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1425 aurelien 1 
<?php
2 
/**
3 
* PHP Version 5
4 
*
5 
* @category  PHP
6 
* @package   jrest
7 
* @author    David Delon <david@tela-botania.org>
8 
* @author    Aurélien Peronnet <aurelien@tela-botania.org>
9 
* @copyright 2010 Tela-Botanica
10 
* @license   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
11 
* @version   SVN: <svn_id>
12 
* @link      /doc/jrest/
13 
*/
14 
 
15 
/**
16 
 *
17 
 * La classe appelle les web service d'eflore pour éviter que le code client
18 
 * ne soit dépendant de la version d'eflore
19 
 */
20 
class RechercheInfosTaxonBeta extends Cel {
21 
 
1427 aurelien 22 
	private $url_service_nom = null;
23 
	private $url_service_taxon = null;
24 
	private $url_service_chorologie = null;
25 
 
1487 aurelien 26 
	private $masque_recherche = null;
1527 aurelien 27 
	private $code_referentiel = 'bdtfx';
1784 raphael 28 
 
29 
	// initialisé à TRUE par rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax()
30 
	// si l'espèce passée a le motif <ref>:(nt|nn):<num>, eg: isfan:nt:1591
31 
	public $is_notation_spe = FALSE;
32 
 
1527 aurelien 33 
	public function RechercheInfosTaxonBeta($config, $code_referentiel = 'bdtfx') {
34 
		parent::__construct($config);
35 
		$this->code_referentiel = $code_referentiel;
36 
		$this->formaterUrlsServices($config);
37 
	}
1487 aurelien 38 
 
1527 aurelien 39 
	private function formaterUrlsServices($config) {
40 
		$this->url_service_nom = str_replace('{referentiel}', $this->code_referentiel ,$config['eflore']['url_service_nom']);
41 
		$this->url_service_taxon = str_replace('{referentiel}', $this->code_referentiel ,$config['eflore']['url_service_taxon']);
1427 aurelien 42 
		$this->url_service_chorologie_obs = $config['eflore']['url_service_chorologie_obs'];
1425 aurelien 43 
	}
44 
 
45 
	public function rechercherGenreEspeceSurPrefixe($genre = null, $espece = null) {
46 
 
47 
		$liste_genre_espece = array();
1487 aurelien 48 
		$this->masque_recherche = trim(trim($genre).' '.trim($espece,' *'));
49 
		$masque = urlencode($this->masque_recherche);
1427 aurelien 50 
		$requete = @file_get_contents($this->url_service_nom.'?masque='.$masque.'&recherche=etendue&retour.format=min&navigation.limite=50&ns.structure=au');
1425 aurelien 51 
		if($requete != '') {
52 
			$requete = json_decode($requete);
53 
			if(is_object($requete) && isset($requete->resultat)) {
54 
				foreach ($requete->resultat as $id => $res) {
1427 aurelien 55 
					$retenu = ($res->retenu == "true") ? '3' : '4';
1425 aurelien 56 
					$liste_genre_espece[] = array($res->nom_sci_complet, $id, $retenu);
57 
				}
58 
			}
1427 aurelien 59 
			usort($liste_genre_espece, array($this, 'comparerParRetenuPuisNom'));
1425 aurelien 60 
		}
61 
		return $liste_genre_espece;
62 
	}
63 
 
1427 aurelien 64 
	function comparerParRetenuPuisNom($a, $b) {
65 
		if($a[2] == 3 && $b[2] != 3) {
66 
			return -1;
67 
		} elseif($a[2] != 3 && $b[2] == 3) {
68 
			return 1;
69 
		} else {
1487 aurelien 70 
			return levenshtein($this->masque_recherche, $a[0]) >= levenshtein($this->masque_recherche, $b[0]);
1427 aurelien 71 
		}
1425 aurelien 72 
	}
73 
 
74 
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesEtFormaterNom($numNom) {
75 
		$resultat_infos_complementaires = (array)$this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom);
76 
		$retour_infos_complementaires = array();
1780 raphael 77 
		if (isset($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet']) && $resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet']) {
78 
           	$retour_infos_complementaires=array((self::supprimerBiblio($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet'])));
1425 aurelien 79 
	    }
80 
 
81 
		return $retour_infos_complementaires;
82 
	}
83 
 
84 
	public function rechercherInformationsComplementairesSurNom($nom_saisi) {
1487 aurelien 85 
		$nom_saisi = trim($nom_saisi);
1486 aurelien 86 
		// Essai de recherche sur le nom saisi tel quel
87 
		$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, true);
88 
		if(empty($liste_genre_espece)) {
89 
			// Essai de recherche stricte en tentant de supprimer le nom d'auteur
90 
			$nom_saisi_sans_auteur = $this->supprimerAuteur($nom_saisi);
1787 raphael 91 
			if($nom_saisi_sans_auteur) { // ne pas faire la requête sur un mot vide
92 
				$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi_sans_auteur, true);
93 
			}
1486 aurelien 94 
			if(empty($liste_genre_espece)) {
95 
				// Dernière tentative : essai de recherche étendue
96 
				$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, false);
97 
			}
98 
		}
99 
		return $liste_genre_espece;
100 
	}
101 
 
102 
	private function effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, $stricte = true) {
1787 raphael 103 
		$res = @json_decode(file_get_contents(sprintf('%1$s?masque=%2$s&recherche=%3$s&ns.format=txt&retour.champs=%4$s&navigation.limite=1',
104 
													  $this->url_service_nom,
105 
													  urlencode($nom_saisi),
106 
													  ($stricte ? 'stricte' : 'etendue'),
107 
													  implode(',', array("id","nom_sci","auteur","nom_retenu.id","famille","num_taxonomique","nom_retenu_complet")))));
1780 raphael 108 
		if(!$res) return NULL;
109 
		$resultat = (array)$res->resultat;
110 
		return array_pop($resultat);
1486 aurelien 111 
	}
112 
 
