| 18,6 → 18,8 |
|---|
| private $referentielDao = null; |
| private $traitementDao = null; |
| private $resultatDao = null; |
| private $metaDao = null; |
| private $colonnesOrdonnees = array(); |
| |
| public function __construct() { |
| parent::__construct(); |
| 31,6 → 33,54 |
|---|
| $this->resultatDao = new ResultatDao(); |
| $this->traitementDao = new TraitementDao(); |
| $this->referentielDao = new ReferentielDao(); |
| $this->metaDao = new MetaDao(); |
| // tableau colonnesOrdonnees à modifier aussi dans service/Recherche.php |
| $this->colonnesOrdonnees = array("nn" => array("Numéro nomenclatural","checked","Identifiant numérique du nom scientifique"), |
| "nr" => array("Numéro nomenclatural du nom retenu","checked","Identifiant numérique du nom scientifique (num_nom) retenu pour désigner le taxon"), |
| "nt" => array("Numéro taxonomique","checked","Identifiant numérique du taxon auquel est rattaché le nom"), |
| "cd" => array("Numéro INPN","checked","Identifiant numérique unique du nom scientifique attribué par l’INPN"), |
| "rg" => array("Code rang","checked","Code numérique indiquant le rang du nom scientifique (voir tableau 7 du manuel technique)"), |
| "fam" => array("Famille (APG III)","checked","Nom de la famille dans APG III"), |
| "nsc" => array("Nom avec auteur","checked","Nom scientifique avec auteur(s)"), |
| "bibc" => array("Année et bibliographie","checked","Format à étudier celui de Tela : 1868, Brev. Pl. Nov., 2 : 70 ou celui de Kew : Brev. Pl. Nov., 2 : 70 (1868)"), |
| "nsrc" => array("Nom retenu avec auteur","checked","Nom retenu pour tous les taxons (identique si le nom est édjà le nom retenu)"), |
| "nf" => array("Nom français normalisé","checked","Nom français conseillé pour ce taxon (à venir)"), |
| "extax" => array("Présent dans Taxref","checked",""), |
| "lien" => array("Permalien","checked","Lien http vers la fiche nomenclaturale"), |
| "ntsup" => array("Numéro nomenclatural rang supérieur","","Identifiant numérique du nom (num_nom) de rang supérieur dans la classification par défaut de l'index"), |
| "pre" => array("Répartition géographique","","Code indiquant si le taxon est présent dans la zone géographique définie par le référentiel (tableau 9)"), |
| "ns" => array("Nom sans auteur","","Nom scientifique sans auteur"), |
| "aut" => array("Auteur","","Intitulé de(s) l'auteur(s) du nom (abréviations standards de Brummitt et Powell)"), |
| "ann" => array("Année publication","","Année de la publication effective du support papier"), |
| "bib" => array("Bibliographie","","Référence bibliographique de la publication d'origine du nom"), |
| "ntype" => array("Numéro du type","","Identifiant numérique (num_nom) du 1er basionyme appliqué à la planche d'herbier"), |
| "nbas" => array("Numéro du basionyme","","Identifiant numérique (num_nom) du basionyme du nom"), |
| "genre" => array("Genre","","Nom d'un genre dans le cas d'un monôme du rang genre ou d'une combinaison"), |
| "esp" => array("Epithète espèce","","Épithète de l'espèce"), |
| "eing" => array("Epithète infragénérique","","Épithète infra-générique d'une combinaison dont le rang est situé entre le genre et l'espèce"), |
| "te" => array("Type d'épithète infraspécifique","","Abréviation indiquant le type de l'épithète infra-spécifique"), |
| "einsp" => array("Epithète infraspécifique","","Épithète infra-spécifique d'une combinaison"), |
| "hybp01" => array("Hybride parent 1","","Identifiant du nom (num_nom) du parent numéro 1 (dans le cas d'un hybride)"), |
| "nomsupgen" => array("Nom supra générique","","Monôme dont le rang est supérieur au genre"), |
| "hybp02" => array("Hybride parent 2","","Identifiant du nom (num_nom) du parent numéro 2 (dans le cas d'un hybride)"), |
| "stori" => array("Statut d'origine","","Code indiquant le statut d'origine du taxon dans la zone géographique définie par le référentiel (tableau 10)"), |
| "stint" => array("Statut d'introduction","","Code indiquant le statut d'introduction du taxon dans la zone géographique définie par le référentiel (tableau 11)"), |
| "stcul" => array("Statut de culture","","Code indiquant le statut de culture du taxon dans la zone géographique définie par le référentiel (tableau 12)"), |
| "notes" => array("Remarques","","Notes complémentaires"), |
| "nomadd" => array("Commentaires nomenclaturaux","","Commentaires nomenclaturaux pouvant être associés à un nom (voir tableau 8 du manuel technique)"), |
| "nsr" => array("Nom retenu sans auteur","","Nom scientifique du nom retenu sans auteur"), |
| "hom" => array("Homonymie","","Contient la valeur 1 si le nom possède un homonyme ou si le nom est un homonyme. Dans le cas contraire"), |
| "synprop" => array("Synonyme proprate","","Contient plusieurs identifiants numériques (num_nom) dans le cas d'un nom obtenu suite à la division d'un taxon. Contient un seul identifiant numérique (num_nom) dans le cas d'un nom obtenu suite à la fusion de plusieurs taxons."), |
