Subversion Repositories eFlore/Applications.cel

<?php

/**

* @category  PHP

* @package   jrest

* @author    Raphaël Droz <raphael@tela-botania.org>

* @copyright 2013 Tela-Botanica

* @license   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL

* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>

*/

/**

 * Service d'import de données d'observation du CEL au format XLS

 *

 * Sont define()'d commme n° de colonne tous les abbrevs retournés par

 * FormateurGroupeColonne::nomEnsembleVersListeColonnes() préfixés par C_  cf: detectionEntete()

 *

 * Exemple d'un test:

 * $ GET "/jrest/ExportXLS/22506?format=csv&range=*&limite=13" \

 *   | curl -F "upload=@-" -F utilisateur=22506 "/jrest/ImportXLS"

 * # 13 observations importées

 * + cf MySQL general_log = 1

 *

 **/

set_include_path(get_include_path() . PATH_SEPARATOR . dirname(dirname(realpath(__FILE__))) . '/lib');

// TERM

error_reporting(-1);

ini_set('html_errors', 0);

ini_set('xdebug.cli_color', 2);

require_once('lib/PHPExcel/Classes/PHPExcel.php');

require_once('FormateurGroupeColonne.php');

date_default_timezone_set("Europe/Paris");

// nombre d'INSERT à cumuler par requête SQL

// (= nombre de lignes XLS à bufferiser)

//define('NB_LIRE_LIGNE_SIMUL', 30);

define('NB_LIRE_LIGNE_SIMUL', 5);

// Numbers of days between January 1, 1900 and 1970 (including 19 leap years)

// see traiterDateObs()

// define("MIN_DATES_DIFF", 25569);

class MyReadFilter implements PHPExcel_Reader_IReadFilter {

	// exclusion de colonnes

	public $exclues = array();

	// lecture par morceaux

    public $ligne_debut = 0;

    public $ligne_fin = 0;

	public function __construct() {}

	public function def_interval($debut, $nb) {

		$this->ligne_debut = $debut;

		$this->ligne_fin = $debut + $nb;

	}

    public function readCell($colonne, $ligne, $worksheetName = '') {

		if(@$this->exclues[$colonne]) return false;

		// si des n° de morceaux ont été initialisés, on filtre...

		if($this->ligne_debut && ($ligne < $this->ligne_debut || $ligne >= $this->ligne_fin)) return false;

		return true;

    }

}

// XXX: PHP 5.3

function __anonyme_1($v) {	return !$v['importable']; }

function __anonyme_2(&$v) {	$v = $v['nom']; }

function __anonyme_3($cell) { return !is_null($cell); };

function __anonyme_5($item) { return is_null($item) ? '?' : $item; }

function __anonyme_6() { return NULL; }

class ImportXLS extends Cel  {

	static function __anonyme_4(&$item, $key, $obj) { $item = $obj->quoteNonNull(trim($item)); }

	static $ordre_BDD = Array(

		"ce_utilisateur",

		"prenom_utilisateur",

		"nom_utilisateur",

		"courriel_utilisateur",

		"ordre",

		"nom_sel",

		"nom_sel_nn",

		"nom_ret",

		"nom_ret_nn",

		"nt",

		"famille",

		"nom_referentiel",

		"zone_geo",

		"ce_zone_geo",

		"date_observation",

		"lieudit",

		"station",

		"milieu",

		"mots_cles_texte",

		"commentaire",

		"transmission",

		"date_creation",

		"date_modification",

		"date_transmission",

		"latitude",

		"longitude",

		"altitude",

		"abondance",

		"certitude",

		"phenologie",

		"code_insee_calcule"

	);

	// cf: initialiser_pdo_ordered_statements()

	// eg: "INSERT INTO cel_obs (ce_utilisateur, ..., phenologie, code_insee_calcule) VALUES"

	// colonnes statiques d'abord, les autres ensuite, dans l'ordre de $ordre_BDD

	static $insert_prefix_ordre;

	// eg: "(<id>, <prenom>, <nom>, <email>, now(), now(), ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?)"

	// dont le nombre de placeholder dépend du nombre de colonnes non-statiques

	// colonnes statiques d'abord, les autres ensuite, dans l'ordre de $ordre_BDD

	static $insert_ligne_pattern_ordre;

	// seconde (meilleure) possibilité

	// cf: initialiser_pdo_statements()

	// eg: "INSERT INTO cel_obs (ce_utilisateur, ..., date_creation, ...phenologie, code_insee_calcule) VALUES"

	static $insert_prefix;

	// eg: "(<id>, <prenom>, <nom>, <email>, ?, ?, ?, now(), now(), ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?)"

	// dont le nombre de placeholder dépend du nombre de colonnes non-statiques

	static $insert_ligne_pattern;

	/*

	  Ces colonnes:

	  - sont propres à l'ensemble des enregistrements uploadés

	  - sont indépendantes du numéro de lignes

	  - n'ont pas de valeur par défaut dans la structure de la table

	  - nécessitent une initialisation dans le cadre de l'upload

	  initialiser_colonnes_statiques() y merge les données d'identification utilisateur

	*/

	public $colonnes_statiques = Array(

		"ce_utilisateur" => NULL,

		"prenom_utilisateur" => NULL,

		"nom_utilisateur" => NULL,

		"courriel_utilisateur" => NULL,

		// fixes (fonction SQL)

		// XXX future: mais pourraient varier dans le futur si la mise-à-jour

		// d'observation est implémentée

		"date_creation" => "now()",

		"date_modification" => "now()",

	);

	public $id_utilisateur = NULL;

	// erreurs d'import

	public $bilan = Array();

	function ImportXLS($config) {

		parent::__construct($config);

	}

	function createElement($pairs) {

		if(!isset($pairs['utilisateur']) || trim($pairs['utilisateur']) == '') {

			echo '0'; exit;

