/branches/v2.0-betulales/services/modules/Resultat.php |
---|
New file |
0,0 → 1,143 |
<?php |
/** |
* Service fournissant des données sur les résultats d'un traitement. |
* Encodage en entrée : utf8 |
* Encodage en sortie : utf8 |
* |
* @category Php 5.2 |
* @package Referentiel |
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org> |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt> |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt> |
* @copyright 2010 Tela-Botanica |
* @version $Id$ |
*/ |
class Resultat extends Ref { |
/** |
* Méthode principale appelée avec une requête de type GET. |
*/ |
public function getElement($params_url = array()) { |
// Initialisation des variables |
$info = array(); |
// Nour recherchons le type de requête demandé |
$p = $this->traiterParametresUrl(array('type'), $params_url, false); |
extract($p); |
if (!is_null($type)) { |
$methode = 'getElement'.$type; |
if (method_exists($this, $methode)) { |
array_shift($params_url); |
$info = $this->$methode($params_url); |
} else { |
$this->messages[] = "Le type d'information demandé '$type' n'est pas disponible."; |
} |
} else { |
$this->messages[] = "Veuillez préciser le type de requête."; |
} |
// Envoie sur la sortie standard |
$this->envoyer($info); |
} |
/** Méthode pour récupérer le nombre de résultat d'un traitement donné. |
* Appelée avec les paramêtres d'url suivant : |
* /Resultat/Nombre/id_traitement |
* |
* @return mixed le nombre de résultat ou false en cas d'échec. |
*/ |
public function getElementNombre($params_url) { |
$p = $this->traiterParametresUrl(array('id'), $params_url); |
extract($p); |
$requete = 'SELECT COUNT(*) AS nbre '. |
"FROM ref_resultat ". |
"WHERE ce_traitement = $id "; |
// Récupération des résultats |
try { |
$nbre = $this->bdd->query($requete)->fetchColumn(); |
if ($nbre === false) { |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat."; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
return $nbre; |
} |
/** Méthode pour récupérer les infos d'un résultat. |
* Appelée avec les paramêtres d'url suivant : |
* /Resultat/Info/id_resultat |
* |
* @return mixed les infos du résultat ou false en cas d'échec. |
*/ |
public function getElementInfo($params_url) { |
$p = $this->traiterParametresUrl(array('id'), $params_url); |
extract($p); |
$requete = 'SELECT * '. |
"FROM ref_resultat ". |
"WHERE id_resultat = $id "; |
// Récupération des résultats |
try { |
$infos = $this->bdd->query($requete)->fetch(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($infos === false) { |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat."; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
return $infos; |
} |
/** Méthode pour récupérer des infos partielles (id, nom, resultat) des résultats d'un traitement. |
* Appelée avec les paramêtres d'url suivant : |
* /Resultat/Traitement/id_traitement |
* |
* @return mixed le tableau de tableau d'infos ou false en cas d'échec. |
*/ |
public function getElementTraitement($params_url) { |
$p = $this->traiterParametresUrl(array('id'), $params_url); |
extract($p); |
$requete = 'SELECT * '. |
"FROM ref_resultat ". |
"WHERE ce_traitement = $id "; |
// Récupération des résultats |
try { |
$infos = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($infos === false) { |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat."; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
return $infos; |
} |
/** |
* Méthode appelée pour ajouter un traitement. |
* |
* @return mixed l'id du nouvel enregistrement ou false! |
*/ |
public function createElement($params_post) { |
$params_proteges = $this->traiterParametresPost(array('id_traitement', 'nom', 'description', 'resultat', 'message'), $params_post); |
extract($params_proteges); |
$meta_date_creation = $this->bdd->quote(date ("Y-m-d H:i:s")); |
try { |
$requete = "INSERT INTO ref_resultat ". |
' (ce_traitement, nom, description, resultat, message, meta_date_creation) '. |
" VALUES ($id_traitement, $nom, $description, $resultat, $message, $meta_date_creation) "; |
$resultat = $this->bdd->exec($requete); |
if ($resultat === false) { |
$id = false; |
$this->debug[] = "Résultat NON ajouté."; |
} else { |
$id = $this->bdd->lastInsertId(); |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage(), $requete); |
} |
$this->envoyer($id); |
} |
} |
?> |
/branches/v2.0-betulales/services/modules/Referentiel.php |
---|
New file |
0,0 → 1,384 |
<?php |
/** |
* Service fournissant des données de la table contenant le référentiel de travail. |
* Encodage en entrée : utf8 |
* Encodage en sortie : utf8 |
* |
* @category Php 5.2 |
* @package Referentiel |
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org> |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt> |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt> |
* @copyright 2010 Tela-Botanica |
* @version $Id$ |
*/ |
class Referentiel extends Ref { |
/** |
* Méthode principale appelée avec une requête de type GET. |
*/ |
public function getElement($params_url = array()) { |
// Initialisation des variables |
$info = array(); |
// Nour recherchons le type de requête demandé |
$p = $this->traiterParametresUrl(array('type'), $params_url, false); |
extract($p); |
if (!is_null($type)) { |
$methode = 'getElement'.$type; |
if (method_exists($this, $methode)) { |
array_shift($params_url); |
$info = $this->$methode($params_url); |
} else { |
$this->messages[] = "Le type d'information demandé '$type' n'est pas disponible."; |
} |
} else { |
$this->messages[] = "Veuillez préciser le type de requête."; |
} |
// Envoie sur la sortie standard |
$this->envoyer($info); |
} |
/* Méthode pour récupérer les infos sur les référentiels disponibles |
* Appelée avec les paramêtres d'url suivant : |
* /RefReferentiel/tout/code_du_referentiel |
*/ |
public function getElementDispo($params_url) { |
$requete = 'SHOW TABLES '; |
$donnees = false; |
// Récupération des résultats |
try { |
$tables = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_COLUMN, 0); |
if ($tables !== false) { |
foreach ($tables as $table) { |
if (preg_match('/^([a-z]+)_meta$/', $table, $match)) { |
$donnees[] = $match[1]; |
} |
} |
} else { |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat."; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
return $donnees; |
} |
/* Méthode pour récupérer les noms d'un référentiel. |
* Appelée avec les paramêtres d'url suivant : |
* /Referentiel/tout/code_du_referentiel?start=0&limit=1000 |
*/ |
public function getElementTout($params_url) { |
$p = $this->traiterParametresUrl(array('projet'), $params_url, false); |
extract($p); |
$donnees = false; |
if (!is_null($projet)) { |
$requete = ($this->distinct ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' * '. |
"FROM $projet ". |
'ORDER BY '.((!is_null($this->orderby)) ? $this->orderby : 'num_nom ASC').' '. |
"LIMIT $this->start, $this->limit "; |
$this->debug[] = $requete; |
// Récupération des résultats |
try { |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($donnees === false) { |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat."; |
} else { |
$donnees_tmp = $donnees; |
$donnees = array(); |
foreach ($donnees_tmp as &$nom) { |
$donnees[$nom['num_nom']] = $nom; |
unset($nom); |
} |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
} else { |
$this->messages[] = "Veuillez préciser le nom de code du projet comme second paramêtre (ex. : bdnff)."; |
} |
return $donnees; |
} |
/* Méthode pour récupérer le nombre de noms présents dans un référentiel. |
* Appelée avec les paramêtres d'url suivant : |
* /RefReferentiel/nombre/code_du_referentiel |
*/ |
public function getElementNombre($params_url) { |
$p = $this->traiterParametresUrl(array('projet'), $params_url, false); |
extract($p); |
$nbre = false; |
if (!is_null($projet)) { |
$requete = 'SELECT COUNT(*) AS nbre '. |
"FROM $projet "; |
// Récupération des résultats |
try { |
$nbre = $this->bdd->query($requete)->fetchColumn(); |
if ($nbre === false) { |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat."; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
} else { |
$this->messages[] = "Veuillez préciser le nom de code du projet comme second paramêtre (ex. : bdnff)."; |
} |
return $nbre; |
} |
/* Méthode pour récupérer le titre d'un référentiel. |
* Appelée avec les paramêtres d'url suivant : |
* /RefReferentiel/nom/code_du_referentiel |
*/ |
public function getElementNom($params_url) { |
$p = $this->traiterParametresUrl(array('projet'), $params_url, false); |
extract($p); |
$nom = false; |
if (!is_null($projet)) { |
$requete = "SELECT titre FROM {$projet}_meta WHERE id_meta = (SELECT MAX(id_meta) FROM {$projet}_meta);"; |
// Récupération des résultats |
try { |
$nom = $this->bdd->query($requete)->fetchColumn(); |
if ($nom === false) { |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat."; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
} else { |
$this->messages[] = "Veuillez préciser le nom de code du projet comme second paramêtre (ex. : bdnff)."; |
} |
return $nom; |
} |
/* Méthode pour récupérer le titre d'un référentiel. |
* Appelée avec les paramêtres d'url suivant : |
* /RefReferentiel/nom/code_du_referentiel |
*/ |
public function getElementDateMiseAJour($params_url) { |
$p = $this->traiterParametresUrl(array('projet'), $params_url, false); |
extract($p); |
$nom = false; |
if (!is_null($projet)) { |
$requete = 'SELECT UPDATE_TIME '. |
'FROM information_schema.tables '. |
'WHERE TABLE_SCHEMA = \'referentiels\' '. |
'AND TABLE_NAME = \''.$projet.'\''; |
// Récupération des résultats |
try { |
$nom = $this->bdd->query($requete)->fetchColumn(); |
