| 862 |
aurelien |
1 |
<?php
|
| 867 |
aurelien |
2 |
/**
|
|
|
3 |
* PHP Version 5
|
|
|
4 |
*
|
|
|
5 |
* @category PHP
|
|
|
6 |
* @package jrest
|
| 897 |
aurelien |
7 |
* @author David Delon <david@tela-botania.org>
|
|
|
8 |
* @author Aurélien Peronnet <aurelien@tela-botania.org>
|
| 867 |
aurelien |
9 |
* @copyright 2010 Tela-Botanica
|
|
|
10 |
* @license http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
|
|
|
11 |
* @version SVN: <svn_id>
|
|
|
12 |
* @link /doc/jrest/
|
|
|
13 |
*/
|
| 891 |
aurelien |
14 |
|
|
|
15 |
/**
|
|
|
16 |
*
|
|
|
17 |
* Classe de recherche d'informations sur un taxon donné
|
|
|
18 |
* lors de l'évolution d'eflore, devrait être remplacée par
|
|
|
19 |
* un appel aux nouveaux web services
|
|
|
20 |
*/
|
| 862 |
aurelien |
21 |
class RechercheInfosTaxon extends Cel {
|
| 891 |
aurelien |
22 |
|
|
|
23 |
public function RechercheInfosTaxon($config) {
|
|
|
24 |
|
| 897 |
aurelien |
25 |
parent::__construct($config);
|
| 891 |
aurelien |
26 |
// Connection à la base de données spécifique eflore
|
| 897 |
aurelien |
27 |
$this->bdd = $this->connecterPDO($this->config, 'eflore');
|
| 891 |
aurelien |
28 |
}
|
|
|
29 |
|
|
|
30 |
public function rechercherGenreEspeceSurPrefixe($genre = null, $espece = null) {
|
|
|
31 |
|
|
|
32 |
$liste_genre_espece = array();
|
|
|
33 |
|
|
|
34 |
$requete_recherche = '';
|
|
|
35 |
// Genre et Espece
|
|
|
36 |
if ($espece != null && $genre != null) {
|
|
|
37 |
if (strlen($espece) > 0 ) {
|
| 995 |
aurelien |
38 |
$espece=preg_replace('/\*+/','%',$espece);
|
| 891 |
aurelien |
39 |
$requete_recherche = "SELECT DISTINCT en_nom_genre, en_epithete_espece, en_nom_supra_generique, en_epithete_infra_generique,".
|
|
|
40 |
" auteur_bex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio_ex ".
|
|
|
41 |
" , auteur_b.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio ".
|
|
|
42 |
" , auteur_mex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif_ex ".
|
|
|
43 |
" , auteur_m.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif ".
|
|
|
44 |
" , en_epithete_espece, en_epithete_infra_specifique, enrg_abreviation_rang, en_id_nom, esn_ce_statut" .
|
|
|
45 |
" FROM eflore_nom, eflore_nom_rang, " .
|
|
|
46 |
" eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_bex ".
|
|
|
47 |
" , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_b ".
|
|
|
48 |
" , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_mex ".
|
|
|
49 |
" , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_m ".
|
|
|
50 |
" , eflore_selection_nom".
|
|
|
51 |
" WHERE en_id_version_projet_nom = '25' AND en_nom_genre LIKE ".$this->proteger($genre.'%').
|
|
|
52 |
" AND en_ce_rang > 160 " .
|
|
|
53 |
" AND en_epithete_espece like ".$this->proteger($espece.'%')." AND en_ce_rang = enrg_id_rang " .
|
|
|
54 |
" AND en_ce_auteur_basio_ex = auteur_bex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
|
|
|
55 |
" AND en_ce_auteur_basio = auteur_b.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
|
|
|
56 |
" AND en_ce_auteur_modif_ex = auteur_mex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
|
|
|
57 |
" AND en_ce_auteur_modif = auteur_m.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
|
|
|
58 |
" AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom " .
|
|
|
59 |
" AND esn_id_nom= en_id_nom ".