		}

		$id_utilisateur = intval($pairs['utilisateur']);

		$this->id_utilisateur = $id_utilisateur; // pour traiterImage();

		if(!isset($_SESSION)) session_start();

        $this->controleUtilisateur($id_utilisateur);

        $this->utilisateur = $this->getInfosComplementairesUtilisateur($id_utilisateur);

		$this->initialiser_colonnes_statiques($id_utilisateur);

		// initialisation du statement PDO/MySQL

		// première version, pattern de requête pas génial

		/* list(self;;$insert_prefix_ordre, self::$insert_ligne_pattern_ordre) =

		   $this->initialiser_pdo_ordered_statements($this->colonnes_statiques); */

		list(self::$insert_prefix, self::$insert_ligne_pattern) =

			$this->initialiser_pdo_statements($this->colonnes_statiques);

		$infos_fichier = array_pop($_FILES);

		/*$objPHPExcel = PHPExcel_IOFactory::load($infos_fichier['tmp_name']);

		  $donnees = $objPHPExcel->getActiveSheet()->toArray(NULL,FALSE,FALSE,TRUE);*/

		/*$objReader = PHPExcel_IOFactory::createReader("Excel5");

		$objReader->setReadDataOnly(true);

		$objPHPExcel = $objReader->load($infos_fichier['tmp_name']);*/

		//var_dump($donnees);

		// renomme le fichier pour lui ajouter son extension initiale, ce qui

		// permet (une sorte) d'autodétection du format.

		$fichier = $infos_fichier['tmp_name'];

		$extension = pathinfo($infos_fichier['name'], PATHINFO_EXTENSION);

		if( (strlen($extension) == 3 || strlen($extension) == 4) &&

			(@rename($fichier, $fichier . '.' . $extension))) { // XXX: @ safe-mode

			$fichier = $fichier . '.' . $extension;

		}

		$objReader = PHPExcel_IOFactory::createReaderForFile($fichier);

		$objReader->setReadDataOnly(true);

		// TODO: is_a obsolete entre 5.0 et 5.3, retirer le @ à terme

		if(@is_a($objReader, 'PHPExcel_Reader_CSV')) {

			$objReader->setDelimiter(',')

				->setEnclosure('"')

				->setLineEnding("\n")

				->setSheetIndex(0);

		}

		// on ne conserve que l'en-tête

		$filtre = new MyReadFilter();

		$filtre->def_interval(1, 2);

		$objReader->setReadFilter($filtre);

		$objPHPExcel = $objReader->load($fichier);

		$obj_infos = $objReader->listWorksheetInfo($fichier);

		// XXX: indépendant du readFilter ?

		$nb_lignes = $obj_infos[0]['totalRows'];

		$donnees = $objPHPExcel->getActiveSheet()->toArray(NULL, FALSE, FALSE, TRUE);

		$filtre->exclues = self::detectionEntete($donnees[1]);

		$obs_ajouts = 0;

		$obs_maj = 0;

		$nb_images_ajoutees = 0;

		$nb_mots_cle_ajoutes = 0;

		$dernier_ordre = $this->requeter("SELECT MAX(ordre) AS ordre FROM cel_obs WHERE ce_utilisateur = $id_utilisateur");

		$dernier_ordre = intval($dernier_ordre[0]['ordre']) + 1;

		if(! $dernier_ordre) $dernier_ordre = 0;

		// on catch to les trigger_error(E_USER_NOTICE);

		set_error_handler(array($this, 'erreurs_stock'), E_USER_NOTICE);

		// lecture par morceaux (chunks), NB_LIRE_LIGNE_SIMUL lignes à fois

		// pour aboutir des requêtes SQL d'insert groupés.

		for($ligne = 2; $ligne < $nb_lignes + NB_LIRE_LIGNE_SIMUL; $ligne += NB_LIRE_LIGNE_SIMUL) {

			$filtre->def_interval($ligne, NB_LIRE_LIGNE_SIMUL);

			$objReader->setReadFilter($filtre);

			/* recharge avec $filtre actif (filtre sur lignes colonnes):

			   - exclue les colonnes inutiles/inutilisables)

			   - ne selectionne que les lignes dans le range [$ligne - $ligne + NB_LIRE_LIGNE_SIMUL] */

			$objPHPExcel = $objReader->load($fichier);

			$donnees = $objPHPExcel->getActiveSheet()->toArray(NULL, FALSE, FALSE, TRUE);

			// ici on appel la fonction qui fera effectivement l'insertion multiple

			// à partir des (au plus) NB_LIRE_LIGNE_SIMUL lignes

			// TODO: passer $this, ne sert que pour appeler des méthodes publiques qui pourraient être statiques

			// notamment dans RechercheInfosTaxonBeta.php

			list($enregistrements, $images, $mots_cle) =

				self::chargerLignes($this, $donnees, $this->colonnes_statiques, $dernier_ordre);

			if(! $enregistrements) break;

			self::trierColonnes($enregistrements);

			// normalement: NB_LIRE_LIGNE_SIMUL, sauf si une enregistrement ne semble pas valide

			// ou bien lors du dernier chunk

			$nb_rec = count($enregistrements);

			$sql_pattern = self::$insert_prefix .

				str_repeat(self::$insert_ligne_pattern_ordre . ', ', $nb_rec - 1) .

				self::$insert_ligne_pattern_ordre;

			$sql_pattern = self::$insert_prefix .

				str_repeat(self::$insert_ligne_pattern . ', ', $nb_rec - 1) .

				self::$insert_ligne_pattern;

			$this->bdd->beginTransaction();

			$stmt = $this->bdd->prepare($sql_pattern);

			$donnees = array();

			foreach($enregistrements as $e) $donnees = array_merge($donnees, array_values($e));

