| New file |
|---|
| 0,0 → 1,264 |
|---|
| <?php |
| /** |
| * PHP Version 5 |
| * |
| * @category PHP |
| * @package jrest |
| * @author David Delon <david@tela-botania.org> |
| * @author Aurélien Peronnet <aurelien@tela-botania.org> |
| * @copyright 2010 Tela-Botanica |
| * @license http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL |
| * @version SVN: <svn_id> |
| * @link /doc/jrest/ |
| */ |
| |
| /** |
| * |
| * La classe appelle les web service d'eflore pour éviter que le code client |
| * ne soit dépendant de la version d'eflore |
| */ |
| class RechercheInfosTaxonBeta extends Cel { |
| |
| private $url_service_nom = null; |
| private $url_service_taxon = null; |
| private $url_service_chorologie = null; |
| |
| private $masque_recherche = null; |
| private $code_referentiel = 'bdtfx'; |
| |
| public function RechercheInfosTaxonBeta($config, $code_referentiel = 'bdtfx') { |
| parent::__construct($config); |
| $this->code_referentiel = $code_referentiel; |
| $this->formaterUrlsServices($config); |
| } |
| |
| private function formaterUrlsServices($config) { |
| $this->url_service_nom = str_replace('{referentiel}', $this->code_referentiel ,$config['eflore']['url_service_nom']); |
| $this->url_service_taxon = str_replace('{referentiel}', $this->code_referentiel ,$config['eflore']['url_service_taxon']); |
| $this->url_service_chorologie_obs = $config['eflore']['url_service_chorologie_obs']; |
| } |
| |
| public function rechercherGenreEspeceSurPrefixe($genre = null, $espece = null) { |
| |
| $liste_genre_espece = array(); |
| $this->masque_recherche = trim(trim($genre).' '.trim($espece,' *')); |
| $masque = urlencode($this->masque_recherche); |
| $requete = @file_get_contents($this->url_service_nom.'?masque='.$masque.'&recherche=etendue&retour.format=min&navigation.limite=50&ns.structure=au'); |
| if($requete != '') { |
| $requete = json_decode($requete); |
| if(is_object($requete) && isset($requete->resultat)) { |
| foreach ($requete->resultat as $id => $res) { |
| $retenu = ($res->retenu == "true") ? '3' : '4'; |
| $liste_genre_espece[] = array($res->nom_sci_complet, $id, $retenu); |
| } |
| } |
| usort($liste_genre_espece, array($this, 'comparerParRetenuPuisNom')); |
| } |
| return $liste_genre_espece; |
| } |
| |
| function comparerParRetenuPuisNom($a, $b) { |
| if($a[2] == 3 && $b[2] != 3) { |
| return -1; |
| } elseif($a[2] != 3 && $b[2] == 3) { |
| return 1; |
| } else { |
| return levenshtein($this->masque_recherche, $a[0]) >= levenshtein($this->masque_recherche, $b[0]); |
| } |
| } |
| |
| public function effectuerRequeteInfosComplementairesEtFormaterNom($numNom) { |
| |
| $resultat_infos_complementaires = (array)$this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom); |
| $retour_infos_complementaires = array(); |
| if (isset($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet']) && $resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet'] != '') { |
| $retour_infos_complementaires=array(($this->supprimerBiblio($resultat_infos_complementaires['nom_retenu_complet']))); |
| } |
| |
| return $retour_infos_complementaires; |
| } |
| |
| public function rechercherInformationsComplementairesSurNom($nom_saisi) { |
| $nom_saisi = trim($nom_saisi); |
| // Essai de recherche sur le nom saisi tel quel |
| $liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, true); |
| if(empty($liste_genre_espece)) { |
| // Essai de recherche stricte en tentant de supprimer le nom d'auteur |
