862 |
aurelien |
1 |
<?php
|
867 |
aurelien |
2 |
/**
|
|
|
3 |
* PHP Version 5
|
|
|
4 |
*
|
|
|
5 |
* @category PHP
|
|
|
6 |
* @package jrest
|
897 |
aurelien |
7 |
* @author David Delon <david@tela-botania.org>
|
|
|
8 |
* @author Aurélien Peronnet <aurelien@tela-botania.org>
|
867 |
aurelien |
9 |
* @copyright 2010 Tela-Botanica
|
|
|
10 |
* @license http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
|
|
|
11 |
* @version SVN: <svn_id>
|
|
|
12 |
* @link /doc/jrest/
|
|
|
13 |
*/
|
891 |
aurelien |
14 |
|
|
|
15 |
/**
|
|
|
16 |
*
|
|
|
17 |
* Classe de recherche d'informations sur un taxon donné
|
|
|
18 |
* lors de l'évolution d'eflore, devrait être remplacée par
|
|
|
19 |
* un appel aux nouveaux web services
|
|
|
20 |
*/
|
862 |
aurelien |
21 |
class RechercheInfosTaxon extends Cel {
|
891 |
aurelien |
22 |
|
|
|
23 |
public function RechercheInfosTaxon($config) {
|
|
|
24 |
|
897 |
aurelien |
25 |
parent::__construct($config);
|
891 |
aurelien |
26 |
// Connection à la base de données spécifique eflore
|
897 |
aurelien |
27 |
$this->bdd = $this->connecterPDO($this->config, 'eflore');
|
891 |
aurelien |
28 |
}
|
|
|
29 |
|
|
|
30 |
public function rechercherGenreEspeceSurPrefixe($genre = null, $espece = null) {
|
|
|
31 |
|
|
|
32 |
$liste_genre_espece = array();
|
|
|
33 |
|
|
|
34 |
$requete_recherche = '';
|
|
|
35 |
// Genre et Espece
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|
|
36 |
if ($espece != null && $genre != null) {
|
|
|
37 |
if (strlen($espece) > 0 ) {
|
|
|
38 |
$espece=ereg_replace('\*+','%',$espece);
|
|
|
39 |
$requete_recherche = "SELECT DISTINCT en_nom_genre, en_epithete_espece, en_nom_supra_generique, en_epithete_infra_generique,".
|
|
|
40 |
" auteur_bex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio_ex ".
|
|
|
41 |
" , auteur_b.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio ".
|
|
|
42 |
" , auteur_mex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif_ex ".
|
|
|
43 |
" , auteur_m.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif ".
|
|
|
44 |
" , en_epithete_espece, en_epithete_infra_specifique, enrg_abreviation_rang, en_id_nom, esn_ce_statut" .
|
|
|
45 |
" FROM eflore_nom, eflore_nom_rang, " .
|
|
|
46 |
" eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_bex ".
|
|
|
47 |
" , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_b ".
|
|
|
48 |
" , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_mex ".
|
|
|
49 |
" , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_m ".
|
|
|
50 |
" , eflore_selection_nom".
|
|
|
51 |
" WHERE en_id_version_projet_nom = '25' AND en_nom_genre LIKE ".$this->proteger($genre.'%').
|
|
|
52 |
" AND en_ce_rang > 160 " .
|
|
|
53 |
" AND en_epithete_espece like ".$this->proteger($espece.'%')." AND en_ce_rang = enrg_id_rang " .
|
|
|
54 |
" AND en_ce_auteur_basio_ex = auteur_bex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
|
|
|
55 |
" AND en_ce_auteur_basio = auteur_b.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
|
|
|
56 |
" AND en_ce_auteur_modif_ex = auteur_mex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
|
|
|
57 |
" AND en_ce_auteur_modif = auteur_m.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
|
|
|
58 |
" AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom " .
|
|
|
59 |
" AND esn_id_nom= en_id_nom ".
