} elseif (preg_match('/statut_origine_(.*)/', $param, $lieu)) {
|
|
|
152 |
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine'][$lieu['1']]['code'] = $valeur;
|
85 |
delphine |
153 |
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine'][$lieu['1']]['valeur'] =
|
|
|
154 |
$this->tableau_manuel['statuts_origine'][$valeur];
|
82 |
delphine |
155 |
} elseif ($param == 'statut_introduction') {
|
|
|
156 |
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction']['France']['code'] = $valeur;
|
85 |
delphine |
157 |
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction']['France']['valeur'] =
|
|
|
158 |
$this->tableau_manuel['statuts_introduction'][$valeur];
|
82 |
delphine |
159 |
} elseif (preg_match('/statut_introduction_(.*)/', $param, $lieu)) {
|
|
|
160 |
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction'][$lieu['1']]['code'] = $valeur;
|
85 |
delphine |
161 |
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction'][$lieu['1']]['valeur'] =
|
|
|
162 |
$this->tableau_manuel['statuts_introduction'][$valeur];
|
82 |
delphine |
163 |
} elseif ($param == 'statut_culture') {
|
|
|
164 |
$this->donnees['chorologie']['Statut de culture']['France']['code'] = $valeur;
|
85 |
delphine |
165 |
$this->donnees['chorologie']['Statut de culture']['France']['valeur'] =
|
|
|
166 |
$this->tableau_manuel['statuts_culture'][$valeur];
|
82 |
delphine |
167 |
} elseif (preg_match('/statut_culture_(.*)/', $param, $lieu)) {
|
|
|
168 |
$this->donnees['chorologie']['Statut de culture'][$lieu['1']]['code'] = $valeur;
|
85 |
delphine |
169 |
$this->donnees['chorologie']['Statut de culture'][$lieu['1']]['valeur'] =
|
|
|
170 |
$this->tableau_manuel['statuts_culture'][$valeur];
|
82 |
delphine |
171 |
}
|
|
|
172 |
}
|
|
|
173 |
foreach ($this->donnees['chorologie']['Présence'] as $lieu=>$valeur) {
|
|
|
174 |
if (!isset($this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine'][$lieu])) {
|
|
|
175 |
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine'][$lieu]['code'] = '';
|
85 |
delphine |
176 |
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine'][$lieu]['valeur'] =
|
|
|
177 |
$this->tableau_manuel['statuts_origine'][''];
|
82 |
delphine |
178 |
}
|
|
|
179 |
if (!isset($this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction'][$lieu])) {
|
|
|
180 |
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction'][$lieu]['code'] = '';
|
85 |
delphine |
181 |
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction'][$lieu]['valeur'] =
|
|
|
182 |
$this->tableau_manuel['statuts_introduction'][''];
|
82 |
delphine |
183 |
}
|
|
|
184 |
if (!isset($this->donnees['chorologie']['Statut de culture'][$lieu])) {
|
|
|
185 |
$this->donnees['chorologie']['Statut de culture'][$lieu]['code'] = '';
|
85 |
delphine |
186 |
$this->donnees['chorologie']['Statut de culture'][$lieu]['valeur'] =
|
|
|
187 |
$this->tableau_manuel['statuts_culture'][''];
|
82 |
delphine |
188 |
}
|
|
|
189 |
}
|
|
|
190 |
}
|
|
|
191 |
|
85 |
delphine |
192 |
private function chargerClassification() {
|
|
|
193 |
if ($this->donnees['info']['num_tax_sup'] != '' || isset($this->donnees['retenu']['num_tax_sup'])) {
|
|
|
194 |
if ($this->donnees['num_nom'] == $this->donnees['num_nom_retenu']) {
|
|
|
195 |
$this->donnees['classification']['supérieurs'] = array_reverse($this->taxonDao->getClassification
|
|
|
196 |
('Superieur', $this->referentiel, $this->donnees['info']['num_tax_sup']));
|
|
|
197 |
} else {
|
|
|
198 |
$this->donnees['classification']['supérieurs'] = array_reverse($this->taxonDao->getClassification
|
|
|
199 |
('Superieur', $this->referentiel, $this->donnees['retenu']['num_tax_sup']));
|
|
|
200 |
}
|
|
|
201 |
}
|
|
|
202 |
if ($this->donnees['num_nom_retenu'] != '') {
|
|
|
203 |
$class_inf = $this->taxonDao->getClassification
|
|
|
204 |
('Inferieur', $this->referentiel, $this->donnees['num_nom_retenu']);
|
|
|
205 |
$this->donnees['classification']['inférieurs'] = $class_inf['inf'];
|
|
|
206 |
$this->donnees['niveau'] = $class_inf['niveau'];
