| /trunk/jrest/tests/phptests/determ-espece-bdnffnn.test.php |
|---|
| 1,3 → 1,3 |
| <?php |
| // test détermination espèce avec bdnffnn |
| return array('data' => array('Espèce' => 'BDNFFnn72475')); |
| return array('data' => array('Espèce' => 'bdtfx:nn:72475')); |
| /trunk/jrest/tests/phptests/determ-espece-bdnffnt.test.php |
|---|
| 1,3 → 1,3 |
| <?php |
| // test détermination espèce avec bdnffnt, minuscules |
| return array('data' => array('Espèce' => 'BDNFFnt5757')); |
| return array('data' => array('Espèce' => 'bdtfx:nt:5757')); |
| /trunk/jrest/tests/phptests/determ-espece-syno-bdnff.test.php |
|---|
| 8,4 → 8,4 |
| | 101838 | 101838 | Rhaponticum coniferum | |
| +---------+----------------+-----------------------+ |
| */ |
| return array('data' => array('Espèce' => 'BDNFFnn38821')); |
| return array('data' => array('Espèce' => 'bdtfx:nn:38821')); |
| /trunk/jrest/services/ImportXLS.php |
|---|
| 674,7 → 674,7 |
| TODO: s'affranchir du webservice pour la détermination du nom scientifique en s'appuyant sur cel_references, |
| pour des questions de performances |
| */ |
| static function traiterEspece($ligne, Array &$espece, $referentiel, $cel) { |
| static function traiterEspece($ligne, Array &$espece, &$referentiel, $cel) { |
| if(empty($ligne[C_NOM_SEL])) return; |
| // nom_sel reste toujours celui de l'utilisateur |
| 698,7 → 698,7 |
| SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html, auteur, annee, biblio_origine FROM bdtfx_v1_01 WHERE num_nom = 31468 |
| */ |
| // $determ = $taxon_info_webservice->rechercherInformationsComplementairesSurNom($ligne[C_NOM_SEL]); |
| // permet une reconnaissance de BDNFFnnXXXX |
| // permet une reconnaissance de bdtfx:nn:XXXX |
| $determ = $taxon_info_webservice->rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax(trim($ligne[C_NOM_SEL])); |
| // note: rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax peut ne retourner qu'une seule clef "nom_sel" |
| 722,8 → 722,19 |
| // ne devrait jamais arriver ! |
| if(!$determ) die("erreur critique: " . __FILE__ . ':' . __LINE__); |
| // succès de la détection = écrasement du numéro nomenclatural saisi... |
| $espece[C_NOM_SEL] = $determ->nom_sci; |
| // un schéma <ref>:(nt|nn):<num> (ie: bdtfx:nt:8503) a été passé |
| // dans ce cas on met à jour le référentiel avec celui passé dans le champ espèce |
| if(isset($determ->ref)) { |
| $referentiel = $determ->ref; |
| } |
| // succès de la détection |
| // nom_sel est remplacé, mais seulement si un motif spécial à été utilisé (bdtfx:nn:4567) |
| if($taxon_info_webservice->is_notation_spe) { |
| $espece[C_NOM_SEL] = $determ->nom_sci; |
| } |
| // écrasement des numéros (nomenclatural, taxonomique) saisis... |
| $espece[C_NOM_SEL_NN] = $determ->id; |
| $espece[C_NOM_RET] = RechercheInfosTaxonBeta::supprimerBiblio($determ->nom_retenu_complet); |
| $espece[C_NOM_RET_NN] = $determ->{"nom_retenu.id"}; |
| /trunk/jrest/lib/RechercheInfosTaxonBeta.php |
|---|
| 25,7 → 25,11 |
| private $masque_recherche = null; |
| private $code_referentiel = 'bdtfx'; |
| // initialisé à TRUE par rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax() |
| // si l'espèce passée a le motif <ref>:(nt|nn):<num>, eg: isfan:nt:1591 |
| public $is_notation_spe = FALSE; |
| public function RechercheInfosTaxonBeta($config, $code_referentiel = 'bdtfx') { |
| parent::__construct($config); |
| $this->code_referentiel = $code_referentiel; |
| 166,27 → 170,28 |
| return $presence_taxon; |
| } |
| public function effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumTax($numTax) { |
| //TODO: retourner moins de champs grâce au paramètre retour.champs |
| return @json_decode(file_get_contents($this->url_service_taxon."/nt:".$numTax)); |
| } |
| /* texte libre, nom scientifique, |
| ou code nomenclatural (format BDNFFnn999999) |
| ou code taxonomique (format BDNFFnt999999) |
| ou code nomenclatural (format bdtfx:nn:999999) |
| ou code taxonomique (format bdtfx:nt:999999) |
| TODO: voir ce qu'on fait pour l'import de différent référentiels */ |
| function rechercherInfosSurTexteCodeOuNumTax($identifiant_espece) { |
| preg_match('/BDNFFnn(\d+)/',$identifiant_espece, $elements); |
| // Numero nomenclatural |
| if (isset($elements[1])) |
| return $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($elements[1]); |
| preg_match('/(' . implode('|', Cel::$referentiels_valides) .'):(nn|nt):(\d+)/i', $identifiant_espece, $elements); |
| if($elements) { |
| $this->is_notation_spe = TRUE; |
| list(, $ref, $type, $num) = $elements; |
| // Numero nomenclatural |
| if ($type == 'nn') { |
| $obj = $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumNom($num); |
| } |
| // Numero taxonomique |
| else { |
| //TODO: retourner moins de champs grâce au paramètre retour.champs |
| $obj = @json_decode(file_get_contents($this->url_service_taxon."/nt:".$num)); |
| } |
| $obj->ref = $ref; |
| return $obj; |
| } |
| // Numero taxonomique ou nom scientifique |
| preg_match('/BDNFFnt(\d+)/', $identifiant_espece, $elements); |
| // Numero taxonomique |
| if (isset($elements[1])) |
| return $this->effectuerRequeteInfosComplementairesSurNumTax($elements[1]); |
| // Nom scientifique |
| return $this->rechercherInformationsComplementairesSurNom($identifiant_espece); |
| } |