Subversion Repositories eFlore/Applications.cel

Rev

Rev 3513 | Go to most recent revision | Details | Compare with Previous | Last modification | View Log | RSS feed

Rev Author Line No. Line
2893 delphine 1 
<?php
2 
// declare(encoding='UTF-8');
3 
/**
4 
 * Classe de nettoyage de la base de données du CEL.
5 
 * Suppression des antislash
6 
 * Remplacement des chaines vides par des NULL
7 
 * Unifier les référentiels : pas de nom de version, majuscule...
8 
 * Unifier les certitudes
9 
 * Supprimer les INSEE-C: non rempli, les dates 0000-00
10 
 *
11 
 * Utilisation :
12 
 * - <code>/opt/lamp/bin/php cli.php nettoyage -a (voir méthode executer)</code>
13 
 *
14 
 * @category   CEL
15 
 * @package    Scripts
16 
 * @subpackage Nettoyage
17 
 * @author     Delphine CAUQUIL <delphine@tela-botanica.org>
18 
 * @license    GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
19 
 * @license    CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
20 
 * @copyright  1999-2016 Tela Botanica <accueil@tela-botanica.org>
21 
 */
22 
class Nettoyage extends Script {
23 
 
24 
	protected $bdd;
2936 delphine 25 
	protected $colonnes;
3439 delphine 26 
	protected $bd_cel = "tb_nettoye_cel";
27 
	protected $bd_del = "tb_del";
3663 delphine 28 
	protected $bd_flore = "tb_eflore";
2893 delphine 29 
 
30 
 
31 
	public function __construct($script_nom, $parametres_cli) {
32 
		parent::__construct($script_nom, $parametres_cli);
33 
		$this->bdd = new Bdd();
3439 delphine 34 
		$this->bd_cel = Config::get('nettoyage.cel_nettoye');
35 
		$this->bd_del = Config::get('nettoyage.del');
3663 delphine 36 
		$this->bd_flore = Config::get('nettoyage.flore');
2893 delphine 37 
	}
38 
 
39 
	public function executer() {
40 
		$cmd = $this->getParametre('a');
3445 delphine 41 
		$requete_colonnes = "SELECT column_name FROM information_schema.columns WHERE table_name = 'cel_obs' AND table_schema='".$this->bd_cel."';";
2936 delphine 42 
		$this->colonnes = $this->bdd->recupererTous($requete_colonnes);
2893 delphine 43 
		try {
44 
			switch ($cmd) {
45 
				case 'tout' :
2936 delphine 46 
					$this->supprimerRetourLigne();
2893 delphine 47 
					$this->supprimerAntislash();
3296 delphine 48 
					$this->supprimerGuillemet();
3258 delphine 49 
					$this->unifierNull();
2893 delphine 50 
					$this->unifierNomReferentiel();
51 
					$this->unifierCertitude();
3663 delphine 52 
					//$this->supprimerCertitudeAutre();
3258 delphine 53 
					$this->unifierUtilisateur();
3456 delphine 54 
					$this->unifierPhenologie();
3258 delphine 55 
					$this->verifierCodeInsee();
2893 delphine 56 
					$this->verifierGeodatum();
3438 delphine 57 
					$this->supprimerInfosLiesObsInexistante();
58 
					$this->supprimerImagesetTagAnonymes();
3258 delphine 59 
					$this->analyserMotsCles();
3303 delphine 60 
					$this->changerSensible();
2893 delphine 61 
					$this->unifierNull();
62 
					break;
3296 delphine 63 
				case 'supprimerRetourLigne' :
64 
				    $this->supprimerRetourLigne();
65 
				    break;
2893 delphine 66 
				case 'supprimerAntislash' :
67 
					$this->supprimerAntislash();
68 
					break;
3296 delphine 69 
				case 'supprimerGuillemet' :
70 
				    $this->supprimerGuillemet();
71 
				    break;
2893 delphine 72 
				case 'unifierNomReferentiel' :
73 
					$this->unifierNomReferentiel();
74 
					break;
75 
				case 'unifierCertitude' :
76 
					$this->unifierCertitude();
77 
					break;
3258 delphine 78 
				case 'supprimerCertitudeAutre' : // après unifier certitude si les autres valeurs sont bien à supprimer
79 
				    $this->supprimerCertitudeAutre();
80 
				    break;
81 
				case 'analyserMotsCles' : // après unifier certitude si les autres valeurs sont bien à supprimer
82 
				    $this->analyserMotsCles();
83 
				    break;
2893 delphine 84 
				case 'verifierGeodatum' :
85 
					$this->verifierGeodatum();
86 
					break;
3258 delphine 87 
				case 'verifierCodeInsee' :
88 
				    $this->verifierCodeInsee();
89 
				    break;
3303 delphine 90 
				case 'sensible' :
91 
				    $this->changerSensible();
92 
				    break;
2893 delphine 93 
				case 'unifierNull' : // lancer en dernier pour bien réussir
94 
					$this->unifierNull();
95 
					break;
3449 delphine 96 
				case 'supprimerImagesetTagAnonymes' :
97 
				    $this->supprimerImagesetTagAnonymes();
98 
				    break;
3258 delphine 99 
				case 'supprimerInfosLiesObsInexistante' :
100 
				    $this->supprimerInfosLiesObsInexistante();
101 
				    break;
102 
				case 'unifierUtilisateur' :
103 
				    $this->unifierUtilisateur();
104 
				    break;
3296 delphine 105 
				case 'unifierInfosEspece' :
3663 delphine 106 
				    $this->unifierInfosEspeces();
3296 delphine 107 
				    break;
3456 delphine 108 
				case 'unifierPhenologie' :
109 
				    $this->unifierPhenologie();
110 
				    break;
2893 delphine 111 
				default :
112 
					$msg = "Erreur : la commande '$cmd' n'existe pas!\n".
113 
						"Commandes existantes : regenererMotsClesTexteObs, regenererMotsClesTexteImages"
114 
							. ", regenererMotsClesTexteObsTout, regenererMotsClesTexteImagesTout"
115 
							. ", viderMotsClesTexteImagesSansMotsCles, viderMotsClesTexteObsSansMotsCles"
116 
							. ", regenererChampsTailleImage, reparerLiaisonsOublieesObs, reparerLiaisonsOublieesImages"
117 
							. ", reparerLiaisonsObsParMotsClesTexte, reductionMotsClesImages, reductionMotsClesImagesUtil"
118 
							. ", reduireEtNormaliserMotsClesImagesUtil, reduireEtNormaliserMotsClesImages"
119 
							. ", reductionMotsClesObs, reductionMotsClesObsUtil, reduireEtNormaliserMotsClesObsUtil"
120 
							. ", reduireEtNormaliserMotsClesObs";
121 
					throw new Exception($msg);
122 
			}
123 
		} catch (Exception $e) {
124 
			$this->traiterErreur($e->getMessage());
125 
		}
126 
	}
127 
 
128 
 
2936 delphine 129 
	private function supprimerRetourLigne() {
130 
		foreach ($this->colonnes as $id=>$colonne) {
131 
			echo "Suppression des retour ligne dans la colonne ".$colonne['column_name']." ...";
3439 delphine 132 
			$requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET ".$colonne['column_name']." = REPLACE(".$colonne['column_name'].', "\n", "")';
2936 delphine 133 
			$this->bdd->requeter($requete);
134 
			echo "effectuée \n";
135 
		}
136 
	}
2893 delphine 137 
 
138 
	private function supprimerAntislash() {
2936 delphine 139 
		foreach ($this->colonnes as $id=>$colonne) {
2893 delphine 140 
			echo "Suppression des antislash dans la colonne ".$colonne['column_name']." ...";
3456 delphine 141 
			$requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET ".$colonne['column_name']." = REPLACE(".$colonne['column_name'].', "\\\", "")';
2893 delphine 142 
			$this->bdd->requeter($requete);
143 
			echo "effectuée \n";
144 
		}
145 
	}
146 
 
2936 delphine 147 
	private function supprimerGuillemet() {
148 
		foreach ($this->colonnes as $id=>$colonne) {
149 
			echo "Suppression des guillements dans la colonne ".$colonne['column_name']." ...";
3439 delphine 150 
			$requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET ".$colonne['column_name']." = REPLACE(".$colonne['column_name'].',"\"", "")';
2936 delphine 151 
			$this->bdd->requeter($requete);
152 
			echo "effectuée \n";
153 
		}
154 
	}
155 
 
