Subversion Repositories Applications.referentiel

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Rev Author Line No. Line
271 delphine 1
<?php
2
// declare(encoding='UTF-8');
3
/**
4
 * Classe Controleur du module Accueil.
5
 * Affichage les infos sur l'ensemble des référentiels disponibles.
6
 *
7
 * @package		Referentiel
8
 * @category	Php5.2
9
 * @author		Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
10
 * @copyright	2010 Tela-Botanica
11
 * @license		http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
12
 * @license		http://www.gnu.org/licenses/gpl.html Licence GNU-GPL
13
 * @version		SVN: $Id$
14
 */
15
class Informations extends AppliControleur {
16
 
17
	private $referentiel = null;
18
	private $referentielDao = null;
352 delphine 19
	private $rechercheDao = null;
276 aurelien 20
	private $traitementDao = null;
21
	private $resultatDao = null;
325 delphine 22
	private $metaDao = null;
23
	private $colonnesOrdonnees = array();
271 delphine 24
 
25
	public function __construct()  {
26
		parent::__construct();
27
 
28
		// Récupération de paramêtres
29
		if (isset($_GET['ref'])) { // code du projet courrant
30
			$this->referentiel = strtolower(strip_tags($_GET['ref']));
31
		}
32
 
33
		// Chargement des DAO nécessaires
276 aurelien 34
		$this->resultatDao = new ResultatDao();
35
		$this->traitementDao = new TraitementDao();
271 delphine 36
		$this->referentielDao = new ReferentielDao();
352 delphine 37
		$this->rechercheDao = new RechercheDao();
325 delphine 38
		$this->metaDao = new MetaDao();
39
		// tableau colonnesOrdonnees à modifier aussi dans service/Recherche.php
40
		$this->colonnesOrdonnees = array("nn" => array("Numéro nomenclatural","checked","Identifiant numérique du nom scientifique"),
41
			"nr" => array("Numéro nomenclatural du nom retenu","checked","Identifiant numérique du nom scientifique (num_nom) retenu pour désigner le taxon"),
42
			"nt" => array("Numéro taxonomique","checked","Identifiant numérique du taxon auquel est rattaché le nom"),
43
			"cd" => array("Numéro INPN","checked","Identifiant numérique unique du nom scientifique attribué par l’INPN"),
44
			"rg" => array("Code rang","checked","Code numérique indiquant le rang du nom scientifique (voir tableau 7 du manuel technique)"),
45
			"fam" => array("Famille (APG III)","checked","Nom de la famille dans APG III"),
46
			"nsc" => array("Nom avec auteur","checked","Nom scientifique avec auteur(s)"),
47
			"bibc" => array("Année et bibliographie","checked","Format à étudier celui de Tela : 1868, Brev. Pl. Nov., 2 : 70 ou celui de Kew :  Brev. Pl. Nov., 2 : 70 (1868)"),
48
			"nsrc" => array("Nom retenu avec auteur","checked","Nom retenu pour tous les taxons (identique si le nom est édjà le nom retenu)"),
49
			"nf" => array("Nom français normalisé","checked","Nom français conseillé pour ce taxon (à venir)"),
50
			"extax" => array("Présent dans Taxref","checked",""),
51
			"lien" => array("Permalien","checked","Lien http vers la fiche nomenclaturale"),
52
			"ntsup" => array("Numéro nomenclatural rang supérieur","","Identifiant numérique du nom (num_nom) de rang supérieur dans la classification par défaut de l'index"),
53
			"pre" => array("Répartition géographique","","Code indiquant si le taxon est présent dans la zone géographique définie par le référentiel (tableau 9)"),
54
			"ns" => array("Nom sans auteur","","Nom scientifique sans auteur"),
55
			"aut" => array("Auteur","","Intitulé de(s) l'auteur(s) du nom (abréviations standards de Brummitt et Powell)"),
56
			"ann" => array("Année publication","","Année de la publication effective du support papier"),
57
			"bib" => array("Bibliographie","","Référence bibliographique de la publication d'origine du nom"),
58
			"ntype" => array("Numéro du type","","Identifiant numérique (num_nom) du 1er basionyme appliqué à la planche d'herbier"),
59
			"nbas" => array("Numéro du basionyme","","Identifiant numérique (num_nom) du basionyme du nom"),
60
