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/trunk/interfaces/controleurs/FicheTaxon.php
16,6 → 16,59
private $donnees = array();
protected $taxonDao = null;
// Codification de la présence d'un taxon
private $presence_taxon = array (
'P' => 'Présent',
'S' => 'Supposé présent (présence à confirmer)',
'D' => 'Présence douteuse',
'E' => 'Éteint',
'C' => 'Cité par erreur comme présent',
'A' => 'Absent',
'' => 'Pas d\'information',
'-' => 'Autre statut de présence',
'E-W' => 'Disparu',
'P-B' =>'Présence accidentelle (Taxon « visiteur »)',
'E-F' => 'Trouvé en fouille',
'-C' => 'Cryptogène');
// Codification du statut d'origine
private $statut_origine= array(
'N' => 'Natif',
'S' => 'Supposé natif',
'D' => 'Origine douteuse',
'E' => 'Anciennement natif (éteint)',
'C' => 'Cité par erreur comme natif',
'A' => 'Non natif',
'' => 'Pas d\'information',
'X' => 'Inapplicable','-' => 'Autre statut d\'origine',
'N-E' => 'Endémique',
'N-S' => 'Sub-Endémique',
'E-Z' => 'Endémique éteinte');
// Codification du statut d'introduction
private $statut_introduction = array(
'I' => 'Introduit',
'S' => 'Supposé introduit',
'D' => 'Introduction douteuse',
'E' => 'Anciennement introduit (éteint)',
'C' => 'Cité par erreur comme introduit',
'A' => 'Non introduit',
'' => 'Pas d\'information',
'X' => 'Inapplicable',
'-' => 'Autre notion d\'introduction',
'I-J' => 'Introduit envahissant',
'I-M' => 'Domestique / Introduit non établi'
);
// Codification du statut de culture
private $statut_culture = array(
'C' => 'Cultivé en extérieur',
'I' => 'Cultivé en intérieur',
'S' => 'Supposé cultivé',
'D' => 'Culture douteuse',
'E' => 'Anciennement cultivé (éteint)',
'C' => 'Cité par erreur comme cultivé',
'' => 'Pas d\'information',
'X' => 'Inapplicable',
'-' => 'Autre notion de culture'
);
//+----------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// Méthodes
/**
26,7 → 79,7
}
// +---------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// FICHE COLLECTION
// FICHE CONSULTATION TAXON
public function afficherTaxon() {
// Récupération du référentiel
if (isset($_GET['ref'])) {
48,22 → 101,139
$this->donnees['num_nom'] = $_GET['num_nom'];
$this->donnees['num_nom_retenu'] = $_GET['num_nom_retenu'];
$this->donnees['nom'] = $_GET['nom'];
//$this->donnees['info'] = $this->taxonDao->getTaxon($this->referentiel, $this->donnees['num_nom']);
$this->donnees['info'] = $this->taxonDao->getTaxon($this->referentiel, $this->donnees['num_nom']);
// Chargement des données des onglets
$this->chargerNomenclature();
//print_r($this->donnees);
/*$this->chargerSynonymie();
$this->chargerClassification();
$this->chargerNotes();
$this->chargerSynonymie();
//$this->chargerClassification();
$this->chargerChorologie();
$this->chargerComplements();*/
//$this->chargerComplements();
$this->setSortie(self::RENDU_CORPS, $this->getVue('fiche_taxon', $this->donnees));
//$this->chargerPiedDePage();
}
}
private function chargerNomenclature() {
$this->donnees['selectionne'] = $this->taxonDao->getNomenclature($this->referentiel, $this->donnees['num_nom']);
if (strpos($this->donnees['nom'], ' x ') ) {
if ($this->donnees['num_nom'] != $this->donnees['num_nom_retenu']) {
$this->donnees['retenu'] = $this->taxonDao->getNomenclature($this->referentiel, $this->donnees['num_nom_retenu']);
$this->donnees['parents'] = $this->taxonDao->getParentsHybride($this->referentiel, $this->donnees['num_nom_retenu']);
} else {
$this->donnees['parents'] = $this->taxonDao->getParentsHybride($this->referentiel, $this->donnees['num_nom']);
}
} else {
if ($this->donnees['num_nom'] != $this->donnees['num_nom_retenu']) {
$this->donnees['retenu'] = $this->taxonDao->getNomenclature($this->referentiel, $this->donnees['num_nom_retenu']);
}
}
}
// recherche les synonymes (à compléter)
private function chargerSynonymie() {
$rechercheDao = new RechercheDao();
// recherche des synonymes nomenclaturaux et taxonomiques
$parametres = $this->parserChaineDeRecherche('nn:'.$this->donnees['num_nom'].' tax:1');
$parametres['ref']= $this->referentiel;
$synonymes = $rechercheDao->chercher('ParTaxon', $parametres);
foreach ($synonymes as $synonyme) {
if ($this->donnees['num_nom'] != $synonyme['num_nom'] && $synonyme['basionyme'] != null) {
if (($this->donnees['num_nom'] != $synonyme['num_nom']) && ($synonyme['basionyme'] == $this->donnees['num_nom'] ||
$this->donnees['info']['basionyme'] == $synonyme['num_nom'] || $this->donnees['info']['basionyme'] == $synonyme['basionyme'])) {
$this->donnees['fiche_synonymie']['nomenclaturale'][] = $synonyme;
} elseif ($this->donnees['num_nom'] != $synonyme['num_nom'] && $synonyme['basionyme'] != null &&
$this->donnees['info']['basionyme'] != null) {
$this->donnees['fiche_synonymie']['taxonomique'][] = $synonyme;
}
} elseif ($this->donnees['num_nom'] != $synonyme['num_nom']) {
///nom est synonyme mal applique de num_nom_retenu
if ($synonyme['synonyme_mal_applique'] == 1) {
$this->donnees['fiche_synonymie']['mal appliquée'][] = $synonyme;
} else {