if ($nom === false) { |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat."; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
} else { |
$this->messages[] = "Veuillez préciser le nom de code du projet comme second paramêtre (ex. : bdnff)."; |
} |
return $nom; |
} |
/* Méthode pour récupérer certains champs et noms pour l'export |
* Appelée avec les paramètres d'url suivant : |
* /Recherche/Export/_ |
* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, version, champs, filtre |
* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur * |
*/ |
public function getElementExport($param) { |
// Initialisation des variables |
$info = array(); |
$p = $this->traiterParametresUrl(array("ref","version","champs","filtre"), $param, false); |
$ref = $p['ref'].'_v'.$p['version']; |
$racine_tmp = $this->config['chemins']['chemin_tmp']; |
$dossier = $racine_tmp.date('Y_m_d').'/'; |
if(!is_dir($dossier)){ |
mkdir($dossier); |
chmod($dossier, 0777); |
} |
$fichier = $dossier.$ref."_".time().'.csv'; |
if (isset($p['champs'])) { |
$champs = $this->formaterColonnes($p['champs'], $ref); |
$requete = 'SELECT "'.implode('","', $champs['titre']).'" UNION (SELECT '.implode(', ',$champs['select']). |
" INTO OUTFILE '".$fichier."' CHARACTER SET utf8 FIELDS TERMINATED BY '\t' OPTIONALLY ENCLOSED BY '' LINES TERMINATED BY '\n' ". |
" FROM $ref a left join $ref b on b.num_nom=a.num_nom_retenu"; |
if (isset($p['filtre']) && $p['filtre'] != "*") { |
$param_filtres = explode(",",$p["filtre"]); |
$dernier_filtre = array_pop($param_filtres); |
$filtres = array("nnr"=>"a.num_nom = a.num_nom_retenu", "pre" => "a.presence = 'P'"); |
if (!isset($filtres[$dernier_filtre])) { // si il s'agit du filtre famille |
$filtres["fam"] = "a.famille = '".$dernier_filtre."'"; |
$dernier_filtre = "fam"; |
} |
array_push($param_filtres, $dernier_filtre); |
$requete .= " WHERE ".implode(" AND ",array_intersect_key($filtres, array_flip($param_filtres))); |
} |
$requete .= ")"; |
// Récupération des résultats |
try { |
$donnees = $this->bdd->query($requete); |
if ($donnees === false) { |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat : $requete"; |
} else { |
$info = $donnees; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()).$requete; |
} |
} |
return $fichier; |
} |
private function formaterColonnes($colonnes, $ref) { |
$colonnesOrdonnees = array("nn" => array("a.num_nom", "num_nom", "Numéro nomenclatural"), |
"nr" => array("a.num_nom_retenu", "num_nom_retenu", "Numéro nomenclatural du nom retenu"), |
"nt" => array("a.num_taxonomique", "num_taxonomique", "Numéro taxonomique"), |
"cd" => array("a.cd_nom", "cd_nom", "Numéro INPN"), |
"rg" => array("a.rang", "rang", "Code rang"), |
"fam" => array("a.famille", "famille", "Famille (APG III)"), |
"nsc" => array("concat(a.nom_sci,' ',a.auteur)", "nom_sci", "Nom avec auteur"), |
"bibc" => array("concat(a.annee,' ',a.biblio_origine)", "annee", "Année et bibliographie"), |
"nsrc" => array("concat(b.nom_sci,' ',b.auteur) as nom_sci_retenu_complet", "auteur", "Nom retenu avec auteur"), |
"nf" => array("a.nom_francais", "nom_francais", "Nom français normalisé"), |
"extax" => array("if (a.exclure_taxref = 1, 0, 1)", "exclure_taxref", "Présent dans Taxref"), |
"lien" => array("concat('http://www.tela-botanica.org/bdtfx-nn-',a.num_nom)", "num_nom", "Permalien"), |
"ntsup" => array("a.num_tax_sup", "num_tax_sup", "Numéro nomenclatural rang supérieur"), |
"pre" => array("a.presence", "presence", "Répartition géographique"), |
"ns" => array("a.nom_sci", "nom_sci", "Nom sans auteur"), |
"aut" => array("a.auteur", "auteur", "Auteur"), |
"ann" => array("a.annee", "annee", "Année publication"), |
"bib" => array("a.biblio_origine", "biblio_origine", "Bibliographie"), |
"ntype" => array("a.num_type", "num_type", "Numéro du type"), |
"nbas" => array("a.num_basionyme", "num_basionyme", "Numéro du basionyme"), |
"genre" => array("a.genre", "genre", "Genre"), |
"esp" => array("a.epithete_sp", "epithete_sp", "Epithète espèce"), |
"eing" => array("a.epithete_infra_generique", "epithete_infra_generique", "Epithète infragénérique"), |
"te" => array("a.type_epithete", "type_epithete", "Type d'épithète infraspécifique"), |
"einsp" => array("a.epithete_infra_sp", "epithete_infra_sp", "Epithète infraspécifique"), |
"hybp01" => array("a.hybride_parent_01", "hybride_parent_01", "Hybride parent 1"), |
"nomsupgen" => array("a.nom_supra_generique", "nom_supra_generique", "Nom supra générique"), |
"hybp02" => array("a.hybride_parent_02", "hybride_parent_02", "Hybride parent 2"), |
"stori" => array("a.statut_origine", "statut_origine", "Statut d'origine"), |
"stint" => array("a.statut_introduction", "statut_introduction", "Statut d'introduction"), |
"stcult" => array("a.statut_culture", "statut_culture", "Statut de culture"), |
"notes" => array("a.notes", "notes", "Remarques"), |
"nomadd" => array("a.nom_addendum", "nom_addendum", "Commentaires nomenclaturaux"), |
"nsr" => array("b.nom_sci as nom_sci_retenu", "nom_sci", "Nom retenu sans auteur"), |
"hom" => array("a.homonyme", "homonyme", "Homonymie"), |
"synprop" => array("a.synonyme_proparte", "synonyme_proparte", "Synonyme proprate"), |
"syndout" => array("a.synonyme_douteux", "synonyme_douteux", "Synonyme douteux"), |
"synmapp" => array("a.synonyme_mal_applique", "synonyme_mal_applique", "Synonyme mal appliqué"), |
"synorth" => array("a.synonyme_orthographique", "synonyme_orthographique", "Synonyme orthographique"), |
"orthori" => array("a.orthographe_originelle", "orthographe_originelle", "Orthographe originelle"), |
"hybp01n" => array("a.hybride_parent_01_notes", "hybride_parent_01_notes", "Hybride parent 1 notes"), |
"hybp02n" => array("a.hybride_parent_02_notes", "hybride_parent_02_notes", "Hybride parent 2 notes"), |
"cultgp" => array("a.cultivar_groupe", "cultivar_groupe", "Groupe de cultivar"), |
"cult" => array("a.cultivar", "cultivar", "Nom cultivar"), |
"nomcomm" => array("a.nom_commercial", "nom_commercial", "Nom commercial"), |
"autres" => array("a.*", "*", "Autres")); |
$colonnes = explode(",", $colonnes); |
$requete = "SHOW COLUMNS FROM $ref"; |
$colonnesTable = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_COLUMN, "Field"); |
foreach ($colonnes as $colonne) { |
if ($colonne == "autres") { |
foreach ($colonnesOrdonnees as $colOrd) { |
$test[] = $colOrd[1]; |
} |
$colonneAutres = array_diff($colonnesTable, $test); |
$champs['select'] = array_merge($champs['select'], array_map(array($this, 'ajouterIndexTable'), $colonneAutres)); |
$champs['titre'] = array_merge($champs['titre'], array_map(array($this, 'ajouterAutresTable'), $colonneAutres)); |
} else { |
if (array_search($colonnesOrdonnees[$colonne][1], $colonnesTable) != false) { |
$champs['select'][] = $colonnesOrdonnees[$colonne][0]; |
$champs['titre'][] = $colonnesOrdonnees[$colonne][2]; |
} |
} |
} |
return $champs; |
} |
private function ajouterIndexTable($valeur) { |
return 'a.'.$valeur; |
} |
private function ajouterAutresTable($valeur) { |
return 'Autres : '.$valeur; |
} |
/** |
* Méthode principale appelée avec une requête de type POST. |
*/ |
public function updateElement($params_url, $params_post) { |
// Initialisation des variables |
$info = array(); |
// Nour recherchons le type de requête demandé |
extract($this->traiterParametresUrl(array('action'), $params_url, true)); |
extract($this->traiterParametresPost(array('referentiel'), $params_post, true)); |
extract($this->traiterParametresPost(array('noms'), $params_post, false)); |
$referentiel =trim($referentiel, "'"); |
if (!is_null($referentiel)) {$action =trim($action, "'"); |
if (!is_null($action)) { |
$methode = 'updateElement'.$action; |
if (method_exists($this, $methode)) { |
//array_shift($param); |
$info = $this->$methode($referentiel, $noms); |
} else { |
$this->messages[] = "Le type de mise à jour demandé '$action' n'est pas disponible."; |
} |
} else { |
$this->messages[] = "Veuillez préciser le type de mise à jour à faire."; |
// TODO : coder une mise à jour générique dans une méthode updateElementDefaut($id, $params_post); |
} |
} else { |
$this->messages[] = "Veuillez préciser l'id du traitement comme premier paramêtre dans l'url."; |
} |
// Envoie sur la sortie standard |
$this->envoyer($info); |
} |
private function getElementTablePrChpFamille($referentiel) { |
$infos = "";$referentiel = $referentiel[0]; |
$requete = "SHOW COLUMNS FROM {$referentiel} LIKE 'famille' "; |
$resultat = $this->bdd->query($requete)->fetch(); |
if ($resultat === false) { |
$requete = "ALTER TABLE {$referentiel} ". |
'ADD famille VARCHAR(50) '. |
'CHARACTER SET utf8 COLLATE utf8_general_ci NULL DEFAULT "" '; |
$this->bdd->exec($requete); |
} |
$requeteInfos = 'SELECT num_nom, num_nom_retenu, num_tax_sup, rang, nom_sci '. |
"FROM {$referentiel} ". |
"WHERE rang >= 180 ". |
"ORDER BY rang ASC, num_tax_sup ASC, num_nom_retenu DESC "; |
$infos = $this->bdd->query($requeteInfos)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC); |
return $infos; |
} |
private function updateElementChpFamille($referentiel, $noms) { |
foreach ($noms as $id => $famille) { |
$requete = "UPDATE {$referentiel} SET famille = '$famille' WHERE num_nom = $id "; |
$resultat = $this->bdd->query($requete); |
if ($resultat === false) { |
$this->messages[] = "Erreur d'insertion pour le tuple $id"; |
} |
} |
} |
} |
?> |
/branches/v2.0-betulales/services/modules/Meta.php |
---|
New file |
0,0 → 1,139 |
<?php |
/** |
* Service fournissant des données de la table contenant les méta-données d'un référentiel de travail. |
* Encodage en entrée : utf8 |
* Encodage en sortie : utf8 |
* |
* @category Php 5.2 |
* @package Referentiel |
