Subversion Repositories Applications.referentiel

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Rev Author Line No. Line
271 delphine 1
<?php
2
// declare(encoding='UTF-8');
3
/**
4
 * Classe Controleur du module Accueil.
5
 * Affichage les infos sur l'ensemble des référentiels disponibles.
6
 *
7
 * @package		Referentiel
8
 * @category	Php5.2
9
 * @author		Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
10
 * @copyright	2010 Tela-Botanica
11
 * @license		http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
12
 * @license		http://www.gnu.org/licenses/gpl.html Licence GNU-GPL
13
 * @version		SVN: $Id$
14
 */
15
class Informations extends AppliControleur {
16
 
17
	private $referentiel = null;
18
	private $referentielDao = null;
276 aurelien 19
	private $traitementDao = null;
20
	private $resultatDao = null;
325 delphine 21
	private $metaDao = null;
22
	private $colonnesOrdonnees = array();
271 delphine 23
 
24
	public function __construct()  {
25
		parent::__construct();
26
 
27
		// Récupération de paramêtres
28
		if (isset($_GET['ref'])) { // code du projet courrant
29
			$this->referentiel = strtolower(strip_tags($_GET['ref']));
30
		}
31
 
32
		// Chargement des DAO nécessaires
276 aurelien 33
		$this->resultatDao = new ResultatDao();
34
		$this->traitementDao = new TraitementDao();
271 delphine 35
		$this->referentielDao = new ReferentielDao();
325 delphine 36
		$this->metaDao = new MetaDao();
37
		// tableau colonnesOrdonnees à modifier aussi dans service/Recherche.php
38
		$this->colonnesOrdonnees = array("nn" => array("Numéro nomenclatural","checked","Identifiant numérique du nom scientifique"),
39
			"nr" => array("Numéro nomenclatural du nom retenu","checked","Identifiant numérique du nom scientifique (num_nom) retenu pour désigner le taxon"),
40
			"nt" => array("Numéro taxonomique","checked","Identifiant numérique du taxon auquel est rattaché le nom"),
41
			"cd" => array("Numéro INPN","checked","Identifiant numérique unique du nom scientifique attribué par l’INPN"),
42
			"rg" => array("Code rang","checked","Code numérique indiquant le rang du nom scientifique (voir tableau 7 du manuel technique)"),
43
			"fam" => array("Famille (APG III)","checked","Nom de la famille dans APG III"),
44
			"nsc" => array("Nom avec auteur","checked","Nom scientifique avec auteur(s)"),
45
			"bibc" => array("Année et bibliographie","checked","Format à étudier celui de Tela : 1868, Brev. Pl. Nov., 2 : 70 ou celui de Kew :  Brev. Pl. Nov., 2 : 70 (1868)"),
46
			"nsrc" => array("Nom retenu avec auteur","checked","Nom retenu pour tous les taxons (identique si le nom est édjà le nom retenu)"),
47
			"nf" => array("Nom français normalisé","checked","Nom français conseillé pour ce taxon (à venir)"),
48
			"extax" => array("Présent dans Taxref","checked",""),
49
			"lien" => array("Permalien","checked","Lien http vers la fiche nomenclaturale"),
50
			"ntsup" => array("Numéro nomenclatural rang supérieur","","Identifiant numérique du nom (num_nom) de rang supérieur dans la classification par défaut de l'index"),
51
			"pre" => array("Répartition géographique","","Code indiquant si le taxon est présent dans la zone géographique définie par le référentiel (tableau 9)"),
52
			"ns" => array("Nom sans auteur","","Nom scientifique sans auteur"),
53
			"aut" => array("Auteur","","Intitulé de(s) l'auteur(s) du nom (abréviations standards de Brummitt et Powell)"),
54
			"ann" => array("Année publication","","Année de la publication effective du support papier"),
55
			"bib" => array("Bibliographie","","Référence bibliographique de la publication d'origine du nom"),
