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1425 aurelien 1
<?php
2
/**
3
* PHP Version 5
4
*
5
* @category  PHP
6
* @package   jrest
7
* @author    David Delon <david@tela-botania.org>
8
* @author    Aurélien Peronnet <aurelien@tela-botania.org>
9
* @copyright 2010 Tela-Botanica
10
* @license   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
11
* @version   SVN: <svn_id>
12
* @link      /doc/jrest/
13
*/
14
 
15
/**
16
 *
17
 * La classe appelle les web service d'eflore pour éviter que le code client
18
 * ne soit dépendant de la version d'eflore
19
 */
20
class RechercheInfosTaxonBeta extends Cel {
21
 
1427 aurelien 22
	private $url_service_nom = null;
23
	private $url_service_taxon = null;
24
	private $url_service_chorologie = null;
25
 
1487 aurelien 26
	private $masque_recherche = null;
27
 
1425 aurelien 28
	public function RechercheInfosTaxonBeta($config) {
29
		parent::__construct($config);
1427 aurelien 30
		$this->url_service_nom = $config['eflore']['url_service_nom'];
31
		$this->url_service_taxon = $config['eflore']['url_service_taxon'];
32
		$this->url_service_chorologie_obs = $config['eflore']['url_service_chorologie_obs'];
1425 aurelien 33
	}
34
 
35
	public function rechercherGenreEspeceSurPrefixe($genre = null, $espece = null) {
36
 
37
		$liste_genre_espece = array();
1487 aurelien 38
		$this->masque_recherche = trim(trim($genre).' '.trim($espece,' *'));
39
		$masque = urlencode($this->masque_recherche);
1427 aurelien 40
		$requete = @file_get_contents($this->url_service_nom.'?masque='.$masque.'&recherche=etendue&retour.format=min&navigation.limite=50&ns.structure=au');
1425 aurelien 41
		if($requete != '') {
42
			$requete = json_decode($requete);
43
			if(is_object($requete) && isset($requete->resultat)) {
44
				foreach ($requete->resultat as $id => $res) {
1427 aurelien 45
					$retenu = ($res->retenu == "true") ? '3' : '4';
1425 aurelien 46
					$liste_genre_espece[] = array($res->nom_sci_complet, $id, $retenu);
47
				}
48
			}
1427 aurelien 49
			usort($liste_genre_espece, array($this, 'comparerParRetenuPuisNom'));
1425 aurelien 50
		}
51
		return $liste_genre_espece;
52
	}
53
 
1427 aurelien 54
	function comparerParRetenuPuisNom($a, $b) {
55
		if($a[2] == 3 && $b[2] != 3) {
56
			return -1;
57
		} elseif($a[2] != 3 && $b[2] == 3) {
58
			return 1;
59
		} else {
1487 aurelien 60
			return levenshtein($this->masque_recherche, $a[0]) >= levenshtein($this->masque_recherche, $b[0]);
1427 aurelien 61
		}
1425 aurelien 62
	}
63
 
64
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesEtFormaterNom($numNom) {
65
 
66
		$resultat_infos_complementaires = (array)$this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom);
67
		$retour_infos_complementaires = array();
68
		if (isset($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet']) && $resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet'] != '') {
69
           	$retour_infos_complementaires=array(($this->supprimerBiblio($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet'])));
70
	    }
71
 
72
		return $retour_infos_complementaires;
73
	}
74
 
75
	public function rechercherInformationsComplementairesSurNom($nom_saisi) {
1487 aurelien 76
		$nom_saisi = trim($nom_saisi);
1486 aurelien 77
		// Essai de recherche sur le nom saisi tel quel
78
		$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, true);
79
		if(empty($liste_genre_espece)) {
80
			// Essai de recherche stricte en tentant de supprimer le nom d'auteur
81
			$nom_saisi_sans_auteur = $this->supprimerAuteur($nom_saisi);
82
			$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi_sans_auteur, true);
83
			if(empty($liste_genre_espece)) {
84
				// Dernière tentative : essai de recherche étendue
85
				$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, false);
86
			}
87
		}
88
		return $liste_genre_espece;
89
	}
90
 
