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<?php
/**
*
*
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org>
*
*
*/
class BaseflorRangSupInsertion {
private $table = null;
private $donnees_initiales = array();
private $valeurs_insertion;
private $infos_taxon = array();
private $conteneur;
private $efloreCommun;
private $message;
private $outils;
private $nn_courant;
private $nn_superieur;
private $champs_ecologiques = array();
private $Bdd;
public function __construct(Conteneur $conteneur, Bdd $bdd) {
$this->conteneur = $conteneur;
$this->Bdd = $bdd;
$this->efloreCommun = $conteneur->getEfloreCommun();
$this->message = $conteneur->getMessages();
$this->outils = $conteneur->getOutils();
$this->dossierBase = dirname(__FILE__).'/';
}
public function insererDonnees(){
echo "Chargement de la structure en cours \n" ;
$this->efloreCommun->chargerFichierSql('chemins.rang_sup_sql');
echo "Récupération des données de baseflor en cours \n";
$this->recupererDonneesInitiales();
echo "Calcul des valeurs pour les rangs supérieurs en cours \n";
$this->consulterInfosTaxons();
$this->recupererValeursInsertion();
$this->insererDonneesRangSup();
}
private function insererDonneesRangSup() {
$table = Config::get('tables.rang_sup');
$requete_truncate = 'TRUNCATE TABLE '.$table;
$this->Bdd->requeter($requete_truncate);
$i = 0;
foreach ($this->valeurs_insertion as $nn => $valeurs){
$requete = "INSERT INTO $table VALUES({$i},$nn, 'bdtfx', '{$valeurs['ve_lumiere']['min']}', ".
"'{$valeurs['ve_lumiere']['max']}','{$valeurs['ve_temperature']['min']}',".
"'{$valeurs['ve_temperature']['max']}','{$valeurs['ve_continentalite']['min']}',".
"'{$valeurs['ve_continentalite']['max']}','{$valeurs['ve_humidite_atmos']['min']}',".
"'{$valeurs['ve_humidite_atmos']['max']}','{$valeurs['ve_humidite_edaph']['min']}',".
"'{$valeurs['ve_humidite_edaph']['max']}','{$valeurs['ve_reaction_sol']['min']}',".
"'{$valeurs['ve_reaction_sol']['max']}','{$valeurs['ve_nutriments_sol']['min']}',".
"'{$valeurs['ve_nutriments_sol']['max']}','{$valeurs['ve_salinite']['min']}',".
"'{$valeurs['ve_salinite']['max']}','{$valeurs['ve_texture_sol']['min']}',".
"'{$valeurs['ve_texture_sol']['max']}','{$valeurs['ve_mat_org_sol']['min']}',".
"'{$valeurs['ve_mat_org_sol']['max']}');";
$this->Bdd->requeter($requete);
$i++;
$this->message->afficherAvancement('Insertion des valeurs pour les rangs supérieurs en cours');
}
}
 
 
// dans cette solution je parcours les donnees de baseflor
// je teste une donnée (si min max) pour récuperer les valeurs pour chaque rang superieur
// jusqu'à famille (180) puis je passe à la suivante jusqu'à avoir parcouru tout baseflor
private function recupererValeursInsertion(){
$this->champs_ecologiques = $this->outils->recupererTableauConfig(Config::get('Parametres.champsEcologiques'));
$this->valeurs_insertion = array();
if (empty($this->donnees_initiales)) {
throw new Exception("Erreur : pas de données à traiter.");
} else {
foreach ($this->donnees_initiales as $nn => $ecologie) {
$this->nn_courant = $nn;
$this->nn_superieur = isset($this->infos_taxon[$this->nn_courant]) ? $this->infos_taxon[$this->nn_courant]['nn_sup'] : null;
$rang = isset($this->infos_taxon[$this->nn_superieur]) ? $this->infos_taxon[$this->nn_superieur]['rang'] : 179 ;
while ($rang >= 180){
if (!isset($donnees_initiales[$this->nn_superieur])) {
foreach ($this->champs_ecologiques as $nom) {
$this->testerSiMinMax($nom, $ecologie[$nom]);
}
}
$this->nn_superieur = isset($this->infos_taxon[$this->nn_superieur]) ? $this->infos_taxon[$this->nn_superieur]['nn_sup'] : null;
