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Rev Author Line No. Line
417 aurelien 1 
<?php
2 
 
3 
// In : utf8
4 
// Out : utf8
5 
 
483 david 6 
 
7 
// TODO : traiter image multilignes
540 david 8 
// TODO : doublons
483 david 9 
 
480 david 10 
/*
417 aurelien 11 
 
480 david 12 
Octobre 2010 David Delon.
13 
Import d'observations dans le carnet en ligne à partir d'un fichier excel chargé par l'utilisateur
14 
et liaison d'images déjà chargee aux observations ainsi crées.
417 aurelien 15 
 
480 david 16 
Nom des colonnes imposé, mais présence de toutes les colonnes non obligatoires, ordre non imposé
17 
Aucune valeur dans les colonnes n'est obligatoire
18 
Pour une ligne donnée, si tous les champs vides on ne fait rien, ou si seul le champ image est présent.
19 
Si la seule différence entre deux lignes est la valeur de la colonne image, on considère que c'est la même observation à laquelle on associe plusieurs images.
20 
Si au moins deux lignes (ou plus) sont complètement identiques on prend en compte une seule ligne (les doublons sont éliminés).
445 david 21 
 
480 david 22 
*/
445 david 23 
 
480 david 24 
 
25 
// Nom des colonnes
26 
 
445 david 27 
define('COMMUNE','commune'); // soit un nom de commune, soit un code INSEE (5 chiffres), ou "nom de commune (numero departement)"
28 
define('LIEUDIT','lieu-dit'); // Texte libre
29 
define('STATION','station'); // Texte libre
30 
define('MILIEU','milieu'); // Texte libre
31 
define('LATITUDE','latitude'); // En decimal systeme WGS84
32 
define('LONGITUDE','longitude'); // En decimal systeme WGS84
33 
define('NOTES','notes'); // Texte libre
34 
define('DATEOBS','date'); // date au format jj/mm/aaaa
35 
define('ESPECE','espece'); // texte libre, nom latin, ou code nomenclatural (format BDNFFnn999999)
36 
define('IMAGE','image'); //  nom des fichiers images préalablement uploadés sur le CEL séparés par des "/"
540 david 37 
define('DEPARTEMENT','departement'); //  Texte libre
445 david 38 
 
540 david 39 
 
480 david 40 
// Resultat de l'analyse d'une ligne
445 david 41 
define('LIGNE_VIDE',1); //
42 
define('LIGNE_NORMALE',2); //
43 
define('LIGNE_IMAGE_SEULEMENT',3); //
44 
 
540 david 45 
// Parser de Nom
46 
include('NameParser.php');
445 david 47 
 
417 aurelien 48 
Class InventoryImportExcel extends DBAccessor  {
49 
 
445 david 50 
// Element constituant une observation
417 aurelien 51 
 
540 david 52 
	var $format_observation=array(COMMUNE ,LIEUDIT ,STATION , DEPARTEMENT, MILIEU ,LATITUDE ,LONGITUDE ,NOTES ,DATEOBS ,ESPECE ,IMAGE );
480 david 53 
 
54 
// Fichier configuration
417 aurelien 55 
	var $config;
480 david 56 
 
57 
// Encapsulation classe lecture fichier excel
417 aurelien 58 
	var $extendExcelReader;
59 
 
540 david 60 
// Dernier numero d'ordre utilise
61 
	var $dernier_ordre=1;
62 
 
480 david 63 
/**
64 
 Constructeur
65 
**/
417 aurelien 66 
	function InventoryImportExcel($config) {
67 
 
68 
		$this->config=$config;
69 
		// Pas d'heritage multiple en php :(
70 
 
71 
		$this->extendExcelReader = new ExcelReader();
72 
		$this->extendExcelReader->initExcelReader();
540 david 73 
 
74 
/* Recherche dernier numero d'ordre utilise : pas de mise a jour concurente a priori */
75 
 
76 
 
417 aurelien 77 
	}
78 
 
480 david 79 
/**
80 
 Sur post
81 
**/
445 david 82 
	function createElement($pairs) {
417 aurelien 83 
 
84 
 
480 david 85 
		$pairs['utilisateur']=$_POST['identifiant'];
417 aurelien 86 
 
540 david 87 
        session_start();
88 
        $this->controleUtilisateur($pairs['utilisateur']);
480 david 89 
 
417 aurelien 90 
 
540 david 91 
        foreach($_FILES as $file) { // C'est le plus simple
92 
            $infos_fichier = $file ;
93 
        }
417 aurelien 94 
 
480 david 95 
 
96 
// Chargement tableau en memoire
445 david 97 
 
98 
		$data = new Spreadsheet_Excel_Reader($infos_fichier['tmp_name'], false); // false : pour menager la memoire.
480 david 99 
		$arr = array();
445 david 100 
 
101 
		$rowcount=$data->rowcount(0);
102 
		$colcount=$data->colcount(0);
103 
 
104 
		if ($rowcount<=1) { // TODO : retour erreur
105 
			print "Tableau vide";
106 
			exit;
107 
		}
108 
 
540 david 109 
// Chargement tableau
110 
        for($row=1;$row<=$rowcount;$row++)
111 
            for($col=1;$col<=$colcount;$col++)
112 
                $arr[$col][$row] = $data->val($row,$col,0); // Attention, inversion voulue
445 david 113 
 
540 david 114 
 
417 aurelien 115 
 
540 david 116 
// 1 : Traitement intitules
417 aurelien 117 
 
445 david 118 
		$line = array();
417 aurelien 119 
 
445 david 120 
/* Les colonnes ne sont pas forcemment dans l'ordre  : on les extrait pour traitement futur  */
121 
 