2893 delphine 156 
	private function unifierNull() {
3447 delphine 157 
	    foreach ($this->colonnes as $id=>$colonne) {
2893 delphine 158 
			echo "Suppression des vides dans la colonne ".$colonne['column_name']." ...";
2895 delphine 159 
			$dsl = array( 'transmission', 'altitude');
2894 delphine 160 
			if (isset($dsl[$colonne['column_name']])) {
3463 delphine 161 
				$requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET ".$colonne['column_name']." = NULL WHERE trim(".$colonne['column_name'].") = '' and ".$colonne['column_name']." != '0'";
2894 delphine 162 
			} else {
3449 delphine 163 
				$requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET ".$colonne['column_name']." = NULL WHERE trim(".$colonne['column_name'].") = '' OR ".$colonne['column_name']." IN ('INSEE-C:', '0000-00-00 00:00:00', '0.00000')";
2894 delphine 164 
			}
2893 delphine 165 
			$this->bdd->requeter($requete);
166 
			echo "effectuée \n";
167 
		}
168 
	}
169 
 
170 
	private function unifierCertitude() {
171 
		echo "Uniformisation du champ certitude/identification";
3258 delphine 172 
		$certitude = array("A déterminer" => "à déterminer",
173 
		    "À déterminer, voir photo" => "à déterminer",
3446 delphine 174 
		    "A déterminer" => "à déterminer",
3258 delphine 175 
		    "aDeterminer" => "à déterminer",
176 
		    "déterminer" => "à déterminer",
177 
		    "Inconnue" => "à déterminer",
178 
		    "Ceraine" => "certain",
179 
		    "certain" => "certain",
180 
		    "Certainaaua" => "certain",
181 
		    "Certaine" => "certain",
182 
		    "Certaine K- rhizines blanche" => "certain",
183 
		    "Certaine ( mais voir notes)" => "certain",
184 
		    "Certaine (à 99%)" => "certain",
185 
		    "Certaine Anett" => "certain",
186 
		    "Certaine Anette" => "certain",
187 
		    "Certaine Valériane officinale" => "certain",
188 
		    "Certaine, Faite et confirmée par JM BERAUD" => "certain",
189 
		    "Certaine, par Jean Lebail" => "certain",
190 
		    "Certaine, subsp. minus" => "certain",
191 
		    "Certainea" => "certain",
192 
		    "Certaineanno" => "certain",
193 
		    "Certainearia n" => "certain",
194 
		    "Certainee" => "certain",
195 
		    "Certainej" => "certain",
196 
		    "Certainel" => "certain",
197 
		    "CertaineNom de travai" => "certain",
198 
		    "CertaineNom de travail" => "certain",
199 
		    "Certainesites" => "certain",
200 
		    "Certainesous-bois de feuillus en versant sud à sud-ouest" => "certain",
201 
		    "Certaineu" => "certain",
202 
		    "sure" => "certain",
203 
		    "validée sur forum Naturalistes de l'ouest" => "certain",
204 
		    "à confirmer" => "douteux",
205 
		    "à approfondir" => "douteux",
206 
		    "à cofirmer" => "douteux",
207 
		    "À confiermer" => "douteux",
208 
		    "A confirlmer" => "douteux",
209 
		    "A confirmer" => "douteux",
210 
		    "à confirmer vs. pumilum" => "douteux",
211 
		    "à conirmer" => "douteux",
212 
		    "à vérifier" => "douteux",
213 
		    "douteuse" => "douteux",
214 
		    "Douteuse (canadensis ?)" => "douteux",
215 
		    "Douteuse ?" => "douteux",
216 
		    "Douteuse à confirmer" => "douteux",
217 
		    "Douteuse peut-être cordata" => "douteux",
218 
		    "Douteuse, fleurs rouges" => "douteux",
219 
		    "douteux" => "douteux",
220 
		    "espèce bisannuelle mais non bien déterminée" => "douteux",
221 
		    "Incertaine" => "douteux",
222 
		    "Pavot douteux" => "douteux",
223 
		    "Potentille ansérine, supposé" => "douteux",
224 
		    "presque certaine" => "douteux",
225 
		    "Quasi Certaine" => "douteux",
226 
		    "ssp déterminer" => "douteux",
227 
		    "subsp à vérifier" => "douteux",
228 
		    "subsp. microphyllum ?" => "douteux",
229 
		    "très douteuse" => "douteux",
230 
		    "Très probable" => "douteux");
2893 delphine 231 
		foreach ($certitude as $valeur=>$saisie) {
3446 delphine 232 
			$requete = 'UPDATE '.$this->bd_cel.'.cel_obs SET commentaire = concat(commentaire, " Certitude : ", certitude), certitude = "'.$saisie.'" WHERE certitude ="'.$valeur.'"';
2893 delphine 233 
			$this->bdd->requeter($requete);
234 
			echo "effectuée \n";
235 
		}
3439 delphine 236 
		$requete_verif = "SELECT certitude FROM ".$this->bd_cel.".cel_obs WHERE certitude NOT IN ('douteux', 'certain', 'à déterminer', '') and certitude is not NULL";
2893 delphine 237 
		$verif = $this->bdd->recupererTous($requete_verif);
238 
		if ($verif != array()) print_r($verif);
239 
	}
240 
 
3258 delphine 241 
	private function supprimerCertitudeAutre() {
242 
	    echo "suppression des valeurs non compréhensible du champ certitude/identification";
3439 delphine 243 
	    $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs
3296 delphine 244 
	        SET commentaire = case isnull(commentaire) when 1 THEN certitude ELSE concat(commentaire, ' Certitude : ', certitude) END,
245 
	        certitude = '' WHERE `certitude` NOT IN ('douteux', 'certain', 'à déterminer', '') and certitude is not NULL";
3258 delphine 246 
	    $this->bdd->requeter($requete);
247 
	        echo "effectuée \n";
3446 delphine 248 
	    $requete_verif = "SELECT certitude FROM ".$this->bd_cel.".cel_obs WHERE certitude NOT IN ('douteux', 'certain', 'à déterminer', '') and certitude is not NULL";
3258 delphine 249 
	    $verif = $this->bdd->recupererTous($requete_verif);
250 
	    if ($verif != array()) print_r($verif);
251 
	}
252 
 
