Subversion Repositories Applications.referentiel

Compare Revisions

Ignore whitespace Rev 71 → Rev 72

/trunk/interfaces/squelettes/resultat_recherche_taxon.tpl.html
New file
0,0 → 1,63
<!-- REF - DEBUT RESULTAT -->
<div id="ref-resultat-recherche">
<?=$fragmenteur;?>
<? if (isset($resultats)) : ?>
<table>
<thead>
<tr>
<th>Identifiant numérique du nom scientifique retenu</th>
<th>Identifiant numérique du nom scientifique</th>
<th>Nom scientifique</th>
<th>Auteur</th>
<th>Année</th>
<th>Référence bibliographique</th>
<th>Nom addendum</th>
</tr>
</thead>
<tbody>
<?if (isset($resultats['nom_retenu'])) :
foreach ($resultats['nom_retenu'] as $id => $retenu) : ?>
<tr class='nom_retenu'>
<td></td>
<td><?=$retenu['num_nom'];?></td>
<td><?=$retenu['nom_complet'];?></td>
<td><?=$retenu['auteur'];?></td>
<td><?=$retenu['annee'];?></td>
<td><?=$retenu['biblio_origine'];?></td>
<td><?=$retenu['nom_addendum'];?></td>
</tr>
<?if (isset($resultats[$id])) :
foreach ($resultats[$id] as $synonyme) : ?>
<tr>
<td><?=$synonyme['num_nom_retenu'];?></td>
<td><?=$synonyme['num_nom'];?></td>
<td><?=$synonyme['nom_complet'];?></td>
<td><?=$synonyme['auteur'];?></td>
<td><?=$synonyme['annee'];?></td>
<td><?=$synonyme['biblio_origine'];?></td>
<td><?=$synonyme['nom_addendum'];?></td>
</tr>
<? endforeach;
endif;
endforeach;
else :
foreach ($resultats as $res) :
foreach ($res as $synonyme) : ?>
<tr>
<td><?=$synonyme['num_nom_retenu'];?></td>
<td><?=$synonyme['num_nom'];?></td>
<td><?=$synonyme['nom_complet'];?></td>
<td><?=$synonyme['auteur'];?></td>
<td><?=$synonyme['annee'];?></td>
<td><?=$synonyme['biblio_origine'];?></td>
<td><?=$synonyme['nom_addendum'];?></td>
</tr>
<? endforeach;
endforeach;
endif;?>
</tbody>
</table>
<? endif; ?>
</div>
<!-- REF - FIN RESULTAT -->
/trunk/interfaces/controleurs/Recherche.php
5,6 → 5,7
*
* @package Referentiel
* @category Php5
* @author Delphine CAUQUIL <delphine@tela-botanica.org>
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @copyright 2010 Tela-Botanica
* @license http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
16,11 → 17,13
private $chaine_recherche = null;
private static $url_exemple = null;
private $referentiel = null;
private $donnees_par_page;
private $donnees_par_page_choix;
//+----------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// Méthodes
/**
* Fonction d'affichage par défaut, elle appelle la liste des administrateurs
* Fonction d'affichage par défaut
*/
public function executerActionParDefaut() {
return $this->rechercher();
40,7 → 43,7
$donnees['url_referentiel'] = $this->referentiel;
$donnees['url_module'] = 'Recherche';
$donnees['url_action'] = 'rechercher';
self::$url_exemple = $this->obtenirUrlRecherche('BDNFM','%s');
self::$url_exemple = $this->obtenirUrlRecherche('bdnff','%s');
// Gestion du squelette et de la sortie
$this->setSortie(self::RENDU_TETE, $this->getVue('moteur', $donnees));
87,10 → 90,12
* @return string la vue correspondante
*/
public function rechercher() {
$this->donnees_par_page = Config::get('resultat_par_page_defaut');
$this->donnees_par_page_choix = Config::get('resultat_par_page_choix');
$donnees = array();
$rechercheDao = new RechercheDao();
$parametres = array('mots' => '*');
if (isset($_GET['ref'])) { // code du projet courrant
if (isset($_GET['ref'])) { // code du projet courant
$this->referentiel = strtolower($_GET['ref']);
}
$this->definirCommeModulePrincipal(get_class($this));
97,7 → 102,7
$this->construireMenu($this->referentiel);
$this->construireFilAriane($this->referentiel);
// Récupération des paramêtres de l'url
// Récupération des paramètres de l'url
$chaine_de_recherche = $this->obtenirChaineRecherche();
if (!empty($chaine_de_recherche)) {
$this->url->setVariablesRequete(array('module' => 'Recherche',
107,16 → 112,41
}
