| 631 |
delphine |
1 |
<?php
|
|
|
2 |
// declare(encoding='UTF-8');
|
|
|
3 |
/**
|
|
|
4 |
* Description :
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|
|
5 |
* Classe CommunNomsTaxons.php
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|
|
6 |
* Encodage en entrée : utf8
|
|
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7 |
* Encodage en sortie : utf8
|
|
|
8 |
* @package framework-v3
|
|
|
9 |
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
|
|
|
10 |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
|
|
|
11 |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
|
|
|
12 |
* @version 1.0
|
|
|
13 |
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
|
|
|
14 |
*/
|
|
|
15 |
|
|
|
16 |
|
|
|
17 |
abstract class CommunNomsTaxons extends Commun {
|
|
|
18 |
|
|
|
19 |
/** Tableau de correspondance entre les noms des champs et les codes de l'ontologie.*/
|
|
|
20 |
private $relationsChampsCodesOntologie = null;
|
|
|
21 |
protected $table_retour; //Permet de stocker le tableau de résultat (non encodé en json)
|
|
|
22 |
protected $resultat_req; // Permet de stocker le résultat de la requete principale.
|
|
|
23 |
protected $compo_nom = null; //Stocke sous forme de tableau les composant du nom à ajouter au nom scientifique
|
|
|
24 |
protected $table;// Nom de la table dans laquelle on récupèrera les données dans les requetes SQL
|
|
|
25 |
protected $total_resultat = null;
|
|
|
26 |
/** Stocke le service appelé correspondant. Est utilisé principalement lors de l'affichage du href d'un synonyme
|
|
|
27 |
(ex id=12, basionyme num 25 est un synonyme) dans le service taxon */
|
|
|
28 |
protected $service_href = null;
|
|
|
29 |
protected $erreursParametres = null;
|
|
|
30 |
protected $sans_nom_sci = array('gen','sp','ssp','fam','au_ss','bib_ss');
|
|
|
31 |
private $bib_traitees = array();
|
|
|
32 |
private $ontologie = array();
|
|
|
33 |
|
|
|
34 |
//+------------------------------- PARAMÈTRES ---------------------------------------------------------------+
|
|
|
35 |
|
|
|
36 |
public function traiterParametres() {
|
|
|
37 |
$this->definirParametresParDefaut();
|
|
|
38 |
$this->verifierParametres();
|
|
|
39 |
|
|
|
40 |
if (isset($this->parametres) && count($this->parametres) > 0) {
|
|
|
41 |
foreach ($this->parametres as $param => $val) {
|
|
|
42 |
switch ($param) {
|
|
|
43 |
case 'ns.structure' :
|
|
|
44 |
$this->remplirTableCompositionNom($val);
|
|
|
45 |
if (in_array($val,$this->sans_nom_sci)){
|
|
|
46 |
$this->requete_champ = implode(', ',$this->compo_nom);
|
| 657 |
jpm |
47 |
}else {
|
| 631 |
delphine |
48 |
$this->requete_champ .= ' ,'.implode(', ',$this->compo_nom);
|
|
|
49 |
}
|
|
|
50 |
break;
|
|
|
51 |
case 'navigation.depart' :
|
|
|
52 |
$this->limite_requete['depart'] = $val;
|
|
|
53 |
break;
|
|
|
54 |
case 'navigation.limite' :
|
|
|
55 |
$this->limite_requete['limite'] = $val;
|
|
|
56 |
break;
|
|
|
57 |
}
|
|
|
58 |
}
|
|
|
59 |
$this->traiterParametresSpecifiques();
|
|
|
60 |
}
|
|
|
61 |
}
|
|
|
62 |
|
|
|
63 |
protected function definirParametresParDefaut() {
|
|
|
64 |
if (empty($this->parametres['recherche'])) {
|
|
|
65 |
$this->parametres['recherche'] = 'stricte';
|
|
|
66 |
}
|
|
|
67 |
if (empty($this->parametres['ns.format'])) {
|
|
|
68 |
$this->parametres['ns.format'] = 'txt';
|
|
|
69 |
}
|
|
|
70 |
if (empty($this->parametres['retour.format'])) {
|
|
|
71 |
$this->parametres['retour.format'] = 'max';
|
|
|
72 |
}
|
|
|
73 |
if (empty($this->parametres['ns.structure']) &&
|
|
|
74 |
$this->parametres['retour.format'] != 'oss') {
|
|
|
75 |
$this->parametres['ns.structure'] = 'au,an,bib';
|
|
|
76 |
}
|
|
|
77 |
}
|
| 657 |
jpm |
78 |
|
|
|
79 |
|
| 631 |
delphine |
80 |
public function verifierParametres() {
|
|
|
81 |
//$this->verifierParametresAPI();
|
|
|
82 |
|
|
|
83 |
$this->verifierParametre('recherche', 'stricte|floue|etendue|complete');
|
|
|
84 |
$this->verifierParametre('ns.format', 'htm|txt');
|
|
|
85 |
$this->verifierParametre('retour.format', 'min|max|oss|perso');
|
|
|
86 |
$this->verifierParametreAvecValeurMultipe('ns.structure', 'an|au|bib|ad|gen|sp|ssp|fam|au_ss|bib_ss');
|
|
|
87 |
|
|
|
88 |
/*if (count($this->erreursParametres) > 0) {
|
|
|
89 |
$m = 'Erreur dans votre requête : '.implode('<br/>', $this->erreursParametres);
|
|
|
90 |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $m);
|
|
|
91 |
}*/
|
|
|
92 |
}
|
|
|
93 |
|
|
|
94 |
public function verifierParametresAPI() {
|
|
|
95 |
$parametresApi = $this->recupererTableauConfig('parametresAPI');
|
|
|
96 |
while (!is_null($parametre = key($this->parametres))) {
|
|
|
97 |
if (!in_array($parametre, $parametresApi)) {
|
|
|
98 |
$this->erreursParametres[] = "Le paramètre '$parametre' n'est pas pris en compte par cette version de l'API.";
|
|
|
99 |
}
|
|
|
100 |
next($this->parametres);
|
|
|
101 |
}
|
|
|
102 |
}
|
|
|
103 |
|
|
|
104 |
public function verifierParametre($parametre, $valeursPermises) {
|
|
|
105 |
if (isset($this->parametres[$parametre]) && !empty($this->parametres[$parametre])) {
|
|
|
106 |
$valeur = $this->parametres[$parametre];
|
|
|
107 |
$this->verifierValeursPermises($parametre, $valeur, $valeursPermises);
|
|
|
108 |
}
|
|
|
109 |
}
|
|
|
110 |
|
|
|
111 |
public function verifierParametreAvecValeurMultipe($parametre, $valeursPermises) {
|
|
|
112 |
if (isset($this->parametres[$parametre]) && !empty($this->parametres[$parametre])) {
|
|
|
113 |
$valeursConcatenees = $this->parametres[$parametre];
|
|
|
114 |
$valeurs = explode(',', $valeursConcatenees);
|
|
|
115 |
foreach ($valeurs as $valeur) {
|
|
|
116 |
$this->verifierValeursPermises($parametre, $valeur, $valeursPermises);
|
|
|
117 |
}
|
|
|
118 |
}
|
|
|
119 |
}
|
|
|
120 |
|
|
|
121 |
private function verifierValeursPermises($parametre, $valeur, $valeursPermises) {
|
|
|
122 |
if (!in_array($valeur, explode('|', $valeursPermises))) {
|
|
|
123 |
$this->erreursParametres[] = "Le paramètre '$parametre' ne peut pas prendre la valeur '$valeur'. Valeurs permises : $valeursPermises";
|
|
|
124 |
}
|
|
|
125 |
}
|
|
|
126 |
|
|
|
127 |
public function traiterParametresCommuns() {
|
|
|
128 |
|
|
|
129 |
}
|
|
|
130 |
|
|
|
131 |
public function ajouterFiltreMasque($nom_champ, $valeur) {
|
|
|
132 |
$valeur = explode(',',$valeur);
|
|
|
133 |
$conditions = array();
|
|
|
134 |
if ($nom_champ == 'annee' || $nom_champ == 'rang') {
|
|
|
135 |
foreach ($valeur as $val) {
|
|
|
136 |
$conditions[] = "$nom_champ = ".$this->getBdd()->proteger($val);
|
|
|
137 |
}
|
|
|
138 |
} else {
|
|
|
139 |
if ($this->parametres['recherche'] == 'etendue') {
|
|
|
140 |
foreach ($valeur as $val) {
|
|
|
141 |
$val = $this->modifierValeur($val);
|
|
|
142 |
$conditions[] = "$nom_champ LIKE ".$this->getBdd()->proteger($val);
|
|
|
143 |
}
|
| 657 |
jpm |
144 |
|
| 631 |
delphine |
145 |
} elseif ($this->parametres['recherche'] == 'floue') {
|
|
|
146 |
foreach ($valeur as $val) {
|
|
|
147 |
$val = $this->getBdd()->proteger($val);
|
|
|
148 |
$conditions[] = "( SOUNDEX($nom_champ) = SOUNDEX($val))".
