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1425 aurelien 1
<?php
2
/**
1926 raphael 3
 * PHP Version 5
4
 *
5
 * @category  PHP
6
 * @package	  jrest
7
 * @author	  David Delon <david@tela-botania.org>
8
 * @author	  Aurélien Peronnet <aurelien@tela-botania.org>
9
 * @copyright 2010 Tela-Botanica
10
 * @license	  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
11
 * @version	  SVN: <svn_id>
12
 * @link	  /doc/jrest/
13
 */
1425 aurelien 14
 
15
/**
16
 *
17
 * La classe appelle les web service d'eflore pour éviter que le code client
18
 * ne soit dépendant de la version d'eflore
19
 */
20
class RechercheInfosTaxonBeta extends Cel {
1926 raphael 21
 
22
	const DEBUG = FALSE;
23
 
1427 aurelien 24
	private $url_service_nom = null;
25
	private $url_service_taxon = null;
26
	private $url_service_chorologie = null;
27
 
1487 aurelien 28
	private $masque_recherche = null;
1527 aurelien 29
	private $code_referentiel = 'bdtfx';
1784 raphael 30
 
31
	// initialisé à TRUE par rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax()
32
	// si l'espèce passée a le motif <ref>:(nt|nn):<num>, eg: isfan:nt:1591
33
	public $is_notation_spe = FALSE;
34
 
1527 aurelien 35
	public function RechercheInfosTaxonBeta($config, $code_referentiel = 'bdtfx') {
36
		parent::__construct($config);
37
		$this->code_referentiel = $code_referentiel;
38
		$this->formaterUrlsServices($config);
39
	}
1487 aurelien 40
 
1527 aurelien 41
	private function formaterUrlsServices($config) {
42
		$this->url_service_nom = str_replace('{referentiel}', $this->code_referentiel ,$config['eflore']['url_service_nom']);
43
		$this->url_service_taxon = str_replace('{referentiel}', $this->code_referentiel ,$config['eflore']['url_service_taxon']);
1427 aurelien 44
		$this->url_service_chorologie_obs = $config['eflore']['url_service_chorologie_obs'];
1852 raphael 45
		$this->config = $config;
1425 aurelien 46
	}
47
 
48
	public function rechercherGenreEspeceSurPrefixe($genre = null, $espece = null) {
49
 
50
		$liste_genre_espece = array();
1487 aurelien 51
		$this->masque_recherche = trim(trim($genre).' '.trim($espece,' *'));
52
		$masque = urlencode($this->masque_recherche);
1926 raphael 53
		if(self::DEBUG) error_log("CEL fetch: " . $this->url_service_nom.'?masque='.$masque.'&recherche=etendue&retour.format=min&navigation.limite=50&ns.structure=au');
1427 aurelien 54
		$requete = @file_get_contents($this->url_service_nom.'?masque='.$masque.'&recherche=etendue&retour.format=min&navigation.limite=50&ns.structure=au');
1425 aurelien 55
		if($requete != '') {
56
			$requete = json_decode($requete);
57
			if(is_object($requete) && isset($requete->resultat)) {
58
				foreach ($requete->resultat as $id => $res) {
1427 aurelien 59
					$retenu = ($res->retenu == "true") ? '3' : '4';
1425 aurelien 60
					$liste_genre_espece[] = array($res->nom_sci_complet, $id, $retenu);
61
				}
62
			}
1427 aurelien 63
			usort($liste_genre_espece, array($this, 'comparerParRetenuPuisNom'));
1425 aurelien 64
		}
65
		return $liste_genre_espece;
66
	}
67
 
1427 aurelien 68
	function comparerParRetenuPuisNom($a, $b) {
69
		if($a[2] == 3 && $b[2] != 3) {
70
			return -1;
71
		} elseif($a[2] != 3 && $b[2] == 3) {
72
			return 1;
73
		} else {
1487 aurelien 74
			return levenshtein($this->masque_recherche, $a[0]) >= levenshtein($this->masque_recherche, $b[0]);
1427 aurelien 75
		}
1425 aurelien 76
	}
77
 
78
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesEtFormaterNom($numNom) {
79
		$resultat_infos_complementaires = (array)$this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom);
80
		$retour_infos_complementaires = array();
1780 raphael 81
		if (isset($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet']) && $resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet']) {
1926 raphael 82
			$retour_infos_complementaires=array((self::supprimerBiblio($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet'])));
83
		}
1425 aurelien 84
 
