Subversion Repositories Applications.referentiel

Rev

Rev 103 | Rev 110 | Go to most recent revision | Details | Compare with Previous | Last modification | View Log | RSS feed

Rev Author Line No. Line
78 delphine 1 
<?php
2 
// declare(encoding='UTF-8');
3 
/**
4 
 * Classe Controleur du module Fiche Taxon.
5 
 *
6 
 * @category	Php 5.2
7 
 * @package		Taxon
8 
 * @author		Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
9 
 * @copyright	2010 Tela-Botanica
10 
 * @license		http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
11 
 * @license		http://www.gnu.org/licenses/gpl.html Licence GNU-GPL
12 
 * @version		SVN: $Id: Fiche.php 96 2010-06-21 16:46:31Z jpm $
13 
 */
14 
class FicheTaxon extends AppliControleur {
15 
 
16 
	private $donnees = array();
17 
	protected $taxonDao = null;
85 delphine 18 
	private $tableau_manuel = null;
19 
	private $num_taxon = array(0=>0,1=>0,2=>0);
78 delphine 20 
 
21 
	//+----------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
22 
	// Méthodes
23 
	/**
24 
	 * Fonction d'affichage par défaut
25 
	 */
26 
	public function executerActionParDefaut() {
27 
		return $this->afficherTaxon();
28 
	}
29 
 
30 
	// +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
82 delphine 31 
	// FICHE CONSULTATION TAXON
78 delphine 32 
	public function afficherTaxon() {
33 
		// Récupération du référentiel
34 
		if (isset($_GET['ref'])) {
35 
			$this->referentiel = strtolower($_GET['ref']);
36 
		}
37 
		// Gestion des actions par défaut
38 
		$this->taxonDao = new TaxonDao();
39 
		$this->definirCommeModulePrincipal(get_class($this));
40 
		$this->construireMenu($this->referentiel);
41 
		$this->construireFilAriane($this->referentiel);
42 
		$this->executerActionReferentiel('Recherche', 'chargerMoteurRecherche', $this->referentiel);
43 
 
44 
		// Gestion des données de la requête
45 
		if (!isset($_GET['num_nom'])) {
46 
 
47 
		} else {
48 
			// Récupération des données
49 
			$this->donnees['referentiel'] = $this->referentiel;
50 
			$this->donnees['num_nom'] = $_GET['num_nom'];
82 delphine 51 
			$this->donnees['info'] = $this->taxonDao->getTaxon($this->referentiel, $this->donnees['num_nom']);
103 jpm 52 
			$this->donnees['num_nom_retenu'] = $this->donnees['info']['num_nom_retenu'];
53 
			$this->donnees['nom'] = $this->donnees['info']['nom_complet'];
78 delphine 54 
 
88 delphine 55 
			if ($this->donnees['info'] != '') {
56 
				// Chargement des données des onglets
57 
				$this->chargerNomenclature();
58 
				$this->chargerSynonymie();
59 
				$this->chargerClassification();
60 
				$this->chargerChorologie();
61 
				$this->chargerComplements();
62 
			}
78 delphine 63 
 
64 
			$this->setSortie(self::RENDU_CORPS, $this->getVue('fiche_taxon', $this->donnees));
65 
		}
66 
	}
67 
 
82 delphine 68 
	private function chargerNomenclature() {
69 
		$this->donnees['selectionne'] = $this->taxonDao->getNomenclature($this->referentiel, $this->donnees['num_nom']);
70 
		if (strpos($this->donnees['nom'], ' x ') ) {
85 delphine 71 
			if ($this->donnees['num_nom'] != $this->donnees['num_nom_retenu'] && $this->donnees['num_nom_retenu'] != '') {
82 delphine 72 
				$this->donnees['retenu'] = $this->taxonDao->getNomenclature($this->referentiel, $this->donnees['num_nom_retenu']);
73 
				$this->donnees['parents'] = $this->taxonDao->getParentsHybride($this->referentiel, $this->donnees['num_nom_retenu']);
74 
			} else {
75 
				$this->donnees['parents'] = $this->taxonDao->getParentsHybride($this->referentiel, $this->donnees['num_nom']);
76 
			}
77 
		} else {
85 delphine 78 
			if ($this->donnees['num_nom'] != $this->donnees['num_nom_retenu'] && $this->donnees['num_nom_retenu'] != '') {
82 delphine 79 
				$this->donnees['retenu'] = $this->taxonDao->getNomenclature($this->referentiel, $this->donnees['num_nom_retenu']);
80 
			}
81 
		}
82 
	}
83 
 
