Subversion Repositories eFlore/Applications.cel

Rev

Rev 891 | Go to most recent revision | Details | Compare with Previous | Last modification | View Log | RSS feed

Rev Author Line No. Line
862 aurelien 1 
<?php
867 aurelien 2 
/**
3 
* PHP Version 5
4 
*
5 
* @category  PHP
6 
* @package   jrest
897 aurelien 7 
* @author    David Delon <david@tela-botania.org>
8 
* @author    Aurélien Peronnet <aurelien@tela-botania.org>
867 aurelien 9 
* @copyright 2010 Tela-Botanica
10 
* @license   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
11 
* @version   SVN: <svn_id>
12 
* @link      /doc/jrest/
13 
*/
891 aurelien 14 
 
15 
/**
16 
 *
17 
 * Classe de recherche d'informations sur un taxon donné
18 
 * lors de l'évolution d'eflore, devrait être remplacée par
19 
 * un appel aux nouveaux web services
20 
 */
862 aurelien 21 
class RechercheInfosTaxon extends Cel {
891 aurelien 22 
 
23 
	public function RechercheInfosTaxon($config) {
24 
 
897 aurelien 25 
		parent::__construct($config);
891 aurelien 26 
		// Connection à la base de données spécifique eflore
897 aurelien 27 
		$this->bdd = $this->connecterPDO($this->config, 'eflore');
891 aurelien 28 
	}
29 
 
30 
	public function rechercherGenreEspeceSurPrefixe($genre = null, $espece = null) {
31 
 
32 
		$liste_genre_espece = array();
33 
 
34 
		$requete_recherche = '';
35 
		// Genre et Espece
36 
		if ($espece != null && $genre != null) {
37 
            if (strlen($espece) > 0 ) {
38 
				$espece=ereg_replace('\*+','%',$espece);
39 
    	       	$requete_recherche = "SELECT DISTINCT en_nom_genre, en_epithete_espece, en_nom_supra_generique, en_epithete_infra_generique,".
40 
    	       			"   auteur_bex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio_ex ".
41 
    	       			" , auteur_b.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio ".
42 
    	       			" , auteur_mex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif_ex ".
43 
    	       			" , auteur_m.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif ".
44 
    	       			" , en_epithete_espece, en_epithete_infra_specifique, enrg_abreviation_rang, en_id_nom, esn_ce_statut" .
45 
    	       			" FROM eflore_nom, eflore_nom_rang, " .
46 
    	       			"  	  eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_bex ".
47 
    	       			"   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_b ".
48 
    	       			"   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_mex ".
49 
    	       			"   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_m ".
50 
    	       	     	"   , eflore_selection_nom".
51 
    	       			" WHERE en_id_version_projet_nom = '25' AND en_nom_genre LIKE ".$this->proteger($genre.'%').
52 
    	       			" AND en_ce_rang > 160 " .
53 
    	       			" AND en_epithete_espece like ".$this->proteger($espece.'%')." AND en_ce_rang = enrg_id_rang " .
54 
    	       			" AND en_ce_auteur_basio_ex = auteur_bex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
55 
    	       			" AND en_ce_auteur_basio = auteur_b.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege  ".
56 
    	       			" AND en_ce_auteur_modif_ex = auteur_mex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
57 
    	       			" AND en_ce_auteur_modif = auteur_m.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
58 
    	       			" AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom " .
59 
    	       			" AND esn_id_nom= en_id_nom ".
60 
    	       			" ORDER BY esn_ce_statut, en_ce_rang, en_epithete_espece, en_nom_genre LIMIT 50";
61 
            }
62 
		}
63 
		else {
64 
			if ($genre != null) {
65 
				$genre=ereg_replace('\*+','%',$genre);
66 
				//TODO: comprendre pourquoi à l'origine il y avait : (strlen($genre) >= 1) /*&& ($genre != '%')
67 
	            if ((strlen($genre) >= 1)) {
68 
				    $requete_recherche = "SELECT DISTINCT en_nom_genre, en_id_nom, 0 as esn_ce_statut FROM  eflore_nom WHERE en_id_version_projet_nom = '25'" .
69 
				    "AND en_ce_rang = 160 " .
70 
				    "AND en_nom_genre LIKE ".$this->proteger($genre.'%')." ORDER BY esn_ce_statut, en_nom_genre LIMIT 50";
71 
	            }
72 
			}
73 
		}
74 
 