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org> |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt> |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt> |
* @copyright 2010 Tela-Botanica |
* @version $Id$ |
*/ |
class Meta extends Ref { |
/** |
* Méthode principale appelée avec une requête de type GET. |
*/ |
public function getElement($params_url = array()) { |
// Initialisation des variables |
$info = array(); |
// Nour recherchons le type de requête demandé |
$p = $this->traiterParametresUrl(array('type'), $params_url, false); |
extract($p); |
if (!is_null($type)) { |
$methode = 'getElement'.$type; |
if (method_exists($this, $methode)) { |
array_shift($params_url); |
$info = $this->$methode($params_url); |
} else { |
$this->messages[] = "Le type d'information demandé '$type' n'est pas disponible."; |
} |
} else { |
$this->messages[] = "Veuillez préciser le type de requête."; |
} |
// Envoie sur la sortie standard |
$this->envoyer($info); |
} |
/** Méthode pour récupérer les dernières meta-données ajoutées |
* Appelée avec les paramêtres d'url suivant : |
* /Meta/Dernier/code_projet |
*/ |
public function getElementDerniere($params_url) { |
$p = $this->traiterParametresUrl(array('projet'), $params_url, false); |
extract($p); |
$donnees = false; |
if (isset($projet)) { |
$nom_table = strtolower($projet).'_meta'; |
$requete = ($this->distinct ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' * '. |
"FROM `$nom_table` ". |
'ORDER BY '.((!is_null($this->orderby)) ? $this->orderby : 'id_meta DESC').' '. |
'LIMIT 0,1 '; |
// Récupération des résultats |
try { |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetch(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($donnees === false) { |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat."; |
} else if (0 == count($donnees)) { |
$donnees = null; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
} else { |
$this->messages[] = "Veuillez préciser le nom de code du projet comme premier paramêtre (ex. : bdnff). "; |
} |
return $donnees; |
} |
public function getElementExport($param) { |
// Initialisation des variables |
$info = array(); |
$champs = array("titre", "code", "version", "domaine_taxo", "domaine_geo", "domaine_nom", "classification", "coordinateur", "auteur", "contributeur", "date_production", "source", "contact", "editeur", "droit", "licence", "referencement"); |
$p = $this->traiterParametresUrl(array("ref","version"), $param, false); |
$racine_tmp = $this->config['chemins']['chemin_tmp']; |
$fichier = $racine_tmp.date('Y_m_d')."/meta_".$p['version']."_".time().'.csv'; |
$requete = "SELECT '".implode("', '", $champs)."' UNION ( SELECT ".implode(", ", $champs). |
" INTO OUTFILE '". |
$fichier."' CHARACTER SET utf8 FIELDS TERMINATED BY '\t' OPTIONALLY ENCLOSED BY '' LINES TERMINATED BY '\n' ". |
" FROM ".$p['ref']."_meta WHERE version = '".str_replace("_", ".", $p['version'])."')"; |
// Récupération des résultats |
try { |
$donnees = $this->bdd->query($requete); |
if ($donnees === false) { |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat : $requete"; |
} else { |
$info = $donnees; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()).$requete; |
} |
return $fichier; |
} |
/** |
* Méthode appelée pour ajouter des méta-données à un référentiel. |
* Retour l'id du nouvel enregistrement ou false! |
*/ |
public function createElement($params_post) { |
$params_attendus = array('titre', 'code', 'domaine_taxo', 'domaine_geo', 'domaine_nom', 'classification', |
'version', 'coordinateur', 'auteur', 'contributeur', 'date_production', 'date_validation', 'source', |
'contact', 'editeur', 'droit', 'licence', 'referencement', 'stat_combinaison', 'stat_taxon', 'stat_modification', |
'signature'); |
$params_proteges = $this->traiterParametresPost($params_attendus, $params_post); |
$nom_table = strtolower($params_post['code']).'_meta'; |
$champs = array(); |
$valeurs = array(); |
foreach ($params_proteges as $champ => $valeur) { |
$champs[] = $champ; |
$valeurs[] = $valeur; |
} |
try { |
$requete = "INSERT INTO `$nom_table` (".implode(', ', $champs).') VALUES ('.implode(', ', $valeurs).') '; |
$resultat = $this->bdd->exec($requete); |
if ($resultat === false) { |
$id = false; |
$this->debug[] = "Méta-données NON ajoutées."; |
} else { |
$id = $this->bdd->lastInsertId(); |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage(), $requete); |
} |
$this->envoyer($id); |
} |
} |
/branches/v2.0-betulales/services/modules/ArchiverReferentiel.php |
---|
New file |
0,0 → 1,57 |
<?php |
/** |
* Service réalisant l'archivage d'une version de travail d'un référentiel. |
* Encodage en entrée : utf8 |
* Encodage en sortie : utf8 |
* |
* @category Php 5.2 |
* @package Referentiel |
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org> |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt> |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt> |
* @copyright 2010 Tela-Botanica |
* @version $Id$ |
*/ |
class ArchiverReferentiel extends Ref { |
/** |
* Méthode appelée pour ajouter des méta-données à un référentiel. |
* Retour l'id du nouvel enregistrement ou false! |
*/ |
public function createElement($params_post) { |
$params_attendus = array('code', 'version'); |
$params_proteges = $this->traiterParametresPost($params_attendus, $params_post); |
$nom_table_origine = strtolower($params_post['code']); |
$nom_table_copie = strtolower($params_post['code']).'_v'.str_replace('.', '_', $params_post['version']); |
$retour = false; |
try { |
$requete = "SHOW CREATE TABLE `$nom_table_origine`"; |
$resultat = $this->bdd->query($requete)->fetch(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($resultat === false) { |
$this->debug[] = "La récupération de la commande sql de création de la table d'archive a échoué."; |
} else { |
$requete = $resultat['Create Table']; |
$requete = str_replace($nom_table_origine, $nom_table_copie, $requete); |
$resultat = $this->bdd->exec($requete); |
if ($resultat === false) { |
$this->debug[] = "La création de la structure de la table d'archive a échoué."; |
} else { |
$requete = "INSERT INTO `$nom_table_copie` SELECT * FROM `$nom_table_origine`"; |
$resultat = $this->bdd->exec($requete); |
if ($resultat === false) { |
$this->debug[] = "La copie des données a échoué."; |
} else { |
$retour = true; |
} |
} |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage(), $requete); |
} |
$this->envoyer($retour); |
} |
} |
/branches/v2.0-betulales/services/modules/FicheTaxon.php |
---|
New file |
0,0 → 1,274 |
<?php |
/** |
* Service fournissant des données de la table contenant le référentiel de travail. |
* Encodage en entrée : utf8 |
* Encodage en sortie : utf8 |
* |
* @category Php 5.2 |
* @package Referentiel |
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org> |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt> |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt> |
* @copyright 2010 Tela-Botanica |
* @version $Id$ |
*/ |
class FicheTaxon extends Ref { |
private $resultat = ''; |
/** |
* Méthode principale appelée avec une requête de type GET. |
*/ |
public function getElement($params_url = array()) { |
// Initialisation des variables |
$info = array(); |
// Nour recherchons le type de requête demandé |
$p = $this->traiterParametresUrl(array('type'), $params_url, false); |
extract($p); |
if (!is_null($type)) { |
$methode = 'getElement'.$type; |
if (method_exists($this, $methode)) { |
array_shift($params_url); |
$ref = $params_url[0]; |
$num_nom = $params_url[1]; |
$info = $this->$methode($ref, $num_nom); |
} else { |
$this->messages[] = "Le type d'information demandé '$type' n'est pas disponible."; |
} |
} else { |
$this->messages[] = "Veuillez préciser le type de requête."; |
} |
// Envoie sur la sortie standard |
$this->envoyer($info); |
} |
/* Méthode pour récupérer les infos sur le taxon sélectionné (appelée une fois au chargement de la page |
* Appelée avec les paramètres d'url suivant : /Taxon/ref/num_nom */ |
public function getElementTaxon($ref, $num_nom) { |
$requete = "SELECT * FROM {$ref} WHERE num_nom = {$num_nom};"; |
// Récupération des résultats |
try { |
$info = ''; |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($donnees === false) { |
$this->messages[] = "La requête n'a retourné aucun résultat."; |
} else { |
$info = $donnees; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
return $info; |
} |
/* Méthode pour récupérer les infos sur un taxon (retourne seulement les champs affichés) |
* Appelée avec les paramètres d'url suivant : /TaxonAffichage/ref/num_nom */ |
public function getElementTaxonAffichage($ref, $num_nom) { |
$requete = "SELECT num_nom_retenu, num_nom, num_tax_sup, nom_sci, auteur, annee, biblio_origine, ". |
" nom_addendum, nom_francais FROM {$ref} WHERE num_nom = {$num_nom};"; |
// Récupération des résultats |
try { |
$info = ''; |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($donnees === array()) { |
$this->messages[] = "La requête n'a retourné aucun résultat."; |
} else { |
$info = $donnees; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
return $info; |
} |
/* Méthode pour récupérer les infos sur un taxon et so, basyonyme |
* Appelée avec les paramètres d'url suivant : /Taxon/ref/num_nom */ |
public function getElementNomenclature($ref, $num_nom) { |
$requete = "SELECT s.num_nom_retenu, s.num_nom, s.num_tax_sup, s.nom_sci, s.auteur, s.annee, ". |
" s.biblio_origine, s.nom_addendum, s.nom_francais, b.num_nom AS bas_num, b.num_nom_retenu AS ". |
" bas_num_retenu, b.nom_sci AS bas_nom, b.auteur AS bas_auteur, b.annee AS bas_annee, ". |
" b.biblio_origine AS bas_bib, b.nom_addendum AS bas_nom_add ". |