3456 delphine 253 
	private function unifierPhenologie() {
254 
	    echo "Uniformisation du champ phenologie";
255 
	    $phenologie = array("2" => "00-09: germination, développement des bourgeons",
256 
	        "5" => "00-09: germination, développement des bourgeons",
257 
	        "5" => "00-09: germination, développement des bourgeons",
258 
	        "8" => "00-09: germination, développement des bourgeons",
259 
	        "8" => "00-09: germination, développement des bourgeons",
260 
	        "9" => "00-09: germination, développement des bourgeons",
261 
	        "00-09" => "00-09: germination, développement des bourgeons",
262 
	        "Germination, développement des bourgeons" => "00-09: germination, développement des bourgeons",
263 
	        "10" => "10-19: développement des feuilles",
264 
	        "11" => "10-19: développement des feuilles",
265 
	        "12" => "10-19: développement des feuilles",
266 
	        "14" => "10-19: développement des feuilles",
267 
	        "15" => "10-19: développement des feuilles",
268 
	        "16" => "10-19: développement des feuilles",
269 
	        "17" => "10-19: développement des feuilles",
270 
	        "18" => "10-19: développement des feuilles",
271 
	        "19" => "10-19: développement des feuilles",
272 
	        "10-19" => "10-19: développement des feuilles",
273 
	        "10-19: développement des feui" => "10-19: développement des feuilles",
274 
	        "10-19: développement des feuilles" => "10-19: développement des feuilles",
275 
	        "15: environ % des feuilles épanouies" => "10-19: développement des feuilles",
276 
	        "19   environ 50% des feuilles épanouies" => "10-19: développement des feuilles",
277 
	        "en feuilles" => "10-19: développement des feuilles",
278 
	        "Feuille" => "10-19: développement des feuilles",
279 
	        "feuille peu dvt, a confirmer" => "10-19: développement des feuilles",
280 
	        "feuilles seulement" => "10-19: développement des feuilles",
281 
	        "20" => "20-29: formation de pousses latérales, tallage",
282 
	        "Formation de pousses latérales, tallage" => "20-29: formation de pousses latérales, tallage",
283 
	        "30" => "30-39: développement des tiges, croissance des rosettes",
284 
	        "35" => "30-39: développement des tiges, croissance des rosettes",
285 
	        "36" => "30-39: développement des tiges, croissance des rosettes",
286 
	        "38" => "30-39: développement des tiges, croissance des rosettes",
287 
	        "39" => "30-39: développement des tiges, croissance des rosettes",
288 
	        "3: développement des tiges, croissance des rosettes" => "30-39: développement des tiges, croissance des rosettes",
289 
	        "Développement des tiges, croissance des rosettes" => "30-39: développement des tiges, croissance des rosettes",
290 
	        "40" => "40-49: développement des organes de propagation végétative",
291 
	        "43" => "40-49: développement des organes de propagation végétative",
292 
	        "45" => "40-49: développement des organes de propagation végétative",
293 
	        "46" => "40-49: développement des organes de propagation végétative",
294 
	        "48" => "40-49: développement des organes de propagation végétative",
295 
	        "49" => "40-49: développement des organes de propagation végétative",
296 
	        "40-49" => "40-49: développement des organes de propagation végétative",
297 
	        "40-49: développement des organes de propagation végétative" => "40-49: développement des organes de propagation végétative",
298 
	        "40-49: développement des organes de propagation végétativegt" => "40-49: développement des organes de propagation végétative",
299 
	        "40-49: développement des organes de propagation végétativepas d'inflorescence" => "40-49: développement des organes de propagation végétative",
300 
	        "50" => "50-59 : apparition de l’inflorescence",
301 
	        "56" => "50-59 : apparition de l’inflorescence",
302 
	        "57" => "50-59 : apparition de l’inflorescence",
303 
	        "58" => "50-59 : apparition de l’inflorescence",
304 
	        "59" => "50-59 : apparition de l’inflorescence",
305 
	        "10x En bouton" => "50-59 : apparition de l’inflorescence",
306 
	        "14x En bouton" => "50-59 : apparition de l’inflorescence",
307 
	        "20x En bouton" => "50-59 : apparition de l’inflorescence",
308 
	        "30-39" => "50-59 : apparition de l’inflorescence",
309 
	        "50-59" => "50-59 : apparition de l’inflorescence",
310 
	        "50-59: apparition de l'inflorescence, épiais" => "50-59 : apparition de l’inflorescence",
311 
	        "50-59: apparition de l'inflorescence, épiaison" => "50-59 : apparition de l’inflorescence",
312 
	        "59: apparition de l'inflorescence, épiaison" => "50-59 : apparition de l’inflorescence",
313 
	        "8x En bouton" => "50-59 : apparition de l’inflorescence",
314 
	        "60" => "60-69 : floraison",
315 
	        "62" => "60-69 : floraison",
316 
	        "63" => "60-69 : floraison",
317 
	        "64" => "60-69 : floraison",
318 
	        "66" => "60-69 : floraison",
319 
	        "67" => "60-69 : floraison",
320 
	        "68" => "60-69 : floraison",
321 
	        "69" => "60-69 : floraison",
322 
	        " floraison " => "60-69 : floraison",
323 
	        "-69: floraison" => "60-69 : floraison",
324 
	        "10x Fin de floraison" => "60-69 : floraison",
325 
	        "12x Pleine floraison" => "60-69 : floraison",
326 
	        "14x Début de floraison" => "60-69 : floraison",
327 
	        "150x Pleine floraison" => "60-69 : floraison",
328 
	        "17x Fin de floraison" => "60-69 : floraison",
329 
	        "1x Début de floraison" => "60-69 : floraison",
330 
	        "1x En fleur" => "60-69 : floraison",
331 
	        "1x Fin de floraison" => "60-69 : floraison",
332 
	        "1x Pleine floraison" => "60-69 : floraison",
333 
	        "20x Début de floraison" => "60-69 : floraison",
334 
	        "20x Pleine floraison" => "60-69 : floraison",
335 
	        "25x Pleine floraison" => "60-69 : floraison",
336 
	        "27x En fleur" => "60-69 : floraison",
337 
	        "30x Fin de floraison" => "60-69 : floraison",
338 
	        "35x Début de floraison" => "60-69 : floraison",
339 
	        "35x Fin de floraison" => "60-69 : floraison",
340 
	        "35x Pleine floraison" => "60-69 : floraison",
341 
	        "3x Fin de floraison" => "60-69 : floraison",
342 
	        "3x Pleine floraison" => "60-69 : floraison",
343 
	        "40x Début de floraison" => "60-69 : floraison",
344 
	        "44x Pleine floraison" => "60-69 : floraison",
345 
	        "48x Pleine floraison" => "60-69 : floraison",
346 
	        "4x Pleine floraison" => "60-69 : floraison",
347 
	        "50x Pleine floraison" => "60-69 : floraison",
348 
	        "5x Pleine floraison" => "60-69 : floraison",
349 
	        "6: floraison" => "60-69 : floraison",
350 
	        "60 : floraison en amorce, pétales jaunes, corolle non ouverte encore" => "60-69 : floraison",
351 
	        "60-" => "60-69 : floraison",
352 
	        "60-6: floraison" => "60-69 : floraison",
353 
	        "60-65" => "60-69 : floraison",
354 
	        "60-69" => "60-69 : floraison",
355 
	        "60-69 floraison" => "60-69 : floraison",
356 
	        "60-69 floraison +70-79: fructification" => "60-69 : floraison",
357 
	        "60-69: florai" => "60-69 : floraison",
358 
	        "60-69: florais" => "60-69 : floraison",
359 
	        "60-69: floraison" => "60-69 : floraison",
360 
	        "60-69: floraison - fructification" => "60-69 : floraison",
361 
	        "60-69: floraison (8" => "60-69 : floraison",
362 
	        "60-69: floraison 1 individu fleuri sur une trentaine" => "60-69 : floraison",
363 
	        "60-69: floraison à 50 pour" => "60-69 : floraison",
364 
	        "60-69: floraison Fleurs déjà fanées ou en cours de l'être" => "60-69 : floraison",
365 
	        "60-69: floraison floraison" => "60-69 : floraison",
366 
	        "60-69: floraison pour le 09/04/2019" => "60-69 : floraison",
367 
	        "60-69: floraison5" => "60-69 : floraison",
368 
	        "60-69: floraison6" => "60-69 : floraison",
369 
	        "60-69: floraisondi" => "60-69 : floraison",
370 
	        "60-69: floraisonentre les pierres du mur des quai" => "60-69 : floraison",
371 
	        "60-69: floraisonfleurs et fruit" => "60-69 : floraison",
372 
	        "60-69: floraisonl" => "60-69 : floraison",
373 
	        "60-69: floraisonvi" => "60-69 : floraison",
374 
	        "60-69: fructification" => "60-69 : floraison",
375 
	        "60: floraison" => "60-69 : floraison",
376 
	        "63: floraison" => "60-69 : floraison",
377 
	        "63: environ 3% des fleurs épanouies" => "60-69 : floraison",
378 
	        "64: floraison" => "60-69 : floraison",
379 
	        "66, avec quelques fruits" => "60-69 : floraison",
380 
	        "66: floraison" => "60-69 : floraison",
381 
	        "67 : floraison" => "60-69 : floraison",
382 
	        "67 Nbses fleurs épanouies," => "60-69 : floraison",
383 
	        "67: floraison" => "60-69 : floraison",
384 
	        "67: environ 70% des fleurs épanouies + formation de gousses." => "60-69 : floraison",
385 
	        "68: environ 0% des fleurs épanouies" => "60-69 : floraison",
386 
	        "68: floraison" => "60-69 : floraison",
387 
	        "68: environ 50% des fleurs épanouies" => "60-69 : floraison",
388 
	        "68: environ 80% des fleurs épanouies + formation des gousses." => "60-69 : floraison",
389 
	        "68floraison" => "60-69 : floraison",
390 
	        "69 (floraison de toutes fleurs)" => "60-69 : floraison",
391 
	        "69-70" => "60-69 : floraison",
392 
	        "69-70: fin de floraisonfructification" => "60-69 : floraison",
393 
	        "69-70n" => "60-69 : floraison",
394 
	        "69: 100% des fleurs épanouies" => "60-69 : floraison",
395 
	        "69s" => "60-69 : floraison",
396 
	        "82x Pleine floraison" => "60-69 : floraison",
397 
	        "9: floraison" => "60-69 : floraison",
398 
	        "début de ffloraison" => "60-69 : floraison",
399 
	        "début floraison" => "60-69 : floraison",
400 
	        "en fleurs" => "60-69 : floraison",
401 
	        "environ 30% des fleurs épanouies" => "60-69 : floraison",
402 
	        "environ 950% des fleurs épanouies" => "60-69 : floraison",
403 
	        "fin d floraison" => "60-69 : floraison",
404 
	        "fin de floraison" => "60-69 : floraison",
405 
	        "fin floraison" => "60-69 : floraison",
406 
	        "fl" => "60-69 : floraison",
407 
	        "fl2" => "60-69 : floraison",
408 
	        "fleur" => "60-69 : floraison",
409 
	        "Fleurs" => "60-69 : floraison",
410 
	        "fleurs épanouies; fin" => "60-69 : floraison",
411 
	        "floraison" => "60-69 : floraison",
412 
	        "Nombreux plants en début de floraison" => "60-69 : floraison",