540 david 122 
        for($col=1;$col<=$colcount;$col++) {
123 
            $colonne=strtolower($arr[$col][1]);
124 
            $colonne=trim($colonne);
125 
            $colonne=cp1252_to_utf8($colonne);
126 
            $colonne=remove_accent($colonne);
127 
            switch ($colonne) {  // On ne garde que les colonnes que l'on souhaite traiter
128 
                case COMMUNE:
129 
                case LIEUDIT:
130 
                case STATION:
131 
                case MILIEU:
132 
                case DEPARTEMENT:
133 
                case LATITUDE:
134 
                case LONGITUDE:
135 
                case NOTES:
136 
                case DATEOBS:
137 
                case ESPECE:
138 
                case IMAGE:
139 
                    $selection=array_values($arr[$col]);
140 
                    array_shift($selection); // On ne garde pas la premiere ligne, qui contient les intitules
141 
                    $line[$colonne]=$selection;
142 
                    break;
445 david 143 
 
540 david 144 
            }
145 
        }
445 david 146 
 
147 
 
540 david 148 
//	print_r($line[COMMUNE]);
149 
//		print_r($line[LIEUDIT]);
150 
//		print_r($line[STATION]);
151 
//		print_r($line[MILIEU]);
152 
//		print_r($line[DEPARTEMENT]);
153 
//		print_r($line[LATITUDE]);
154 
//		print_r($line[LONGITUDE]);
155 
//		print_r($line[NOTES]);
156 
//		print_r($line[DATEOBS]);
157 
//		print_r($line[ESPECE]);
158 
//		print_r($line[IMAGE]);
159 
 
160 
 
445 david 161 
// 1 : Traitement lignes
162 
 
483 david 163 
		$cpt_obs=0;
540 david 164 
 
165 
 
166 
        /* Recherche dernier numero d'ordre utilise : pas de mise a jour concurente a priori */
167 
 
168 
 
169 
        $DB=$this->connectDB($this->config,'database_cel');
170 
        $query="SELECT MAX(ordre) AS ordre FROM cel_inventory WHERE identifiant='".$DB->escapeSimple($pairs['utilisateur'])."' ";
171 
 
172 
        $res =& $DB->query($query);
173 
        if (DB::isError($res)) {
174 
            die($res->getMessage());
175 
        }
176 
 
177 
        while ($row =& $res->fetchrow(DB_FETCHMODE_ASSOC)) {
178 
            $this->dernier_ordre=$row['ordre']; // 1  par defaut
179 
        }
180 
 
480 david 181 
		for ($i=0;$i<=$rowcount-1;$i++) {
540 david 182 
			// On saute les eventuelles lignes vides du debut et les lignes contenant des information sur image uniquement
480 david 183 
			while ((in_array($retour_analyse=$this->analyserLigne($line,$i),array(LIGNE_IMAGE_SEULEMENT, LIGNE_VIDE))) && ($i<=$rowcount)) {
184 
				if  ($retour_analyse==LIGNE_IMAGE_SEULEMENT) {
185 
	//				print "image non rattachee a une observation";
186 
				}
187 
				else {
188 
	//				print "vide";
189 
				}
445 david 190 
				$i++;
191 
			}
480 david 192 
			while (($this->analyserLigne($line,$i)==LIGNE_NORMALE) && ($i<=$rowcount)) {
540 david 193 
				$ordre=$this->traiterLigne($line,$i,$pairs['utilisateur'],$DB);
483 david 194 
				if ($ordre>0) {
195 
					$cpt_obs++; // Compteur d'observations crees
196 
				}
445 david 197 
				$i++;
480 david 198 
				// On saute les lignes vide ou on traite les lignes suivantes contenant des informations sur image seulement
199 
				while ((in_array($retour_analyse=$this->analyserLigne($line,$i),array(LIGNE_IMAGE_SEULEMENT, LIGNE_VIDE))) && ($i<=$rowcount)) {
445 david 200 
					if  ($retour_analyse==LIGNE_IMAGE_SEULEMENT) {
480 david 201 
						$this->traiterLigneComplement($line,$i,$pairs['utilisateur'],$ordre); // images supplementaires
445 david 202 
					}
203 
					else {
480 david 204 
	//					print "vide";
445 david 205 
					}
206 
					$i++;
207 
				}
208 
			}
209 
 
210 
 
211 
		}
540 david 212 
		//print $cpt_obs ." nouvelle(s) observation(s) !";
213 
		print $cpt_obs ;
445 david 214 
 
417 aurelien 215 
	}
216 
 
445 david 217 
function analyserLigne($line,$i) {
218 
	$ligne_vide=true;
219 
	$ligne_image_seulement=true;
220 
	$ligne_normale=true;
221 
	foreach ($this->format_observation as $colonne) {
222 
		if (isset ($line[$colonne][$i]) && $line[$colonne][$i]!='') {
223 
			if ($colonne!=IMAGE) {
224 
				$ligne_image_seulement=false;
225 
				$ligne_vide=false;
226 
				break;
227 
			}
228 
			$ligne_vide=false;
229 
		}
230 
	}
231 
	if ($ligne_vide) {
232 
		return LIGNE_VIDE;
233 
	}
234 
	else {
235 
		if ($ligne_image_seulement) {
236 
			return LIGNE_IMAGE_SEULEMENT;
237 
		}
238 
		else {
239 
			return LIGNE_NORMALE;
240 
		}
241 
	}
242 
 