" FROM {$ref} s, {$ref} b WHERE ".(($ref == "bdtfx" || $ref == "bdtre") ? 's.num_basionyme' : |
's.basionyme')." = b.num_nom AND s.num_nom = {$num_nom};"; |
// Récupération des résultats |
try { |
$info = ''; |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($donnees === array()) { |
$info = $this->getElementTaxonAffichage($ref, $num_nom); |
} else { |
$info = $donnees; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
return $info; |
} |
/* Méthode pour récupérer les infos sur les parents d'un taxon hybride sélectionné |
* Appelée avec les paramètres d'url suivant : /ParentsHybride/ref/num_nom */ |
public function getElementParentsHybride($ref, $num_nom) { |
$requete = ""; |
$requete_parents = "SELECT hybride_parent_01, hybride_parent_02 FROM {$ref} WHERE num_nom = {$num_nom};"; |
$parents = $this->bdd->query($requete_parents)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($parents[0]['hybride_parent_01'] != '' && $parents[0]['hybride_parent_02'] != '') { |
$requete = "SELECT p1.num_nom AS p1_num, p1.nom_sci AS p1_nom, p1.auteur AS p1_auteur, p1.annee AS p1_annee, |
p1.biblio_origine AS p1_bib, p1.nom_addendum AS p1_nom_add, p1.num_nom AS p1_num_retenu, |
p2.num_nom AS p2_num, p2.nom_sci AS p2_nom, p2.auteur AS p2_auteur, p2.annee AS p2_annee, |
p2.biblio_origine AS p2_bib, p2.nom_addendum AS p2_nom_add, p2.num_nom AS p2_num_retenu ". |
" FROM {$ref} p1, {$ref} p2, {$ref} h ". |
" WHERE p1.num_nom = h.hybride_parent_01 AND p2.num_nom = h.hybride_parent_02 AND h.num_nom = {$num_nom};"; |
} elseif ($parents[0]['hybride_parent_01'] != '' && $parents[0]['hybride_parent_02'] == '') { |
$requete = "SELECT p1.num_nom AS p1_num, p1.nom_sci AS p1_nom, p1.auteur AS p1_auteur, p1.annee AS p1_annee, |
p1.biblio_origine AS p1_bib, p1.nom_addendum AS p1_nom_add, p1.num_nom AS p1_num_retenu ". |
" FROM {$ref} p1, {$ref} p2, {$ref} h ". |
" WHERE p1.num_nom = h.hybride_parent_01 AND h.num_nom = {$num_nom};"; |
} elseif ($parents[0]['hybride_parent_01'] == '' && $parents[0]['hybride_parent_02'] != '') { |
$requete = "SELECT p2.num_nom AS p2_num, p2.nom_sci AS p2_nom, p2.auteur AS p2_auteur, p2.annee AS p2_annee, |
p2.biblio_origine AS p2_bib, p2.nom_addendum AS p2_nom_add, p2.num_nom AS p2_num_retenu ". |
" FROM {$ref} p1, {$ref} p2, {$ref} h ". |
" WHERE p2.num_nom = h.hybride_parent_02 AND h.num_nom = {$num_nom};"; |
} |
$donnees = array(); |
// Récupération des résultats |
try { |
$info = ''; |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($donnees === array()) { |
$this->messages[] = "La requête n'a retourné aucun résultat."; |
} else { |
$info = $donnees; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
return $info; |
} |
/* Méthode pour récupérer les infos sur les taxons de rang supérieur(retourne seulement les champs affichés) |
* Appelée avec les paramètres d'url suivant : /TaxonSuperieur/ref/num_nom */ |
public function getElementTaxonSuperieur($ref, $num_nom) { |
$taxonSuperieur = $num_nom; |
$info = ''; |
while ($taxonSuperieur != null) { |
$requete = "SELECT num_nom, rang, num_tax_sup, nom_supra_generique, nom_sci, auteur, annee, " |
." biblio_origine, presence, nom_addendum FROM {$ref} WHERE num_nom = {$taxonSuperieur};"; |
// Récupération des résultats |
try { |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($donnees === array() || isset($info[$donnees[0]['num_nom']])) { |
$taxonSuperieur = null; |
} else { |
$taxonSuperieur = $donnees[0]['num_tax_sup']; |
$info[$donnees[0]['num_nom']] = $donnees[0]; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
} |
return $info; |
} |
public function getElementTaxonInferieur($ref, $num_nom, $niveau = 1) { |
$requete = 'SELECT num_nom, rang, num_tax_sup, nom_supra_generique, nom_sci, auteur, annee, '. |
' biblio_origine, presence, nom_addendum '. |
"FROM {$ref} ". |
'WHERE num_tax_sup = '.$num_nom.";"; |
// Récupération des résultats |
try { |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($donnees === array()) { |
} elseif (isset($niveau) && $niveau >= 6) { |
if ((isset($this->resultat['niveau']) && $niveau > $this->resultat['niveau']) || !isset($this->resultat['niveau'])) { |
$this->resultat['niveau'] = $niveau; |
} |
foreach ($donnees as $donnee) { |
$this->resultat['inf'][$donnee['num_nom']] = $donnee; |
$this->resultat['inf'][$donnee['num_nom']]['niveau'] = $niveau; |
$this->resultat['nb_par_rang'][$donnee['rang']] = |
(isset($this->resultat['nb_par_rang'][$donnee['rang']])) ? |
$this->resultat['nb_par_rang'][$donnee['rang']] + 1 |
: 1; |
} |
} elseif (count($donnees) >= 100 || |
(isset($this->resultat['inf']) && count($this->resultat['inf'])+count($donnees) >= 100)) { |
if ((isset($this->resultat['niveau']) && $niveau > $this->resultat['niveau']) || !isset($this->resultat['niveau'])) { |
$this->resultat['niveau'] = $niveau; |
$this->resultat['nb_niveau'][$niveau] = count($donnees); |
} |
foreach ($donnees as $donnee) { |
$this->resultat['inf'][$donnee['num_nom']] = $donnee; |
$this->resultat['nb_par_rang'][$donnee['rang']] = |
(isset($this->resultat['nb_par_rang'][$donnee['rang']])) ? |
$this->resultat['nb_par_rang'][$donnee['rang']] + 1 |
: 1; |
} |
} else { |
if ((isset($this->resultat['niveau']) && $niveau > $this->resultat['niveau']) || !isset($this->resultat['niveau'])) { |
$this->resultat['niveau'] = $niveau; |
} |
$niveau ++; |
foreach ($donnees as $donnee) { |
$this->resultat['inf'][$donnee['num_nom']] = $donnee; |
$this->resultat['inf'][$donnee['num_nom']]['niveau'] = $niveau - 1; |
$this->getElementTaxonInferieur($ref, $donnee['num_nom'], $niveau); |
$this->resultat['nb_par_rang'][$donnee['rang']] = |
(isset($this->resultat['nb_par_rang'][$donnee['rang']])) ? |
$this->resultat['nb_par_rang'][$donnee['rang']] + 1 |
: 1; |
} |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
return $this->resultat; |
} |
public function getElementHomonyme($ref, $nom_sci) { |
$requete = "SELECT num_nom_retenu, num_nom, nom_sci, auteur, annee, biblio_origine, homonyme, ". |
" nom_addendum, nom_francais FROM {$ref} WHERE nom_sci = '{$this->bdd->proteger($nom_sci)}';"; |
// Récupération des résultats |
try { |
$info = ''; |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($donnees === array()) { |
$this->messages[] = "La requête n'a retourné aucun résultat."; |
} else { |
$info = $donnees; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
return $info; |
} |
public function getElementBasionyme($ref, $basionyme) { |
$requete = "SELECT num_nom_retenu, num_nom, nom_sci, auteur, annee, biblio_origine, homonyme, ". |
" nom_addendum, nom_francais FROM {$ref} WHERE ".(($ref == "bdtfx" || $ref == "bdtre") ? 'num_basionyme' : |
'basionyme')." = '{$basionyme}';"; |
// Récupération des résultats |
try { |
$info = ''; |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($donnees === array()) { |
$this->messages[] = "La requête n'a retourné aucun résultat."; |
} else { |
$info = $donnees; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
return $info; |
} |
} |
?> |
/branches/v2.0-betulales/services/modules/Recherche.php |
---|
New file |
0,0 → 1,644 |
<?php |
/** |
* Service fournissant des informations sur les référentiels répondant aux critères de recherche |
* fournis en paramètre. |
* Encodage en entrée : utf8 |
* Encodage en sortie : utf8 |
* @author Delphine CAUQUIL <delphine@tela-botanica.org> |
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org> |
* @license http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL |
* @license http://www.gnu.org/licenses/gpl.html Licence GNU-GPL |
* @version $Id$ |
* @copyright 2010 Tela-Botanica |
*/ |
class Recherche extends Ref { |
/** |
* Méthode principale appelée avec une requête de type GET. |
* Elle sert d'aiguilleur pour appeller la méthode correspondant au type de recherche passé en paramêtre. |
*/ |
public function getElement($param = array()) { |
// Initialisation des variables |
$info = array(); |
// Nous recherchons le type de requête demandé |
$type = $param[0]; |
$methode = 'getElement'.$type; |
if (method_exists($this, $methode)) { |
array_shift($param); |
$info = $this->$methode($param); |
} else { |
$this->messages[] = "Le type de recherche demandé '$type' n'est pas disponible."; |
} |
// Envoie sur la sortie standard |
$this->envoyer($info); |
} |
/* Méthode pour récupérer le nombre de taxons répondant à la requête |
* Appelée avec les paramètres d'url suivant : |
* /Recherche/Nombre/_ |
* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés |
* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur * |
*/ |
public function getElementNombre($param) { |
// Initialisation des variables |
$info = array(); |
// Pré traitement des paramètres |
$p = $this->pretraiterParametresUrl($param); |
$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2); |
// Construction de la requête |
// Il est important de compter le nombre de taxons pour l'affichage |
$requete = (($this->distinct) ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' COUNT(num_nom) AS nbre FROM '.$referentiel. |
$this->construireWhere($p, $referentiel).' '; |
// Récupération des résultats |
try { |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetch(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($donnees === false) { |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat : $requete"; |
} else { |
$info = $donnees['nbre']; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()).$requete; |
} |
return $info; |
} |
/* Méthode pour récupérer une liste de taxons |
* Appelée avec les paramêtres d'url suivant : |
* /Recherche/ParDefaut/_ |
* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés |
* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur * |
*/ |
public function getElementParDefaut($param) { |
