71 |
delphine |
1 |
<?php
|
|
|
2 |
/**
|
|
|
3 |
* Service fournissant des informations sur les référentiels répondant aux critères de recherche
|
|
|
4 |
* fournis en paramètre.
|
|
|
5 |
* Encodage en entrée : utf8
|
|
|
6 |
* Encodage en sortie : utf8
|
72 |
delphine |
7 |
* @author Delphine CAUQUIL <delphine@tela-botanica.org>
|
|
|
8 |
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
|
71 |
delphine |
9 |
* @license http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
|
|
|
10 |
* @license http://www.gnu.org/licenses/gpl.html Licence GNU-GPL
|
72 |
delphine |
11 |
* @version $Id$
|
71 |
delphine |
12 |
* @copyright 2010 Tela-Botanica
|
|
|
13 |
*/
|
72 |
delphine |
14 |
|
71 |
delphine |
15 |
class Recherche extends Ref {
|
|
|
16 |
|
|
|
17 |
/**
|
|
|
18 |
* Méthode principale appelée avec une requête de type GET.
|
|
|
19 |
* Elle sert d'aiguilleur pour appeller la méthode correspondant au type de recherche passé en paramêtre.
|
|
|
20 |
*/
|
|
|
21 |
public function getElement($param = array()) {
|
|
|
22 |
// Initialisation des variables
|
|
|
23 |
$info = array();
|
|
|
24 |
|
72 |
delphine |
25 |
// Nous recherchons le type de requête demandé
|
71 |
delphine |
26 |
$type = $param[0];
|
|
|
27 |
|
|
|
28 |
$methode = 'getElement'.$type;
|
|
|
29 |
if (method_exists($this, $methode)) {
|
|
|
30 |
array_shift($param);
|
|
|
31 |
$info = $this->$methode($param);
|
|
|
32 |
} else {
|
|
|
33 |
$this->messages[] = "Le type de recherche demandé '$type' n'est pas disponible.";
|
|
|
34 |
}
|
|
|
35 |
|
|
|
36 |
// Envoie sur la sortie standard
|
|
|
37 |
$this->envoyer($info);
|
|
|
38 |
}
|
|
|
39 |
|
72 |
delphine |
40 |
/* Méthode pour récupérer le nombre de taxons répondant à la requête
|
|
|
41 |
* Appelée avec les paramètres d'url suivant :
|
|
|
42 |
* /Recherche/Nombre/_
|
|
|
43 |
* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés
|
|
|
44 |
* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
|
|
|
45 |
*/
|
|
|
46 |
public function getElementNombre($param) {
|
|
|
47 |
// Initialisation des variables
|
|
|
48 |
$info = array();
|
|
|
49 |
|
|
|
50 |
// Pré traitement des paramètres
|
|
|
51 |
$p = $this->pretraiterParametresUrl($param);
|
|
|
52 |
$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2);
|
|
|
53 |
|
|
|
54 |
// Construction de la requête
|
|
|
55 |
// Il est important de compter le nombre de taxons pour l'affichage
|
|
|
56 |
$requete = (($this->distinct) ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' COUNT(num_nom) AS nbre FROM '.$referentiel.
|
306 |
delphine |
57 |
$this->construireWhere($p, $referentiel).' ';
|
72 |
delphine |
58 |
// Récupération des résultats
|
|
|
59 |
try {
|
|
|
60 |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetch(PDO::FETCH_ASSOC);
|
|
|
61 |
if ($donnees === false) {
|
235 |
delphine |
62 |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat : $requete";
|
72 |
delphine |
63 |
} else {
|
|
|
64 |
$info = $donnees['nbre'];
|
|
|
65 |
}
|
|
|
66 |
} catch (PDOException $e) {
|
235 |
delphine |
67 |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()).$requete;
|
72 |
delphine |
68 |
}
|
|
|
69 |
|
|
|
70 |
return $info;
|
|
|
71 |
}
|
|
|
72 |
|
|
|
73 |
/* Méthode pour récupérer une liste de taxons
|
71 |
delphine |
74 |
* Appelée avec les paramêtres d'url suivant :
|
72 |
delphine |
75 |
* /Recherche/ParDefaut/_
|
|
|
76 |
* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés
|
|
|
77 |
* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
|
71 |
delphine |
78 |
*/
|
|
|
79 |
public function getElementParDefaut($param) {
|
|
|
80 |
// Initialisation des variables
|
|
|
81 |
$info = array();
|
|
|
82 |
|
72 |
delphine |
83 |
// Pré traitement des paramètres
|
71 |
delphine |
84 |
$p = $this->pretraiterParametresUrl($param);
|
|
|
85 |
$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2);
|
|
|
86 |
|
72 |
delphine |
87 |
// Construction de la requête
|
149 |
jpm |
88 |
$requete = (($this->distinct) ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' num_nom, nom_sci, auteur, annee, '.
