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<?php |
|
/** |
* Classe InformationsBaseflor.php permet de faire des requetes de baseflor en fonction d'un référentiel |
*( BDTFX, BDAFX, BDBFX ) et d'un numéro nomenclatural ( différent de 0 ). |
* fin d'url possibles : |
* /informations/#bdnt.nn:#num_nomen --> retourne tous les champs pour un BDNT et un num_nomen |
* /informations/#bdnt.nn:#num_nomen?champs=description --> retourne champs description pour un BDNT et un num_nomen |
* /informations/#bdnt.nn:#num_nomen?champs=ecologie --> retourne champs ecologiques pour un BDNT et un num_nomen |
* /informations/#bdnt.nn:#num_nomen/relations/catminat --> donne les num nomen et les bdnt pour tous |
* les taxons qui ont le même code catminat ( code milieu ) que celui entré |
* |
* Encodage en entrée : utf8 |
* Encodage en sortie : utf8 |
* @package eflore-projets |
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org> |
* @author Delphine CAUQUIL <delphine@tela-botanica.org> |
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org> |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt> |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt> |
* @version 1.0 |
* @copyright 1999-2012 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org) |
*/ |
|
class InformationsBaseflor extends Commun{ |
|
protected $table = ""; |
private $format_reponse = 'informations'; |
private $retour_format = 'max'; |
private $champs_ontologiques = array(); |
protected $serviceNom = 'informations'; |
private $Bdd; |
private $requete_condition = ""; |
private $champs_recherches = '*'; |
private $resultat_json; |
private $nb_ressources; |
protected $limite_requete = array( 'depart' => 0, 'limite' => 10); |
|
|
public function consulter($ressources, $parametres) { |
$this->ressources = $ressources; |
$this->parametres = $parametres; |
$this->nb_ressources = count($ressources); |
|
$this->traiterParametres(); |
$this->definirTables(); |
$this->traiterRessources(); |
$resultats = null; |
foreach ($this->table_version as $version) { |
$this->table = $version; |
$requete = $this->assemblerLaRequete(); |
$resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete); |
$versionResultat = $this->analyserResultat($resultat); |
if (count($this->table_version) > 1) { |
$resultats[$version] = $versionResultat; |
} else { |
$resultats = $versionResultat; |
} |
} |
return $resultats; |
} |
|
public function __construct(Conteneur $Conteneur) { |
$this->Bdd = $Conteneur->getBdd(); |
} |
|
|
public function analyserResultat($resultat) { |
$versionResultat = null; |
if ($resultat == '') { |
$message = 'La requête SQL formée comporte une erreur!'; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE; |
throw new Exception($message, $code); |
} elseif ($resultat) { |
$versionResultat = $this->retournerResultatFormate($resultat); |
} |
return $versionResultat; |
} |
|
//+--------------------------traitement ressources ou paramètres -------------------------------------------+ |
public function traiterParametres() { |
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres)) { |
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) { |
switch ($param) { |
case 'categorie' : |
if($this->nb_ressources != 1 ) { |
$e = "Nombre de ressource != 1 pour informations/#id/relations/catminat"; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
|
if ($valeur == "description") { |
$this->champs_recherches = "num_nomen, BDNT, chorologie, inflorescence," |
." sexualite, ordre_maturation, " |
."pollinisation, fruit, dissemination, couleur_fleur, macule, floraison, type_bio, " |
."form_vegetale "; |
$this->requete_condition[] = "( chorologie != '' OR inflorescence != '' ". |