897 aurelien 75 
        if ($requete_recherche != '') {
891 aurelien 76 
        	$resultat_recherche = $this->requeter($requete_recherche);
77 
 
78 
        	if (is_array($resultat_recherche)) {
897 aurelien 79 
        		foreach ($resultat_recherche as $ligne) {
891 aurelien 80 
        			$liste_genre_espece[] = array($this->formaterNom($ligne),
81 
        										$ligne['en_id_nom'],
82 
        										$ligne['esn_ce_statut']
83 
        									);
84 
        		}
85 
        	}
86 
        }
87 
 
88 
		return $liste_genre_espece;
89 
	}
862 aurelien 90 
 
891 aurelien 91 
	function rechercherInformationsComplementairesSurNumNom($numNom) {
862 aurelien 92 
 
891 aurelien 93 
		$resultat_infos_complementaires = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom);
94 
 
95 
		// Nom retenu, Num Nomen nom retenu, Num Taxon, Famille
96 
		$value=array('Nom_Retenu'=>"",'Num_Nom_Retenu'=>"0",'Num_Taxon'=>"0",'Famille'=>"");
97 
 
98 
        if (is_array($resultat_infos_complementaires)) {
897 aurelien 99 
		    foreach ($resultat_infos_complementaires as $row) {
891 aurelien 100 
		        	$fam=$this->rechercherFamille($row['esn_id_taxon']);
101 
	        	while (($fam['en_ce_rang']!='fin') && ($fam['en_ce_rang'] !=120)) {
102 
		        	$fam=$this->rechercherFamille($fam['etr_id_taxon_2']);
103 
	        	}
104 
	        	if ($fam['en_ce_rang']==120) {
105 
	        		$famille=$fam['en_nom_supra_generique'];
106 
	        	}
107 
	        	else {
108 
	        		$famille="Famille inconnue";
109 
	        	}
110 
	        	$value=array('Nom_Retenu'=>$this->formaterNom($row),'Num_Nom_Retenu'=>$row['esn_id_nom'],'Num_Taxon'=>$row['esn_id_taxon'],'Famille'=>$famille);
111 
		    }
112 
        }
113 
 
114 
	    return $value;
115 
 
116 
	}
117 
 
118 
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesEtFormaterNom($numNom) {
119 
 
120 
		$resultat_infos_complementaires = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom);
121 
 
122 
		$retour_infos_complementaires = array();
123 
		foreach ($resultat_infos_complementaires as $info) {
124 
           $retour_infos_complementaires=array(($this->formaterNom($info)));
125 
	    }
126 
 
127 
		return $retour_infos_complementaires;
128 
	}
129 
 
130 
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom) {
131 
 
867 aurelien 132 
		$requete_infos_complementaires = "SELECT DISTINCT en_nom_genre, en_epithete_espece, en_nom_supra_generique, en_epithete_infra_generique,".
862 aurelien 133 
			     	       			"   auteur_bex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio_ex ".
134 
        	       			" , auteur_b.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio ".
135 
        	       			" , auteur_mex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif_ex ".
136 
        	       			" , auteur_m.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif ".
137 
			     " , en_epithete_espece, en_epithete_infra_specifique, enrg_abreviation_rang, b.esn_id_taxon, b.esn_id_nom" .
138 
			     " FROM eflore_nom, eflore_nom_rang," .
139 
			       			"  	  eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_bex ".
140 
        	       			"   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_b ".
141 
        	       			"   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_mex ".
142 
        	       			"   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_m ".
143 
			     " ,eflore_selection_nom a, eflore_selection_nom b".
891 aurelien 144 
			     " WHERE a.esn_id_nom= ".$this->proteger($numNom).
862 aurelien 145 
			     " AND a.esn_id_version_projet_taxon = 25 ".
146 
			     " AND a.esn_id_taxon=b.esn_id_taxon ".
147 
			     " AND b.esn_ce_statut=3 ".
148 
			     " AND a.esn_id_version_projet_taxon=b.esn_id_version_projet_taxon" .
149 
			     " AND en_ce_rang = enrg_id_rang" .
150 
			     " AND en_id_nom = b.esn_id_nom" .
151 
			     " AND en_ce_auteur_basio_ex = auteur_bex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
152 
       			 " AND en_ce_auteur_basio = auteur_b.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege  ".
153 
       			 " AND en_ce_auteur_modif_ex = auteur_mex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
154 
        	     " AND en_ce_auteur_modif = auteur_m.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
155 
			     " AND a.esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom ";
156 
 