|
251 |
delphine |
89 |
'biblio_origine, nom_addendum, num_nom_retenu, presence, exclure_taxref'.
|
306 |
delphine |
90 |
' FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p, $referentiel).
|
282 |
delphine |
91 |
'ORDER BY '.((!is_null($this->orderby)) ? $this->orderby : 'nom_sci ASC').' '.
|
291 |
delphine |
92 |
"LIMIT $this->start, $this->limit ";
|
71 |
delphine |
93 |
|
72 |
delphine |
94 |
// Récupération des résultats
|
|
|
95 |
try {
|
|
|
96 |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
|
|
|
97 |
if ($donnees === false) {
|
235 |
delphine |
98 |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat : $requete";
|
72 |
delphine |
99 |
} else {
|
|
|
100 |
$info = $donnees;
|
71 |
delphine |
101 |
}
|
72 |
delphine |
102 |
} catch (PDOException $e) {
|
235 |
delphine |
103 |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()).$requete;
|
71 |
delphine |
104 |
}
|
72 |
delphine |
105 |
return $info;
|
71 |
delphine |
106 |
}
|
|
|
107 |
|
72 |
delphine |
108 |
|
|
|
109 |
/* Méthode pour récupérer le nombre de taxons répondant à une requête sur la synonymie
|
|
|
110 |
* Appelée avec les paramètres d'url suivant :
|
|
|
111 |
* /Recherche/Nombre/_
|
|
|
112 |
* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés
|
|
|
113 |
* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
|
71 |
delphine |
114 |
*/
|
72 |
delphine |
115 |
public function getElementNombreTaxon($param) {
|
71 |
delphine |
116 |
// Initialisation des variables
|
|
|
117 |
$info = array();
|
|
|
118 |
|
72 |
delphine |
119 |
// Pré traitement des paramètres
|
71 |
delphine |
120 |
$p = $this->pretraiterParametresUrl($param);
|
|
|
121 |
$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2);
|
|
|
122 |
|
72 |
delphine |
123 |
|
71 |
delphine |
124 |
// Construction de la requête
|
72 |
delphine |
125 |
// Il est important de compter le nombre de taxons pour l'affichage
|
306 |
delphine |
126 |
$requete = 'SELECT count(DISTINCT num_nom_retenu) as nbr FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p, $referentiel).';';
|
71 |
delphine |
127 |
|
|
|
128 |
// Récupération des résultats
|
|
|
129 |
try {
|
|
|
130 |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetch(PDO::FETCH_ASSOC);
|
|
|
131 |
if ($donnees === false) {
|
|
|
132 |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat.";
|
|
|
133 |
} else {
|
72 |
delphine |
134 |
$info = $donnees['nbr'];
|
71 |
delphine |
135 |
}
|
|
|
136 |
} catch (PDOException $e) {
|
|
|
137 |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
|
|
|
138 |
}
|
|
|
139 |
|
|
|
140 |
return $info;
|
|
|
141 |
}
|
|
|
142 |
|
72 |
delphine |
143 |
/* Méthode pour récupérer une liste de taxons
|
|
|
144 |
* Appelée avec les paramêtres d'url suivant :
|
|
|
145 |
* /Recherche/ParDefaut/_
|
|
|
146 |
* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés
|
|
|
147 |
* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
|
|
|
148 |
*/
|
|
|
149 |
public function getElementParTaxon($param) {
|
|
|
150 |
// Initialisation des variables
|
88 |
delphine |
151 |
$info = '';
|
72 |
delphine |
152 |
|
|
|
153 |
// Pré traitement des paramètres
|
|
|
154 |
$p = $this->pretraiterParametresUrl($param);
|
|
|
155 |
$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2);
|
|
|
156 |
|
|
|
157 |
$liste_nom = $this->getNomRetenu($param);
|
88 |
delphine |
158 |
if ($liste_nom != '') {
|
|
|
159 |
// Construction de la requête
|
|
|
160 |
// si recherche des synonymes
|
149 |
jpm |
161 |
$requete = (($this->distinct) ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' num_nom, nom_sci, auteur, annee, '.
|
317 |
delphine |
162 |
'biblio_origine, nom_addendum, num_nom_retenu, '.(($referentiel == "bdtfx" || $referentiel == "bdtre") ? 'num_basionyme' :
|
306 |
delphine |
163 |
'basionyme').', synonyme_mal_applique, presence, exclure_taxref '.
|
242 |
delphine |
164 |
' FROM '.$referentiel.' WHERE num_nom_retenu IN ('.$liste_nom.') '.
