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1425 aurelien 1
<?php
2
/**
3
* PHP Version 5
4
*
5
* @category  PHP
6
* @package   jrest
7
* @author    David Delon <david@tela-botania.org>
8
* @author    Aurélien Peronnet <aurelien@tela-botania.org>
9
* @copyright 2010 Tela-Botanica
10
* @license   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
11
* @version   SVN: <svn_id>
12
* @link      /doc/jrest/
13
*/
14
 
15
/**
16
 *
17
 * La classe appelle les web service d'eflore pour éviter que le code client
18
 * ne soit dépendant de la version d'eflore
19
 */
20
class RechercheInfosTaxonBeta extends Cel {
21
 
1427 aurelien 22
	private $url_service_nom = null;
23
	private $url_service_taxon = null;
24
	private $url_service_chorologie = null;
25
 
1487 aurelien 26
	private $masque_recherche = null;
1527 aurelien 27
	private $code_referentiel = 'bdtfx';
1784 raphael 28
 
29
	// initialisé à TRUE par rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax()
30
	// si l'espèce passée a le motif <ref>:(nt|nn):<num>, eg: isfan:nt:1591
31
	public $is_notation_spe = FALSE;
32
 
1527 aurelien 33
	public function RechercheInfosTaxonBeta($config, $code_referentiel = 'bdtfx') {
34
		parent::__construct($config);
35
		$this->code_referentiel = $code_referentiel;
36
		$this->formaterUrlsServices($config);
37
	}
1487 aurelien 38
 
1527 aurelien 39
	private function formaterUrlsServices($config) {
40
		$this->url_service_nom = str_replace('{referentiel}', $this->code_referentiel ,$config['eflore']['url_service_nom']);
41
		$this->url_service_taxon = str_replace('{referentiel}', $this->code_referentiel ,$config['eflore']['url_service_taxon']);
1427 aurelien 42
		$this->url_service_chorologie_obs = $config['eflore']['url_service_chorologie_obs'];
1852 raphael 43
		$this->config = $config;
1425 aurelien 44
	}
45
 
46
	public function rechercherGenreEspeceSurPrefixe($genre = null, $espece = null) {
47
 
48
		$liste_genre_espece = array();
1487 aurelien 49
		$this->masque_recherche = trim(trim($genre).' '.trim($espece,' *'));
50
		$masque = urlencode($this->masque_recherche);
1427 aurelien 51
		$requete = @file_get_contents($this->url_service_nom.'?masque='.$masque.'&recherche=etendue&retour.format=min&navigation.limite=50&ns.structure=au');
1425 aurelien 52
		if($requete != '') {
53
			$requete = json_decode($requete);
54
			if(is_object($requete) && isset($requete->resultat)) {
55
				foreach ($requete->resultat as $id => $res) {
1427 aurelien 56
					$retenu = ($res->retenu == "true") ? '3' : '4';
1425 aurelien 57
					$liste_genre_espece[] = array($res->nom_sci_complet, $id, $retenu);
58
				}
59
			}
1427 aurelien 60
			usort($liste_genre_espece, array($this, 'comparerParRetenuPuisNom'));
1425 aurelien 61
		}
62
		return $liste_genre_espece;
63
	}
64
 
1427 aurelien 65
	function comparerParRetenuPuisNom($a, $b) {
66
		if($a[2] == 3 && $b[2] != 3) {
67
			return -1;
68
		} elseif($a[2] != 3 && $b[2] == 3) {
69
			return 1;
70
		} else {
1487 aurelien 71
			return levenshtein($this->masque_recherche, $a[0]) >= levenshtein($this->masque_recherche, $b[0]);
1427 aurelien 72
		}
1425 aurelien 73
	}
74
 
75
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesEtFormaterNom($numNom) {
76
		$resultat_infos_complementaires = (array)$this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom);
77
		$retour_infos_complementaires = array();
1780 raphael 78
		if (isset($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet']) && $resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet']) {
79
           	$retour_infos_complementaires=array((self::supprimerBiblio($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet'])));
1425 aurelien 80
	    }
81
 