$rang = !empty($this->nn_superieur) ? $this->infos_taxon[$this->nn_superieur]['rang'] : 179 ;
}
}
}
}
// ici je parcours toutes les données de baseflor et je teste et récupère les valeurs pour le rang superieur
//direct puis je récupère les données obtenues et je recommence jusqu'à que tous les rangs obtenus soient des familles
private function recupererValeursInsertion2(){
$this->champs_ecologiques = $this->outils->recupererTableauConfig(Config::get('Parametres.champsEcologiques'));
$this->valeurs_insertion = array();
if (empty($this->donnees_initiales)) {
throw new Exception("Erreur : pas de données à traiter.");
} else {
$donnees_traitees = $this->donnees_initiales;
$donnees_deja_traitees = array();
$condition_fin = true;
$tab_num_nom = array_keys($donnees_traitees);
while (!empty($donnees_traitees)) {
reset($donnees_traitees);
$this->nn_courant = array_shift($tab_num_nom);
$data = array_shift($donnees_traitees);
if (isset($this->infos_taxon[$this->nn_courant])) {
$this->nn_superieur = $this->infos_taxon[$this->nn_courant]['nn_sup'];
if (!isset($donnees_deja_traitees[$this->nn_courant])) {
if ($this->infos_taxon[$this->nn_superieur]['rang'] >= 180){
$condition_fin = false;
foreach ($this->champs_ecologiques as $nom) {
$this->testerSiMinMax($nom, $data[$nom]);
}
}
}
$donnees_deja_traitees[$this->nn_courant] = 1;
}
if ($condition_fin == false && empty($donnees_traitees)) {
$donnees_traitees = $this->valeurs_insertion;
$tab_num_nom = array_keys($donnees_traitees);
$condition_fin = true;
}
}
}
}
// je stocke des valeurs à insérer sous la forme : $insertion [{nn_tax_sup}][{nom_de_chps}][{max ou min}] = {valeur}
private function testerSiMinMax($nom, $valeur) {
$nn = $this->nn_superieur;
if ( !isset($this->valeurs_insertion[$nn][$nom]['min'])
|| empty($valeur['min'])
|| empty($this->valeurs_insertion[$nn][$nom]['min'])
|| $this->valeurs_insertion[$nn][$nom]['min'] > $valeur['min'] ){
$this->valeurs_insertion[$nn][$nom]['min'] = $valeur['min'];
}
if ( !isset($this->valeurs_insertion[$nn][$nom]['max'])
|| empty($this->valeurs_insertion[$nn][$nom]['max'])
|| empty($valeur['max'])
|| $this->valeurs_insertion[$nn][$nom]['max'] < $valeur['max'] ) {
$this->valeurs_insertion[$nn][$nom]['max'] = $valeur['max'];
}
}
// je stocke les infos taxons sous la forme : $info_taxon[{num_nomem}][{num_nomen_sup ou rang}] = {valeur}
private function consulterInfosTaxons() {
$table = Config::get('tables.taxons');
$requete = 'SELECT A.num_nom AS nn, B.num_tax_sup AS nn_sup, A.rang '.
"FROM $table A JOIN $table B ON (A.num_nom_retenu = B.num_nom) ".
'WHERE B.num_nom = B.num_nom_retenu ';
$resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete);
foreach ($resultat as $res) {
$this->infos_taxon[$res['nn']] = array('nn_sup' => $res['nn_sup'], 'rang' => $res['rang'] );
}
}
// je stocke les valeurs initiales sous la forme : $initiales[{nn_nomem}][{champs ecologique}][{'min' ou 'max'}]
private function recupererDonneesInitiales() {
$table = Config::get('tables.donnees');
$requete = "SELECT num_nomen, ve_lumiere, ve_temperature, ve_continentalite, ve_humidite_atmos, ".
"ve_humidite_edaph, ve_reaction_sol, ve_nutriments_sol, ve_salinite, ve_texture_sol, ve_mat_org_sol ".
"FROM $table WHERE BDNT = 'BDTFX' ".
" AND num_nomen != 0 ".
" AND !(ve_lumiere = '' and ve_mat_org_sol = '' and ve_temperature = '' and ve_continentalite = '' ".
" and ve_humidite_atmos = '' and ve_humidite_edaph = '' and ve_nutriments_sol = '' and ve_salinite = ''".
