Subversion Repositories eFlore/Applications.cel

<?php

/**

 * @category  PHP

 * @package   jrest

 * @author    Raphaël Droz <raphael@tela-botania.org>

 * @copyright 2013 Tela-Botanica

 * @license   http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL

 * @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>

 */

/**

 * Service d'import de données d'observation du CEL au format XLS

 *

 * Sont define()'d commme n° de colonne tous les abbrevs retournés par

 * FormateurGroupeColonne::nomEnsembleVersListeColonnes() préfixés par C_  cf: detectionEntete()

 *

 * Exemple d'un test:

 * $ GET "/jrest/ExportXLS/22506?format=csv&range=*&limite=13" \

 *   | curl -F "upload=@-" -F utilisateur=22506 "/jrest/ImportXLS"

 * # 13 observations importées

 * + cf MySQL general_log = 1

 *

 **/

set_include_path(get_include_path() . PATH_SEPARATOR . dirname(dirname(realpath(__FILE__))) . '/lib');

// TERM

error_reporting(-1);

ini_set('html_errors', 0);

ini_set('xdebug.cli_color', 2);

require_once('lib/PHPExcel/Classes/PHPExcel.php');

require_once('FormateurGroupeColonne.php');

date_default_timezone_set("Europe/Paris");

// nombre d'INSERT à cumuler par requête SQL

// (= nombre de lignes XLS à bufferiser)

//define('NB_LIRE_LIGNE_SIMUL', 30);

define('NB_LIRE_LIGNE_SIMUL', 5);

// en cas d'import d'un fichier CSV, utilise fgetcsv() plutôt

// que PHPExcel ce qui se traduit par un gain de performances très substanciel

define('QUICK_CSV_IMPORT', TRUE);

// Numbers of days between January 1, 1900 and 1970 (including 19 leap years)

// see traiterDateObs()

// define("MIN_DATES_DIFF", 25569);

class MyReadFilter implements PHPExcel_Reader_IReadFilter {

    // exclusion de colonnes

    public $exclues = array();

    // lecture par morceaux

    public $ligne_debut = 0;

    public $ligne_fin = 0;

    public function __construct() {}

    public function def_interval($debut, $nb) {

	$this->ligne_debut = $debut;

	$this->ligne_fin = $debut + $nb;

    }

    public function readCell($colonne, $ligne, $worksheetName = '') {

	if(@$this->exclues[$colonne]) return false;

	// si des n° de morceaux ont été initialisés, on filtre...

	if($this->ligne_debut && ($ligne < $this->ligne_debut || $ligne >= $this->ligne_fin)) return false;

	return true;

    }

}

// XXX: PHP 5.3

function __anonyme_1($v) {	return !$v['importable']; }

function __anonyme_2(&$v) {	$v = $v['nom']; }

function __anonyme_3($cell) { return !is_null($cell); };

function __anonyme_5($item) { return is_null($item) ? '?' : $item; }

function __anonyme_6() { return NULL; }

class ImportXLS extends Cel  {

    static function __anonyme_4(&$item, $key) { $item = self::quoteNonNull(trim($item)); }

    static $ordre_BDD = Array(

	"ce_utilisateur",

	"prenom_utilisateur",

	"nom_utilisateur",

	"courriel_utilisateur",

	"ordre",

	"nom_sel",

	"nom_sel_nn",

	"nom_ret",

	"nom_ret_nn",

	"nt",

	"famille",

	"nom_referentiel",

	"zone_geo",

	"ce_zone_geo",

	"date_observation",

	"lieudit",

	"station",

	"milieu",

	"mots_cles_texte",

	"commentaire",

	"transmission",

	"date_creation",

	"date_modification",

	"date_transmission",

	"latitude",

	"longitude",

	"altitude",

	"abondance",

	"certitude",

	"phenologie",

	"code_insee_calcule"

    );

    // cf: initialiser_pdo_ordered_statements()

    // eg: "INSERT INTO cel_obs (ce_utilisateur, ..., phenologie, code_insee_calcule) VALUES"

    // colonnes statiques d'abord, les autres ensuite, dans l'ordre de $ordre_BDD

    static $insert_prefix_ordre;

    // eg: "(<id>, <prenom>, <nom>, <email>, now(), now(), ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?)"

    // dont le nombre de placeholder dépend du nombre de colonnes non-statiques

    // colonnes statiques d'abord, les autres ensuite, dans l'ordre de $ordre_BDD

    static $insert_ligne_pattern_ordre;

    // seconde (meilleure) possibilité

    // cf: initialiser_pdo_statements()

    // eg: "INSERT INTO cel_obs (ce_utilisateur, ..., date_creation, ...phenologie, code_insee_calcule) VALUES"

    static $insert_prefix;

    // eg: "(<id>, <prenom>, <nom>, <email>, ?, ?, ?, now(), now(), ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?, ?)"

    // dont le nombre de placeholder dépend du nombre de colonnes non-statiques

    static $insert_ligne_pattern;

    /*

      Ces colonnes:

      - sont propres à l'ensemble des enregistrements uploadés

      - sont indépendantes du numéro de lignes

      - n'ont pas de valeur par défaut dans la structure de la table

      - nécessitent une initialisation dans le cadre de l'upload

      initialiser_colonnes_statiques() y merge les données d'identification utilisateur

    */

    public $colonnes_statiques = Array(

	"ce_utilisateur" => NULL,

	"prenom_utilisateur" => NULL,

	"nom_utilisateur" => NULL,

	"courriel_utilisateur" => NULL,

	// fixes (fonction SQL)

	// XXX future: mais pourraient varier dans le futur si la mise-à-jour

	// d'observation est implémentée

	"date_creation" => "now()",

	"date_modification" => "now()",

    );

    public $id_utilisateur = NULL;

    // erreurs d'import

    public $bilan = Array();

    // cache (pour traiterLocalisation() pour l'instant)

    static $cache = Array('geo' => array());

    function ImportXLS($config) {

	parent::__construct($config);

    }

    function createElement($pairs) {

	if(!isset($pairs['utilisateur']) || trim($pairs['utilisateur']) == '') {

	    exit('0');