891 aurelien 157 
 
867 aurelien 158 
		$resultat_infos_complementaires = $this->requeter($requete_infos_complementaires);
891 aurelien 159 
 
160 
		return $resultat_infos_complementaires;
862 aurelien 161 
	}
162 
 
891 aurelien 163 
	public function rechercherInformationsComplementairesSurNom($nom_saisi) {
867 aurelien 164 
 
862 aurelien 165 
		$value = array();
166 
 
897 aurelien 167 
		if ($nom_saisi != null && $nom_saisi != "") {
862 aurelien 168 
 
891 aurelien 169 
			$requete_infos_comp_sur_nom = 'SELECT * FROM '.$this->config['cel_db']['bdd_eflore'].'.eflore_nom_intitule '.
862 aurelien 170 
			'WHERE eni_id_categorie_format = 3 AND '.
171 
			'eni_id_version_projet_nom = 25 AND '.
172 
			'(eni_id_valeur_format = 3 OR eni_id_valeur_format = 4) AND '.
173 
			'eni_intitule_nom LIKE "'.$nom_saisi.'%" '.
174 
			'ORDER BY LENGTH(eni_intitule_nom)';
175 
 
867 aurelien 176 
			$resultat_infos_comp_sur_nom = $this->executer($requete_infos_comp_sur_nom);
862 aurelien 177 
 
867 aurelien 178 
	        if (is_array($resultat_infos_comp_sur_nom)) {
179 
		        foreach ($resultat_infos_comp_sur_nom as $ligne) {
180 
		        	$value[]=array($ligne['eni_id_nom'], $ligne['eni_intitule_nom']);
181 
		        }
862 aurelien 182 
	        }
183 
		}
184 
 
185 
		return $value;
186 
	}
187 
 
891 aurelien 188 
	public function rechercherFamille($taxon) {
862 aurelien 189 
 
897 aurelien 190 
		$row = array();
862 aurelien 191 
 
867 aurelien 192 
		$requete_famille = "SELECT DISTINCT en_ce_rang, etr_id_taxon_2, en_id_nom, en_nom_supra_generique ".
891 aurelien 193 
		" FROM eflore_taxon_relation, ".
194 
		" eflore_selection_nom, ".
195 
		" eflore_nom ".
862 aurelien 196 
		" WHERE etr_id_taxon_1 = ".$taxon.
197 
		" AND etr_id_version_projet_taxon_1 = 25 ".
198 
		" AND etr_id_categorie_taxon = 3 ".
199 
		" AND etr_id_valeur_taxon = 3 ".
200 
		" AND esn_id_taxon =  etr_id_taxon_2 ".
201 
		" AND esn_ce_statut = 3 ".
202 
		" AND esn_id_version_projet_taxon = etr_id_version_projet_taxon_1 ".
203 
		" AND en_id_nom = esn_id_nom ".
204 
		" AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom  ";
867 aurelien 205 
 
206 
		$resultat_recherche_famille = $this->requeter($requete_famille);
862 aurelien 207 
 
867 aurelien 208 
		if (!is_array($resultat_recherche_famille) || count($resultat_recherche_famille) == 0) {
862 aurelien 209 
	    	$row['en_ce_rang']='fin';
210 
	    }
211 
 
