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/trunk/jrest/lib/RechercheInfosTaxon.php
1,8 → 1,6
<?php
/**
* PHP Version 5
*
* Classe de recherche d'informations sur un taxon donné
*
* @category PHP
* @package jrest
12,10 → 10,126
* @version SVN: <svn_id>
* @link /doc/jrest/
*/
 
/**
*
* Classe de recherche d'informations sur un taxon donné
* lors de l'évolution d'eflore, devrait être remplacée par
* un appel aux nouveaux web services
*/
class RechercheInfosTaxon extends Cel {
public function RechercheInfosTaxon($config) {
parent::__construct($config);
// Connection à la base de données spécifique eflore
$this->bdd = $this->connecterPDO($this->config, 'database');
}
public function rechercherGenreEspeceSurPrefixe($genre = null, $espece = null) {
$liste_genre_espece = array();
$requete_recherche = '';
// Genre et Espece
if ($espece != null && $genre != null) {
if (strlen($espece) > 0 ) {
$espece=ereg_replace('\*+','%',$espece);
$requete_recherche = "SELECT DISTINCT en_nom_genre, en_epithete_espece, en_nom_supra_generique, en_epithete_infra_generique,".
" auteur_bex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio_ex ".
" , auteur_b.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio ".
" , auteur_mex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif_ex ".
" , auteur_m.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_modif ".
" , en_epithete_espece, en_epithete_infra_specifique, enrg_abreviation_rang, en_id_nom, esn_ce_statut" .
" FROM eflore_nom, eflore_nom_rang, " .
" eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_bex ".
" , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_b ".
" , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_mex ".
" , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_m ".
" , eflore_selection_nom".
" WHERE en_id_version_projet_nom = '25' AND en_nom_genre LIKE ".$this->proteger($genre.'%').
" AND en_ce_rang > 160 " .
" AND en_epithete_espece like ".$this->proteger($espece.'%')." AND en_ce_rang = enrg_id_rang " .
" AND en_ce_auteur_basio_ex = auteur_bex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
" AND en_ce_auteur_basio = auteur_b.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
" AND en_ce_auteur_modif_ex = auteur_mex.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
" AND en_ce_auteur_modif = auteur_m.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
" AND esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom " .
" AND esn_id_nom= en_id_nom ".
" ORDER BY esn_ce_statut, en_ce_rang, en_epithete_espece, en_nom_genre LIMIT 50";
}
}
else {
if ($genre != null) {
$genre=ereg_replace('\*+','%',$genre);
//TODO: comprendre pourquoi à l'origine il y avait : (strlen($genre) >= 1) /*&& ($genre != '%')
if ((strlen($genre) >= 1)) {
$requete_recherche = "SELECT DISTINCT en_nom_genre, en_id_nom, 0 as esn_ce_statut FROM eflore_nom WHERE en_id_version_projet_nom = '25'" .
"AND en_ce_rang = 160 " .
"AND en_nom_genre LIKE ".$this->proteger($genre.'%')." ORDER BY esn_ce_statut, en_nom_genre LIMIT 50";
}
}
}
if($requete_recherche != '') {
$resultat_recherche = $this->requeter($requete_recherche);
if (is_array($resultat_recherche)) {
foreach($resultat_recherche as $ligne) {
$liste_genre_espece[] = array($this->formaterNom($ligne),
$ligne['en_id_nom'],
$ligne['esn_ce_statut']
);
}
}
}
return $liste_genre_espece;
}
 
function rechercherInformationsComplementaires($numNom) {
function rechercherInformationsComplementairesSurNumNom($numNom) {
 
$resultat_infos_complementaires = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom);
 