417 aurelien 243 
 
445 david 244 
}
417 aurelien 245 
 
540 david 246 
function traiterLigne($line,$i,$utilisateur,$DB) { // Controle donnee et insertion
480 david 247 
	$info_image=array();
445 david 248 
	foreach ($this->format_observation as $colonne) {
249 
		if (isset ($line[$colonne][$i]) && $line[$colonne][$i]!='') {
250 
			switch ($colonne) {  // On ne garde que les colonnes que l'on souhaite traiter
251 
				case COMMUNE:
252 
					$info_commune=$this->traiterCommune($line[COMMUNE][$i]);
253 
					break;
254 
				case LIEUDIT:
480 david 255 
					$info_lieudit=$this->traiterLieudit($line[LIEUDIT][$i]);
445 david 256 
					break;
257 
				case STATION:
480 david 258 
					$info_station=$this->traiterStation($line[STATION][$i]);
445 david 259 
					break;
260 
				case MILIEU:
480 david 261 
					$info_milieu=$this->traiterMilieu($line[MILIEU][$i]);
445 david 262 
					break;
540 david 263 
                case DEPARTEMENT:
264 
					$info_commune['code']=$this->traiterDepartement($line[DEPARTEMENT][$i]);
265 
					break;
445 david 266 
				case LATITUDE:
480 david 267 
					$info_latitude=$this->traiterLatitude($line[LATITUDE][$i]);
445 david 268 
					break;
269 
				case LONGITUDE:
480 david 270 
					$info_longitude=$this->traiterLongitude($line[LONGITUDE][$i]);
445 david 271 
					break;
272 
				case NOTES:
480 david 273 
					$info_notes=$this->traiterNotes($line[NOTES][$i]);
445 david 274 
					break;
275 
				case DATEOBS:
480 david 276 
					$info_dateobs=$this->traiterDateObs($line[DATEOBS][$i]);
445 david 277 
					break;
278 
				case ESPECE:
480 david 279 
					$info_espece=$this->traiterEspece($line[ESPECE][$i]);
540 david 280 
                    if (isset($info_espece['en_id_nom']) && $info_espece['en_id_nom']!='') {
281 
                        $complement=$this->rechercherInformationsComplementaires($info_espece['en_id_nom']);
282 
                        $info_espece['nom_ret']=$complement['Nom_Retenu'];
283 
                        $info_espece['num_nom_ret']=$complement['Num_Nom_Retenu'];
284 
                        $info_espece['num_taxon']=$complement['Num_Taxon'];
285 
                        $info_espece['famille']=$complement['Famille'];
286 
                    }
287 
                    break;
445 david 288 
				case IMAGE:
480 david 289 
					$info_image=$this->traiterImage($line[IMAGE][$i],$utilisateur); // Image separee par des / +  utilisateur
445 david 290 
					break;
291 
			}
292 
		}
480 david 293 
		else {
294 
		 	switch($colonne) {
295 
				case COMMUNE:
296 
					$info_commune['name']="000null";
297 
					$info_commune['code']="000null";
298 
					break;
299 
				case LIEUDIT:
300 
					$info_lieudit="000null";
301 
					break;
302 
				case STATION:
303 
					$info_station="000null";
304 
					break;
305 
				case MILIEU:
306 
					$info_milieu="000null";
307 
					break;
540 david 308 
				case DEPARTEMENT:
309 
					$info_commune['code']="000null";
310 
					break;
480 david 311 
				case LATITUDE:
312 
					$info_latitude="000null";
313 
					break;
314 
				case LONGITUDE:
315 
					$info_longitude="000null";
316 
					break;
317 
 
318 
			}
319 
 
320 
		}
445 david 321 
	}
322 
 
540 david 323 
                $this->dernier_ordre++;
480 david 324 
 
325 
                list($jour,$mois,$annee)=split("/",$info_dateobs);
326 
                $info_dateobs=$annee."-".$mois."-".$jour." 0:0:0";
327 
 
540 david 328 
                $query  = "INSERT INTO cel_inventory (identifiant,ordre,nom_sel,num_nom_sel,nom_ret,num_nom_ret,num_taxon,famille,location,id_location,date_observation,lieudit,station, milieu, commentaire, date_creation,date_modification,coord_x,coord_y) " .
329 
                    " VALUES('".$DB->escapeSimple($utilisateur)."','".
330 
                    $DB->escapeSimple($this->dernier_ordre)."','".
331 
                    $DB->escapeSimple($info_espece['nom_sel'])."','".
332 
                    $DB->escapeSimple($info_espece['en_id_nom'])."','".
333 
                    $DB->escapeSimple($info_espece['nom_ret'])."','".
334 
                    $DB->escapeSimple($info_espece['num_nom_ret'])."','".
335 
                    $DB->escapeSimple($info_espece['num_taxon'])."','".
336 
                    $DB->escapeSimple($info_espece['famille'])."','".
337 
                    $DB->escapeSimple($info_commune['name'])."','".
338 
                    $DB->escapeSimple($info_commune['code'])."','".
339 
                    $DB->escapeSimple($info_dateobs)."','".
340 
                    $DB->escapeSimple($info_lieudit)."','".
341 
                    $DB->escapeSimple($info_station)."','".
342 
                    $DB->escapeSimple($info_milieu)."','".
343 
                    $DB->escapeSimple($info_notes)."',".
344 
                    "now() , now(),'".
345 
                    $DB->escapeSimple($info_latitude)."','".
346 
                    $DB->escapeSimple($info_longitude)."')";
480 david 347 
//		print "\n";
348 
 
349 
 
350 
		   $res =& $DB->query($query);
351 
 
352 
                if (PEAR::isError($res)) {
353 
                        return false;
354 
                }
355 
 
356 
 
357 
	// creation lien image
358 
	foreach ($info_image as $pic) {
359 
 
360 
		$query = 'INSERT INTO cel_obs_images (coi_ce_image, coi_ce_utilisateur, coi_ce_observation) VALUES ("'.$DB->escapeSimple($pic['ci_id_image']).'","'.$DB->escapeSimple($utilisateur).'",    "'.$DB->escapeSimple($ordre).'") ON DUPLICATE KEY UPDATE coi_ce_image = coi_ce_image' ;
361 
 
362 
//print $query;
363 
 
364 
		$res =& $DB->query($query);
365 
 
366 
                if (PEAR::isError($res)) {
367 
                        return false;
368 
                }
369 
 
370 
 
371 
	}
372 
 
373 
 
374 
 
540 david 375 
		return $this->dernier_ordre;
480 david 376 
 
377 
 
417 aurelien 378 
}
379 
 
480 david 380 
function traiterLigneComplement($line,$i,$utilisateur) {
417 aurelien 381 
 