|
284 |
delphine |
165 |
'ORDER BY nom_sci ASC ';
|
88 |
delphine |
166 |
try {
|
|
|
167 |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
|
|
|
168 |
$info = $donnees;
|
|
|
169 |
} catch (PDOException $e) {
|
|
|
170 |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
|
|
|
171 |
}
|
284 |
delphine |
172 |
}
|
72 |
delphine |
173 |
return $info;
|
88 |
delphine |
174 |
|
72 |
delphine |
175 |
}
|
|
|
176 |
|
297 |
aurelien |
177 |
/* Méthode pour récupérer une liste de taxons
|
|
|
178 |
* Appelée avec les paramêtres d'url suivant :
|
|
|
179 |
* /Recherche/ParDefaut/_
|
|
|
180 |
* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés
|
|
|
181 |
* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
|
|
|
182 |
*/
|
|
|
183 |
public function getElementNombreSynonymeParTaxon($param) {
|
|
|
184 |
// Initialisation des variables
|
|
|
185 |
$info = '';
|
|
|
186 |
|
|
|
187 |
// Pré traitement des paramètres
|
|
|
188 |
$p = $this->pretraiterParametresUrl($param);
|
|
|
189 |
$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2);
|
|
|
190 |
|
|
|
191 |
$liste_nom = $this->getNomRetenu($param);
|
|
|
192 |
if ($liste_nom != '') {
|
|
|
193 |
// Construction de la requête
|
|
|
194 |
// si recherche des synonymes
|
|
|
195 |
$requete = (($this->distinct) ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' COUNT(num_nom) as nbr, num_nom_retenu '.
|
|
|
196 |
'FROM '.$referentiel.' WHERE num_nom_retenu IN ('.$liste_nom.') GROUP BY num_nom_retenu '.
|
|
|
197 |
'ORDER BY nom_sci ASC ';
|
|
|
198 |
try {
|
|
|
199 |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
|
|
|
200 |
foreach($donnees as $ligne) {
|
|
|
201 |
$info[$ligne['num_nom_retenu']] = $ligne['nbr'];
|
|
|
202 |
}
|
|
|
203 |
} catch (PDOException $e) {
|
|
|
204 |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
|
|
|
205 |
}
|
|
|
206 |
}
|
|
|
207 |
return $info;
|
|
|
208 |
|
|
|
209 |
}
|
|
|
210 |
|
285 |
gduche |
211 |
/**
|
|
|
212 |
* Récupérer le nombre de taxons d'une classifiation (infra ou supra)
|
|
|
213 |
* Appelée avec les paramètres d'url suivant :
|
|
|
214 |
* /Recherche/NombreClassif/_
|
|
|
215 |
* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés
|
|
|
216 |
* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
|
|
|
217 |
*/
|
|
|
218 |
public function getElementNombreClassif($param) {
|
|
|
219 |
// Initialisation des variables
|
|
|
220 |
$info = array();
|
|
|
221 |
|
|
|
222 |
// Pré traitement des paramètres
|
|
|
223 |
$p = $this->pretraiterParametresUrl($param);
|
|
|
224 |
$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2);
|
|
|
225 |
|
|
|
226 |
$requete = '';
|
|
|
227 |
if (isset($p['classif'])) {
|
|
|
228 |
if (!isset($p['nn'])) {
|
|
|
229 |
$p['rg'] = 180;
|
|
|
230 |
}
|
|
|
231 |
|
|
|
232 |
if ($p['classif'] == 'infra') {
|
|
|
233 |
$requete = 'SELECT COUNT(num_nom) as nbr '.
|
|
|
234 |
'FROM '.$referentiel.' '.
|
|
|
235 |
'WHERE num_tax_sup IN '.
|
|
|
236 |
'(SELECT num_nom '.
|
306 |
delphine |
237 |
'FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p, $referentiel).') ';
|
285 |
gduche |
238 |
} else {
|
|
|
239 |
$requete = 'SELECT count(distinct num_tax_sup) as nbr '.