	}

	$id_utilisateur = intval($pairs['utilisateur']);

	$this->id_utilisateur = $id_utilisateur; // pour traiterImage();

	if(!isset($_SESSION)) session_start();

	$this->controleUtilisateur($id_utilisateur);

	$this->utilisateur = $this->getInfosComplementairesUtilisateur($id_utilisateur);

	$this->initialiser_colonnes_statiques($id_utilisateur);

	// initialisation du statement PDO/MySQL

	// première version, pattern de requête pas génial

	/* list(self;;$insert_prefix_ordre, self::$insert_ligne_pattern_ordre) =

	   $this->initialiser_pdo_ordered_statements($this->colonnes_statiques); */

	list(self::$insert_prefix, self::$insert_ligne_pattern) =

	    $this->initialiser_pdo_statements($this->colonnes_statiques);

	$infos_fichier = array_pop($_FILES);

	/*$objPHPExcel = PHPExcel_IOFactory::load($infos_fichier['tmp_name']);

	  $donnees = $objPHPExcel->getActiveSheet()->toArray(NULL,FALSE,FALSE,TRUE);*/

	/*$objReader = PHPExcel_IOFactory::createReader("Excel5");

	  $objReader->setReadDataOnly(true);

	  $objPHPExcel = $objReader->load($infos_fichier['tmp_name']);*/

	//var_dump($donnees);

	// renomme le fichier pour lui ajouter son extension initiale, ce qui

	// permet (une sorte) d'autodétection du format.

	$fichier = $infos_fichier['tmp_name'];

	$extension = pathinfo($infos_fichier['name'], PATHINFO_EXTENSION);

	if( (strlen($extension) == 3 || strlen($extension) == 4) &&

	    (@rename($fichier, $fichier . '.' . $extension))) { // XXX: @ safe-mode

	    $fichier = $fichier . '.' . $extension;

	}

	$objReader = PHPExcel_IOFactory::createReaderForFile($fichier);

	// TODO: check if compatible with toArray(<1>,<2>,TRUE,<4>)

	$objReader->setReadDataOnly(true);

	// TODO: is_a obsolete entre 5.0 et 5.3, retirer le @ à terme

	$IS_CSV = @is_a($objReader, 'PHPExcel_Reader_CSV') && QUICK_CSV_IMPORT;

	// en cas d'usage de fgetcsv, testons que nous pouvons compter les lignes

	if($IS_CSV) $nb_lignes = intval(exec("wc -l $fichier"));

	// et, le cas échéant, fallback sur PHPExcel à nouveau. La raison de ce test ici est

	// l'instabilité du serveur (safe_mode, safe_mode_exec_dir, symlink vers binaires pour exec(), ... multiples points-of-failure)

	if($IS_CSV && !$nb_lignes) $IS_CSV = FALSE;

	if($IS_CSV) {

	    $objReader->setDelimiter(',')

		->setEnclosure('"')

		->setLineEnding("\n")

		->setSheetIndex(0);

	}

	// on ne conserve que l'en-tête

	$filtre = new MyReadFilter();

	$filtre->def_interval(1, 2);

	$objReader->setReadFilter($filtre);

	$objPHPExcel = $objReader->load($fichier);

	$obj_infos = $objReader->listWorksheetInfo($fichier);

	if($IS_CSV) {

	    // $nb_lignes est déjà défini ci-dessus

	    $csvFileHandler = fopen($fichier, 'r');

	    // nous utilisons la valeur de retour dans un but informatif de l'utilisateur à la

	    // fin de l'import, *mais aussi* dans un array_diff_key() ci-dessous car bien que dans le

	    // fond le "parser" fgetcsv() n'ait pas d'intérêt à connaître les colonnes à ignorer,

	    // il se trouve que celles-ci peuvent interférer sur des fonctions comme traiterEspece()

	    // cf test "ref-nom-num.test.php" pour lequel l'élément C_NOM_SEL vaudrait 3 et $ligne serait array(3 => -42)

	    $filtre->exclues = self::detectionEntete(fgetcsv($csvFileHandler), TRUE);

	} else {

	    // XXX: indépendant du readFilter ?

	    $nb_lignes = $obj_infos[0]['totalRows'];

	    $donnees = $objPHPExcel->getActiveSheet()->toArray(NULL, FALSE, TRUE, TRUE);

	    $filtre->exclues = self::detectionEntete($donnees[1]);

	}

	$obs_ajouts = 0;

	$obs_maj = 0;

	$nb_images_ajoutees = 0;

	$nb_mots_cle_ajoutes = 0;

	$dernier_ordre = Cel::db()->requeter("SELECT MAX(ordre) AS ordre FROM cel_obs WHERE ce_utilisateur = $id_utilisateur");

	$dernier_ordre = intval($dernier_ordre[0]['ordre']) + 1;

	if(! $dernier_ordre) $dernier_ordre = 0;

	// on catch to les trigger_error(E_USER_NOTICE);

	set_error_handler(array($this, 'erreurs_stock'), E_USER_NOTICE);

	$this->taxon_info_webservice = new RechercheInfosTaxonBeta($this->config, NULL);

	// lecture par morceaux (chunks), NB_LIRE_LIGNE_SIMUL lignes à fois

	// pour aboutir des requêtes SQL d'insert groupés.

	for($ligne = 2; $ligne < $nb_lignes + NB_LIRE_LIGNE_SIMUL; $ligne += NB_LIRE_LIGNE_SIMUL) {

	    if(!$IS_CSV) {

		$filtre->def_interval($ligne, NB_LIRE_LIGNE_SIMUL);

		$objReader->setReadFilter($filtre);

		/* recharge avec $filtre actif (filtre sur lignes colonnes):

		   - exclue les colonnes inutiles/inutilisables)

		   - ne selectionne que les lignes dans le range [$ligne - $ligne + NB_LIRE_LIGNE_SIMUL] */

		$objPHPExcel = $objReader->load($fichier)->getActiveSheet();

		// set col typing

		if(C_CE_ZONE_GEO != 'C_CE_ZONE_GEO')