480 david 382 
// TODO
383 
 
445 david 384 
}
385 
function traiterCommune($identifiant_commune) {  // Recherche correspondance sur nom, si pas unique, correspondance dep. sinon code insee
386 
 
387 
 
540 david 388 
        $identifiant_commune=trim($identifiant_commune);
445 david 389 
 
390 
        $identifiant_commune=utf8_encode($identifiant_commune); // FIXME : devrait deja etre en utf8 a ce niveau
391 
 
540 david 392 
	preg_match('/(.*) \(([0-9][0-9]*)\)/',$identifiant_commune,$elements);
445 david 393 
 
394 
        $DB=$this->connectDB($this->config,'database_cel'); // FIXME regarder si opportun ici
395 
 
540 david 396 
	if ($elements[1]) { // commune + departement : montpellier (34)
445 david 397 
		$nom_commune=$elements[1];
398 
		$code_commune=$elements[2];
399 
 
480 david 400 
 	        $query="SELECT DISTINCT name, code  FROM locations WHERE name = '".$DB->escapeSimple($nom_commune)."' AND code ='".$DB->escapeSimple($code_commune)."'";
445 david 401 
 
402 
	}
540 david 403 
	else { // Code insee seul
404 
        preg_match('/([0-9][0-9]*)|(2A[0-9][0-9]*)|(2B[0-9][0-9]*)/',$identifiant_commune,$elements);
405 
        if ($elements[1]) { // code insee  commune
406 
            $code_insee_commune=$elements[1];
407 
            $query="SELECT DISTINCT name, code  FROM locations WHERE insee_code ='".$DB->escapeSimple($code_insee_commune)."'";
408 
        }
409 
        else { // Commune seule (le departement sera recupere dans la colonne departement si elle est presente, on prend le risque ici de retourner une mauvaise
410 
               // Commune
411 
            preg_match('/(.*)/',$identifiant_commune,$elements);
412 
            if ($elements[1]) { // commune
413 
                $nom_commune=$elements[1];
414 
                $query="SELECT DISTINCT name, code  FROM locations WHERE name = '".$DB->escapeSimple($nom_commune)."'";
415 
            }
416 
        }
445 david 417 
	}
418 
 
419 
 
420 
	$res =& $DB->query($query);
421 
 
422 
        if (DB::isError($res)) {
423 
		 die($res->getMessage());
424 
	}
425 
 
426 
	return $res->fetchrow(DB_FETCHMODE_ASSOC);
427 
 
428 
 
429 
 
430 
 
431 
}
432 
 
433 
function traiterLieudit($lieudit) { // texte libre
434 
 
480 david 435 
	//echo "traitement lieudit";
436 
 
540 david 437 
	return utf8_encode(trim($lieudit));
445 david 438 
}
439 
 
440 
function traiterStation($station) { // texte libre
480 david 441 
//	echo "traitement station";
540 david 442 
	return utf8_encode(trim($station));
445 david 443 
}
444 
 
445 
function traiterMilieu($milieu) { // texte libre
480 david 446 
//	echo "traitement milieu";
540 david 447 
	return utf8_encode(trim($milieu));
445 david 448 
}
449 
 
540 david 450 
function traiterDepartement($departement) { // texte libre
451 
//	echo "traitement milieu";
452 
	return utf8_encode(trim($departement));
453 
}
454 
 
445 david 455 
function traiterLatitude($latitude) {	//  verifier formal decimal + limite france ? TODO
480 david 456 
//	echo "traitement latitude";
540 david 457 
	return trim($latitude);
445 david 458 
}
459 
 
460 
function traiterLongitude($longitude) { // verifier format decimal + limite france ? TODO
480 david 461 
//	echo "traitement longitude";
540 david 462 
	return trim($longitude);
445 david 463 
}
464 
 
465 
function traiterNotes($notes) { // texte libre
480 david 466 
//	echo "traitement notes";
540 david 467 
	return utf8_encode(trim($notes));
445 david 468 
}
469 
 
470 
function traiterDateObs($dateobs) { // verifier jj/mm/aaaa sinon date vide TODO
480 david 471 
//	echo "traitement dateobs";
540 david 472 
	return trim($dateobs);
445 david 473 
}
474 
 
540 david 475 
function traiterEspece($identifiant_espece) {  // texte libre, nom scientifique , ou code nomenclatural (format BDNFFnn999999) ou code taxonomique (format BDNFFnt999999)
449 david 476 
 
480 david 477 
//	echo "traitement  espece";
540 david 478 
        $identifiant_espece=trim($identifiant_espece);
445 david 479 
 
480 
        $identifiant_espece=utf8_encode($identifiant_espece); // FIXME : devrait deja etre en utf8 a ce niveau
481 
 
540 david 482 
	    preg_match('/BDNFFnn([0-9][0-9]*)/',$identifiant_espece,$elements);
483 
 
449 david 484 
		if ($elements[1]) { // Numero nomenclatural
445 david 485 
 
449 david 486 
 
540 david 487 
            // Recherche du nom associe
488 
            $DB=$this->connectDB($this->config); // FIXME : gerer cache de connection
489 
            $query = "SELECT DISTINCT en_nom_genre, en_epithete_espece, en_nom_supra_generique, en_epithete_infra_generique,".
490 
                "   auteur_bex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio_ex ".
491 
                " , auteur_b.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio ".
492 
                " , auteur_mex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif_ex ".
493 
                " , auteur_m.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif ".
494 
                " , en_epithete_espece, en_epithete_infra_specifique, enrg_abreviation_rang, en_id_nom" .
495 
                " FROM eflore_nom, eflore_nom_rang, eflore_selection_nom a,  " .
496 
                " eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_bex ".
497 
                " , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_b ".
498 
                " , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_mex ".
499 
                " , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_m ".
500 
                " WHERE a.esn_id_nom= '".$elements[1]. "'".
501 
                " AND a.esn_id_version_projet_taxon = 25 ".
502 
                " AND en_ce_rang = enrg_id_rang" .
503 
                " AND en_id_nom = a.esn_id_nom" .
504 
                " AND en_ce_auteur_basio_ex = auteur_bex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
505 
                " AND en_ce_auteur_basio = auteur_b.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege  ".
506 
                " AND en_ce_auteur_modif_ex = auteur_mex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
507 
                " AND en_ce_auteur_modif = auteur_m.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
508 
                " AND a.esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom ";
480 david 509 
 