|
|
|
207 |
}
|
|
|
208 |
}
|
|
|
209 |
|
|
|
210 |
public function chargerComplements() {
|
|
|
211 |
$champs_manuel_technique = explode(',', $this->manuel['champs']);
|
|
|
212 |
$champs_base_donnees = key($this->donnees['info']);
|
|
|
213 |
$champs_supp_base = array_diff_key($this->donnees['info'], array_flip($champs_manuel_technique));
|
|
|
214 |
foreach ($champs_supp_base as $champ=>$valeur) {
|
|
|
215 |
if (!(preg_match('/presence_(.*)/',$champ) || preg_match('/statut_origine_(.*)/', $champ) ||
|
|
|
216 |
preg_match('/statut_introduction_(.*)/', $champ) || preg_match('/statut_culture_(.*)/', $champ))) {
|
|
|
217 |
$this->donnees['complement'][$champ] = $valeur;
|
|
|
218 |
}
|
|
|
219 |
}
|
|
|
220 |
}
|
|
|
221 |
|
82 |
delphine |
222 |
private function parserChaineDeRecherche($chaine) {
|
|
|
223 |
$mots = preg_split('/ /i', $chaine, -1, PREG_SPLIT_NO_EMPTY);
|
|
|
224 |
$parametres = array('mots' => '');
|
|
|
225 |
$cle_precedente = null;
|
|
|
226 |
foreach ($mots as $mot) {
|
|
|
227 |
if (preg_match('/^(sg|gen|sp|ssp|au|an|nn|bib|nr|tax):(.*)$/', $mot, $match)) {
|
|
|
228 |
$cle = $match[1];
|
|
|
229 |
$cle_precedente = $cle;
|
|
|
230 |
$valeur = $match[2];
|
|
|
231 |
$parametres[$cle] = $valeur;
|
|
|
232 |
} else if (!is_null($cle_precedente)) {
|
|
|
233 |
$parametres[$cle_precedente] .= ' '.$mot;
|
|
|
234 |
} else if (is_null($cle_precedente)) {
|
|
|
235 |
if (empty($parametres['mots'])) {
|
|
|
236 |
$parametres['mots'] = $mot;
|
|
|
237 |
} else {
|
|
|
238 |
$parametres['mots'] .= ' '.$mot;
|
|
|
239 |
}
|
|
|
240 |
}
|
|
|
241 |
}
|
|
|
242 |
return $parametres;
|
|
|
243 |
}
|
|
|
244 |
|
|
|
245 |
// retourne l'url de la fiche taxon pour les liens
|
78 |
delphine |
246 |
public static function getUrlFicheTaxon($params, $type) {
|
|
|
247 |
$taxon = null;
|
|
|
248 |
switch ($type) {
|
|
|
249 |
case 'bas' :
|
|
|
250 |
$taxon['num_nom'] = $params['bas_num'];
|
|
|
251 |
$taxon['num_nom_retenu'] = $params['bas_num_retenu'];
|
|
|
252 |
$taxon['nom_complet'] = $params['bas_nom'];
|
|
|
253 |
break;
|
|
|
254 |
case 'p1' :
|
|
|
255 |
$taxon['num_nom'] = $params['p1_num'];
|
|
|
256 |
$taxon['num_nom_retenu'] = $params['p1_num'];
|
|
|
257 |
$taxon['nom_complet'] = $params['p1_nom'];
|
|
|
258 |
break;
|
|
|
259 |
case 'p2' :
|
|
|
260 |
$taxon['num_nom'] = $params['p2_num'];
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261 |
$taxon['num_nom_retenu'] = $params['p2_num'];
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262 |
$taxon['nom_complet'] = $params['p2_nom'];
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263 |
break;
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264 |
default : break;
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265 |
}
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266 |
return Recherche::getUrlFicheTaxon($taxon);
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267 |
}
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268 |
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85 |
delphine |
269 |
// charger tableau de $this->manuel
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270 |
private function chargerTableauManuel($titreTableau) {
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271 |
$champs = explode(',', $this->manuel[$titreTableau]);
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272 |
foreach ($champs as $champ) {
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273 |
list($champ_nom, $type) = explode('=', trim($champ));
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274 |
$this->tableau_manuel[$titreTableau][$champ_nom] = $type;
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275 |
}
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276 |
}
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277 |
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78 |
delphine |
278 |
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279 |
}
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