"OR sexualite != '' OR ordre_maturation != '' OR pollinisation != '' ". |
"OR fruit != '' OR dissemination != '' OR couleur_fleur != '' OR macule != '' ". |
"OR floraison != '' OR type_bio != '' OR form_vegetale != '' )"; |
} elseif ($valeur == "ecologie") { |
$this->champs_recherches = " num_nomen, BDNT, ve_lumiere , ve_temperature," |
." ve_continentalite, ve_humidite_atmos, ve_humidite_edaph, ve_reaction_sol," |
." ve_nutriments_sol, ve_salinite, ve_texture_sol, ve_mat_org_sol, " |
." vi_lumiere, vi_temperature, vi_continentalite, vi_humidite_edaph," |
." vi_reaction_sol, vi_nutriments_sol, vi_salinite "; |
$this->requete_condition[] = "( ve_lumiere != '' OR ve_temperature != '' ". |
"OR ve_continentalite != '' OR ve_humidite_atmos != '' ". |
"OR ve_humidite_edaph != '' OR ve_reaction_sol != '' ". |
"OR ve_nutriments_sol != '' OR ve_salinite != '' ". |
"OR ve_texture_sol != '' OR ve_mat_org_sol != '' )"; |
} else { |
$e = "Valeur de paramètre inconnue pour 'categorie'. Ce paramètre n'est pas autorisé pour informations/#id/relations/catminat"; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
break; |
case 'retour.format' : |
if ($valeur == 'min' || $valeur == 'max' && $this->nb_ressources == 1) { |
$this->retour_format = $valeur; |
|
} else { |
$e = "Valeur de paramètre inconnue pour 'retour.format'. Ce paramètre n'est pas autorisé pour informations/#id/relations/catminat"; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
break; |
case 'navigation.depart' : |
$this->definirNavigationDepart($valeur); |
break; |
case 'navigation.limite' : |
$this->definirNavigationLimite($valeur); |
break; |
case 'version.projet' : |
$this->traiterVersion($valeur); |
break; |
default : |
$e = 'Erreur dans les parametres de votre requête : </br> Le paramètre " ' |
.$param.' " n\'existe pas.'; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
break; |
} |
} |
} |
} |
|
|
|
public function traiterRessources() { |
if(preg_match('/^(.+)\.nn:([0-9]+)$/', $this->ressources[0], $retour)){ |
$id = $retour[2]; |
$ref = $retour[1]; |
if ($ref == 'bdtfx' || $ref == 'bdafx' || $ref == 'bdbfx') { |
if($this->nb_ressources == 1) { |
$this->requete_condition[] = "num_nomen = ".$id." AND BDNT = '".strtoupper($ref)."' "; |
} else { |
$this->definirParametresRequeteRelations($ref, $id); |
} |
} else { |
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> Le référentiel " ' |
.$ref.' " n\'existe pas.'; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
|
} else { |
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> La ressource demandée n\'existe pas.'; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
|
} |
|
} |
|
function definirParametresRequeteRelations($ref, $id){ |
if ($this->ressources[1] == 'relations'){ |
switch ($this->ressources[2]) { |
case 'catminat' : |
$this->requete_condition[] = "catminat_code = ( SELECT catminat_code from ".$this->table_version[0]." WHERE " |
." num_nomen = ".$id." AND BDNT = '".$ref. "' ) AND num_nomen != ".$id." "; |
$this->champs_recherches = " catminat_code, num_nomen, BDNT, nom_sci "; |
break; |
default : |
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> Le type de relation " ' |
.$this->ressources[2].' " n\'existe pas.'; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
break; |
} |
} else { |
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> Le type de ressources " ' |
.$this->ressources[1].' " n\'existe pas.'; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} |
|
|
//+++------------------------------traitement des versions----------------------------------------++ |
|
public function traiterVersion($valeur) { |
if (preg_match('/^[0-9]+(?:[._][0-9]+)*$/', $valeur) || $valeur == '+') { |
$this->version_projet = $valeur; |
