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862 aurelien 1
<?php
867 aurelien 2
/**
3
* PHP Version 5
4
*
5
* @category  PHP
6
* @package   jrest
897 aurelien 7
* @author    David Delon <david@tela-botania.org>
8
* @author    Aurélien Peronnet <aurelien@tela-botania.org>
867 aurelien 9
* @copyright 2010 Tela-Botanica
10
* @license   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
11
* @version   SVN: <svn_id>
12
* @link      /doc/jrest/
13
*/
891 aurelien 14
 
15
/**
16
 *
17
 * Classe de recherche d'informations sur un taxon donné
18
 * lors de l'évolution d'eflore, devrait être remplacée par
19
 * un appel aux nouveaux web services
20
 */
862 aurelien 21
class RechercheInfosTaxon extends Cel {
891 aurelien 22
 
23
	public function RechercheInfosTaxon($config) {
24
 
897 aurelien 25
		parent::__construct($config);
891 aurelien 26
		// Connection à la base de données spécifique eflore
897 aurelien 27
		$this->bdd = $this->connecterPDO($this->config, 'eflore');
891 aurelien 28
	}
29
 
30
	public function rechercherGenreEspeceSurPrefixe($genre = null, $espece = null) {
31
 
32
		$liste_genre_espece = array();
33
 
34
		$requete_recherche = '';
35
		// Genre et Espece
36
		if ($espece != null && $genre != null) {
37
            if (strlen($espece) > 0 ) {
995 aurelien 38
				$espece=preg_replace('/\*+/','%',$espece);
891 aurelien 39
    	       	$requete_recherche = "SELECT DISTINCT en_nom_genre, en_epithete_espece, en_nom_supra_generique, en_epithete_infra_generique,".
40
    	       			"   auteur_bex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio_ex ".
41
    	       			" , auteur_b.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio ".
42
    	       			" , auteur_mex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif_ex ".
43
    	       			" , auteur_m.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif ".
44
    	       			" , en_epithete_espece, en_epithete_infra_specifique, enrg_abreviation_rang, en_id_nom, esn_ce_statut" .
45
    	       			" FROM eflore_nom, eflore_nom_rang, " .
46
    	       			"  	  eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_bex ".
47
    	       			"   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_b ".
48
    	       			"   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_mex ".
49
    	       			"   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_m ".
50
    	       	     	"   , eflore_selection_nom".
51
    	       			" WHERE en_id_version_projet_nom = '25' AND en_nom_genre LIKE ".$this->proteger($genre.'%').
52
    	       			" AND en_ce_rang > 160 " .
53
    	       			" AND en_epithete_espece like ".$this->proteger($espece.'%')." AND en_ce_rang = enrg_id_rang " .
54
    	       			" AND en_ce_auteur_basio_ex = auteur_bex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
55
    	       			" AND en_ce_auteur_basio = auteur_b.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege  ".
56
    	       			" AND en_ce_auteur_modif_ex = auteur_mex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
57
    	       			" AND en_ce_auteur_modif = auteur_m.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
58
    	       			" AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom " .
59
    	       			" AND esn_id_nom= en_id_nom ".
60
    	       			" ORDER BY esn_ce_statut, en_ce_rang, en_epithete_espece, en_nom_genre LIMIT 50";
61
            }
62
		}
63
		else {
64
			if ($genre != null) {
995 aurelien 65
				$genre=preg_replace('/\*+/','%',$genre);
891 aurelien 66
				//TODO: comprendre pourquoi à l'origine il y avait : (strlen($genre) >= 1) /*&& ($genre != '%')
906 aurelien 67
				// voir avec david
891 aurelien 68
	            if ((strlen($genre) >= 1)) {
69
				    $requete_recherche = "SELECT DISTINCT en_nom_genre, en_id_nom, 0 as esn_ce_statut FROM  eflore_nom WHERE en_id_version_projet_nom = '25'" .
70
				    "AND en_ce_rang = 160 " .
71
				    "AND en_nom_genre LIKE ".$this->proteger($genre.'%')." ORDER BY esn_ce_statut, en_nom_genre LIMIT 50";
72
	            }
73
			}
74
		}
75
 
897 aurelien 76
        if ($requete_recherche != '') {
891 aurelien 77
        	$resultat_recherche = $this->requeter($requete_recherche);
78
 