540 david 510 
            $res =& $DB->query($query);
480 david 511 
 
512 
 
540 david 513 
            if (DB::isError($res)) {
514 
                die($res->getMessage());
515 
            }
480 david 516 
 
540 david 517 
            $row =& $res->fetchrow(DB_FETCHMODE_ASSOC);
518 
            return array("nom_sel"=>$this->formaterNom($row),"en_id_nom"=>$elements[1]);
519 
 
449 david 520 
		}
521 
 
540 david 522 
		else { //  Numero taxonomique ou nom scientifique
523 
	        preg_match('/BDNFFnt([0-9][0-9]*)/',$identifiant_espece,$elements);
449 david 524 
 
540 david 525 
		    if ($elements[1]) { // Numero taxonomique
526 
 
527 
                $DB=$this->connectDB($this->config);
449 david 528 
 
540 david 529 
                $query = "SELECT DISTINCT en_nom_genre, en_epithete_espece, en_nom_supra_generique, en_epithete_infra_generique,".
530 
                    "   auteur_bex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio_ex ".
531 
                    " , auteur_b.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio ".
532 
                    " , auteur_mex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif_ex ".
533 
                    " , auteur_m.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif ".
534 
                    " , en_epithete_espece, en_epithete_infra_specifique, enrg_abreviation_rang, en_id_nom" .
535 
                    " FROM eflore_nom, eflore_nom_rang," .
536 
                    "     eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_bex ".
537 
                    "   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_b ".
538 
                    "   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_mex ".
539 
                    "   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_m ".
540 
                    " , eflore_selection_nom ".
541 
                    " WHERE esn_id_taxon = '".$elements[1]. "'".
542 
                    " AND esn_id_version_projet_taxon = 25 ".
543 
                    " AND esn_ce_statut=3 ".
544 
                    " AND en_id_nom = esn_id_nom" .
545 
                    " AND en_ce_rang = enrg_id_rang" .
546 
                    " AND en_ce_auteur_basio_ex = auteur_bex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
547 
                    " AND en_ce_auteur_basio = auteur_b.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege  ".
548 
                    " AND en_ce_auteur_modif_ex = auteur_mex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
549 
                    " AND en_ce_auteur_modif = auteur_m.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
550 
                    " AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom ";
449 david 551 
 
540 david 552 
                $res =& $DB->query($query);
449 david 553 
 
540 david 554 
                if (DB::isError($res)) {
555 
                    die($res->getMessage());
556 
                }
449 david 557 
 
540 david 558 
                $row =& $res->fetchrow(DB_FETCHMODE_ASSOC);
559 
                return array("nom_sel"=>$this->formaterNom($row),"en_id_nom"=>$row['en_id_nom']);
449 david 560 
 
561 
 
540 david 562 
            }
480 david 563 
 
540 david 564 
            else { // Nom scientifique
565 
                $nameparser=new NameParser();
566 
                $nom_latin_decoupe=$nameparser->parse($identifiant_espece);
480 david 567 
 
540 david 568 
//print_r($nom_latin_decoupe);
569 
                    $DB=$this->connectDB($this->config); // FIXME regarder si opportun ici
480 david 570 
 
540 david 571 
                        // requete sous espece (on privilegie les noms retenu cf tri par esn_ce_statut)
572 
                        if (isset($nom_latin_decoupe['infra']) && $nom_latin_decoupe['infra']!="") {
573 
                            $query="SELECT DISTINCT en_id_nom, esn_ce_statut" .
574 
                                            " FROM eflore_nom, eflore_nom_rang, eflore_selection_nom " .
575 
                                            " WHERE en_id_version_projet_nom = '25' AND en_nom_genre = '".$DB->escapeSimple($nom_latin_decoupe['genus'])."' " .
576 
                                            " AND enrg_abreviation_rang = '".$DB->escapeSimple($nom_latin_decoupe['infra_type'])."' " .
577 
                                            " AND en_epithete_infra_specifique = '".$DB->escapeSimple($nom_latin_decoupe['infra'])."' " .
578 
                                            " AND esn_id_nom= en_id_nom ".
579 
                                            " AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom " .
580 
                                            " AND en_epithete_espece =  '".$DB->escapeSimple($nom_latin_decoupe['species'])."' AND en_ce_rang = enrg_id_rang " .
581 
                                            " ORDER BY esn_ce_statut ".
582 
                                            " LIMIT 1";
583 
                        }
584 
                        else { // espece  (on privilegie les noms retenu cf tri par esn_ce_statut)
585 
                             $query="SELECT DISTINCT en_id_nom, esn_ce_statut" .
586 
                                            " FROM eflore_nom, eflore_nom_rang, eflore_selection_nom " .
587 
                                            " WHERE en_id_version_projet_nom = '25' AND en_nom_genre = '".$DB->escapeSimple($nom_latin_decoupe['genus'])."' " .
588 
                                            " AND enrg_abreviation_rang = 'sp.' " .
589 
                                            " AND esn_id_nom= en_id_nom ".
590 
                                            " AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom " .
591 
                                            " AND en_epithete_espece =  '".$DB->escapeSimple($nom_latin_decoupe['species'])."' AND en_ce_rang = enrg_id_rang " .
592 
                                            " ORDER BY esn_ce_statut ".
593 
                                            " LIMIT 1";
594 
 