$parametres = $this->parserChaineDeRecherche($chaine_de_recherche);
$parametres['ref'] = $this->referentiel;
if (isset($parametres['tax']) && ($parametres['tax'] == 1)) {
$this->donnees_par_page = 2;
$this->donnees_par_page_choix = '1,2,5,10';
$donnees['fragmenteur'] = $this->gererFragmenteur($rechercheDao, $parametres, 'NombreTaxon');
$resultats = $rechercheDao->chercher('ParTaxon', $parametres);
foreach ($resultats as $res) {
if ($res['num_nom'] == $res['num_nom_retenu']) {
$donnees['resultats']['nom_retenu'][$res['num_nom_retenu']] = $res;
} else {
$donnees['resultats'][$res['num_nom_retenu']][$res['num_nom']] = $res;
}
}
$resultat = $this->getVue('resultat_recherche_taxon', $donnees);
} else {
$donnees['fragmenteur'] = $this->gererFragmenteur($rechercheDao, $parametres);
$donnees['resultats'] = $rechercheDao->chercher('ParDefaut', $parametres);
$resultat = $this->getVue('resultat_recherche', $donnees);
}
// Gestion des squelettes
$this->chargerMoteurRecherche($this->referentiel);
$this->setSortie(self::RENDU_CORPS, $resultat);
}
private function gererFragmenteur($rechercheDao, $parametres, $type = 'Nombre') {
// Gestion du nombre de résultats
$donnees_total = $rechercheDao->chercherStructureNbre($parametres);
$donnees_total = $rechercheDao->chercherStructureNbre($type, $parametres);
// Gestion du fragmenteur
$options = array(
'url' => $this->url,
'donnees_total' => $donnees_total,
'donnees_par_page' => Config::get('resultat_par_page_defaut'),
'donnees_par_page_choix' => Config::get('resultat_par_page_choix'),
);
'donnees_par_page' => $this->donnees_par_page,
'donnees_par_page_choix' => $this->donnees_par_page_choix);
$fragmenteur = Composant::fabrique('fragmenteur', $options);
$donnees['fragmenteur'] = $fragmenteur->executer();
list($de, $a) = $fragmenteur->getDeplacementParPageId();
125,13 → 155,7
// Gestion de l'accès aux données
$rechercheDao->setLimitation(($de - 1), $fragmenteur->getDonneesParPage());
$rechercheDao->setDistinction(1);
$donnees['resultats'] = $rechercheDao->chercher($parametres);
// Gestion des squelettes
$this->chargerMoteurRecherche($this->referentiel);
$resultat = $this->getVue('resultat_recherche', $donnees);
$this->setSortie(self::RENDU_CORPS, $resultat);
return $donnees['fragmenteur'];
}
private function parserChaineDeRecherche($chaine) {
153,34 → 177,7
$parametres['mots'] .= ' '.$mot;
}
}
}
$this->remplacerAbreviationParId($parametres);
}
return $parametres;
}
private function remplacerAbreviationParId(&$parametres) {
// liste 27 : Liste des relations entre une collection et une personne (id:1030)
// liste 80 : Liste des types de collection botanique (id:1083)
$params_a_remplacer = array('veg' => 1043, 'bot' => 1083, 'pr' => 1030);
foreach ($params_a_remplacer as $param => $id_liste) {
if (isset($parametres[$param])) {
// Si plusieurs valeurs séparées par des virgules
$valeurs = explode(',', $parametres[$param]);
$valeurs_nbre = count($valeurs);
$liste = Ontologie::getListeTrieeParAbreviation($id_liste);
foreach ($valeurs as $valeur) {
$cle = strtoupper($valeur);
if (isset($liste[$cle])) {
if ($valeurs_nbre == 1) {
$parametres[$param] = $liste[$cle]['id'];
} else if ($valeurs_nbre > 1) {
$valeur = preg_quote($valeur, '/');
$parametres[$param] = preg_replace("/$valeur/", $liste[$cle]['id'], $parametres[$param]);
}
}
}
}
}
}
}
/trunk/services/modules/Recherche.php
4,13 → 4,14
* fournis en paramètre.
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
*
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @author Delphine CAUQUIL <delphine@tela-botanica.org>
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @license http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
* @license http://www.gnu.org/licenses/gpl.html Licence GNU-GPL
* @version $Id$
* @version $Id$
* @copyright 2010 Tela-Botanica
*/
 