|
|
|
149 |
" OR ( SOUNDEX(REVERSE($nom_champ)) = SOUNDEX(REVERSE($val)))";
|
|
|
150 |
}
|
|
|
151 |
} else {
|
|
|
152 |
foreach ($valeur as $val) {
|
|
|
153 |
$conditions[] = "$nom_champ LIKE ".$this->getBdd()->proteger($val);
|
|
|
154 |
}
|
|
|
155 |
}
|
|
|
156 |
}
|
|
|
157 |
$this->requete_condition[]= '('.implode(' OR ', $conditions ).')';
|
|
|
158 |
$this->masque[$nom_champ] = $nom_champ.'='.implode(',',$valeur);
|
|
|
159 |
}
|
|
|
160 |
|
|
|
161 |
private function modifierValeur($valeur) {
|
|
|
162 |
$valeur = $this->remplacerCaractereHybrideEtChimere($valeur);
|
|
|
163 |
$valeur = $this->preparerChainePourRechercheEtendue($valeur);
|
|
|
164 |
return $valeur;
|
|
|
165 |
}
|
|
|
166 |
|
|
|
167 |
private function remplacerCaractereHybrideEtChimere($valeur) {
|
|
|
168 |
$caracteres = array('×', '%D7', '+', '%2B');
|
|
|
169 |
$remplacements = array('x ','x ', '+', '+');
|
|
|
170 |
$valeur = str_replace($caracteres, $remplacements, $valeur);
|
|
|
171 |
return $valeur;
|
|
|
172 |
}
|
|
|
173 |
|
|
|
174 |
private function preparerChainePourRechercheEtendue($valeur) {
|
|
|
175 |
$valeur = str_replace(' ', '% ', trim($valeur));
|
|
|
176 |
$valeur = $valeur.'%';
|
|
|
177 |
return $valeur;
|
|
|
178 |
}
|
|
|
179 |
|
|
|
180 |
//+-------------------------------Fonctions d'analyse des ressources-------------------------------------+
|
|
|
181 |
|
|
|
182 |
private function etreRessourceId() {
|
|
|
183 |
$ok = false;
|
|
|
184 |
if ($this->estUnIdentifiant() && count($this->ressources) == 1) {
|
|
|
185 |
$ok = true;
|
|
|
186 |
}
|
|
|
187 |
return $ok;
|
|
|
188 |
}
|
|
|
189 |
|
|
|
190 |
public function traiterRessources() {
|
|
|
191 |
if (isset($this->ressources) && count($this->ressources) > 0) {
|
|
|
192 |
if ($this->ressources[0] == 'relations') {
|
| 994 |
mathias |
193 |
$this->traiterRessourceIdRelations();
|
| 631 |
delphine |
194 |
} elseif ($this->estUnIdentifiant()) { //l'identifiant peut etre de type /#id ou /nt:#id
|
|
|
195 |
$this->traiterRessourcesIdentifiant(); // dans le service noms ou taxons
|
|
|
196 |
} elseif ($this->ressources[0] == 'stats') { //ressource = noms/stats
|
|
|
197 |
$this->traiterRessourcesStats();
|
|
|
198 |
} else {
|
|
|
199 |
$e = 'Erreur dans votre requete </br> Ressources disponibles : <br/>
|
|
|
200 |
<li> /'.$this->service.'/#id (id : L\'identifiant du nom rechercher)</li>
|
|
|
201 |
<li> /'.$this->service.'/nt:#id (id : Numero du taxon recherche)</li>
|
|
|
202 |
<li> /'.$this->service.'/stats </li>';
|
|
|
203 |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
|
|
|
204 |
}
|
|
|
205 |
}
|
|
|
206 |
}
|
|
|
207 |
|
|
|
208 |
public function traiterRessourcesStats() {
|
|
|
209 |
$this->format_reponse = $this->service.'/stats';
|
|
|
210 |
|
|
|
211 |
$e = "Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : $this->service/stats/[annees|rangs|initiales]";
|
|
|
212 |
if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {
|
|
|
213 |
switch ($this->ressources[1]) {
|
|
|
214 |
case 'annees' :
|
|
|
215 |
$this->traiterRessourceStatsAnnees();
|
|
|
216 |
break;
|
|
|
217 |
case 'rangs' :
|
|
|
218 |
$this->traiterRessourceStatsRangs();
|
|
|
219 |
break;
|
|
|
220 |
case 'initiales' :
|
|
|
221 |
$this->traiterRessourceStatsInitiales();
|
|
|
222 |
break;
|
|
|
223 |
default :
|
|
|
224 |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
|
|
|
225 |
break;
|
|
|
226 |
}
|
|
|
227 |
} else {
|
|
|
228 |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
|
|
|
229 |
}
|
|
|
230 |
}
|
|
|
231 |
|
|
|
232 |
/** Vérifie si la première valeur de la table de ressource est un identifiant :
|
|
|
233 |
* un numerique ou un numéro taxonomique sous la forme nt:xx */
|
|
|
234 |
public function estUnIdentifiant() {
|
|
|
235 |
return (is_numeric($this->ressources[0]) || (strrpos($this->ressources[0],'nt:') !== false
|
|
|
236 |
&& is_numeric(str_replace('nt:','',$this->ressources[0]))));
|
|
|
237 |
}
|
|
|
238 |
|
|
|
239 |
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
|
|
|
240 |
// Fonction d'analyse des parametres
|
|
|
241 |
|
|
|
242 |
/** Permet de remplir le tableau compo_nom. Il comprendra en fct du paramètre ns.structure les éléments à rajouter
|
|
|
243 |
* au nom_sci (annee, auteur, biblio ou addendum). */
|
|
|
244 |
public function remplirTableCompositionNom($valeur) {
|
|
|
245 |
$structure_nom = explode(',', $valeur);
|
|
|
246 |
foreach ($structure_nom as $structure) {
|
| 657 |
jpm |
247 |
$structure = trim($structure);
|
|
|
248 |
$patterns = array('/^an$/', '/^au$/', '/^bib$/', '/^ad$/', '/^sp$/', '/^gen$/', '/^ssp$/','/^fam$/',
|
|
|
249 |
'/^au_ss$/','/^bib_ss$/');
|
|
|
250 |
$champs = array('annee', 'auteur', 'biblio_origine', 'nom_addendum', 'epithete_sp', 'genre',
|
|
|
251 |
'epithete_infra_sp','famille','auteur', 'biblio_origine');
|
|
|
252 |
|
|
|
253 |
// avec str_replace() 'sp' est inclu dans 'ssp', et la conversion pour 'ssp' est mauvaise
|
|
|
254 |
$this->compo_nom[$structure] = preg_replace($patterns, $champs, $structure);
|
|
|
255 |
}
|
| 631 |
delphine |
256 |
}
|
|
|
257 |
|
|
|
258 |
public function mettreAuFormat() {
|
|
|
259 |
if ($this->parametres['ns.format'] == 'htm') {
|
|
|
260 |
