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862 aurelien 1
<?php
867 aurelien 2
/**
3
* PHP Version 5
4
*
5
* @category  PHP
6
* @package   jrest
897 aurelien 7
* @author    David Delon <david@tela-botania.org>
8
* @author    Aurélien Peronnet <aurelien@tela-botania.org>
867 aurelien 9
* @copyright 2010 Tela-Botanica
10
* @license   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
11
* @version   SVN: <svn_id>
12
* @link      /doc/jrest/
13
*/
891 aurelien 14
 
15
/**
16
 *
17
 * Classe de recherche d'informations sur un taxon donné
18
 * lors de l'évolution d'eflore, devrait être remplacée par
19
 * un appel aux nouveaux web services
20
 */
862 aurelien 21
class RechercheInfosTaxon extends Cel {
891 aurelien 22
 
23
	public function RechercheInfosTaxon($config) {
24
 
897 aurelien 25
		parent::__construct($config);
891 aurelien 26
		// Connection à la base de données spécifique eflore
897 aurelien 27
		$this->bdd = $this->connecterPDO($this->config, 'eflore');
891 aurelien 28
	}
29
 
30
	public function rechercherGenreEspeceSurPrefixe($genre = null, $espece = null) {
31
 
32
		$liste_genre_espece = array();
33
 
34
		$requete_recherche = '';
35
		// Genre et Espece
36
		if ($espece != null && $genre != null) {
37
            if (strlen($espece) > 0 ) {
38
				$espece=ereg_replace('\*+','%',$espece);
39
    	       	$requete_recherche = "SELECT DISTINCT en_nom_genre, en_epithete_espece, en_nom_supra_generique, en_epithete_infra_generique,".
40
    	       			"   auteur_bex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio_ex ".
41
    	       			" , auteur_b.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio ".
42
    	       			" , auteur_mex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif_ex ".
43
    	       			" , auteur_m.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif ".
44
    	       			" , en_epithete_espece, en_epithete_infra_specifique, enrg_abreviation_rang, en_id_nom, esn_ce_statut" .
45
    	       			" FROM eflore_nom, eflore_nom_rang, " .
46
    	       			"  	  eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_bex ".
47
    	       			"   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_b ".
48
    	       			"   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_mex ".
49
    	       			"   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_m ".
50
    	       	     	"   , eflore_selection_nom".
51
    	       			" WHERE en_id_version_projet_nom = '25' AND en_nom_genre LIKE ".$this->proteger($genre.'%').
52
    	       			" AND en_ce_rang > 160 " .
53
    	       			" AND en_epithete_espece like ".$this->proteger($espece.'%')." AND en_ce_rang = enrg_id_rang " .
54
    	       			" AND en_ce_auteur_basio_ex = auteur_bex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
55
    	       			" AND en_ce_auteur_basio = auteur_b.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege  ".
56
    	       			" AND en_ce_auteur_modif_ex = auteur_mex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
57
    	       			" AND en_ce_auteur_modif = auteur_m.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
58
    	       			" AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom " .
59
    	       			" AND esn_id_nom= en_id_nom ".
60
    	       			" ORDER BY esn_ce_statut, en_ce_rang, en_epithete_espece, en_nom_genre LIMIT 50";
61
            }
62
		}
63
		else {
64
			if ($genre != null) {
65
				$genre=ereg_replace('\*+','%',$genre);
66
				//TODO: comprendre pourquoi à l'origine il y avait : (strlen($genre) >= 1) /*&& ($genre != '%')
67
	            if ((strlen($genre) >= 1)) {
68
				    $requete_recherche = "SELECT DISTINCT en_nom_genre, en_id_nom, 0 as esn_ce_statut FROM  eflore_nom WHERE en_id_version_projet_nom = '25'" .
69
				    "AND en_ce_rang = 160 " .
70
				    "AND en_nom_genre LIKE ".$this->proteger($genre.'%')." ORDER BY esn_ce_statut, en_nom_genre LIMIT 50";
71
	            }
72
			}
73
		}
74
 