595 
                        }
596 
                $res =& $DB->query($query);
597 
                if (DB::isError($res)) {
598 
                     die($res->getMessage());
599 
                }
480 david 600 
 
540 david 601 
                $id_nom=$res->fetchrow(DB_FETCHMODE_ASSOC);
480 david 602 
 
540 david 603 
                // Recherche du nom associe
604 
                $DB=$this->connectDB($this->config); // FIXME : gerer cache de connection
605 
                $query = "SELECT DISTINCT en_nom_genre, en_epithete_espece, en_nom_supra_generique, en_epithete_infra_generique,".
606 
                    "   auteur_bex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio_ex ".
607 
                    " , auteur_b.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio ".
608 
                    " , auteur_mex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif_ex ".
609 
                    " , auteur_m.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif ".
610 
                    " , en_epithete_espece, en_epithete_infra_specifique, enrg_abreviation_rang, en_id_nom" .
611 
                    " FROM eflore_nom, eflore_nom_rang, eflore_selection_nom a,  " .
612 
                    "         eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_bex ".
613 
                    "   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_b ".
614 
                    "   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_mex ".
615 
                    "   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_m ".
616 
                    " WHERE a.esn_id_nom= '".$id_nom['en_id_nom']. "'".
617 
                    " AND a.esn_id_version_projet_taxon = 25 ".
618 
                    " AND en_ce_rang = enrg_id_rang" .
619 
                    " AND en_id_nom = a.esn_id_nom" .
620 
                    " AND en_ce_auteur_basio_ex = auteur_bex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
621 
                    " AND en_ce_auteur_basio = auteur_b.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege  ".
622 
                    " AND en_ce_auteur_modif_ex = auteur_mex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
623 
                    " AND en_ce_auteur_modif = auteur_m.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
624 
                    " AND a.esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom ";
625 
                $res =& $DB->query($query);
480 david 626 
 
627 
 
540 david 628 
                if (DB::isError($res)) {
629 
                    die($res->getMessage());
630 
                }
445 david 631 
 
540 david 632 
                if ($res->numRows() > 0 ) {
633 
                    $row =& $res->fetchrow(DB_FETCHMODE_ASSOC);
634 
                    return array("nom_sel"=>$this->formaterNom($row),"en_id_nom"=>$id_nom['en_id_nom']);
635 
                }
636 
                else {
637 
                    return array("nom_sel"=>$identifiant_espece);
638 
                }
445 david 639 
 
480 david 640 
 
540 david 641 
                }
642 
            }
480 david 643 
 
644 
 
445 david 645 
}
646 
 
647 
 
648 
 
480 david 649 
function traiterImage($images,$utilisateur) { // recherche id image de ce nom
650 
 
651 
	//echo "traitement  image";
652 
        $DB=$this->connectDB($this->config,'cel_db');
653 
 
654 
	$liste_images = explode("/",$images) ;
655 
 
656 
	$row =array();
657 
        foreach($liste_images as $image) {
658 
 
659 
		$query="SELECT * FROM cel_images WHERE ci_ce_utilisateur='".$DB->escapeSimple($utilisateur)."' AND ci_nom_original='".$DB->escapeSimple($image)."'";
660 
 
661 
	        $res  =& $DB->query($query);
662 
		$row [] =& $res->fetchrow(DB_FETCHMODE_ASSOC);
663 
 
664 
	        if (DB::isError($res)) {
665 
        	    die($res->getMessage());
666 
	        }
667 
 
668 
	}
669 
	return $row;
670 
 
671 
 
445 david 672 
}
673 
 
540 david 674 
       function rechercherInformationsComplementaires($numNom) { // Num taxon, Num retenu ...
445 david 675 
 
480 david 676 
                $DB=$this->connectDB($this->config);
677 
 
678 
                $query = "SELECT DISTINCT en_nom_genre, en_epithete_espece, en_nom_supra_generique, en_epithete_infra_generique,".
540 david 679 
                    "   auteur_bex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio_ex ".
680 
                    " , auteur_b.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio ".
681 
                    " , auteur_mex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif_ex ".
682 
                    " , auteur_m.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif ".
683 
                    " , en_epithete_espece, en_epithete_infra_specifique, enrg_abreviation_rang, b.esn_id_taxon, b.esn_id_nom" .
684 
                    " FROM eflore_nom, eflore_nom_rang," .
685 
                    "     eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_bex ".
686 
                    "   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_b ".
687 
                    "   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_mex ".
688 
                    "   , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_m ".
689 
                    " ,eflore_selection_nom a, eflore_selection_nom b".
690 
                    " WHERE a.esn_id_nom= ".$numNom.
691 
                    " AND a.esn_id_version_projet_taxon = 25 ".
692 
                    " AND a.esn_id_taxon=b.esn_id_taxon ".
693 
                    " AND b.esn_ce_statut=3 ".
694 
                    " AND a.esn_id_version_projet_taxon=b.esn_id_version_projet_taxon" .
695 
                    " AND en_ce_rang = enrg_id_rang" .
696 
                    " AND en_id_nom = b.esn_id_nom" .
697 
                    " AND en_ce_auteur_basio_ex = auteur_bex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
698 
                    " AND en_ce_auteur_basio = auteur_b.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege  ".
699 
                    " AND en_ce_auteur_modif_ex = auteur_mex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
700 
                    " AND en_ce_auteur_modif = auteur_m.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
701 
                    " AND a.esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom ";
480 david 702 
 
703 
 
540 david 704 
                $res =& $DB->query($query);
480 david 705 
 
706 
 
707 
 
540 david 708 
                if (DB::isError($res)) {
709 
                    die($res->getMessage());
710 
                }
480 david 711 
 
540 david 712 
                // Nom retenu, Num Nomenclatural nom retenu, Num Taxon,
480 david 713 
 
714 
                $value=array('Nom_Retenu'=>"",'Num_Nom_Retenu'=>"0",'Num_Taxon'=>"0",'Famille'=>"");
715 
 
