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754 raphael 1
-- date d'observation dans le futur
2
UPDATE cel_obs SET date_observation = NULL WHERE date_observation > now();
3
-- cleanup
4
UPDATE cel_obs SET date_observation = NULL WHERE date_observation = '0000-00-00 00:00:00';
5
-- cleanup
6
UPDATE cel_obs SET latitude = NULL, longitude = NULL WHERE longitude = 0 and latitude = 0;
7
 
8
-- referentiels: 65800 NULL, 13000 ''
9
UPDATE cel_obs SET nom_referentiel = SUBSTRING_INDEX(nom_referentiel, ':', 1);
10
UPDATE cel_obs SET nom_referentiel = 'bdtfx' WHERE nom_referentiel IN ('bdtfx_v1','bdnff');
11
-- UPDATE cel_obs SET nom_referentiel = NULL where nom_referentiel = '';
12
 
13
 
14
/*
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Cleanup des observation ayant un nom_ret_nn à 0 (mais un nom_ret défini...):
16
En effet, on peut pour l'instant POSTer $nom_ret, d'où bien souvent nom_sel == nom_ret, cependant nom_ret_nn = 0
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(pas d'autodétection).
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Nous pourrions donc les nullifier sans remord, ... mais ...
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nom_ret == 0 est VALIDE (car bdtfx.num_nom_retenu == 0 est valide) [ 3800 nom_retenu "orphelins" de taxon ]
20
 
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1) créer un index pour les jointures:
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CREATE INDEX i_nom_ret ON bdtfx_v1_02 (`nom_sci`(8))
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2) regarder les num_nom_ret orphelins de taxon en BDTFX:
24
SELECT * FROM bdtfx_v1_02 WHERE num_nom_retenu = 0; # 3960
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3) regarder les num_nom_ret orphelins de taxon en BDTFX:
26
SELECT * FROM bdtxa_v1_00 WHERE num_nom_retenu = 0; # 0
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4) regarder les orphelins équivalents dans cel_obs:
28
SELECT date_observation, SUBSTRING(nom_sel, 1, 50), nom_ret_nn, nom_ret, b.nom_sci FROM cel_obs c LEFT JOIN tb_eflore.bdtfx_v1_02 b on (c.nom_ret = b.nom_sci) WHERE nom_ret_nn = 0; # 7740
29
 
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Donc ceux dont le nom_ret à été POSTé manuellement et qui matchent le nom_sci de BDTFX : on les conserve.
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Mais les autres, qui ont un nom_ret probablement erroné et un nom_ret_nn à 0, on NULLify les données censées être (correctement) autogénérées !
32
 
33
Cela concerne:
34
SELECT date_observation, SUBSTRING(nom_sel, 1, 50), nom_ret_nn, nom_ret, b.nom_sci FROM cel_obs c LEFT JOIN tb_eflore.bdtfx_v1_02 b on (c.nom_ret = b.nom_sci) WHERE nom_ret_nn = 0
35
 AND c.nom_ret != '' AND id_observation NOT IN ( SELECT id_observation FROM cel_obs c, tb_eflore.bdtfx_v1_02 b WHERE c.nom_ret = b.nom_sci AND c.nom_ret_nn = 0 );  # 960
36
*/
37
-- D'où la requête :
38
UPDATE cel_obs SET nom_sel_nn = NULL, nom_ret = NULL, nom_ret_nn = NULL, nt = NULL, famille = NULL WHERE id_observation IN
39
( SELECT id_observation FROM cel_obs c LEFT JOIN tb_eflore.bdtfx_v1_02 b on (c.nom_ret = b.nom_sci) WHERE nom_ret_nn = 0
40
 AND c.nom_ret != '' AND id_observation NOT IN ( SELECT id_observation FROM cel_obs c, tb_eflore.bdtfx_v1_02 b WHERE c.nom_ret = b.nom_sci AND c.nom_ret_nn = 0 ) );
41
 
42
-- TODO
43
-- UPDATE cel_obs SET nom_ret_nn = NULL WHERE nom_ret_nn = 0;
44
-- UPDATE cel_obs SET nom_sel_nn = NULL WHERE nom_sel_nn = 0;
45
 
46
/*
47
UPDATE cel_obs SET nom_sel = NULL, nom_sel_nn = NULL, nom_ret = NULL, nom_ret_nn = NULL, nt = NULL, famille = NULL,
48
	FROM cel_obs
49
	WHERE (nom_sel = '' OR nom_sel IS NULL) AND
50
	(
51
	(nom_ret IS NOT NULL AND nom_ret != '') OR
52
	(nom_ret_nn IS NOT NULL AND nom_ret_nn != 0 AND nom_ret_nn != '') OR
53
	(nt IS NOT NULL AND nt != 0 AND nt != '') OR
54
	(famille IS NOT NULL AND famille != '')
55
	)
56
*/
57