897 aurelien 75
        if ($requete_recherche != '') {
891 aurelien 76
        	$resultat_recherche = $this->requeter($requete_recherche);
77
 
78
        	if (is_array($resultat_recherche)) {
897 aurelien 79
        		foreach ($resultat_recherche as $ligne) {
891 aurelien 80
        			$liste_genre_espece[] = array($this->formaterNom($ligne),
81
        										$ligne['en_id_nom'],
82
        										$ligne['esn_ce_statut']
83
        									);
84
        		}
85
        	}
86
        }
87
 
88
		return $liste_genre_espece;
89
	}
862 aurelien 90
 
891 aurelien 91
	function rechercherInformationsComplementairesSurNumNom($numNom) {
862 aurelien 92
 
891 aurelien 93
		$resultat_infos_complementaires = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom);
94
 
95
		// Nom retenu, Num Nomen nom retenu, Num Taxon, Famille
96
		$value=array('Nom_Retenu'=>"",'Num_Nom_Retenu'=>"0",'Num_Taxon'=>"0",'Famille'=>"");
97
 
98
        if (is_array($resultat_infos_complementaires)) {
897 aurelien 99
		    foreach ($resultat_infos_complementaires as $row) {
891 aurelien 100
		        	$fam=$this->rechercherFamille($row['esn_id_taxon']);
101
	        	while (($fam['en_ce_rang']!='fin') && ($fam['en_ce_rang'] !=120)) {
102
		        	$fam=$this->rechercherFamille($fam['etr_id_taxon_2']);
103
	        	}
104
	        	if ($fam['en_ce_rang']==120) {
105
	        		$famille=$fam['en_nom_supra_generique'];
106
	        	}
107
	        	else {
108
	        		$famille="Famille inconnue";
109
	        	}
110
	        	$value=array('Nom_Retenu'=>$this->formaterNom($row),'Num_Nom_Retenu'=>$row['esn_id_nom'],'Num_Taxon'=>$row['esn_id_taxon'],'Famille'=>$famille);
111
		    }
112
        }
113
 
114
	    return $value;
115
 
116
	}
117
 
118
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesEtFormaterNom($numNom) {
119
 
120
		$resultat_infos_complementaires = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom);
121
 
122
		$retour_infos_complementaires = array();
123
		foreach ($resultat_infos_complementaires as $info) {
124
           $retour_infos_complementaires=array(($this->formaterNom($info)));
125
	    }
126
 
127
		return $retour_infos_complementaires;
128
	}
129
 
130
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom) {
131
 
867 aurelien 132
		$requete_infos_complementaires = "SELECT DISTINCT en_nom_genre, en_epithete_espece, en_nom_supra_generique, en_epithete_infra_generique,".
862 aurelien 133
			     	       			"   auteur_bex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio_ex ".
134
        	       			" , auteur_b.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio ".
135
        	       			" , auteur_mex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif_ex ".
136
        	       			" , auteur_m.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif ".
137
			     " , en_epithete_espece, en_epithete_infra_specifique, enrg_abreviation_rang, b.esn_id_taxon, b.esn_id_nom" .
138
			     " FROM eflore_nom, eflore_nom_rang," .
139
			       			"  	  eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_bex ".
140
        	       			"   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_b ".
141
        	       			"   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_mex ".
142
        	       			"   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_m ".
143
			     " ,eflore_selection_nom a, eflore_selection_nom b".
891 aurelien 144
			     " WHERE a.esn_id_nom= ".$this->proteger($numNom).
862 aurelien 145
			     " AND a.esn_id_version_projet_taxon = 25 ".
146
			     " AND a.esn_id_taxon=b.esn_id_taxon ".
147
			     " AND b.esn_ce_statut=3 ".
148
			     " AND a.esn_id_version_projet_taxon=b.esn_id_version_projet_taxon" .
149
			     " AND en_ce_rang = enrg_id_rang" .
150
			     " AND en_id_nom = b.esn_id_nom" .
151
			     " AND en_ce_auteur_basio_ex = auteur_bex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
152
       			 " AND en_ce_auteur_basio = auteur_b.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege  ".
153
       			 " AND en_ce_auteur_modif_ex = auteur_mex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
154
        	     " AND en_ce_auteur_modif = auteur_m.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
155
			     " AND a.esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom ";
156
 