		    $objPHPExcel->getStyle(C_CE_ZONE_GEO . '2:' . C_CE_ZONE_GEO . $objPHPExcel->getHighestRow())->getNumberFormat()->setFormatCode('00000');

		// TODO: set to string type

		if(C_ZONE_GEO != 'C_ZONE_GEO')

		    $objPHPExcel->getStyle(C_ZONE_GEO . '2:' . C_ZONE_GEO . $objPHPExcel->getHighestRow())->getNumberFormat()->setFormatCode('00000');

		$donnees = $objPHPExcel->toArray(NULL, FALSE, TRUE, TRUE);

	    }

	    else {

		$i = NB_LIRE_LIGNE_SIMUL;

		$donnees = array();

		while($i--) {

		    $tab = fgetcsv($csvFileHandler);

		    if(!$tab) continue;

		    $donnees[] = array_diff_key($tab, $filtre->exclues);

		}

	    }

	    // var_dump($donnees, get_defined_constants(true)['user']);die;

	    // ici on appel la fonction qui fera effectivement l'insertion multiple

	    // à partir des (au plus) NB_LIRE_LIGNE_SIMUL lignes

	    // TODO: passer $this, ne sert que pour appeler des méthodes publiques qui pourraient être statiques

	    list($enregistrements, $images, $mots_cle) =

		self::chargerLignes($this, $donnees, $this->colonnes_statiques, $dernier_ordre);

	    if(! $enregistrements) break;

	    self::trierColonnes($enregistrements);

	    // normalement: NB_LIRE_LIGNE_SIMUL, sauf si une enregistrement ne semble pas valide

	    // ou bien lors du dernier chunk

	    $nb_rec = count($enregistrements);

	    $sql_pattern = self::$insert_prefix .

		str_repeat(self::$insert_ligne_pattern_ordre . ', ', $nb_rec - 1) .

		self::$insert_ligne_pattern_ordre;

	    $sql_pattern = self::$insert_prefix .

		str_repeat(self::$insert_ligne_pattern . ', ', $nb_rec - 1) .

		self::$insert_ligne_pattern;

	    Cel::db()->beginTransaction();

	    $stmt = Cel::db()->prepare($sql_pattern);

	    $donnees = array();

	    foreach($enregistrements as $e) $donnees = array_merge($donnees, array_values($e));

	     // echo $sql_pattern . "\n"; var_dump($enregistrements, $donnees); die; // debug ici

	    $stmt->execute($donnees);

	    // $stmt->debugDumpParams(); // https://bugs.php.net/bug.php?id=52384

	    $dernier_autoinc = Cel::db()->lastInsertId();

	    Cel::db()->commit();

	    if(! $dernier_autoinc) trigger_error("l'insertion semble avoir échoué", E_USER_NOTICE);

	    $obs_ajouts += count($enregistrements);

	    // $obs_ajouts += count($enregistrements['insert']);

	    // $obs_maj += count($enregistrements['update']);

	    $ordre_ids = self::chargerCorrespondancesIdOrdre($this, $enregistrements);

	    $nb_images_ajoutees += self::stockerImages($enregistrements, $images, $ordre_ids);

	    $nb_mots_cle_ajoutes += self::stockerMotsCle($enregistrements, $mots_cle, $dernier_autoinc);

	}

	restore_error_handler();

	if($this->bilan) echo implode("\n", $this->bilan) . "\n";

	printf('%1$d observation%2$s ajoutée%2$s' . "\n" .

	       '%3$d image%4$s attachée%4$s' . "\n" .

	       // '%5$d mot%6$c-clef ajouté%6$c [TODO]' . "\n" . // TODO

	       (count($filtre->exclues) > 0 ? 'colonne%7$s non-traitée%7$s: %8$s' . "\n" : ''),

	       $obs_ajouts,

	       $obs_ajouts > 1 ? 's' : '',

	       $nb_images_ajoutees,

	       $nb_images_ajoutees > 1 ? 's' : '',

	       $nb_mots_cle_ajoutes,

	       $nb_mots_cle_ajoutes > 1 ? 's' : '',

	       count($filtre->exclues) > 1 ? 's' : '',

	       implode(', ', $filtre->exclues));

	die();

    }

    /* detectionEntete() sert deux rôles:

       1) détecter le type de colonne attendu à partir des textes de la ligne d'en-tête afin de define()

       2) permet d'identifier les colonnes non-supportées/inutiles afin d'alléger le processus de parsing de PHPExcel

       grace au ReadFilter (C'est le rôle de la valeur de retour)

       La raison de la présence du paramètre $numeric_keys est que pour réussir à identifier les colonnes à exclure nous

       devons traiter un tableau représentant la ligne d'en-tête aussi bien:

       - sous forme associative pour PHPExcel (les clefs sont les lettres de l'alphabet)

       - sous forme de clefs numériques (fgetcsv())

       Le détecter après coup est difficile et pourtant cette distinction est importante car le comportement

       d'array_merge() (réordonnancement des clefs numérique) n'est pas souhaitable dans le second cas. */

    static function detectionEntete($entete, $numeric_keys = FALSE) {

	$colonnes_reconnues = Array();

	$cols = FormateurGroupeColonne::nomEnsembleVersListeColonnes('standard,avance');

	foreach($entete as $k => $v) {

	    // traite les colonnes en faisant fi de la casse et des accents

	    $entete_simple = iconv('UTF-8', 'ASCII//TRANSLIT', strtolower(trim($v)));

	    foreach($cols as $col) {

		$entete_officiel_simple = iconv('UTF-8', 'ASCII//TRANSLIT', strtolower(trim($col['nom'])));

		$entete_officiel_abbrev = $col['abbrev'];

		if($entete_simple == $entete_officiel_simple || $entete_simple == $entete_officiel_abbrev) {

		    // debug echo "define C_" . strtoupper($entete_officiel_abbrev) . ", $k ($v)\n";

		    define("C_" . strtoupper($entete_officiel_abbrev), $k);

		    $colonnes_reconnues[$k] = 1;

		    break;

		}

	    }

	}

	// défini tous les index que nous utilisons à une valeur d'index de colonne Excel qui n'existe pas dans