85
		return $retour_infos_complementaires;
86
	}
87
 
88
	public function rechercherInformationsComplementairesSurNom($nom_saisi) {
1487 aurelien 89
		$nom_saisi = trim($nom_saisi);
1486 aurelien 90
		// Essai de recherche sur le nom saisi tel quel
1862 raphael 91
		$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, 'stricte');
92
		if($liste_genre_espece) return $liste_genre_espece;
93
 
94
		// Essai de recherche stricte en tentant de supprimer le nom d'auteur
95
		if( ($nom_saisi_sans_auteur = self::supprimerAuteur($nom_saisi)) ) { // ne pas faire la requête sur un mot vide
96
			$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi_sans_auteur, 'stricte');
1486 aurelien 97
		}
1862 raphael 98
		if($liste_genre_espece) return $liste_genre_espece;
99
 
100
		// avant-dernière tentative : essai de recherche étendue
101
		$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, 'etendue');
102
		if($liste_genre_espece) return $liste_genre_espece;
103
 
104
		// dernière tentative: concaténation (nom_sci,auteur) (= nom-retenu généré utilisé comme nom_sci)
105
		$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, 'concat');
106
 
1486 aurelien 107
		return $liste_genre_espece;
108
	}
109
 
1862 raphael 110
	private function effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, $mode = 'stricte') {
1926 raphael 111
		if(self::DEBUG) error_log("CEL fetch: " . sprintf('%1$s?masque=%2$s&recherche=%3$s&ns.format=txt&retour.champs=%4$s&navigation.limite=1', $this->url_service_nom, urlencode($nom_saisi), $mode, implode(',', array("id","nom_sci","auteur","nom_retenu.id","famille","num_taxonomique","nom_retenu_complet"))));
1787 raphael 112
		$res = @json_decode(file_get_contents(sprintf('%1$s?masque=%2$s&recherche=%3$s&ns.format=txt&retour.champs=%4$s&navigation.limite=1',
1926 raphael 113
		$this->url_service_nom,
114
		urlencode($nom_saisi),
115
		$mode,
116
		implode(',', array("id","nom_sci","auteur","nom_retenu.id","famille","num_taxonomique","nom_retenu_complet")))));
1780 raphael 117
		if(!$res) return NULL;
118
		$resultat = (array)$res->resultat;
119
		return array_pop($resultat);
1486 aurelien 120
	}
121
 
1833 raphael 122
	static function supprimerAuteur($nom_saisi) {
1486 aurelien 123
		// TODO: gérer les hybrides
1833 raphael 124
		if(self::estUnHybride($nom_saisi) || self::estUneFormuleHybridite($nom_saisi)) {
1486 aurelien 125
			$nom_decoupe = explode(' ', $nom_saisi);
126
			$derniere_position_hybride = end(array_keys($nom_decoupe, 'x'));
127
			$nom_saisi_sans_auteur = implode(' ',array_slice($nom_decoupe, 0, $derniere_position_hybride + 2));
128
		} else {
1833 raphael 129
			/* Attention le parseur de nom n'est pas fiable à 100%
130
			   mais ça marche dans la plupart des cas
131
			   à part les formules d'hybridité saisies avec un auteur */
132
			$nameparser = new NameParser();
1486 aurelien 133
			$auteur = $nameparser->parse_auth($nom_saisi);
134
			$nom_saisi_sans_auteur = str_replace($auteur, '', $nom_saisi);
135
		}
136
 
1833 raphael 137
		return trim($nom_saisi_sans_auteur);
1486 aurelien 138
	}
139
 
1833 raphael 140
	static function estUneFormuleHybridite($nom_saisi) {
1486 aurelien 141
		return strpos($nom_saisi,' x ') !== false;
142
	}
143
 
1833 raphael 144
	static function estUnHybride($nom_saisi) {
1486 aurelien 145
		return strpos($nom_saisi,'x ') === 0;
146
	}
147
 
1852 raphael 148
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num_nom, $ref = NULL) {
149
		if($ref && isset($this->config['eflore']['api_host'])) {
1926 raphael 150
			if(self::DEBUG) error_log("CEL fetch: " .$this->config['eflore']['api_host'] . '/');
1852 raphael 151
			return @json_decode(file_get_contents($this->config['eflore']['api_host'] . '/' .
1926 raphael 152
			$ref . '/' .
153
			'noms' . '/' .
154
			$num_nom .
155
			'?retour.champs=' . implode(',', array('nom_sci,auteur',
156
			'id',
157
			'nom_retenu_complet',
158
			'nom_retenu.id',
159
			'num_taxonomique',
160
			'famille'))));
1852 raphael 161
		}
162
		// XXX: compat
1926 raphael 163
		if(self::DEBUG) error_log("CEL fetch: " . $this->url_service_nom.'/'.$num_nom.'?retour.champs=nom_sci,auteur,id,nom_retenu_complet,nom_retenu.id,num_taxonomique,famille');
1780 raphael 164
		return @json_decode(file_get_contents($this->url_service_nom.'/'.$num_nom.'?retour.champs=nom_sci,auteur,id,nom_retenu_complet,nom_retenu.id,num_taxonomique,famille'));
1425 aurelien 165
	}
1780 raphael 166
 