|
|
|
60 |
" ORDER BY esn_ce_statut, en_ce_rang, en_epithete_espece, en_nom_genre LIMIT 50";
|
|
|
61 |
}
|
|
|
62 |
}
|
|
|
63 |
else {
|
|
|
64 |
if ($genre != null) {
|
|
|
65 |
$genre=ereg_replace('\*+','%',$genre);
|
|
|
66 |
//TODO: comprendre pourquoi à l'origine il y avait : (strlen($genre) >= 1) /*&& ($genre != '%')
|
906 |
aurelien |
67 |
// voir avec david
|
891 |
aurelien |
68 |
if ((strlen($genre) >= 1)) {
|
|
|
69 |
$requete_recherche = "SELECT DISTINCT en_nom_genre, en_id_nom, 0 as esn_ce_statut FROM eflore_nom WHERE en_id_version_projet_nom = '25'" .
|
|
|
70 |
"AND en_ce_rang = 160 " .
|
|
|
71 |
"AND en_nom_genre LIKE ".$this->proteger($genre.'%')." ORDER BY esn_ce_statut, en_nom_genre LIMIT 50";
|
|
|
72 |
}
|
|
|
73 |
}
|
|
|
74 |
}
|
|
|
75 |
|
897 |
aurelien |
76 |
if ($requete_recherche != '') {
|
891 |
aurelien |
77 |
$resultat_recherche = $this->requeter($requete_recherche);
|
|
|
78 |
|
|
|
79 |
if (is_array($resultat_recherche)) {
|
897 |
aurelien |
80 |
foreach ($resultat_recherche as $ligne) {
|
891 |
aurelien |
81 |
$liste_genre_espece[] = array($this->formaterNom($ligne),
|
|
|
82 |
$ligne['en_id_nom'],
|
|
|
83 |
$ligne['esn_ce_statut']
|
|
|
84 |
);
|
|
|
85 |
}
|
|
|
86 |
}
|
|
|
87 |
}
|
|
|
88 |
|
|
|
89 |
return $liste_genre_espece;
|
|
|
90 |
}
|
862 |
aurelien |
91 |
|
891 |
aurelien |
92 |
function rechercherInformationsComplementairesSurNumNom($numNom) {
|
862 |
aurelien |
93 |
|
891 |
aurelien |
94 |
$resultat_infos_complementaires = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom);
|
|
|
95 |
|
|
|
96 |
// Nom retenu, Num Nomen nom retenu, Num Taxon, Famille
|
|
|
97 |
$value=array('Nom_Retenu'=>"",'Num_Nom_Retenu'=>"0",'Num_Taxon'=>"0",'Famille'=>"");
|
|
|
98 |
|
|
|
99 |
if (is_array($resultat_infos_complementaires)) {
|
897 |
aurelien |
100 |
foreach ($resultat_infos_complementaires as $row) {
|
891 |
aurelien |
101 |
$fam=$this->rechercherFamille($row['esn_id_taxon']);
|
|
|
102 |
while (($fam['en_ce_rang']!='fin') && ($fam['en_ce_rang'] !=120)) {
|
|
|
103 |
$fam=$this->rechercherFamille($fam['etr_id_taxon_2']);
|
|
|
104 |
}
|
|
|
105 |
if ($fam['en_ce_rang']==120) {
|
|
|
106 |
$famille=$fam['en_nom_supra_generique'];
|
|
|
107 |
}
|
|
|
108 |
else {
|
|
|
109 |
$famille="Famille inconnue";
|
|
|
110 |
}
|
|
|
111 |
$value=array('Nom_Retenu'=>$this->formaterNom($row),'Num_Nom_Retenu'=>$row['esn_id_nom'],'Num_Taxon'=>$row['esn_id_taxon'],'Famille'=>$famille);
|
|
|
112 |
}
|
|
|
113 |
}
|
|
|
114 |
|
|
|
115 |
return $value;
|
|
|
116 |
|
|
|
117 |
}
|
|
|
118 |
|
|
|
119 |
public function effectuerRequeteInfosComplementairesEtFormaterNom($numNom) {
|
|
|
120 |
|
|
|
121 |
$resultat_infos_complementaires = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom);
|
|
|
122 |
|
|
|
123 |
$retour_infos_complementaires = array();
|
|
|
124 |
foreach ($resultat_infos_complementaires as $info) {
|
|
|
125 |
$retour_infos_complementaires=array(($this->formaterNom($info)));
|
|
|
126 |
}
|
|
|
127 |
|
|
|
128 |
return $retour_infos_complementaires;
|
|
|
129 |
}
|
|
|
130 |
|
|
|
131 |
public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom) {
|
|
|
132 |
|
867 |
aurelien |
133 |
$requete_infos_complementaires = "SELECT DISTINCT en_nom_genre, en_epithete_espece, en_nom_supra_generique, en_epithete_infra_generique,".