|
306 |
delphine |
240 |
'FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p, $referentiel).' ';
|
285 |
gduche |
241 |
|
|
|
242 |
}
|
|
|
243 |
|
|
|
244 |
} else {
|
|
|
245 |
// Construction de la requête
|
|
|
246 |
// Il est important de compter le nombre de taxons pour l'affichage
|
306 |
delphine |
247 |
$requete = 'SELECT count(DISTINCT num_nom_retenu) as nbr FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p, $referentiel).';';
|
285 |
gduche |
248 |
}
|
|
|
249 |
// Récupération des résultats
|
|
|
250 |
try {
|
|
|
251 |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetch(PDO::FETCH_ASSOC);
|
|
|
252 |
if ($donnees === false) {
|
|
|
253 |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat.";
|
|
|
254 |
} else {
|
|
|
255 |
$info = $donnees['nbr'];
|
|
|
256 |
|
|
|
257 |
}
|
|
|
258 |
} catch (PDOException $e) {
|
|
|
259 |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
|
|
|
260 |
}
|
|
|
261 |
|
|
|
262 |
return $info;
|
|
|
263 |
}
|
297 |
aurelien |
264 |
|
|
|
265 |
/**
|
|
|
266 |
* Récupérer le nombre de taxons d'une classifiation (infra ou supra)
|
|
|
267 |
* Appelée avec les paramètres d'url suivant :
|
|
|
268 |
* /Recherche/NombreClassif/_
|
|
|
269 |
* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés
|
|
|
270 |
* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
|
|
|
271 |
*/
|
|
|
272 |
public function getElementNombreClassifParTaxon($param) {
|
|
|
273 |
// Initialisation des variables
|
|
|
274 |
$info = array();
|
|
|
275 |
|
|
|
276 |
// Pré traitement des paramètres
|
|
|
277 |
$p = $this->pretraiterParametresUrl($param);
|
|
|
278 |
$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2);
|
|
|
279 |
|
|
|
280 |
$requete = '';
|
|
|
281 |
if (isset($p['classif'])) {
|
|
|
282 |
if (!isset($p['nn'])) {
|
|
|
283 |
$p['rg'] = 180;
|
|
|
284 |
}
|
|
|
285 |
|
|
|
286 |
if ($p['classif'] == 'infra') {
|
|
|
287 |
$requete = 'SELECT COUNT(num_nom) as nbr, num_tax_sup '.
|
|
|
288 |
'FROM '.$referentiel.' '.
|
|
|
289 |
'WHERE num_tax_sup IN '.
|
|
|
290 |
'(SELECT num_nom '.
|
306 |
delphine |
291 |
'FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p, $referentiel).') GROUP BY num_tax_sup';
|
297 |
aurelien |
292 |
} else {
|
|
|
293 |
$requete = 'SELECT count(distinct num_tax_sup) as nbr, num_tax_sup '.
|
306 |
delphine |
294 |
'FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p, $referentiel).' GROUP BY num_tax_sup';
|
297 |
aurelien |
295 |
}
|
|
|
296 |
} else {
|
|
|
297 |
// Construction de la requête
|
|
|
298 |
// Il est important de compter le nombre de taxons pour l'affichage
|
306 |
delphine |
299 |
$requete = 'SELECT count(DISTINCT num_nom_retenu) as nbr, num_tax_sup FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p, $referentiel).' GROUP BY num_tax_sup;';
|
297 |
aurelien |
300 |
}
|
|
|
301 |
// Récupération des résultats
|
|
|
302 |
try {
|
|
|
303 |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
|
|
|
304 |
if ($donnees === false) {
|
|
|
305 |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat.";
|
|
|
306 |
} else {
|
|
|
307 |
foreach($donnees as $ligne) {
|
|
|
308 |
$info[$ligne['num_tax_sup']] = $ligne['nbr'];
|
|
|
309 |
}
|
|
|
310 |
}
|
|
|
311 |
} catch (PDOException $e) {
|
|
|
312 |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
|
|
|
313 |
}
|
|
|
314 |
|
|
|
315 |
return $info;
|
|
|
316 |
}
|
285 |
gduche |
317 |
|
|
|
318 |
/**
|
|
|
319 |
* Récupérer la classification d'un taxon donné (ses enfants ou parents)
|
|
|
320 |
* Appelée avec les paramêtres d'url suivant :
|
|
|
321 |
* /Recherche/Hierarchie/_
|
|
|
322 |
* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés (dont classif est le sens de la requête infra ou supra)
|
|
|
323 |
* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
|
|
|
324 |
*/
|
|
|
325 |
public function getElementClassification($param) {
|
|
|
326 |
|
|
|
327 |
$resultats = array();
|
|
|
328 |
|
|
|
329 |
try {
|
|
|
330 |
$p = $this->pretraiterParametresUrl($param);
|
|
|
331 |
$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2);
|
|
|
332 |
$classif = $p['classif'];
|
|
|
333 |
|
|
|
334 |
//Si on ne recherche pas sur un numéro taxonomique, on veut ne trouver que les familles
|
|
|
335 |
if (!isset($p['nn'])) {
|
|
|
336 |
$p['rg'] = 180;
|
|
|
337 |
}
|
|
|
338 |
|
|
|
339 |
// Récupérer les informations du nom sélectionné
|
|
|
340 |
$requete = (($this->distinct) ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').
|
|
|
341 |
' num_nom, nom_sci, auteur, annee, biblio_origine, nom_addendum,'.