79
        	if (is_array($resultat_recherche)) {
897 aurelien 80
        		foreach ($resultat_recherche as $ligne) {
891 aurelien 81
        			$liste_genre_espece[] = array($this->formaterNom($ligne),
82
        										$ligne['en_id_nom'],
83
        										$ligne['esn_ce_statut']
84
        									);
85
        		}
86
        	}
87
        }
88
 
89
		return $liste_genre_espece;
90
	}
862 aurelien 91
 
891 aurelien 92
	function rechercherInformationsComplementairesSurNumNom($numNom) {
862 aurelien 93
 
891 aurelien 94
		$resultat_infos_complementaires = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom);
95
 
96
		// Nom retenu, Num Nomen nom retenu, Num Taxon, Famille
97
		$value=array('Nom_Retenu'=>"",'Num_Nom_Retenu'=>"0",'Num_Taxon'=>"0",'Famille'=>"");
98
 
99
        if (is_array($resultat_infos_complementaires)) {
897 aurelien 100
		    foreach ($resultat_infos_complementaires as $row) {
891 aurelien 101
		        	$fam=$this->rechercherFamille($row['esn_id_taxon']);
102
	        	while (($fam['en_ce_rang']!='fin') && ($fam['en_ce_rang'] !=120)) {
103
		        	$fam=$this->rechercherFamille($fam['etr_id_taxon_2']);
104
	        	}
105
	        	if ($fam['en_ce_rang']==120) {
106
	        		$famille=$fam['en_nom_supra_generique'];
107
	        	}
108
	        	else {
109
	        		$famille="Famille inconnue";
110
	        	}
111
	        	$value=array('Nom_Retenu'=>$this->formaterNom($row),'Num_Nom_Retenu'=>$row['esn_id_nom'],'Num_Taxon'=>$row['esn_id_taxon'],'Famille'=>$famille);
112
		    }
113
        }
114
 
115
	    return $value;
116
 
117
	}
118
 
119
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesEtFormaterNom($numNom) {
120
 
121
		$resultat_infos_complementaires = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom);
122
 
123
		$retour_infos_complementaires = array();
124
		foreach ($resultat_infos_complementaires as $info) {
125
           $retour_infos_complementaires=array(($this->formaterNom($info)));
126
	    }
127
 
128
		return $retour_infos_complementaires;
129
	}
130
 
131
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom) {
132
 
867 aurelien 133
		$requete_infos_complementaires = "SELECT DISTINCT en_nom_genre, en_epithete_espece, en_nom_supra_generique, en_epithete_infra_generique,".
862 aurelien 134
			     	       			"   auteur_bex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio_ex ".
135
        	       			" , auteur_b.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio ".
136
        	       			" , auteur_mex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif_ex ".
137
        	       			" , auteur_m.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif ".
138
			     " , en_epithete_espece, en_epithete_infra_specifique, enrg_abreviation_rang, b.esn_id_taxon, b.esn_id_nom" .
139
			     " FROM eflore_nom, eflore_nom_rang," .
140
			       			"  	  eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_bex ".
141
        	       			"   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_b ".
142
        	       			"   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_mex ".
143
        	       			"   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_m ".
144
			     " ,eflore_selection_nom a, eflore_selection_nom b".
891 aurelien 145
			     " WHERE a.esn_id_nom= ".$this->proteger($numNom).
862 aurelien 146
			     " AND a.esn_id_version_projet_taxon = 25 ".
147
			     " AND a.esn_id_taxon=b.esn_id_taxon ".
148
			     " AND b.esn_ce_statut=3 ".
149
			     " AND a.esn_id_version_projet_taxon=b.esn_id_version_projet_taxon" .
150
			     " AND en_ce_rang = enrg_id_rang" .
151
			     " AND en_id_nom = b.esn_id_nom" .
152
			     " AND en_ce_auteur_basio_ex = auteur_bex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
153
       			 " AND en_ce_auteur_basio = auteur_b.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege  ".
154
       			 " AND en_ce_auteur_modif_ex = auteur_mex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
155
        	     " AND en_ce_auteur_modif = auteur_m.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
156
			     " AND a.esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom ";
157
 
891 aurelien 158
 
867 aurelien 159
		$resultat_infos_complementaires = $this->requeter($requete_infos_complementaires);
891 aurelien 160
 