867 aurelien 212 
		return $row;
862 aurelien 213 
	}
891 aurelien 214 
 
215 
	public function rechercherNumTaxSurNumNom($num_nom) {
216 
 
217 
		$requete_num_tax = "SELECT DISTINCT b.esn_id_taxon FROM eflore_nom, eflore_nom_rang," .
218 
		" eflore_selection_nom a, eflore_selection_nom b".
219 
		" WHERE a.esn_id_nom= ".$this->proteger($num_nom).
220 
		" AND a.esn_id_version_projet_taxon = 25 ".
221 
		" AND a.esn_id_taxon=b.esn_id_taxon ".
222 
		" AND b.esn_ce_statut=3 ".
223 
		" AND a.esn_id_version_projet_taxon=b.esn_id_version_projet_taxon" .
224 
		" AND en_ce_rang = enrg_id_rang" .
225 
		" AND en_id_nom = b.esn_id_nom" .
226 
		" AND a.esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom ";
227 
 
228 
	    $res_num_nom = $this->requeter($requete_num_tax);
229 
 
230 
		$nt = null;
897 aurelien 231 
		if (is_array($res_num_nom) && count($res_num_nom) > 0) {
891 aurelien 232 
			$nt=$res_num_nom[0]['esn_id_taxon'];
233 
		}
234 
 
235 
		return $nt;
236 
	}
237 
 
238 
	private function formaterNom($rawnom) {
862 aurelien 239 
 
891 aurelien 240 
        // Constitution du nom:
241 
        $nom = '';
862 aurelien 242 
 
891 aurelien 243 
        if ($rawnom['en_nom_supra_generique'] != '') {
244 
            $nom .= $rawnom['en_nom_supra_generique'];
245 
        } else if ($rawnom['en_epithete_infra_generique'] != '') {
246 
            $nom .= $rawnom['en_epithete_infra_generique'];
247 
        } else {
248 
            if ($rawnom['en_nom_genre'] != '') {
249 
                $nom .=  $rawnom['en_nom_genre'];
250 
            }
251 
            if ($rawnom['en_epithete_espece']!= '') {
252 
                $nom .= ' '.$rawnom['en_epithete_espece'];
253 
            }
254 
            if ($rawnom['en_epithete_infra_specifique'] != '') {
255 
                if (!empty($rawnom['enrg_abreviation_rang'])) {
256 
                        $nom .= ' '.$rawnom['enrg_abreviation_rang'].'';
257 
                }
258 
                $nom .= ' '.$rawnom['en_epithete_infra_specifique'];
259 
            }
260 
        }
862 aurelien 261 
 
891 aurelien 262 
        return $nom.$this->retournerAuteur($rawnom) ;
263 
 	}
264 
 
265 
	private function retournerAuteur($rawnom) {
862 aurelien 266 
		$auteurs = '';
267 
		$auteur_basio = '';
268 
		$auteur_modif = '';
269 
		if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_basio_ex']) && $rawnom['abreviation_auteur_basio_ex']!='-' )  {
270 
		    $auteur_basio .= $rawnom['abreviation_auteur_basio_ex'];
271 
		    if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_basio']) && $rawnom['abreviation_auteur_basio']!='-') {
272 
		        $auteur_basio .= ' ex '.$rawnom['abreviation_auteur_basio'];
273 
		    }
274 
		} else if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_basio']) && $rawnom['abreviation_auteur_basio']!='-') {
275 
		    $auteur_basio .= $rawnom['abreviation_auteur_basio'];
276 
		}
277 
 
278 
		if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_modif_ex']) && $rawnom['abreviation_auteur_modif_ex']!='-') {
279 
		    $auteur_modif .= $rawnom['abreviation_auteur_modif_ex'];
280 
		    if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_modif']) && $rawnom['abreviation_auteur_modif']!='-') {
281 
		        $auteur_modif .= ' ex '.$rawnom['abreviation_auteur_modif'];
282 
		    }
283 
		} else if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_modif']) && $rawnom['abreviation_auteur_modif']!='-')  {
284 
		    $auteur_modif .= $rawnom['abreviation_auteur_modif'];
285 
		}
286 
 
287 
		if (!empty($auteur_modif)) {
288 
		    $auteurs = ' ('.$auteur_basio.') '.$auteur_modif;
289 
		} elseif (!empty($auteur_basio)) {
290 
		    $auteurs = ' '.$auteur_basio;
291 
		}
292 
 
293 
		return $auteurs ;
294 
	}
295 
}
296 
?>