|
|
|
342 |
' num_nom_retenu, presence, exclure_taxref, num_tax_sup'.
|
306 |
delphine |
343 |
' FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p, $referentiel).
|
285 |
gduche |
344 |
' ORDER BY '.((!is_null($this->orderby)) ? $this->orderby : 'nom_sci ASC');
|
297 |
aurelien |
345 |
|
285 |
gduche |
346 |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
|
297 |
aurelien |
347 |
|
285 |
gduche |
348 |
if ($donnees === false) {
|
|
|
349 |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat : $requete";
|
|
|
350 |
} else {
|
|
|
351 |
|
|
|
352 |
if ($classif == 'infra') {
|
|
|
353 |
$resultats = $this->trouverInfra($referentiel, $donnees);
|
|
|
354 |
} else {
|
|
|
355 |
$resultats = $this->trouverSupra($referentiel, $donnees);
|
|
|
356 |
}
|
|
|
357 |
}
|
|
|
358 |
} catch (PDOException $e) {
|
|
|
359 |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()).$requete;
|
|
|
360 |
}
|
|
|
361 |
return $resultats;
|
|
|
362 |
}
|
|
|
363 |
|
|
|
364 |
/**
|
|
|
365 |
* Parcourir les données passées en paramètre pour trouver les taxons inférieurs
|
|
|
366 |
* @param $referentiel String le référentiel pour la requête
|
|
|
367 |
* @param $donnees Array un tableau de résultats contenant des lignes taxons
|
|
|
368 |
* @return un tableau de résultats contenant les taxons inférieurs
|
|
|
369 |
* */
|
|
|
370 |
public function trouverInfra($referentiel, $donnees) {
|
297 |
aurelien |
371 |
$resultats = array();
|
285 |
gduche |
372 |
foreach ($donnees as $taxon) {
|
|
|
373 |
|
297 |
aurelien |
374 |
$donneesInfras = array();
|
285 |
gduche |
375 |
$requete = 'SELECT DISTINCT '.
|
|
|
376 |
' num_nom, nom_sci, auteur, annee, biblio_origine, nom_addendum,'.
|
|
|
377 |
' num_nom_retenu, presence, exclure_taxref'.
|
|
|
378 |
' FROM '.$referentiel.
|
|
|
379 |
' WHERE num_tax_sup = '.$taxon['num_nom'].' '.
|
|
|
380 |
' ORDER BY '.((!is_null($this->orderby)) ? $this->orderby : 'nom_sci ASC').' '.
|
|
|
381 |
"LIMIT $this->start, $this->limit ";
|
297 |
aurelien |
382 |
|
285 |
gduche |
383 |
$donneesInfras = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
|
|
|
384 |
if ($donneesInfras !== false) {
|
|
|
385 |
$resultats = array_merge($resultats, $donneesInfras);
|
|
|
386 |
}
|
|
|
387 |
}
|
297 |
aurelien |
388 |
return $resultats;
|
285 |
gduche |
389 |
}
|
|
|
390 |
|
|
|
391 |
/**
|
|
|
392 |
* Parcourir les données passées en paramètre pour trouver les taxons supérieurs
|
|
|
393 |
* @param $referentiel String le référentiel pour la requête
|
|
|
394 |
* @param $donnees Array un tableau de résultats contenant des lignes taxons
|
|
|
395 |
* @return un tableau de résultats contenant les taxons supérieurs
|
|
|
396 |
* */
|
|
|
397 |
public function trouverSupra($referentiel, $donnees) {
|
|
|
398 |
$resultats = array();
|
|
|
399 |
$numNomSup = array();
|
|
|
400 |
|
|
|
401 |
foreach ($donnees as $taxon) {
|
|
|
402 |
$numNomSup[] = $taxon['num_tax_sup'];
|
|
|
403 |
}
|
|
|
404 |
|
|
|
405 |
// Récupérer les taxons supérieurs :
|
|
|
406 |
$requete = 'SELECT DISTINCT '.
|
|
|
407 |
' num_nom, nom_sci, auteur, annee, biblio_origine, nom_addendum,'.
|
|
|
408 |
' num_nom_retenu, presence, exclure_taxref, num_tax_sup'.
|
|
|
409 |
' FROM '.$referentiel.
|
|
|
410 |
' WHERE num_nom IN ('.implode(',', $numNomSup).') '.
|
|
|
411 |
' ORDER BY '.((!is_null($this->orderby)) ? $this->orderby : 'nom_sci ASC').' '.
