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Rev Author Line No. Line
1425 aurelien 1
<?php
2
/**
3
* PHP Version 5
4
*
5
* @category  PHP
6
* @package   jrest
7
* @author    David Delon <david@tela-botania.org>
8
* @author    Aurélien Peronnet <aurelien@tela-botania.org>
9
* @copyright 2010 Tela-Botanica
10
* @license   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
11
* @version   SVN: <svn_id>
12
* @link      /doc/jrest/
13
*/
14
 
15
/**
16
 *
17
 * La classe appelle les web service d'eflore pour éviter que le code client
18
 * ne soit dépendant de la version d'eflore
19
 */
20
class RechercheInfosTaxonBeta extends Cel {
21
 
1427 aurelien 22
	private $url_service_nom = null;
23
	private $url_service_taxon = null;
24
	private $url_service_chorologie = null;
25
 
1487 aurelien 26
	private $masque_recherche = null;
1527 aurelien 27
	private $code_referentiel = 'bdtfx';
28
 
29
	public function RechercheInfosTaxonBeta($config, $code_referentiel = 'bdtfx') {
30
		parent::__construct($config);
31
		$this->code_referentiel = $code_referentiel;
32
		$this->formaterUrlsServices($config);
33
	}
1487 aurelien 34
 
1527 aurelien 35
	private function formaterUrlsServices($config) {
36
		$this->url_service_nom = str_replace('{referentiel}', $this->code_referentiel ,$config['eflore']['url_service_nom']);
37
		$this->url_service_taxon = str_replace('{referentiel}', $this->code_referentiel ,$config['eflore']['url_service_taxon']);
1427 aurelien 38
		$this->url_service_chorologie_obs = $config['eflore']['url_service_chorologie_obs'];
1425 aurelien 39
	}
40
 
41
	public function rechercherGenreEspeceSurPrefixe($genre = null, $espece = null) {
42
 
43
		$liste_genre_espece = array();
1487 aurelien 44
		$this->masque_recherche = trim(trim($genre).' '.trim($espece,' *'));
45
		$masque = urlencode($this->masque_recherche);
1427 aurelien 46
		$requete = @file_get_contents($this->url_service_nom.'?masque='.$masque.'&recherche=etendue&retour.format=min&navigation.limite=50&ns.structure=au');
1425 aurelien 47
		if($requete != '') {
48
			$requete = json_decode($requete);
49
			if(is_object($requete) && isset($requete->resultat)) {
50
				foreach ($requete->resultat as $id => $res) {
1427 aurelien 51
					$retenu = ($res->retenu == "true") ? '3' : '4';
1425 aurelien 52
					$liste_genre_espece[] = array($res->nom_sci_complet, $id, $retenu);
53
				}
54
			}
1427 aurelien 55
			usort($liste_genre_espece, array($this, 'comparerParRetenuPuisNom'));
1425 aurelien 56
		}
57
		return $liste_genre_espece;
58
	}
59
 
1427 aurelien 60
	function comparerParRetenuPuisNom($a, $b) {
61
		if($a[2] == 3 && $b[2] != 3) {
62
			return -1;
63
		} elseif($a[2] != 3 && $b[2] == 3) {
64
			return 1;
65
		} else {
1487 aurelien 66
			return levenshtein($this->masque_recherche, $a[0]) >= levenshtein($this->masque_recherche, $b[0]);
1427 aurelien 67
		}
1425 aurelien 68
	}
69
 
70
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesEtFormaterNom($numNom) {
71
		$resultat_infos_complementaires = (array)$this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom);
72
		$retour_infos_complementaires = array();
1780 raphael 73
		if (isset($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet']) && $resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet']) {
74
           	$retour_infos_complementaires=array((self::supprimerBiblio($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet'])));
1425 aurelien 75
	    }
76
 
77
		return $retour_infos_complementaires;
78
	}
79
 
80
	public function rechercherInformationsComplementairesSurNom($nom_saisi) {
1487 aurelien 81
		$nom_saisi = trim($nom_saisi);
1486 aurelien 82
		// Essai de recherche sur le nom saisi tel quel
83
		$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, true);
84
		if(empty($liste_genre_espece)) {
85
			// Essai de recherche stricte en tentant de supprimer le nom d'auteur
86
			$nom_saisi_sans_auteur = $this->supprimerAuteur($nom_saisi);
87
			$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi_sans_auteur, true);
88
			if(empty($liste_genre_espece)) {
89
				// Dernière tentative : essai de recherche étendue
90
				$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, false);
91
			}
92
		}
93
		return $liste_genre_espece;
94
	}
95
 
96
	private function effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, $stricte = true) {
97
		$url_recherche = $this->getUrlRechercheInfosComplementaires($nom_saisi, $stricte);
1780 raphael 98
		$res = @json_decode(file_get_contents($url_recherche));
99
		if(!$res) return NULL;
100
		$resultat = (array)$res->resultat;
101
		return array_pop($resultat);
1486 aurelien 102
	}
103
 