161
		return $resultat_infos_complementaires;
862 aurelien 162
	}
163
 
891 aurelien 164
	public function rechercherInformationsComplementairesSurNom($nom_saisi) {
867 aurelien 165
 
862 aurelien 166
		$value = array();
167
 
897 aurelien 168
		if ($nom_saisi != null && $nom_saisi != "") {
862 aurelien 169
 
920 aurelien 170
			$requete_infos_comp_sur_nom = 'SELECT * FROM eflore_nom_intitule '.
862 aurelien 171
			'WHERE eni_id_categorie_format = 3 AND '.
172
			'eni_id_version_projet_nom = 25 AND '.
173
			'(eni_id_valeur_format = 3 OR eni_id_valeur_format = 4) AND '.
174
			'eni_intitule_nom LIKE "'.$nom_saisi.'%" '.
175
			'ORDER BY LENGTH(eni_intitule_nom)';
176
 
920 aurelien 177
			$resultat_infos_comp_sur_nom = $this->requeter($requete_infos_comp_sur_nom);
862 aurelien 178
 
867 aurelien 179
	        if (is_array($resultat_infos_comp_sur_nom)) {
180
		        foreach ($resultat_infos_comp_sur_nom as $ligne) {
181
		        	$value[]=array($ligne['eni_id_nom'], $ligne['eni_intitule_nom']);
182
		        }
862 aurelien 183
	        }
184
		}
185
 
186
		return $value;
187
	}
188
 
891 aurelien 189
	public function rechercherFamille($taxon) {
862 aurelien 190
 
897 aurelien 191
		$row = array();
862 aurelien 192
 
867 aurelien 193
		$requete_famille = "SELECT DISTINCT en_ce_rang, etr_id_taxon_2, en_id_nom, en_nom_supra_generique ".
891 aurelien 194
		" FROM eflore_taxon_relation, ".
195
		" eflore_selection_nom, ".
196
		" eflore_nom ".
862 aurelien 197
		" WHERE etr_id_taxon_1 = ".$taxon.
198
		" AND etr_id_version_projet_taxon_1 = 25 ".
199
		" AND etr_id_categorie_taxon = 3 ".
200
		" AND etr_id_valeur_taxon = 3 ".
201
		" AND esn_id_taxon =  etr_id_taxon_2 ".
202
		" AND esn_ce_statut = 3 ".
203
		" AND esn_id_version_projet_taxon = etr_id_version_projet_taxon_1 ".
204
		" AND en_id_nom = esn_id_nom ".
205
		" AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom  ";
867 aurelien 206
 
207
		$resultat_recherche_famille = $this->requeter($requete_famille);
862 aurelien 208
 
867 aurelien 209
		if (!is_array($resultat_recherche_famille) || count($resultat_recherche_famille) == 0) {
862 aurelien 210
	    	$row['en_ce_rang']='fin';
211
	    }
212
 
867 aurelien 213
		return $row;
862 aurelien 214
	}
891 aurelien 215
 
216
	public function rechercherNumTaxSurNumNom($num_nom) {
217
 
218
		$requete_num_tax = "SELECT DISTINCT b.esn_id_taxon FROM eflore_nom, eflore_nom_rang," .
219
		" eflore_selection_nom a, eflore_selection_nom b".
220
		" WHERE a.esn_id_nom= ".$this->proteger($num_nom).
221
		" AND a.esn_id_version_projet_taxon = 25 ".
222
		" AND a.esn_id_taxon=b.esn_id_taxon ".
223
		" AND b.esn_ce_statut=3 ".
224
		" AND a.esn_id_version_projet_taxon=b.esn_id_version_projet_taxon" .
225
		" AND en_ce_rang = enrg_id_rang" .
226
		" AND en_id_nom = b.esn_id_nom" .
227
		" AND a.esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom ";
228
 
229
	    $res_num_nom = $this->requeter($requete_num_tax);
230
 
231
		$nt = null;
897 aurelien 232
		if (is_array($res_num_nom) && count($res_num_nom) > 0) {
891 aurelien 233
			$nt=$res_num_nom[0]['esn_id_taxon'];
234
		}
235
 
236
		return $nt;
237
	}
238
 
906 aurelien 239
	public function taxonEstPresentDansDepartement($num_taxon,$code_departement) {
240
 