82
		return $retour_infos_complementaires;
83
	}
84
 
85
	public function rechercherInformationsComplementairesSurNom($nom_saisi) {
1487 aurelien 86
		$nom_saisi = trim($nom_saisi);
1486 aurelien 87
		// Essai de recherche sur le nom saisi tel quel
1862 raphael 88
		$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, 'stricte');
89
		if($liste_genre_espece) return $liste_genre_espece;
90
 
91
		// Essai de recherche stricte en tentant de supprimer le nom d'auteur
92
		if( ($nom_saisi_sans_auteur = self::supprimerAuteur($nom_saisi)) ) { // ne pas faire la requête sur un mot vide
93
			$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi_sans_auteur, 'stricte');
1486 aurelien 94
		}
1862 raphael 95
		if($liste_genre_espece) return $liste_genre_espece;
96
 
97
		// avant-dernière tentative : essai de recherche étendue
98
		$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, 'etendue');
99
		if($liste_genre_espece) return $liste_genre_espece;
100
 
101
		// dernière tentative: concaténation (nom_sci,auteur) (= nom-retenu généré utilisé comme nom_sci)
102
		$liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, 'concat');
103
 
1486 aurelien 104
		return $liste_genre_espece;
105
	}
106
 
1862 raphael 107
	private function effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, $mode = 'stricte') {
1787 raphael 108
		$res = @json_decode(file_get_contents(sprintf('%1$s?masque=%2$s&recherche=%3$s&ns.format=txt&retour.champs=%4$s&navigation.limite=1',
109
													  $this->url_service_nom,
110
													  urlencode($nom_saisi),
1862 raphael 111
													  $mode,
1787 raphael 112
													  implode(',', array("id","nom_sci","auteur","nom_retenu.id","famille","num_taxonomique","nom_retenu_complet")))));
1780 raphael 113
		if(!$res) return NULL;
114
		$resultat = (array)$res->resultat;
115
		return array_pop($resultat);
1486 aurelien 116
	}
117
 
1833 raphael 118
	static function supprimerAuteur($nom_saisi) {
1486 aurelien 119
		// TODO: gérer les hybrides
1833 raphael 120
		if(self::estUnHybride($nom_saisi) || self::estUneFormuleHybridite($nom_saisi)) {
1486 aurelien 121
			$nom_decoupe = explode(' ', $nom_saisi);
122
			$derniere_position_hybride = end(array_keys($nom_decoupe, 'x'));
123
			$nom_saisi_sans_auteur = implode(' ',array_slice($nom_decoupe, 0, $derniere_position_hybride + 2));
124
		} else {
1833 raphael 125
			/* Attention le parseur de nom n'est pas fiable à 100%
126
			   mais ça marche dans la plupart des cas
127
			   à part les formules d'hybridité saisies avec un auteur */
128
			$nameparser = new NameParser();
1486 aurelien 129
			$auteur = $nameparser->parse_auth($nom_saisi);
130
			$nom_saisi_sans_auteur = str_replace($auteur, '', $nom_saisi);
131
		}
132
 
1833 raphael 133
		return trim($nom_saisi_sans_auteur);
1486 aurelien 134
	}
135
 
1833 raphael 136
	static function estUneFormuleHybridite($nom_saisi) {
1486 aurelien 137
		return strpos($nom_saisi,' x ') !== false;
138
	}
139
 
1833 raphael 140
	static function estUnHybride($nom_saisi) {
1486 aurelien 141
		return strpos($nom_saisi,'x ') === 0;
142
	}
143
 
1852 raphael 144
	public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num_nom, $ref = NULL) {
145
		if($ref && isset($this->config['eflore']['api_host'])) {
146
			return @json_decode(file_get_contents($this->config['eflore']['api_host'] . '/' .
147
												  $ref . '/' .
148
												  'noms' . '/' .
149
												  $num_nom .
150
												  '?retour.champs=' . implode(',', array('nom_sci,auteur',
151
																								  'id',
152
																								  'nom_retenu_complet',
153
																								  'nom_retenu.id',
154
																								  'num_taxonomique',
155
																								  'famille'))));
156
		}
157
		// XXX: compat
1780 raphael 158
		return @json_decode(file_get_contents($this->url_service_nom.'/'.$num_nom.'?retour.champs=nom_sci,auteur,id,nom_retenu_complet,nom_retenu.id,num_taxonomique,famille'));
1425 aurelien 159
	}
1780 raphael 160
 