|
|
|
60 |
" ORDER BY esn_ce_statut, en_ce_rang, en_epithete_espece, en_nom_genre LIMIT 50";
|
|
|
61 |
}
|
|
|
62 |
}
|
|
|
63 |
else {
|
|
|
64 |
if ($genre != null) {
|
| 995 |
aurelien |
65 |
$genre=preg_replace('/\*+/','%',$genre);
|
| 891 |
aurelien |
66 |
//TODO: comprendre pourquoi à l'origine il y avait : (strlen($genre) >= 1) /*&& ($genre != '%')
|
| 906 |
aurelien |
67 |
// voir avec david
|
| 891 |
aurelien |
68 |
if ((strlen($genre) >= 1)) {
|
|
|
69 |
$requete_recherche = "SELECT DISTINCT en_nom_genre, en_id_nom, 0 as esn_ce_statut FROM eflore_nom WHERE en_id_version_projet_nom = '25'" .
|
|
|
70 |
"AND en_ce_rang = 160 " .
|
|
|
71 |
"AND en_nom_genre LIKE ".$this->proteger($genre.'%')." ORDER BY esn_ce_statut, en_nom_genre LIMIT 50";
|
|
|
72 |
}
|
|
|
73 |
}
|
|
|
74 |
}
|
|
|
75 |
|
| 897 |
aurelien |
76 |
if ($requete_recherche != '') {
|
| 891 |
aurelien |
77 |
$resultat_recherche = $this->requeter($requete_recherche);
|
|
|
78 |
|
|
|
79 |
if (is_array($resultat_recherche)) {
|
| 897 |
aurelien |
80 |
foreach ($resultat_recherche as $ligne) {
|
| 891 |
aurelien |
81 |
$liste_genre_espece[] = array($this->formaterNom($ligne),
|
|
|
82 |
$ligne['en_id_nom'],
|
|
|
83 |
$ligne['esn_ce_statut']
|
|
|
84 |
);
|
|
|
85 |
}
|
|
|
86 |
}
|
|
|
87 |
}
|
|
|
88 |
|
|
|
89 |
return $liste_genre_espece;
|
|
|
90 |
}
|
| 862 |
aurelien |
91 |
|
| 891 |
aurelien |
92 |
function rechercherInformationsComplementairesSurNumNom($numNom) {
|
| 862 |
aurelien |
93 |
|
| 891 |
aurelien |
94 |
$resultat_infos_complementaires = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom);
|
|
|
95 |
|
|
|
96 |
// Nom retenu, Num Nomen nom retenu, Num Taxon, Famille
|
|
|
97 |
$value=array('Nom_Retenu'=>"",'Num_Nom_Retenu'=>"0",'Num_Taxon'=>"0",'Famille'=>"");
|
|
|
98 |
|
|
|
99 |
if (is_array($resultat_infos_complementaires)) {
|
| 897 |
aurelien |
100 |
foreach ($resultat_infos_complementaires as $row) {
|
| 891 |
aurelien |
101 |
$fam=$this->rechercherFamille($row['esn_id_taxon']);
|
|
|
102 |
while (($fam['en_ce_rang']!='fin') && ($fam['en_ce_rang'] !=120)) {
|
|
|
103 |
$fam=$this->rechercherFamille($fam['etr_id_taxon_2']);
|
|
|
104 |
}
|
|
|
105 |
if ($fam['en_ce_rang']==120) {
|
|
|
106 |
$famille=$fam['en_nom_supra_generique'];
|
|
|
107 |
}
|
|
|
108 |
else {
|
|
|
109 |
$famille="Famille inconnue";
|
|
|
110 |
}
|
|
|
111 |
$value=array('Nom_Retenu'=>$this->formaterNom($row),'Num_Nom_Retenu'=>$row['esn_id_nom'],'Num_Taxon'=>$row['esn_id_taxon'],'Famille'=>$famille);
|
|
|
112 |
}
|
|
|
113 |
}
|
|
|
114 |
|
|
|
115 |
return $value;
|
|
|
116 |
|
|
|
117 |
}
|
|
|
118 |
|
|
|
119 |
public function effectuerRequeteInfosComplementairesEtFormaterNom($numNom) {
|
|
|
120 |
|
|
|
121 |
$resultat_infos_complementaires = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom);
|
|
|
122 |
|
|
|
123 |
$retour_infos_complementaires = array();
|
|
|
124 |
foreach ($resultat_infos_complementaires as $info) {
|
|
|
125 |
$retour_infos_complementaires=array(($this->formaterNom($info)));
|
|
|
126 |
}
|
|
|
127 |
|
|
|
128 |
return $retour_infos_complementaires;
|
|
|
129 |
}
|
|
|
130 |
|
|
|
131 |
public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom) {
|
|
|
132 |
|
| 867 |
aurelien |
133 |
$requete_infos_complementaires = "SELECT DISTINCT en_nom_genre, en_epithete_espece, en_nom_supra_generique, en_epithete_infra_generique,".