413 
	        "61" => "61: environ 10% des fleurs épanouies",
414 
	        "10% des fleurs épanouies" => "61: environ 10% des fleurs épanouies",
415 
	        "61 :" => "61: environ 10% des fleurs épanouies",
416 
	        "61 :  environ 10% des fleurs épanouies" => "61: environ 10% des fleurs épanouies",
417 
	        "61: début defloraison" => "61: environ 10% des fleurs épanouies",
418 
	        "61: floraison" => "61: environ 10% des fleurs épanouies",
419 
	        "61: environ 10% des fleurs épanouie" => "61: environ 10% des fleurs épanouies",
420 
	        "61: environ 10% des fleurs épanouies" => "61: environ 10% des fleurs épanouies",
421 
	        "61: environ 10% des fleurs épanouies63" => "61: environ 10% des fleurs épanouies",
422 
	        "61: environ 10% des fleurs épanouies68" => "61: environ 10% des fleurs épanouies",
423 
	        "61: environ 2% des fleurs épanouies" => "61: environ 10% des fleurs épanouies",
424 
	        "61: environ20% des fleurs épanouies" => "61: environ 10% des fleurs épanouies",
425 
	        "Fleurs (environ 10% des fleurs épanouies)" => "61: environ 10% des fleurs épanouies",
426 
	        "65" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
427 
	        "65" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
428 
	        "6: environ 50% des fleurs épanouies" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
429 
	        "65 , avec quelques fruits" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
430 
	        "65 : environ 80% des fleurs épanouies" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
431 
	        "65 : environ 10% des fleurs ép" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
432 
	        "65 : environ 50% des fleurs épa" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
433 
	        "65 : environ 50% des fleurs épanouies" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
434 
	        "65 : environ 50% des fleurs épanouies-75" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
435 
	        "65-6: floraison" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
436 
	        "65-69: floraison" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
437 
	        "65-7: floraison" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
438 
	        "65-72" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
439 
	        "65:" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
440 
	        "65: floraison" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
441 
	        "65: environ 10% des fleurs épanouies" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
442 
	        "65: environ 50% des fleurs épanoui" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
443 
	        "65: environ 50% des fleurs épanouie6" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
444 
	        "65: environ 50% des fleurs épanouies" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
445 
	        "65: environ 50% des fleurs épanouies et fructification" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
446 
	        "65: environ 50% des fleurs épanouies75" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
447 
	        "65: environ 50% des fleurs épanouies78" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
448 
	        "65:-70" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
449 
	        "65:-75" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
450 
	        "avec quelques fruits, 65" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
451 
	        "nviron 50% des fleurs épanouies" => "65: environ 50% des fleurs épanouies",
452 
	        "70" => "70-79: fructification",
453 
	        "71" => "70-79: fructification",
454 
	        "72" => "70-79: fructification",
455 
	        "73" => "70-79: fructification",
456 
	        "74" => "70-79: fructification",
457 
	        "75" => "70-79: fructification",
458 
	        "76" => "70-79: fructification",
459 
	        "77" => "70-79: fructification",
460 
	        "78" => "70-79: fructification",
461 
	        "79" => "70-79: fructification",
462 
	        "7: fructification" => "70-79: fructification",
463 
	        "70-: fructification" => "70-79: fructification",
464 
	        "70-71" => "70-79: fructification",
465 
	        "70-79" => "70-79: fructification",
466 
	        "70-79: floraison" => "70-79: fructification",
467 
	        "70-79: fructification" => "70-79: fructification",
468 
	        "70-79: fructification ?" => "70-79: fructification",
469 
	        "70-79: fructification +floraison" => "70-79: fructification",
470 
	        "70-79: fructification Entre autre" => "70-79: fructification",
471 
	        "70-79: fructification, mais fruits verts" => "70-79: fructification",
472 
	        "70-79: fructificationfleurs et fruit" => "70-79: fructification",
473 
	        "70-79:fin floraison fructification" => "70-79: fructification",
474 
	        "709: fructification" => "70-79: fructification",
475 
	        "75: fructification" => "70-79: fructification",
476 
	        "Début de ruits" => "70-79: fructification",
477 
	        "fin floraison et fructification" => "70-79: fructification",
478 
	        "fleur, fruit" => "70-79: fructification",
479 
	        "fleurs e fructification" => "70-79: fructification",
480 
	        "Fleurs et début fruits" => "70-79: fructification",
481 
	        "Fleurs et début ruits" => "70-79: fructification",
482 
	        "Fleurs et fructification" => "70-79: fructification",
483 
	        "floraison - fructification" => "70-79: fructification",
484 
	        "floraison zet fructification" => "70-79: fructification",
485 
	        "Floraison, fructification" => "70-79: fructification",
486 
	        "floraison(fin) fructification" => "70-79: fructification",
487 
	        "floraison+ ou - finie" => "70-79: fructification",
488 
	        "fr1" => "70-79: fructification",
489 
	        "quelques fruits rares" => "70-79: fructification",
490 
	        "stérile70-79: fructification" => "70-79: fructification",
491 
	        "toutes les fleurs épanouies et début fructification" => "70-79: fructification",
492 
	        "fleurs et fruits" => "70-79: fructification",
493 
	        "Fleurs et jeunes fruits" => "70-79: fructification",
494 
	        "floraison + fructification" => "70-79: fructification",
495 
	        "Fructificaiton" => "70-79: fructification",
496 
	        "fleurs et quelques fruits" => "70-79: fructification",
497 
	        "Fleurs et surtout début defruits" => "70-79: fructification",
498 
	        "floraison et fructification" => "70-79: fructification",
499 
	        "fructification" => "70-79: fructification",
500 
	        "Fleurs/fruits" => "70-79: fructification",
501 
	        "fructification ?" => "70-79: fructification",
502 
	        "80" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
503 
	        "81" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
504 
	        "82" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
505 
	        "83" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
506 
	        "84" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
507 
	        "86" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
508 
	        "87" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
509 
	        "88" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
510 
	        "89" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
511 
	        "-89: maturité des fruits et des graines" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
512 
	        "80-89" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
513 
	        "80-89: maturité des fruits et des graines" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
514 
	        "80-89: maturité des fruits et des graines,début sénescence" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
515 
	        "80-95" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
516 
	        "88  maturité des fruits et des graines" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
517 
	        "89: maturité des fruits et des graines" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
518 
	        "floraison et fructification, graines mûres" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
519 
	        "floraison et maturation des graines" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
520 
	        "fructification passée" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
521 
	        "Fruit" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
522 
	        "Fruits" => "80-89: maturité des fruits et des graines",
523 
	        "85" => "85: 50% des fruits matures",
524 
	        "50% des fruits matures (fructification d'Août)î" => "85: 50% des fruits matures",
525 
	        "85, mais avec encore des fleurs" => "85: 50% des fruits matures",
526 
	        "85:" => "85: 50% des fruits matures",
527 
	        "85:   fruits matures 20" => "85: 50% des fruits matures",
528 
	        "85: 50% des fruits mature8" => "85: 50% des fruits matures",
529 
	        "85: 50% des fruits matures" => "85: 50% des fruits matures",
530 
	        "85: 50% des fruits matures0" => "85: 50% des fruits matures",
531 
	        "85: 50% des fruits matures56" => "85: 50% des fruits matures",
532 
	        "85: 50% des fruits matures88" => "85: 50% des fruits matures",
533 
	        "88: 50% des fruits matures" => "85: 50% des fruits matures",
534 
	        "90" => "90-99: sénescence et dormance",
535 
	        "91" => "90-99: sénescence et dormance",
536 
	        "92" => "90-99: sénescence et dormance",
537 
	        "94" => "90-99: sénescence et dormance",
538 
	        "95" => "90-99: sénescence et dormance",
539 
	        "97" => "90-99: sénescence et dormance",
540 
	        "98" => "90-99: sénescence et dormance",
541 
	        "99" => "90-99: sénescence et dormance",
542 
	        "100% de feuilles jaunes" => "90-99: sénescence et dormance",
543 
	        "80% feuillage d'automne" => "90-99: sénescence et dormance",
544 
	        "90-99" => "90-99: sénescence et dormance",
545 
	        "90-99: sénescence et dormance" => "90-99: sénescence et dormance",
546 
	        "95: environ 9% des feuilles jaunes" => "90-99: sénescence et dormance"
547 
	    );
548 
	    foreach ($phenologie as $valeur=>$saisie) {
549 
	        $requete = 'UPDATE '.$this->bd_cel.'.cel_obs SET commentaire = concat(commentaire, " Certitude : ", certitude), phenologie = "'.$saisie.'" WHERE phenologie ="'.$valeur.'"';
550 
	        $this->bdd->requeter($requete);
551 
	        echo "effectuée \n";
552 
	    }
553 
	    $requete_verif = "SELECT certitude FROM ".$this->bd_cel.".cel_obs WHERE certitude NOT IN ('douteux', 'certain', 'à déterminer', '') and certitude is not NULL";
554 
	    $verif = $this->bdd->recupererTous($requete_verif);
555 
	    if ($verif != array()) print_r($verif);
556 
	}
557 
 