91
	private function effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, $stricte = true) {
92
		$url_recherche = $this->getUrlRechercheInfosComplementaires($nom_saisi, $stricte);
93
		$resultat = @file_get_contents($url_recherche);
94
		$liste_genre_espece = array();
95
		if($resultat != '') {
96
			$liste_genre_espece = $this->parserResultatRechercheTaxon($resultat);
97
		}
98
		return $liste_genre_espece;
99
	}
100
 
101
	private function getUrlRechercheInfosComplementaires($nom_saisi, $stricte = true) {
102
		$type_recherche = $stricte ? 'stricte' : 'etendue';
103
		return $url_recherche_etendue = $this->url_service_nom.'?masque='.urlencode($nom_saisi).'&recherche='.$type_recherche.'&ns.format=txt&retour.champs=nom_sci,auteur,nom_retenu.id&navigation.limite=1';
104
	}
105
 
106
	private function supprimerAuteur($nom_saisi) {
107
		// Attention le parseur de nom n'est pas fiable à 100%
108
		// mais ça marche dans la plupart des cas
109
		// à part les formules d'hybridité saisies avec un auteur
110
		// TODO: gérer les hybrides
1425 aurelien 111
		$nameparser = new NameParser();
1486 aurelien 112
		if($this->estUnHybride($nom_saisi) || $this->estUneFormuleHybridite($nom_saisi)) {
113
			$nom_decoupe = explode(' ', $nom_saisi);
114
			$derniere_position_hybride = end(array_keys($nom_decoupe, 'x'));
115
			$nom_saisi_sans_auteur = implode(' ',array_slice($nom_decoupe, 0, $derniere_position_hybride + 2));
116
		} else {
117
			$auteur = $nameparser->parse_auth($nom_saisi);
118
			$nom_saisi_sans_auteur = str_replace($auteur, '', $nom_saisi);
119
		}
120
 
121
		$nom_saisi_sans_auteur = trim($nom_saisi_sans_auteur);
122
		return $nom_saisi_sans_auteur;
123
	}
124
 
125
	private function estUneFormuleHybridite($nom_saisi) {
126
		return strpos($nom_saisi,' x ') !== false;
127
	}
128
 
129
	private function estUnHybride($nom_saisi) {
130
		return strpos($nom_saisi,'x ') === 0;
131
	}
132
 
133
	private function parserResultatRechercheTaxon($resultat) {
1425 aurelien 134
		$liste_genre_espece = array();
1486 aurelien 135
		$resultat = json_decode($resultat);
136
		if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat)) {
137
			foreach ($resultat->resultat as $id => $res) {
138
				$nom_complet = $res->{'nom_sci'}.' '.$res->auteur;
139
				$liste_genre_espece[] = array($id,$nom_complet);
1425 aurelien 140
			}
1486 aurelien 141
		}
1425 aurelien 142
		return $liste_genre_espece;
143
	}
144
 
145
	public function rechercherInformationsComplementairesSurNumNom($num_nom) {
146
		$infos_formatees = array();
147
		$infos = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num_nom);
148
		if(is_object($infos)) {
149
			$infos_formatees = $this->formaterInfosComplementairesSurNumNom($infos);
150
		}
151
		return $infos_formatees;
152
	}
153
 
154
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num_nom) {
155
		$infos = array();
1432 aurelien 156
		$url = $this->url_service_nom.'/'.$num_nom.'?retour.champs=nom_sci,auteur,id,nom_retenu_complet,nom_retenu.id,num_taxonomique,famille';
1425 aurelien 157
		$resultat = @file_get_contents($url);
158
		if($resultat != '') {
159
			$infos = json_decode($resultat);
160
		}
161
		return $infos;
162
	}
163
 
164
	private function formaterInfosComplementairesSurNumNom($infos) {
165
		$infos = (array)$infos;
166
		return $infos_formatees = array(
167
			'Nom_Retenu' => $this->supprimerBiblio($infos['nom_retenu_complet']),
168
			'Num_Nom_Retenu' => $infos['nom_retenu.id'],
169
			'Num_Taxon' => $infos['num_taxonomique'],
170
			'Famille' => $infos['famille']
171
		);
172
	}
173
 
