| 94,9 → 94,9 |
|---|
| |
| $obsAAjouter['user_sci_name'] = isset($obs['nom_sel']) ? $obs['nom_sel'] : null; |
| $obsAAjouter['user_sci_name_id'] = isset($obs['num_nom_sel']) ? $obs['num_nom_sel'] : null; |
| $obsAAjouter['accepted_sci_name'] = isset($obs['nom_ret']) ? $obs['nom_ret'] : null; |
| $obsAAjouter['accepted_sci_name'] = isset($obs['accepted_sci_name']) ? $obs['accepted_sci_name'] : null; |
| $obsAAjouter['accepted_sci_name_id'] = isset($obs['num_nom_ret']) ? $obs['num_nom_ret'] : null; |
| $obsAAjouter['family'] = isset($obs['famille']) ? $obs['famille'] : null; |
| $obsAAjouter['family'] = isset($obs['family']) ? $obs['family'] : null; |
| $obsAAjouter['taxo_repo'] = isset($obs['referentiel']) ? ($obs['referentiel'] == 'bdtfxr') ? 'bdtfx' : $obs['referentiel'] : null; |
| |
| $obsAAjouter['date_observed'] = $this->transormerDateFrVersMysql($obs['date']); |
| 278,7 → 278,7 |
|---|
| |
| /** |
| * Retourne true si les champs suivants sont présents dans le tableau : |
| * - obsId1[nom_sel] |
| * - obsId1[user_sci_name] |
| * - obsId1[latitude]' : obs.geoloc.lat || '', |
| 'obsId1[longitude]' : obs.geoloc.lon || '', |
| * mot-clé "pn:referentiel" |
| 290,37 → 290,36 |
|---|
| |
| /** |
| * Si les données taxonomiques sont incomplètes dans $obs |
| * (clefs 'nom_sel_nn', 'nom_sel', 'nom_referentiel', 'nom_ret_nn', |
| * 'nom_ret', 'famille'), tente d'en récupérer un maximum à l'aide des |
| * (clefs 'nom_sel_nn', 'user_sci_name', 'taxo_repo', 'accepted_sci_name_id', |
| * 'accepted_sci_name', 'family'), tente d'en récupérer un maximum à l'aide des |
| * services eFlore, à condition que soient mentionnés au moins : |
| * - un nom de référentiel |
| * - un nom_sel_nn OU un nom_sel |
| * - un nom_sel_nn OU un user_sci_name |
| */ |
| protected function enrichirDonneesTaxonomiques(&$obs) { |
| // sans référentiel, on ne peut rien faire |
| if (! empty($obs['nom_referentiel'])) { |
| if (! empty($obs['taxo_repo'])) { |
| // copies locales pour ne pas abimer les données d'entrée |
| $nn = $obs['nom_sel_nn']; |
| $ref = $obs['nom_referentiel']; |
| $ns = $obs['nom_sel']; |
| $nr = $obs['nom_ret']; |
| $nnr = $obs['nom_ret_nn']; |
| $fam = $obs['famille']; |
| $nt = $obs['nt']; |
| $ref = $obs['taxo_repo']; |
| $ns = $obs['user_sci_name']; |
| $nr = $obs['accepted_sci_name']; |
| $nnr = $obs['accepted_sci_name_id']; |
| $fam = $obs['family']; |
| |
| // si j'ai un nn, tentative de retrouver le nnr, le nom_sel, |
| // le nom_ret et la famille, s'ils ne sont pas déjà présents (on |
| // si j'ai un nn, tentative de retrouver le nnr, le user_sci_name, |
| // le accepted_sci_name et la famille, s'ils ne sont pas déjà présents (on |
| // pourrait les écraser systématiquement mais l'appel au service |
| // dégrade les perfs) |
| if ((! empty($nn) && is_numeric($nn)) |
| // omission du test sur 'nom_ret' car le service eFlore noms ne le retourne que sans auteur (pas bon) |
| && (empty($ns) || empty($nnr) || empty($nt) || empty($fam) /*|| empty($nr)*/)) { |
| // omission du test sur 'accepted_sci_name' car le service eFlore noms ne le retourne que sans auteur (pas bon) |
| && (empty($ns) || empty($nnr) || empty($fam) /*|| empty($nr)*/)) { |
| // go |
| $this->enrichirDonneesTaxonomiquesParNN($ref, $nn, $obs); |
| } else { |
| // si j'ai un nom complet, avec un peu de bol il sera dans le référentiel |
| if ((! empty($ns)) |
| && (empty($nn) || empty($nnr) || empty($nt) || empty($fam) /*|| empty($nr)*/)) { |
| && (empty($nn) || empty($nnr) || empty($fam) /*|| empty($nr)*/)) { |
| // go |
| $this->enrichirDonneesTaxonomiquesParNS($ref, $ns, $obs); |
| } |
| 361,7 → 360,7 |
|---|
| } |
| if ($nn_trouve != null) { |
| // gagné ! |
| $obs['nom_sel_nn'] = $nn_trouve; |
| $obs['user_sci_name_id'] = $nn_trouve; |
| // et maintenant on recolle ce qu'on peut à partir du nn |
| $this->enrichirDonneesTaxonomiquesParNN($ref, $nn_trouve, $obs); |
| } |
| 388,17 → 387,14 |
|---|
| $infos_nom = json_decode($infos_nom, true); |
| // une fois qu'on a les infos, on écrase tout |
| if ($infos_nom['nom_complet'] != null) { |
| $obs['nom_sel'] = $infos_nom['nom_complet']; |
| $obs['user_sci_name'] = $infos_nom['nom_complet']; |
| } |
| if ($infos_nom['nom_retenu.id'] != null) { |
| $obs['nom_ret_nn'] = $infos_nom['nom_retenu.id']; |
| $obs['accepted_sci_name_id'] = $infos_nom['nom_retenu.id']; |
| } |
| if ($infos_nom['num_taxonomique'] != null) { |
| $obs['nt'] = $infos_nom['num_taxonomique']; |
| } |
| // manque le nom_ret retourné sans auteur (insatisfaisant) |
| // manque le accepted_sci_name retourné sans auteur (insatisfaisant) |
| if ($infos_nom['famille'] != null) { |
| $obs['famille'] = $infos_nom['famille']; |
| $obs['family'] = $infos_nom['family']; |
| } |
| } catch(Exception $e) { |
| // échec silencieux |