|
|
|
412 |
"LIMIT $this->start, $this->limit ";
|
|
|
413 |
|
|
|
414 |
$donneesSupras = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
|
|
|
415 |
|
|
|
416 |
if ($donneesSupras !== false) {
|
|
|
417 |
$resultats = $donneesSupras;
|
|
|
418 |
}
|
|
|
419 |
|
|
|
420 |
return $resultats;
|
|
|
421 |
}
|
|
|
422 |
|
72 |
delphine |
423 |
/* Méthode pour récupérer une liste de noms retenus
|
|
|
424 |
*/
|
|
|
425 |
public function getNomRetenu($param) {
|
|
|
426 |
// Initialisation des variables
|
|
|
427 |
$info = array();
|
|
|
428 |
|
|
|
429 |
// Pré traitement des paramètres
|
|
|
430 |
$p = $this->pretraiterParametresUrl($param);
|
|
|
431 |
$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2);
|
|
|
432 |
|
|
|
433 |
// Construction de la requête
|
|
|
434 |
// si recherche des synonymes
|
306 |
delphine |
435 |
$requete_nom_retenu = 'SELECT DISTINCT num_nom_retenu FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p, $referentiel)
|
293 |
delphine |
436 |
." ORDER BY nom_sci ASC LIMIT $this->start, $this->limit ".';';
|
72 |
delphine |
437 |
try {
|
|
|
438 |
$info = '';
|
|
|
439 |
$donnees_nom_retenu = $this->bdd->query($requete_nom_retenu)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
|
|
|
440 |
|
|
|
441 |
if ($donnees_nom_retenu === false) {
|
|
|
442 |
$this->messages[] = "La requête n'a retourné aucun résultat.";
|
|
|
443 |
} else {
|
|
|
444 |
$liste_nom = '';
|
|
|
445 |
foreach ($donnees_nom_retenu as $donnees_nom) {
|
|
|
446 |
if ($donnees_nom['num_nom_retenu'] != '') {
|
|
|
447 |
$liste_nom .= (!empty($liste_nom) ? ', ' : '').'"'.$donnees_nom['num_nom_retenu'].'"';
|
|
|
448 |
}
|
|
|
449 |
}
|
|
|
450 |
$info = $liste_nom;
|
|
|
451 |
}
|
|
|
452 |
} catch (PDOException $e) {
|
|
|
453 |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
|
|
|
454 |
}
|
|
|
455 |
return $info;
|
|
|
456 |
}
|
|
|
457 |
|
71 |
delphine |
458 |
private function pretraiterParametresUrl($param) {
|
72 |
delphine |
459 |
// Tableau des paramètres qui peuvent être passés dans l'url
|
71 |
delphine |
460 |
$params_passes = array('ref' => 'str',
|
|
|
461 |
'mots' => 'str',
|
132 |
delphine |
462 |
'sg' => 'str_exact',
|
|
|
463 |
'gen' => 'str_exact',
|
|
|
464 |
'sp' => 'str_exact',
|
|
|
465 |
'ssp' => 'str_exact',
|
71 |
delphine |
466 |
'au' => 'str',
|
|
|
467 |
'an' => 'str',
|
|
|
468 |
'nn' => 'int',
|
|
|
469 |
'bib' => 'str',
|
|
|
470 |
'nr' => 'bool',
|
235 |
delphine |
471 |
'tax' => 'bool',
|
|
|
472 |
'pre' => 'bool',
|
285 |
gduche |
473 |
'taxref' => 'bool',
|
|
|
474 |
'classif' => '',
|
|
|
475 |
'rg' => 'int');
|
71 |
delphine |
476 |
|
|
|
477 |
$p = $this->traiterParametresUrl(array_keys($params_passes), $param, false);
|
109 |
jpm |
478 |
//$this->debug[] = $param;
|
71 |
delphine |
479 |
foreach ($params_passes as $param_passe => $type) {
|
|
|
480 |
if (isset($p[$param_passe])) {
|
|
|
481 |
// Suppression des éventuels espaces en début et fin de chaine
|
|
|
482 |
$valeur = trim($p[$param_passe]);
|
|
|
483 |
|
72 |
delphine |
484 |
// Type de paramètre chaine
|
71 |
delphine |
485 |
if ($type == 'str') {
|
|
|
486 |
// Suppression des slash
|
|
|
487 |
$valeur = stripslashes($valeur);
|
|
|
488 |
|
290 |
delphine |
489 |
// Utilisation d'une recherche de chaîne
|
71 |
delphine |
490 |
if (preg_match('/^"(.*)"$/', $valeur, $match)) {
|
|
|
491 |