} elseif ($valeur == '*') { |
$this->version_projet = ($this->nb_ressources == 1) ? $valeur : '+' ; |
} else { |
$e = "Erreur : La version est inconnue."; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
|
} |
|
public function definirTables() { |
$table_num_version = $this->recupererVersionDisponible(); |
$prefixe_table = config::get('bdd_table'); |
if ( in_array($this->version_projet,$table_num_version) ) { |
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.$this->version_projet; |
} elseif ($this->version_projet == '+') { |
$derniere_version = $table_num_version[count($table_num_version) - 1]; |
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.str_replace('.', '_', $derniere_version); |
} elseif ($this->version_projet == '*') { |
foreach ($table_num_version as $num_version) { |
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.str_replace('.', '_', $num_version); |
} |
} else { |
$e = "Erreur : La version est inconnue."; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} |
|
//+--------------------------formatages de resultats -------------------------------------------+ |
|
public function retournerResultatFormate($resultat) { |
$resultat_json = $resultat[0]; |
if ($this->retour_format == 'max'){ |
if ($this->nb_ressources == 1) { |
if (@$this->parametres['categorie'] == 'ecologie') { |
$this->formaterResultatsChampsEcologie($resultat_json); |
} elseif (@$this->parametres['categorie'] == 'description') { |
$this->formaterResultatsChampsDescription($resultat_json); |
}else { |
$this->formaterResultatsTousChamps($resultat_json); |
} |
} else { |
$this->formaterResultatsRelations($resultat); |
} |
} else { |
$this->resultat_json = $resultat_json; |
} |
return $this->resultat_json; |
} |
|
public function formaterResultatsRelations($resultat) { |
$this->resultat_json['entete'] = $this->ajouterEnteteResultat(); |
$resultat_json = array(); |
foreach ($resultat as $cle => $res){ |
$resultat_json[$cle] = $res ; |
$resultat_json[$cle]['href'] = $this->ajouterHref('informations',strtolower($res['BDNT']).".nn:".$res['num_nomen']); |
} |
$this->resultat_json['resultat'] = $resultat_json; |
} |
|
public function ajouterEnteteResultat() { |
$entete['depart'] = $this->limite_requete['depart']; |
$entete['limite'] = $this->limite_requete['limite']; |
$entete['total'] = $this->total_resultat; |
$entete['version'] = $this->version_projet; |
if ($this->limite_requete['limite'] != '*') { |
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/informations/'.$this->ressources[0].'/relations/catminat'); |
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') { |
$entete['href.precedent'] = $url['precedent']; |
} |
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') { |
$entete['href.suivant'] = $url['suivant']; |
} |
} |
return $entete; |
} |
|
public function formaterResultatsTousChamps($resultat) { |
$this->resultat_json = $resultat; |
$this->traiterTypeBio(); |
$graphique_presence = $this->traiterEcologie() ; |
if ($graphique_presence) { |
$graphique = $this->ajouterLiensGraphique($graphique_presence); |
} |
} |
|
public function formaterResultatsChampsEcologie($resultat) { |
$this->resultat_json = $resultat; |
$graphique_presence = $this->traiterEcologie() ; |
if ($graphique_presence) { |
$graphique = $this->ajouterLiensGraphique($graphique_presence); |
} |
} |
|
|
public function formaterResultatsChampsDescription($resultat) { |
$this->resultat_json = $resultat; |
$this->traiterTypeBio(); |
} |
|
//vérifie la présence de données écologiques pour les graphiques et récupère leur ontologie |
public function traiterEcologie() { |
$donnees_presence = false; |
$this->champs_ontologiques = Commun::s_recupererTableauConfig('Paramètres.champs_ontologiques'); |