3258 delphine 558 
	private function unifierUtilisateur() {
3438 delphine 559 
	    echo "vérification de la présence de l'annuaire \n";
3439 delphine 560 
	    $requete = "SELECT * FROM ".$this->bd_cel.".`users`;";
3438 delphine 561 
	    $result = $this->bdd->requeter($requete);
3439 delphine 562 
	    if ($result === NULL) {echo $requete;
3438 delphine 563 
	        echo "Il manque la table annuaire (à recopier de telaorg users\n";
564 
	        exit;
565 
	    }
566 
 
3297 delphine 567 
	    echo "suppression de le colonne ordre \n";
3439 delphine 568 
	    $requete = "ALTER TABLE ".$this->bd_cel.".cel_obs DROP INDEX id_obs;";
3297 delphine 569 
	    $this->bdd->requeter($requete);
3439 delphine 570 
	    $requete = "ALTER TABLE ".$this->bd_cel.".cel_obs DROP INDEX ordre;";
3297 delphine 571 
	    $this->bdd->requeter($requete);
3456 delphine 572 
	    $requete = "ALTER TABLE ".$this->bd_cel.".`cel_obs` DROP IF EXISTS `ordre`;";
3297 delphine 573 
	    $this->bdd->requeter($requete);
3456 delphine 574 
	    $requete = "ALTER TABLE ".$this->bd_cel.".`cel_obs` ADD IF NOT EXISTS pseudo  varchar(250);";
3438 delphine 575 
	    $this->bdd->requeter($requete);
3258 delphine 576 
 
577 
	    echo "modification des observations ayant une adresse mail en identifiant";
3449 delphine 578 
	    $requete_annu_mail = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_obs` right join ".$this->bd_cel.".`users` ON `user_email` = ce_utilisateur SET `ce_utilisateur` = `ID`, pseudo = user_nicename,
3438 delphine 579 
	        `courriel_utilisateur` =  `user_email`  WHERE ce_utilisateur like '%@%'";
3258 delphine 580 
	    $utilisateur_mail = $this->bdd->recupererTous($requete_annu_mail);
581 
 
582 
	    echo "modification des observations ayant une adresse mail mais pas d'identifiant";
3439 delphine 583 
	    $requete_annu_mail = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_obs` join ".$this->bd_cel.".`users` ON `user_email` = courriel_utilisateur SET `ce_utilisateur` = `ID`, pseudo = user_nicename,
3513 delphine 584 
	        `courriel_utilisateur` =  `user_email`  WHERE (ce_utilisateur IS NULL OR CHAR_LENGTH(ce_utilisateur) > 6
3258 delphine 585 
	        OR ce_utilisateur = 0) and courriel_utilisateur like '%@%'";
586 
	    $utilisateur_mail = $this->bdd->recupererTous($requete_annu_mail);
587 
 
588 
	    echo "modification des observations ayant un identifiant";
3439 delphine 589 
	    $requete_annu_mail = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_obs` join ".$this->bd_cel.".`users` ON ID = ce_utilisateur SET pseudo = user_nicename,
3513 delphine 590 
	        `courriel_utilisateur` =  `user_email` WHERE (ce_utilisateur IS NULL OR char_length(ce_utilisateur) > 6) and (courriel_utilisateur is null or courriel_utilisateur='')";
3258 delphine 591 
	    $utilisateur_mail = $this->bdd->recupererTous($requete_annu_mail);
592 
 
3296 delphine 593 
	    echo "suppression des autres valeurs ce_utilisateur";
3513 delphine 594 
	    $requete_annu_mail = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_obs` SET ce_utilisateur = NULL, courriel_utilisateur = if (ce_utilisateur like '%@%'and (courriel_utilisateur is null or courriel_utilisateur='') , ce_utilisateur, courriel_utilisateur) WHERE ce_utilisateur IS NOT NULL AND char_length(ce_utilisateur) > 6";
3296 delphine 595 
	    $utilisateur_mail = $this->bdd->recupererTous($requete_annu_mail);
596 
 
3438 delphine 597 
	    echo "suppression des obs anonymes";
3513 delphine 598 
	    $requete_anonyme = "DELETE FROM ".$this->bd_cel.".`cel_obs` WHERE (ce_utilisateur IS NULL OR char_length(ce_utilisateur) > 6
3438 delphine 599 
	        OR ce_utilisateur = 0) and (`courriel_utilisateur` is null or `courriel_utilisateur` not like '%@%')";
600 
	    $this->bdd->requeter($requete_anonyme);
3297 delphine 601 
 
3439 delphine 602 
	    $requete_verif = "SELECT `ce_utilisateur`, `prenom_utilisateur`, `nom_utilisateur`, `courriel_utilisateur`  FROM ".$this->bd_cel.".cel_obs
3513 delphine 603 
	            WHERE ce_utilisateur IS NOT NULL OR char_length(ce_utilisateur) > 6";
3438 delphine 604 
	    $verif = $this->bdd->recupererTous($requete_verif);
605 
	    if ($verif != array()) print_r($verif);
606 
	    echo "effectuée \n";
3456 delphine 607 
	    $this->unifierUtilisateurTag("cel_arbre_mots_cles_obs");
608 
	    $this->unifierUtilisateurTag("cel_arbre_mots_cles_images");
3438 delphine 609 
	}
610 
 
3456 delphine 611 
	private function unifierUtilisateurTag($table) {
612 
	    echo "séparation des identifiants en ce_utilisateur et courriel";
613 
	    $requete = "ALTER TABLE ".$this->bd_cel.".".$table." ADD courriel varchar(255);";
614 
	    $this->bdd->requeter($requete);
3462 delphine 615 
	    $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".".$table." SET courriel = id_utilisateur,
616 
	        id_utilisateur = NULL WHERE id_utilisateur like '%@%';";
3456 delphine 617 
	    $this->bdd->requeter($requete);
618 
	    echo "recherche des identifiants pour les tags ayant que des courriels dans users";
3461 delphine 619 
	    $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".".$table." join ".$this->bd_cel.".`users` ON `user_email` = courriel SET `id_utilisateur` = `ID`
3456 delphine 620 
	        WHERE courriel like '%@%';";
621 
	    $this->bdd->requeter($requete);
622 
	    echo "recherche des identifiants pour les tags ayant que des courriels dans obs";
623 
	    $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".".$table." t join ".$this->bd_cel.".`cel_obs` o ON
3461 delphine 624 
	        `courriel` = courriel_utilisateur SET t.`id_utilisateur` = o.`ce_utilisateur`
3456 delphine 625 
	        WHERE courriel_utilisateur like '%@%';";
626 
	    $this->bdd->requeter($requete);
627 
	    echo "suppression des tags sans identifiant";
3463 delphine 628 
	    $requete_anonyme = "DELETE FROM ".$this->bd_cel.".".$table." WHERE
3513 delphine 629 
	        (id_utilisateur IS NULL OR trim(id_utilisateur) = '') OR char_length(id_utilisateur) > 6";
3456 delphine 630 
	    $this->bdd->requeter($requete_anonyme);
631 
	    if ($table == "cel_arbre_mots_cles_obs") {
632 
    	    $requete_anonyme = "DELETE FROM ".$this->bd_cel.".`cel_mots_cles_obs_liaison`
633 
    	        WHERE `id_element_lie` not in (SELECT `id_observation` FROM ".$this->bd_cel.".`cel_obs`)
634 
    	            OR `id_mot_cle` NOT IN (SELECT `id_mot_cle` FROM ".$this->bd_cel.".`cel_arbre_mots_cles_obs`);";
635 
    	    $this->bdd->requeter($requete_anonyme);
636 
	    } else {
637 
	        $requete_anonyme = "DELETE FROM ".$this->bd_cel.".`cel_mots_cles_images_liaison`
638 
	            WHERE `id_element_lie` not in (SELECT `id_image` FROM ".$this->bd_cel.".`cel_images`)
639 
	                OR `id_mot_cle` NOT IN (SELECT `id_mot_cle` FROM ".$this->bd_cel.".`cel_arbre_mots_cles_images`);";
640 
	        $this->bdd->requeter($requete_anonyme);
641 
	    }
642 
	}
643 
 