	// le tableau renvoyé par PHPExcel

	// Attention cependant d'utiliser des indexes différenciés car traiterLonLat() et traiterEspece()

	// les utilisent

	foreach($cols as $col) {

	    if(!defined("C_" . strtoupper($col['abbrev'])))

		define("C_" . strtoupper($col['abbrev']), "C_" . strtoupper($col['abbrev']));

	}

	// prépare le filtre de PHPExcel qui évitera le traitement de toutes les colonnes superflues

	// eg: diff ( Array( H => Commune, I => rien ) , Array( H => 1, K => 1 )

	// ==> Array( I => rien )

	$colonnesID_non_reconnues = array_diff_key($entete, $colonnes_reconnues);

	// des colonnes de FormateurGroupeColonne::nomEnsembleVersListeColonnes()

	// ne retient que celles marquées "importables"

	$colonnes_automatiques = array_filter($cols, '__anonyme_1');

	// ne conserve que le nom long pour matcher avec la ligne XLS d'entête

	array_walk($colonnes_automatiques, '__anonyme_2');

	// intersect ( Array ( N => Milieu, S => Ordre ), Array ( ordre => Ordre, phenologie => Phénologie ) )

	// ==> Array ( S => Ordre, AA => Phénologie )

	$colonnesID_a_exclure = array_intersect($entete, $colonnes_automatiques);

	if($numeric_keys) {

	    return $colonnesID_non_reconnues + $colonnesID_a_exclure;

	}

	// TODO: pourquoi ne pas comparer avec les abbrevs aussi ?

	// merge ( Array( I => rien ) , Array ( S => Ordre, AA => Phénologie ) )

	// ==> Array ( I => rien, AA => Phénologie )

	return array_merge($colonnesID_non_reconnues, $colonnesID_a_exclure);

    }

    static function chargerCorrespondancesIdOrdre($cel, $lignes) {

    	$ordre_ids = array();

    	$requete_obs_ids = "SELECT id_observation, ordre FROM cel_obs WHERE ordre IN (";

    	foreach($lignes as &$ligne) {

    		$requete_obs_ids .= $ligne['ordre'].',';

    	}

    	$requete_obs_ids = rtrim($requete_obs_ids, ',');

    	$requete_obs_ids .= ") AND ce_utilisateur = ".Cel::db()->proteger($cel->id_utilisateur);

    	$obs_ids = Cel::db()->requeter($requete_obs_ids);

    	foreach($obs_ids as &$obs) {

    		$ordre_ids[$obs['ordre']] = $obs['id_observation'];

    	}

    	return $ordre_ids;

    }

    /*

     * charge un groupe de lignes

     */

    static function chargerLignes($cel, $lignes, $colonnes_statiques, &$dernier_ordre) {

	$enregistrement = NULL;

	$enregistrements = Array();

	$toutes_images = Array();

	$tous_mots_cle = Array();

	foreach($lignes as $ligne) {

	    // dans le cas de fgetcsv, on peut avoir des false additionnel (cf do/while l. 279)

	    if($ligne === false) continue;

	    //$ligne = array_filter($ligne, function($cell) { return !is_null($cell); });

	    //if(!$ligne) continue;

	    // on a besoin des NULL pour éviter des notice d'index indéfini

	    if(! array_filter($ligne, '__anonyme_3')) continue;

	    if( ($enregistrement = self::chargerLigne($ligne, $dernier_ordre, $cel)) ) {

		// $enregistrements[] = array_merge($colonnes_statiques, $enregistrement);

		$enregistrements[] = $enregistrement;

		$pos = count($enregistrements) - 1;

		$last = &$enregistrements[$pos];

		if(isset($enregistrement['_images'])) {

		    // ne dépend pas de cel_obs, et seront insérées *après* les enregistrements

		    // mais nous ne voulons pas nous priver de faire des INSERT multiples pour autant

		    $toutes_images[] = Array("images" => $last['_images'],

					     "obs_pos" => $pos);

		    // ce champ n'a pas à faire partie de l'insertion dans cel_obs,

		    // mais est utile pour cel_obs_images

		    unset($last['_images']);

		}

		if(isset($enregistrement['_mots_cle'])) {

		    // ne dépend pas de cel_obs, et seront insérés *après* les enregistrements

		    // mais nous ne voulons pas nous priver de faire des INSERT multiples pour autant

		    $tous_mots_cle[] = Array("mots_cle" => $last['_mots_cle'],

					     "obs_pos" => $pos);

		    // la version inlinée des mots est enregistrées dans cel_obs

		    // mais cel_mots_cles_obs fait foi.

		    // XXX: postponer l'ajout de ces informations dans cel_obs *après* l'insertion effective

		    // des records dans cel_mots_cles_obs ?

		    unset($last['_mots_cle']);

		}

		$dernier_ordre++;

	    }

	}

	// XXX future: return Array($enregistrements_a_inserer, $enregistrements_a_MAJ, $toutes_images);

	return Array($enregistrements, $toutes_images, $tous_mots_cle);

    }

    static function trierColonnes(&$enregistrements) {

	foreach($enregistrements as &$enregistrement) {

	    $enregistrement = self::sortArrayByArray($enregistrement, self::$ordre_BDD);

	    //array_walk($enregistrement, function(&$item, $k) { $item = is_null($item) ? "NULL" : $item; });

	    //$req .= implode(', ', $enregistrement) . "\n";

	}

    }

    static function stockerMotsCle($enregistrements, $tous_mots_cle, $lastid) {

	$c = 0;

	// debug: var_dump($tous_mots_cle);die;

	foreach($tous_mots_cle as $v) $c += count($v['mots_cle']['to_insert']);

	return $c;

    }

    static function stockerImages($enregistrements, $toutes_images, $ordre_ids) {

	$images_insert = 'INSERT INTO cel_obs_images (id_image, id_observation) VALUES %s ON DUPLICATE KEY UPDATE id_image = id_image';

	$images_obs_assoc = Array();

	foreach($toutes_images as $images_pour_obs) {

	    $obs = $enregistrements[$images_pour_obs["obs_pos"]];

	    $id_obs = $ordre_ids[$obs['ordre']]; // id réel de l'observation correspondant à l'ordre

	    foreach($images_pour_obs['images'] as $image) {

		$images_obs_assoc[] = sprintf('(%d,%d)',

					      $image['id_image'], // intval() useless

					      $id_obs); // intval() useless

	    }

	}

	if($images_obs_assoc) {

	    $requete = sprintf($images_insert, implode(', ', $images_obs_assoc));

	    // debug echo "$requete\n";

	    Cel::db()->requeter($requete);

	}

	return count($images_obs_assoc);

    }

    /*

      Aucune des valeurs présentes dans $enregistrement n'est quotée

      cad aucune des valeurs retournée par traiter{Espece|Localisation}()

      car ce tableau est passé à un PDO::preparedStatement() qui applique

      proprement les règle d'échappement.