// Initialisation des variables |
$info = array(); |
// Pré traitement des paramètres |
$p = $this->pretraiterParametresUrl($param); |
$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2); |
// Construction de la requête |
$requete = (($this->distinct) ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' num_nom, nom_sci, auteur, annee, '. |
'biblio_origine, nom_addendum, num_nom_retenu, presence, exclure_taxref'. |
' FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p, $referentiel). |
'ORDER BY '.((!is_null($this->orderby)) ? $this->orderby : 'nom_sci ASC').' '. |
"LIMIT $this->start, $this->limit "; |
// Récupération des résultats |
try { |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($donnees === false) { |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat : $requete"; |
} else { |
$info = $donnees; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()).$requete; |
} |
return $info; |
} |
/* Méthode pour récupérer le nombre de taxons répondant à une requête sur la synonymie |
* Appelée avec les paramètres d'url suivant : |
* /Recherche/Nombre/_ |
* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés |
* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur * |
*/ |
public function getElementNombreTaxon($param) { |
// Initialisation des variables |
$info = array(); |
// Pré traitement des paramètres |
$p = $this->pretraiterParametresUrl($param); |
$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2); |
// Construction de la requête |
// Il est important de compter le nombre de taxons pour l'affichage |
$requete = 'SELECT count(DISTINCT num_nom_retenu) as nbr FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p, $referentiel).';'; |
// Récupération des résultats |
try { |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetch(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($donnees === false) { |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat."; |
} else { |
$info = $donnees['nbr']; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
return $info; |
} |
/* Méthode pour récupérer une liste de taxons |
* Appelée avec les paramêtres d'url suivant : |
* /Recherche/ParDefaut/_ |
* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés |
* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur * |
*/ |
public function getElementParTaxon($param) { |
// Initialisation des variables |
$info = ''; |
// Pré traitement des paramètres |
$p = $this->pretraiterParametresUrl($param); |
$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2); |
$liste_nom = $this->getNomRetenu($param); |
if ($liste_nom != '') { |
// Construction de la requête |
// si recherche des synonymes |
$requete = (($this->distinct) ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' num_nom, nom_sci, auteur, annee, '. |
'biblio_origine, nom_addendum, num_nom_retenu, '.(($referentiel == "bdtfx" || $referentiel == "bdtre") ? 'num_basionyme' : |
'basionyme').', synonyme_mal_applique, presence, exclure_taxref '. |
' FROM '.$referentiel.' WHERE num_nom_retenu IN ('.$liste_nom.') '. |
'ORDER BY nom_sci ASC '; |
try { |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC); |
$info = $donnees; |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
} |
return $info; |
} |
/* Méthode pour récupérer une liste de taxons |
* Appelée avec les paramêtres d'url suivant : |
* /Recherche/ParDefaut/_ |
* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés |
* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur * |
*/ |
public function getElementNombreSynonymeParTaxon($param) { |
// Initialisation des variables |
$info = ''; |
// Pré traitement des paramètres |
$p = $this->pretraiterParametresUrl($param); |
$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2); |
$liste_nom = $this->getNomRetenu($param); |
if ($liste_nom != '') { |
// Construction de la requête |
// si recherche des synonymes |
$requete = (($this->distinct) ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' COUNT(num_nom) as nbr, num_nom_retenu '. |
'FROM '.$referentiel.' WHERE num_nom_retenu IN ('.$liste_nom.') GROUP BY num_nom_retenu '. |
'ORDER BY nom_sci ASC '; |
try { |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC); |
foreach($donnees as $ligne) { |
$info[$ligne['num_nom_retenu']] = $ligne['nbr']; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
} |
return $info; |
} |
/** |
* Récupérer le nombre de taxons d'une classifiation (infra ou supra) |
* Appelée avec les paramètres d'url suivant : |
* /Recherche/NombreClassif/_ |
* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés |
* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur * |
*/ |
public function getElementNombreClassif($param) { |
// Initialisation des variables |
$info = array(); |
// Pré traitement des paramètres |
$p = $this->pretraiterParametresUrl($param); |
$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2); |
$requete = ''; |
if (isset($p['classif'])) { |
if (!isset($p['nn'])) { |
$p['rg'] = 180; |
} |
if ($p['classif'] == 'infra') { |
$requete = 'SELECT COUNT(num_nom) as nbr '. |
'FROM '.$referentiel.' '. |
'WHERE num_tax_sup IN '. |
'(SELECT num_nom '. |
'FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p, $referentiel).') '; |
} else { |
$requete = 'SELECT count(distinct num_tax_sup) as nbr '. |
'FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p, $referentiel).' '; |
} |
} else { |
// Construction de la requête |
// Il est important de compter le nombre de taxons pour l'affichage |
$requete = 'SELECT count(DISTINCT num_nom_retenu) as nbr FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p, $referentiel).';'; |
} |
// Récupération des résultats |
try { |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetch(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($donnees === false) { |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat."; |
} else { |
$info = $donnees['nbr']; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
return $info; |
} |
/** |
* Récupérer le nombre de taxons d'une classifiation (infra ou supra) |
* Appelée avec les paramètres d'url suivant : |
* /Recherche/NombreClassif/_ |
* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés |
* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur * |
*/ |
public function getElementNombreClassifParTaxon($param) { |
// Initialisation des variables |
$info = array(); |
// Pré traitement des paramètres |
$p = $this->pretraiterParametresUrl($param); |
$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2); |
$requete = ''; |
if (isset($p['classif'])) { |
if (!isset($p['nn'])) { |
$p['rg'] = 180; |
} |
if ($p['classif'] == 'infra') { |
$requete = 'SELECT COUNT(num_nom) as nbr, num_tax_sup '. |
'FROM '.$referentiel.' '. |
'WHERE num_tax_sup IN '. |
'(SELECT num_nom '. |
'FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p, $referentiel).') GROUP BY num_tax_sup'; |
} else { |
$requete = 'SELECT count(distinct num_tax_sup) as nbr, num_tax_sup '. |
'FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p, $referentiel).' GROUP BY num_tax_sup'; |
} |
} else { |
// Construction de la requête |
// Il est important de compter le nombre de taxons pour l'affichage |
$requete = 'SELECT count(DISTINCT num_nom_retenu) as nbr, num_tax_sup FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p, $referentiel).' GROUP BY num_tax_sup;'; |
} |
// Récupération des résultats |
try { |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($donnees === false) { |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat."; |
} else { |
foreach($donnees as $ligne) { |
$info[$ligne['num_tax_sup']] = $ligne['nbr']; |
} |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
return $info; |
} |
/** |
* Récupérer la classification d'un taxon donné (ses enfants ou parents) |
* Appelée avec les paramêtres d'url suivant : |
* /Recherche/Hierarchie/_ |
* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés (dont classif est le sens de la requête infra ou supra) |
* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur * |
*/ |
public function getElementClassification($param) { |
$resultats = array(); |
try { |
$p = $this->pretraiterParametresUrl($param); |
$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2); |
$classif = $p['classif']; |
//Si on ne recherche pas sur un numéro taxonomique, on veut ne trouver que les familles |
if (!isset($p['nn'])) { |
$p['rg'] = 180; |
} |
// Récupérer les informations du nom sélectionné |
$requete = (($this->distinct) ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT'). |
' num_nom, nom_sci, auteur, annee, biblio_origine, nom_addendum,'. |
' num_nom_retenu, presence, exclure_taxref, num_tax_sup'. |
' FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p, $referentiel). |
' ORDER BY '.((!is_null($this->orderby)) ? $this->orderby : 'nom_sci ASC'); |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($donnees === false) { |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat : $requete"; |
} else { |
if ($classif == 'infra') { |
$resultats = $this->trouverInfra($referentiel, $donnees); |
} else { |
$resultats = $this->trouverSupra($referentiel, $donnees); |
} |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()).$requete; |
} |
return $resultats; |
} |
/** |
* Parcourir les données passées en paramètre pour trouver les taxons inférieurs |
* @param $referentiel String le référentiel pour la requête |
* @param $donnees Array un tableau de résultats contenant des lignes taxons |
* @return un tableau de résultats contenant les taxons inférieurs |
* */ |
public function trouverInfra($referentiel, $donnees) { |
$resultats = array(); |
foreach ($donnees as $taxon) { |