3663 delphine 644 
	private function unifierInfosEspeces() {
645 
	    echo "maj infos espèces \n";
646 
	    /*$requete = "ALTER TABLE ".$this->bd_cel.".`cel_obs` ADD infosnn  varchar(2),
647 
	       ADD bd_nom_sci varchar(250), ADD bd_num_nom int(11), ADD bd_nom_sci_retenu varchar(250),
648 
	       ADD bd_num_nom_retenu int(11) ;";
649 
	    $this->bdd->requeter($requete);
650 
	    */
651 
	    $liste_referentiels = array("bdtfx" => "bdtfx_v6_00", "bdtre" => "bdtre_v1_00",
652 
	        "isfan" => "isfan_v2013", "apd" => "apd_v3_4_0", "bdtxa" => "bdtxa_v1_01",
653 
	        "aublet" => "aublet_v2016_09", "florical" => "florical_v2016_04_22", "lbf" => "lbf_v1_00");
654 
 
655 
	    $this->unifierInfosEspecesBDTFX();
656 
	    foreach ($liste_referentiels as $ref => $version) {
657 
    	    //Num nom et nom sci sont les mêmes
658 
    	    // chercher les versions
659 
    	    $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_obs`
660 
    	        join (SELECT `num_nom`, `num_nom_retenu`, `nom_sci`,
661 
    	        case when annee = '' THEN concat(`nom_sci`, ' ', auteur) ELSE concat(`nom_sci`, ' ', auteur, ' [',annee,']') END as nom_sci_complet,
662 
    	        nom_sci_complet_ret FROM ".$this->bd_flore.".".$version.
663 
 
664 
    	        'left join (select `num_nom` as nn, `nom_sci` as nom_sci_ret,
665 
    	        case when annee = "" THEN concat(`nom_sci`, " ", auteur) ELSE concat(`nom_sci`, " ", auteur, " [",annee,"]") END as nom_sci_complet_ret
666 
    	        from ".$this->bd_flore.".".$version." where `num_nom` = `num_nom_retenu`) ret
667 
    	            on `num_nom_retenu` = nn) bdtfx
668 
    	        on `nom_sel_nn` = num_nom and `nom_sel` like concat(nom_sci,"%")
669 
    	        SET `nom_sel` = nom_sci_complet, `nom_sel_nn` = num_nom , `nom_ret` = nom_sci_complet_ret, `nom_ret_nn` = num_nom_retenu,
670 
    	        infosnn = 1
671 
    	        WHERE nom_referentiel = "'.$ref.'"';
672 
    	    $this->bdd->requeter($requete);
673 
 
674 
    	    //Num nom id, nom sci !=
675 
    	    $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_obs`
676 
    	        join (SELECT `num_nom`, `num_nom_retenu`, `nom_sci`,
677 
    	        case when annee = '' THEN concat(`nom_sci`, ' ', auteur) ELSE concat(`nom_sci`, ' ', auteur, ' [',annee,']') END as nom_sci_complet,
678 
    	        nom_sci_complet_ret FROM ".$this->bd_flore.".".$version.
679 
 
680 
    	        'left join (select `num_nom` as nn, `nom_sci` as nom_sci_ret,
681 
    	        case when annee = "" THEN concat(`nom_sci`, " ", auteur) ELSE concat(`nom_sci`, " ", auteur, " [",annee,"]") END as nom_sci_complet_ret
682 
    	        from ".$this->bd_flore.".".$version." where `num_nom` = `num_nom_retenu`) ret
683 
    	            on `num_nom_retenu` = nn) bdtfx
684 
    	            on `nom_sel_nn` = num_nom and and (nom_sel like concat(nom_sci,"%") and nom_ret like concat(nom_sci,"%"))
685 
    	                and (nom_sel like concat(nom_sci_ret,"%") and nom_ret like concat(nom_sci_ret,"%"))
686 
    	        SET `nom_sel` = nom_sci_complet, `nom_sel_nn` = num_nom , `nom_ret` = nom_sci_complet_ret, `nom_ret_nn` = num_nom_retenu,
687 
    	        infosnn = 2
688 
    	        WHERE nom_referentiel = "'.$ref.'" and infosnn != 1';
689 
    	    $this->bdd->requeter($requete);
690 
    	    //
691 
	    }
692 
	}
693 
 
694 
	private function unifierInfosEspecesBDTFX() {
695 
	    echo "maj infos espèces \n";
696 
	    /*$requete = "ALTER TABLE ".$this->bd_cel.".`cel_obs` ADD infosnn  varchar(2),
697 
	     ADD bd_nom_sci varchar(250), ADD bd_num_nom int(11), ADD bd_nom_sci_retenu varchar(250),
698 
	     ADD bd_num_nom_retenu int(11) ;";
699 
	     $this->bdd->requeter($requete);
700 
	     */
701 
 
702 
	        //Num nom et nom sci sont les mêmes
703 
	        // chercher les versions
704 
	        $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_obs`"
705 
    	        .' join bdtfx on `nom_sel_nn` = num_nom and `nom_sel` like concat(nom_sci, "%")
706 
    	            SET `nom_sel` = nom_sci_complet, `nom_sel_nn` = num_nom ,
707 
    	            `nom_ret` = nom_ret_complet, `nom_ret_nn` = num_nom_retenu,
708 
    	            infosnn = 1
709 
    	            where `nom_referentiel` = "bdtfx" ';
710 
	        $this->bdd->requeter($requete);
711 
 
712 
	        //Num nom id, nom sci +-=
713 
	        $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_obs`"
714 
	            .' join bdtfx on `nom_sel_nn` = num_nom and and (nom_sel like concat(nom_sci,"%") and nom_ret like concat(nom_sci,"%"))
715 
    	            and (nom_sel like concat(nom_sci_ret,"%") and nom_ret like concat(nom_sci_ret,"%"))
716 
	                SET `nom_sel` = nom_sci_complet, `nom_sel_nn` = num_nom ,
717 
    	            `nom_ret` = nom_ret_complet, `nom_ret_nn` = num_nom_retenu,
718 
    	            infosnn = 2
719 
    	            where `nom_referentiel` = "bdtfx"  and infosnn != "1"';
720 
	        $this->bdd->requeter($requete);
721 
 
722 
	        //Num nom id, nom sci +-=
723 
	        $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_obs`"
724 
	            .' join bdtfx on `nom_sel_nn` = num_nom and and (nom_sel not like concat(nom_sci,"%") and nom_ret not like concat(nom_sci,"%"))
725 
    	            and (nom_sel not like concat(nom_sci_ret,"%") and nom_ret not like concat(nom_sci_ret,"%"))
726 
	                SET `bd_nom_sci` = nom_sci_complet, `bd_num_nom` = num_nom ,
727 
    	            `bd_nom_sci_retenu` = nom_ret_complet, `bd_num_nom_retenu` = num_nom_retenu,
728 
    	            infosnn = 3
729 
    	            where `nom_referentiel` = "bdtfx"  and infosnn not in ("1", "2")';
730 
	            $this->bdd->requeter($requete);
731 
	}
732 
 
3438 delphine 733 
	private function supprimerImagesetTagAnonymes() {
3463 delphine 734 
	    echo "vérification de la présence de l'annuaire \n";
735 
	    $requete = "SELECT * FROM ".$this->bd_cel.".`users`;";
736 
	    $result = $this->bdd->requeter($requete);
3663 delphine 737 
	    if ($result === NULL) {
738 
	        echo $requete;
739 
	        echo "Il manque la table annuaire (à recopier de telaorg users\n";
740 
	        exit;
3463 delphine 741 
	    }
742 
 
743 
	    echo "suppression de le colonne ordre \n";
744 
	    $requete = "ALTER TABLE ".$this->bd_cel.".cel_images DROP INDEX id_img;";
745 
	    $this->bdd->requeter($requete);
746 
	    $requete = "ALTER TABLE ".$this->bd_cel.".`cel_images` DROP IF EXISTS `ordre`;";
747 
	    $this->bdd->requeter($requete);
748 
	    $requete = "ALTER TABLE ".$this->bd_cel.".`cel_images` ADD IF NOT EXISTS pseudo  varchar(250);";
749 
	    $this->bdd->requeter($requete);
750 
 
751 
	    echo "modification des images ayant une adresse mail en identifiant";
752 
	    $requete_annu_mail = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_images` right join ".$this->bd_cel.".`users` ON `user_email` = ce_utilisateur SET `ce_utilisateur` = `ID`, pseudo = user_nicename,
753 
	        `courriel_utilisateur` =  `user_email`  WHERE ce_utilisateur like '%@%'";
754 
	    $utilisateur_mail = $this->bdd->recupererTous($requete_annu_mail);
755 
 