|
| 862 |
aurelien |
134 |
" auteur_bex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio_ex ".
|
|
|
135 |
" , auteur_b.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio ".
|
|
|
136 |
" , auteur_mex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif_ex ".
|
|
|
137 |
" , auteur_m.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif ".
|
|
|
138 |
" , en_epithete_espece, en_epithete_infra_specifique, enrg_abreviation_rang, b.esn_id_taxon, b.esn_id_nom" .
|
|
|
139 |
" FROM eflore_nom, eflore_nom_rang," .
|
|
|
140 |
" eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_bex ".
|
|
|
141 |
" , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_b ".
|
|
|
142 |
" , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_mex ".
|
|
|
143 |
" , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_m ".
|
|
|
144 |
" ,eflore_selection_nom a, eflore_selection_nom b".
|
| 891 |
aurelien |
145 |
" WHERE a.esn_id_nom= ".$this->proteger($numNom).
|
| 862 |
aurelien |
146 |
" AND a.esn_id_version_projet_taxon = 25 ".
|
|
|
147 |
" AND a.esn_id_taxon=b.esn_id_taxon ".
|
|
|
148 |
" AND b.esn_ce_statut=3 ".
|
|
|
149 |
" AND a.esn_id_version_projet_taxon=b.esn_id_version_projet_taxon" .
|
|
|
150 |
" AND en_ce_rang = enrg_id_rang" .
|
|
|
151 |
" AND en_id_nom = b.esn_id_nom" .
|
|
|
152 |
" AND en_ce_auteur_basio_ex = auteur_bex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
|
|
|
153 |
" AND en_ce_auteur_basio = auteur_b.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
|
|
|
154 |
" AND en_ce_auteur_modif_ex = auteur_mex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
|
|
|
155 |
" AND en_ce_auteur_modif = auteur_m.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
|
|
|
156 |
" AND a.esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom ";
|
|
|
157 |
|
| 891 |
aurelien |
158 |
|
| 867 |
aurelien |
159 |
$resultat_infos_complementaires = $this->requeter($requete_infos_complementaires);
|
| 891 |
aurelien |
160 |
|
|
|
161 |
return $resultat_infos_complementaires;
|
| 862 |
aurelien |
162 |
}
|
|
|
163 |
|
| 1318 |
aurelien |
164 |
public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumTax($numTax) {
|
|
|
165 |
|
|
|
166 |
$requete_infos_complementaires = "SELECT DISTINCT en_nom_genre, en_epithete_espece, en_nom_supra_generique, en_epithete_infra_generique,".
|
|
|
167 |
" auteur_bex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio_ex ".
|
|
|
168 |
" , auteur_b.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio ".
|
|
|
169 |
" , auteur_mex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif_ex ".
|
|
|
170 |
" , auteur_m.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif ".
|
|
|
171 |
" , en_epithete_espece, en_epithete_infra_specifique, enrg_abreviation_rang, en_id_nom" .
|
|
|
172 |
" FROM eflore_nom, eflore_nom_rang," .
|
|
|
173 |
" eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_bex ".
|
|
|
174 |
" , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_b ".
|
|
|
175 |
" , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_mex ".
|
|
|
176 |
" , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_m ".
|
|
|
177 |
" , eflore_selection_nom ".
|
|
|
178 |
" WHERE esn_id_taxon = '".$numTax. "'".
|
|
|
179 |
" AND esn_id_version_projet_taxon = 25 ".
|
|
|
180 |
" AND esn_ce_statut=3 ".
|
|
|
181 |
" AND en_id_nom = esn_id_nom" .
|
|
|
182 |
" AND en_ce_rang = enrg_id_rang" .
