/branches/v2.1-emondoir/widget/modules/saisie/configurations/defaut.ini |
---|
4,4 → 4,4 |
bdtfx.version = 1.01 |
bdtxa.version = 1.00 |
isfan.version = 1.00 |
bdtao.version = 1.00 |
apd.version = 3.4.0 |
/branches/v2.1-emondoir/widget/modules/saisie/squelettes/defaut/defaut.tpl.html |
---|
373,7 → 373,7 |
<option value="bdtfx" selected="selected" title="Trachéophytes de France métropolitaine">Métropole (BDTFX)</option> |
<option value="bdtxa" title="Trachéophytes des Antilles">Antilles françaises (BDTXA)</option> |
<option value="isfan" title="Afrique du Nord">Afrique du Nord (ISFAN)</option> |
<option value="bdtao" title="Afrique de l'Ouest et du Centre">Afrique de l'Ouest et du Centre (BDTAO)</option> |
<option value="apd" title="Afrique de l'Ouest et du Centre">Afrique de l'Ouest et du Centre (APD)</option> |
</select> |
</span> |
</div> |
/branches/v2.1-emondoir/widget/modules/saisie/squelettes/defaut/js/defaut.js |
---|
132,7 → 132,7 |
// @TODO tester le filtrage par bounding box : https://developers.google.com/maps/documentation/geocoding/#Viewports |
switch(NOM_SCI_PROJET) { |
case 'isfan': |
case 'bdtao': |
case 'apd': |
region = ''; |
suffixeTerme = ''; |
} |
224,7 → 224,7 |
} else if(NOM_SCI_PROJET == 'isfan') { |
var latLng = new google.maps.LatLng(29.28358, 10.21884);// Afrique du Nord |
var zoomDefaut = 4; |
} else if(NOM_SCI_PROJET == 'bdtao') { |
} else if(NOM_SCI_PROJET == 'apd') { |
var latLng = new google.maps.LatLng(8.75624, 1.80176);// Afrique de l'Ouest et du Centre |
var zoomDefaut = 4; |
} else { |
701,7 → 701,7 |
'num_nom_ret' : $("#taxon").data("numNomRet"), |
'num_taxon' : $("#taxon").data("nt"), |
'famille' : $("#taxon").data("famille"), |
'referentiel' : ($("#taxon").data("numNomSel") == undefined ? '' : NOM_SCI_REFERENTIEL), |
'referentiel' : ($("#taxon").data("numNomSel") == undefined ? '' : NOM_SCI_PROJET), |
'latitude' : $("#latitude").val(), |
'longitude' : $("#longitude").val(), |
/branches/v2.1-emondoir/widget/modules/saisie |
---|
Property changes: |
Modified: svn:mergeinfo |
Merged /trunk/widget/modules/saisie:r2155,2157-2159,2161 |
/branches/v2.1-emondoir/widget |
---|
Property changes: |
Modified: svn:mergeinfo |
Merged /trunk/widget:r2155,2157-2159,2161 |
/branches/v2.1-emondoir/jrest/services/CelValidationObservation.php |
---|
97,7 → 97,7 |
const bdtfx = 'bdtfx_v2_00'; |
const bdtxa = 'bdtxa_v1_01'; |
const isfan = 'isfan_v2013'; |
const bdtao = 'bdtao_v1_00'; |
const apd = 'apd_v1_00'; |
// get from num_nom(_sel) |
static function NN($db, $id, $ref) { |
131,12 → 131,12 |
" FROM %s.%s o". |
" LEFT JOIN %s.%s ret ON o.num_nom_retenu != 0 AND o.num_nom_retenu = ret.num_nom". |
" WHERE o.num_nom = %d -- %s:%d", self::db, self::isfan, self::db, self::isfan, intval($id), __FILE__, __LINE__))->fetch(PDO::FETCH_ASSOC); |
case "bdtao": |
case "apd": |
return $db->query(sprintf("SELECT o.num_nom_retenu AS nom_ret_nn, o.num_taxonomique AS nt, CONCAT(o.nom_sci, ' ', o.auteur) AS nom_sel". |
" , o.famille, CONCAT(ret.nom_sci, ' ', ret.auteur) AS nom_ret". |
" FROM %s.%s o". |
" LEFT JOIN %s.%s ret ON o.num_nom_retenu != 0 AND o.num_nom_retenu = ret.num_nom". |
" WHERE o.num_nom = %d -- %s:%d", self::db, self::bdtao, self::db, self::bdtao, intval($id), __FILE__, __LINE__))->fetch(PDO::FETCH_ASSOC); |