756 
	    echo "modification des images ayant une adresse mail mais pas d'identifiant";
757 
	    $requete_annu_mail = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_images` join ".$this->bd_cel.".`users` ON `user_email` = courriel_utilisateur SET `ce_utilisateur` = `ID`, pseudo = user_nicename,
3513 delphine 758 
	        `courriel_utilisateur` =  `user_email`  WHERE (ce_utilisateur IS NULL OR char_length(ce_utilisateur) > 6
3463 delphine 759 
	        OR ce_utilisateur = 0) and courriel_utilisateur like '%@%'";
760 
	    $utilisateur_mail = $this->bdd->recupererTous($requete_annu_mail);
761 
 
762 
	    echo "modification des images ayant un identifiant";
763 
	    $requete_annu_mail = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_images` join ".$this->bd_cel.".`users` ON ID = ce_utilisateur SET pseudo = user_nicename,
3513 delphine 764 
	        `courriel_utilisateur` =  `user_email` WHERE (ce_utilisateur IS NULL OR char_length(ce_utilisateur) > 6) and (courriel_utilisateur is null or courriel_utilisateur='')";
3463 delphine 765 
	    $utilisateur_mail = $this->bdd->recupererTous($requete_annu_mail);
766 
 
767 
	    echo "suppression des autres valeurs ce_utilisateur";
768 
	    $requete_annu_mail = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_images` SET ce_utilisateur = NULL, courriel_utilisateur = if (ce_utilisateur like '%@%'and (courriel_utilisateur is null or courriel_utilisateur='') , ce_utilisateur, courriel_utilisateur)
3465 delphine 769 
	        WHERE ce_utilisateur IS NOT NULL AND (LENGTH(ce_utilisateur) > 6 OR trim(ce_utilisateur) = '')";
3463 delphine 770 
	    $utilisateur_mail = $this->bdd->recupererTous($requete_annu_mail);
771 
 
772 
 
3465 delphine 773 
	    echo "suppression des images\n";
3513 delphine 774 
	    $requete_anonyme = "DELETE FROM ".$this->bd_cel.".`cel_images` WHERE (ce_utilisateur IS NULL OR char_length(ce_utilisateur) > 6
3297 delphine 775 
	        OR ce_utilisateur = 0) and (`courriel_utilisateur` is null or `courriel_utilisateur` not like '%@%')";
776 
	    $this->bdd->requeter($requete_anonyme);
3463 delphine 777 
 
778 
 
3456 delphine 779 
	  /*  echo "suppression des tags obs anonymes";
3439 delphine 780 
	    $requete_create = "CREATE TABLE ".$this->bd_cel.".user_mot_cle_absent AS SELECT distinct id_utilisateur FROM ".$this->bd_cel.".cel_arbre_mots_cles_obs WHERE id_utilisateur not in
781 
	            (SELECT distinct id_utilisateur FROM ".$this->bd_cel.".cel_arbre_mots_cles_obs WHERE id_utilisateur in
782 
	            (select distinct ce_utilisateur from ".$this->bd_cel.".cel_obs) or
783 
	            id_utilisateur in (SELECT distinct courriel_utilisateur FROM ".$this->bd_cel.".cel_obs))";
3438 delphine 784 
	    $this->bdd->requeter($requete_create);
3450 delphine 785 
	    $requete_index = "ALTER TABLE ".$this->bd_cel.".`user_mot_cle_absent` ADD PRIMARY KEY(`id_utilisateur`);";
3438 delphine 786 
	    $this->bdd->requeter($requete_index);
3451 delphine 787 
	    $requete_anonyme = "DELETE FROM ".$this->bd_cel.".`cel_arbre_mots_cles_obs` WHERE `id_utilisateur` in (SELECT * FROM ".$this->bd_cel.".`user_mot_cle_absent`);";
3297 delphine 788 
	    $this->bdd->requeter($requete_anonyme);
3450 delphine 789 
	    $requete_anonyme = "DROP TABLE ".$this->bd_cel.".user_mot_cle_absent;";
3297 delphine 790 
	    $this->bdd->requeter($requete_anonyme);
3450 delphine 791 
	    $requete_anonyme = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_arbre_mots_cles_obs` a join ".$this->bd_cel.".cel_obs b on a.`id_utilisateur` = b.courriel_utilisateur SET a.`id_utilisateur` = b.ce_utilisateur
3438 delphine 792 
	        WHERE b.ce_utilisateur IS NOT NULL AND b.ce_utilisateur != ''";
3456 delphine 793 
	    $this->bdd->requeter($requete_anonyme);*/
794 
 
3258 delphine 795 
	}
796 
 
2893 delphine 797 
	private function unifierNomReferentiel() {
798 
		echo "Uniformisation du nom de référentiel";
3456 delphine 799 
		$referentiels = array("bdtfx", "bdtre", "bdtxa", "apd", "lbf", "isfan");
2893 delphine 800 
		foreach ($referentiels as $referentiel) {
3439 delphine 801 
			$requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET nom_referentiel = '".$referentiel."' WHERE nom_referentiel like '".$referentiel."%'";
2893 delphine 802 
			$this->bdd->requeter($requete);
3513 delphine 803 
			$requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET nom_referentiel = 'Autre/inconnu' WHERE nom_sel_nn IS NULL or nom_sel_nn = '0'";
2894 delphine 804 
			$this->bdd->requeter($requete);
3456 delphine 805 
			$requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET nom_referentiel = 'apd' WHERE nom_referentiel like 'bdtao%'";
2895 delphine 806 
			$this->bdd->requeter($requete);
3456 delphine 807 
			$requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET nom_referentiel = 'bdtfx' WHERE nom_referentiel like 'bdnff%'";
2895 delphine 808 
			$this->bdd->requeter($requete);
2893 delphine 809 
			echo "effectuée \n";
3513 delphine 810 
			$requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET nom_referentiel = 'Autre/inconnu' WHERE nom_referentiel IS NULL or nom_referentiel = ''";
3296 delphine 811 
			$this->bdd->requeter($requete);
812 
			echo "effectuée \n";
2893 delphine 813 
		}
3513 delphine 814 
		$requete_verif = "SELECT nom_referentiel FROM ".$this->bd_cel.".cel_obs WHERE nom_referentiel NOT IN ('".implode("', '", $referentiels)."', 'Autre/inconnu')";
2893 delphine 815 
		$verif = $this->bdd->recupererTous($requete_verif);
816 
		if ($verif != array()) print_r($verif);
817 
	}
818 
 
3258 delphine 819 
	private function supprimerInfosLiesObsInexistante() {
820 
	    echo "Supprimer infos liés à obs inexistante";
3439 delphine 821 
	    $requete = "DELETE FROM ".$this->bd_cel.".`cel_obs_etendues` WHERE `id_observation` not in (select `id_observation` from ".$this->bd_cel.".cel_obs);";
3258 delphine 822 
	    $this->bdd->requeter($requete);
3439 delphine 823 
	    $requete = "DELETE FROM ".$this->bd_cel.".`cel_mots_cles_obs_liaison` WHERE `id_element_lie` not in (select `id_observation` from ".$this->bd_cel.".cel_obs);";
3258 delphine 824 
	    $this->bdd->requeter($requete);
3456 delphine 825 
	    $requete = "DELETE FROM ".$this->bd_cel.".`cel_mots_cles_obs_liaison` WHERE `id_mot_cle` not in (SELECT `id_mot_cle` FROM ".$this->bd_cel.".`cel_arbre_mots_cles_obs`);";
3258 delphine 826 
	    $this->bdd->requeter($requete);
3456 delphine 827 
	    $requete = "DELETE FROM ".$this->bd_cel.".`cel_images`  WHERE `ce_observation` is not null and `ce_observation` not in (select id_observation from ".$this->bd_cel.".cel_obs)";
3438 delphine 828 
	    $this->bdd->requeter($requete);
3439 delphine 829 
	    $requete = "DELETE FROM ".$this->bd_cel.".`cel_mots_cles_images_liaison` WHERE `id_element_lie` not in (select `id_image` from ".$this->bd_cel.".cel_images);";
3438 delphine 830 
	    $this->bdd->requeter($requete);
3456 delphine 831 
	    $requete = "DELETE FROM ".$this->bd_cel.".`cel_mots_cles_images_liaison` WHERE `id_mot_cle` not in (SELECT `id_mot_cle` FROM ".$this->bd_cel.".`cel_arbre_mots_cles_images`);";
3438 delphine 832 
	    $this->bdd->requeter($requete);
3258 delphine 833 
	    echo "effectuée \n";
834 
	}
835 
 
