Subversion Repositories eFlore/Applications.moissonnage

<?php

/**

 * Classe qui va effectuer toutes les operations liees aux referentiels ou rechercher

 * des informations sur les taxons dans les tables des referentiels dans la base de donnees

 *

 * Operations a utiliser :

 *   - recupererListeReferentielsDisponibles (statique) : recherche dans les fichiers de configuration

 *     la liste des referentiels disponibles et les renvoie dans un tableau

 *

 *   - chargerTaxon : recherche dans la table possedant le meme nom que le nom du referentiel en attribut

 *     les informations generales sur un taxon (numero nomenclatural retenu, numero taxonomique,

 *     nom scientifique, rang) a partir de son numero taxonomique

 *     On stockera dans un attribut un tableau associatif contenant ces informations + le nom du referentiel,

 *     ou la valeur nulle si aucun taxon n'a ete trouve

 *

 *   - recupererSousTaxons : a partir du numero nomenclatural d'un taxon, la fonction va recuperer

 *     tous les taxons de rang inferieur de maniere recursive jusqu'en ne plus en trouver de nouveaux

 *     la recherche s'effectuera seulement au niveau des rangs famille, genre, espece et sous-espece

 *     pour limiter le nombre d'informations qui sera a la fin renvoye

 *

 *   - obtenirNumeroNomenclatural : recherche le numero nomenclatural d'un taxon a partir de son nom scientifique

 *

 * @package framework-0.3

 * @author Alexandre GALIBERT <alexandre.galibert@tela-botanica.org>

 * @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>

 * @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>

 * @version $Id$

 * @copyright 2013 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)

 *

 */

class Referentiel {

	private $nomComplet;

	private $nomCourt;

	private $taxon;

	private $bdd = null;

	private $nomsChampsBdtfx = array('nn' => 'num_nom_retenu', 'nt' => 'num_taxonomique', 'ns' => 'nom_sci');

	private $nomsChampsBdtxa = array('nn' => 'num_nom_retenu', 'nt' => 'num_tax', 'ns' => 'nom_sci');

	private $champs;

	public function __construct($nomReferentiel, $taxon = null) {

		$this->nomComplet = $nomReferentiel;

		$this->nomCourt = current(explode('_', $nomReferentiel));

		$proprieteChamps = 'nomsChamps' . ucfirst($this->nomCourt);

		foreach ($this->$proprieteChamps as $nomCourt => $nomChamp) {

			$this->champs[$nomCourt] = $nomChamp;

		}

		$this->taxon = $taxon;

	}

	public function renvoyerNomCompletReferentiel() {

		return $this->nomComplet;

	}

	public function renvoyerTaxon() {

		return $this->taxon;

	}

	public function chargerTaxon($typeNumero, $numTaxon) {

		$taxon = null;

		// verifier que le numero de taxon soit bien une chaine de caracteres composee uniquement

		// que de nombres entiers avant de construire la requete SQL a executer

		if (preg_match('/^\d+$/', $numTaxon) == 1) {

			$champWhere = $typeNumero == 'nt' ? $this->champs['nt']: 'num_nom';

			$requete =

				"SELECT ".$this->champs['nn']." AS nn, ".$this->champs['nt']." AS nt, ".

				$this->champs['ns']." AS nom, rang FROM ".$this->nomComplet." WHERE ".

				$champWhere."={$numTaxon} AND num_nom=".$this->champs['nn']." ".

				"ORDER BY rang, If(num_nom=".$this->champs['nn'].", 0, 1) LIMIT 0, 1";

			$taxon = $this->getBdd()->recuperer($requete);

			if ($taxon == false) {

				$taxon = null;

			} else {

				$taxon['referentiel'] = $this->nomComplet;

			}

		}

		$this->taxon = $taxon;

	}

	private function getBdd() {

		if (is_null($this->bdd)) {

			$this->bdd = new Bdd();

		}

		$nomBdd = Config::get('bdd_nom');

		$this->bdd->requeter("USE ".$nomBdd);

		return $this->bdd;

	}

	public function recupererSynonymesEtSousEspeces() {

		$sousTaxons = array();

		if (!is_null($this->taxon) && $this->taxon['rang'] >= Config::get('rang.espece')) {

			$requete =

			"SELECT ".$this->champs['nn']." AS nn, ".$this->champs['nt']." AS nt, ".

			$this->champs['ns']." AS nom, rang FROM ".$this->nomComplet. " WHERE ".

			$this->champs['nt']."=".$this->taxon['nt']." OR hierarchie LIKE '%-".$this->champs['nn']."-%'";

			$sousTaxons = $this->getBdd()->recupererTous($requete);

		}

		return $sousTaxons;

	}

	public function recupererGenres() {

		$sousTaxons = array();

		if (!is_null($this->taxon) && $this->taxon['rang'] == Config::get('rang.famille')) {

			$requete =

			"SELECT ".$this->champs['nn']." AS nn, ".$this->champs['nt']." AS nt, ".

			$this->champs['ns']." AS nom, rang FROM ".$this->nomComplet. " WHERE ".

			"num_tax_sup=".$this->taxon['nn']." AND num_nom=".$this->champs['nn'];

			$sousTaxons = $this->getBdd()->recupererTous($requete);

		}

		return $sousTaxons;

	}

	public static function recupererListeReferentielsDisponibles() {

		$tableau = array();

		$tableauPartiel = explode(',', Config::get('referentiels_dispo'));

		$tableauPartiel = array_map('trim', $tableauPartiel);

		foreach ($tableauPartiel as $champ) {

			if (strpos($champ, '=') === false) {

				$tableau[] = $champ;

			} else {

				list($cle, $val) = explode('=', $champ);

				$clePropre = trim($cle);

				$valeurPropre = trim($val);

				$tableau[$clePropre] = $valeurPropre;

			}

		}

		return $tableau;

	}

	public function obtenirNumeroNomenclatural($nomScientifique, $numeroNomenclatural = null) {

		$aProteger = $this->getBdd()->proteger(trim($nomScientifique) . '%');

		$requete = "SELECT ".$this->champs['nn']." AS nn FROM ".$this->nomComplet." ".

			"WHERE ".$this->champs['ns']." LIKE ".$aProteger;

		if (!is_null($numeroNomenclatural) || strlen($numeroNomenclatural) > 0) {

			$requete .= " OR ".$this->champs['nn']."={$numeroNomenclatural}";

		}

		$taxon = $this->getBdd()->recuperer($requete);

		if ($taxon == false) {

			$taxon = null;

		} else {

			$taxon['referentiel'] = $this->nomComplet;

		}

		return $taxon;

	}

}

?>