174
	private function supprimerBiblio($nom) {
175
		return preg_replace('/ \[.*\]/','',$nom);
176
	}
177
 
178
	public function rechercherNumTaxSurNumNom($num_nom) {
179
 
180
		$nt = null;
1427 aurelien 181
		$url = $this->url_service_nom."/".$num_nom.'?retour.champs=num_taxonomique';
1425 aurelien 182
		$resultat = @file_get_contents($url);
183
		if($resultat != '') {
184
			$infos = json_decode($resultat);
185
			$nt = $infos->num_taxonomique;
186
		}
187
 
188
		return $nt;
189
	}
190
 
191
	public function taxonEstPresentDansDepartement($num_taxon,$code_departement) {
192
		$presence_taxon = false;
1427 aurelien 193
		$url = $this->url_service_chorologie_obs.'?masque.departement='.$code_departement.'&masque.determination.nt='.$num_taxon.'&navigation.limite=1';
1425 aurelien 194
		$resultat = @file_get_contents($url);
195
		if($resultat != '') {
196
			$resultat = json_decode($resultat);
197
			if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat) && count($resultat->resultat) > 0) {
198
				$presence_taxon = true;
199
			}
200
		}
201
		return $presence_taxon;
202
	}
203
 
204
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumTax($numTax) {
205
 
1426 aurelien 206
		$infos = array();
207
		//TODO: retourner moins de champs grâce au paramètre retour.champs
1427 aurelien 208
		$url = $this->url_service_taxon."/nt:".$numTax;
1426 aurelien 209
		$resultat = @file_get_contents($url);
210
		if($resultat != '') {
211
			$infos = json_decode($resultat);
212
		}
213
 
214
		return $infos;
1425 aurelien 215
	}
216
 
217
	function rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax($identifiant_espece) {
218
		// texte libre, nom scientifique,
219
		// ou code nomenclatural (format BDNFFnn999999)
220
		// ou code taxonomique (format BDNFFnt999999)
221
		$identifiant_espece=trim($identifiant_espece);
222
		$identifiant_espece=utf8_encode($identifiant_espece);
1426 aurelien 223
 
1425 aurelien 224
		$retour = array();
225
 
226
		preg_match('/BDNFFnn([0-9][0-9]*)/',$identifiant_espece, $elements);
227
		if (isset($elements[1])) {
228
			// Numero nomenclatural
229
			$infos_taxon = $this->rechercherInformationsComplementairesSurNumNom($elements[1]);
1426 aurelien 230
			$retour = array("nom_sel" => $infos_taxon['Nom_Retenu'], "en_id_nom" => $elements[1]);
1425 aurelien 231
		} else {
232
			//  Numero taxonomique ou nom scientifique
233
			preg_match('/BDNFFnt([0-9][0-9]*)/', $identifiant_espece, $elements);
234
			if (isset($elements[1])) {
235
				// Numero taxonomique
1426 aurelien 236
				$infos_taxon = (array)$this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumTax($elements[1]);
237
				if(isset($infos_taxon['nom_retenu.libelle']) && isset($infos_taxon['id'])) {
238
					$nom = $infos_taxon['nom_retenu.libelle'];
239
					$nom .= (isset($infos_taxon['auteur'])) ? ' '.$infos_taxon['auteur'] : '';
240
					$retour = array("nom_sel" => $nom,
241
									"en_id_nom" => $infos_taxon['id']);
242
				}
1425 aurelien 243
			} else {
244
				// Nom scientifique
1426 aurelien 245
				$id_nom = $this->rechercherInformationsComplementairesSurNom($identifiant_espece);
1425 aurelien 246
				// Recherche du nom associe
247
				$retour = array("nom_sel" => $identifiant_espece);
1432 aurelien 248
				if(is_array($id_nom) && count($id_nom) > 0 && isset($id_nom[0][0]) && isset($id_nom[0][1])) {
1426 aurelien 249
					$nn = $id_nom[0][0];
1432 aurelien 250
					$retour = array("nom_sel" => $id_nom[0][1], "en_id_nom" => $id_nom[0][0]);
1425 aurelien 251
				}
252
			}
253
		}
254
 
255
		return $retour;
256
	}
257
}
258
?>