|
|
|
183 |
" AND en_ce_auteur_basio_ex = auteur_bex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
|
|
|
184 |
" AND en_ce_auteur_basio = auteur_b.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
|
|
|
185 |
" AND en_ce_auteur_modif_ex = auteur_mex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
|
|
|
186 |
" AND en_ce_auteur_modif = auteur_m.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
|
|
|
187 |
" AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom ";
|
|
|
188 |
|
|
|
189 |
$resultat_infos_complementaires = $this->requeter($requete_infos_complementaires);
|
|
|
190 |
|
|
|
191 |
return $resultat_infos_complementaires;
|
|
|
192 |
}
|
|
|
193 |
|
| 891 |
aurelien |
194 |
public function rechercherInformationsComplementairesSurNom($nom_saisi) {
|
| 867 |
aurelien |
195 |
|
| 862 |
aurelien |
196 |
$value = array();
|
|
|
197 |
|
| 897 |
aurelien |
198 |
if ($nom_saisi != null && $nom_saisi != "") {
|
| 862 |
aurelien |
199 |
|
| 920 |
aurelien |
200 |
$requete_infos_comp_sur_nom = 'SELECT * FROM eflore_nom_intitule '.
|
| 862 |
aurelien |
201 |
'WHERE eni_id_categorie_format = 3 AND '.
|
|
|
202 |
'eni_id_version_projet_nom = 25 AND '.
|
|
|
203 |
'(eni_id_valeur_format = 3 OR eni_id_valeur_format = 4) AND '.
|
|
|
204 |
'eni_intitule_nom LIKE "'.$nom_saisi.'%" '.
|
|
|
205 |
'ORDER BY LENGTH(eni_intitule_nom)';
|
|
|
206 |
|
| 920 |
aurelien |
207 |
$resultat_infos_comp_sur_nom = $this->requeter($requete_infos_comp_sur_nom);
|
| 862 |
aurelien |
208 |
|
| 867 |
aurelien |
209 |
if (is_array($resultat_infos_comp_sur_nom)) {
|
|
|
210 |
foreach ($resultat_infos_comp_sur_nom as $ligne) {
|
|
|
211 |
$value[]=array($ligne['eni_id_nom'], $ligne['eni_intitule_nom']);
|
|
|
212 |
}
|
| 862 |
aurelien |
213 |
}
|
|
|
214 |
}
|
|
|
215 |
|
|
|
216 |
return $value;
|
|
|
217 |
}
|
|
|
218 |
|
| 891 |
aurelien |
219 |
public function rechercherFamille($taxon) {
|
| 862 |
aurelien |
220 |
|
| 897 |
aurelien |
221 |
$row = array();
|
| 862 |
aurelien |
222 |
|
| 867 |
aurelien |
223 |
$requete_famille = "SELECT DISTINCT en_ce_rang, etr_id_taxon_2, en_id_nom, en_nom_supra_generique ".
|
| 891 |
aurelien |
224 |
" FROM eflore_taxon_relation, ".
|
|
|
225 |
" eflore_selection_nom, ".
|
|
|
226 |
" eflore_nom ".
|
| 862 |
aurelien |
227 |
" WHERE etr_id_taxon_1 = ".$taxon.
|
|
|
228 |
" AND etr_id_version_projet_taxon_1 = 25 ".
|
|
|
229 |
" AND etr_id_categorie_taxon = 3 ".
|
|
|
230 |
" AND etr_id_valeur_taxon = 3 ".
|
|
|
231 |
" AND esn_id_taxon = etr_id_taxon_2 ".
|
|
|
232 |
" AND esn_ce_statut = 3 ".
|
|
|
233 |
" AND esn_id_version_projet_taxon = etr_id_version_projet_taxon_1 ".
|
|
|
234 |
" AND en_id_nom = esn_id_nom ".
|
|
|
235 |
" AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom ";
|
| 1294 |
aurelien |
236 |
|
|
|
237 |
$resultat_recherche_famille = $this->requeter($requete_famille);
|
| 867 |
aurelien |
238 |
|
|
|
239 |
if (!is_array($resultat_recherche_famille) || count($resultat_recherche_famille) == 0) {
|
| 1294 |
aurelien |
240 |
$resultat_recherche_famille = array('en_ce_rang' => 'fin');
|
|
|
241 |
} else {
|
|
|
242 |
$resultat_recherche_famille = $resultat_recherche_famille[0];
|
| 862 |
aurelien |
243 |
}
|
|
|
244 |
|
| 1294 |
aurelien |
245 |
return $resultat_recherche_famille;
|
| 862 |
aurelien |
246 |
}
|
| 891 |
aurelien |
247 |
|
|
|
248 |
public function rechercherNumTaxSurNumNom($num_nom) {
|
|
|
249 |
|
|
|
250 |
$requete_num_tax = "SELECT DISTINCT b.esn_id_taxon FROM eflore_nom, eflore_nom_rang," .