			"genre" => array("Genre","","Nom d'un genre dans le cas d'un monôme du rang genre ou d'une combinaison"),
61
			"esp" => array("Epithète espèce","","Épithète de l'espèce"),
62
			"eing" => array("Epithète infragénérique","","Épithète infra-générique d'une combinaison dont le rang est situé entre le genre et l'espèce"),
63
			"te" => array("Type d'épithète infraspécifique","","Abréviation indiquant le type de l'épithète infra-spécifique"),
64
			"einsp" => array("Epithète infraspécifique","","Épithète infra-spécifique d'une combinaison"),
65
			"hybp01" => array("Hybride parent 1","","Identifiant du nom (num_nom) du parent numéro 1 (dans le cas d'un hybride)"),
66
			"nomsupgen" => array("Nom supra générique","","Monôme dont le rang est supérieur au genre"),
67
			"hybp02" => array("Hybride parent 2","","Identifiant du nom (num_nom) du parent numéro 2 (dans le cas d'un hybride)"),
68
			"stori" => array("Statut d'origine","","Code indiquant le statut d'origine du taxon dans la zone géographique définie par le référentiel (tableau 10)"),
69
			"stint" => array("Statut d'introduction","","Code indiquant le statut d'introduction du taxon dans la zone géographique définie par le référentiel (tableau 11)"),
339 mathias 70
			"stcult" => array("Statut de culture","","Code indiquant le statut de culture du taxon dans la zone géographique définie par le référentiel (tableau 12)"),
325 delphine 71
			"notes" => array("Remarques","","Notes complémentaires"),
72
			"nomadd" => array("Commentaires nomenclaturaux","","Commentaires nomenclaturaux pouvant être associés à un nom (voir tableau 8 du manuel technique)"),
73
			"nsr" => array("Nom retenu sans auteur","","Nom scientifique du nom retenu sans auteur"),
74
			"hom" => array("Homonymie","","Contient la valeur 1 si le nom possède un homonyme ou si le nom est un homonyme. Dans le cas contraire"),
353 delphine 75
			"syn" => array("Statut du nom", "", "retenu, synonyme, ambigü, calculé à partir des num_nom et num_nom_retenu"),
325 delphine 76
			"synprop" => array("Synonyme proprate","","Contient plusieurs identifiants numériques (num_nom) dans le cas d'un nom obtenu suite à la division d'un taxon. Contient un seul identifiant numérique (num_nom) dans le cas d'un nom obtenu suite à la fusion de plusieurs taxons."),
77
			"syndout" => array("Synonyme douteux","","Contient la valeur 1 si le nom est un synonyme douteux. Dans le cas contraire"),
78
			"synmapp" => array("Synonyme mal appliqué","","Contient la valeur 1 si le nom est un synonyme mal appliqué (cas des sensu). Dans le cas contraire"),
79
			"synorth" => array("Synonyme orthographique","","Contient l'identifiant numérique du nom (num_nom) correctement orthographié"),
80
			"orthori" => array("Orthographe originelle","","Contient la graphie originelle d'un nom non-conforme faisant l'objet d'une correction orthographique obligatoire"),
81
			"hybp01n" => array("Hybride parent 1 notes","","Notes éventuelles sur l'hybridité et le parent numéro 1"),
82
			"hybp02n" => array("Hybride parent 2 notes","","Notes éventuelles sur l'hybridité et le parent numéro 2"),
83
			"cultgp" => array("Groupe de cultivar","","Nom d'un groupe de cultivar (sansl'abréviation « Gp »)"),
84
			"cult" => array("Nom cultivar","","Nom d'un cultivar (sans les guillemets simple ou abréviation « cv. »)"),
85
			"nomcomm" => array("Nom commercial","","Nom commercial d'une plante (en majuscule"),
86
			"autres" => array("Autres","","colonnes spécifiques au référentiel"));
271 delphine 87
	}
88
 
89
	//+----------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
90
	// Méthodes
91
	/**
92
	 * Fonction d'affichage par défaut
93
	 */
94
	public function executerActionParDefaut() {
95
		return $this->afficherDetail();
96
	}
97
 
98
	/**
99
	 * Affiche le détail d'un référentiel et la liste des actions possibles
100
	 */
101
	public function afficherDetail() {
102
		$this->definirCommeModulePrincipal('Informations');
329 mathias 103
		$donnees = $this->preparerPagePourDetailReferentielEtTelechargement();
104
 