if (strrpos($this->requete_champ, 'nom_sci_html as nom_sci') === false) {
|
|
|
261 |
$this->requete_champ = str_replace('nom_sci', 'nom_sci_html as nom_sci', $this->requete_champ);
|
|
|
262 |
}
|
|
|
263 |
}
|
|
|
264 |
}
|
|
|
265 |
|
|
|
266 |
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
|
|
|
267 |
// Fonctions de formatage
|
|
|
268 |
|
|
|
269 |
/** Fonction permettant de creer la table dont le nom est passé en paramètre (champs_api, champs_bdtfx,
|
|
|
270 |
* correspondance_champs...). Les données de chaque table sont présentes dans le fichier de configuration config.ini
|
|
|
271 |
* @param String $table : Peut contenir plusieurs nom de table dont on souhaite récupérer les données : table,table,table. */
|
|
|
272 |
public function recupererTableSignification($table) {
|
|
|
273 |
$tables = explode(',', $table);
|
|
|
274 |
foreach ($tables as $tab) {
|
|
|
275 |
if ($tab == 'champs_comp') {
|
|
|
276 |
$champ_bdnff_api = array_keys($this->champs_api); //on recupère le nom des champ ds la bdd
|
|
|
277 |
$this->champs_comp = array_diff($this->champs_table, $champ_bdnff_api);
|
|
|
278 |
} elseif ($tab == 'champs_api') {
|
|
|
279 |
foreach ($this->correspondance_champs as $key => $val) {
|
|
|
280 |
preg_match('/(hybride[.]parent_0[12](?:[.]notes)?|nom_sci[.][^.]+|[^.]+)(?:[.](id|code))?/', $val, $match);
|
|
|
281 |
$val = $match[1];
|
|
|
282 |
$this->champs_api[$key] = $val;
|
|
|
283 |
}
|
|
|
284 |
} else {
|
|
|
285 |
$this->$tab = $this->recupererTableauConfig($tab);
|
|
|
286 |
}
|
|
|
287 |
}
|
|
|
288 |
}
|
|
|
289 |
|
|
|
290 |
public function formaterEnOss($resultat) {
|
|
|
291 |
$table_nom = array();
|
|
|
292 |
$oss = '';
|
|
|
293 |
foreach ($resultat as $tab) {
|
|
|
294 |
if (isset($tab['nom_sci']) ) {
|
|
|
295 |
if (!in_array($tab['nom_sci'], $table_nom)) {
|
|
|
296 |
$table_nom[] = $tab['nom_sci'];
|
|
|
297 |
$oss[] = $tab['nom_sci'].' '.$this->ajouterCompositionNom($tab);
|
|
|
298 |
}
|
|
|
299 |
}else {
|
|
|
300 |
$res = $this->ajouterCompositionNom($tab);
|
|
|
301 |
if($res) {
|
|
|
302 |
$oss[] = $res;
|
|
|
303 |
}
|
|
|
304 |
}
|
| 657 |
jpm |
305 |
|
| 631 |
delphine |
306 |
}
|
| 657 |
jpm |
307 |
|
| 631 |
delphine |
308 |
if (isset($this->masque)) $masque = implode('&', $this->masque);
|
|
|
309 |
else $masque = 'Pas de masque';
|
|
|
310 |
$table_retour_oss = array($masque, $oss);
|
|
|
311 |
return $table_retour_oss;
|
|
|
312 |
}
|
|
|
313 |
|
|
|
314 |
public function afficherEnteteResultat($url_service) {
|
|
|
315 |
$this->table_retour['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
|
|
|
316 |
$this->table_retour['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
|
|
|
317 |
$this->table_retour['total'] = $this->total_resultat;
|
|
|
318 |
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, $url_service);
|
|
|
319 |
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') {
|
|
|
320 |
$this->table_retour['href.precedent'] = $url['precedent'];
|
|
|
321 |
}
|
|
|
322 |
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') {
|
|
|
323 |
$this->table_retour['href.suivant'] = $url['suivant'];
|
|
|
324 |
}
|
|
|
325 |
}
|
|
|
326 |
|
|
|
327 |
public function afficherNomHrefRetenu($tab, $num) {
|
|
|
328 |
$this->resultat_req = $tab;
|
|
|
329 |
$this->afficherDonnees('num_nom', $num);
|
|
|
330 |
if ($this->parametres['retour.format'] == 'min') { // sinon est affiché ds afficherDonnees(num_nom, $val) ci-dessus
|
|
|
331 |
$this->table_retour['nom_sci'] = $tab['nom_sci'];
|
|
|
332 |
$this->table_retour['nom_sci_complet'] = $tab['nom_sci'].' '.$this->ajouterCompositionNom($tab);
|
|
|
333 |
}
|
|
|
334 |
if ($tab['num_nom_retenu'] != '') {
|
|
|
335 |
$retenu = ($tab['num_nom_retenu'] == $num) ? 'true' : 'false';
|
|
|
336 |
} else {
|
|
|
337 |
$retenu = 'absent';
|
|
|
338 |
}
|
|
|
339 |
$this->table_retour['retenu'] = $retenu;
|
|
|
340 |
unset($this->table_retour['id']);
|
|
|
341 |
}
|
|
|
342 |
|
|
|
343 |
|
|
|
344 |
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
|
|
|
345 |
// Fonction de formatage pour les services /#id/
|
|
|
346 |
|
|
|
347 |
public function formaterId($resultat) {
|
|
|
348 |
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
|
|
|
349 |
$this->resultat_req = $resultat;
|
|
|
350 |
|
|
|
351 |
foreach ($resultat as $cle => $valeur) {
|
|
|
352 |
if ($valeur != '') {
|
|
|
353 |
$this->afficherDonnees($cle, $valeur);
|
|
|
354 |
}
|
|
|
355 |
}
|
|
|
356 |
if (isset($this->parametres['retour.champs']) && $this->format_reponse == 'noms/id') {
|
|
|
357 |
$retour = $this->table_retour;
|
|
|
358 |
$this->table_retour = array();
|
|
|
359 |
$champs = explode(',', $this->parametres['retour.champs']);
|
|
|
360 |
$this->ajouterChampsPersonnalises($champs, $retour);
|
|
|
361 |
}
|
|
|
362 |
unset($this->table_retour['href']);
|
|
|
363 |
return $this->table_retour;
|
|
|
364 |
}
|
|
|
365 |
|
|
|
366 |
public function formaterIdChamp($resultat) {
|
|
|
367 |
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
|
|
|
368 |
$reponse_id = $this->formaterId($resultat);
|
|
|
369 |
$this->table_retour = array();
|
|
|
370 |
$champs = explode(' ', $this->ressources[1]);
|
|
|
371 |
$this->ajouterChampsPersonnalises($champs, $reponse_id);
|
|
|
372 |