|
|
|
251 |
" eflore_selection_nom a, eflore_selection_nom b".
|
|
|
252 |
" WHERE a.esn_id_nom= ".$this->proteger($num_nom).
|
|
|
253 |
" AND a.esn_id_version_projet_taxon = 25 ".
|
|
|
254 |
" AND a.esn_id_taxon=b.esn_id_taxon ".
|
|
|
255 |
" AND b.esn_ce_statut=3 ".
|
|
|
256 |
" AND a.esn_id_version_projet_taxon=b.esn_id_version_projet_taxon" .
|
|
|
257 |
" AND en_ce_rang = enrg_id_rang" .
|
|
|
258 |
" AND en_id_nom = b.esn_id_nom" .
|
|
|
259 |
" AND a.esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom ";
|
|
|
260 |
|
|
|
261 |
$res_num_nom = $this->requeter($requete_num_tax);
|
|
|
262 |
|
|
|
263 |
$nt = null;
|
| 897 |
aurelien |
264 |
if (is_array($res_num_nom) && count($res_num_nom) > 0) {
|
| 891 |
aurelien |
265 |
$nt=$res_num_nom[0]['esn_id_taxon'];
|
|
|
266 |
}
|
|
|
267 |
|
|
|
268 |
return $nt;
|
|
|
269 |
}
|
|
|
270 |
|
| 906 |
aurelien |
271 |
public function taxonEstPresentDansDepartement($num_taxon,$code_departement) {
|
|
|
272 |
|
|
|
273 |
$requete_presence_taxon = "SELECT ecd_ce_taxon FROM eflore_zg, eflore_chorologie_donnee ".
|
|
|
274 |
"WHERE ecd_ce_taxon = ".$this->proteger($num_taxon)." ".
|
|
|
275 |
"AND ezg_code=".$this->proteger($code_departement)." ".
|
|
|
276 |
"AND ecd_ce_zone_geo = ezg_id_zone_geo ".
|
|
|
277 |
"AND ezg_id_projet_zg = ecd_ce_version_projet_zg ".
|
|
|
278 |
"AND ecd_ce_version_projet_taxon=25";
|
|
|
279 |
|
|
|
280 |
$resultat_presence_taxon = $this->requeter($requete_presence_taxon);
|
|
|
281 |
|
|
|
282 |
$presence_taxon = (is_array($resultat_presence_taxon) && count($resultat_presence_taxon) > 0);
|
|
|
283 |
|
|
|
284 |
return $presence_taxon;
|
|
|
285 |
}
|
|
|
286 |
|
| 1318 |
aurelien |
287 |
private function decouperNomEtRechercheEspeceOuSousEspece($identifiant_espece) {
|
|
|
288 |
$nameparser=new NameParser();
|
|
|
289 |
$nom_latin_decoupe=$nameparser->parse($identifiant_espece);
|
|
|
290 |
|
|
|
291 |
// requete sous espece (on privilegie les noms retenu cf tri par esn_ce_statut)
|
|
|
292 |
if (isset($nom_latin_decoupe['infra']) && $nom_latin_decoupe['infra']!="") {
|
|
|
293 |
$requete="SELECT DISTINCT en_id_nom, esn_ce_statut" .
|
|
|
294 |
" FROM eflore_nom, eflore_nom_rang, eflore_selection_nom " .
|
|
|
295 |
" WHERE en_id_version_projet_nom = '25' AND en_nom_genre = '".$this->proteger($nom_latin_decoupe['genus'])."' " .
|
|
|
296 |
" AND enrg_abreviation_rang = '".$this->proteger($nom_latin_decoupe['infra_type'])."' " .
|
|
|
297 |
" AND en_epithete_infra_specifique = '".$this->proteger($nom_latin_decoupe['infra'])."' " .
|
|
|
298 |
" AND esn_id_nom= en_id_nom ".
|
|
|
299 |
" AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom " .
|
|
|
300 |
" AND en_epithete_espece = '".$this->proteger($nom_latin_decoupe['species'])."' AND en_ce_rang = enrg_id_rang " .