84 
	// recherche les synonymes (à compléter)
85 
	private function chargerSynonymie() {
86 
		$rechercheDao = new RechercheDao();
87 
		// recherche des synonymes nomenclaturaux et taxonomiques
88 
		$parametres = $this->parserChaineDeRecherche('nn:'.$this->donnees['num_nom'].' tax:1');
89 
		$parametres['ref']= $this->referentiel;
85 delphine 90 
		$synonymes = $rechercheDao->chercher('ParTaxon', $parametres);
91 
		if ($synonymes != '') {
92 
			foreach ($synonymes as $synonyme) {
104 delphine 93 
				$this->trierSynonymesNomenclaturauxTaxonomiques($synonyme);
94 
				$this->trierSynonymesMalAppliques($synonyme);
95 
				$this->trierSynonymesOrthographiques($synonyme);
82 delphine 96 
			}
104 delphine 97 
		}
98 
		// synonyme douteux
99 
		if ($this->donnees['info']['synonyme_douteux'] == 1) {
100 
			$this->donnees['fiche_synonymie']['douteux']['num_nom'] = $this->donnees['info'];
101 
		}
102 
		// synonyme proparte
103 
		if ($this->donnees['info']['synonyme_proparte'] != ''){
104 
			$propartes = preg_split('/;/', $this->donnees['info']['synonyme_proparte']);
105 
			foreach ($propartes as $protarte) {
106 
				$this->donnees['fiche_synonymie']['pro parte'] =
107 
				$this->taxonDao->getTaxonAffichage($this->referentiel, $proparte);
85 delphine 108 
			}
104 delphine 109 
		}
110 
		// homonymie
111 
		$nom = $this->encodeChaine($this->donnees['info']['nom_complet']);
112 
		$homonyme = $this->taxonDao->getHomonyme($this->referentiel, $nom);
113 
		if (count($homonyme) > 1) {
114 
			$this->donnees['fiche_synonymie']['Homonymie (sensu)'] = $homonyme;
115 
		}
116 
		// Même basionyme
117 
		if ($this->donnees['info']['basionyme'] != '') {
118 
			$basionyme_commun = $this->taxonDao->getNomsBasionymeCommun($this->referentiel, $this->donnees['info']['basionyme']);
119 
			foreach ($basionyme_commun as $nom) {
120 
				if ($nom['num_nom_retenu'] != $this->donnees['num_nom_retenu']) {
121 
					$this->donnees['fiche_synonymie']['Basionyme commun'][] = $nom;
88 delphine 122 
				}
123 
			}
104 delphine 124 
		}
125 
	}
126 
	private function trierSynonymesNomenclaturauxTaxonomiques($synonyme) {
127 
		if ($this->donnees['num_nom'] != $synonyme['num_nom'] && $synonyme['basionyme'] != null) {
128 
			if (($this->donnees['num_nom'] != $synonyme['num_nom']) && ($synonyme['basionyme'] ==
129 
					$this->donnees['num_nom'] || $this->donnees['info']['basionyme'] == $synonyme['num_nom'] ||
130 
					$this->donnees['info']['basionyme'] == $synonyme['basionyme'])) {
131 
				$this->donnees['fiche_synonymie']['nomenclaturale'][] = $synonyme;
132 
			} elseif ($this->donnees['num_nom'] != $synonyme['num_nom'] && $synonyme['basionyme'] != null &&
133 
					$this->donnees['info']['basionyme'] != null) {
134 
				$this->donnees['fiche_synonymie']['taxonomique'][] = $synonyme;
135 
			}
136 
		} elseif ($this->donnees['num_nom'] != $synonyme['num_nom']) {
137 
			$this->donnees['fiche_synonymie']['indéterminée (pas de basionyme)'][] = $synonyme;
138 
		}
139 
	}
140 
	private function trierSynonymesMalAppliques($synonyme) {
141 
		if ($synonyme['synonyme_mal_applique'] == 1) {
142 
			if ($synonyme['num_nom'] == $synonyme['num_nom_retenu']) {
143 
				$synonyme['statut'] = 'posséde des synonymes mal appliqués';
144 
			} else {
145 
				$synonyme['statut'] = 'est synonyme mal appliqué du num_nom '.$synonyme['num_nom_retenu'];
88 delphine 146 
			}
104 delphine 147 
			$this->donnees['fiche_synonymie']['mal appliquée'][] = $synonyme;
148 
		}
82 delphine 149 
	}
104 delphine 150 
	private function trierSynonymesOrthographiques($synonyme) {
151 
		if (isset($synonyme['synonyme_orthographique']) && $synonyme['synonyme_orthographique'] != '') {
152 
			if ($synonyme['synonyme_orthographique'] == $synonyme['num_nom']) {
153 
				$synonyme['statut'] = 'posséde des synonymes orthographiques';
154 
			} else {
155 
				$synonyme['statut'] = 'est synonyme orthographique du num_nom '.$synonyme['synonyme_orthographique'];
156 
			}
157 
			$this->donnees['fiche_synonymie']['orthographique'][] = $synonyme;
158 
		}
159 
	}
82 delphine 160 
 