			/* debug ici: echo $sql_pattern . "\n"; var_dump($enregistrements, $donnees); die;*/

			$stmt->execute($donnees);

			// $stmt->debugDumpParams(); // https://bugs.php.net/bug.php?id=52384

			$dernier_autoinc = $this->bdd->lastInsertId();

			$this->bdd->commit();

			if(! $dernier_autoinc) trigger_error("l'insertion semble avoir échoué", E_USER_NOTICE);

			$obs_ajouts += count($enregistrements);

			// $obs_ajouts += count($enregistrements['insert']);

			// $obs_maj += count($enregistrements['update']);

			$nb_images_ajoutees += self::stockerImages($this, $enregistrements, $images, $dernier_autoinc);

			$nb_mots_cle_ajoutes += self::stockerMotsCle($this, $enregistrements, $mots_cle, $dernier_autoinc);

		}

		restore_error_handler();

		if($this->bilan) echo implode("\n", $this->bilan) . "\n";

 		$summary = sprintf("%d observation(s) ajoutée(s)\n%d image(s) attachée(s)\n%d mot(s)-clé ajouté(s) [TODO]\ncolonnes non-traitées: %s\n",

						   $obs_ajouts,

						   $nb_images_ajoutees,

						   $nb_mots_cle_ajoutes,

						   implode(', ', $filtre->exclues));

		die("$summary");

	}

	static function detectionEntete($entete) {

		$colonnes_reconnues = Array();

		$cols = FormateurGroupeColonne::nomEnsembleVersListeColonnes('standard,avance');

		foreach($entete as $k => $v) {

			$entete_simple = iconv('UTF-8', 'ASCII//TRANSLIT', strtolower(trim($v)));

			foreach($cols as $col) {

				$entete_officiel_simple = iconv('UTF-8', 'ASCII//TRANSLIT', strtolower(trim($col['nom'])));

				$entete_officiel_abbrev = $col['abbrev'];

				if($entete_simple == $entete_officiel_simple || $entete_simple == $entete_officiel_abbrev) {

					// debug echo "define C_" . strtoupper($entete_officiel_abbrev) . ", $k ($v)\n";

					define("C_" . strtoupper($entete_officiel_abbrev), $k);

					$colonnes_reconnues[$k] = 1;

					break;

				}

			}

		}

		// prépare le filtre de PHPExcel qui évitera le traitement de toutes les colonnes superflues

		// eg: diff ( Array( H => Commune, I => rien ) , Array( H => 1, K => 1 )

		// ==> Array( I => rien )

		$colonnesID_non_reconnues = array_diff_key($entete, $colonnes_reconnues);

		// des colonnes de FormateurGroupeColonne::nomEnsembleVersListeColonnes()

		// ne retient que celles marquées "importables"

		$colonnes_automatiques = array_filter($cols, '__anonyme_1');

		// ne conserve que le nom long pour matcher avec la ligne XLS d'entête

		array_walk($colonnes_automatiques, '__anonyme_2');

		// intersect ( Array ( N => Milieu, S => Ordre ), Array ( ordre => Ordre, phenologie => Phénologie ) )

		// ==> Array ( S => Ordre, AA => Phénologie )

		$colonnesID_a_exclure = array_intersect($entete, $colonnes_automatiques);

		// TODO: pourquoi ne pas comparer avec les abbrevs aussi ?

		// merge ( Array( I => rien ) , Array ( S => Ordre, AA => Phénologie ) )

		// ==> Array ( I => rien, AA => Phénologie )

		return array_merge($colonnesID_non_reconnues, $colonnesID_a_exclure);

	}

	/*

	 * charge un groupe de lignes

	 */

	static function chargerLignes($cel, $lignes, $colonnes_statiques, &$dernier_ordre) {

		$enregistrement = NULL;

		$enregistrements = Array();

		$toutes_images = Array();

		$tous_mots_cle = Array();

		foreach($lignes as $ligne) {

			//$ligne = array_filter($ligne, function($cell) { return !is_null($cell); });

			//if(!$ligne) continue;

			// on a besoin des NULL pour éviter des notice d'index indéfini

			if(! array_filter($ligne, '__anonyme_3')) continue;

			if( ($enregistrement = self::chargerLigne($ligne, $dernier_ordre, $cel)) ) {

				// $enregistrements[] = array_merge($colonnes_statiques, $enregistrement);

				$enregistrements[] = $enregistrement;

				$pos = count($enregistrements) - 1;

				$last = &$enregistrements[$pos];

				if(isset($enregistrement['_images'])) {

					// ne dépend pas de cel_obs, et seront insérées *après* les enregistrements

					// mais nous ne voulons pas nous priver de faire des INSERT multiples pour autant

					$toutes_images[] = Array("images" => $last['_images'],

											 "obs_pos" => $pos);

					// ce champ n'a pas à faire partie de l'insertion dans cel_obs,

					// mais est utile pour cel_obs_images

					unset($last['_images']);

				}

				if(isset($enregistrement['_mots_cle'])) {

					// ne dépend pas de cel_obs, et seront insérés *après* les enregistrements

					// mais nous ne voulons pas nous priver de faire des INSERT multiples pour autant

					$tous_mots_cle[] = Array("mots_cle" => $last['_mots_cle'],

											 "obs_pos" => $pos);

					// la version inlinée des mots est enregistrées dans cel_obs

					// mais cel_mots_cles_obs fait foi.