    */

    static function chargerLigne($ligne, $dernier_ordre, $cel) {

	// évite des notices d'index lors des trigger_error()

	$ref_ligne = !empty($ligne[C_NOM_SEL]) ? trim($ligne[C_NOM_SEL]) : '';

	// en premier car le résultat est utile pour

	// * traiter espèce (traiterEspece())

	// * traiter longitude et latitude (traiterLonLat())

	$referentiel = self::identReferentiel(trim(strtolower(@$ligne[C_NOM_REFERENTIEL])), $ligne, $ref_ligne);

	// $espece est rempli de plusieurs informations

	$espece = Array(C_NOM_SEL => NULL, C_NOM_SEL_NN => NULL, C_NOM_RET => NULL,

			C_NOM_RET_NN => NULL, C_NT => NULL, C_FAMILLE => NULL);

	self::traiterEspece($ligne, $espece, $referentiel, $cel->taxon_info_webservice);

	if(!$espece[C_NOM_SEL]) $referentiel = Cel::$fallback_referentiel;

	if($espece[C_NOM_SEL] && !$espece[C_NOM_SEL_NN]) $referentiel = Cel::$fallback_referentiel;

	// $localisation est rempli à partir de plusieurs champs: C_ZONE_GEO et C_CE_ZONE_GEO

	$localisation = Array(C_ZONE_GEO => NULL, C_CE_ZONE_GEO => NULL);

	self::traiterLocalisation($ligne, $localisation);

	// $transmission est utilisé pour date_transmission

	// XXX: @ contre "Undefined index"

	@$transmission = in_array(strtolower(trim($ligne[C_TRANSMISSION])), array(1, 'oui')) ? 1 : 0;

	// Dans ce tableau, seules devraient apparaître les données variable pour chaque ligne.

	// Dans ce tableau, l'ordre des clefs n'importe pas (cf: self::sortArrayByArray())

	$enregistrement = Array(

	    "ordre" => $dernier_ordre,

	    "nom_sel" => $espece[C_NOM_SEL],

	    "nom_sel_nn" => $espece[C_NOM_SEL_NN],

	    "nom_ret" => $espece[C_NOM_RET],

	    "nom_ret_nn" => $espece[C_NOM_RET_NN],

	    "nt" => $espece[C_NT],

	    "famille" => $espece[C_FAMILLE],

	    "nom_referentiel" => $referentiel,

	    "zone_geo" => $localisation[C_ZONE_GEO],

	    "ce_zone_geo" => $localisation[C_CE_ZONE_GEO],

	    // $ligne: uniquement pour les infos en cas de gestion d'erreurs (date incompréhensible)

	    "date_observation" => isset($ligne[C_DATE_OBSERVATION]) ? self::traiterDateObs($ligne[C_DATE_OBSERVATION], $ref_ligne) : NULL,

	    "lieudit" => isset($ligne[C_LIEUDIT]) ? trim($ligne[C_LIEUDIT]) : NULL,

	    "station" => isset($ligne[C_STATION]) ? trim($ligne[C_STATION]) : NULL,

	    "milieu" => isset($ligne[C_MILIEU]) ? trim($ligne[C_MILIEU]) : NULL,

	    "mots_cles_texte" => NULL, // TODO: foreign-key

	    // XXX: @ contre "Undefined index"

	    "commentaire" => isset($ligne[C_COMMENTAIRE]) ? trim($ligne[C_COMMENTAIRE]) : NULL,

	    "transmission" => $transmission,

	    "date_transmission" => $transmission ? date("Y-m-d H:i:s") : NULL, // pas de fonction SQL dans un PDO statement, <=> now()

	    // $ligne: uniquement pour les infos en cas de gestion d'erreurs (lon/lat incompréhensible)

	    "latitude" => isset($ligne[C_LATITUDE]) ? self::traiterLonLat(NULL, $ligne[C_LATITUDE], $referentiel, $ref_ligne) : NULL,

	    "longitude" => isset($ligne[C_LONGITUDE]) ? self::traiterLonLat($ligne[C_LONGITUDE], NULL, $referentiel, $ref_ligne) : NULL,

	    "altitude" => isset($ligne[C_ALTITUDE]) ? intval($ligne[C_ALTITUDE]) : NULL, // TODO: guess alt from lon/lat

	    // @ car potentiellement optionnelles ou toutes vides => pas d'index dans PHPExcel (tableau optimisé)

	    "abondance" => @$ligne[C_ABONDANCE],

	    "certitude" => @$ligne[C_CERTITUDE],

	    "phenologie" => @$ligne[C_PHENOLOGIE],

	    "code_insee_calcule" => substr($localisation[C_CE_ZONE_GEO], -5) // varchar(5)

	);

	// passage de $enregistrement par référence, ainsi ['_images'] n'est défini

	// que si des résultats sont trouvés

	// "@" car PHPExcel supprime les colonnes null sur toute la feuille (ou tout le chunk)

	if(@$ligne[C_IMAGES]) self::traiterImage($ligne[C_IMAGES], $cel->id_utilisateur, $enregistrement);

	if(@$ligne[C_MOTS_CLES_TEXTE]) self::traiterMotsCle($ligne[C_MOTS_CLES_TEXTE], $cel->id_utilisateur, $enregistrement);

	return $enregistrement;

    }

    static function traiterImage($str, $id_utilisateur, &$enregistrement) {

	$liste_images = array_filter(explode("/", $str));