56
			"ntype" => array("Numéro du type","","Identifiant numérique (num_nom) du 1er basionyme appliqué à la planche d'herbier"),
57
			"nbas" => array("Numéro du basionyme","","Identifiant numérique (num_nom) du basionyme du nom"),
58
			"genre" => array("Genre","","Nom d'un genre dans le cas d'un monôme du rang genre ou d'une combinaison"),
59
			"esp" => array("Epithète espèce","","Épithète de l'espèce"),
60
			"eing" => array("Epithète infragénérique","","Épithète infra-générique d'une combinaison dont le rang est situé entre le genre et l'espèce"),
61
			"te" => array("Type d'épithète infraspécifique","","Abréviation indiquant le type de l'épithète infra-spécifique"),
62
			"einsp" => array("Epithète infraspécifique","","Épithète infra-spécifique d'une combinaison"),
63
			"hybp01" => array("Hybride parent 1","","Identifiant du nom (num_nom) du parent numéro 1 (dans le cas d'un hybride)"),
64
			"nomsupgen" => array("Nom supra générique","","Monôme dont le rang est supérieur au genre"),
65
			"hybp02" => array("Hybride parent 2","","Identifiant du nom (num_nom) du parent numéro 2 (dans le cas d'un hybride)"),
66
			"stori" => array("Statut d'origine","","Code indiquant le statut d'origine du taxon dans la zone géographique définie par le référentiel (tableau 10)"),
67
			"stint" => array("Statut d'introduction","","Code indiquant le statut d'introduction du taxon dans la zone géographique définie par le référentiel (tableau 11)"),
339 mathias 68
			"stcult" => array("Statut de culture","","Code indiquant le statut de culture du taxon dans la zone géographique définie par le référentiel (tableau 12)"),
325 delphine 69
			"notes" => array("Remarques","","Notes complémentaires"),
70
			"nomadd" => array("Commentaires nomenclaturaux","","Commentaires nomenclaturaux pouvant être associés à un nom (voir tableau 8 du manuel technique)"),
71
			"nsr" => array("Nom retenu sans auteur","","Nom scientifique du nom retenu sans auteur"),
72
			"hom" => array("Homonymie","","Contient la valeur 1 si le nom possède un homonyme ou si le nom est un homonyme. Dans le cas contraire"),
73
			"synprop" => array("Synonyme proprate","","Contient plusieurs identifiants numériques (num_nom) dans le cas d'un nom obtenu suite à la division d'un taxon. Contient un seul identifiant numérique (num_nom) dans le cas d'un nom obtenu suite à la fusion de plusieurs taxons."),
74
			"syndout" => array("Synonyme douteux","","Contient la valeur 1 si le nom est un synonyme douteux. Dans le cas contraire"),
75
			"synmapp" => array("Synonyme mal appliqué","","Contient la valeur 1 si le nom est un synonyme mal appliqué (cas des sensu). Dans le cas contraire"),
76
			"synorth" => array("Synonyme orthographique","","Contient l'identifiant numérique du nom (num_nom) correctement orthographié"),
77
			"orthori" => array("Orthographe originelle","","Contient la graphie originelle d'un nom non-conforme faisant l'objet d'une correction orthographique obligatoire"),
78
			"hybp01n" => array("Hybride parent 1 notes","","Notes éventuelles sur l'hybridité et le parent numéro 1"),
79
			"hybp02n" => array("Hybride parent 2 notes","","Notes éventuelles sur l'hybridité et le parent numéro 2"),
80
			"cultgp" => array("Groupe de cultivar","","Nom d'un groupe de cultivar (sansl'abréviation « Gp »)"),
81
			"cult" => array("Nom cultivar","","Nom d'un cultivar (sans les guillemets simple ou abréviation « cv. »)"),
82
			"nomcomm" => array("Nom commercial","","Nom commercial d'une plante (en majuscule"),
83
			"autres" => array("Autres","","colonnes spécifiques au référentiel"));
271 delphine 84
	}
85
 