161 
	private function chargerChorologie() {
85 delphine 162 
		$this->chargerTableauManuel('presence');
163 
		$this->chargerTableauManuel('statuts_origine');
164 
		$this->chargerTableauManuel('statuts_introduction');
165 
		$this->chargerTableauManuel('statuts_culture');
82 delphine 166 
		foreach ($this->donnees['info'] as $param => $valeur) {
167 
			if ($param == 'presence') {
168 
				$this->donnees['chorologie']['Présence']['France']['code'] = $valeur;
85 delphine 169 
				$this->donnees['chorologie']['Présence']['France']['valeur'] = $this->tableau_manuel['presence'][$valeur];
82 delphine 170 
			} elseif (preg_match('/presence_(.*)/', $param, $lieu)) {
171 
				$this->donnees['chorologie']['Présence'][$lieu['1']]['code'] = $valeur;
85 delphine 172 
				$this->donnees['chorologie']['Présence'][$lieu['1']]['valeur'] = $this->tableau_manuel['presence'][$valeur];
82 delphine 173 
			} elseif ($param == 'statut_origine') {
174 
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine']['France']['code'] = $valeur;
85 delphine 175 
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine']['France']['valeur'] =
176 
					$this->tableau_manuel['statuts_origine'][$valeur];
82 delphine 177 
			} elseif (preg_match('/statut_origine_(.*)/', $param, $lieu)) {
178 
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine'][$lieu['1']]['code'] = $valeur;
85 delphine 179 
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine'][$lieu['1']]['valeur'] =
180 
					$this->tableau_manuel['statuts_origine'][$valeur];
82 delphine 181 
			} elseif ($param == 'statut_introduction') {
182 
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction']['France']['code'] = $valeur;
85 delphine 183 
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction']['France']['valeur'] =
184 
					$this->tableau_manuel['statuts_introduction'][$valeur];
82 delphine 185 
			} elseif (preg_match('/statut_introduction_(.*)/', $param, $lieu)) {
186 
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction'][$lieu['1']]['code'] = $valeur;
85 delphine 187 
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction'][$lieu['1']]['valeur'] =
188 
					$this->tableau_manuel['statuts_introduction'][$valeur];
82 delphine 189 
			} elseif ($param == 'statut_culture') {
190 
				$this->donnees['chorologie']['Statut de culture']['France']['code'] = $valeur;
85 delphine 191 
				$this->donnees['chorologie']['Statut de culture']['France']['valeur'] =
192 
					$this->tableau_manuel['statuts_culture'][$valeur];
82 delphine 193 
			} elseif (preg_match('/statut_culture_(.*)/', $param, $lieu)) {
194 
				$this->donnees['chorologie']['Statut de culture'][$lieu['1']]['code'] = $valeur;
85 delphine 195 
				$this->donnees['chorologie']['Statut de culture'][$lieu['1']]['valeur'] =
196 
					$this->tableau_manuel['statuts_culture'][$valeur];
82 delphine 197 
			}
198 
		}
199 
		foreach ($this->donnees['chorologie']['Présence'] as $lieu=>$valeur) {
200 
			if (!isset($this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine'][$lieu])) {
201 
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine'][$lieu]['code'] = '';
85 delphine 202 
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine'][$lieu]['valeur'] =
203 
					$this->tableau_manuel['statuts_origine'][''];
82 delphine 204 
			}
205 
			if (!isset($this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction'][$lieu])) {
206 
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction'][$lieu]['code'] = '';
85 delphine 207 
				$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction'][$lieu]['valeur'] =
208 
					$this->tableau_manuel['statuts_introduction'][''];
82 delphine 209 
			}
210 
			if (!isset($this->donnees['chorologie']['Statut de culture'][$lieu])) {
211 
				$this->donnees['chorologie']['Statut de culture'][$lieu]['code'] = '';
85 delphine 212 
				$this->donnees['chorologie']['Statut de culture'][$lieu]['valeur'] =
213 
					$this->tableau_manuel['statuts_culture'][''];
82 delphine 214 
			}
215 
		}
216 
	}
217 
 