$this->donnees['fiche_synonymie']['indéterminée (pas de basionyme)'][] = $synonyme;
}
}
}
// recherche synonyme proparte
if ($this->donnees['info']['synonyme_proparte'] != ''){
$this->donnees['fiche_synonymie']['pro parte']['num_nom'] = $this->donnees['info']['synonyme_proparte'];
}
// recherche si taxon est un synonyme douteux
if ($this->donnees['info']['synonyme_douteux'] == 1) {
$this->donnees['fiche_synonymie']['douteux']['num_nom'] = $this->donnees['info'];
}
}
private function chargerChorologie() {
foreach ($this->donnees['info'] as $param => $valeur) {
if ($param == 'presence') {
$this->donnees['chorologie']['Présence']['France']['code'] = $valeur;
$this->donnees['chorologie']['Présence']['France']['valeur'] = $this->presence_taxon[$valeur];
} elseif (preg_match('/presence_(.*)/', $param, $lieu)) {
$this->donnees['chorologie']['Présence'][$lieu['1']]['code'] = $valeur;
$this->donnees['chorologie']['Présence'][$lieu['1']]['valeur'] = $this->presence_taxon[$valeur];
} elseif ($param == 'statut_origine') {
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine']['France']['code'] = $valeur;
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine']['France']['valeur'] = $this->statut_origine[$valeur];
} elseif (preg_match('/statut_origine_(.*)/', $param, $lieu)) {
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine'][$lieu['1']]['code'] = $valeur;
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine'][$lieu['1']]['valeur'] = $this->statut_origine[$valeur];
} elseif ($param == 'statut_introduction') {
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction']['France']['code'] = $valeur;
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction']['France']['valeur'] = $this->statut_introduction[$valeur];
} elseif (preg_match('/statut_introduction_(.*)/', $param, $lieu)) {
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction'][$lieu['1']]['code'] = $valeur;
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction'][$lieu['1']]['valeur'] = $this->statut_introduction[$valeur];
} elseif ($param == 'statut_culture') {
$this->donnees['chorologie']['Statut de culture']['France']['code'] = $valeur;
$this->donnees['chorologie']['Statut de culture']['France']['valeur'] = $this->statut_culture[$valeur];
} elseif (preg_match('/statut_culture_(.*)/', $param, $lieu)) {
$this->donnees['chorologie']['Statut de culture'][$lieu['1']]['code'] = $valeur;
$this->donnees['chorologie']['Statut de culture'][$lieu['1']]['valeur'] = $this->statut_culture[$valeur];
}
}
foreach ($this->donnees['chorologie']['Présence'] as $lieu=>$valeur) {
if (!isset($this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine'][$lieu])) {
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine'][$lieu]['code'] = '';
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'origine'][$lieu]['valeur'] = $this->statut_origine[''];
}
if (!isset($this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction'][$lieu])) {
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction'][$lieu]['code'] = '';
$this->donnees['chorologie']['Statut d\'introduction'][$lieu]['valeur'] = $this->statut_introduction[''];
}
if (!isset($this->donnees['chorologie']['Statut de culture'][$lieu])) {
$this->donnees['chorologie']['Statut de culture'][$lieu]['code'] = '';
$this->donnees['chorologie']['Statut de culture'][$lieu]['valeur'] = $this->statut_culture[''];
}
}
}
private function parserChaineDeRecherche($chaine) {
$mots = preg_split('/ /i', $chaine, -1, PREG_SPLIT_NO_EMPTY);
$parametres = array('mots' => '');
$cle_precedente = null;
foreach ($mots as $mot) {
if (preg_match('/^(sg|gen|sp|ssp|au|an|nn|bib|nr|tax):(.*)$/', $mot, $match)) {
$cle = $match[1];
$cle_precedente = $cle;
$valeur = $match[2];
$parametres[$cle] = $valeur;
} else if (!is_null($cle_precedente)) {
$parametres[$cle_precedente] .= ' '.$mot;
} else if (is_null($cle_precedente)) {
if (empty($parametres['mots'])) {
$parametres['mots'] = $mot;
} else {
$parametres['mots'] .= ' '.$mot;
}
}
}
return $parametres;
}
// retourne l'url de la fiche taxon pour les liens
public static function getUrlFicheTaxon($params, $type) {
$taxon = null;
switch ($type) {
87,21 → 257,5
return Recherche::getUrlFicheTaxon($taxon);
}
private function chargerNomenclature() {
$this->donnees['selectionne'] = $this->taxonDao->getNomenclature($this->referentiel, $this->donnees['num_nom']);
if (strpos($this->donnees['nom'], ' x ') ) {
if ($this->donnees['num_nom'] != $this->donnees['num_nom_retenu']) {
$this->donnees['retenu'] = $this->taxonDao->getNomenclature($this->referentiel, $this->donnees['num_nom_retenu']);
$this->donnees['parents'] = $this->taxonDao->getParentsHybride($this->referentiel, $this->donnees['num_nom_retenu']);
} else {
$this->donnees['parents'] = $this->taxonDao->getParentsHybride($this->referentiel, $this->donnees['num_nom']);
}
} else {
if ($this->donnees['num_nom'] != $this->donnees['num_nom_retenu']) {
$this->donnees['retenu'] = $this->taxonDao->getNomenclature($this->referentiel, $this->donnees['num_nom_retenu']);
}
}
}
 
}