|
862 |
aurelien |
134 |
" auteur_bex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio_ex ".
|
|
|
135 |
" , auteur_b.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio ".
|
|
|
136 |
" , auteur_mex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif_ex ".
|
|
|
137 |
" , auteur_m.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif ".
|
|
|
138 |
" , en_epithete_espece, en_epithete_infra_specifique, enrg_abreviation_rang, b.esn_id_taxon, b.esn_id_nom" .
|
|
|
139 |
" FROM eflore_nom, eflore_nom_rang," .
|
|
|
140 |
" eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_bex ".
|
|
|
141 |
" , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_b ".
|
|
|
142 |
" , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_mex ".
|
|
|
143 |
" , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_m ".
|
|
|
144 |
" ,eflore_selection_nom a, eflore_selection_nom b".
|
891 |
aurelien |
145 |
" WHERE a.esn_id_nom= ".$this->proteger($numNom).
|
862 |
aurelien |
146 |
" AND a.esn_id_version_projet_taxon = 25 ".
|
|
|
147 |
" AND a.esn_id_taxon=b.esn_id_taxon ".
|
|
|
148 |
" AND b.esn_ce_statut=3 ".
|
|
|
149 |
" AND a.esn_id_version_projet_taxon=b.esn_id_version_projet_taxon" .
|
|
|
150 |
" AND en_ce_rang = enrg_id_rang" .
|
|
|
151 |
" AND en_id_nom = b.esn_id_nom" .
|
|
|
152 |
" AND en_ce_auteur_basio_ex = auteur_bex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
|
|
|
153 |
" AND en_ce_auteur_basio = auteur_b.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
|
|
|
154 |
" AND en_ce_auteur_modif_ex = auteur_mex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
|
|
|
155 |
" AND en_ce_auteur_modif = auteur_m.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
|
|
|
156 |
" AND a.esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom ";
|
|
|
157 |
|
891 |
aurelien |
158 |
|
867 |
aurelien |
159 |
$resultat_infos_complementaires = $this->requeter($requete_infos_complementaires);
|
891 |
aurelien |
160 |
|
|
|
161 |
return $resultat_infos_complementaires;
|
862 |
aurelien |
162 |
}
|
|
|
163 |
|
891 |
aurelien |
164 |
public function rechercherInformationsComplementairesSurNom($nom_saisi) {
|
867 |
aurelien |
165 |
|
862 |
aurelien |
166 |
$value = array();
|
|
|
167 |
|
897 |
aurelien |
168 |
if ($nom_saisi != null && $nom_saisi != "") {
|
862 |
aurelien |
169 |
|
891 |
aurelien |
170 |
$requete_infos_comp_sur_nom = 'SELECT * FROM '.$this->config['cel_db']['bdd_eflore'].'.eflore_nom_intitule '.
|
862 |
aurelien |
171 |
'WHERE eni_id_categorie_format = 3 AND '.
|
|
|
172 |
'eni_id_version_projet_nom = 25 AND '.
|
|
|
173 |
'(eni_id_valeur_format = 3 OR eni_id_valeur_format = 4) AND '.
|
|
|
174 |
'eni_intitule_nom LIKE "'.$nom_saisi.'%" '.
|
|
|
175 |
'ORDER BY LENGTH(eni_intitule_nom)';
|
|
|
176 |
|
867 |
aurelien |
177 |
$resultat_infos_comp_sur_nom = $this->executer($requete_infos_comp_sur_nom);
|
862 |
aurelien |
178 |
|
867 |
aurelien |
179 |
if (is_array($resultat_infos_comp_sur_nom)) {
|
|
|
180 |
foreach ($resultat_infos_comp_sur_nom as $ligne) {
|
|
|
181 |
$value[]=array($ligne['eni_id_nom'], $ligne['eni_intitule_nom']);
|
|
|
182 |
}
|
862 |
aurelien |
183 |
}
|
|
|
184 |
}
|
|
|
185 |
|
|
|
186 |
return $value;
|
|
|
187 |
}
|
|
|
188 |
|
891 |
aurelien |
189 |
public function rechercherFamille($taxon) {
|
862 |
aurelien |
190 |
|
897 |
aurelien |
191 |
$row = array();
|
862 |
aurelien |
192 |
|
867 |
aurelien |
193 |
$requete_famille = "SELECT DISTINCT en_ce_rang, etr_id_taxon_2, en_id_nom, en_nom_supra_generique ".