891 aurelien 157
 
867 aurelien 158
		$resultat_infos_complementaires = $this->requeter($requete_infos_complementaires);
891 aurelien 159
 
160
		return $resultat_infos_complementaires;
862 aurelien 161
	}
162
 
891 aurelien 163
	public function rechercherInformationsComplementairesSurNom($nom_saisi) {
867 aurelien 164
 
862 aurelien 165
		$value = array();
166
 
897 aurelien 167
		if ($nom_saisi != null && $nom_saisi != "") {
862 aurelien 168
 
891 aurelien 169
			$requete_infos_comp_sur_nom = 'SELECT * FROM '.$this->config['cel_db']['bdd_eflore'].'.eflore_nom_intitule '.
862 aurelien 170
			'WHERE eni_id_categorie_format = 3 AND '.
171
			'eni_id_version_projet_nom = 25 AND '.
172
			'(eni_id_valeur_format = 3 OR eni_id_valeur_format = 4) AND '.
173
			'eni_intitule_nom LIKE "'.$nom_saisi.'%" '.
174
			'ORDER BY LENGTH(eni_intitule_nom)';
175
 
867 aurelien 176
			$resultat_infos_comp_sur_nom = $this->executer($requete_infos_comp_sur_nom);
862 aurelien 177
 
867 aurelien 178
	        if (is_array($resultat_infos_comp_sur_nom)) {
179
		        foreach ($resultat_infos_comp_sur_nom as $ligne) {
180
		        	$value[]=array($ligne['eni_id_nom'], $ligne['eni_intitule_nom']);
181
		        }
862 aurelien 182
	        }
183
		}
184
 
185
		return $value;
186
	}
187
 
891 aurelien 188
	public function rechercherFamille($taxon) {
862 aurelien 189
 
897 aurelien 190
		$row = array();
862 aurelien 191
 
867 aurelien 192
		$requete_famille = "SELECT DISTINCT en_ce_rang, etr_id_taxon_2, en_id_nom, en_nom_supra_generique ".
891 aurelien 193
		" FROM eflore_taxon_relation, ".
194
		" eflore_selection_nom, ".
195
		" eflore_nom ".
862 aurelien 196
		" WHERE etr_id_taxon_1 = ".$taxon.
197
		" AND etr_id_version_projet_taxon_1 = 25 ".
198
		" AND etr_id_categorie_taxon = 3 ".
199
		" AND etr_id_valeur_taxon = 3 ".
200
		" AND esn_id_taxon =  etr_id_taxon_2 ".
201
		" AND esn_ce_statut = 3 ".
202
		" AND esn_id_version_projet_taxon = etr_id_version_projet_taxon_1 ".
203
		" AND en_id_nom = esn_id_nom ".
204
		" AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom  ";
867 aurelien 205
 
206
		$resultat_recherche_famille = $this->requeter($requete_famille);
862 aurelien 207
 
867 aurelien 208
		if (!is_array($resultat_recherche_famille) || count($resultat_recherche_famille) == 0) {
862 aurelien 209
	    	$row['en_ce_rang']='fin';
210
	    }
211
 