" WHERE o.num_nom = %d -- %s:%d", self::db, self::apd, self::db, self::apd, intval($id), __FILE__, __LINE__))->fetch(PDO::FETCH_ASSOC); |
} |
return FALSE; |
} |
/branches/v2.1-emondoir/jrest/services/CelObs.php |
---|
15,16 → 15,25 |
* @copyright © 2013, Jean-Pascal MILCENT |
*/ |
class CelObs extends Cel { |
private $rechercheObs = null; |
private $chpsEtendus = null; |
private $donnees = null; |
public function __construct($config) { |
parent::__construct($config); |
$this->rechercheObs = new RechercheObservation($config); |
$this->chpsEtendus = new GestionChampsEtendus($config, 'obs'); |
$this->chargerNomsTablesReferentiels(); |
} |
private function chargerNomsTablesReferentiels() { |
// Créé des attributs avec le code du référentiel : bdtfx, bdtxa, apd, isfan |
foreach ( $this->config['referentiels'] as $referentiel => $table) { |
$this->$referentiel = $table; |
} |
} |
function getElement($ressources){ |
$retour = false; |
$idObs = $ressources[0]; |
96,4 → 105,179 |
} |
return $retour; |
} |
/** |
* Méthode appelée avec une requête de type POST et un identifiant d'observation. |
* Modifie une observation en fonction des informations envoyées en POST. |
* Utilisé par: |
* - service:del:0.1/determinations/ : ValiderDetermination.php::modifierObservationParDetermination() |
* - service:del:0.1/observations/#idObs [POST] : pour dépublier une observation |
* |
* @param $uid array $uid[0] (int) : identifiant observation |
* @param pairs array tableau contenant les champs à modifier sous la forme : nom_du_champ=nouvelle_valeur |
*/ |
public function updateElement($ressources, $donnees) { |
$this->donnees = $donnees; |
if ($this->controlerAccessibiliteWs()) { |
if ($this->controleAppelIpAutorisee()) { |
$idObs = isset($ressources[0]) ? $ressources[0] : ''; |
$this->verifierIdentifiantObs($idObs); |
if (count($this->donnees) == 1) { |
$donneesObligatoires = array('transmission'); |
if ($this->verifierDonneesObligatoires($donneesObligatoires)) { |
$this->depublierObs($idObs); |
} |
} else if (count($this->donnees) == 4) { |
$donneesObligatoires = array('id_observation', 'nom_sel_nn', 'nom_referentiel', 'id_utilisateur'); |
if ($this->verifierDonneesObligatoires($donneesObligatoires)) { |
$this->accepterPropositionDEL($idObs); |
} |
} else { |
$msg = "La modification complète d'une observation n'est pas implémentée."; |
$this->envoyerMessageErreur(501, $msg); |
} |
$this->envoyer('ok'); |
} |
} |
} |
private function verifierIdentifiantObs($chaine) { |
$ok = preg_match('/^[0-9]+$/', $chaine); |
if ($ok == false) { |
$msg = "Indiquer un seul identifiant numérique d'observation."; |
$this->envoyerMessageErreur(412, $msg); |
} |
return $ok; |
} |
private function verifierDonneesObligatoires($champsObligatoires) { |
foreach ($champsObligatoires as $param) { |
if (! isset($this->donnees[$param])) { |
$msg = sprintf("Paramètre %s manquant (parmi %s)", $param, implode(', ', $champsObligatoires)); |
$this->envoyerMessageErreur(412, $msg); |
} |
} |
return true; |
} |
private function depublierObs($idObs) { |
$gestionnaireObs = new GestionObservation($this->config); |
$depublication = $gestionnaireObs->modifierTransmissionObservation($idObs, false); |
if ($depublication === false) { |
$msg = "Un problème est survenu (voir log). Les observations n'ont pas pu être dépubliées."; |
$this->envoyerMessageErreur(304, $msg); |
} |
} |
/** |