// Nom retenu, Num Nomen nom retenu, Num Taxon, Famille
$value=array('Nom_Retenu'=>"",'Num_Nom_Retenu'=>"0",'Num_Taxon'=>"0",'Famille'=>"");
 
if (is_array($resultat_infos_complementaires)) {
foreach($resultat_infos_complementaires as $row) {
$fam=$this->rechercherFamille($row['esn_id_taxon']);
while (($fam['en_ce_rang']!='fin') && ($fam['en_ce_rang'] !=120)) {
$fam=$this->rechercherFamille($fam['etr_id_taxon_2']);
}
if ($fam['en_ce_rang']==120) {
$famille=$fam['en_nom_supra_generique'];
}
else {
$famille="Famille inconnue";
}
$value=array('Nom_Retenu'=>$this->formaterNom($row),'Num_Nom_Retenu'=>$row['esn_id_nom'],'Num_Taxon'=>$row['esn_id_taxon'],'Famille'=>$famille);
}
}
 
return $value;
 
}
public function effectuerRequeteInfosComplementairesEtFormaterNom($numNom) {
$resultat_infos_complementaires = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom);
$retour_infos_complementaires = array();
foreach ($resultat_infos_complementaires as $info) {
$retour_infos_complementaires=array(($this->formaterNom($info)));
}
return $retour_infos_complementaires;
}
public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($numNom) {
$requete_infos_complementaires = "SELECT DISTINCT en_nom_genre, en_epithete_espece, en_nom_supra_generique, en_epithete_infra_generique,".
" auteur_bex.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio_ex ".
" , auteur_b.enaia_intitule_abrege AS abreviation_auteur_basio ".
28,7 → 142,7
" , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_mex ".
" , eflore_naturaliste_intitule_abreviation AS auteur_m ".
" ,eflore_selection_nom a, eflore_selection_nom b".
" WHERE a.esn_id_nom= ".$numNom.
" WHERE a.esn_id_nom= ".$this->proteger($numNom).
" AND a.esn_id_version_projet_taxon = 25 ".
" AND a.esn_id_taxon=b.esn_id_taxon ".
" AND b.esn_ce_statut=3 ".
41,38 → 155,19
" AND en_ce_auteur_modif = auteur_m.enaia_id_intitule_naturaliste_abrege ".
" AND a.esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom ";
 
$resultat_infos_complementaires = $this->requeter($requete_infos_complementaires);
 
// Nom retenu, Num Nomen nom retenu, Num Taxon, Famille
$value=array('Nom_Retenu'=>"",'Num_Nom_Retenu'=>"0",'Num_Taxon'=>"0",'Famille'=>"");
 
if (is_array($resultat_infos_complementaires)) {
foreach($resultat_infos_complementaires as $row) {
$fam=$this->rechercherFamille($row['esn_id_taxon']);
while (($fam['en_ce_rang']!='fin') && ($fam['en_ce_rang'] !=120)) {
$fam=$this->rechercherFamille($fam['etr_id_taxon_2']);
}
if ($fam['en_ce_rang']==120) {
$famille=$fam['en_nom_supra_generique'];
}
else {
$famille="Famille inconnue";
}
$value=array('Nom_Retenu'=>$this->formaterNom($row),'Num_Nom_Retenu'=>$row['esn_id_nom'],'Num_Taxon'=>$row['esn_id_taxon'],'Famille'=>$famille);
}
}
 
return $value;
 
return $resultat_infos_complementaires;
}
function rechercherInformationsComplementairesSurNom($nom_saisi) {
public function rechercherInformationsComplementairesSurNom($nom_saisi) {
$value = array();
if($nom_saisi != null && $nom_saisi != "") {
$requete_infos_comp_sur_nom = 'SELECT * FROM eflore_nom_intitule '.
$requete_infos_comp_sur_nom = 'SELECT * FROM '.$this->config['cel_db']['bdd_eflore'].'.eflore_nom_intitule '.
'WHERE eni_id_categorie_format = 3 AND '.
'eni_id_version_projet_nom = 25 AND '.
'(eni_id_valeur_format = 3 OR eni_id_valeur_format = 4) AND '.
91,40 → 186,14
return $value;
}
 