|
|
|
301 |
" ORDER BY esn_ce_statut ".
|
|
|
302 |
" LIMIT 1";
|
|
|
303 |
}
|
|
|
304 |
else { // espece (on privilegie les noms retenu cf tri par esn_ce_statut)
|
|
|
305 |
$requete="SELECT DISTINCT en_id_nom, esn_ce_statut" .
|
|
|
306 |
" FROM eflore_nom, eflore_nom_rang, eflore_selection_nom " .
|
|
|
307 |
" WHERE en_id_version_projet_nom = '25' AND en_nom_genre = '".$this->proteger($nom_latin_decoupe['genus'])."' " .
|
|
|
308 |
" AND enrg_abreviation_rang = 'sp.' " .
|
|
|
309 |
" AND esn_id_nom= en_id_nom ".
|
|
|
310 |
" AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom " .
|
|
|
311 |
" AND en_epithete_espece = '".$this->proteger($nom_latin_decoupe['species'])."' AND en_ce_rang = enrg_id_rang " .
|
|
|
312 |
" ORDER BY esn_ce_statut ".
|
|
|
313 |
" LIMIT 1";
|
|
|
314 |
|
|
|
315 |
}
|
|
|
316 |
|
|
|
317 |
$resultat = $this->requeter($requete);
|
|
|
318 |
|
|
|
319 |
$retour = array();
|
|
|
320 |
if (is_array($resultat) && count($resultat) > 0) {
|
|
|
321 |
$retour = $resultat[0];
|
|
|
322 |
}
|
|
|
323 |
|
|
|
324 |
return $resultat;
|
|
|
325 |
}
|
|
|
326 |
|
| 891 |
aurelien |
327 |
private function formaterNom($rawnom) {
|
| 862 |
aurelien |
328 |
|
| 891 |
aurelien |
329 |
// Constitution du nom:
|
|
|
330 |
$nom = '';
|
| 862 |
aurelien |
331 |
|
| 995 |
aurelien |
332 |
if (isset($rawnom['en_nom_supra_generique']) && $rawnom['en_nom_supra_generique'] != '') {
|
| 891 |
aurelien |
333 |
$nom .= $rawnom['en_nom_supra_generique'];
|
| 995 |
aurelien |
334 |
} else if (isset($rawnom['en_epithete_infra_generique']) && $rawnom['en_epithete_infra_generique'] != '') {
|
| 891 |
aurelien |
335 |
$nom .= $rawnom['en_epithete_infra_generique'];
|
|
|
336 |
} else {
|
| 995 |
aurelien |
337 |
if (isset($rawnom['en_nom_genre']) && $rawnom['en_nom_genre'] != '') {
|
| 891 |
aurelien |
338 |
$nom .= $rawnom['en_nom_genre'];
|
|
|
339 |
}
|
| 995 |
aurelien |
340 |
if (isset($rawnom['en_epithete_espece']) && $rawnom['en_epithete_espece']!= '') {
|
| 891 |
aurelien |
341 |
$nom .= ' '.$rawnom['en_epithete_espece'];
|
|
|
342 |
}
|
| 995 |
aurelien |
343 |
if (isset($rawnom['en_epithete_infra_specifique']) && $rawnom['en_epithete_infra_specifique'] != '') {
|
| 891 |
aurelien |
344 |
if (!empty($rawnom['enrg_abreviation_rang'])) {
|
|
|
345 |
$nom .= ' '.$rawnom['enrg_abreviation_rang'].'';
|
|
|
346 |
}
|
|
|
347 |
$nom .= ' '.$rawnom['en_epithete_infra_specifique'];
|
|
|
348 |
}
|
|
|
349 |
}
|
| 862 |
aurelien |
350 |
|
| 891 |
aurelien |
351 |
return $nom.$this->retournerAuteur($rawnom) ;
|
|
|
352 |
}
|
|
|
353 |
|
|
|
354 |
private function retournerAuteur($rawnom) {
|
| 862 |
aurelien |
355 |
$auteurs = '';
|
|
|
356 |
$auteur_basio = '';
|
|
|
357 |
$auteur_modif = '';
|
|
|
358 |
if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_basio_ex']) && $rawnom['abreviation_auteur_basio_ex']!='-' ) {
|
|
|
359 |
$auteur_basio .= $rawnom['abreviation_auteur_basio_ex'];
|
|
|
360 |
if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_basio']) && $rawnom['abreviation_auteur_basio']!='-') {
|
|
|
361 |
$auteur_basio .= ' ex '.$rawnom['abreviation_auteur_basio'];