104
	private function getUrlRechercheInfosComplementaires($nom_saisi, $stricte = true) {
105
		$type_recherche = $stricte ? 'stricte' : 'etendue';
106
		return $url_recherche_etendue = $this->url_service_nom.'?masque='.urlencode($nom_saisi).'&recherche='.$type_recherche.'&ns.format=txt&retour.champs=nom_sci,auteur,nom_retenu.id&navigation.limite=1';
107
	}
108
 
109
	private function supprimerAuteur($nom_saisi) {
110
		// Attention le parseur de nom n'est pas fiable à 100%
111
		// mais ça marche dans la plupart des cas
112
		// à part les formules d'hybridité saisies avec un auteur
113
		// TODO: gérer les hybrides
1425 aurelien 114
		$nameparser = new NameParser();
1486 aurelien 115
		if($this->estUnHybride($nom_saisi) || $this->estUneFormuleHybridite($nom_saisi)) {
116
			$nom_decoupe = explode(' ', $nom_saisi);
117
			$derniere_position_hybride = end(array_keys($nom_decoupe, 'x'));
118
			$nom_saisi_sans_auteur = implode(' ',array_slice($nom_decoupe, 0, $derniere_position_hybride + 2));
119
		} else {
120
			$auteur = $nameparser->parse_auth($nom_saisi);
121
			$nom_saisi_sans_auteur = str_replace($auteur, '', $nom_saisi);
122
		}
123
 
124
		$nom_saisi_sans_auteur = trim($nom_saisi_sans_auteur);
125
		return $nom_saisi_sans_auteur;
126
	}
127
 
128
	private function estUneFormuleHybridite($nom_saisi) {
129
		return strpos($nom_saisi,' x ') !== false;
130
	}
131
 
132
	private function estUnHybride($nom_saisi) {
133
		return strpos($nom_saisi,'x ') === 0;
134
	}
135
 
1425 aurelien 136
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num_nom) {
1780 raphael 137
		return @json_decode(file_get_contents($this->url_service_nom.'/'.$num_nom.'?retour.champs=nom_sci,auteur,id,nom_retenu_complet,nom_retenu.id,num_taxonomique,famille'));
1425 aurelien 138
	}
1780 raphael 139
 
140
	static function supprimerBiblio($nom) {
1425 aurelien 141
		return preg_replace('/ \[.*\]/','',$nom);
142
	}
143
 
144
	public function rechercherNumTaxSurNumNom($num_nom) {
145
		$nt = null;
1427 aurelien 146
		$url = $this->url_service_nom."/".$num_nom.'?retour.champs=num_taxonomique';
1425 aurelien 147
		$resultat = @file_get_contents($url);
148
		if($resultat != '') {
149
			$infos = json_decode($resultat);
150
			$nt = $infos->num_taxonomique;
151
		}
152
 
153
		return $nt;
154
	}
155
 
156
	public function taxonEstPresentDansDepartement($num_taxon,$code_departement) {
157
		$presence_taxon = false;
1427 aurelien 158
		$url = $this->url_service_chorologie_obs.'?masque.departement='.$code_departement.'&masque.determination.nt='.$num_taxon.'&navigation.limite=1';
1425 aurelien 159
		$resultat = @file_get_contents($url);
160
		if($resultat != '') {
161
			$resultat = json_decode($resultat);
162
			if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat) && count($resultat->resultat) > 0) {
163
				$presence_taxon = true;
164
			}
165
		}
166
		return $presence_taxon;
167
	}
168
 
169
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumTax($numTax) {
1426 aurelien 170
		//TODO: retourner moins de champs grâce au paramètre retour.champs
1780 raphael 171
		return @json_decode(file_get_contents($this->url_service_taxon."/nt:".$numTax));
172
	}
1426 aurelien 173
 
1780 raphael 174
	/* texte libre, nom scientifique,
175
	   ou code nomenclatural (format BDNFFnn999999)
176
	   ou code taxonomique (format BDNFFnt999999)
177
	   TODO: voir ce qu'on fait pour l'import de différent référentiels */
1425 aurelien 178
	function rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax($identifiant_espece) {
1780 raphael 179
		preg_match('/BDNFFnn(\d+)/',$identifiant_espece, $elements);
180
		// Numero nomenclatural
181
		if (isset($elements[1]))
182
			return $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($elements[1]);
1746 raphael 183
 
1780 raphael 184
		//  Numero taxonomique ou nom scientifique
185
		preg_match('/BDNFFnt(\d+)/', $identifiant_espece, $elements);
186
		// Numero taxonomique
187
		if (isset($elements[1]))
188
			return $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumTax($elements[1]);
189
 
190
		// Nom scientifique
191
		return $this->rechercherInformationsComplementairesSurNom($identifiant_espece);
1425 aurelien 192
	}
1591 aurelien 193
 
194
	public function rechercherSynonymesSurNumNom($num_nom) {
195
		$retour = array();
1780 raphael 196
		$resultat = @file_get_contents($this->url_service_nom.'/'.$num_nom.'/relations/synonymie/?retour.format=min');
1591 aurelien 197
		if($resultat != '') {
198
			$resultat = json_decode($resultat);
199
			if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat) && count($resultat->resultat) > 0) {
200
				$retour = $resultat->resultat;
201
			}
202
		}
203
		return $retour;
204
	}
1425 aurelien 205
}
206
?>