return $this->table_retour;
|
|
|
373 |
}
|
|
|
374 |
|
|
|
375 |
protected function ajouterChampsPersonnalises($champs, $reponse_id) {
|
|
|
376 |
$champs_a_libeller = array('nom_retenu', 'rang', 'basionyme', 'hybride', 'hybride.parent_01',
|
|
|
377 |
'hybride.parent_02', 'presence', 'tax_sup', 'statut_origine', 'statut_culture', 'statut_introduction');
|
|
|
378 |
if (! is_null($champs) && is_array($champs) && count($champs) > 0) {
|
|
|
379 |
foreach ($champs as $champ) {
|
|
|
380 |
if ($this->verifierValiditeChamp($champ)) {
|
|
|
381 |
if (strrpos($champ, '.*') !== false) {
|
|
|
382 |
$this->afficherPointEtoile($champ, $reponse_id);
|
|
|
383 |
} elseif (in_array($champ, $champs_a_libeller)) {
|
| 657 |
jpm |
384 |
$this->table_retour[$champ.'.libelle'] =
|
| 631 |
delphine |
385 |
(isset($reponse_id[$champ.'.libelle'])) ? $reponse_id[$champ.'.libelle'] : null;
|
|
|
386 |
} else {
|
|
|
387 |
$champ = $this->trouverChampBddCorrespondant($champ);
|
|
|
388 |
$this->table_retour[$champ] = (isset($reponse_id[$champ])) ? $reponse_id[$champ] : null;
|
|
|
389 |
}
|
|
|
390 |
}
|
|
|
391 |
}
|
|
|
392 |
}
|
|
|
393 |
}
|
|
|
394 |
|
|
|
395 |
public function afficherPointEtoile($champ, $reponse) {
|
|
|
396 |
preg_match('/^([^.]+\.)\*$/', $champ, $match);
|
|
|
397 |
if ($match[1] == 'nom_sci') {
|
|
|
398 |
$this->afficherNomSciPointEpithete($this->resultat_req);
|
|
|
399 |
} else {
|
|
|
400 |
foreach ($reponse as $chp => $valeur) {
|
|
|
401 |
if (strrpos($chp, $match[1]) !== false) {
|
|
|
402 |
if ($valeur != '') {
|
|
|
403 |
$this->table_retour[$chp] = $valeur;
|
|
|
404 |
} else {
|
|
|
405 |
$this->table_retour[$chp] = null;
|
|
|
406 |
}
|
|
|
407 |
}
|
|
|
408 |
}
|
|
|
409 |
}
|
|
|
410 |
}
|
|
|
411 |
|
|
|
412 |
public function decomposerNomChamp($champ) {
|
|
|
413 |
$decomposition = false;
|
|
|
414 |
if (preg_match('/^(?:([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+))(?:\.(.+))?$/', $champ, $match)) {
|
|
|
415 |
$radical_champ = $match[1];
|
|
|
416 |
$suffixe = (isset($match[2])) ? $match[2] : "";
|
|
|
417 |
$decomposition = array($radical_champ, $suffixe);
|
|
|
418 |
}
|
|
|
419 |
return $decomposition;
|
|
|
420 |
}
|
|
|
421 |
|
|
|
422 |
public function verifierValiditeChamp($champ) {
|
|
|
423 |
$decomposition = $this->decomposerNomChamp($champ);
|
|
|
424 |
$validite_ressource = true;
|
|
|
425 |
if ($decomposition) {
|
|
|
426 |
list($radical, $suffixe) = $decomposition;
|
|
|
427 |
$champs_complementaire = array('nom_retenu_complet', 'basionyme_complet');
|
|
|
428 |
// on verifie si le nom du champ existe bien
|
|
|
429 |
if (!$this->estChampApi($radical) && !$this->estChampComplementaire($radical)) {
|
|
|
430 |
if (!in_array($radical, $champs_complementaire)) {
|
|
|
431 |
$validite_ressource = false;
|
|
|
432 |
$e = 'Le champ "'.$radical.'" n\'existe pas dans la base. <br/><br/>';
|
|
|
433 |
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
|
|
|
434 |
}
|
|
|
435 |
} elseif ($this->estUnPoint($champ)) {
|
|
|
436 |
$validite_ressource = $this->verifierValiditeSuffixe($suffixe, $radical);
|
|
|
437 |
}
|
|
|
438 |
}
|
|
|
439 |
return $validite_ressource;
|
|
|
440 |
}
|
|
|
441 |
|
|
|
442 |
public function estChampApi($radical_champ) {
|
|
|
443 |
$champ_api_ok = false;
|
|
|
444 |
if (in_array($radical_champ, $this->champs_api) || in_array($radical_champ, $this->correspondance_champs)) {
|
|
|
445 |
$champ_api_ok = true;
|
|
|
446 |
}
|
|
|
447 |
return $champ_api_ok;
|
|
|
448 |
}
|
|
|
449 |
|
|
|
450 |
public function estChampComplementaire($radical_champ) {
|
|
|
451 |
$champ_complementaire_ok = in_array($radical_champ, $this->champs_comp) ? true : false;
|
|
|
452 |
return $champ_complementaire_ok;
|
|
|
453 |
}
|
|
|
454 |
|
|
|
455 |
public function verifierValiditeSuffixe($suffixe, $radical_champ) {
|
|
|
456 |
$validite_ressource = true;
|
|
|
457 |
if ($this->correspondAUnId($radical_champ) || $radical_champ == 'id') {
|
|
|
458 |
$this->verificationSuffixesIdentifiant($suffixe, $radical_champ, $validite_ressource);
|
|
|
459 |
} elseif ($this->correspondAUnCode($radical_champ)) {
|
|
|
460 |
$this->verificationSuffixesCodes($suffixe, $radical_champ, $validite_ressource);
|
|
|
461 |
} elseif ($radical_champ == 'nom_sci') {
|
|
|
462 |
if ($suffixe != '*') {
|
|
|
463 |
$validite_ressource = false;
|
|
|
464 |
$m = 'Erreur : Le suffixe demandé n\'existe pas pour le champ "'.$radical_champ.'".<br/>
|
|
|
465 |
Les suffixes possibles sont les suivants : <li> * </li>';
|
|
|
466 |
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $m);
|
|
|
467 |
}
|
|
|
468 |
} else {
|
|
|
469 |
$validite_ressource = false;
|
|
|
470 |
$m = 'Erreur : Le paramètre "'.$radical_champ.'" ne peut pas présenter de suffixe. <br/><br/>';
|
|
|
471 |
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $m);
|
|
|
472 |
}
|
|
|
473 |
return $validite_ressource;
|
|
|
474 |
}
|
|
|
475 |
|
|
|
476 |
public function verificationSuffixesCodes(&$suffixe, &$radical_champ, &$validite_ressource ) {
|
|
|
477 |
if (!in_array($suffixe, array('*', 'code', 'href', 'details'))) {
|
|
|
478 |
$validite_ressource = false;
|
|
|
479 |
$e = 'Erreur : Le suffixe demandé n\'existe pas pour le champ "'.$radical_champ.'.<br/> Les suffixes '