class Recherche extends Ref {
 
/**
21,7 → 22,7
// Initialisation des variables
$info = array();
// Nour recherchons le type de requête demandé
// Nous recherchons le type de requête demandé
$type = $param[0];
$methode = 'getElement'.$type;
36,92 → 37,93
$this->envoyer($info);
}
/* Méthode pour récupérer une liste d'information sur les collections et/ou structures en fonction de mots et de
* restrictions.
/* Méthode pour récupérer le nombre de taxons répondant à la requête
* Appelée avec les paramètres d'url suivant :
* /Recherche/Nombre/_
* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés
* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
*/
public function getElementNombre($param) {
// Initialisation des variables
$info = array();
// Pré traitement des paramètres
$p = $this->pretraiterParametresUrl($param);
$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2);
 
// Construction de la requête
// Il est important de compter le nombre de taxons pour l'affichage
$requete = (($this->distinct) ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' COUNT(num_nom) AS nbre FROM '.$referentiel.
$this->construireWhere($p).' ';
 
// Récupération des résultats
try {
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetch(PDO::FETCH_ASSOC);
if ($donnees === false) {
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat.";
} else {
$info = $donnees['nbre'];
}
} catch (PDOException $e) {
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
}
 
return $info;
}
/* Méthode pour récupérer une liste de taxons
* Appelée avec les paramêtres d'url suivant :
* /CoelRecherche/ParDefaut/_
* ou les _ représentent dans l'ordre : mots
* Si un des paramêtres est abscent, il prendre la valeur *
* /Recherche/ParDefaut/_
* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés
* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
*/
public function getElementParDefaut($param) {
// Initialisation des variables
$info = array();
// Pré traitement des paramêtres
// Pré traitement des paramètres
$p = $this->pretraiterParametresUrl($param);
$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2);
// Construction de la requête
if (isset($p['tax']) && $p['tax'] == true) {
$requete_synonyme = 'SELECT DISTINCT num_nom_retenu FROM '.$referentiel.
$this->construireFromEtWhere($p).';';
try {
$info = '';
$donnees_synonyme = $this->bdd->query($requete_synonyme)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
if ($donnees_synonyme === false) {
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat.";
} else{
$liste_nom = '';
foreach ($donnees_synonyme as $donnees_syn) {
if ($donnees_syn['num_nom_retenu'] != '') {
$liste_nom .= (!empty($liste_nom) ? ', ' : '').'"'.$donnees_syn['num_nom_retenu'].'"';
}
}
// Construction de la requête
$requete = (($this->distinct) ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' num_nom, nom_complet, auteur, annee, '.
'biblio_origine, nom_addendum, num_nom_retenu FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p).
'ORDER BY '.((!is_null($this->orderby)) ? $this->orderby : 'num_nom ASC, nom_complet ASC').' '.
"LIMIT $this->start, $this->limit ";
$requete = (($this->distinct) ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' num_nom, nom_complet, auteur, annee, '.
'biblio_origine, nom_addendum, num_nom_retenu FROM '.$referentiel.' WHERE num_nom_retenu IN ('.$liste_nom.') '.
'ORDER BY num_nom_retenu '."LIMIT $this->start, $this->limit ";
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
$info = $donnees;
}
} catch (PDOException $e) {
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
// Récupération des résultats
try {
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
if ($donnees === false) {
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat.";
} else {
$info = $donnees;
}
return $info;
} else {
$requete = (($this->distinct) ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' num_nom, nom_complet, auteur, annee, '.
'biblio_origine, nom_addendum, num_nom_retenu FROM '.$referentiel.
$this->construireFromEtWhere($p).
'ORDER BY '.((!is_null($this->orderby)) ? $this->orderby : 'num_nom ASC, nom_complet ASC').' '.
"LIMIT $this->start, $this->limit ";
// Récupération des résultats
try {
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
if ($donnees === false) {
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat.";
} else {
$info = $donnees;
}
} catch (PDOException $e) {
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
}
return $info;
} catch (PDOException $e) {
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
}
return $info;
}
/* Méthode pour récupérer une liste d'information sur les collections et/ou structures en fonction de mots et de
* restrictions.
* Appelée avec les paramêtres d'url suivant :
* /CoelRecherche/ParDefaut/_
* ou les _ représentent dans l'ordre : mots
* Si un des paramêtres est abscent, il prendre la valeur *
/* Méthode pour récupérer le nombre de taxons répondant à une requête sur la synonymie
* Appelée avec les paramètres d'url suivant :
* /Recherche/Nombre/_
* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés
* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
*/
public function getElementNombre($param) {
public function getElementNombreTaxon($param) {
// Initialisation des variables
$info = array();
// Pré traitement des paramêtres
// Pré traitement des paramètres
$p = $this->pretraiterParametresUrl($param);
$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2);
 