					// XXX: postponer l'ajout de ces informations dans cel_obs *après* l'insertion effective

					// des records dans cel_mots_cles_obs ?

					unset($last['_mots_cle']);

				}

				$dernier_ordre++;

			}

		}

		// XXX future: return Array($enregistrements_a_inserer, $enregistrements_a_MAJ, $toutes_images);

		return Array($enregistrements, $toutes_images, $tous_mots_cle);

	}

	static function trierColonnes(&$enregistrements) {

		foreach($enregistrements as &$enregistrement) {

			$enregistrement = self::sortArrayByArray($enregistrement, self::$ordre_BDD);

			//array_walk($enregistrement, function(&$item, $k) { $item = is_null($item) ? "NULL" : $item; });

			//$req .= implode(', ', $enregistrement) . "\n";

		}

	}

	static function stockerMotsCle($cel, $enregistrements, $tous_mots_cle, $lastid) {

		$c = 0;

		// debug: var_dump($tous_mots_cle);die;

		foreach($tous_mots_cle as $v) $c += count($v['mots_cle']['to_insert']);

		return $c;

	}

	static function stockerImages($cel, $enregistrements, $toutes_images, $lastid) {

		$images_insert = 'INSERT INTO cel_obs_images (id_image, id_observation) VALUES %s ON DUPLICATE KEY UPDATE id_image = id_image';

		$images_obs_assoc = Array();

		foreach($toutes_images as $images_pour_obs) {

			$obs = $enregistrements[$images_pour_obs["obs_pos"]];

			$id_obs = $lastid // dernier autoinc inséré

				- count($enregistrements) + 1 // correspondrait au premier autoinc

				+ $images_pour_obs["obs_pos"]; // ordre d'insertion = ordre dans le tableau $enregistrements (commence à 0)

			foreach($images_pour_obs['images'] as $image) {

				$images_obs_assoc[] = sprintf('(%d,%d)',

											  $image['id_image'], // intval() useless

											  $id_obs); // intval() useless

			}

		}

		if($images_obs_assoc) {

			$requete = sprintf($images_insert, implode(', ', $images_obs_assoc));

			// debug echo "$requete\n";

			$cel->requeter($requete);

		}

		return count($images_obs_assoc);

	}

	/*

	  Aucune des valeurs présentes dans $enregistrement n'est quotée

	  cad aucune des valeurs retournée par traiter{Espece|Localisation}()

	  car ce tableau est passé à un PDO::preparedStatement() qui applique

	  proprement les règle d'échappement.

	 */

	static function chargerLigne($ligne, $dernier_ordre, $cel) {

		// en premier car le résultat est utile pour

		// traiter longitude et latitude (traiterLonLat())

		$referentiel = self::identReferentiel($ligne[C_NOM_REFERENTIEL]);

		// $espece est rempli de plusieurs informations

		$espece = Array(C_NOM_SEL => NULL, C_NOM_SEL_NN => NULL, C_NOM_RET => NULL,

						C_NOM_RET_NN => NULL, C_NT => NULL, C_FAMILLE => NULL);

		self::traiterEspece($ligne, $espece, $cel);

		// $localisation est rempli à partir de plusieurs champs: C_ZONE_GEO et C_CE_ZONE_GEO

		$localisation = Array(C_ZONE_GEO => NULL, C_CE_ZONE_GEO => NULL);

		self::traiterLocalisation($ligne, $localisation, $cel);

		// $transmission est utilisé pour date_transmission

		// XXX: @ contre "Undefined index"

		@$transmission = in_array(strtolower(trim($ligne[C_TRANSMISSION])), array(1, 'oui')) ? 1 : 0;

		// Dans ce tableau, seules devraient apparaître les données variable pour chaque ligne.

		// Dans ce tableau, l'ordre des clefs n'importe pas (cf: self::sortArrayByArray())

		$enregistrement = Array(

			"ordre" => $dernier_ordre,

			"nom_sel" => $espece[C_NOM_SEL],

			"nom_sel_nn" => $espece[C_NOM_SEL_NN],

			"nom_ret" => $espece[C_NOM_RET],

			"nom_ret_nn" => $espece[C_NOM_RET_NN],

			"nt" => $espece[C_NT],

			"famille" => $espece[C_FAMILLE],

			"nom_referentiel" => $referentiel,

			"zone_geo" => $localisation[C_ZONE_GEO],

			"ce_zone_geo" => $localisation[C_CE_ZONE_GEO],

			// $ligne: uniquement pour les infos en cas de gestion d'erreurs (date incompréhensible)

			"date_observation" => self::traiterDateObs($ligne[C_DATE_OBSERVATION], $ligne),

			"lieudit" => isset($ligne[C_LIEUDIT]) ? trim($ligne[C_LIEUDIT]) : NULL,

			"station" => isset($ligne[C_STATION]) ? trim($ligne[C_STATION]) : NULL,

			"milieu" => isset($ligne[C_MILIEU]) ? trim($ligne[C_MILIEU]) : NULL,

			"mots_cles_texte" => NULL, // TODO: foreign-key

			// XXX: @ contre "Undefined index"

			"commentaire" => isset($ligne[C_COMMENTAIRE]) ? trim($ligne[C_COMMENTAIRE]) : NULL,

			"transmission" => $transmission,

			"date_transmission" => $transmission ? date("Y-m-d H:i:s") : NULL, // pas de fonction SQL dans un PDO statement, <=> now()

			// $ligne: uniquement pour les infos en cas de gestion d'erreurs (lon/lat incompréhensible)

			"latitude" => isset($ligne[C_LATITUDE]) ? self::traiterLonLat(NULL, $ligne[C_LATITUDE], $referentiel, $ligne) : NULL,

			"longitude" => isset($ligne[C_LONGITUDE]) ? self::traiterLonLat($ligne[C_LONGITUDE], NULL, $referentiel, $ligne) : NULL,

			"altitude" => isset($ligne[C_ALTITUDE]) ? intval($ligne[C_ALTITUDE]) : NULL, // TODO: guess alt from lon/lat