|
891 |
aurelien |
194 |
" FROM eflore_taxon_relation, ".
|
|
|
195 |
" eflore_selection_nom, ".
|
|
|
196 |
" eflore_nom ".
|
862 |
aurelien |
197 |
" WHERE etr_id_taxon_1 = ".$taxon.
|
|
|
198 |
" AND etr_id_version_projet_taxon_1 = 25 ".
|
|
|
199 |
" AND etr_id_categorie_taxon = 3 ".
|
|
|
200 |
" AND etr_id_valeur_taxon = 3 ".
|
|
|
201 |
" AND esn_id_taxon = etr_id_taxon_2 ".
|
|
|
202 |
" AND esn_ce_statut = 3 ".
|
|
|
203 |
" AND esn_id_version_projet_taxon = etr_id_version_projet_taxon_1 ".
|
|
|
204 |
" AND en_id_nom = esn_id_nom ".
|
|
|
205 |
" AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom ";
|
867 |
aurelien |
206 |
|
|
|
207 |
$resultat_recherche_famille = $this->requeter($requete_famille);
|
862 |
aurelien |
208 |
|
867 |
aurelien |
209 |
if (!is_array($resultat_recherche_famille) || count($resultat_recherche_famille) == 0) {
|
862 |
aurelien |
210 |
$row['en_ce_rang']='fin';
|
|
|
211 |
}
|
|
|
212 |
|
867 |
aurelien |
213 |
return $row;
|
862 |
aurelien |
214 |
}
|
891 |
aurelien |
215 |
|
|
|
216 |
public function rechercherNumTaxSurNumNom($num_nom) {
|
|
|
217 |
|
|
|
218 |
$requete_num_tax = "SELECT DISTINCT b.esn_id_taxon FROM eflore_nom, eflore_nom_rang," .
|
|
|
219 |
" eflore_selection_nom a, eflore_selection_nom b".
|
|
|
220 |
" WHERE a.esn_id_nom= ".$this->proteger($num_nom).
|
|
|
221 |
" AND a.esn_id_version_projet_taxon = 25 ".
|
|
|
222 |
" AND a.esn_id_taxon=b.esn_id_taxon ".
|
|
|
223 |
" AND b.esn_ce_statut=3 ".
|
|
|
224 |
" AND a.esn_id_version_projet_taxon=b.esn_id_version_projet_taxon" .
|
|
|
225 |
" AND en_ce_rang = enrg_id_rang" .
|
|
|
226 |
" AND en_id_nom = b.esn_id_nom" .
|
|
|
227 |
" AND a.esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom ";
|
|
|
228 |
|
|
|
229 |
$res_num_nom = $this->requeter($requete_num_tax);
|
|
|
230 |
|
|
|
231 |
$nt = null;
|
897 |
aurelien |
232 |
if (is_array($res_num_nom) && count($res_num_nom) > 0) {
|
891 |
aurelien |
233 |
$nt=$res_num_nom[0]['esn_id_taxon'];
|
|
|
234 |
}
|
|
|
235 |
|
|
|
236 |
return $nt;
|
|
|
237 |
}
|
|
|
238 |
|
906 |
aurelien |
239 |
public function taxonEstPresentDansDepartement($num_taxon,$code_departement) {
|
|
|
240 |
|
|
|
241 |
$requete_presence_taxon = "SELECT ecd_ce_taxon FROM eflore_zg, eflore_chorologie_donnee ".
|
|
|
242 |
"WHERE ecd_ce_taxon = ".$this->proteger($num_taxon)." ".
|
|
|
243 |
"AND ezg_code=".$this->proteger($code_departement)." ".
|
|
|
244 |
"AND ecd_ce_zone_geo = ezg_id_zone_geo ".
|
|
|
245 |
"AND ezg_id_projet_zg = ecd_ce_version_projet_zg ".