2893 delphine 836 
	private function verifierGeodatum() {
837 
		echo "Uniformisation du geodatum";
3439 delphine 838 
		$requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET geodatum = 'WGS84' WHERE (latitude IS NOT NULL or latitude != '0.00000') AND geodatum IS NULL";
2893 delphine 839 
		$this->bdd->requeter($requete);
3439 delphine 840 
		$requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET geodatum = NULL WHERE (latitude IS NULL or latitude = '0.00000')";
2895 delphine 841 
		$this->bdd->requeter($requete);
2893 delphine 842 
		echo "effectuée \n";
3456 delphine 843 
		echo "Suppression des coordonnées fausses : ";
844 
		$requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET latitude = NULL, longitude = NULL WHERE latitude < -90 OR latitude > 90 OR longitude < -180 OR longitude > 180";
845 
		$this->bdd->requeter($requete);
846 
		echo "effectuée \n";
2893 delphine 847 
	}
3258 delphine 848 
 
849 
	private function verifierCodeInsee() {
3456 delphine 850 
	    echo "Mise à jour des valeurs code_insee";
851 
	    $requete = 'UPDATE `cel_obs` SET `ce_zone_geo` = NULL,
852 
	        commentaire = concat(if(commentaire is null, "", concat(commentaire, ", ")), if(ce_zone_geo is null, "", concat("Zone geo : ",ce_zone_geo))) where `ce_zone_geo` not like "insee-c%"';
853 
	    $this->bdd->requeter($requete);
854 
	    $requete = 'UPDATE `cel_obs` SET `ce_zone_geo` = substr(`ce_zone_geo`, 9, 5) where `ce_zone_geo` like "insee-c:%"';
855 
	    $this->bdd->requeter($requete);
856 
	    $requete = 'UPDATE `cel_obs` SET `ce_zone_geo` = NULL where trim(`ce_zone_geo`) = ""';
857 
	    $this->bdd->requeter($requete);
858 
	    echo "effectuée \n";
859 
 
860 
 
3258 delphine 861 
	    echo "Vérification du code insee";
3456 delphine 862 
	    $requete = "ALTER TABLE ".$this->bd_cel.".`cel_obs` ADD IF NOT EXISTS `locality_consistency` INT(1) ;";
3297 delphine 863 
	    $this->bdd->requeter($requete);
864 
 
3439 delphine 865 
	    $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET locality_consistency = '0' WHERE
3258 delphine 866 
	        ((ce_zone_geo != 'INSEE-C:' and ce_zone_geo like 'INSEE-C:%') and code_insee_calcule != '') and
867 
	        replace(`ce_zone_geo`, 'INSEE-C:', '') != `code_insee_calcule`";
868 
	    $this->bdd->requeter($requete);
3439 delphine 869 
	    $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET locality_consistency = '1' WHERE
3258 delphine 870 
	        ((ce_zone_geo != 'INSEE-C:' and ce_zone_geo like 'INSEE-C:%') and code_insee_calcule != '') and
3296 delphine 871 
	        replace(`ce_zone_geo`, 'INSEE-C:', '') = `code_insee_calcule`";
872 
	    $this->bdd->requeter($requete);
873 
 
874 
	    $requete_verif = "SELECT `ce_zone_geo`, `code_insee_calcule`, `locality_consistency` FROM `cel_obs` WHERE `locality_consistency` IS NOT NULL";
875 
	    $verif = $this->bdd->recupererTous($requete_verif);
876 
	    if ($verif != array()) print_r($verif);
3258 delphine 877 
	    echo "effectuée \n";
878 
	}
879 
 
880 
	private function analyserMotsCles(){
3296 delphine 881 
	    echo "Input source \n";
3456 delphine 882 
	    $requete = "ALTER TABLE ".$this->bd_cel.".`cel_obs` ADD IF NOT EXISTS `input_source` VARCHAR(15)";
3297 delphine 883 
	    $this->bdd->requeter($requete);
884 
 
3510 killian 885 
	    $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET input_source = 'PlantNet' WHERE `mots_cles_texte` like '%plantnet%'";
3296 delphine 886 
	    $this->bdd->requeter($requete);
3258 delphine 887 
 
3439 delphine 888 
	    $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET input_source = 'autre' WHERE `mots_cles_texte` like '%MobileSauvages%'";
3296 delphine 889 
	    $this->bdd->requeter($requete);
890 
 
3447 delphine 891 
	    $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET input_source = 'widget' WHERE `mots_cles_texte` like '%Projets coopératifs%' and (input_source = '' OR input_source IS NULL)";
3296 delphine 892 
	    $this->bdd->requeter($requete);
893 
 
3447 delphine 894 
	    $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET input_source = 'widget' WHERE `mots_cles_texte` like '%widget%' and (input_source = '' OR input_source IS NULL)";
3296 delphine 895 
	    $this->bdd->requeter($requete);
896 
 
3510 killian 897 
	    $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET input_source = 'CEL' WHERE input_source = '' OR input_source IS NULL";
3296 delphine 898 
	    $this->bdd->requeter($requete);
3438 delphine 899 
 
3296 delphine 900 
	    echo "Suppression motcle du chemin \n";
3513 delphine 901 
	    $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_arbre_mots_cles_obs` SET chemin =
902 
	        if(CHAR_LENGTH(chemin)-CHAR_LENGTH(`mot_cle`) = 2, '\/', substr(`chemin`, 1, CHAR_LENGTH(chemin)-CHAR_LENGTH(`mot_cle`)-2))";
3296 delphine 903 
	    $this->bdd->requeter($requete);
904 
 
3513 delphine 905 
	    $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_arbre_mots_cles_images` SET chemin =
906 
	        substr(`chemin`, 1, CHAR_LENGTH(chemin)-CHAR_LENGTH(`mot_cle`)-1)";
3296 delphine 907 
	    $this->bdd->requeter($requete);
908 
 
909 
	    echo "Certitude à certaine quand obs validée sur ip \n";
3439 delphine 910 
	    $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_obs` c left join
3438 delphine 911 
	        (SELECT distinct `ce_observation`, `nom_sel_nn`
3439 delphine 912 
	        FROM ".$this->bd_del.".`del_commentaire` WHERE `proposition_retenue` = 1) d on
3296 delphine 913 
	        `ce_observation` = `id_observation` SET `certitude` = 'certain'
3438 delphine 914 
	        WHERE (c.`mots_cles_texte` LIKE '%adeterminer%'
3446 delphine 915 
	        or c.`certitude` = 'à déterminer') and c.`nom_sel_nn` = d.`nom_sel_nn`";
3296 delphine 916 
	    $this->bdd->requeter($requete);
917 
 
918 
	    echo "Certitude à douteux quand obs validée sur ip mais num_nom diff entre ip et cel \n";
3439 delphine 919 
	    $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_obs` c left join
3438 delphine 920 
	        (SELECT distinct `ce_observation`, `nom_sel_nn`
3439 delphine 921 
	        FROM ".$this->bd_del.".`del_commentaire`  WHERE `proposition_retenue` = 1 ) d on
3296 delphine 922 
	        `ce_observation` = `id_observation` SET `certitude` = 'douteux'
3438 delphine 923 
	        WHERE (c.`mots_cles_texte` LIKE '%adeterminer%'
3446 delphine 924 
	        or c.`certitude` = 'à déterminer') and c.`nom_sel_nn` != d.`nom_sel_nn`";
3296 delphine 925 
	    $this->bdd->requeter($requete);
926 
 
927 
	    echo "Certitude à aDeterminer quand obs non validée sur ip \n";
3446 delphine 928 
	    $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_obs` c SET `certitude` = 'à déterminer'
3296 delphine 929 
	        WHERE c.`mots_cles_texte` LIKE '%adeterminer%' AND
930 
	        (c.`certitude` = '' or c.certitude IS NULL)";
931 
	    $this->bdd->requeter($requete);
932 
 
3439 delphine 933 
	    $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".`cel_obs` SET
3296 delphine 934 
	        `mots_cles_texte` = REPLACE(`mots_cles_texte`, 'aDeterminer,', '')
935 
	        WHERE `mots_cles_texte` LIKE '%adeterminer,%'";
936 
	    $this->bdd->requeter($requete);
937 
 
3438 delphine 938 
 
3258 delphine 939 
	}
3303 delphine 940 
 
3438 delphine 941 
 
942 
 
3303 delphine 943 
	private function changerSensible(){
944 
	    echo "Sensible \n";
3456 delphine 945 
	    $requete = "ALTER TABLE ".$this->bd_cel.".`cel_obs` ADD IF NOT EXISTS `published_location` varchar(50)";
3303 delphine 946 
	    $this->bdd->requeter($requete);
947 
 
3439 delphine 948 
	    $requete = "UPDATE ".$this->bd_cel.".cel_obs SET published_location = 'localité' WHERE `mots_cles_texte` like '%sensible%'";
3303 delphine 949 
	    $this->bdd->requeter($requete);
950 
	}
2893 delphine 951 
}