|
|
|
480 |
.'possibles sont les suivants : <li> .* </li><li> .code </li><li> .href </li><li> .details </li>';
|
|
|
481 |
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
|
|
|
482 |
}
|
|
|
483 |
}
|
|
|
484 |
|
|
|
485 |
public function verificationSuffixesIdentifiant(&$suffixe, &$radical_champ, &$validite_ressource) {
|
|
|
486 |
if ((strrpos($radical_champ, 'parent') !== false && !in_array($suffixe, array('*', 'id', 'href', 'details', 'notes')))
|
|
|
487 |
|| !in_array($suffixe, array('*', 'id', 'href', 'details')) && strrpos($radical_champ, 'parent') === false) {
|
|
|
488 |
$validite_ressource = false;
|
|
|
489 |
$e = 'Erreur : Le suffixe demandé n\'existe pas pour le champ "'.$radical_champ.'".<br/> Les suffixes '
|
|
|
490 |
.'possibles sont les suivants : <li> .* </li><li> .id </li><li> .href </li><li> .details </li>'
|
|
|
491 |
.'<li> .notes (seulement pour les hybride.parent)';
|
|
|
492 |
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
|
|
|
493 |
}
|
|
|
494 |
}
|
|
|
495 |
|
|
|
496 |
|
|
|
497 |
//------------------------------fonction de formatage pour les services /stats/-----------------------------------------
|
|
|
498 |
|
|
|
499 |
public function formaterStatsAnnee($resultat) {
|
|
|
500 |
foreach ($resultat as $cle_annee) {
|
|
|
501 |
$annee = ($cle_annee['annee'] != '') ? $cle_annee['annee'] : 'ND';
|
|
|
502 |
$nb = $cle_annee['nombre'];
|
|
|
503 |
$retour_stats_annee[$annee] = $nb;
|
|
|
504 |
}
|
|
|
505 |
return $retour_stats_annee;
|
|
|
506 |
}
|
|
|
507 |
|
|
|
508 |
public function formaterStatsRang($resultat) {
|
|
|
509 |
foreach ($resultat as $rangs) {
|
|
|
510 |
if ($rangs['rang'] != 0) {
|
|
|
511 |
$rang = $rangs['rang'];
|
|
|
512 |
if ($this->parametres['retour.format'] == 'max') {
|
|
|
513 |
$retour_rang[$rang]['rang'] = $this->ajouterSignificationCode('rang',$rang);
|
|
|
514 |
}
|
|
|
515 |
$nombre = $rangs['nombre'];
|
|
|
516 |
$retour_rang[$rang]['nombre'] = $nombre;
|
|
|
517 |
}
|
|
|
518 |
}
|
|
|
519 |
return $retour_rang;
|
|
|
520 |
}
|
|
|
521 |
|
|
|
522 |
public function formaterStatsInitiales($resultat) {
|
|
|
523 |
$rang = null;
|
|
|
524 |
$table_rang = array();
|
|
|
525 |
foreach ($resultat as $tuple) {
|
|
|
526 |
if ($tuple['rang'] != 0) {
|
|
|
527 |
$this->memoriserRang($table_rang, $tuple, $rang);
|
|
|
528 |
if ($tuple['lettre'] == 'x ') {
|
|
|
529 |
$this->ajouterHybrideChimere('hybride', $rang, $tuple);
|
|
|
530 |
} elseif ($tuple['lettre'] == '+ ') {
|
|
|
531 |
$this->ajouterHybrideChimere('chimere', $rang, $tuple);
|
|
|
532 |
} else {
|
|
|
533 |
$l = substr($tuple['lettre'], 0, 1);
|
|
|
534 |
if (isset($this->table_retour[$rang][$l])) {
|
|
|
535 |
$this->table_retour[$rang][substr($tuple['lettre'], 0, 1)] += floatval($tuple['nb']);
|
|
|
536 |
} else {
|
|
|
537 |
$this->table_retour[$rang][substr($tuple['lettre'], 0, 1)] = floatval($tuple['nb']);
|
|
|
538 |
}
|
|
|
539 |
}
|
|
|
540 |
}
|
|
|
541 |
}
|
|
|
542 |
return $this->table_retour;
|
|
|
543 |
}
|
|
|
544 |
|
|
|
545 |
public function memoriserRang(&$table_rang, $tuple, &$rang) {
|
|
|
546 |
if (is_array($table_rang)) {
|
|
|
547 |
if (!in_array($tuple['rang'], $table_rang)) {
|
|
|
548 |
$rang = $tuple['rang'];
|
|
|
549 |
$table_rang[] = $rang;
|
|
|
550 |
if ($this->parametres['retour.format'] == 'max') {
|
|
|
551 |
$rang = $this->ajouterSignificationCode('rang', $rang);
|
|
|
552 |
}
|
|
|
553 |
}
|
|
|
554 |
}
|
|
|
555 |
}
|
|
|
556 |
|
|
|
557 |
public function ajouterHybrideChimere($groupe, &$rang, &$tuple) {
|
|
|
558 |
if (isset($this->table_retour[$rang][str_replace('hybride', 'hyb', $groupe)])) {
|
|
|
559 |
$this->table_retour[$rang][$groupe] += floatval($tuple['nb']);
|
|
|
560 |
} else {
|
|
|
561 |
$this->table_retour[$rang][$groupe] = floatval($tuple['nb']);
|
|
|
562 |
}
|
|
|
563 |
}
|
|
|
564 |
|
|
|
565 |
//-----------------------------Fonctions d'affichage utiliser dans les fonctions de formatage---------------------------
|
|
|
566 |
|
|
|
567 |
public function afficherDonnees($champApi, $valeur) {
|
|
|
568 |
$champBdd = $this->trouverChampBddCorrespondant($champApi);
|
|
|
569 |
if ($this->parametres['retour.format'] == 'min') {
|
|
|
570 |
if ($champApi == 'nom_sci') {
|
|
|
571 |
$valeur = $valeur.' '.$this->ajouterCompositionNom($this->resultat_req);
|
|
|
572 |
}
|
|
|
573 |
if ($champApi == 'nom_sci_html') {
|
|
|
574 |
$valeur = $valeur.' '.$this->ajouterCompositionNom($this->resultat_req, 'htm');
|
|
|
575 |
}
|
|
|
576 |
$this->table_retour[$champBdd] = $valeur;
|
|
|
577 |
} else {
|
|
|
578 |
$this->afficherToutesLesInfos($champBdd, $valeur);
|
|
|
579 |
}
|
|
|
580 |
}
|
|
|
581 |
|
|
|
582 |
public function trouverChampBddCorrespondant($champApi) {
|
|
|
583 |
if (array_key_exists($champApi, $this->champs_api)) {
|
|
|
584 |
$champBdd = $this->correspondance_champs[$champApi];
|
|
|
585 |
} else {
|
|
|
586 |
$champBdd = $champApi;
|
|
|
587 |
}
|
|
|
588 |
return $champBdd;
|
|
|
589 |
}
|
|
|
590 |
|
|
|
591 |
public function afficherToutesLesInfos($nom_champ_api, $valeur) {
|
|
|
592 |
if ($this->presentePlusieursId($nom_champ_api, $valeur)) {
|
|
|
593 |
preg_match('/^([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+)(?:\.id)?$/', $nom_champ_api, $match);