716 
                while ($row =& $res->fetchrow(DB_FETCHMODE_ASSOC)) {
540 david 717 
                    $fam=$this->rechercherFamille($row['esn_id_taxon'],$DB);
718 
 
719 
                    // Recherche Famille
720 
                    while (($fam['en_ce_rang']!='fin') && ($fam['en_ce_rang'] !=120)) {
480 david 721 
                        $fam=$this->rechercherFamille($fam['etr_id_taxon_2'],$DB);
540 david 722 
                    }
723 
                    if ($fam['en_ce_rang']==120) {
480 david 724 
                        $famille=$fam['en_nom_supra_generique'];
540 david 725 
                    }
726 
                    else {
480 david 727 
                        $famille="Famille inconnue";
540 david 728 
                    }
729 
 
730 
                    $value=array('Nom_Retenu'=>$this->formaterNom($row),'Num_Nom_Retenu'=>$row['esn_id_nom'],'Num_Taxon'=>$row['esn_id_taxon'],'Famille'=>$famille);
480 david 731 
                }
732 
 
540 david 733 
                return $value;
480 david 734 
 
735 
 
736 
 
737 
        }
738 
 
449 david 739 
function formaterNom($rawnom) {
480 david 740 
 
741 
 
449 david 742 
                // Constitution du nom:
743 
                $nom = '';
445 david 744 
 
449 david 745 
                if ($rawnom['en_nom_supra_generique'] != '') {
746 
                    $nom .= $rawnom['en_nom_supra_generique'];
747 
                } else if ($rawnom['en_epithete_infra_generique'] != '') {
748 
                    $nom .= $rawnom['en_epithete_infra_generique'];
749 
                } else {
750 
                        if ($rawnom['en_nom_genre'] != '') {
751 
                            $nom .=  $rawnom['en_nom_genre'];
752 
                        }
753 
                        if ($rawnom['en_epithete_espece']!= '') {
754 
                            $nom .= ' '.$rawnom['en_epithete_espece'];
755 
                        }
756 
                        if ($rawnom['en_epithete_infra_specifique'] != '') {
757 
                                if (!empty($rawnom['enrg_abreviation_rang'])) {
758 
                                        $nom .= ' '.$rawnom['enrg_abreviation_rang'].'';
759 
                                }
760 
                                $nom .= ' '.$rawnom['en_epithete_infra_specifique'];
761 
                        }
762 
 
763 
                }
480 david 764 
 
765 
                return $nom .$this->retournerAuteur($rawnom) ;
766 
 
767 
 }
768 
 
769 
 
770 
function rechercherFamille($taxon,&$DB) {
771 
 
540 david 772 
    $row=array();
480 david 773 
 
540 david 774 
    $query="SELECT DISTINCT en_ce_rang, etr_id_taxon_2, en_id_nom, en_nom_supra_generique ".
480 david 775 
        " FROM eflore_taxon_relation, eflore_selection_nom, eflore_nom ".
776 
        " WHERE etr_id_taxon_1 = ".$taxon.
777 
        " AND etr_id_version_projet_taxon_1 = 25 ".
778 
        " AND etr_id_categorie_taxon = 3 ".
779 
        " AND etr_id_valeur_taxon = 3 ".
780 
        " AND esn_id_taxon =  etr_id_taxon_2 ".
781 
        " AND esn_ce_statut = 3 ".
782 
        " AND esn_id_version_projet_taxon = etr_id_version_projet_taxon_1 ".
783 
        " AND en_id_nom = esn_id_nom ".
784 
        " AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom  ";
540 david 785 
    $res =& $DB->query($query);
480 david 786 
 
540 david 787 
    if (DB::isError($res)) {
788 
        die($res->getMessage());
789 
    }
480 david 790 
 
540 david 791 
    if ($row =& $res->fetchrow(DB_FETCHMODE_ASSOC)) {
792 
        return $row;
480 david 793 
    }
794 
    else {
795 
        $row['en_ce_rang']='fin';
796 
        return $row;
797 
    }
798 
 
445 david 799 
}
800 
 
480 david 801 
 
449 david 802 
function retournerAuteur($rawnom) {
445 david 803 
 
540 david 804 
    $auteurs = '';
805 
    $auteur_basio = '';
806 
    $auteur_modif = '';
807 
    if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_basio_ex']) && $rawnom['abreviation_auteur_basio_ex']!='-' )  {
808 
        $auteur_basio .= $rawnom['abreviation_auteur_basio_ex'];
809 
        if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_basio']) && $rawnom['abreviation_auteur_basio']!='-') {
810 
            $auteur_basio .= ' ex '.$rawnom['abreviation_auteur_basio'];
811 
        }
812 
    } else if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_basio']) && $rawnom['abreviation_auteur_basio']!='-') {
813 
        $auteur_basio .= $rawnom['abreviation_auteur_basio'];
814 
    }
445 david 815 
 
540 david 816 
    if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_modif_ex']) && $rawnom['abreviation_auteur_modif_ex']!='-') {
817 
        $auteur_modif .= $rawnom['abreviation_auteur_modif_ex'];
818 
        if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_modif']) && $rawnom['abreviation_auteur_modif']!='-') {
819 
            $auteur_modif .= ' ex '.$rawnom['abreviation_auteur_modif'];
820 
        }
821 
    } else if (!empty($rawnom['abreviation_auteur_modif']) && $rawnom['abreviation_auteur_modif']!='-')  {
822 
        $auteur_modif .= $rawnom['abreviation_auteur_modif'];
823 
    }
449 david 824 
 
540 david 825 
    if (!empty($auteur_modif)) {
826 
        $auteurs = ' ('.$auteur_basio.') '.$auteur_modif;
827 
    } elseif (!empty($auteur_basio)) {
828 
        $auteurs = ' '.$auteur_basio;
829 
    }
830 
 