$donneesInfras = array(); |
$requete = 'SELECT DISTINCT '. |
' num_nom, nom_sci, auteur, annee, biblio_origine, nom_addendum,'. |
' num_nom_retenu, presence, exclure_taxref'. |
' FROM '.$referentiel. |
' WHERE num_tax_sup = '.$taxon['num_nom'].' '. |
' ORDER BY '.((!is_null($this->orderby)) ? $this->orderby : 'nom_sci ASC').' '. |
"LIMIT $this->start, $this->limit "; |
$donneesInfras = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($donneesInfras !== false) { |
$resultats = array_merge($resultats, $donneesInfras); |
} |
} |
return $resultats; |
} |
/** |
* Parcourir les données passées en paramètre pour trouver les taxons supérieurs |
* @param $referentiel String le référentiel pour la requête |
* @param $donnees Array un tableau de résultats contenant des lignes taxons |
* @return un tableau de résultats contenant les taxons supérieurs |
* */ |
public function trouverSupra($referentiel, $donnees) { |
$resultats = array(); |
$numNomSup = array(); |
foreach ($donnees as $taxon) { |
$numNomSup[] = $taxon['num_tax_sup']; |
} |
// Récupérer les taxons supérieurs : |
$requete = 'SELECT DISTINCT '. |
' num_nom, nom_sci, auteur, annee, biblio_origine, nom_addendum,'. |
' num_nom_retenu, presence, exclure_taxref, num_tax_sup'. |
' FROM '.$referentiel. |
' WHERE num_nom IN ('.implode(',', $numNomSup).') '. |
' ORDER BY '.((!is_null($this->orderby)) ? $this->orderby : 'nom_sci ASC').' '. |
"LIMIT $this->start, $this->limit "; |
$donneesSupras = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($donneesSupras !== false) { |
$resultats = $donneesSupras; |
} |
return $resultats; |
} |
/* Méthode pour récupérer une liste de noms retenus |
*/ |
public function getNomRetenu($param) { |
// Initialisation des variables |
$info = array(); |
// Pré traitement des paramètres |
$p = $this->pretraiterParametresUrl($param); |
$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2); |
// Construction de la requête |
// si recherche des synonymes |
$requete_nom_retenu = 'SELECT DISTINCT num_nom_retenu FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p, $referentiel) |
." ORDER BY nom_sci ASC LIMIT $this->start, $this->limit ".';'; |
try { |
$info = ''; |
$donnees_nom_retenu = $this->bdd->query($requete_nom_retenu)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($donnees_nom_retenu === false) { |
$this->messages[] = "La requête n'a retourné aucun résultat."; |
} else { |
$liste_nom = ''; |
foreach ($donnees_nom_retenu as $donnees_nom) { |
if ($donnees_nom['num_nom_retenu'] != '') { |
$liste_nom .= (!empty($liste_nom) ? ', ' : '').'"'.$donnees_nom['num_nom_retenu'].'"'; |
} |
} |
$info = $liste_nom; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
return $info; |
} |
private function pretraiterParametresUrl($param) { |
// Tableau des paramètres qui peuvent être passés dans l'url |
$params_passes = array('ref' => 'str', |
'mots' => 'str', |
'sg' => 'str_exact', |
'gen' => 'str_exact', |
'sp' => 'str_exact', |
'ssp' => 'str_exact', |
'au' => 'str', |
'an' => 'str', |
'nn' => 'int', |
'bib' => 'str', |
'nr' => 'bool', |
'tax' => 'bool', |
'pre' => 'bool', |
'taxref' => 'bool', |
'classif' => '', |
'rg' => 'int'); |
$p = $this->traiterParametresUrl(array_keys($params_passes), $param, false); |
//$this->debug[] = $param; |
foreach ($params_passes as $param_passe => $type) { |
if (isset($p[$param_passe])) { |
// Suppression des éventuels espaces en début et fin de chaine |
$valeur = trim($p[$param_passe]); |
// Type de paramètre chaine |
if ($type == 'str') { |
// Suppression des slash |
$valeur = stripslashes($valeur); |
// Utilisation d'une recherche de chaîne |
if (preg_match('/^"(.*)"$/', $valeur, $match)) { |
$valeur = '%'.$match[1].'%'; |
} elseif ($valeur == "#") { |
}else{ |
// Recherche de mots non liés |
$mots = explode(' ', $valeur); |
$valeur = '%'.implode ('%', $mots).'%'; |
} |
// Mise en place des quotes pour l'interrogation dans la bdd |
$valeur = $this->bdd->quote($valeur); |
} |
// Type de paramètre chaine exacte |
if ($type == 'str_exact') { |
// Suppression des slash |
$valeur = stripslashes($valeur); |
// Utilisation d'une recherche de chaîne exacte |
if (preg_match('/^"(.*)"$/', $valeur, $match)) { |
$valeur = $match[1]; |
} else { |
// Recherche de mots non liés |
$mots = explode(' ', $valeur); |
$valeur = implode (' ', $mots); |
} |
// Mise en place des quotes pour l'interrogation dans la bdd |
$valeur = $this->bdd->quote($valeur); |
} |
// Type de paramètre booléen |
if ($type == 'bool') { |
if (preg_match('/^[0]$/', $valeur)) { |
$valeur = false; |
} else if (preg_match('/^[1]$/', $valeur)) { |
$valeur = true; |
} else { |
$this->messages[] = "Le paramètre '$param_passe' attend une valeur de type 0 ou 1 et non '$valeur'."; |
$valeur = null; |
} |
} |
// Type de paramètre entier |
if ($type == 'int') { |
if (!preg_match('/^(?:[0-9]+,\s*)*[0-9]+$/', $valeur)) { |
$this->messages[] = "Le paramètre '$param_passe' attend une ou plusieurs valeurs de type entiers ". |
"séparés par des virgules et non '$valeur'."; |
$valeur = null; |
} |
} |
$p[$param_passe] = $valeur; |
} |
} |
return $p; |
} |
private function construireWhere($p, $referentiel) { |
// Initialisation de variables |
$where = ' WHERE '; |
// Construire where en fonction des paramêtres |
if (isset($p['mots'])) { |
if (stripos($p['mots'], "#") == 1) { |
$where .= " 1 "; |
} else { |
$where .= 'AND ('. |
" num_nom LIKE {$p['mots']} ". |
" OR num_nom_retenu LIKE {$p['mots']} ". |
" OR num_tax_sup LIKE {$p['mots']} ". |
" OR rang LIKE {$p['mots']} ". |
" OR nom_sci LIKE {$p['mots']} ". |
" OR nom_supra_generique LIKE {$p['mots']} ". |
" OR genre LIKE {$p['mots']} ". |
" OR epithete_infra_generique LIKE {$p['mots']} ". |
" OR epithete_sp LIKE {$p['mots']} ". |
" OR type_epithete LIKE {$p['mots']} ". |
" OR epithete_infra_sp LIKE {$p['mots']} ". |
" OR cultivar_groupe LIKE {$p['mots']} ". |
" OR cultivar LIKE {$p['mots']} ". |
" OR nom_commercial LIKE {$p['mots']} ". |
" OR auteur LIKE {$p['mots']} ". |
" OR annee LIKE {$p['mots']} ". |
" OR biblio_origine LIKE {$p['mots']} ". |
" OR notes LIKE {$p['mots']} ". |
" OR nom_addendum LIKE {$p['mots']} ". |
" OR homonyme LIKE {$p['mots']} ". |
" OR synonyme_proparte LIKE {$p['mots']} ". |
" OR synonyme_douteux LIKE {$p['mots']} ". |
" OR synonyme_mal_applique LIKE {$p['mots']} ". |
" OR synonyme_orthographique LIKE {$p['mots']} ". |
" OR hybride_parent_01 LIKE {$p['mots']} ". |
" OR hybride_parent_01_notes LIKE {$p['mots']} ". |
" OR hybride_parent_02 LIKE {$p['mots']} ". |
" OR hybride_parent_02_notes LIKE {$p['mots']} ". |
" OR nom_francais LIKE {$p['mots']} ". |
" OR presence LIKE {$p['mots']} ". |
" OR statut_origine LIKE {$p['mots']} ". |
" OR statut_introduction LIKE {$p['mots']} ". |
" OR statut_culture LIKE {$p['mots']} "; |
$where .= ($referentiel == "bdtfx") ? " OR num_basionyme LIKE {$p['mots']}) " : " OR basionyme LIKE {$p['mots']}) "; |
} |
} |
if (isset($p['sg'])) { |
$where .= "AND nom_supra_generique LIKE {$p['sg']} "; |
} |
if (isset($p['gen'])) { |
$where .= "AND genre LIKE ({$p['gen']}) "; |
} |
if (isset($p['sp'])) { |
$where .= "AND epithete_sp LIKE {$p['sp']} "; |
} |
if (isset($p['ssp'])) { |
$where .= "AND epithete_infra_sp LIKE {$p['ssp']} "; |
} |
if (isset($p['au'])) { |
$where .= "AND auteur LIKE {$p['au']} "; |
} |
if (isset($p['an'])) { |
$where .= "AND annee LIKE ({$p['an']}) "; |
} |
if (isset($p['nn'])) { |
$where .= "AND num_nom IN ({$p['nn']}) "; |
} |
if (isset($p['bib'])) { |
$where .= "AND biblio_origine LIKE ({$p['bib']}) "; |
} |
if (isset($p['nr']) && $p['nr'] == true) { |
$where .= "AND num_nom_retenu = num_nom "; |
} |
if (isset($p['pre']) && $p['pre'] == true) { |
$where .= "AND presence NOT IN ('A', '') "; |
} elseif(isset($p['pre']) && $p['pre'] != true) { |
$where .= "AND presence IN ('A', '') "; |
} |
if (isset($p['taxref'])) { |
$where .= "AND exclure_taxref ="; |
$where .= ($p['taxref'] == true) ? " 0 " : " 1 "; |
} |
if (isset($p['rg'])) { |
$where .= "AND rang = $p[rg] "; |
} |
$where = str_replace('WHERE AND', ' WHERE ', $where); |
// Retour du Where associé |
if (count($p) == 1) { |
$where = ""; |
} |
return $where; |
} |
} |
?> |
/branches/v2.0-betulales/services/modules/TableStructure.php |
---|
New file |
0,0 → 1,88 |
<?php |
/** |
* Service fournissant des informations sur la structure d'une table des référentiels. |
* Encodage en entrée : utf8 |
* Encodage en sortie : utf8 |
* |
* @category Php 5.2 |
* @package Referentiel |
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org> |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt> |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt> |
* @copyright 2010 Tela-Botanica |
* @version $Id$ |
*/ |
class TableStructure extends Ref { |
/** |
* Méthode principale appelée avec une requête de type GET. |
*/ |
public function getElement($param = array()) { |
// Initialisation des variables |
$info = array(); |
// Nour recherchons le type de requête demandé |
$p = $this->traiterParametresUrl(array('type', 'table'), $param, false); |
$type = $p['type']; |
$table = $p['table']; |
if (!is_null($type)) { |
if (!is_null($table)) { |
$methode = 'getElement'.$type; |
if (method_exists($this, $methode)) { |
//array_shift($param); |
$info = $this->$methode($table); |
} else { |
$this->messages[] = "Le type d'information demandé '$type' n'est pas disponible."; |
} |
} else { |
$this->messages[] = "Veuillez préciser le nom de la table comme premier paramêtre."; |
} |
} else { |
$this->messages[] = "Veuillez préciser le type de requête."; |
} |
// Envoie sur la sortie standard |
$this->envoyer($info); |
} |
/* Méthode pour récupérer des informations sur les colonnes d'une table. |