			// @ car potentiellement optionnelles ou toutes vides => pas d'index dans PHPExcel (tableau optimisé)

			"abondance" => @$ligne[C_ABONDANCE],

			"certitude" => @$ligne[C_CERTITUDE],

			"phenologie" => @$ligne[C_PHENOLOGIE],

			"code_insee_calcule" => substr($localisation[C_CE_ZONE_GEO], -5) // varchar(5)

		);

		// passage de $enregistrement par référence, ainsi ['_images'] n'est défini

		// que si des résultats sont trouvés

		// "@" car PHPExcel supprime les colonnes null sur toute la feuille (ou tout le chunk)

		if(@$ligne[C_IMAGES]) self::traiterImage($ligne[C_IMAGES], $cel, $enregistrement);

		if(@$ligne[C_MOTS_CLES_TEXTE]) self::traiterMotsCle($ligne[C_MOTS_CLES_TEXTE], $cel, $enregistrement);

		return $enregistrement;

	}

	static function traiterImage($str, $cel, &$enregistrement) {

		$liste_images = array_filter(explode("/", $str));

		//array_walk($liste_images, '__anonyme_4', $cel);

		array_walk($liste_images, array(__CLASS__, '__anonyme_4'), $cel);

		$requete = sprintf(

			"SELECT id_image, nom_original FROM cel_images WHERE ce_utilisateur = %d AND nom_original IN (\"%s\")",

			$cel->id_utilisateur,

			implode('","', $liste_images));

		$resultat = $cel->requeter($requete);

		if($resultat) $enregistrement['_images'] = $resultat;

	}

	static function traiterMotsCle($str, $cel, &$enregistrement) {

		$liste_mots_cle = $liste_mots_cle_recherche = array_map("trim", array_unique(array_filter(explode(",", $str))));

		array_walk($liste_mots_cle_recherche, array(__CLASS__, '__anonyme_4'), $cel);

		// TODO!!!! remplace > (pour les tests uniquement) par un = et supprimer le group by mot_cle

		$requete = sprintf("SELECT id_mot_cle_obs, mot_cle FROM cel_mots_cles_obs WHERE id_utilisateur > %d ".

						   "AND mot_cle IN (%s) ".

						   "GROUP BY mot_cle",

						   $cel->id_utilisateur,

						   implode(',', $liste_mots_cle_recherche));

		$resultat_sql = $cel->requeter($requete);

		if(!$resultat_sql) return;

		$resultat = array();

		foreach($resultat_sql as $v) $resultat[$v['id_mot_cle_obs']] = $v['mot_cle'];

		$enregistrement['mots_cles_texte'] = implode(',', $liste_mots_cle);

		$enregistrement['_mots_cle'] = array("existing" => $resultat,

											 "to_insert" => array_diff($liste_mots_cle, $resultat));

	}

	/* FONCTIONS de TRANSFORMATION de VALEUR DE CELLULE */

	// TODO: PHP 5.3, utiliser date_parse_from_format()

	// TODO: parser les heures (cf product-owner)

	// TODO: passer par le timestamp pour s'assurer de la validité

	static function traiterDateObs($date, $ligne) {

		// TODO: see https://github.com/PHPOffice/PHPExcel/issues/208

		if(is_double($date)) {

			if($date > 0)

				return PHPExcel_Style_NumberFormat::toFormattedString($date, PHPExcel_Style_NumberFormat::FORMAT_DATE_YYYYMMDD2) . " 00:00:00";

			trigger_error("ligne \"{$ligne[C_NOM_SEL]}\": " .

						  "Attention: date antérieure à 1970 et format de cellule \"DATE\" utilisés ensemble",

						  E_USER_NOTICE);

			// throw new Exception("erreur: date antérieure à 1970 et format de cellule \"DATE\" utilisés ensemble");

			// attention, UNIX timestamp, car Excel les décompte depuis 1900

			// cf http://fczaja.blogspot.fr/2011/06/convert-excel-date-into-timestamp.html

			// $timestamp = ($date - MIN_DATES_DIFF) * 60 * 60 * 24 - time(); // NON

			// $timestamp = PHPExcel_Calculation::getInstance()->calculateFormula("=" . $date . "-DATE(1970,1,1)*60*60*24"); // NON

			// echo strftime("%Y/%m/%d 00:00:00", $timestamp); // NON

		}

		else {

			// attend l'un des formats de

			// http://www.php.net/manual/fr/datetime.formats.date.php

			// le plus simple: YYYY/MM/DD (utilisé à l'export)

			$timestamp = strtotime($date);

			if(! $timestamp) {

				if($date) trigger_error("ligne \"{$ligne[C_NOM_SEL]}\": Attention: date erronée ($date)", E_USER_NOTICE);

				return NULL;

			}

			return strftime("%Y-%m-%d 00:00:00", $timestamp);

		}

	}

	static function identReferentiel($referentiel) {

		// SELECT DISTINCT nom_referentiel, COUNT(id_observation) AS count FROM cel_obs GROUP BY nom_referentiel ORDER BY count DESC;

		if(strpos(strtolower($referentiel), 'bdtfx') !== FALSE) return 'bdtfx:v1.01';

		if(strpos(strtolower($referentiel), 'bdtxa') !== FALSE) return 'bdtxa:v1.00';

		if(strpos(strtolower($referentiel), 'bdnff') !== FALSE) return 'bdnff:4.02';

		if(strpos(strtolower($referentiel), 'isfan') !== FALSE) return 'isfan:v1.00';

		if($referentiel) {

			trigger_error("ligne \"{$ligne[C_NOM_SEL]}\": Attention: référentiel inconnu", E_USER_NOTICE);

		}

		return NULL;