	//array_walk($liste_images, '__anonyme_4');

	array_walk($liste_images, array(__CLASS__, '__anonyme_4'));

	$requete = sprintf(

	    "SELECT id_image, nom_original FROM cel_images WHERE ce_utilisateur = %d AND nom_original IN (%s)",

	    $id_utilisateur,

	    implode(',', $liste_images));

	$resultat = Cel::db()->requeter($requete);

	if($resultat) $enregistrement['_images'] = $resultat;

    }

    static function traiterMotsCle($str, $id_utilisateur, &$enregistrement) {

	$liste_mots_cle = $liste_mots_cle_recherche = array_map("trim", array_unique(array_filter(explode(",", $str))));

	array_walk($liste_mots_cle_recherche, array(__CLASS__, '__anonyme_4'));

	// TODO!!!! remplace > (pour les tests uniquement) par un = et supprimer le group by mot_cle

	$requete = sprintf("SELECT id_mot_cle_obs, mot_cle FROM cel_mots_cles_obs WHERE id_utilisateur > %d ".

			   "AND mot_cle IN (%s) ".

			   "GROUP BY mot_cle",

			   $id_utilisateur,

			   implode(',', $liste_mots_cle_recherche));

	$resultat_sql = Cel::db()->requeter($requete);

	if(!$resultat_sql) return;

	$resultat = array();

	foreach($resultat_sql as $v) $resultat[$v['id_mot_cle_obs']] = $v['mot_cle'];

	$enregistrement['mots_cles_texte'] = implode(',', $liste_mots_cle);

	$enregistrement['_mots_cle'] = array("existing" => $resultat,

					     "to_insert" => array_diff($liste_mots_cle, $resultat));

    }

    /* FONCTIONS de TRANSFORMATION de VALEUR DE CELLULE */

    // TODO: PHP 5.3, utiliser date_parse_from_format()

    // TODO: parser les heures (cf product-owner)

    // TODO: passer par le timestamp pour s'assurer de la validité

    static function traiterDateObs($date, $ref_ligne) {

	// TODO: see https://github.com/PHPOffice/PHPExcel/issues/208

	// TODO: PHPExcel_Shared_Date::ExcelToPHP()

	if(is_double($date)) {

	    if($date > 0)

		return PHPExcel_Style_NumberFormat::toFormattedString($date, PHPExcel_Style_NumberFormat::FORMAT_DATE_YYYYMMDD2) . " 00:00:00";

	    trigger_error("ligne \"{$ref_ligne}\": " .

			  "Attention: date antérieure à 1970 et format de cellule \"DATE\" utilisés ensemble",

			  E_USER_NOTICE);

	    // throw new Exception("erreur: date antérieure à 1970 et format de cellule \"DATE\" utilisés ensemble");

	    // attention, UNIX timestamp, car Excel les décompte depuis 1900

	    // cf http://fczaja.blogspot.fr/2011/06/convert-excel-date-into-timestamp.html

	    // $timestamp = ($date - MIN_DATES_DIFF) * 60 * 60 * 24 - time(); // NON

	    // $timestamp = PHPExcel_Calculation::getInstance()->calculateFormula("=" . $date . "-DATE(1970,1,1)*60*60*24"); // NON

	    // echo strftime("%Y/%m/%d 00:00:00", $timestamp); // NON

	}

	else {

	    // attend l'un des formats de

	    // http://www.php.net/manual/fr/datetime.formats.date.php

	    // le plus simple: YYYY/MM/DD (utilisé à l'export), mais DD-MM-YYYY est aussi supporté

	    $matches = NULL;

	    // et on essaie d'être sympa et supporter aussi DD/MM/YYYY

	    if(preg_match(';^([0-3]?\d)/([01]\d)/([12]\d\d\d)$;', $date, $matches)) {

		$date = $matches[3] . '/' . $matches[2] . '/' . $matches[1];

	    }

	    $timestamp = strtotime($date);

	    if(! $timestamp || $timestamp > time() + 3600 * 24 * 1) { // une journée d'avance maxi autorisée (décallage horaire ?)

		if($date) trigger_error("ligne \"{$ref_ligne}\": Attention: date erronée ($date)", E_USER_NOTICE);

		return NULL;

	    }

	    return strftime("%Y-%m-%d 00:00:00", $timestamp);

	}

    }

    static function identReferentiel($referentiel, $ligne, $ref_ligne) {

	// SELECT DISTINCT nom_referentiel, COUNT(id_observation) AS count FROM cel_obs GROUP BY nom_referentiel ORDER BY count DESC;

	if(strpos($referentiel, 'bdtfx') !== FALSE) return 'bdtfx'; //:v1.01';

	if(strpos($referentiel, 'bdtxa') !== FALSE) return 'bdtxa'; //:v1.00';

	//if(strpos($referentiel, 'bdnff') !== FALSE) return 'bdnff'; //:4.02';

	if(strpos($referentiel, 'bdnff') !== FALSE) return 'bdtfx';

	if(strpos($referentiel, 'isfan') !== FALSE) return 'isfan'; //:v1.00';

	if(strpos($referentiel, 'autre') !== FALSE) return 'autre';

	if($referentiel && isset($ligne[C_NOM_SEL]) && $ligne[C_NOM_SEL]) {

	    trigger_error("ligne \"{$ref_ligne}\": Attention: référentiel \"{$referentiel}\" inconnu", E_USER_NOTICE);

	    return 'autre';

	}

	// pas de référentiel ou pas de NOM_SEL: NULL

	return NULL;

	/* TODO: cf story,

	   En cas de NULL faire une seconde passe de détection à partir du nom saisi

	   + accepter les n° de version */

    }

    static function traiterLonLat($lon = NULL, $lat = NULL, $referentiel = 'bdtfx', $ref_ligne) {

	// en CSV ces valeurs sont des string, avec séparateur en français (","; cf défauts dans ExportXLS)

	if($lon && is_string($lon)) $lon = str_replace(',', '.', $lon);

	if($lat && is_string($lat)) $lat = str_replace(',', '.', $lat);

	// sprintf applique une précision à 5 décimale (comme le ferait MySQL)

	// tout en uniformisant le format de séparateur des décimales (le ".")

	if($lon && is_numeric($lon) && $lon >= -180 && $lon <= 180) return sprintf('%.5F', $lon);

	if($lat && is_numeric($lat) && $lat >= -90 && $lat <= 90) return sprintf('%.5F', $lat);

	if($lon || $lat) {

	    trigger_error("ligne \"{$ref_ligne}\": " .