831 
    return $auteurs ;
449 david 832 
}
833 
 
834 
 
835 
 
480 david 836 
 
449 david 837 
}
838 
 
839 
 
540 david 840 
function remove_accent($str)
841 
{
842 
  $a = array('À', 'Á', 'Â', 'Ã', 'Ä', 'Å', 'Æ', 'Ç', 'È', 'É', 'Ê', 'Ë', 'Ì', 'Í', 'Î',
843 
             'Ï', 'Ð', 'Ñ', 'Ò', 'Ó', 'Ô', 'Õ', 'Ö', 'Ø', 'Ù', 'Ú', 'Û', 'Ü', 'Ý', 'ß',
844 
             'à', 'á', 'â', 'ã', 'ä', 'å', 'æ', 'ç', 'è', 'é', 'ê', 'ë', 'ì', 'í', 'î',
845 
             'ï', 'ñ', 'ò', 'ó', 'ô', 'õ', 'ö', 'ø', 'ù', 'ú', 'û', 'ü', 'ý', 'ÿ', 'Ā',
846 
             'ā', 'Ă', 'ă', 'Ą', 'ą', 'Ć', 'ć', 'Ĉ', 'ĉ', 'Ċ', 'ċ', 'Č', 'č', 'Ď', 'ď',
847 
             'Đ', 'đ', 'Ē', 'ē', 'Ĕ', 'ĕ', 'Ė', 'ė', 'Ę', 'ę', 'Ě', 'ě', 'Ĝ', 'ĝ', 'Ğ',
848 
             'ğ', 'Ġ', 'ġ', 'Ģ', 'ģ', 'Ĥ', 'ĥ', 'Ħ', 'ħ', 'Ĩ', 'ĩ', 'Ī', 'ī', 'Ĭ', 'ĭ',
849 
             'Į', 'į', 'İ', 'ı', 'IJ', 'ij', 'Ĵ', 'ĵ', 'Ķ', 'ķ', 'Ĺ', 'ĺ', 'Ļ', 'ļ', 'Ľ',
850 
             'ľ', 'Ŀ', 'ŀ', 'Ł', 'ł', 'Ń', 'ń', 'Ņ', 'ņ', 'Ň', 'ň', 'ʼn', 'Ō', 'ō', 'Ŏ',
851 
             'ŏ', 'Ő', 'ő', 'Œ', 'œ', 'Ŕ', 'ŕ', 'Ŗ', 'ŗ', 'Ř', 'ř', 'Ś', 'ś', 'Ŝ', 'ŝ',
852 
             'Ş', 'ş', 'Š', 'š', 'Ţ', 'ţ', 'Ť', 'ť', 'Ŧ', 'ŧ', 'Ũ', 'ũ', 'Ū', 'ū', 'Ŭ',
853 
             'ŭ', 'Ů', 'ů', 'Ű', 'ű', 'Ų', 'ų', 'Ŵ', 'ŵ', 'Ŷ', 'ŷ', 'Ÿ', 'Ź', 'ź', 'Ż',
854 
             'ż', 'Ž', 'ž', 'ſ', 'ƒ', 'Ơ', 'ơ', 'Ư', 'ư', 'Ǎ', 'ǎ', 'Ǐ', 'ǐ', 'Ǒ', 'ǒ',
855 
             'Ǔ', 'ǔ', 'Ǖ', 'ǖ', 'Ǘ', 'ǘ', 'Ǚ', 'ǚ', 'Ǜ', 'ǜ', 'Ǻ', 'ǻ', 'Ǽ', 'ǽ', 'Ǿ', 'ǿ');
856 
 
857 
  $b = array('A', 'A', 'A', 'A', 'A', 'A', 'AE', 'C', 'E', 'E', 'E', 'E', 'I', 'I', 'I',
858 
             'I', 'D', 'N', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'U', 'U', 'U', 'U', 'Y', 's',
859 
             'a', 'a', 'a', 'a', 'a', 'a', 'ae', 'c', 'e', 'e', 'e', 'e', 'i', 'i', 'i',
860 
             'i', 'n', 'o', 'o', 'o', 'o', 'o', 'o', 'u', 'u', 'u', 'u', 'y', 'y', 'A', 'a',
861 
             'A', 'a', 'A', 'a', 'C', 'c', 'C', 'c', 'C', 'c', 'C', 'c', 'D', 'd', 'D', 'd',
862 
             'E', 'e', 'E', 'e', 'E', 'e', 'E', 'e', 'E', 'e', 'G', 'g', 'G', 'g', 'G', 'g',
863 
             'G', 'g', 'H', 'h', 'H', 'h', 'I', 'i', 'I', 'i', 'I', 'i', 'I', 'i', 'I', 'i',
864 
             'IJ', 'ij', 'J', 'j', 'K', 'k', 'L', 'l', 'L', 'l', 'L', 'l', 'L', 'l', 'l', 'l',
865 
             'N', 'n', 'N', 'n', 'N', 'n', 'n', 'O', 'o', 'O', 'o', 'O', 'o', 'OE', 'oe', 'R',
866 
             'r', 'R', 'r', 'R', 'r', 'S', 's', 'S', 's', 'S', 's', 'S', 's', 'T', 't', 'T', 't',
867 
             'T', 't', 'U', 'u', 'U', 'u', 'U', 'u', 'U', 'u', 'U', 'u', 'U', 'u', 'W', 'w', 'Y',
868 
             'y', 'Y', 'Z', 'z', 'Z', 'z', 'Z', 'z', 's', 'f', 'O', 'o', 'U', 'u', 'A', 'a', 'I',
869 
             'i', 'O', 'o', 'U', 'u', 'U', 'u', 'U', 'u', 'U', 'u', 'U', 'u', 'A', 'a', 'AE', 'ae', 'O', 'o');
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  return str_replace($a, $b, $str);
871 
}
449 david 872 
 
540 david 873 
 
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417 aurelien 907 
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*
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*
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