$valeur = '%'.$match[1].'%';
|
290 |
delphine |
492 |
} elseif ($valeur == "#") {
|
|
|
493 |
}else{
|
71 |
delphine |
494 |
// Recherche de mots non liés
|
|
|
495 |
$mots = explode(' ', $valeur);
|
|
|
496 |
$valeur = '%'.implode ('%', $mots).'%';
|
|
|
497 |
}
|
72 |
delphine |
498 |
// Mise en place des quotes pour l'interrogation dans la bdd
|
71 |
delphine |
499 |
$valeur = $this->bdd->quote($valeur);
|
|
|
500 |
}
|
132 |
delphine |
501 |
// Type de paramètre chaine exacte
|
|
|
502 |
if ($type == 'str_exact') {
|
|
|
503 |
// Suppression des slash
|
|
|
504 |
$valeur = stripslashes($valeur);
|
|
|
505 |
|
|
|
506 |
// Utilisation d'une recherche de chaîne exacte
|
|
|
507 |
if (preg_match('/^"(.*)"$/', $valeur, $match)) {
|
282 |
delphine |
508 |
$valeur = $match[1];
|
132 |
delphine |
509 |
} else {
|
|
|
510 |
// Recherche de mots non liés
|
|
|
511 |
$mots = explode(' ', $valeur);
|
282 |
delphine |
512 |
$valeur = implode (' ', $mots);
|
132 |
delphine |
513 |
}
|
|
|
514 |
// Mise en place des quotes pour l'interrogation dans la bdd
|
|
|
515 |
$valeur = $this->bdd->quote($valeur);
|
|
|
516 |
}
|
72 |
delphine |
517 |
// Type de paramètre booléen
|
71 |
delphine |
518 |
if ($type == 'bool') {
|
|
|
519 |
if (preg_match('/^[0]$/', $valeur)) {
|
|
|
520 |
$valeur = false;
|
|
|
521 |
} else if (preg_match('/^[1]$/', $valeur)) {
|
|
|
522 |
$valeur = true;
|
|
|
523 |
} else {
|
72 |
delphine |
524 |
$this->messages[] = "Le paramètre '$param_passe' attend une valeur de type 0 ou 1 et non '$valeur'.";
|
71 |
delphine |
525 |
$valeur = null;
|
|
|
526 |
}
|
|
|
527 |
|
|
|
528 |
}
|
72 |
delphine |
529 |
// Type de paramètre entier
|
71 |
delphine |
530 |
if ($type == 'int') {
|
|
|
531 |
if (!preg_match('/^(?:[0-9]+,\s*)*[0-9]+$/', $valeur)) {
|
72 |
delphine |
532 |
$this->messages[] = "Le paramètre '$param_passe' attend une ou plusieurs valeurs de type entiers ".
|
71 |
delphine |
533 |
"séparés par des virgules et non '$valeur'.";
|
|
|
534 |
$valeur = null;
|
|
|
535 |
}
|
|
|
536 |
}
|
|
|
537 |
|
|
|
538 |
$p[$param_passe] = $valeur;
|
|
|
539 |
}
|
|
|
540 |
}
|
|
|
541 |
|
|
|
542 |
return $p;
|
|
|
543 |
}
|
|
|
544 |
|
306 |
delphine |
545 |
private function construireWhere($p, $referentiel) {
|
71 |
delphine |
546 |
// Initialisation de variables
|
|
|
547 |
$where = ' WHERE ';
|
|
|
548 |
|
72 |
delphine |
549 |
// Construire where en fonction des paramêtres
|
71 |
delphine |
550 |
if (isset($p['mots'])) {
|
291 |
delphine |
551 |
if (stripos($p['mots'], "#") == 1) {
|
|
|
552 |
$where .= " 1 ";
|
290 |
delphine |
553 |
} else {
|
71 |
delphine |
554 |
$where .= 'AND ('.
|
|
|
555 |
" num_nom LIKE {$p['mots']} ".
|
|
|
556 |
" OR num_nom_retenu LIKE {$p['mots']} ".
|
|
|
557 |
" OR num_tax_sup LIKE {$p['mots']} ".
|
|
|
558 |
" OR rang LIKE {$p['mots']} ".
|
149 |
jpm |
559 |
" OR nom_sci LIKE {$p['mots']} ".
|
71 |
delphine |
560 |
" OR nom_supra_generique LIKE {$p['mots']} ".
|
|
|
561 |
" OR genre LIKE {$p['mots']} ".
|
|
|
562 |
" OR epithete_infra_generique LIKE {$p['mots']} ".
|
|
|
563 |
" OR epithete_sp LIKE {$p['mots']} ".
|
|
|
564 |
" OR type_epithete LIKE {$p['mots']} ".
|
|
|
565 |
" OR epithete_infra_sp LIKE {$p['mots']} ".
|
|
|
566 |
" OR cultivar_groupe LIKE {$p['mots']} ".
|
|
|
567 |
" OR cultivar LIKE {$p['mots']} ".
|
|
|
568 |
" OR nom_commercial LIKE {$p['mots']} ".