161
	static function supprimerBiblio($nom) {
1805 raphael 162
		return trim(preg_replace('/ \[.*\]/','',$nom));
1425 aurelien 163
	}
164
 
165
	public function rechercherNumTaxSurNumNom($num_nom) {
166
		$nt = null;
1427 aurelien 167
		$url = $this->url_service_nom."/".$num_nom.'?retour.champs=num_taxonomique';
1425 aurelien 168
		$resultat = @file_get_contents($url);
169
		if($resultat != '') {
170
			$infos = json_decode($resultat);
171
			$nt = $infos->num_taxonomique;
172
		}
173
 
174
		return $nt;
175
	}
176
 
177
	public function taxonEstPresentDansDepartement($num_taxon,$code_departement) {
178
		$presence_taxon = false;
1427 aurelien 179
		$url = $this->url_service_chorologie_obs.'?masque.departement='.$code_departement.'&masque.determination.nt='.$num_taxon.'&navigation.limite=1';
1425 aurelien 180
		$resultat = @file_get_contents($url);
181
		if($resultat != '') {
182
			$resultat = json_decode($resultat);
183
			if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat) && count($resultat->resultat) > 0) {
184
				$presence_taxon = true;
185
			}
186
		}
187
		return $presence_taxon;
188
	}
189
 
1780 raphael 190
	/* texte libre, nom scientifique,
1784 raphael 191
	   ou code nomenclatural (format bdtfx:nn:999999)
192
	   ou code taxonomique (format bdtfx:nt:999999)
1780 raphael 193
	   TODO: voir ce qu'on fait pour l'import de différent référentiels */
1425 aurelien 194
	function rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax($identifiant_espece) {
1784 raphael 195
		preg_match('/(' . implode('|', Cel::$referentiels_valides) .'):(nn|nt):(\d+)/i', $identifiant_espece, $elements);
196
		if($elements) {
197
			$this->is_notation_spe = TRUE;
198
			list(, $ref, $type, $num) = $elements;
1796 raphael 199
 
200
			if($ref != $this->code_referentiel) {
201
				// TODO: ignorer la colonne référentiel, et utiliser le référentiel donné
202
				// mais il faut alors avertir le service (d'import/modif) d'utiliser le référentiel
203
				// passé au nom d'espèce
1852 raphael 204
				// Seul le effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom() le supporte, car c'est encore
205
				// un peu complexe à implémenter proprement pour cause d'attributs de classes.
1796 raphael 206
			}
1784 raphael 207
			// Numero nomenclatural
208
			if ($type == 'nn') {
1852 raphael 209
				$obj = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num, $ref);
1784 raphael 210
			}
211
			// Numero taxonomique
212
			else {
213
				//TODO: retourner moins de champs grâce au paramètre retour.champs
214
				$obj = @json_decode(file_get_contents($this->url_service_taxon."/nt:".$num));
215
			}
1796 raphael 216
			if($obj) $obj->ref = $ref;
1784 raphael 217
			return $obj;
218
		}
1746 raphael 219
 
1780 raphael 220
		// Nom scientifique
221
		return $this->rechercherInformationsComplementairesSurNom($identifiant_espece);
1425 aurelien 222
	}
1591 aurelien 223
 
224
	public function rechercherSynonymesSurNumNom($num_nom) {
225
		$retour = array();
1780 raphael 226
		$resultat = @file_get_contents($this->url_service_nom.'/'.$num_nom.'/relations/synonymie/?retour.format=min');
1591 aurelien 227
		if($resultat != '') {
228
			$resultat = json_decode($resultat);
229
			if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat) && count($resultat->resultat) > 0) {
230
				$retour = $resultat->resultat;
231
			}
232
		}
233
		return $retour;
234
	}
1425 aurelien 235
}
236
?>