867 aurelien 212
		return $row;
862 aurelien 213
	}
891 aurelien 214
 
215
	public function rechercherNumTaxSurNumNom($num_nom) {
216
 
217
		$requete_num_tax = "SELECT DISTINCT b.esn_id_taxon FROM eflore_nom, eflore_nom_rang," .
218
		" eflore_selection_nom a, eflore_selection_nom b".
219
		" WHERE a.esn_id_nom= ".$this->proteger($num_nom).
220
		" AND a.esn_id_version_projet_taxon = 25 ".
221
		" AND a.esn_id_taxon=b.esn_id_taxon ".
222
		" AND b.esn_ce_statut=3 ".
223
		" AND a.esn_id_version_projet_taxon=b.esn_id_version_projet_taxon" .
224
		" AND en_ce_rang = enrg_id_rang" .
225
		" AND en_id_nom = b.esn_id_nom" .
226
		" AND a.esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom ";
227
 
228
	    $res_num_nom = $this->requeter($requete_num_tax);
229
 
230
		$nt = null;
897 aurelien 231
		if (is_array($res_num_nom) && count($res_num_nom) > 0) {
891 aurelien 232
			$nt=$res_num_nom[0]['esn_id_taxon'];
233
		}
234
 
235
		return $nt;
236
	}
237
 
238
	private function formaterNom($rawnom) {
862 aurelien 239
 
891 aurelien 240
        // Constitution du nom:
241
        $nom = '';
862 aurelien 242
 
891 aurelien 243
        if ($rawnom['en_nom_supra_generique'] != '') {
244
            $nom .= $rawnom['en_nom_supra_generique'];
245
        } else if ($rawnom['en_epithete_infra_generique'] != '') {
246
            $nom .= $rawnom['en_epithete_infra_generique'];
247
        } else {
248
            if ($rawnom['en_nom_genre'] != '') {
249
                $nom .=  $rawnom['en_nom_genre'];
250
            }
251
            if ($rawnom['en_epithete_espece']!= '') {
252
                $nom .= ' '.$rawnom['en_epithete_espece'];
253
            }
254
            if ($rawnom['en_epithete_infra_specifique'] != '') {
255
                if (!empty($rawnom['enrg_abreviation_rang'])) {
256
                        $nom .= ' '.$rawnom['enrg_abreviation_rang'].'';
257
                }
258
                $nom .= ' '.$rawnom['en_epithete_infra_specifique'];
259
            }
260
        }
862 aurelien 261
 
891 aurelien 262
        return $nom.$this->retournerAuteur($rawnom) ;
263
 	}
264
 
265
	private function retournerAuteur($rawnom) {
862 aurelien 266
		$auteurs = '';
267
		$auteur_basio = '';
268
		$auteur_modif = '';
269
		if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_basio_ex']) && $rawnom['abreviation_auteur_basio_ex']!='-' )  {
270
		    $auteur_basio .= $rawnom['abreviation_auteur_basio_ex'];
271
		    if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_basio']) && $rawnom['abreviation_auteur_basio']!='-') {
272
		        $auteur_basio .= ' ex '.$rawnom['abreviation_auteur_basio'];
273
		    }
274
		} else if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_basio']) && $rawnom['abreviation_auteur_basio']!='-') {
275
		    $auteur_basio .= $rawnom['abreviation_auteur_basio'];
276
		}
277
 
278
		if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_modif_ex']) && $rawnom['abreviation_auteur_modif_ex']!='-') {
279
		    $auteur_modif .= $rawnom['abreviation_auteur_modif_ex'];
280
		    if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_modif']) && $rawnom['abreviation_auteur_modif']!='-') {
281
		        $auteur_modif .= ' ex '.$rawnom['abreviation_auteur_modif'];
282
		    }
283
		} else if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_modif']) && $rawnom['abreviation_auteur_modif']!='-')  {
284
		    $auteur_modif .= $rawnom['abreviation_auteur_modif'];
285
		}
286
 
287
		if (!empty($auteur_modif)) {
288
		    $auteurs = ' ('.$auteur_basio.') '.$auteur_modif;
289
		} elseif (!empty($auteur_basio)) {
290
		    $auteurs = ' '.$auteur_basio;
291
		}
292
 
293
		return $auteurs ;
294
	}
295
}
296
?>