| $nom_saisi_sans_auteur = $this->supprimerAuteur($nom_saisi); |
| $liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi_sans_auteur, true); |
| if(empty($liste_genre_espece)) { |
| // Dernière tentative : essai de recherche étendue |
| $liste_genre_espece = $this->effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, false); |
| } |
| } |
| return $liste_genre_espece; |
| } |
| |
| private function effectuerRequeteUrlRecherche($nom_saisi, $stricte = true) { |
| $url_recherche = $this->getUrlRechercheInfosComplementaires($nom_saisi, $stricte); |
| $resultat = @file_get_contents($url_recherche); |
| $liste_genre_espece = array(); |
| if($resultat != '') { |
| $liste_genre_espece = $this->parserResultatRechercheTaxon($resultat); |
| } |
| return $liste_genre_espece; |
| } |
| |
| private function getUrlRechercheInfosComplementaires($nom_saisi, $stricte = true) { |
| $type_recherche = $stricte ? 'stricte' : 'etendue'; |
| return $url_recherche_etendue = $this->url_service_nom.'?masque='.urlencode($nom_saisi).'&recherche='.$type_recherche.'&ns.format=txt&retour.champs=nom_sci,auteur,nom_retenu.id&navigation.limite=1'; |
| } |
| |
| private function supprimerAuteur($nom_saisi) { |
| // Attention le parseur de nom n'est pas fiable à 100% |
| // mais ça marche dans la plupart des cas |
| // à part les formules d'hybridité saisies avec un auteur |
| // TODO: gérer les hybrides |
| $nameparser = new NameParser(); |
| if($this->estUnHybride($nom_saisi) || $this->estUneFormuleHybridite($nom_saisi)) { |
| $nom_decoupe = explode(' ', $nom_saisi); |
| $derniere_position_hybride = end(array_keys($nom_decoupe, 'x')); |
| $nom_saisi_sans_auteur = implode(' ',array_slice($nom_decoupe, 0, $derniere_position_hybride + 2)); |
| } else { |
| $auteur = $nameparser->parse_auth($nom_saisi); |
| $nom_saisi_sans_auteur = str_replace($auteur, '', $nom_saisi); |
| } |
| |
| $nom_saisi_sans_auteur = trim($nom_saisi_sans_auteur); |
| return $nom_saisi_sans_auteur; |
| } |
| |
| private function estUneFormuleHybridite($nom_saisi) { |
| return strpos($nom_saisi,' x ') !== false; |
| } |
| |
| private function estUnHybride($nom_saisi) { |
| return strpos($nom_saisi,'x ') === 0; |
| } |
| |
| private function parserResultatRechercheTaxon($resultat) { |
| $liste_genre_espece = array(); |
| $resultat = json_decode($resultat); |
| if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat)) { |
| foreach ($resultat->resultat as $id => $res) { |
| $nom_complet = $res->{'nom_sci'}.' '.$res->auteur; |
| $liste_genre_espece[] = array($id,$nom_complet); |
| } |
| } |
| return $liste_genre_espece; |
| } |
| |
| public function rechercherInformationsComplementairesSurNumNom($num_nom) { |
| $infos_formatees = array(); |
| $infos = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num_nom); |
| if(is_object($infos)) { |
| $infos_formatees = $this->formaterInfosComplementairesSurNumNom($infos); |
| } |
| return $infos_formatees; |
| } |
| |
| public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num_nom) { |
| $infos = array(); |
| $url = $this->url_service_nom.'/'.$num_nom.'?retour.champs=nom_sci,auteur,id,nom_retenu_complet,nom_retenu.id,num_taxonomique,famille'; |
| $resultat = @file_get_contents($url); |
| if($resultat != '') { |
| $infos = json_decode($resultat); |
| } |
| return $infos; |
| } |
| |
| private function formaterInfosComplementairesSurNumNom($infos) { |
| $infos = (array)$infos; |