* Modifie une observation aveec les infos d'une proposition : |
* Nous complétons les données de la proposition acceptée ici car: |
* 1) la table tb_del.del_commentaire ne contient pas toutes les informations nécessaires |
* 2) la table tb_del.del_commentaire ne *devrait* pas contenir beaucoup plus que nom_sel et nom_sel_nn |
* 3) la génération de ces données ici, au moment de l'UPDATE, est le meilleur garant de leur fiabilité |
*/ |
private function accepterPropositionDEL($idObs) { |
$gestion_observation = new GestionObservation($this->config); |
$donnees = array_map('trim', $this->donnees); |
$idUtilisateur = $donnees['id_utilisateur']; |
$donneesAModifier = array( |
'certitude' => 'Certaine', |
'nom_referentiel' => $donnees['nom_referentiel'], |
); |
// TODO : la récupération des infos du nom est aussi effectué par la suite voir ce qu'il faut garder |
$infosNoms = $this->getNomInfos($donnees['nom_sel_nn'], $donnees['nom_referentiel']); |
if ($infosNoms) { |
$donneesAModifier = array_merge($donneesAModifier, $infosNoms); |
} |
$modification = $gestion_observation->modifierObservationPublique($idObs, $donneesAModifier); |
if ($modification) { |
// supression des éventuelles liaison de l'obs avec le mot clé contenu dans obsKeywordDelete |
$gestionMotsClesObs = new GestionMotsClesChemin($this->config, 'obs'); |
$supp_liaison_mot_cle = $gestionMotsClesObs->supprimerLiaisonPourMotCleEtIdElementLie('aDeterminer', $idObs, $idUtilisateur); |
} else { |
$msg = "Impossible de modifier l'observation associée à cet identifiant. Erreur mysql : " . mysql_error(); |
$this->envoyerMessageErreur(500, $msg);// Internal Server Error |
} |
} |
// TODO : cette méthode et celles qui en dépendent sont peut être inutiles au vue de la méthode traiterEspece() de GestionObservation |
private function getNomInfos($id_nom, $code_referentiel) { |
$retour = false; |
if ($id_nom && $code_referentiel) { |
switch ($code_referentiel) { |
case 'bdtfx' : |
$retour = $this->getInfosBdtfx($id_nom); |
break; |
case 'bdtxa' : |
$retour = $this->getInfosBdtxa($id_nom); |
break; |
case 'isfan' : |
$retour = $this->getInfosIsfan($id_nom); |
break; |
case 'apd' : |
$retour = $this->getInfosApd($id_nom); |
break; |
} |
} |
return $retour; |
} |
private function getInfosBdtfx($id_nom) { |
$idNomP = CEL::db()->proteger($id_nom); |
$requete = "SELECT o.num_nom_retenu AS nom_ret_nn, o.num_taxonomique AS nt, o.famille, ". |
" CONCAT(o.nom_sci, ' ', o.auteur) AS nom_sel, ". |
" CONCAT(ret.nom_sci, ' ', ret.auteur) AS nom_ret ". |
"FROM {$this->bdtfx} AS o ". |
" LEFT JOIN {$this->bdtfx} AS ret ON (o.num_nom_retenu != 0 AND o.num_nom_retenu = ret.num_nom) ". |
"WHERE o.num_nom = $idNomP ". |
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__; |
$resultat = Cel::db()->requeterLigne($requete); |
return $resultat; |
} |
private function getInfosBdtxa($id_nom) { |
$idNomP = CEL::db()->proteger($id_nom); |
// Champ "num_tax" au lieu de "num_taxonomique" |
$requete = "SELECT o.num_nom_retenu AS nom_ret_nn, o.num_tax AS nt, o.famille, ". |
" CONCAT(o.nom_sci, ' ', o.auteur) AS nom_sel, ". |
" CONCAT(ret.nom_sci, ' ', ret.auteur) AS nom_ret ". |
"FROM {$this->bdtxa} AS o ". |
" LEFT JOIN {$this->bdtxa} AS ret ON (o.num_nom_retenu != 0 AND o.num_nom_retenu = ret.num_nom) ". |
"WHERE o.num_nom = $idNomP ". |