			  "Attention: longitude ou latitude erronée",

			  E_USER_NOTICE);

	}

	return NULL;

	/* limite france métropole si bdtfx ? ou bdtxa ? ...

	   NON!

	   Un taxon d'un référentiel donné peut être théoriquement observé n'importe où sur le globe.

	   Il n'y a pas lieu d'effectuer des restriction ici.

	   Cependant des erreurs fréquentes (0,0 ou lon/lat inversées) peuvent être détectés ici.

	   TODO */

	$bbox = self::getReferentielBBox($referentiel);

	if(!$bbox) return NULL;

	if($lon) {

	    if($lon < $bbox['EST'] && $lon > $bbox['OUEST']) return is_numeric($lon) ? $lon : NULL;

	    else return NULL;

	}

	if($lat) {

	    if($lat < $bbox['NORD'] && $lat > $bbox['SUD']) return is_numeric($lat) ? $lat : NULL;

	    return NULL;

	}

    }

    /*

      TODO: s'affranchir du webservice pour la détermination du nom scientifique en s'appuyant sur cel_references,

      pour des questions de performances

    */

    static function traiterEspece($ligne, Array &$espece, &$referentiel, $taxon_info_webservice) {

	if(empty($ligne[C_NOM_SEL])) {

	    // TODO: nous ne déclarons pas "Numéro nomenclatural" comme colonne importable

	    // Nous ne pouvons donc pas tenter d'être sympa sur la détermination par num_nom

	    /* if(!empty($ligne[C_NOM_SEL_NN]) && $referentiel != Cel::$fallback_referentiel)

	       $ligne[C_NOM_SEL] = $referentiel . ':nn:' . $ligne[C_NOM_SEL_NN];

	       else */

	    return;

	}

	// nom_sel reste toujours celui de l'utilisateur

	$espece[C_NOM_SEL] = trim($ligne[C_NOM_SEL]);

	// XXX/attention, nous ne devrions pas accepter un référentiel absent !

	if(!$referentiel) $referentiel = 'bdtfx';

	$taxon_info_webservice->setReferentiel($referentiel);

	$ascii = iconv('UTF-8', 'ASCII//TRANSLIT', $ligne[C_NOM_SEL]);

	// TODO: si empty(C_NOM_SEL) et !empty(C_NOM_SEL_NN) : recherche info à partir de C_NOM_SEL_NN

	// echo "rechercherInformationsComplementairesSurNom()\n";

	/*

	  SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu ,auteur, annee, biblio_origine, nom_sci,auteur  FROM bdtfx_v1_01  WHERE (nom_sci LIKE 'Heliotropium europaeum')  ORDER BY nom_sci ASC	  LIMIT 0, 1

	  #

	  SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu ,auteur, annee, biblio_origine, nom_sci,auteur  FROM bdtfx_v1_01  WHERE (nom_sci LIKE 'eliotropium euro')  ORDER BY nom_sci ASC   LIMIT 0, 1

	  SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu ,auteur, annee, biblio_origine, nom_sci,auteur  FROM bdtfx_v1_01  WHERE (nom_sci LIKE 'eliotropium')	ORDER BY nom_sci ASC   LIMIT 0, 1

	  SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu ,auteur, annee, biblio_origine, nom_sci,auteur  FROM bdtfx_v1_01  WHERE (nom_sci LIKE 'eliotropium% euro%')  ORDER BY nom_sci ASC   LIMIT 0, 1

	  #

	  SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html, auteur, annee, biblio_origine FROM bdtfx_v1_01 WHERE num_nom = 31468

	*/

	// $determ = $taxon_info_webservice->rechercherInformationsComplementairesSurNom($ligne[C_NOM_SEL]);

	// permet une reconnaissance de bdtfx:nn:XXXX

	$determ = $taxon_info_webservice->rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax(trim($ligne[C_NOM_SEL]));

	// note: rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax peut ne retourner qu'une seule clef "nom_sel"

	if (! $determ) {

	    // on supprime les noms retenus et renvoi tel quel

	    // on réutilise les define pour les noms d'indexes, tant qu'à faire

	    // XXX; tout à NULL sauf C_NOM_SEL ci-dessus ?

	    $espece[C_NOM_SEL_NN] = @$ligne[C_NOM_SEL_NN];

	    $espece[C_NOM_RET] = @$ligne[C_NOM_RET];

	    $espece[C_NOM_RET_NN] = @$ligne[C_NOM_RET_NN];

	    $espece[C_NT] = @$ligne[C_NT];

	    $espece[C_FAMILLE] = @$ligne[C_FAMILLE];

	    return;

	}

	// succès de la détection, mais résultat partiel

	if(!isset($determ->id))

	    $determ = $taxon_info_webservice->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($determ->{"nom_retenu.id"});

	// ne devrait jamais arriver !

	if(!$determ) die("erreur critique: " . __FILE__ . ':' . __LINE__);

	// un schéma <ref>:(nt|nn):<num> (ie: bdtfx:nt:8503) a été passé

	// dans ce cas on met à jour le référentiel avec celui passé dans le champ espèce

	if(isset($determ->ref)) {

	    $referentiel = $determ->ref;

	}

	// succès de la détection

	// nom_sel est remplacé, mais seulement si un motif spécial à été utilisé (bdtfx:nn:4567)

	if($taxon_info_webservice->is_notation_spe) {

	    $espece[C_NOM_SEL] = $determ->nom_sci;

	}

	// écrasement des numéros (nomenclatural, taxonomique) saisis...