		/* TODO: cf story,

		   En cas de NULL faire une seconde passe de détection à partir du nom saisi

		   + accepter les n° de version */

	}

	static function traiterLonLat($lon = NULL, $lat = NULL, $referentiel = 'bdtfx:v1.01', $ligne) {

		// en CSV ces valeurs sont des string, avec séparateur en français (","; cf défauts dans ExportXLS)

		if($lon && is_string($lon)) $lon = str_replace(',', '.', $lon);

		if($lat && is_string($lat)) $lat = str_replace(',', '.', $lat);

		// sprintf applique une précision à 5 décimale (comme le ferait MySQL)

		// tout en uniformisant le format de séparateur des décimales (le ".")

		if($lon && is_numeric($lon) && $lon >= -180 && $lon <= 180) return sprintf('%.5F', $lon);

		if($lat && is_numeric($lat) && $lat >= -90 && $lat <= 90) return sprintf('%.5F', $lat);

		if($lon || $lat) {

			trigger_error("ligne \"{$ligne[C_NOM_SEL]}\": " .

						  "Attention: longitude ou latitude erronée",

						  E_USER_NOTICE);

		}

		return NULL;

		/* limite france métropole si bdtfx ? ou bdtxa ? ...

		   NON!

		   Un taxon d'un référentiel donné peut être théoriquement observé n'importe où sur le globe.

		   Il n'y a pas lieu d'effectuer des restriction ici.

		   Cependant des erreurs fréquentes (0,0 ou lon/lat inversées) peuvent être détectés ici.

		   TODO */

		$bbox = self::getReferentielBBox($referentiel);

		if(!$bbox) return NULL;

		if($lon) {

			if($lon < $bbox['EST'] && $lon > $bbox['OUEST']) return is_numeric($lon) ? $lon : NULL;

			else return NULL;

		}

		if($lat) {

			if($lat < $bbox['NORD'] && $lat > $bbox['SUD']) return is_numeric($lat) ? $lat : NULL;

			return NULL;

		}

	}

	/*

	  TODO: s'affranchir du webservice pour la détermination du nom scientifique en s'appuyant sur cel_references,

	  pour des questions de performances

	*/

	static function traiterEspece($ligne, Array &$espece, $cel) {

		if(!$ligne[C_NOM_SEL]) return;

		// nom_sel reste toujours celui de l'utilisateur

		$espece[C_NOM_SEL] = trim($ligne[C_NOM_SEL]);

		$taxon_info_webservice = new RechercheInfosTaxonBeta($cel->config);

		$ascii = iconv('UTF-8', 'ASCII//TRANSLIT', $ligne[C_NOM_SEL]);

		// TODO: si empty(C_NOM_SEL) et !empty(C_NOM_SEL_NN) : recherche info à partir de C_NOM_SEL_NN

		// echo "rechercherInformationsComplementairesSurNom()\n";

		/*

		  SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu ,auteur, annee, biblio_origine, nom_sci,auteur  FROM bdtfx_v1_01  WHERE (nom_sci LIKE 'Heliotropium europaeum')  ORDER BY nom_sci ASC   LIMIT 0, 1

		  #

		  SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu ,auteur, annee, biblio_origine, nom_sci,auteur  FROM bdtfx_v1_01  WHERE (nom_sci LIKE 'eliotropium euro')  ORDER BY nom_sci ASC   LIMIT 0, 1

		  SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu ,auteur, annee, biblio_origine, nom_sci,auteur  FROM bdtfx_v1_01  WHERE (nom_sci LIKE 'eliotropium')  ORDER BY nom_sci ASC   LIMIT 0, 1

		  SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu ,auteur, annee, biblio_origine, nom_sci,auteur  FROM bdtfx_v1_01  WHERE (nom_sci LIKE 'eliotropium% euro%')  ORDER BY nom_sci ASC   LIMIT 0, 1

		  #

		  SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html, auteur, annee, biblio_origine FROM bdtfx_v1_01 WHERE num_nom = 31468

		*/

		// $resultat_recherche_espece = $taxon_info_webservice->rechercherInformationsComplementairesSurNom($ligne[C_NOM_SEL]);

		// permet une reconnaissance de BDNFFnnXXXX

		$resultat_recherche_espece = $taxon_info_webservice->rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax(trim($ligne[C_NOM_SEL]));

		// note: rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax peut ne retourner qu'une seule clef "nom_sel"

		if (! $resultat_recherche_espece || !isset($resultat_recherche_espece['en_id_nom'])) {

			// on supprime les noms retenus et renvoi tel quel

			// on réutilise les define pour les noms d'indexes, tant qu'à faire

			// XXX; tout à NULL sauf C_NOM_SEL ci-dessus ?

			$espece[C_NOM_SEL_NN] = $ligne[C_NOM_SEL_NN];

			$espece[C_NOM_RET] = $ligne[C_NOM_RET];

			$espece[C_NOM_RET_NN] = $ligne[C_NOM_RET_NN];

			$espece[C_NT] = $ligne[C_NT];

			$espece[C_FAMILLE] = $ligne[C_FAMILLE];

			return;

		}

		// succès de la détection = écrasement du numéro nomenclatural saisi...