// Construction de la requête
// Il est important de compter le nombre d'association structure-collection différentes pour obtenir le bon nombre
$requete = (($this->distinct) ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' COUNT(num_nom) AS nbre FROM '.$referentiel.
$this->construireFromEtWhere($p).' ';
// Il est important de compter le nombre de taxons pour l'affichage
$requete = 'SELECT count(DISTINCT num_nom_retenu) as nbr FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p).';';
 
// Récupération des résultats
try {
129,7 → 131,7
if ($donnees === false) {
$this->messages[] = "La requête a retourné aucun résultat.";
} else {
$info = $donnees['nbre'];
$info = $donnees['nbr'];
}
} catch (PDOException $e) {
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
138,8 → 140,73
return $info;
}
/* Méthode pour récupérer une liste de taxons
* Appelée avec les paramêtres d'url suivant :
* /Recherche/ParDefaut/_
* ou les _ représentent dans l'ordre : référentiel, mots, paramétres avancés
* Si un des paramètres est absent, il prendre la valeur *
*/
public function getElementParTaxon($param) {
// Initialisation des variables
$info = array();
// Pré traitement des paramètres
$p = $this->pretraiterParametresUrl($param);
$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2);
$liste_nom = $this->getNomRetenu($param);
// Construction de la requête
// si recherche des synonymes
$requete = (($this->distinct) ? 'SELECT DISTINCT' : 'SELECT').' num_nom, nom_complet, auteur, annee, '.
'biblio_origine, nom_addendum, num_nom_retenu FROM '.$referentiel.' WHERE num_nom_retenu IN ('
.$liste_nom.') ORDER BY num_nom ASC ';
try {
$info = '';
$donnees = $this->bdd->query($requete)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
$info = $donnees;
} catch (PDOException $e) {
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
}
return $info;
}
/* Méthode pour récupérer une liste de noms retenus
*/
public function getNomRetenu($param) {
// Initialisation des variables
$info = array();
// Pré traitement des paramètres
$p = $this->pretraiterParametresUrl($param);
$referentiel = substr($p['ref'], 2, -2);
// Construction de la requête
// si recherche des synonymes
$requete_nom_retenu = 'SELECT DISTINCT num_nom_retenu FROM '.$referentiel.$this->construireWhere($p)
."ORDER BY num_nom ASC LIMIT $this->start, $this->limit ".';';
try {
$info = '';
$donnees_nom_retenu = $this->bdd->query($requete_nom_retenu)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
 