|
|
|
594 |
$this->afficherInfosPrecises($match[1], 'details', $valeur);
|
|
|
595 |
$this->table_retour[$nom_champ_api] = $valeur;
|
|
|
596 |
|
|
|
597 |
} elseif (strrpos($nom_champ_api, 'parent') !== false && strrpos($nom_champ_api, 'notes') !== false) {
|
|
|
598 |
$this->table_retour[$nom_champ_api] = $valeur;
|
|
|
599 |
|
|
|
600 |
} elseif (($this->correspondAUnId($nom_champ_api) || $nom_champ_api == 'id' && $valeur != '0')) {
|
|
|
601 |
preg_match('/^([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+)(?:\.id)?$/', $nom_champ_api, $match);
|
|
|
602 |
$this->afficherInfosPrecises($match[1], 'id,signification,href', $valeur);
|
|
|
603 |
|
|
|
604 |
} elseif ($this->correspondAUnCode($nom_champ_api)) {
|
|
|
605 |
preg_match('/^([^.]+)(?:\.code)?$/', $nom_champ_api, $match);
|
|
|
606 |
$this->afficherInfosPrecises($match[1], 'code,signification,href', $valeur);
|
|
|
607 |
|
|
|
608 |
} elseif ($nom_champ_api == 'nom_sci_html') {
|
|
|
609 |
$this->table_retour['nom_sci_html'] = $valeur;
|
|
|
610 |
$this->table_retour['nom_sci_html_complet'] = $valeur.' '.$this->ajouterCompositionNom($this->resultat_req, 'htm');
|
|
|
611 |
}elseif ($nom_champ_api != 'nom_sci') {
|
|
|
612 |
$this->table_retour[$nom_champ_api] = $valeur;
|
|
|
613 |
}
|
|
|
614 |
}
|
|
|
615 |
|
|
|
616 |
public function presentePlusieursId($ressource, $valeur = null) {
|
|
|
617 |
if ($valeur) {
|
|
|
618 |
$presente = strrpos($ressource, 'proparte') !== false && strrpos($valeur, ',') !== false;
|
|
|
619 |
} else { //pour la vérification du champ, on ignore alors la valeur de la ressource
|
|
|
620 |
$presente = strrpos($ressource, 'proparte') !== false;
|
|
|
621 |
}
|
|
|
622 |
return $presente;
|
|
|
623 |
}
|
|
|
624 |
|
|
|
625 |
public function afficherInfosPrecises($champ, $suffixe, $valeur) {
|
|
|
626 |
$suffixes = explode(',', $suffixe);
|
|
|
627 |
//on initialise au service appelé. Sera potentiellement modifié dans la fonction afficherSignification()
|
|
|
628 |
$this->service_href = $this->service;
|
|
|
629 |
foreach ($suffixes as $suffixe) {
|
|
|
630 |
switch ($suffixe) {
|
|
|
631 |
case 'id' :
|
|
|
632 |
$this->table_retour[str_replace('id.id', 'id', $champ.'.id')] = $valeur;
|
|
|
633 |
break;
|
|
|
634 |
case 'details' :
|
|
|
635 |
$this->afficherTableDetails($champ, $valeur);
|
|
|
636 |
break;
|
|
|
637 |
case 'signification' :
|
| 662 |
delphine |
638 |
$this->afficherSignification($champ, $valeur);
|
| 631 |
delphine |
639 |
break;
|
|
|
640 |
case 'href' :
|
|
|
641 |
$url = $this->creerUrl($champ, $valeur);
|
|
|
642 |
$this->table_retour[str_replace('id.href', 'href', $champ.'.href')] = $url;
|
|
|
643 |
break;
|
|
|
644 |
case 'code' :
|
|
|
645 |
$this->table_retour[$champ.'.code'] = $this->obtenirCode($champ, $valeur);
|
|
|
646 |
break;
|
|
|
647 |
case 'notes' :
|
|
|
648 |
$this->table_retour[$champ.'.notes'] = $this->resultat_req[str_replace('.', '_', $champ).'_notes'];
|
|
|
649 |
break;
|
|
|
650 |
default : break;
|
|
|
651 |
}
|
|
|
652 |
}
|
|
|
653 |
}
|
|
|
654 |
|
|
|
655 |
public function afficherTableDetails($nom_champ_api, $valeur) {
|
|
|
656 |
$tab_id = explode(',', $valeur);
|
|
|
657 |
$tab_res = $this->table_retour;
|
|
|
658 |
$this->table_retour = array();
|
|
|
659 |
foreach ($tab_id as $id) {
|
|
|
660 |
$this->afficherInfosPrecises($nom_champ_api, 'id,signification,href', $id);
|
|
|
661 |
$tab_res[$nom_champ_api.'.details'][] = $this->table_retour;
|
|
|
662 |
$this->table_retour = array();
|
|
|
663 |
}
|
|
|
664 |
$this->table_retour = $tab_res;
|
|
|
665 |
}
|
|
|
666 |
|
|
|
667 |
private function obtenirCode($champ, $valeur) {
|
|
|
668 |
$code = $this->transformerChampEnCode($champ);
|
|
|
669 |
return "bdnt.$code:$valeur";
|
|
|
670 |
}
|
|
|
671 |
|
|
|
672 |
private function transformerChampEnCode($champ) {
|
|
|
673 |
if (is_null($this->relationsChampsCodesOntologie)) {
|
|
|
674 |
$this->relationsChampsCodesOntologie = Outils::recupererTableauConfig('ChampsCodesOntologie');
|
|
|
675 |
}
|
|
|
676 |
|
|
|
677 |
$code = $champ;
|
|
|
678 |
if (array_key_exists($champ, $this->relationsChampsCodesOntologie)) {
|
|
|
679 |
$code = $this->relationsChampsCodesOntologie[$champ];
|
|
|
680 |
}
|
|
|
681 |
return $code;
|
|
|
682 |
}
|
|
|
683 |
|
|
|
684 |
public function creerUrl($champ, $valeur) {
|
|
|
685 |
if ($this->correspondAUnId($champ) || $champ == 'id') {
|
|
|
686 |
$service = $this->service_href;
|
|
|
687 |
$url = $this->ajouterHref($service, $valeur);
|
|
|
688 |
} else {
|
|
|
689 |
$code = $this->transformerChampEnCode($champ);
|
|
|
690 |
$url = $this->ajouterHrefAutreProjet('ontologies', "$code:", $valeur, 'bdnt');
|
|
|
691 |
}
|
|
|
692 |
return $url;
|
|
|
693 |
}
|
|
|
694 |
|
|
|
695 |
public function afficherSignification($champ, $valeur) {
|
|
|
696 |
if ($champ == 'id' && isset($this->resultat_req['nom_sci']) && $this->resultat_req['num_nom'] == $valeur) {
|
|
|
697 |
//si le nom_sci du num_nom que l'on veut afficher est déjà dans la table de résultat :
|
|
|
698 |
$this->table_retour['nom_sci'] = $this->resultat_req['nom_sci'];
|
|
|
699 |
$this->table_retour['nom_sci_complet'] = $this->resultat_req['nom_sci'].' '.