function formaterNom($rawnom) {
 
// Constitution du nom:
$nom = '';
 
if ($rawnom['en_nom_supra_generique'] != '') {
$nom .= $rawnom['en_nom_supra_generique'];
} else if ($rawnom['en_epithete_infra_generique'] != '') {
$nom .= $rawnom['en_epithete_infra_generique'];
} else {
if ($rawnom['en_nom_genre'] != '') {
$nom .= $rawnom['en_nom_genre'];
}
if ($rawnom['en_epithete_espece']!= '') {
$nom .= ' '.$rawnom['en_epithete_espece'];
}
if ($rawnom['en_epithete_infra_specifique'] != '') {
if (!empty($rawnom['enrg_abreviation_rang'])) {
$nom .= ' '.$rawnom['enrg_abreviation_rang'].'';
}
$nom .= ' '.$rawnom['en_epithete_infra_specifique'];
}
 
}
 
return $nom .$this->retournerAuteur($rawnom) ;
}
 
function rechercherFamille($taxon) {
public function rechercherFamille($taxon) {
$row=array();
$requete_famille = "SELECT DISTINCT en_ce_rang, etr_id_taxon_2, en_id_nom, en_nom_supra_generique ".
" FROM eflore_taxon_relation, eflore_selection_nom, eflore_nom ".
" FROM eflore_taxon_relation, ".
" eflore_selection_nom, ".
" eflore_nom ".
" WHERE etr_id_taxon_1 = ".$taxon.
" AND etr_id_version_projet_taxon_1 = 25 ".
" AND etr_id_categorie_taxon = 3 ".
143,10 → 212,58
return $row;
}
public function rechercherNumTaxSurNumNom($num_nom) {
$requete_num_tax = "SELECT DISTINCT b.esn_id_taxon FROM eflore_nom, eflore_nom_rang," .
" eflore_selection_nom a, eflore_selection_nom b".
" WHERE a.esn_id_nom= ".$this->proteger($num_nom).
" AND a.esn_id_version_projet_taxon = 25 ".
" AND a.esn_id_taxon=b.esn_id_taxon ".
" AND b.esn_ce_statut=3 ".
" AND a.esn_id_version_projet_taxon=b.esn_id_version_projet_taxon" .
" AND en_ce_rang = enrg_id_rang" .
" AND en_id_nom = b.esn_id_nom" .
" AND a.esn_id_version_projet_taxon=en_id_version_projet_nom ";
$res_num_nom = $this->requeter($requete_num_tax);
$nt = null;
if(is_array($res_num_nom) && count($res_num_nom) > 0) {
$nt=$res_num_nom[0]['esn_id_taxon'];
}
return $nt;
}
private function formaterNom($rawnom) {
 
// Constitution du nom:
$nom = '';
 
if ($rawnom['en_nom_supra_generique'] != '') {
$nom .= $rawnom['en_nom_supra_generique'];
} else if ($rawnom['en_epithete_infra_generique'] != '') {
$nom .= $rawnom['en_epithete_infra_generique'];
} else {
if ($rawnom['en_nom_genre'] != '') {
$nom .= $rawnom['en_nom_genre'];
}
if ($rawnom['en_epithete_espece']!= '') {
$nom .= ' '.$rawnom['en_epithete_espece'];
}
if ($rawnom['en_epithete_infra_specifique'] != '') {
if (!empty($rawnom['enrg_abreviation_rang'])) {
$nom .= ' '.$rawnom['enrg_abreviation_rang'].'';
}
$nom .= ' '.$rawnom['en_epithete_infra_specifique'];
}
}
 
function retournerAuteur($rawnom) {
return $nom.$this->retournerAuteur($rawnom) ;
}
 
private function retournerAuteur($rawnom) {
$auteurs = '';
$auteur_basio = '';
$auteur_modif = '';