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__; |
$resultat = Cel::db()->requeterLigne($requete); |
return $resultat; |
} |
private function getInfosIsfan($id_nom) { |
$idNomP = CEL::db()->proteger($id_nom); |
// Champ "num_tax" au lieu de "num_taxonomique" |
$requete = "SELECT o.num_nom_retenu AS nom_ret_nn, o.num_taxonomique AS nt, o.famille, ". |
" CONCAT(o.nom_sci, ' ', o.auteur) AS nom_sel, ". |
" CONCAT(ret.nom_sci, ' ', ret.auteur) AS nom_ret ". |
"FROM {$this->isfan} AS o ". |
" LEFT JOIN {$this->isfan} AS ret ON (o.num_nom_retenu != 0 AND o.num_nom_retenu = ret.num_nom) ". |
"WHERE o.num_nom = $idNomP ". |
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__; |
$resultat = Cel::db()->requeterLigne($requete); |
return $resultat; |
} |
private function getInfosApd($id_nom) { |
$idNomP = CEL::db()->proteger($id_nom); |
// Champ "num_tax" au lieu de "num_taxonomique" |
$requete = "SELECT o.num_nom_retenu AS nom_ret_nn, o.num_taxonomique AS nt, o.famille, ". |
" CONCAT(o.nom_sci, ' ', o.auteur) AS nom_sel, ". |
" CONCAT(ret.nom_sci, ' ', ret.auteur) AS nom_ret ". |
"FROM {$this->apd} AS o ". |
" LEFT JOIN {$this->apd} AS ret ON (o.num_nom_retenu != 0 AND o.num_nom_retenu = ret.num_nom) ". |
"WHERE o.num_nom = $idNomP ". |
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__; |
$resultat = Cel::db()->requeterLigne($requete); |
return $resultat; |
} |
} |
/branches/v2.1-emondoir/jrest/services/ImportXLS.php |
---|
710,7 → 710,7 |
//if(strpos($referentiel, 'bdnff') !== FALSE) return 'bdnff'; //:4.02'; |
if(strpos($referentiel, 'bdnff') !== FALSE) return 'bdtfx'; |
if(strpos($referentiel, 'isfan') !== FALSE) return 'isfan'; //:v1.00'; |
if(strpos($referentiel, 'bdtao') !== FALSE) return 'bdtao'; //:v1.00'; |
if(strpos($referentiel, 'apd') !== FALSE) return 'apd'; //:v1.00'; |
if(strpos($referentiel, 'autre') !== FALSE) return 'autre'; |
if($referentiel && isset($ligne[C_NOM_SEL]) && $ligne[C_NOM_SEL]) { |
/branches/v2.1-emondoir/jrest/lib/Cel.php |
---|
38,7 → 38,7 |
protected $start; |
protected $limit; |
static $referentiels_valides = array('bdtfx', 'bdtxa', 'isfan', 'bdtao'); |
static $referentiels_valides = array('bdtfx', 'bdtxa', 'isfan', 'apd'); |
static $default_referentiel = 'bdtfx'; |
static $fallback_referentiel = 'autre'; |
/branches/v2.1-emondoir/jrest/jrest.ini.php.defaut |
---|
37,7 → 37,6 |
; URL des services web du CEL sous forme de template à utiliser avec sprintf |
baseURLServicesAnnuaireTpl = "http://www.tela-botanica.org/service:annuaire:%s" |
; Default |
[eflore] |
phptype = mysqli |
username = |
54,7 → 53,14 |
url_service_nom_attribution = "http://localhost/service:eflore:0.1/{referentiel}/noms-vernaculaires/attributions?masque.nt={valeur}&masque.lg={langue}" |
; Images |
[referentiels] |
; Nom des tables des référentiels avec leur version actuellement utilisé pour récupérer les infos des noms |
; ATTENTION : Bien préciser le nom de la base devant le nom de la table ! |
bdtfx = "tb_eflore.bdtfx_v2_00" |
bdtxa = "tb_eflore.bdtxa_v1_01" |
isfan = "tb_eflore.isfan_v2013" |
apd = "tb_eflore.apd_v3_4_0" |
[cel] |
chemin_images = /opt/lampp/htdocs/Documents/images_serveur |
chemin_export = /opt/lampp/htdocs/Documents/export_images |
86,7 → 92,6 |
commande_script_images = "/usr/local/php/5.5/bin/php /home/apitela/www/scripts/cel/cli.php generationimages -a genererMinaturesPourId -id %s &"; |