* Appelée avec les paramêtres d'url suivant : |
* /TableStructure/colonnes/nom_de_la_table |
*/ |
public function getElementColonnes($table) { |
$requete = "SHOW COLUMNS FROM `$table` "; |
// Récupération des résultats |
try { |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($donnees === false) { |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat."; |
} |
$info['colonnes'] = $donnees; |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
return $info; |
} |
/* Méthode pour récupérer un tableau d'analyse de la table. |
* Appelée avec les paramêtres d'url suivant : |
* /TableStructure/analyse/nom_de_la_table |
*/ |
public function getElementAnalyse($table) { |
$requete = "SELECT * FROM `$table` PROCEDURE ANALYSE ( )"; |
// Récupération des résultats |
try { |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($donnees === false) { |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat."; |
} |
$info['analyses'] = $donnees; |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
return $info; |
} |
} |
?> |
/branches/v2.0-betulales/services/modules/Ref.php |
---|
New file |
0,0 → 1,195 |
<?php |
/** |
* Classe mère abstraite contenant les méthodes génériques des services des Référentiels. |
* Encodage en entrée : utf8 |
* Encodage en sortie : utf8 |
* |
* @category Php 5.2 |
* @package Referentiel |
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org> |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt> |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt> |
* @copyright 2010 Tela-Botanica |
* @version $Id$ |
*/ |
abstract class Ref { |
public $config; |
protected $bdd; |
protected $messages = array(); |
protected $debug = array(); |
protected $distinct = false; |
protected $orderby = null; |
protected $formatRetour = 'objet'; |
protected $start = 0; |
protected $limit = 150; |
public function __construct($config, $demarrer_session = true) { |
// Tableau contenant la config de Jrest |
$this->config = $config; |
// Connection à la base de données |
$this->bdd = $this->connecterPDO($this->config, 'database'); |
// Nettoyage du $_GET (sécurité) |
if (isset($_GET)) { |
$get_params = array('orderby', 'distinct', 'start', 'limit', 'formatRetour'); |
foreach ($get_params as $get) { |
if (isset($_GET[$get])) { |
$verifier = array('NULL', "\n", "\r", "\\", "'", '"', "\x00", "\x1a", ';'); |
$_GET[$get] = strip_tags(str_replace($verifier, '', $_GET[$get])); |
if ($_GET[$get] != '') { |
$this->$get = $_GET[$get]; |
} else { |
$_GET[$get] = null; |
} |
} |
} |
} |
} |
/** |
* Méthode appelée quand aucun paramètre n'est passé dans l'url et avec une requête de type GET. |
*/ |
public function getRessource() { |
$this->getElement(array()); |
} |
protected function envoyer($donnees = null, $mime = 'text/html', $encodage = 'utf-8', $json = true) { |
// Traitements des messages d'erreurs et données |
if (count($this->messages) != 0) { |
header('HTTP/1.1 424 Method failure'); |
$sortie = $this->messages; |
// En plus de la réponse, nous passons les messages dans l'entete car la réponse ne peut pas être récupérée |
// avec ce type d'erreur HTTP en php.. |
// FIXME : comment récupérer en php le contenu de la réponse portant le code HTTP 424 ou 500 |
$this->envoyerEnteteMessage(); |
} else { |
$sortie = $donnees; |
} |
// Gestion de l'envoie du déboguage |
$this->envoyerEnteteDebogage(); |
// Encodage au format et JSON et envoie sur la sortie standard |
$contenu = $json ? json_encode($sortie) : $sortie; |
$mime = $json ? 'application/json' : $mime; |
$this->envoyerContenu($encodage, $mime, $contenu); |
} |
protected function envoyerEnteteMessage() { |
if (!is_array($this->messages)) { |
$this->messages[] = $this->messages; |
} |
if (count($this->messages) != 0) { |
foreach ($this->messages as $cle => $val) { |
if (is_array($val)) { |
$this->messages[$cle] = print_r($val, true); |
} |
} |
header('X-MessageJrest-Data: '.json_encode($this->messages)); |
} |
} |
protected function envoyerEnteteDebogage() { |
if (!is_array($this->debug)) { |
$this->debug[] = $this->debug; |
} |
if (count($this->debug) != 0) { |
foreach ($this->debug as $cle => $val) { |
if (is_array($val)) { |
$this->debug[$cle] = print_r($val, true); |
} |
} |
header('X-DebugJrest-Data: '.json_encode($this->debug)); |
} |
} |
protected function envoyerContenu($encodage, $mime, $contenu) { |
header("Content-Type: $mime; charset=$encodage"); |
print $contenu; |
} |
private function connecterPDO($config, $base = 'database') { |
$cfg = $config[$base]; |
$dsn = $cfg['phptype'].':dbname='.$cfg['database'].';host='.$cfg['hostspec']; |
try { |
$PDO = new PDO($dsn, $cfg['username'], $cfg['password']); |
} catch (PDOException $e) { |
echo 'La connexion à la base de donnée via PDO a échouée : ' . $e->getMessage(); |
} |
// Passe en UTF-8 la connexion à la BDD |
$PDO->exec("SET NAMES 'utf8'"); |
// Affiche les erreurs détectées par PDO (sinon mode silencieux => aucune erreur affiché) |
$PDO->setAttribute(PDO::ATTR_ERRMODE, PDO::ERRMODE_EXCEPTION); |
return $PDO; |
} |
protected function executerRequete($requete, $message_echec) { |
try { |
$infos = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($infos === false) { |
$this->messages[] = $message_echec; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur_requete'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage(), $requete); |
} |
return $infos; |
} |
protected function getTxt($id) { |
$sortie = ''; |
switch ($id) { |
case 'sql_erreur' : $sortie = 'Requête echec. Fichier : "%s". Ligne : "%s". Message : %s'; break; |
case 'sql_erreur_requete' : $sortie = "Requête echec.\nFichier : %s.\nLigne : %s.\nMessage : %s.\nRequête : %s"; break; |
default : $sortie = $id; |
} |
return $sortie; |
} |
protected function traiterParametresUrl($params_attendu, $params, $pourBDD = true) { |
$sortie = array(); |
foreach ($params_attendu as $num => $nom) { |
if (isset($params[$num]) && $params[$num] != '*') { |
if ($pourBDD) { |
$params[$num] = $this->bdd->quote($params[$num]); |
} |
$sortie[$nom] = $params[$num]; |
} |
} |
return $sortie; |
} |
protected function traiterParametresPost($params_attendu, $params, $pourBDD = true) { |
$sortie = array(); |
foreach ($params_attendu as $num => $nom) { |
if (isset($params[$nom]) && $params[$nom] != '') { |
if ($pourBDD) { |
$params[$nom] = $this->bdd->quote($params[$nom]); |
} |
$sortie[$nom] = $params[$nom]; |
} else { |
if ($pourBDD) { |
$sortie[$nom] = 'NULL'; |
} else { |
$sortie[$nom] = ''; |
} |
} |
} |
return $sortie; |
} |
protected function traiterBddClauseIn($chaine) { |
$sortie = ''; |
$chaine = trim($chaine, " '"); |
if ($chaine != '') { |
$valeurs = explode(',', $chaine); |
foreach ($valeurs as $id => $valeur) { |
$valeurs[$id] = $this->bdd->quote($valeur); |
} |
$sortie = implode(',', $valeurs); |
} |
return $sortie; |
} |
} |
?> |
/branches/v2.0-betulales/services/modules/Traitement.php |
---|
New file |
0,0 → 1,408 |
<?php |
/** |
* Service permettant d'enregistrer une demande de traitement ou de consulter les infos sur les traitements. |
* Encodage en entrée : utf8 |
* Encodage en sortie : utf8 |
* |
* @category Php 5.2 |
* @package Referentiel |
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org> |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt> |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt> |
* @copyright 2010 Tela-Botanica |
* @version $Id$ |
*/ |
class Traitement extends Ref { |
/** |
* Méthode principale appelée avec une requête de type GET. |
*/ |
public function getElement($params_url = array()) { |
// Initialisation des variables |
$info = null; |
// Nour recherchons le type de requête demandé |
$p = $this->traiterParametresUrl(array('type'), $params_url, false); |
extract($p); |
if (!is_null($type)) { |
$methode = 'getElement'.$type; |
if (method_exists($this, $methode)) { |
array_shift($params_url); |
$info = $this->$methode($params_url); |
} else { |
$this->messages[] = "Le type d'information demandé '$type' n'est pas disponible."; |
} |
} else { |
$this->messages[] = "Veuillez préciser le type de requête."; |
} |
// Envoie sur la sortie standard |
$this->envoyer($info); |
} |
/** Méthode pour récupérer les infos d'un traitement. |
* Appelée avec les paramêtres d'url suivant : |
* /Traitement/Info/id_traitement |
* |
* @return mixed les infos du traitement ou false en cas d'échec. |
*/ |
public function getElementInfo($params_url) { |
$p = $this->traiterParametresUrl(array('id'), $params_url); |
extract($p); |
$infos = false; |
if (!is_null($id)) { |
$requete = 'SELECT * '. |
"FROM ref_traitement ". |
"WHERE id_traitement = $id "; |
// Récupération des résultats |
try { |
$infos = $this->bdd->query($requete)->fetch(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($infos === false) { |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat."; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
} else { |
$this->messages[] = "Veuillez préciser l'identifinat du traitement comme premier paramêtre (ex. : 38)."; |
} |
return $infos; |
} |
/** |
* Retourne les infos sur la dernière demande de traitement pour un projet donné. |
*/ |
public function getElementDerniereDemande($params_url) { |
$p = $this->traiterParametresUrl(array('projet', 'script'), $params_url); |
extract($p); |
$donnees = false; |
if (isset($projet) && isset($script)) { |
$requete = ($this->distinct ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' * '. |
'FROM ref_traitement '. |
"WHERE ".(($projet == "'tout'") ? '' : 'referentiel_code = '.$projet.' AND ') . |
" script = $script ". |
' AND date_debut IS NULL '. |
' AND date_fin IS NULL '. |