85 delphine 218 
	private function chargerClassification() {
219 
		if ($this->donnees['info']['num_tax_sup'] != '' || isset($this->donnees['retenu']['num_tax_sup'])) {
220 
			if ($this->donnees['num_nom'] == $this->donnees['num_nom_retenu']) {
221 
				$this->donnees['classification']['supérieurs'] = array_reverse($this->taxonDao->getClassification
222 
					('Superieur', $this->referentiel, $this->donnees['info']['num_tax_sup']));
223 
			} else {
224 
				$this->donnees['classification']['supérieurs'] = array_reverse($this->taxonDao->getClassification
225 
				('Superieur', $this->referentiel, $this->donnees['retenu']['num_tax_sup']));
226 
			}
227 
		}
228 
		if ($this->donnees['num_nom_retenu'] != '') {
229 
			$class_inf = $this->taxonDao->getClassification
230 
				('Inferieur', $this->referentiel, $this->donnees['num_nom_retenu']);
88 delphine 231 
			if ($class_inf != '') {
232 
				$this->donnees['classification']['inférieurs'] = $class_inf['inf'];
233 
				$this->donnees['niveau'] = $class_inf['niveau'];
234 
			}
85 delphine 235 
		}
236 
	}
237 
 
104 delphine 238 
	private function chargerComplements() {
85 delphine 239 
		$champs_manuel_technique = explode(',', $this->manuel['champs']);
240 
		$champs_base_donnees = key($this->donnees['info']);
241 
		$champs_supp_base = array_diff_key($this->donnees['info'], array_flip($champs_manuel_technique));
242 
		foreach ($champs_supp_base as $champ=>$valeur) {
243 
			if (!(preg_match('/presence_(.*)/',$champ) || preg_match('/statut_origine_(.*)/', $champ) ||
244 
				 preg_match('/statut_introduction_(.*)/', $champ) || preg_match('/statut_culture_(.*)/', $champ))) {
245 
				$this->donnees['complement'][$champ] = $valeur;
246 
			}
247 
		}
248 
	}
249 
 
82 delphine 250 
	private function parserChaineDeRecherche($chaine) {
251 
		$mots = preg_split('/ /i', $chaine, -1, PREG_SPLIT_NO_EMPTY);
252 
		$parametres = array('mots' => '');
253 
		$cle_precedente = null;
254 
		foreach ($mots as $mot) {
255 
			if (preg_match('/^(sg|gen|sp|ssp|au|an|nn|bib|nr|tax):(.*)$/', $mot, $match)) {
256 
				$cle = $match[1];
257 
				$cle_precedente = $cle;
258 
				$valeur = $match[2];
259 
				$parametres[$cle] = $valeur;
260 
			} else if (!is_null($cle_precedente)) {
261 
				$parametres[$cle_precedente] .= ' '.$mot;
262 
			} else if (is_null($cle_precedente)) {
263 
				if (empty($parametres['mots'])) {
264 
					$parametres['mots'] = $mot;
265 
				} else {
266 
					$parametres['mots'] .= ' '.$mot;
267 
				}
268 
			}
269 
		}
270 
		return $parametres;
271 
	}
272 
 
88 delphine 273 
	public function encodeChaine($chaine) {
274 
		if (Config::get('sortie_encodage') != Config::get('appli_encodage')) {
275 
			$chaine = mb_convert_encoding($chaine, Config::get('sortie_encodage'), Config::get('appli_encodage'));
276 
		}
277 
		$chaine = urlencode($chaine);
278 
		return $chaine;
279 
	}
280 
 
82 delphine 281 
	// retourne l'url de la fiche taxon pour les liens
78 delphine 282 
	public static function getUrlFicheTaxon($params, $type) {
283 
		$taxon = null;
284 
		switch ($type) {
285 
			case 'bas' :
286 
				$taxon['num_nom'] = $params['bas_num'];
287 
				break;
288 
			case 'p1' :
289 
				$taxon['num_nom'] = $params['p1_num'];
290 
				break;
291 
			case 'p2' :
292 
				$taxon['num_nom'] = $params['p2_num'];
293 
				break;
294 
			default : break;
295 
		}
296 
		return Recherche::getUrlFicheTaxon($taxon);
297 
	}
298 
 
85 delphine 299 
	// charger tableau de $this->manuel
300 
	private function chargerTableauManuel($titreTableau) {
301 
		$champs = explode(',', $this->manuel[$titreTableau]);
302 
		foreach ($champs as $champ) {
303 
			list($champ_nom, $type) = explode('=', trim($champ));
304 
			$this->tableau_manuel[$titreTableau][$champ_nom] = $type;
305 
		}
306 
	}
307 
 
78 delphine 308 
 
309 
}