|
|
|
700 |
$this->ajouterCompositionNom($this->resultat_req);
|
|
|
701 |
} elseif ($this->correspondAUnId($champ) || $champ == 'id') {
|
|
|
702 |
$nom = $this->recupererNomSci($valeur);
|
|
|
703 |
if ($nom != array()) {
|
|
|
704 |
$this->table_retour[$champ.'.libelle'] = $nom['nom_sci'];
|
|
|
705 |
$this->table_retour[$champ.'_html'] = $nom['nom_sci_html'];
|
|
|
706 |
$this->table_retour[$champ.'_complet'] = $nom['nom_sci_complet'];
|
|
|
707 |
$this->table_retour[$champ.'_html_complet'] = $nom['nom_sci_complet_html'];
|
|
|
708 |
$this->service_href = $nom['service'];
|
|
|
709 |
}
|
|
|
710 |
} elseif ($this->correspondAUnCode($champ)) {
|
|
|
711 |
$this->table_retour[$champ.'.libelle'] = $this->ajouterSignificationCode($champ, $valeur);
|
|
|
712 |
}
|
|
|
713 |
}
|
|
|
714 |
|
|
|
715 |
/** Permet d'afficher les élements nomenclatural du nom_sci lors de l'appel dans le service noms/id/champ du champ^nom_sci.*/
|
|
|
716 |
public function afficherNomSciPointEpithete($resultat) {
|
|
|
717 |
$tab_nom_sci = array('nom_supra_generique', 'genre', 'epithete_infra_generique', 'epithete_sp',
|
|
|
718 |
'type_epithete', 'epithete_infra_sp', 'cultivar_groupe', 'cultivar', 'nom_commercial');
|
|
|
719 |
foreach ($tab_nom_sci as $compo_nom) {
|
|
|
720 |
if (isset($resultat[$compo_nom]) && !empty($resultat[$compo_nom])) {
|
|
|
721 |
$this->table_retour['nom_sci.'.$compo_nom] = $resultat[$compo_nom];
|
|
|
722 |
}
|
|
|
723 |
}
|
|
|
724 |
}
|
|
|
725 |
|
|
|
726 |
public function ajouterSignificationCode($champ, $valeur) {
|
| 662 |
delphine |
727 |
if($this->termeOntologieEstEnCache($champ, $valeur)) {
|
|
|
728 |
$nom_code = $this->obtenirTermeOntologieParCache($champ, $valeur);
|
| 657 |
jpm |
729 |
} else {
|
| 662 |
delphine |
730 |
$code = $this->transformerChampEnCode($champ);
|
|
|
731 |
if (preg_match('/^([^_-]+)(?:_|-)([^_-]+)$/', $code, $match)) {
|
|
|
732 |
$code = $match[1].ucfirst($match[2]);
|
| 631 |
delphine |
733 |
}
|
| 662 |
delphine |
734 |
$url = Config::get('url_ontologie').$code.':'.$valeur.'/nom';
|
| 720 |
aurelien |
735 |
try {
|
|
|
736 |
$res = $this->consulterHref($url); //dans commun.php
|
|
|
737 |
$nom_code = $valeur;
|
|
|
738 |
if (is_object($res)) {
|
|
|
739 |
$nom_code = $res->nom;
|
|
|
740 |
}
|
|
|
741 |
$this->mettreEnCacheOntologie($champ, $valeur, $nom_code);
|
|
|
742 |
} catch (Exception $e) {
|
|
|
743 |
$nom_code = '';
|
| 631 |
delphine |
744 |
}
|
|
|
745 |
}
|
|
|
746 |
return $nom_code;
|
|
|
747 |
}
|
|
|
748 |
|
|
|
749 |
public function recupererNomSci($id) {
|
|
|
750 |
$nom = array();
|
|
|
751 |
if ($id != 0) {
|
|
|
752 |
if ($this->compo_nom == null) {
|
|
|
753 |
$req = 'SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html FROM '.$this->table.' WHERE num_nom = '.$id;
|
|
|
754 |
} else { //on ajoute à la requete sql, les champs de ns.structure
|
|
|
755 |
//print_r($this->compo_nom);
|
|
|
756 |
$req = 'SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html, '.implode(', ', $this->compo_nom)
|
|
|
757 |
.' FROM '.$this->table
|
|
|
758 |
.' WHERE num_nom = '.$id;
|
|
|
759 |
}
|
|
|
760 |
if ($this->parametres['ns.format'] == 'htm') {
|
|
|
761 |
$req = str_replace('nom_sci', 'nom_sci_html as nom_sci', $req);
|
|
|
762 |
}
|
|
|
763 |
$res = $this->getBdd()->recuperer($req);
|
|
|
764 |
if ($res) {
|
|
|
765 |
$nom['nom_sci'] = $res['nom_sci'];
|
|
|
766 |
$nom['nom_sci_html'] = $res['nom_sci_html'];
|
|
|
767 |
$nom['nom_sci_complet'] = $res['nom_sci'].' '.$this->ajouterCompositionNom($res);
|
|
|
768 |
$nom['nom_sci_complet_html'] = $res['nom_sci_html'].' '.$this->ajouterCompositionNom($res, 'htm');
|
|
|
769 |
$nom['service'] = ($res['num_nom_retenu'] == $id && $this->service == 'taxons') ? 'taxons' : 'noms';
|
|
|
770 |
}
|
|
|
771 |
}
|
|
|
772 |
return $nom;
|
|
|
773 |
}
|
|
|
774 |
|
|
|
775 |
/** Permet de retourner une chaine de caractère composée des parametres du nom (ns.structure : annnée, auteur,
|
|
|
776 |
* bibilio et addendum). A ajouter au nom scientifique */
|
|
|
777 |
public function ajouterCompositionNom($tab_res, $format = '') {
|
|
|
778 |
$format = ($format == '') ? $this->parametres['ns.format'] : $format;
|
|
|
779 |
|
|
|
780 |
$nom = '';
|
|
|
781 |
if (isset($this->compo_nom)) {
|
|
|
782 |
if ($format == 'htm') {
|
|
|
783 |
$format = array(
|
|
|
784 |
'au' => '<span class="auteur">%s</span>',
|
|
|
785 |
'an' => '[<span class="annee">%s</span>]',
|
|
|
786 |
'an_bib' => '[<span class="annee">%s</span>, <span class="biblio">%s</span>]',
|
|
|
787 |
'bib' => '[<span class="biblio">%s</span>]',
|
|
|
788 |
'ad' => '[<span class="adendum">%s</span>]');
|
|
|
789 |
} else {
|
|
|
790 |
$format = array(
|
|
|
791 |
'au' => '%s',
|
|
|
792 |
'an' => '[%s]',
|
|
|
793 |
'an_bib' => '[%s, %s]',
|
|
|
794 |
'bib' => '[%s]',
|
|
|
795 |
'ad' => '[%s]',
|
|
|
796 |
'gen' => '%s',
|
|
|
797 |
'sp' => '%s',
|
|
|
798 |
'ssp' => '%s',
|
|
|
799 |
'fam' => '%s',
|
|
|
800 |
'au_ss' => '%s',
|
|
|
801 |
'bib_ss' => '%s');
|
|
|
802 |
}
|
|
|
803 |
$compo_nom = array();
|
|
|
804 |
|
|
|
805 |
foreach ($this->compo_nom as $key => $champ) {
|
|