| return $infos_formatees = array( |
| 'Nom_Retenu' => $this->supprimerBiblio($infos['nom_retenu_complet']), |
| 'Num_Nom_Retenu' => $infos['nom_retenu.id'], |
| 'Num_Taxon' => $infos['num_taxonomique'], |
| 'Famille' => $infos['famille'] |
| ); |
| return $infos_formatees; |
| } |
| |
| private function supprimerBiblio($nom) { |
| return preg_replace('/ \[.*\]/','',$nom); |
| } |
| |
| public function rechercherNumTaxSurNumNom($num_nom) { |
| $nt = null; |
| $url = $this->url_service_nom."/".$num_nom.'?retour.champs=num_taxonomique'; |
| $resultat = @file_get_contents($url); |
| if($resultat != '') { |
| $infos = json_decode($resultat); |
| $nt = $infos->num_taxonomique; |
| } |
| |
| return $nt; |
| } |
| |
| public function taxonEstPresentDansDepartement($num_taxon,$code_departement) { |
| $presence_taxon = false; |
| $url = $this->url_service_chorologie_obs.'?masque.departement='.$code_departement.'&masque.determination.nt='.$num_taxon.'&navigation.limite=1'; |
| $resultat = @file_get_contents($url); |
| if($resultat != '') { |
| $resultat = json_decode($resultat); |
| if(is_object($resultat) && isset($resultat->resultat) && count($resultat->resultat) > 0) { |
| $presence_taxon = true; |
| } |
| } |
| return $presence_taxon; |
| } |
| |
| public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumTax($numTax) { |
| |
| $infos = array(); |
| //TODO: retourner moins de champs grâce au paramètre retour.champs |
| $url = $this->url_service_taxon."/nt:".$numTax; |
| $resultat = @file_get_contents($url); |
| if($resultat != '') { |
| $infos = json_decode($resultat); |
| } |
| |
| return $infos; |
| } |
| |
| function rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax($identifiant_espece) { |
| // texte libre, nom scientifique, |
| // ou code nomenclatural (format BDNFFnn999999) |
| // ou code taxonomique (format BDNFFnt999999) |
| $identifiant_espece=trim($identifiant_espece); |
| $identifiant_espece=utf8_encode($identifiant_espece); |
| |
| $retour = array(); |
| //TODO: voir ce qu'on fait pour l'import de différent référentiels |
| preg_match('/BDNFFnn([0-9][0-9]*)/',$identifiant_espece, $elements); |
| if (isset($elements[1])) { |
| // Numero nomenclatural |
| $infos_taxon = $this->rechercherInformationsComplementairesSurNumNom($elements[1]); |
| $retour = array("nom_sel" => $infos_taxon['Nom_Retenu'], "en_id_nom" => $elements[1]); |
| } else { |
| // Numero taxonomique ou nom scientifique |
| preg_match('/BDNFFnt([0-9][0-9]*)/', $identifiant_espece, $elements); |
| if (isset($elements[1])) { |
| // Numero taxonomique |
| $infos_taxon = (array)$this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumTax($elements[1]); |
| if(isset($infos_taxon['nom_retenu.libelle']) && isset($infos_taxon['id'])) { |
| $nom = $infos_taxon['nom_retenu.libelle']; |
| $nom .= (isset($infos_taxon['auteur'])) ? ' '.$infos_taxon['auteur'] : ''; |
| $retour = array("nom_sel" => $nom, |
| "en_id_nom" => $infos_taxon['id']); |
| } |
| } else { |
| // Nom scientifique |
| $id_nom = $this->rechercherInformationsComplementairesSurNom($identifiant_espece); |
| // Recherche du nom associe |
| $retour = array("nom_sel" => $identifiant_espece); |
| if(is_array($id_nom) && count($id_nom) > 0 && isset($id_nom[0][0]) && isset($id_nom[0][1])) { |
| $nn = $id_nom[0][0]; |
| $retour = array("nom_sel" => $id_nom[0][1], "en_id_nom" => $id_nom[0][0]); |
| } |
| } |
| } |
| |
| return $retour; |
| } |
| } |
| ?> |