86
	//+----------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
87
	// Méthodes
88
	/**
89
	 * Fonction d'affichage par défaut
90
	 */
91
	public function executerActionParDefaut() {
92
		return $this->afficherDetail();
93
	}
94
 
95
	/**
96
	 * Affiche le détail d'un référentiel et la liste des actions possibles
97
	 */
98
	public function afficherDetail() {
99
		$this->definirCommeModulePrincipal('Informations');
329 mathias 100
		$donnees = $this->preparerPagePourDetailReferentielEtTelechargement();
101
 
271 delphine 102
		$donnees['messages'] = $this->getMessages();
103
		$this->traiterEsperluette($donnees);
104
		$this->setSortie(self::RENDU_CORPS, $this->getVue('detail_referentiel', $donnees), false);
105
	}
329 mathias 106
 
325 delphine 107
	public function telecharger() {
326 mathias 108
		$dossier = Config::get('chemin_tmp');
325 delphine 109
		$parametres['ref'] = $this->referentiel;
110
		$parametres['version'] = $_POST["version"];
111
		$parametres['version'] = str_replace(".", "_", $parametres['version']);
342 delphine 112
		if (isset($_POST["champs"])) $parametres['champs'] = implode(",",$_POST["champs"]);
113
		if (isset($_POST["filtres"])) $parametres['filtres'] = implode(",",$_POST["filtres"]);
350 delphine 114
		if (isset($_POST["encodage"])) $parametres['encodage'] = $_POST["encodage"];
325 delphine 115
		$this->supprimerAncienExport($dossier);
116
		$ref = $this->referentielDao->exporter($parametres);
117
		$meta = $this->metaDao->exporter($parametres);
327 mathias 118
 
329 mathias 119
		$dossierDateEtNomDeFichier = date('Y_m_d').'/'.$this->referentiel.time().'.zip';
120
		$cheminZip = $dossier.$dossierDateEtNomDeFichier;
325 delphine 121
		$zip = new ZipArchive();
329 mathias 122
		if($zip->open($cheminZip, ZipArchive::CREATE) === true) {
325 delphine 123
			// Ajout des fichiers métadonnées, référentiel et manuel technique
124
			$meta = str_replace("\\/", "/", $meta);
339 mathias 125
			if (file_exists($meta)) {
126
				$metazip = $zip->addFile($meta, "informations.csv");
127
			}
128
			if (file_exists($ref)) {
129
				$refzip = $zip->addFile($ref, "referentiel.csv");
130
			}
131
			if (file_exists($dossier.'mtpr_V4_4.pdf')) {
132
				$zip->addFile($dossier.'mtpr_V4_4.pdf', 'manuel_technique.pdf');
133
			}
325 delphine 134
			// Et on referme l'archive
135
			$zip->close();
136
		} else {
329 mathias 137
			echo "Erreur : impossible d'ouvrir le fichier [$cheminZip]<br/>";
325 delphine 138
		}
327 mathias 139
 
329 mathias 140
		// on revient à la page de détail, avec un lien de téléchargement en prime
141
		$donnees = $this->preparerPagePourDetailReferentielEtTelechargement();
327 mathias 142
		if (file_exists($cheminZip)) {
329 mathias 143
			$urlLien = Config::get("base_url_telechargements") . $dossierDateEtNomDeFichier;
144
			$donnees['url_telechargement_zip'] = $urlLien;
325 delphine 145
		}
329 mathias 146
		$this->setSortie(self::RENDU_CORPS, $this->getVue('detail_referentiel', $donnees), false);
325 delphine 147
	}
329 mathias 148
 