|
806 |
if (isset($tab_res[$champ]) && !empty($tab_res[$champ])) {
|
|
|
807 |
$compo_nom[$key] = $tab_res[$champ];
|
|
|
808 |
}
|
|
|
809 |
}
|
|
|
810 |
$nom_complet = $this->formerNomComplet($compo_nom, $format);
|
|
|
811 |
$nom = implode(' ', $nom_complet);
|
|
|
812 |
}
|
|
|
813 |
return rtrim($nom, ' ');
|
|
|
814 |
}
|
|
|
815 |
|
|
|
816 |
|
|
|
817 |
public function formerNomComplet($compo_nom, $format) {
|
|
|
818 |
$nom_complet = array();
|
|
|
819 |
extract($compo_nom);
|
|
|
820 |
if (isset($au)) $nom_complet[] = sprintf($format['au'], $au);
|
|
|
821 |
if (isset($an)) {
|
|
|
822 |
if (isset($bib)) {
|
|
|
823 |
$nom_complet[] = sprintf($format['an_bib'], $an, $bib);
|
|
|
824 |
} else {
|
|
|
825 |
$nom_complet[] = sprintf($format['an'], $an);
|
|
|
826 |
}
|
|
|
827 |
} elseif (isset($bib)) {
|
|
|
828 |
$nom_complet[] = sprintf($format['bib'], $bib);
|
|
|
829 |
}
|
|
|
830 |
if (isset($ad)) $nom_complet[] = sprintf($format['ad'], $ad);
|
|
|
831 |
if (isset($gen)) $nom_complet[] = sprintf($format['gen'], $gen);
|
|
|
832 |
if (isset($ssp)) $nom_complet[] = sprintf($format['ssp'], $ssp);
|
|
|
833 |
if (isset($sp)) $nom_complet[] = sprintf($format['sp'], $sp);
|
|
|
834 |
if (isset($fam)) $nom_complet[] = sprintf($format['fam'], $fam);
|
|
|
835 |
if (isset($au_ss)) $nom_complet[] = sprintf($format['au_ss'], $au_ss);
|
|
|
836 |
if (isset($bib_ss)) {
|
|
|
837 |
$bibl = $this->tronquerBiblio($bib_ss);
|
|
|
838 |
//simule un 'select distinct' sur les biblio tronquées
|
| 657 |
jpm |
839 |
if (!isset($this->bib_traitees[$bibl])) {
|
| 631 |
delphine |
840 |
$nom_complet[] = sprintf($format['bib_ss'],$bibl );
|
|
|
841 |
$this->bib_traitees[$bibl] = 1;
|
|
|
842 |
}
|
|
|
843 |
}
|
|
|
844 |
return $nom_complet;
|
|
|
845 |
}
|
|
|
846 |
|
|
|
847 |
public function tronquerBiblio($valeur){
|
|
|
848 |
$bib = '';
|
|
|
849 |
if(strpos($valeur,',') !== false) {
|
|
|
850 |
$bib = explode(',',$valeur);
|
|
|
851 |
}
|
|
|
852 |
if(strpos($bib[0],';') !== false) {
|
| 657 |
jpm |
853 |
|
| 631 |
delphine |
854 |
$bib[0] = strstr($bib[0],';');
|
|
|
855 |
$bib[0] = str_replace('; ','',$bib[0]);
|
|
|
856 |
}
|
|
|
857 |
return $bib[0];
|
|
|
858 |
}
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859 |
|
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|
860 |
|
| 657 |
jpm |
861 |
|
| 631 |
delphine |
862 |
public function correspondAUnCode($key) {
|
|
|
863 |
return (strrpos($key, '.code') !== false) || (in_array($key.'.code', $this->correspondance_champs));
|
|
|
864 |
}
|
|
|
865 |
|
|
|
866 |
public function correspondAUnId($key) {
|
|
|
867 |
return (strrpos($key, '.id') !== false) || (in_array($key.'.id', $this->correspondance_champs));
|
|
|
868 |
}
|
|
|
869 |
|
|
|
870 |
public function estUnPoint($key) {
|
|
|
871 |
if (strrpos($key, 'hybride.parent') !== false) {
|
|
|
872 |
$key = str_replace('hybride.parent', 'hybride_parent', $key);
|
|
|
873 |
}
|
|
|
874 |
return (strrpos($key, '.') !== false);
|
|
|
875 |
}
|
|
|
876 |
|
|
|
877 |
public function recupererMasquePrincipal() {
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|
|
878 |
$masque = null;
|
|
|
879 |
$tab_masque = array(
|
|
|
880 |
'masque' => 'nom_sci',
|
|
|
881 |
'masque_sg' => 'nom_supra_generique',
|
|
|
882 |
'masque_gen' => 'genre',
|
|
|
883 |
'masque_sp' => 'epithete_sp',
|
|
|
884 |
'masque_ssp' => 'epithete_infra_sp',
|
|
|
885 |
'masque_au' => 'auteur',
|
|
|
886 |
'masque_an' => 'annee',
|
|
|
887 |
'masque_bib' => 'biblio_origine',
|
|
|
888 |
'masque_ad' => 'addendum',
|
|
|
889 |
'masque_rg' => 'rang');
|
|
|
890 |
$liste_masque = array();
|
|
|
891 |
|
|
|
892 |
if (isset($this->masque['num_nom'])) {
|
|
|
893 |
$liste_masque[] = $this->masque['num_nom'];
|
|
|
894 |
}
|
|
|
895 |
|
|
|
896 |
foreach ($tab_masque as $key => $filtre) {
|
|
|
897 |
if (isset($this->masque[$filtre])) {
|
|
|
898 |
if (!isset($masque) && !in_array($filtre, array('rang', 'annee'))) {
|
|
|
899 |
$masque = array($key, $filtre);
|
|
|
900 |
}
|
|
|
901 |
$liste_masque[] = $this->masque[$filtre];
|
|
|
902 |
}
|
|
|
903 |
}
|
|
|
904 |
$this->masque = $liste_masque;
|
|
|
905 |
return $masque;
|
|
|
906 |
}
|
| 657 |
jpm |
907 |
|
| 631 |
delphine |
908 |
private function mettreEnCacheOntologie($categorie, $valeur, $correspondance) {
|
|
|
909 |
if(!isset($this->ontologie[$categorie])) {
|
|
|
910 |
$this->ontologie[$categorie] = array();
|
|
|
911 |
}
|
|
|
912 |
if(!isset($this->ontologie[$categorie][$valeur])) {
|
|
|
913 |
$this->ontologie[$categorie][$valeur] = array();
|
|
|
914 |
}
|
|
|
915 |
$this->ontologie[$categorie][$valeur] = $correspondance;
|
|
|
916 |
}
|
| 657 |
jpm |
917 |
|
| 631 |
delphine |
918 |
private function termeOntologieEstEnCache($categorie, $valeur) {
|
|
|
919 |
return array_key_exists($categorie, $this->ontologie) && array_key_exists($valeur, $this->ontologie[$categorie]);
|
|
|
920 |
}
|
| 657 |
jpm |
921 |
|
| 631 |
delphine |
922 |
private function obtenirTermeOntologieParCache($categorie, $valeur) {
|
|
|
923 |
return $this->ontologie[$categorie][$valeur];
|
|
|
924 |
}
|
|
|
925 |
}
|
|
|
926 |
?>
|