271 delphine 105
		$donnees['messages'] = $this->getMessages();
106
		$this->traiterEsperluette($donnees);
107
		$this->setSortie(self::RENDU_CORPS, $this->getVue('detail_referentiel', $donnees), false);
108
	}
329 mathias 109
 
325 delphine 110
	public function telecharger() {
326 mathias 111
		$dossier = Config::get('chemin_tmp');
325 delphine 112
		$parametres['ref'] = $this->referentiel;
113
		$parametres['version'] = $_POST["version"];
114
		$parametres['version'] = str_replace(".", "_", $parametres['version']);
342 delphine 115
		if (isset($_POST["champs"])) $parametres['champs'] = implode(",",$_POST["champs"]);
116
		if (isset($_POST["filtres"])) $parametres['filtres'] = implode(",",$_POST["filtres"]);
350 delphine 117
		if (isset($_POST["encodage"])) $parametres['encodage'] = $_POST["encodage"];
325 delphine 118
		$this->supprimerAncienExport($dossier);
119
		$ref = $this->referentielDao->exporter($parametres);
120
		$meta = $this->metaDao->exporter($parametres);
327 mathias 121
 
329 mathias 122
		$dossierDateEtNomDeFichier = date('Y_m_d').'/'.$this->referentiel.time().'.zip';
123
		$cheminZip = $dossier.$dossierDateEtNomDeFichier;
325 delphine 124
		$zip = new ZipArchive();
329 mathias 125
		if($zip->open($cheminZip, ZipArchive::CREATE) === true) {
325 delphine 126
			// Ajout des fichiers métadonnées, référentiel et manuel technique
127
			$meta = str_replace("\\/", "/", $meta);
339 mathias 128
			if (file_exists($meta)) {
129
				$metazip = $zip->addFile($meta, "informations.csv");
130
			}
131
			if (file_exists($ref)) {
132
				$refzip = $zip->addFile($ref, "referentiel.csv");
133
			}
134
			if (file_exists($dossier.'mtpr_V4_4.pdf')) {
135
				$zip->addFile($dossier.'mtpr_V4_4.pdf', 'manuel_technique.pdf');
136
			}
325 delphine 137
			// Et on referme l'archive
138
			$zip->close();
139
		} else {
329 mathias 140
			echo "Erreur : impossible d'ouvrir le fichier [$cheminZip]<br/>";
325 delphine 141
		}
327 mathias 142
 
329 mathias 143
		// on revient à la page de détail, avec un lien de téléchargement en prime
144
		$donnees = $this->preparerPagePourDetailReferentielEtTelechargement();
327 mathias 145
		if (file_exists($cheminZip)) {
329 mathias 146
			$urlLien = Config::get("base_url_telechargements") . $dossierDateEtNomDeFichier;
147
			$donnees['url_telechargement_zip'] = $urlLien;
325 delphine 148
		}
353 delphine 149
		//$this->transformerEnXls($ref, $dossier);
329 mathias 150
		$this->setSortie(self::RENDU_CORPS, $this->getVue('detail_referentiel', $donnees), false);
325 delphine 151
	}
353 delphine 152
 
153
	public function transformerEnXls($fichier, $dossier) {
154
		include '../bibliotheque/utilitaires/PHPExcel/IOFactory.php';
155
 
156
		$dossier .= date('Y_m_d').'/';
157
 
158
		$objReader = PHPExcel_IOFactory::createReader('CSV');
159
 
160
		// If the files uses a delimiter other than a comma (e.g. a tab), then tell the reader
161
		$objReader->setDelimiter("\t");
162
		// If the files uses an encoding other than UTF-8 or ASCII, then tell the reader
163
		$objReader->setInputEncoding('UTF-8');
164
 
165
		$objPHPExcel = $objReader->load($fichier);
166
		$objWriter = PHPExcel_IOFactory::createWriter($objPHPExcel, 'Excel5');
167
		$objWriter->save($dossier.'MyExcelFile.xls');
168
	}
329 mathias 169
 