149
	// exécute la partie commune entre l'action "detail" et l'action "telecharger"
150
	protected function preparerPagePourDetailReferentielEtTelechargement() {
151
		$donnees = array();
152
		// Traitement de l'info sur le code du référentiel
153
		if (isset($this->referentiel)) {
154
			$this->construireMenu($this->referentiel);
155
			$this->construireFilAriane($this->referentiel);
156
			$donnees['referentiel'] = $this->referentiel;
157
			$donnees['nom_referentiel'] = $this->referentielDao->getNom($this->referentiel);
158
			$donnees['url_menu_test'] = $this->obtenirUrlMenuTest($this->referentiel);
159
			$donnees['url_menu_versionnage'] = $this->obtenirUrlMenuVersionnage($this->referentiel);
160
			$donnees['url_menu_consultation'] = $this->obtenirUrlMenuConsultation($this->referentiel);
161
			$donnees['url_form_telech'] = $this->obtenirUrlDetailReferentielTelechargement($this->referentiel);
162
 
163
			// suppression du téléchargement pour bdbfx
164
			if ($this->referentiel != 'bdbfx') {
165
				$donnees['versions'] = $this->afficherFormulaireTelechargementsReferentiels();
166
				$donnees['infos_telechargements'] = $this->afficherTelechargementsReferentiels();
167
				$donnees['colonnesOrdonnees'] = $this->colonnesOrdonnees;
168
			}
169
		} else {
170
			$this->addMessage("Aucun code de projet de référentiel n'est indiqué (Ex. bdtfx).");
171
		}
172
		return $donnees;
173
	}
174
 
325 delphine 175
	private function supprimerAncienExport($dossier) {
176
		$pointeur = opendir($dossier);
177
		// si pas d'erreur d'ouverture du dossier on lance le scan
178
		if( $pointeur != false ) {
179
			// Parcours du repertoire
180
			while( $ss_dossier = readdir($pointeur)) {
181
				if($ss_dossier != "." && $ss_dossier != "..") {
182
					$chemin_complet = $dossier . $ss_dossier;
183
					if (is_dir($chemin_complet) && $ss_dossier < date('Y_m_d')) {
184
						$fichiers = scandir($chemin_complet);
185
						foreach ($fichiers as $fichier) {
186
							if($fichier != "." && $fichier != "..") {
187
								unlink($chemin_complet."/".$fichier);
188
							}
189
						}
190
						rmdir($chemin_complet);
191
					}
192
				}
193
			}
194
			closedir($pointeur);
195
		}
196
	}
197
 
198
	private function afficherFormulaireTelechargementsReferentiels() {
199
		$versions = $this->traitementDao->getTraitementsTermines($this->referentiel, 'versionnage');
332 mathias 200
		if ($versions != null) {
201
			foreach ($versions as $id => $version) {
202
				$versions[$id] = (unserialize($versions[$id]["script_parametres"]));
203
			}
204
		}
325 delphine 205
		return $versions;
206
	}
276 aurelien 207
	private function afficherTelechargementsReferentiels() {
208
		$infos_telechargements = array();
209
		// Recherche des traitements déjà effectué
210
		$resultat = $this->traitementDao->getTraitementsTermines($this->referentiel, 'versionnage');
211
		if (is_array($resultat)) {
212
			foreach ($resultat as &$traitement) {
213
				$infos_traitement = $this->traitementDao->getInfos($traitement['id_traitement']);
214
				if ($infos_traitement != false) {
215
					// Recherche des fichiers disponibles
216
					$infos_zip = $this->obtenirUrlsZipPourTraitement($infos_traitement);
217
					$infos_telechargements[] = array(
218
								'infos_traitement' => $traitement,
219
								'description' => $this->creerDescriptionTelechargement($traitement),
220
								'urls_zip' => $infos_zip);
221
				}
222
			}
223
		}
224
		return $infos_telechargements;
225
	}
226
 
227
	private function creerDescriptionTelechargement($traitement) {
228
		return strftime('%e %B %Y', strtotime($traitement['meta_date_creation'])).' ('.$this->referentielDao->getNom($this->referentiel).') ';
229
	}
230
 
271 delphine 231
}
232
?>