|
|
|
362 |
}
|
|
|
363 |
} else if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_basio']) && $rawnom['abreviation_auteur_basio']!='-') {
|
|
|
364 |
$auteur_basio .= $rawnom['abreviation_auteur_basio'];
|
|
|
365 |
}
|
|
|
366 |
|
|
|
367 |
if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_modif_ex']) && $rawnom['abreviation_auteur_modif_ex']!='-') {
|
|
|
368 |
$auteur_modif .= $rawnom['abreviation_auteur_modif_ex'];
|
|
|
369 |
if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_modif']) && $rawnom['abreviation_auteur_modif']!='-') {
|
|
|
370 |
$auteur_modif .= ' ex '.$rawnom['abreviation_auteur_modif'];
|
|
|
371 |
}
|
|
|
372 |
} else if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_modif']) && $rawnom['abreviation_auteur_modif']!='-') {
|
|
|
373 |
$auteur_modif .= $rawnom['abreviation_auteur_modif'];
|
|
|
374 |
}
|
|
|
375 |
|
|
|
376 |
if (!empty($auteur_modif)) {
|
|
|
377 |
$auteurs = ' ('.$auteur_basio.') '.$auteur_modif;
|
|
|
378 |
} elseif (!empty($auteur_basio)) {
|
|
|
379 |
$auteurs = ' '.$auteur_basio;
|
|
|
380 |
}
|
|
|
381 |
|
|
|
382 |
return $auteurs ;
|
|
|
383 |
}
|
| 1318 |
aurelien |
384 |
|
|
|
385 |
function rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax($identifiant_espece) {
|
|
|
386 |
// texte libre, nom scientifique,
|
|
|
387 |
// ou code nomenclatural (format BDNFFnn999999)
|
|
|
388 |
// ou code taxonomique (format BDNFFnt999999)
|
|
|
389 |
$identifiant_espece=trim($identifiant_espece);
|
|
|
390 |
$identifiant_espece=utf8_encode($identifiant_espece);
|
|
|
391 |
|
|
|
392 |
$retour = array();
|
|
|
393 |
|
|
|
394 |
preg_match('/BDNFFnn([0-9][0-9]*)/',$identifiant_espece, $elements);
|
|
|
395 |
if (isset($elements[1])) {
|
|
|
396 |
// Numero nomenclatural
|
|
|
397 |
$infos_taxon = $this->rechercherInformationsComplementairesSurNumNom($elements[1]);
|
|
|
398 |
$retour = array("nom_sel" => $this->formaterNom($infos_taxon), "en_id_nom" => $elements[1]);
|
|
|
399 |
} else {
|
|
|
400 |
// Numero taxonomique ou nom scientifique
|
|
|
401 |
preg_match('/BDNFFnt([0-9][0-9]*)/', $identifiant_espece, $elements);
|
|
|
402 |
|
|
|
403 |
if (isset($elements[1])) {
|
|
|
404 |
// Numero taxonomique
|
|
|
405 |
$infos_taxon = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumTax($elements[1]);
|
|
|
406 |
$retour = array("nom_sel" => $this->formaterNom($infos_taxon), "en_id_nom" => $infos_taxon['en_id_nom']);
|
|
|
407 |
} else {
|
|
|
408 |
// Nom scientifique
|
|
|
409 |
$id_nom = $this->decouperNomEtRechercheEspeceOuSousEspece($identifiant_espece);
|
|
|
410 |
// Recherche du nom associe
|
|
|
411 |
$infos_nom = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($id_nom['en_id_nom']);
|
|
|
412 |
if (is_array($infos_nom) && !empty($infos_nom)) {
|
|
|
413 |
$retour = array("nom_sel" => $this->formaterNom($infos_nom), "en_id_nom" => $id_nom['en_id_nom']);
|
|
|
414 |
} else {
|
|
|
415 |
$retour = array("nom_sel" => $identifiant_espece);
|
|
|
416 |
}
|
|
|
417 |
}
|
|
|
418 |
}
|
|
|
419 |
return $retour;
|
|
|
420 |
}
|
| 862 |
aurelien |
421 |
}
|
|
|
422 |
?>
|