if ($donnees_nom_retenu === false) {
$this->messages[] = "La requête n'a retourné aucun résultat.";
} else {
$liste_nom = '';
foreach ($donnees_nom_retenu as $donnees_nom) {
if ($donnees_nom['num_nom_retenu'] != '') {
$liste_nom .= (!empty($liste_nom) ? ', ' : '').'"'.$donnees_nom['num_nom_retenu'].'"';
}
}
$info = $liste_nom;
}
} catch (PDOException $e) {
$this->messages[] = sprintf($this->getTxt('sql_erreur'), $e->getFile(), $e->getLine(), $e->getMessage());
}
return $info;
}
private function pretraiterParametresUrl($param) {
// Tableau des paramêtres qui peuvent être passés dans l'url
// Tableau des paramètres qui peuvent être passés dans l'url
$params_passes = array('ref' => 'str',
'mots' => 'str',
'sg' => 'str',
160,7 → 227,7
// Suppression des éventuels espaces en début et fin de chaine
$valeur = trim($p[$param_passe]);
// Type de paramêtre chaine
// Type de paramètre chaine
if ($type == 'str') {
// Suppression des slash
$valeur = stripslashes($valeur);
173,10 → 240,10
$mots = explode(' ', $valeur);
$valeur = '%'.implode ('%', $mots).'%';
}
// Mise en place des quotes pour l'intérogation dans la bdd
// Mise en place des quotes pour l'interrogation dans la bdd
$valeur = $this->bdd->quote($valeur);
}
// Type de paramêtre booléen
// Type de paramètre booléen
if ($type == 'bool') {
if (preg_match('/^[0]$/', $valeur)) {
$valeur = false;
183,15 → 250,15
} else if (preg_match('/^[1]$/', $valeur)) {
$valeur = true;
} else {
$this->messages[] = "Le paramêtre '$param_passe' attend une valeur de type 0 ou 1 et non '$valeur'.";
$this->messages[] = "Le paramètre '$param_passe' attend une valeur de type 0 ou 1 et non '$valeur'.";
$valeur = null;
}
}
// Type de paramêtre entier
// Type de paramètre entier
if ($type == 'int') {
if (!preg_match('/^(?:[0-9]+,\s*)*[0-9]+$/', $valeur)) {
$this->messages[] = "Le paramêtre '$param_passe' attend une ou plusieurs valeurs de type entiers ".
$this->messages[] = "Le paramètre '$param_passe' attend une ou plusieurs valeurs de type entiers ".
"séparés par des virgules et non '$valeur'.";
$valeur = null;
}
204,13 → 271,11
return $p;
}
private function construireFromEtWhere($p) {
private function construireWhere($p) {
// Initialisation de variables
$from_et_where = '';
//$from = "FROM ".$p['ref']." ";
$where = ' WHERE ';
// Construire from et where en fonction des paramêtres
// Construire where en fonction des paramêtres
if (isset($p['mots'])) {
$where .= 'AND ('.
" num_nom LIKE {$p['mots']} ".
260,7 → 325,7
$where .= "AND epithete_sp LIKE {$p['sp']} ";
}
if (isset($p['ssp'])) {
$where .= "AND epithete_sp LIKE {$p['sp']} ";
$where .= "AND epithete_infra_sp LIKE {$p['ssp']} ";
}
if (isset($p['au'])) {
$where .= "AND auteur LIKE {$p['au']} ";
282,14 → 347,11
$where = str_replace('WHERE AND', ' WHERE ', $where);
// Retour du From et Where associé
// Retour du Where associé
if (count($p) == 0) {
$from_et_where = "";
//$from_et_where = $from;
} else {
$from_et_where = $where;//$from.$where;
$where = "";
}
return $from_et_where;
return $where;
}
}
?>
/trunk/bibliotheque/dao/RechercheDao.php
New file
0,0 → 1,57
<?php
// declare(encoding='UTF-8');
/**
* Modèle d'accès à la base de données des Référentiels.
* Permet d'accèder au méta-données des référentiels.
*
* @package Referentiel
* @category Php 5.2
* @author Delphine CAUQUIL <delphine@tela-botanica.org>
* @author aurelien <aurelien@tela-botanica.org>
* @copyright 2010 Tela-Botanica
* @license http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
* @license http://www.gnu.org/licenses/gpl.html Licence GNU-GPL
* @version SVN: $Id$
*
*/
class RechercheDao extends Dao {
const SERVICE = 'Recherche';
/**
* Recherche un référentiel en fonction de paramètres
* @return le nombre de résultats répondant à la requête
*/
public function chercherStructureNbre($type, $parametres) {
$url = $this->construireUrlRecherche($type, $parametres, false);
$json = $this->envoyerRequeteConsultation($url);
$donnees = json_decode($json);
return $donnees;
}
/**
* Recherche un référentiel en fonction de paramêtres
* @return array un tableau contenant des objets d'informations sur les taxons
*/
public function chercher($type, $parametres) {
$url = $this->construireUrlRecherche($type, $parametres);
$json = $this->envoyerRequeteConsultation($url);
$donnees = json_decode($json, true);
return $donnees;
}
private function construireUrlRecherche($type, $parametres, $limitation = true) {
$url = $this->url_jrest.self::SERVICE.'/'.$type;
$params_a_passer = array('ref', 'mots', 'sg', 'gen', 'sp', 'ssp', 'au', 'an', 'nn', 'bib', 'nr', 'tax');
foreach ($params_a_passer as $param_cle) {
if (isset($parametres[$param_cle]) && $parametres[$param_cle] != '') {
$valeur = urlencode(trim($parametres[$param_cle]));
$url .= '/'.$valeur;
} else {
$url .= '/*';
}
}
return $url;
}
}
?>