		$espece[C_NOM_SEL_NN] = $resultat_recherche_espece['en_id_nom'];

		// et des info complémentaires

		// echo "rechercherInformationsComplementairesSurNumNom()\n";

		$complement = $taxon_info_webservice->rechercherInformationsComplementairesSurNumNom($resultat_recherche_espece['en_id_nom']);

		/*

		  // GET /service:eflore:0.1/bdtfx/noms/31468?retour.champs=nom_sci,auteur,id,nom_retenu_complet,nom_retenu.id,num_taxonomique,famille

		  /home/raphael/eflore/projets/services/modules/0.1/bdtfx/Noms.php:280

		  SELECT  *, nom_sci   FROM bdtfx_v1_01  WHERE num_nom = '31468'

		  SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html, auteur, annee, biblio_origine FROM bdtfx_v1_01 WHERE num_nom = 31468

		  SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html, auteur, annee, biblio_origine FROM bdtfx_v1_01 WHERE num_nom = 86535

		*/

		$espece[C_NOM_RET] = $complement['Nom_Retenu'];

		$espece[C_NOM_RET_NN] = $complement['Num_Nom_Retenu'];

		$espece[C_NT] = $complement['Num_Taxon'];

		$espece[C_FAMILLE] = $complement['Famille'];

		//var_dump("a", $espece);die;

	}

	static function detectFromNom($nom, $cel) {

		$r = $cel->requeter(sprintf("SELECT num_nom, num_tax_sup FROM bdtfx_v1_01 WHERE (nom_sci LIKE '%s') ".

									"ORDER BY nom_sci ASC LIMIT 0, 1",

									$cel->proteger($nom)));

		if($r) return $r;

		$cel->requeter(sprintf("SELECT num_nom, num_tax_sup FROM bdtfx_v1_01 WHERE (nom_sci LIKE '%s' OR nom LIKE '%s') ".

							   "ORDER BY nom_sci ASC LIMIT 0, 1",

							   $cel->proteger($nom),

							   $cel->proteger(str_replace(' ', '% ', $nom))));

		return $r;

	}

	static function traiterLocalisation($ligne, Array &$localisation, $cel) {

	    $identifiant_commune = trim($ligne[C_ZONE_GEO]);

		if(!$identifiant_commune) {

			$departement = trim($ligne[C_CE_ZONE_GEO]);

			if(strpos($departement, "INSEE-C:", 0) === 0) {

				$localisation[C_ZONE_GEO] = $localisation[C_ZONE_GEO];

				$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $localisation[C_CE_ZONE_GEO];

			}

			if(!is_numeric($departement)) {

				$localisation[C_ZONE_GEO] = $localisation[C_ZONE_GEO];

				$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $localisation[C_CE_ZONE_GEO];

			}

			if(strlen($departement) == 4) $departement = "INSEE-C:0" . $departement;

			if(strlen($departement) == 5) $departement = "INSEE-C:" . $departement;

			// if(strlen($departement) <= 9) return "INSEE-C:0" . $departement; // ? ... TODO

			$departement = trim($departement); // TODO

			$localisation[C_ZONE_GEO] = $localisation[C_ZONE_GEO];

			$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $localisation[C_CE_ZONE_GEO];

		}

		$select = "SELECT DISTINCT nom, code  FROM cel_zones_geo";

		if (preg_match('/(.*) \((\d+)\)/', $identifiant_commune, $elements)) {

			// commune + departement : montpellier (34)

			$nom_commune=$elements[1];

			$code_commune=$elements[2];

	 	    $requete = sprintf("%s WHERE nom = %s AND code LIKE %s",

							   $select, $cel->quoteNonNull($nom_commune), $cel->quoteNonNull($code_commune.'%'));

		}

		elseif (preg_match('/^(\d+|(2[ab]\d+))$/i', $identifiant_commune, $elements)) {

			// Code insee seul

			$code_insee_commune=$elements[1];

	 	    $requete = sprintf("%s WHERE code = %s", $select, $cel->quoteNonNull($code_insee_commune));

		}

		else {

			// Commune seule (le departement sera recupere dans la colonne departement si elle est presente)

			// on prend le risque ici de retourner une mauvaise Commune

			$nom_commune = str_replace(" ", "%", iconv('UTF-8', 'ASCII//TRANSLIT', $identifiant_commune));

	 	    $requete = sprintf("%s WHERE nom LIKE %s", $select, $cel->quoteNonNull($nom_commune.'%'));

		}

		$resultat_commune = $cel->requeter($requete);

		// TODO: levenstein sort ?

		// cas de la commune introuvable dans le référentiel

		// réinitialisation aux valeurs du fichier XLS

		if(! $resultat_commune) {

			$localisation[C_ZONE_GEO] = trim($ligne[C_ZONE_GEO]);

			$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = trim($ligne[C_CE_ZONE_GEO]);

		} else {

			$localisation[C_ZONE_GEO] = $resultat_commune[0]['nom'];

			$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $resultat_commune[0]['code'];

		}

		$departement = &$localisation[C_CE_ZONE_GEO];

		if(strpos($departement, "INSEE-C:", 0) === 0) {

			$localisation[C_ZONE_GEO] = $localisation[C_ZONE_GEO];

			$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $localisation[C_CE_ZONE_GEO];

		}

		if(!is_numeric($departement)) {

			$localisation[C_ZONE_GEO] = $localisation[C_ZONE_GEO];

			$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $localisation[C_CE_ZONE_GEO];

		}

		if(strlen($departement) == 4) $departement = "INSEE-C:0" . $departement;

		if(strlen($departement) == 5) $departement = "INSEE-C:" . $departement;

		// if(strlen($departement) <= 9) return "INSEE-C:0" . $departement; // ? ... TODO

		$departement = trim($departement); // TODO

		$localisation[C_ZONE_GEO] = $localisation[C_ZONE_GEO];

		$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $localisation[C_CE_ZONE_GEO];

	}

	/*

	static function traiterLocalisation($ligne, Array &$localisation, $cel) {

	    $identifiant_commune = trim($ligne[C_ZONE_GEO]);

		if(!$identifiant_commune) {

			$departement = trim($ligne[C_CE_ZONE_GEO]);

			goto testdepartement;

		}

		$select = "SELECT DISTINCT nom, code  FROM cel_zones_geo";

		if (preg_match('/(.*) \((\d+)\)/', $identifiant_commune, $elements)) {

			// commune + departement : montpellier (34)