foreach ($this->champs_ontologiques as $cle => $valeur){ |
if ($this->resultat_json[$cle] != ""){ |
$donnees_presence[$this->getNomGraphique($valeur)] = true; |
$this->recupererOntologies($this->resultat_json[$cle], $cle); |
unset($this->resultat_json[$cle]); |
} |
} |
return $donnees_presence; |
} |
|
//donne le nom du graphique correspondant à un champ écologique |
public function getNomGraphique($code_ecolo) { |
$graphique = null; |
if (in_array($code_ecolo, explode(',',Config::get('Paramètres.climat')))) { |
$graphique = 'climat'; |
} elseif (in_array($code_ecolo, explode(',', Config::get('Paramètres.sol')) )) { |
$graphique = 'sol'; |
} |
return $graphique; |
} |
|
public function traiterTypeBio() { |
if ($this->resultat_json['type_bio'] != ""){ |
$tab_ontologie = $this->recupererOntologiePrTypeBio($this->resultat_json['type_bio']); |
unset($this->resultat_json['type_bio']); |
$this->resultat_json= array_merge($this->resultat_json,$tab_ontologie); |
} |
} |
|
public function ajouterLiensGraphique($graphique_presence) { |
if ($graphique_presence['climat']) { |
$this->resultat_json['graphique_climat']['libelle'] = 'climat'; |
$this->resultat_json['graphique_climat']['href'] = |
$this->ajouterHref('graphiques/climat', strtolower($this->resultat_json['BDNT']).'.nn:'.$this->resultat_json['num_nomen']); |
|
} |
if ($graphique_presence['sol']) { |
$this->resultat_json['graphique_sol']['libelle'] = 'sol'; |
$this->resultat_json['graphique_sol']['href'] = |
$this->ajouterHref('graphiques/sol', strtolower($this->resultat_json['BDNT']).'.nn:'.$this->resultat_json['num_nomen']); |
} |
} |
|
|
//+--------------------------traitement ontologies -------------------------------------------+ |
|
public function recupererOntologies($valeur, $champs){ |
$url = Config::get('url_service_base').Config::get('nom_projet'). |
'/ontologies/'.$this->champs_ontologiques[$champs].':'.urlencode(urlencode($valeur)); |
$val = $this->getBdd()->recuperer(sprintf( |
"SELECT a.nom FROM baseflor_ontologies a LEFT JOIN baseflor_ontologies b ON a.id = b.id LEFT JOIN baseflor_ontologies c ON b.classe_id = c.id WHERE". |
" b.code = BINARY '%s' AND c.code = BINARY '%s' LIMIT 0, 100", |
$valeur, |
$this->champs_ontologiques[$champs]), |
Bdd::MODE_OBJET); |
|
$this->resultat_json[$champs.'.libelle'] = isset($val->nom) ? $val->nom : NULL; // eg: VEMO:0 |
$this->resultat_json[$champs.'.code'] = $valeur; |
$this->resultat_json[$champs.'.href'] = $url; |
} |
|
//+-------------ontologie pour le champs type biologique (lire le .txt)---+ |
|
public function recupererOntologiePrTypeBio($type_a_traiter){ |
$resultat_typeBio = ""; |
if ($type_a_traiter != "") { |
$types_prim_sec = $this->separerTypesPrimairesSecondaires($type_a_traiter); |
$types_sstypes = $this->classerPrimSecEnTypesSsTypes($types_prim_sec); |
$resultat_typeBio = $this->formaterJsonTypeBio($types_sstypes, $type_a_traiter ); |
} |
return $resultat_typeBio; |
} |
|
public function classerPrimSecEnTypesSsTypes($types_prim_sec) { |
$types_sstypes = ''; |
foreach ($types_prim_sec as $cle => $tb) { |
$types_sstypes[$cle]= $this->separerTypes_SousTypes($tb, $cle); |
} |
switch (count($types_sstypes)) { |
case 1 : |
$types_sstypes = $types_sstypes['principal']; |
break; |
case 2 : |
$types_sstypes = array_merge($types_sstypes['principal'],$types_sstypes['secondaire']); |
break; |
} |
return $types_sstypes; |
} |
|
|
public function formaterJsonTypeBio( $types_sstypes, $type_a_traiter) { |
$resultat_typeBio['type_bio.code'] = $type_a_traiter; |
foreach ($types_sstypes as $cle => $tb) { |
if (($cle == 'type.principal') || ($cle == 'type.secondaire')) { |
$i = 0; |
foreach ($tb as $types) { |