| "syndout" => array("Synonyme douteux","","Contient la valeur 1 si le nom est un synonyme douteux. Dans le cas contraire"), |
| "synmapp" => array("Synonyme mal appliqué","","Contient la valeur 1 si le nom est un synonyme mal appliqué (cas des sensu). Dans le cas contraire"), |
| "synorth" => array("Synonyme orthographique","","Contient l'identifiant numérique du nom (num_nom) correctement orthographié"), |
| "orthori" => array("Orthographe originelle","","Contient la graphie originelle d'un nom non-conforme faisant l'objet d'une correction orthographique obligatoire"), |
| "hybp01n" => array("Hybride parent 1 notes","","Notes éventuelles sur l'hybridité et le parent numéro 1"), |
| "hybp02n" => array("Hybride parent 2 notes","","Notes éventuelles sur l'hybridité et le parent numéro 2"), |
| "cultgp" => array("Groupe de cultivar","","Nom d'un groupe de cultivar (sansl'abréviation « Gp »)"), |
| "cult" => array("Nom cultivar","","Nom d'un cultivar (sans les guillemets simple ou abréviation « cv. »)"), |
| "nomcomm" => array("Nom commercial","","Nom commercial d'une plante (en majuscule"), |
| "autres" => array("Autres","","colonnes spécifiques au référentiel")); |
| } |
| |
| //+----------------------------------------------------------------------------------------------------------------+ |
| 58,10 → 108,13 |
|---|
| $donnees['url_menu_test'] = $this->obtenirUrlMenuTest($this->referentiel); |
| $donnees['url_menu_versionnage'] = $this->obtenirUrlMenuVersionnage($this->referentiel); |
| $donnees['url_menu_consultation'] = $this->obtenirUrlMenuConsultation($this->referentiel); |
| $donnees['url_form_telech'] = $this->obtenirUrlDetailReferentielTelechargement($this->referentiel); |
| |
| // suppression du téléchargement pour bdbfx |
| if ($this->referentiel != 'bdbfx') { |
| $donnees['versions'] = $this->afficherFormulaireTelechargementsReferentiels(); |
| $donnees['infos_telechargements'] = $this->afficherTelechargementsReferentiels(); |
| $donnees['colonnesOrdonnees'] = $this->colonnesOrdonnees; |
| } |
| } else { |
| $this->addMessage("Aucun code de projet de référentiel n'est indiqué (Ex. bdtfx)."); |
| 72,6 → 125,64 |
|---|
| $this->setSortie(self::RENDU_CORPS, $this->getVue('detail_referentiel', $donnees), false); |
| } |
| |
| public function telecharger() { |
| //$this->afficherDetail(); |
| $dossier = '/home/delphine/tmp/'; |
| $parametres['ref'] = $this->referentiel; |
| $parametres['version'] = $_POST["version"]; |
| $parametres['version'] = str_replace(".", "_", $parametres['version']); |
| $parametres['champs'] = implode(",",$_POST["champs"]); |
| $parametres['filtres'] = implode(",",$_POST["filtres"]); |
| $this->supprimerAncienExport($dossier); |
| $ref = $this->referentielDao->exporter($parametres); |
| $meta = $this->metaDao->exporter($parametres); |
| $zip = new ZipArchive(); |
| if($zip->open($dossier.date('Y_m_d').'/'.$this->referentiel.time().'.zip', ZipArchive::CREATE) === true){ |
| // Ajout des fichiers métadonnées, référentiel et manuel technique |
| $meta = str_replace("\\/", "/", $meta); |
| if (file_exists($meta)) $metazip = $zip->addFile($meta, "informations.csv"); |
| if (file_exists($ref)) $refzip = $zip->addFile($ref, "referentiel.csv"); |
| if (file_exists($dossier.'mtpr_V4_4.pdf')) $zip->addFile($dossier.'mtpr_V4_4.pdf', 'manuel_technique.pdf'); |
| // Et on referme l'archive |
| $zip->close(); |
| } else { |
| print_r('Impossible d'ouvrir "Zip.zip<br/>'); |
| } |
| |
| if (file_exists($fichier)) { |
| print_r("<a href='".$zip."'>"); |
| } |
| } |
| |
| private function supprimerAncienExport($dossier) { |
| $pointeur = opendir($dossier); |
| // si pas d'erreur d'ouverture du dossier on lance le scan |
| if( $pointeur != false ) { |
| // Parcours du repertoire |
| while( $ss_dossier = readdir($pointeur)) { |
| if($ss_dossier != "." && $ss_dossier != "..") { |
| $chemin_complet = $dossier . $ss_dossier; |
| if (is_dir($chemin_complet) && $ss_dossier < date('Y_m_d')) { |
| $fichiers = scandir($chemin_complet); |
| foreach ($fichiers as $fichier) { |
| if($fichier != "." && $fichier != "..") { |
| unlink($chemin_complet."/".$fichier); |
| } |
| } |
| rmdir($chemin_complet); |
| } |
| } |
| } |
| closedir($pointeur); |
| } |
| } |
| |
| private function afficherFormulaireTelechargementsReferentiels() { |
| $versions = $this->traitementDao->getTraitementsTermines($this->referentiel, 'versionnage'); |
| foreach ($versions as $id => $version) { |
| $versions[$id] = (unserialize($versions[$id]["script_parametres"])); } |
| return $versions; |
| } |
| private function afficherTelechargementsReferentiels() { |
| $infos_telechargements = array(); |
| // Recherche des traitements déjà effectué |