167
	static function supprimerBiblio($nom) {
1805 raphael 168
		return trim(preg_replace('/ \[.*\]/','',$nom));
1425 aurelien 169
	}
170
 
171
	public function rechercherNumTaxSurNumNom($num_nom) {
172
		$nt = null;
1427 aurelien 173
		$url = $this->url_service_nom."/".$num_nom.'?retour.champs=num_taxonomique';
1926 raphael 174
		if(self::DEBUG) error_log("CEL fetch: $url");
1425 aurelien 175
		$resultat = @file_get_contents($url);
176
		if($resultat != '') {
177
			$infos = json_decode($resultat);
178
			$nt = $infos->num_taxonomique;
179
		}
180
 
181
		return $nt;
182
	}
183
 
184
	public function taxonEstPresentDansDepartement($num_taxon,$code_departement) {
185
		$presence_taxon = false;
1427 aurelien 186
		$url = $this->url_service_chorologie_obs.'?masque.departement='.$code_departement.'&masque.determination.nt='.$num_taxon.'&navigation.limite=1';
1926 raphael 187
		if(self::DEBUG) error_log("CEL fetch: $url");
1425 aurelien 188
		$resultat = @file_get_contents($url);
189
		if($resultat != '') {
190
			$resultat = json_decode($resultat);
191
			if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat) && count($resultat->resultat) > 0) {
192
				$presence_taxon = true;
193
			}
194
		}
195
		return $presence_taxon;
196
	}
197
 
1780 raphael 198
	/* texte libre, nom scientifique,
1784 raphael 199
	   ou code nomenclatural (format bdtfx:nn:999999)
200
	   ou code taxonomique (format bdtfx:nt:999999)
1780 raphael 201
	   TODO: voir ce qu'on fait pour l'import de différent référentiels */
1425 aurelien 202
	function rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax($identifiant_espece) {
1784 raphael 203
		preg_match('/(' . implode('|', Cel::$referentiels_valides) .'):(nn|nt):(\d+)/i', $identifiant_espece, $elements);
204
		if($elements) {
205
			$this->is_notation_spe = TRUE;
206
			list(, $ref, $type, $num) = $elements;
1796 raphael 207
 
208
			if($ref != $this->code_referentiel) {
209
				// TODO: ignorer la colonne référentiel, et utiliser le référentiel donné
210
				// mais il faut alors avertir le service (d'import/modif) d'utiliser le référentiel
211
				// passé au nom d'espèce
1852 raphael 212
				// Seul le effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom() le supporte, car c'est encore
213
				// un peu complexe à implémenter proprement pour cause d'attributs de classes.
1796 raphael 214
			}
1784 raphael 215
			// Numero nomenclatural
216
			if ($type == 'nn') {
1852 raphael 217
				$obj = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num, $ref);
1784 raphael 218
			}
219
			// Numero taxonomique
220
			else {
221
				//TODO: retourner moins de champs grâce au paramètre retour.champs
1926 raphael 222
				if(self::DEBUG) error_log("CEL fetch: " . $this->url_service_taxon."/nt:".$num);
1784 raphael 223
				$obj = @json_decode(file_get_contents($this->url_service_taxon."/nt:".$num));
224
			}
1796 raphael 225
			if($obj) $obj->ref = $ref;
1784 raphael 226
			return $obj;
227
		}
1746 raphael 228
 
1780 raphael 229
		// Nom scientifique
230
		return $this->rechercherInformationsComplementairesSurNom($identifiant_espece);
1425 aurelien 231
	}
1591 aurelien 232
 
233
	public function rechercherSynonymesSurNumNom($num_nom) {
234
		$retour = array();
1926 raphael 235
		if(self::DEBUG) error_log("CEL fetch: " . $this->url_service_nom.'/'.$num_nom.'/relations/synonymie/?retour.format=min');
1780 raphael 236
		$resultat = @file_get_contents($this->url_service_nom.'/'.$num_nom.'/relations/synonymie/?retour.format=min');
1591 aurelien 237
		if($resultat != '') {
238
			$resultat = json_decode($resultat);
239
			if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat) && count($resultat->resultat) > 0) {
240
				$retour = $resultat->resultat;
241
			}
242
		}
243
		return $retour;
244
	}
1425 aurelien 245
}