|
|
|
569 |
" OR auteur LIKE {$p['mots']} ".
|
|
|
570 |
" OR annee LIKE {$p['mots']} ".
|
|
|
571 |
" OR biblio_origine LIKE {$p['mots']} ".
|
|
|
572 |
" OR notes LIKE {$p['mots']} ".
|
|
|
573 |
" OR nom_addendum LIKE {$p['mots']} ".
|
|
|
574 |
" OR homonyme LIKE {$p['mots']} ".
|
|
|
575 |
" OR synonyme_proparte LIKE {$p['mots']} ".
|
|
|
576 |
" OR synonyme_douteux LIKE {$p['mots']} ".
|
|
|
577 |
" OR synonyme_mal_applique LIKE {$p['mots']} ".
|
|
|
578 |
" OR synonyme_orthographique LIKE {$p['mots']} ".
|
|
|
579 |
" OR hybride_parent_01 LIKE {$p['mots']} ".
|
|
|
580 |
" OR hybride_parent_01_notes LIKE {$p['mots']} ".
|
|
|
581 |
" OR hybride_parent_02 LIKE {$p['mots']} ".
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582 |
" OR hybride_parent_02_notes LIKE {$p['mots']} ".
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583 |
" OR nom_francais LIKE {$p['mots']} ".
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584 |
" OR presence LIKE {$p['mots']} ".
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585 |
" OR statut_origine LIKE {$p['mots']} ".
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586 |
" OR statut_introduction LIKE {$p['mots']} ".
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306 |
delphine |
587 |
" OR statut_culture LIKE {$p['mots']} ";
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317 |
delphine |
588 |
$where .= ($referentiel == "bdtfx") ? " OR num_basionyme LIKE {$p['mots']}) " : " OR basionyme LIKE {$p['mots']}) ";
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290 |
delphine |
589 |
}
|
71 |
delphine |
590 |
}
|
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591 |
if (isset($p['sg'])) {
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592 |
$where .= "AND nom_supra_generique LIKE {$p['sg']} ";
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593 |
}
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594 |
if (isset($p['gen'])) {
|
|
|
595 |
$where .= "AND genre LIKE ({$p['gen']}) ";
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596 |
}
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597 |
if (isset($p['sp'])) {
|
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598 |
$where .= "AND epithete_sp LIKE {$p['sp']} ";
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599 |
}
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600 |
if (isset($p['ssp'])) {
|
72 |
delphine |
601 |
$where .= "AND epithete_infra_sp LIKE {$p['ssp']} ";
|
71 |
delphine |
602 |
}
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603 |
if (isset($p['au'])) {
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604 |
$where .= "AND auteur LIKE {$p['au']} ";
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605 |
}
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606 |
if (isset($p['an'])) {
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607 |
$where .= "AND annee LIKE ({$p['an']}) ";
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608 |
}
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609 |
if (isset($p['nn'])) {
|
109 |
jpm |
610 |
$where .= "AND num_nom IN ({$p['nn']}) ";
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71 |
delphine |
611 |
}
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|
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612 |
if (isset($p['bib'])) {
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613 |
$where .= "AND biblio_origine LIKE ({$p['bib']}) ";
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614 |
}
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615 |
if (isset($p['nr']) && $p['nr'] == true) {
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616 |
$where .= "AND num_nom_retenu = num_nom ";
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|
|
617 |
}
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235 |
delphine |
618 |
if (isset($p['pre']) && $p['pre'] == true) {
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274 |
delphine |
619 |
$where .= "AND presence NOT IN ('A', '') ";
|
|
|
620 |
} elseif(isset($p['pre']) && $p['pre'] != true) {
|
|
|
621 |
$where .= "AND presence IN ('A', '') ";
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622 |
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235 |
delphine |
623 |
}
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624 |
if (isset($p['taxref'])) {
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625 |
$where .= "AND exclure_taxref =";
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626 |
$where .= ($p['taxref'] == true) ? " 0 " : " 1 ";
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627 |
}
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71 |
delphine |
628 |
|
285 |
gduche |
629 |
if (isset($p['rg'])) {
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630 |
$where .= "AND rang = $p[rg] ";
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631 |
}
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71 |
delphine |
632 |
|
285 |
gduche |
633 |
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71 |
delphine |
634 |
$where = str_replace('WHERE AND', ' WHERE ', $where);
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635 |
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636 |
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72 |
delphine |
637 |
// Retour du Where associé
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325 |
delphine |
638 |
if (count($p) == 1) {
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72 |
delphine |
639 |
$where = "";
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71 |
delphine |
640 |
}
|
72 |
delphine |
641 |
return $where;
|
71 |
delphine |
642 |
}
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643 |
}
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644 |
?>
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