" and ve_texture_sol = '' and ve_reaction_sol = '')";
$resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete);
foreach ($resultat as $res) {
$this->donnees_initiales[$res['num_nomen']] = array(
've_lumiere' => array('min' => $res['ve_lumiere'], 'max' => $res['ve_lumiere']),
've_temperature' => array('min' => $res['ve_temperature'], 'max' => $res['ve_temperature']),
've_continentalite' => array('min' => $res['ve_continentalite'], 'max' => $res['ve_continentalite']),
've_humidite_atmos' => array('min' => $res['ve_humidite_atmos'], 'max' => $res['ve_humidite_atmos']),
've_humidite_edaph' => array('min' => $res['ve_humidite_edaph'], 'max' => $res['ve_humidite_edaph']),
've_reaction_sol' => array('min' => $res['ve_reaction_sol'], 'max' => $res['ve_reaction_sol']),
've_nutriments_sol' => array('min' => $res['ve_nutriments_sol'], 'max' => $res['ve_nutriments_sol']),
've_salinite' => array('min' => $res['ve_salinite'], 'max' => $res['ve_salinite']),
've_texture_sol' => array('min' => $res['ve_texture_sol'], 'max' => $res['ve_texture_sol']),
've_mat_org_sol' => array('min' => $res['ve_mat_org_sol'], 'max' => $res['ve_mat_org_sol']));
}
}
// +++ Fonctions de vérification des donnée obtenues ++++//
public function testAscendantsDeBaseflor(){
$this->recupererDonneesInitiales();
$this->consulterInfosTaxons();
$fichier = dirname(__FILE__).'/log/verifTaxonsSup.log';
$liste = array();
foreach ($this->donnees_initiales as $nn => $data) {
$nn_sup = isset($this->infos_taxon[$nn]) ? $this->infos_taxon[$nn]['nn_sup'] : '' ;
if (!empty($nn_sup) && !isset($donnees_initiales[$nn_sup])){
$rang = isset($this->infos_taxon[$nn_sup]) ? $this->infos_taxon[$nn_sup]['rang'] : 179 ;
while ($rang >= 180) {
if (!empty($nn_sup)) {
if (isset($liste["$nn_sup($rang)"])){
$liste["$nn_sup($rang)"] .= ", $nn";
}else {
$liste["$nn_sup($rang)"] = "$nn";
}
$nn_sup = isset($this->infos_taxon[$nn_sup]) ? $this->infos_taxon[$nn_sup]['nn_sup'] : '' ;
$rang = isset($this->infos_taxon[$nn_sup]) ? $this->infos_taxon[$nn_sup]['rang'] : 179 ;
}else {
break;
}
}
}
}
$log = "un ascendant (pas forcement l'ascendant directement au dessus) : les descendants contenus dans baseflor \n";
foreach ($liste as $cle => $inferieur){
$log .= "$cle : $inferieur \n";
}
file_put_contents($fichier, $log);
}
public function testEcologieAscendantsDeBaseflor(){
$this->recupererDonneesInitiales();
$this->consulterInfosTaxons();
$fichier = dirname(__FILE__).'/log/verifTaxonsSupEcolo.log';
$liste = array();
foreach ($this->donnees_initiales as $nn => $data) {
$nn_sup = isset($this->infos_taxon[$nn]) ? $this->infos_taxon[$nn]['nn_sup'] : '' ;
if (!empty($nn_sup) && !isset($donnees_initiales[$nn_sup])){
$rang = isset($this->infos_taxon[$nn_sup]) ? $this->infos_taxon[$nn_sup]['rang'] : 179 ;
while ($rang >= 180) {
if (!empty($nn_sup)) {
$ecolo = array_values($data);
list($l,$t,$c,$ha,$he,$r,$n,$s,$tx,$mo) = $ecolo;
if (isset($liste["$nn_sup($rang)"])){
$liste["$nn_sup($rang)"] .= ",[{$l['min']}, {$t['min']}, {$c['min']},"
."{$ha['min']}, {$he['min']}, {$r['min']}, {$n['min']}, {$s['min']},"
."{$tx['min']}, {$mo['min']}]";
}else {
$liste["$nn_sup($rang)"] = "[{$l['min']}, {$t['min']}, {$c['min']},"
."{$ha['min']}, {$he['min']}, {$r['min']}, {$n['min']}, {$s['min']},"
."{$tx['min']}, {$mo['min']}]";
}
$nn_sup = isset($this->infos_taxon[$nn_sup]) ? $this->infos_taxon[$nn_sup]['nn_sup'] : '' ;
$rang = isset($this->infos_taxon[$nn_sup]) ? $this->infos_taxon[$nn_sup]['rang'] : 179 ;
}else {
break;
}
}
}
}
$log = "nn ascendant (pas forcement l'ascendant directement au dessus) :"
." valeurs descendants contenus dans baseflor \n"
."Pour le calcul des valeurs min et max de gauche, les valeurs de droite sont utilisées. \n";
foreach ($liste as $cle => $inferieurs){
$log .= "$cle : $inferieurs \n";
}
file_put_contents($fichier, $log);
}
 
}