170
	// exécute la partie commune entre l'action "detail" et l'action "telecharger"
171
	protected function preparerPagePourDetailReferentielEtTelechargement() {
172
		$donnees = array();
173
		// Traitement de l'info sur le code du référentiel
174
		if (isset($this->referentiel)) {
175
			$this->construireMenu($this->referentiel);
176
			$this->construireFilAriane($this->referentiel);
177
			$donnees['referentiel'] = $this->referentiel;
178
			$donnees['nom_referentiel'] = $this->referentielDao->getNom($this->referentiel);
179
			$donnees['url_menu_test'] = $this->obtenirUrlMenuTest($this->referentiel);
180
			$donnees['url_menu_versionnage'] = $this->obtenirUrlMenuVersionnage($this->referentiel);
181
			$donnees['url_menu_consultation'] = $this->obtenirUrlMenuConsultation($this->referentiel);
182
			$donnees['url_form_telech'] = $this->obtenirUrlDetailReferentielTelechargement($this->referentiel);
183
 
184
			// suppression du téléchargement pour bdbfx
185
			if ($this->referentiel != 'bdbfx') {
186
				$donnees['versions'] = $this->afficherFormulaireTelechargementsReferentiels();
187
				$donnees['infos_telechargements'] = $this->afficherTelechargementsReferentiels();
188
				$donnees['colonnesOrdonnees'] = $this->colonnesOrdonnees;
352 delphine 189
				$parametres['ref'] = $this->referentiel;
190
				$parametres['rg'] = '180';
191
				$donnees['familles'] = $this->rechercheDao->chercher('ParDefaut', $parametres, 250);
329 mathias 192
			}
193
		} else {
194
			$this->addMessage("Aucun code de projet de référentiel n'est indiqué (Ex. bdtfx).");
195
		}
196
		return $donnees;
197
	}
198
 
325 delphine 199
	private function supprimerAncienExport($dossier) {
200
		$pointeur = opendir($dossier);
201
		// si pas d'erreur d'ouverture du dossier on lance le scan
202
		if( $pointeur != false ) {
203
			// Parcours du repertoire
204
			while( $ss_dossier = readdir($pointeur)) {
205
				if($ss_dossier != "." && $ss_dossier != "..") {
206
					$chemin_complet = $dossier . $ss_dossier;
207
					if (is_dir($chemin_complet) && $ss_dossier < date('Y_m_d')) {
208
						$fichiers = scandir($chemin_complet);
209
						foreach ($fichiers as $fichier) {
210
							if($fichier != "." && $fichier != "..") {
211
								unlink($chemin_complet."/".$fichier);
212
							}
213
						}
214
						rmdir($chemin_complet);
215
					}
216
				}
217
			}
218
			closedir($pointeur);
219
		}
220
	}
221
 
222
	private function afficherFormulaireTelechargementsReferentiels() {
223
		$versions = $this->traitementDao->getTraitementsTermines($this->referentiel, 'versionnage');
332 mathias 224
		if ($versions != null) {
225
			foreach ($versions as $id => $version) {
226
				$versions[$id] = (unserialize($versions[$id]["script_parametres"]));
227
			}
228
		}
325 delphine 229
		return $versions;
230
	}
276 aurelien 231
	private function afficherTelechargementsReferentiels() {
232
		$infos_telechargements = array();
233
		// Recherche des traitements déjà effectué
234
		$resultat = $this->traitementDao->getTraitementsTermines($this->referentiel, 'versionnage');
235
		if (is_array($resultat)) {
236
			foreach ($resultat as &$traitement) {
237
				$infos_traitement = $this->traitementDao->getInfos($traitement['id_traitement']);
238
				if ($infos_traitement != false) {
239
					// Recherche des fichiers disponibles
240
					$infos_zip = $this->obtenirUrlsZipPourTraitement($infos_traitement);
241
					$infos_telechargements[] = array(
242
								'infos_traitement' => $traitement,
243
								'description' => $this->creerDescriptionTelechargement($traitement),
244
								'urls_zip' => $infos_zip);
245
				}
246
			}
247
		}
248
		return $infos_telechargements;
249
	}
250
 
251
	private function creerDescriptionTelechargement($traitement) {
252
		return strftime('%e %B %Y', strtotime($traitement['meta_date_creation'])).' ('.$this->referentielDao->getNom($this->referentiel).') ';
253
	}
254
 
271 delphine 255
}
256
?>