113 
	private function supprimerAuteur($nom_saisi) {
114 
		// Attention le parseur de nom n'est pas fiable à 100%
115 
		// mais ça marche dans la plupart des cas
116 
		// à part les formules d'hybridité saisies avec un auteur
117 
		// TODO: gérer les hybrides
1425 aurelien 118 
		$nameparser = new NameParser();
1486 aurelien 119 
		if($this->estUnHybride($nom_saisi) || $this->estUneFormuleHybridite($nom_saisi)) {
120 
			$nom_decoupe = explode(' ', $nom_saisi);
121 
			$derniere_position_hybride = end(array_keys($nom_decoupe, 'x'));
122 
			$nom_saisi_sans_auteur = implode(' ',array_slice($nom_decoupe, 0, $derniere_position_hybride + 2));
123 
		} else {
124 
			$auteur = $nameparser->parse_auth($nom_saisi);
125 
			$nom_saisi_sans_auteur = str_replace($auteur, '', $nom_saisi);
126 
		}
127 
 
128 
		$nom_saisi_sans_auteur = trim($nom_saisi_sans_auteur);
129 
		return $nom_saisi_sans_auteur;
130 
	}
131 
 
132 
	private function estUneFormuleHybridite($nom_saisi) {
133 
		return strpos($nom_saisi,' x ') !== false;
134 
	}
135 
 
136 
	private function estUnHybride($nom_saisi) {
137 
		return strpos($nom_saisi,'x ') === 0;
138 
	}
139 
 
1425 aurelien 140 
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num_nom) {
1780 raphael 141 
		return @json_decode(file_get_contents($this->url_service_nom.'/'.$num_nom.'?retour.champs=nom_sci,auteur,id,nom_retenu_complet,nom_retenu.id,num_taxonomique,famille'));
1425 aurelien 142 
	}
1780 raphael 143 
 
144 
	static function supprimerBiblio($nom) {
1805 raphael 145 
		return trim(preg_replace('/ \[.*\]/','',$nom));
1425 aurelien 146 
	}
147 
 
148 
	public function rechercherNumTaxSurNumNom($num_nom) {
149 
		$nt = null;
1427 aurelien 150 
		$url = $this->url_service_nom."/".$num_nom.'?retour.champs=num_taxonomique';
1425 aurelien 151 
		$resultat = @file_get_contents($url);
152 
		if($resultat != '') {
153 
			$infos = json_decode($resultat);
154 
			$nt = $infos->num_taxonomique;
155 
		}
156 
 
157 
		return $nt;
158 
	}
159 
 
160 
	public function taxonEstPresentDansDepartement($num_taxon,$code_departement) {
161 
		$presence_taxon = false;
1427 aurelien 162 
		$url = $this->url_service_chorologie_obs.'?masque.departement='.$code_departement.'&masque.determination.nt='.$num_taxon.'&navigation.limite=1';
1425 aurelien 163 
		$resultat = @file_get_contents($url);
164 
		if($resultat != '') {
165 
			$resultat = json_decode($resultat);
166 
			if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat) && count($resultat->resultat) > 0) {
167 
				$presence_taxon = true;
168 
			}
169 
		}
170 
		return $presence_taxon;
171 
	}
172 
 
1780 raphael 173 
	/* texte libre, nom scientifique,
1784 raphael 174 
	   ou code nomenclatural (format bdtfx:nn:999999)
175 
	   ou code taxonomique (format bdtfx:nt:999999)
1780 raphael 176 
	   TODO: voir ce qu'on fait pour l'import de différent référentiels */
1425 aurelien 177 
	function rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax($identifiant_espece) {
1784 raphael 178 
		preg_match('/(' . implode('|', Cel::$referentiels_valides) .'):(nn|nt):(\d+)/i', $identifiant_espece, $elements);
179 
		if($elements) {
180 
			$this->is_notation_spe = TRUE;
181 
			list(, $ref, $type, $num) = $elements;
1796 raphael 182 
 
183 
			if($ref != $this->code_referentiel) {
184 
				// TODO: ignorer la colonne référentiel, et utiliser le référentiel donné
185 
				// mais il faut alors avertir le service (d'import/modif) d'utiliser le référentiel
186 
				// passé au nom d'espèce
187 
			}
1784 raphael 188 
			// Numero nomenclatural
189 
			if ($type == 'nn') {
190 
				$obj = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num);
191 
			}
192 
			// Numero taxonomique
193 
			else {
194 
				//TODO: retourner moins de champs grâce au paramètre retour.champs
195 
				$obj = @json_decode(file_get_contents($this->url_service_taxon."/nt:".$num));
196 
			}
1796 raphael 197 
			if($obj) $obj->ref = $ref;
1784 raphael 198 
			return $obj;
199 
		}
1746 raphael 200 
 
1780 raphael 201 
		// Nom scientifique
202 
		return $this->rechercherInformationsComplementairesSurNom($identifiant_espece);
1425 aurelien 203 
	}
1591 aurelien 204 
 
205 
	public function rechercherSynonymesSurNumNom($num_nom) {
206 
		$retour = array();
1780 raphael 207 
		$resultat = @file_get_contents($this->url_service_nom.'/'.$num_nom.'/relations/synonymie/?retour.format=min');
1591 aurelien 208 
		if($resultat != '') {
209 
			$resultat = json_decode($resultat);
210 
			if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat) && count($resultat->resultat) > 0) {
211 
				$retour = $resultat->resultat;
212 
			}
213 
		}
214 
		return $retour;
215 
	}
1425 aurelien 216 
}
217 
?>