$url = Config::get('url_service_base').Config::get('nom_projet'). |
'/ontologies/TB:'.urlencode(urlencode($types)); |
$val = $this->consulterHref($url); |
$libelle[$cle][$i]= $val->nom; |
$detail[$cle][$i]['libelle'] = $val->nom; |
$detail[$cle][$i]['code'] = $val->code; |
$detail[$cle][$i]['href'] = $url; |
$i++; |
} |
} |
if ($cle == 'sous_type.principal' || $cle == 'sous_type.secondaire' ) { |
$i = 0; |
foreach ($tb as $sstypes) { |
$url = Config::get('url_service_base').Config::get('nom_projet'). |
'/ontologies/ssTT:'.urlencode(urlencode($sstypes)); |
$val = $this->consulterHref($url); |
$libelle[$cle][$i]=$val->nom; |
$detail[$cle][$i]['libelle'] = $val->nom; |
$detail[$cle][$i]['code'] = $val->code; |
$detail[$cle][$i]['href'] = $url; |
$i++; |
} |
} |
} |
//var_dump($libelle); exit; |
$resultat_typeBio['type_bio.libelle']= $this->formaterTypeBioPrLibelle($libelle); |
$resultat_typeBio['type_bio.detail'] = $detail; |
return $resultat_typeBio; |
} |
|
|
|
public function formaterTypeBioPrLibelle($info) { |
$libelle = implode(', ',$info['type.principal'])." "; |
$libelle .= isset($info['sous_type.principal']) ? " (".implode(', ',$info['sous_type.principal']).") " : ""; |
$libelle .= isset($info['type.secondaire']) ? ", ".implode(', ',$info['type.secondaire'])." " : ""; |
$libelle .= isset($info['sous_type.secondaire']) ? "(".implode(', ',$info['sous_type.secondaire']).") " : ""; |
return $libelle; |
} |
|
//séparation des principaux et des secondaires |
public function separerTypesPrimairesSecondaires($type) { |
$types = array(); |
if (preg_match("/(.+)\((.+)\)\-{0,1}(.+){0,1}/", $type,$retour)) { |
$types['principal'] = isset($retour[3]) ? $retour[1].'-'. $retour[3] : $retour[1] ; |
$types['secondaire'] = $retour[2]; |
} else { |
$types['principal'] = $type; |
} |
return $types; |
} |
|
|
public function separerTypes_SousTypes($type_a_traiter, $typePrimOuSec) { |
$types = array(); |
if (preg_match("/^([a-zA-Zé]+)\-(.+)$|^([a-zA-Zé,]+[^\-])$/", $type_a_traiter, $retour)) { |
//type |
$type = array(); |
$type[0] = (isset($retour[3])) ? $retour[3] : $retour[1] ; |
$type = explode(",", $type[0]); |
for ($i = 0 ; $i < count($type); $i++) { |
$types['type.'.$typePrimOuSec][$i] = $type[$i]; |
} |
//sous types |
$ss_types = array(); |
if (isset($retour[2]) && $retour[2] != '') { |
$ss_types[0] = $retour[2] ; |
$ss_types = explode("-", $ss_types[0]); |
for ($i = 0 ; $i < count($ss_types); $i++) { |
$types['sous_type.'.$typePrimOuSec][$i] = $ss_types[$i]; |
} |
} |
} |
return $types; |
} |
|
|
|
|
|
//+--------------------------FONCTIONS D'ASSEMBLAGE DE LA REQUETE-------------------------------------------+ |
|
public function assemblerLaRequete() { |
$requete = ' SELECT '.$this->champs_recherches.' FROM '.$this->table.' ' |
.Informations::retournerRequeteCondition($this->requete_condition).' '; |
if ($this->nb_ressources != 1 ) { |
$requete .= $this->delimiterResultatsRequete(); |
} |
return $requete; |
} |
|
public function delimiterResultatsRequete() { |
$this->total_resultat = Informations::calculerTotalResultat( |
$this->getBdd(), |
$this->table, |
Array(), |
$this->requete_condition); |
if ($this->limite_requete['limite'] == '*') return ''; |
|
if ( ($this->limite_requete['depart'] > $this->total_resultat)) { |
throw new Exception( |
"Erreur : la valeur pour le paramètre navigation.départ est supérieure au nombre total de résultats.", |
RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE); |
} |
|
if (($this->limite_requete['limite'] + $this->limite_requete['depart'] ) < $this->total_resultat) { |
return 'LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', ' .$this->limite_requete['limite']; |
} |
// ? |
return ''; |
} |
} |