241
		$requete_presence_taxon = "SELECT ecd_ce_taxon FROM eflore_zg, eflore_chorologie_donnee ".
242
								  "WHERE ecd_ce_taxon = ".$this->proteger($num_taxon)." ".
243
								  "AND ezg_code=".$this->proteger($code_departement)." ".
244
								  "AND ecd_ce_zone_geo = ezg_id_zone_geo ".
245
								  "AND ezg_id_projet_zg = ecd_ce_version_projet_zg ".
246
								  "AND ecd_ce_version_projet_taxon=25";
247
 
248
		$resultat_presence_taxon = $this->requeter($requete_presence_taxon);
249
 
250
		$presence_taxon = (is_array($resultat_presence_taxon) && count($resultat_presence_taxon) > 0);
251
 
252
		return $presence_taxon;
253
	}
254
 
891 aurelien 255
	private function formaterNom($rawnom) {
862 aurelien 256
 
891 aurelien 257
        // Constitution du nom:
258
        $nom = '';
862 aurelien 259
 
995 aurelien 260
        if (isset($rawnom['en_nom_supra_generique']) && $rawnom['en_nom_supra_generique'] != '') {
891 aurelien 261
            $nom .= $rawnom['en_nom_supra_generique'];
995 aurelien 262
        } else if (isset($rawnom['en_epithete_infra_generique']) && $rawnom['en_epithete_infra_generique'] != '') {
891 aurelien 263
            $nom .= $rawnom['en_epithete_infra_generique'];
264
        } else {
995 aurelien 265
            if (isset($rawnom['en_nom_genre']) &&  $rawnom['en_nom_genre'] != '') {
891 aurelien 266
                $nom .=  $rawnom['en_nom_genre'];
267
            }
995 aurelien 268
            if (isset($rawnom['en_epithete_espece']) &&  $rawnom['en_epithete_espece']!= '') {
891 aurelien 269
                $nom .= ' '.$rawnom['en_epithete_espece'];
270
            }
995 aurelien 271
            if (isset($rawnom['en_epithete_infra_specifique']) &&  $rawnom['en_epithete_infra_specifique'] != '') {
891 aurelien 272
                if (!empty($rawnom['enrg_abreviation_rang'])) {
273
                        $nom .= ' '.$rawnom['enrg_abreviation_rang'].'';
274
                }
275
                $nom .= ' '.$rawnom['en_epithete_infra_specifique'];
276
            }
277
        }
862 aurelien 278
 
891 aurelien 279
        return $nom.$this->retournerAuteur($rawnom) ;
280
 	}
281
 
282
	private function retournerAuteur($rawnom) {
862 aurelien 283
		$auteurs = '';
284
		$auteur_basio = '';
285
		$auteur_modif = '';
286
		if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_basio_ex']) && $rawnom['abreviation_auteur_basio_ex']!='-' )  {
287
		    $auteur_basio .= $rawnom['abreviation_auteur_basio_ex'];
288
		    if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_basio']) && $rawnom['abreviation_auteur_basio']!='-') {
289
		        $auteur_basio .= ' ex '.$rawnom['abreviation_auteur_basio'];
290
		    }
291
		} else if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_basio']) && $rawnom['abreviation_auteur_basio']!='-') {
292
		    $auteur_basio .= $rawnom['abreviation_auteur_basio'];
293
		}
294
 
295
		if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_modif_ex']) && $rawnom['abreviation_auteur_modif_ex']!='-') {
296
		    $auteur_modif .= $rawnom['abreviation_auteur_modif_ex'];
297
		    if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_modif']) && $rawnom['abreviation_auteur_modif']!='-') {
298
		        $auteur_modif .= ' ex '.$rawnom['abreviation_auteur_modif'];
299
		    }
300
		} else if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_modif']) && $rawnom['abreviation_auteur_modif']!='-')  {
301
		    $auteur_modif .= $rawnom['abreviation_auteur_modif'];
302
		}
303
 
304
		if (!empty($auteur_modif)) {
305
		    $auteurs = ' ('.$auteur_basio.') '.$auteur_modif;
306
		} elseif (!empty($auteur_basio)) {
307
		    $auteurs = ' '.$auteur_basio;
308
		}
309
 
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