; Stockage |
[database_cel] |
phptype = mysqli |
username = |
107,14 → 112,12 |
ann_pwd = U_PASSWD |
pass_crypt_funct = md5 |
; LOGS |
[log] |
cheminlog = "/home/Logs/" |
timezone = "Europe/Paris" |
taillemax = 100000 |
; ADMIN |
[jrest_admin] |
admin = aurelien@tela-botanica.org,david.delon@clapas.net,jpm@tela-botanica.org,marie@tela-botanica.org |
ip_autorisees = "localhost,www.tela-botanica.org, api.tela-botanica.org" |
ip_autorisees = "127.0.0.1,193.54.123.216,193.54.123.169" |
;*/?> |
/branches/v2.1-emondoir/src/org/tela_botanica/client/modeles/dao/ObservationAsynchroneDAO.java |
---|
70,7 → 70,7 |
+"&abondance="+URL.encodeComponent(""+obs.getAbondance()) |
+"&certitude="+URL.encodeComponent(""+obs.getCertitude()) |
+"&phenologie="+URL.encodeComponent(""+obs.getPhenologie()) |
+"&nom_referentiel="+URL.encodeComponent(""+obs.getReferentielTaxo()) |
+"&nom_referentiel="+URL.encodeComponent(""+obs.getCodeCourtReferentielTaxo()) |
+"&obs_etendue="+URL.encodeComponent(""+Util.convertirChampsEtendusEnChaineRequete(obs.getChampsEtendus())); |
try { |
125,7 → 125,7 |
+"&abondance="+URL.encodeComponent(""+obs.getAbondance()) |
+"&certitude="+URL.encodeComponent(""+obs.getCertitude()) |
+"&phenologie="+URL.encodeComponent(""+obs.getPhenologie()) |
+"&nom_referentiel="+URL.encodeComponent(""+obs.getReferentielTaxo()) |
+"&nom_referentiel="+URL.encodeComponent(""+obs.getCodeCourtReferentielTaxo()) |
+"&obs_etendue="+URL.encodeComponent(""+Util.convertirChampsEtendusEnChaineRequete(obs.getChampsEtendus())); |
try { |
/branches/v2.1-emondoir/src/org/tela_botanica/client/modeles/objets/Observation.java |
---|
319,8 → 319,13 |
public String getCodeCourtReferentielTaxo() { |
String codeRef = ""; |
if(!getReferentielTaxo().equals("") && getReferentielTaxo().length() >= 5) { |
codeRef = referentielTaxo.substring(0, 5); |
if(!getReferentielTaxo().equals("") && getReferentielTaxo().length() >= 3) { |
int positionDeuxPoints = referentielTaxo.indexOf(':'); |
if (positionDeuxPoints == -1) { |
codeRef = referentielTaxo; |
} else { |
codeRef = referentielTaxo.substring(0, positionDeuxPoints); |
} |
} |
return codeRef; |
} |
/branches/v2.1-emondoir/war/config.defaut.js |
---|
10,7 → 10,7 |
utiliseRedirectionImage:"1", |
referentielGeo:"WGS84", |
cleGoogleMaps:"ABQIAAAADBUAHF9l14gI02QVAbUYJBRqPsByHDhzHLE0yoC9hASLZaFmoRT4_9Zkiscf-BaH_gEy7DVHX5BxwQ", |
referentielsDispos:"bdtfx:v2.00,Métropole (BDTFX);bdtxa:v1.01,Antilles Françaises (BDTXA);isfan:v1.00,Afrique du Nord (ISFAN);bdtao:v1.00,Afrique de l'Ouest et du Centre (BDTAO);autre,Autre/Inconnu", |
referentielsDispos:"bdtfx:v2.00,Métropole (BDTFX);bdtxa:v1.01,Antilles Françaises (BDTXA);isfan:v1.00,Afrique du Nord (ISFAN);apd:v3.4.0,Afrique de l'Ouest et du Centre (APD);autre,Autre/Inconnu", |
refTaxVersion:"1", |
lienEfloreBaseUrl:"www.tela-botanica.org/eflore", |
licence:"", |
/branches/v2.1-emondoir/TODO |
---|
3,5 → 3,5 |
plutôt que gestion en PHP |
CelValidationObservation.php: pose la question de la validation des |
données par rapport à l'indépendance vis-à-vis des référentiels |
nomenclaturaux et taxonomiques (tables bdtfx/bdtxa/isfan/bdtao...) |
nomenclaturaux et taxonomiques (tables bdtfx/bdtxa/isfan/apd...) |
/branches/v2.1-emondoir/. |
---|
Property changes: |
Modified: svn:mergeinfo |
Merged /trunk:r2155,2157-2159,2161 |