|
|
|
246 |
"AND ecd_ce_version_projet_taxon=25";
|
|
|
247 |
|
|
|
248 |
$resultat_presence_taxon = $this->requeter($requete_presence_taxon);
|
|
|
249 |
|
|
|
250 |
$presence_taxon = (is_array($resultat_presence_taxon) && count($resultat_presence_taxon) > 0);
|
|
|
251 |
|
|
|
252 |
return $presence_taxon;
|
|
|
253 |
}
|
|
|
254 |
|
891 |
aurelien |
255 |
private function formaterNom($rawnom) {
|
862 |
aurelien |
256 |
|
891 |
aurelien |
257 |
// Constitution du nom:
|
|
|
258 |
$nom = '';
|
862 |
aurelien |
259 |
|
891 |
aurelien |
260 |
if ($rawnom['en_nom_supra_generique'] != '') {
|
|
|
261 |
$nom .= $rawnom['en_nom_supra_generique'];
|
|
|
262 |
} else if ($rawnom['en_epithete_infra_generique'] != '') {
|
|
|
263 |
$nom .= $rawnom['en_epithete_infra_generique'];
|
|
|
264 |
} else {
|
|
|
265 |
if ($rawnom['en_nom_genre'] != '') {
|
|
|
266 |
$nom .= $rawnom['en_nom_genre'];
|
|
|
267 |
}
|
|
|
268 |
if ($rawnom['en_epithete_espece']!= '') {
|
|
|
269 |
$nom .= ' '.$rawnom['en_epithete_espece'];
|
|
|
270 |
}
|
|
|
271 |
if ($rawnom['en_epithete_infra_specifique'] != '') {
|
|
|
272 |
if (!empty($rawnom['enrg_abreviation_rang'])) {
|
|
|
273 |
$nom .= ' '.$rawnom['enrg_abreviation_rang'].'';
|
|
|
274 |
}
|
|
|
275 |
$nom .= ' '.$rawnom['en_epithete_infra_specifique'];
|
|
|
276 |
}
|
|
|
277 |
}
|
862 |
aurelien |
278 |
|
891 |
aurelien |
279 |
return $nom.$this->retournerAuteur($rawnom) ;
|
|
|
280 |
}
|
|
|
281 |
|
|
|
282 |
private function retournerAuteur($rawnom) {
|
862 |
aurelien |
283 |
$auteurs = '';
|
|
|
284 |
$auteur_basio = '';
|
|
|
285 |
$auteur_modif = '';
|
|
|
286 |
if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_basio_ex']) && $rawnom['abreviation_auteur_basio_ex']!='-' ) {
|
|
|
287 |
$auteur_basio .= $rawnom['abreviation_auteur_basio_ex'];
|
|
|
288 |
if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_basio']) && $rawnom['abreviation_auteur_basio']!='-') {
|
|
|
289 |
$auteur_basio .= ' ex '.$rawnom['abreviation_auteur_basio'];
|
|
|
290 |
}
|
|
|
291 |
} else if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_basio']) && $rawnom['abreviation_auteur_basio']!='-') {
|
|
|
292 |
$auteur_basio .= $rawnom['abreviation_auteur_basio'];
|
|
|
293 |
}
|
|
|
294 |
|
|
|
295 |
if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_modif_ex']) && $rawnom['abreviation_auteur_modif_ex']!='-') {
|
|
|
296 |
$auteur_modif .= $rawnom['abreviation_auteur_modif_ex'];
|
|
|
297 |
if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_modif']) && $rawnom['abreviation_auteur_modif']!='-') {
|
|
|
298 |
$auteur_modif .= ' ex '.$rawnom['abreviation_auteur_modif'];
|
|
|
299 |
}
|
|
|
300 |
} else if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_modif']) && $rawnom['abreviation_auteur_modif']!='-') {
|
|
|
301 |
$auteur_modif .= $rawnom['abreviation_auteur_modif'];
|
|
|
302 |
}
|
|
|
303 |
|
|
|
304 |
if (!empty($auteur_modif)) {
|
|
|
305 |
$auteurs = ' ('.$auteur_basio.') '.$auteur_modif;
|
|
|
306 |
} elseif (!empty($auteur_basio)) {
|
|
|
307 |
$auteurs = ' '.$auteur_basio;
|
|
|
308 |
}
|
|
|
309 |
|
|
|
310 |
return $auteurs ;
|
|
|
311 |
}
|
|
|
312 |
}
|
|
|
313 |
?>
|