'ORDER BY '.((!is_null($this->orderby)) ? $this->orderby : 'meta_date_creation DESC').' '. |
'LIMIT 0,1 '; |
// Récupération des résultats |
try { |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetch(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($donnees === false) { |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat."; |
} else if (0 == count($donnees)) { |
$donnees = null; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
} else { |
$this->messages[] = "Veuillez préciser le nom de code du projet comme premier paramêtre (ex. : bdnff) ". |
"et le code du script à lancer comme second paramêtre (ex. : tests ou versionnage)."; |
} |
return $donnees; |
} |
/** |
* Retourne les infos sur les traitements en attente. |
*/ |
public function getElementEnAttente($params_url) { |
$p = $this->traiterParametresUrl(array('projet', 'script'), $params_url); |
extract($p); |
$donnees = null; |
if (isset($projet) && isset($script)) { |
$requete = ($this->distinct ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' * '. |
'FROM ref_traitement '. |
"WHERE referentiel_code = $projet ". |
" AND script = $script ". |
' AND date_debut IS NULL '. |
' AND date_fin IS NULL '. |
'ORDER BY '.((!is_null($this->orderby)) ? $this->orderby : 'meta_date_creation DESC').' '; |
// Récupération des résultats |
try { |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($donnees === false) { |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat."; |
} else if (0 == count($donnees)) { |
$donnees = null; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
} else { |
$this->messages[] = "Veuillez préciser le nom de code du projet comme premier paramêtre (ex. : bdnff) ". |
"et le code du script à lancer comme second paramêtre (ex. : tests ou versionnage)."; |
} |
return $donnees; |
} |
/** |
* Retourne les infos sur les traitements en cours. |
*/ |
public function getElementEnCours($params_url) { |
$p = $this->traiterParametresUrl(array('projet', 'script'), $params_url); |
extract($p); |
$donnees = null; |
if (isset($projet) && isset($script)) { |
$requete = ($this->distinct ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' * '. |
'FROM ref_traitement '. |
"WHERE referentiel_code = $projet ". |
" AND script = $script ". |
' AND date_debut IS NOT NULL '. |
' AND date_fin IS NULL '. |
'ORDER BY '.((!is_null($this->orderby)) ? $this->orderby : 'meta_date_creation DESC').' '; |
// Récupération des résultats |
try { |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($donnees === false) { |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat."; |
} else if (0 == count($donnees)) { |
$donnees = null; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
} else { |
$this->messages[] = "Veuillez préciser le nom de code du projet comme premier paramêtre (ex. : bdnff) ". |
"et le code du script à lancer comme second paramêtre (ex. : tests ou versionnage)."; |
} |
return $donnees; |
} |
/** |
* Retourne les id des demandes de traitements obsolètes. |
*/ |
public function getElementObsolete($params_url) { |
$p = $this->traiterParametresUrl(array('projet', 'script'), $params_url); |
extract($p); |
$sortie = null; |
if (isset($projet) && isset($script)) { |
try { |
$requete = 'SELECT MAX(date_debut) '. |
'FROM ref_traitement '. |
"WHERE referentiel_code = $projet ". |
" AND script = $script ". |
' AND date_debut IS NOT NULL '. |
'GROUP BY referentiel_code '; |
$date_max = $this->bdd->query($requete)->fetchColumn(); |
if ($date_max === false) { |
$this->messages[] = "La requête de récupération de la date de début max a échouée."; |
} else { |
$date_max = $this->bdd->quote($date_max); |
$requete = 'SELECT id_traitement '. |
'FROM ref_traitement '. |
"WHERE referentiel_code = $projet ". |
" AND script = $script ". |
' AND date_debut IS NULL '. |
' AND date_fin IS NULL '. |
" AND meta_date_creation < $date_max "; |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($donnees === false) { |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat."; |
} |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
// Pos-traitement |
if ($donnees != false) { |
foreach ($donnees as $donnee) { |
$sortie[] = $donnee['id_traitement']; |
} |
} |
} else { |
$this->messages[] = "Veuillez préciser le nom de code du projet comme premier paramêtre (ex. : bdnff) ". |
"et le code du script à lancer comme second paramêtre (ex. : tests ou versionnage)."; |
} |
return $sortie; |
} |
/** |
* Retourne les infos sur les traitements terminés. |
*/ |
public function getElementTermines($params_url) { |
$p = $this->traiterParametresUrl(array('projet', 'script'), $params_url); |
extract($p); |
$donnees = null; |
if (isset($projet) && isset($script)) { |
$requete = ($this->distinct ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' * '. |
'FROM ref_traitement '. |
"WHERE referentiel_code = $projet ". |
" AND script = $script ". |
' AND date_debut IS NOT NULL '. |
' AND date_fin IS NOT NULL '. |
'ORDER BY '.((!is_null($this->orderby)) ? $this->orderby : 'meta_date_creation DESC').' '; |
// Récupération des résultats |
try { |
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC); |
if ($donnees === false) { |
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat."; |
} else if (0 == count($donnees)) { |
$donnees = null; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage()); |
} |
} else { |
$this->messages[] = "Veuillez préciser le nom de code du projet comme premier paramêtre (ex. : bdnff) ". |
"et le code du script à lancer comme second paramêtre (ex. : tests ou versionnage)."; |
} |
return $donnees; |
} |
/** |
* Méthode appelée pour ajouter un traitement. |
* Retour l'id du nouvel enregistrement ou false! |
*/ |
public function createElement($params_post) { |
$params_proteges = $this->traiterParametresPost(array('referentiel_code', 'script', 'script_parametres'), $params_post); |
$meta_date_creation = date ('Y-m-d H:i:s'); |
$nom = $this->bdd->quote("Traitement {$params_post['referentiel_code']} - $meta_date_creation"); |
$meta_date_creation = $this->bdd->quote($meta_date_creation); |
try { |
$requete = "INSERT INTO ref_traitement ". |
' (referentiel_code, script, script_parametres, nom, meta_date_creation) '. |
" VALUES ({$params_proteges['referentiel_code']}, {$params_proteges['script']}, {$params_proteges['script_parametres']}, $nom, $meta_date_creation) "; |
$resultat = $this->bdd->exec($requete); |
if ($resultat === false) { |
$id = false; |
$this->debug[] = "Traitement NON ajouté."; |
} else { |
$id = $this->bdd->lastInsertId(); |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage(), $requete); |
} |
$this->envoyer($id); |
} |
/** |
* Méthode principale appelée avec une requête de type POST. |
*/ |
public function updateElement($params_url, $params_post) { |
// Initialisation des variables |
$info = array(); |
// Nour recherchons le type de requête demandé |
extract($this->traiterParametresUrl(array('id'), $params_url, true)); |
extract($this->traiterParametresPost(array('action'), $params_post, false)); |
if (!is_null($id)) { |
if (!is_null($action)) { |
$methode = 'updateElement'.$action; |
if (method_exists($this, $methode)) { |
//array_shift($param); |
$info = $this->$methode($id, $params_post); |
} else { |
$this->messages[] = "Le type de mise à jour demandé '$action' n'est pas disponible."; |
} |
} else { |
$this->messages[] = "Veuillez préciser le type de mise à jour à faire."; |
// TODO : coder une mise à jour générique dans une méthode updateElementDefaut($id, $params_post); |
} |
} else { |
$this->messages[] = "Veuillez préciser l'id du traitement comme premier paramêtre dans l'url."; |
} |
// Envoie sur la sortie standard |
$this->envoyer($info); |
} |
/** |
* Méthode pour indiquer le démarage d'un traitement. |
*/ |
public function updateElementDebuter($id, $params_post) { |
$ok = true; |
try { |
$requete = 'UPDATE ref_traitement '. |
'SET date_debut = NOW() '. |
"WHERE id_traitement = $id "; |
$this->debug[] = "$requete"; |
$resultat = $this->bdd->exec($requete); |
if ($resultat === false) { |
$ok = false; |
$this->messages[] = "Traitement NON modifié."; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage(), $requete); |
} |
return $ok; |
} |
/** |
* Méthode pour indiquer la fin d'un traitement. |
*/ |
public function updateElementTerminer($id, $params_post) { |
$ok = true; |
try { |
$requete = 'UPDATE ref_traitement '. |
'SET date_fin = NOW(), duree = TIMEDIFF(NOW(), date_debut) '. |
"WHERE id_traitement = $id "; |
$this->debug[] = "$requete"; |
$resultat = $this->bdd->exec($requete); |
if ($resultat === false) { |
$ok = false; |
$this->messages[] = "Traitement NON modifié."; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage(), $requete); |
} |
return $ok; |
} |
/** |
* Méthode principale appelée avec une requête de type DELETE. |
*/ |
public function deleteElement($params_url) { |
// Initialisation des variables |
$ok = true; |
// Extraction des paramètres de l'url |
extract($this->traiterParametresUrl(array('ids'), $params_url, true)); |
if (!is_null($ids)) { |
try { |
$in_ids = $this->traiterBddClauseIn($ids); |
$requete = 'DELETE FROM ref_traitement '. |
"WHERE id_traitement IN ($in_ids) "; |
$this->debug[] = "$requete"; |
$resultat = $this->bdd->exec($requete); |
if ($resultat === false) { |
$ok = false; |
$this->messages[] = "Traitement(s) NON supprimé(s)."; |
} |
} catch (PDOException $e) { |
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage(), $requete); |
} |
} else { |
$this->messages[] = "Veuillez préciser un ou plusieurs id de traitement séparés par des virgules comme premier paramètre dans l'url."; |
} |
// Envoie sur la sortie standard |
$this->envoyer($ok); |
} |
} |
?> |