			$nom_commune=$elements[1];

			$code_commune=$elements[2];

	 	    $requete = sprintf("%s WHERE nom = %s AND code LIKE %s",

							   $select, $cel->quoteNonNull($nom_commune), $cel->quoteNonNull($code_commune.'%'));

		}

		elseif (preg_match('/^(\d+|(2[ab]\d+))$/i', $identifiant_commune, $elements)) {

			// Code insee seul

			$code_insee_commune=$elements[1];

	 	    $requete = sprintf("%s WHERE code = %s", $select, $cel->quoteNonNull($code_insee_commune));

		}

		else {

			// Commune seule (le departement sera recupere dans la colonne departement si elle est presente)

			// on prend le risque ici de retourner une mauvaise Commune

			$nom_commune = str_replace(" ", "%", iconv('UTF-8', 'ASCII//TRANSLIT', $identifiant_commune));

	 	    $requete = sprintf("%s WHERE nom LIKE %s", $select, $cel->quoteNonNull($nom_commune.'%'));

		}

		$resultat_commune = $cel->requeter($requete);

		// TODO: levenstein sort ?

		// cas de la commune introuvable dans le référentiel

		// réinitialisation aux valeurs du fichier XLS

		if(! $resultat_commune) {

			$localisation[C_ZONE_GEO] = trim($ligne[C_ZONE_GEO]);

			$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = trim($ligne[C_CE_ZONE_GEO]);

		} else {

			$localisation[C_ZONE_GEO] = $resultat_commune[0]['nom'];

			$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $resultat_commune[0]['code'];

		}

		$departement = &$localisation[C_CE_ZONE_GEO];

	testdepartement:

		if(strpos($departement, "INSEE-C:", 0) === 0) goto protectloc;

		if(!is_numeric($departement)) goto protectloc; // TODO ?

		if(strlen($departement) == 4) $departement = "INSEE-C:0" . $departement;

		if(strlen($departement) == 5) $departement = "INSEE-C:" . $departement;

		// if(strlen($departement) <= 9) return "INSEE-C:0" . $departement; // ? ... TODO

		$departement = trim($departement); // TODO

	protectloc:

		$localisation[C_ZONE_GEO] = $localisation[C_ZONE_GEO];

		$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $localisation[C_CE_ZONE_GEO];

	}

*/

	/* HELPERS */

	// http://stackoverflow.com/questions/348410/sort-an-array-based-on-another-array

	// XXX; utilisé aussi (temporairement ?) par FormateurGroupeColonne.

	static function sortArrayByArray($array, $orderArray) {

		$ordered = array();

		foreach($orderArray as $key) {

			if(array_key_exists($key, $array)) {

				$ordered[$key] = $array[$key];

				unset($array[$key]);

			}

		}

		return $ordered + $array;

	}

	// retourne une BBox [N,S,E,O) pour un référentiel donné

	static function getReferentielBBox($referentiel) {

		if($referentiel == 'bdtfx:v1.01') return Array(

			'NORD' => 51.2, // Dunkerque

			'SUD' => 41.3, // Bonifacio

			'EST' => 9.7, // Corse

			'OUEST' => -5.2); // Ouessan

		return FALSE;

	}

	// ces valeurs ne sont pas inséré via les placeholders du PDO::preparedStatement

	// et doivent donc être échappées correctement.

	public function initialiser_colonnes_statiques() {

		$this->colonnes_statiques = array_merge($this->colonnes_statiques,

												Array(

													"ce_utilisateur" => $this->id_utilisateur,

													"prenom_utilisateur" => $this->quoteNonNull($this->utilisateur['prenom']),

													"nom_utilisateur" => $this->quoteNonNull($this->utilisateur['nom']),

													"courriel_utilisateur" => $this->quoteNonNull($this->utilisateur['courriel']),

												));

	}

	static function initialiser_pdo_ordered_statements($colonnes_statiques) {

		return Array(

			// insert_ligne_pattern_ordre

			sprintf('INSERT INTO cel_obs (%s, %s) VALUES',

					implode(', ', array_keys($colonnes_statiques)),

					implode(', ', array_diff(self::$ordre_BDD, array_keys($colonnes_statiques)))),

			// insert_ligne_pattern_ordre

			sprintf('(%s, %s ?)',

					implode(', ', $colonnes_statiques),

					str_repeat('?, ', count(self::$ordre_BDD) - count($colonnes_statiques) - 1))

		);

	}

	static function initialiser_pdo_statements($colonnes_statiques) {

		return Array(

			// insert_prefix

			sprintf('INSERT INTO cel_obs (%s) VALUES ',

					implode(', ', self::$ordre_BDD)),

			// insert_ligne_pattern, cf: self::$insert_ligne_pattern

			'(' .

			// 3) créé une chaîne de liste de champ à inséré en DB

			implode(', ', array_values(

				// 2) garde les valeurs fixes (de $colonnes_statiques),

				// mais remplace les NULL par des "?"

				array_map('__anonyme_5',

						  // 1) créé un tableau genre (nom_sel_nn => NULL) depuis self::$ordre_BDD

						  // et écrase certaines valeurs avec $colonnes_statiques (initilisé avec les données utilisateur)

						  array_merge(array_map('__anonyme_6', array_flip(self::$ordre_BDD)), $colonnes_statiques

				)))) .

			')'

		);

	}

	// équivalent à CEL->Bdd->proteger() (qui wrap PDO::quote),

	// sans transformer NULL en ""

	private function quoteNonNull($chaine) {

		if(is_null($chaine)) return "NULL";

		if(!is_string($chaine)) die("erreur __FILE__, __LINE__");

		return $this->bdd->quote($chaine);

	}

	public function erreurs_stock($errno, $errstr) {

		$this->bilan[] = $errstr;

	}

}