	$espece[C_NOM_SEL_NN] = $determ->id;

	$espece[C_NOM_RET] = RechercheInfosTaxonBeta::supprimerBiblio($determ->nom_retenu_complet);

	$espece[C_NOM_RET_NN] = $determ->{"nom_retenu.id"};

	$espece[C_NT] = $determ->num_taxonomique;

	$espece[C_FAMILLE] = $determ->famille;

	return;

	// et des info complémentaires

	/*

	// GET /service:eflore:0.1/bdtfx/noms/31468?retour.champs=nom_sci,auteur,id,nom_retenu_complet,nom_retenu.id,num_taxonomique,famille

	/home/raphael/eflore/projets/services/modules/0.1/bdtfx/Noms.php:280

	SELECT  *, nom_sci   FROM bdtfx_v1_01	 WHERE num_nom = '31468'

	SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html, auteur, annee, biblio_origine FROM bdtfx_v1_01 WHERE num_nom = 31468

	SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html, auteur, annee, biblio_origine FROM bdtfx_v1_01 WHERE num_nom = 86535

	*/

	//var_dump($complement, $espece);die;

    }

    static function detectFromNom($nom) {

	$r = Cel::db()->requeter(sprintf("SELECT num_nom, num_tax_sup FROM bdtfx_v1_01 WHERE (nom_sci LIKE '%s') ".

					 "ORDER BY nom_sci ASC LIMIT 0, 1",

					 Cel::db()->proteger($nom)));

	if($r) return $r;

	Cel::db()->requeter(sprintf("SELECT num_nom, num_tax_sup FROM bdtfx_v1_01 WHERE (nom_sci LIKE '%s' OR nom LIKE '%s') ".

				    "ORDER BY nom_sci ASC LIMIT 0, 1",

				    Cel::db()->proteger($nom),

				    Cel::db()->proteger(str_replace(' ', '% ', $nom))));

	return $r;

    }

    /*

     * TODO: analyse rigoureuse:

     * == Identifiant Commune

     * - INSEE-C:\d{5}

     * - \d{5}

     * - \d{2}

     * == Commune

     * - \w+ (\d{2})

     * - \w+ (\d{5})

     * - \w+

     *

     */

    static function traiterLocalisation($ligne, Array &$localisation) {

	if(empty($ligne[C_ZONE_GEO])) $ligne[C_ZONE_GEO] = NULL;

	if(empty($ligne[C_CE_ZONE_GEO])) $ligne[C_CE_ZONE_GEO] = NULL;

	$identifiant_commune = trim($ligne[C_ZONE_GEO]);

	if(!$identifiant_commune) {

	    $departement = trim($ligne[C_CE_ZONE_GEO]);

	    if(strpos($departement, "INSEE-C:", 0) === 0) {

		$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = trim($ligne[C_CE_ZONE_GEO]);

		if(array_key_exists($localisation[C_CE_ZONE_GEO], self::$cache['geo'])) {

		    $localisation[C_ZONE_GEO] = self::$cache['geo'][$localisation[C_CE_ZONE_GEO]];

		}

		else {

		    $nom = Cel::db()->requeter(sprintf("SELECT nom FROM cel_zones_geo WHERE code = %s LIMIT 1",

						       self::quoteNonNull(substr($localisation[C_CE_ZONE_GEO], strlen("INSEE-C:")))));

		    if($nom) $localisation[C_ZONE_GEO] = $nom[0]['nom'];

		    self::$cache['geo'][$localisation[C_CE_ZONE_GEO]] = @$nom[0]['nom'];

		}

		return;

	    }

	    if(!is_numeric($departement)) {

		$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $ligne[C_CE_ZONE_GEO];

		return;

	    }

	    $cache_attempted = FALSE;

	    if(array_key_exists($departement, self::$cache['geo'])) {

		$cache_attempted = TRUE;

		if(self::$cache['geo'][$departement][0] && self::$cache['geo'][$departement][1]) {

		    $localisation[C_ZONE_GEO] = self::$cache['geo'][$departement][0];

		    $localisation[C_CE_ZONE_GEO] = self::$cache['geo'][$departement][1];

		    return;

		}

	    }

	    if(! $cache_attempted && ($resultat_commune = Cel::db()->requeter(sprintf("SELECT DISTINCT nom, CONCAT('INSEE-C:', code) AS code FROM cel_zones_geo WHERE code = %s LIMIT 1",

										      self::quoteNonNull($departement)))) ) {

		$localisation[C_ZONE_GEO] = $resultat_commune[0]['nom'];

		$localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $resultat_commune[0]['code'];

		self::$cache['geo'][$departement] = array($resultat_commune[0]['nom'], $resultat_commune[0]['code']);

		return;

	    }

	    ;

	    // if(strlen($departement) == 4) $departement = "INSEE-C:0" . $departement;

	    // if(strlen($departement) == 5) $departement = "INSEE-C:" . $departement;

	    // if(strlen($departement) <= 9) return "INSEE-C:0" . $departement; // ? ... TODO

	    $departement = trim($departement); // TODO

	    $localisation[C_CE_ZONE_GEO] = $ligne[C_CE_ZONE_GEO];

	    return;

	}

	$select = "SELECT DISTINCT nom, code FROM cel_zones_geo";

	if (preg_match('/(.+) \((\d{1,5})\)/', $identifiant_commune, $elements)) {

	    // commune + departement : montpellier (34)

	    $nom_commune=$elements[1];

	    $code_commune=$elements[2];

	    if(strlen($code_commune) <= 2) {

		$requete = sprintf("%s WHERE nom = %s AND code LIKE %s",

				   $select, self::quoteNonNull($nom_commune),

				   self::quoteNonNull($code_commune.'%'));

	    }

	    else {

		$requete = sprintf("%s WHERE nom = %s AND code = %d",

				   $select, self::quoteNonNull($nom_commune),

				   $code_commune);

	    }

	}

	elseif (preg_match('/^(\d+|(2[ab]\d+))$/i', $identifiant_commune, $elements)) {

	    // Code insee seul

	    $code_insee_commune=$elements[1];

	    $requete = sprintf("%s WHERE code = %s", $select, self::quoteNonNull($code_insee_commune));

	}

	else {

	    // Commune seule (le departement sera recupere dans la colonne departement si elle est presente)