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New file
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<?php
 
/**
* Exemple lancement:
* /opt/lampp/bin/php -d memory_limit=3500M cli.php desontologisation -a unitebase
*/
 
class Desontologisation extends Script {
 
private $bdd = null;
private $structures = array();
private $communes = array();
private $nonTrouvees = array();
 
public function __construct($script_nom, $parametres) {
parent::__construct($script_nom, $parametres);
$this->bdd = new Bdd();
}
 
public function executer() {
try {
$cmd = $this->getParametre('a');
switch ($cmd) {
case "sauvegarder" :
$this->sauvegarder(); break;
case "unitebase" :
$this->desontologiserUniteBase(); break;
case "uniterangement" :
$this->desontologiserUniteRangement(); break;
case "inventaire" :
$this->desontologiserInventaire(); break;
case "etat" :
$this->desontologiserEtat(); break;
case "periode" :
$this->desontologiserPeriode(); break;
default :
$this->traiterErreur('Erreur : la commande "%s" n\'existe pas!', array($cmd));
}
} catch (Exception $erreur) {
$this->traiterErreur($erreur->getMessage());
}
}
private function sauvegarder() {
$requete = "CREATE TABLE coel_collection_sauv SELECT * FROM coel_collection; CREATE TABLE coel_collection_botanique_sauv SELECT * FROM coel_collection_botanique;";
$infos_truk = $this->bdd->requeter($requete);
}
private function desontologiserInventaire() {
$requete_table = "ALTER TABLE coel_collection_botanique ".
"CHANGE `ccb_ce_inventaire` `ccb_ce_inventaire` VARCHAR(20) NULL DEFAULT NULL COMMENT 'Existe-t-il un inventaire de cette collection?', ".
"CHANGE `ccb_ce_inventaire_auteur` `ccb_ce_inventaire_auteur` VARCHAR(20) NULL DEFAULT NULL COMMENT 'L''auteur de la collection a-t-il participé à cet inventaire?', ".
"CHANGE `ccb_ce_traitement` `ccb_ce_traitement` VARCHAR(20) NULL DEFAULT NULL COMMENT 'L''auteur de la collection a-t-il participé à cet inventaire?';";
$infos_truk = $this->bdd->requeter($requete_table);
$requete = "SELECT ccb_id_collection, ccb_ce_inventaire, ccb_ce_inventaire_auteur, ccb_ce_traitement ".
"FROM coel_collection_botanique ".
"WHERE (ccb_ce_inventaire IS NOT NULL AND ccb_ce_inventaire != '') OR (ccb_ce_inventaire_auteur IS NOT NULL AND ccb_ce_inventaire_auteur != '')";
$infos_truk = $this->bdd->recupererTous($requete);
foreach ($infos_truk as $truk) {
$id_collection = $truk['ccb_id_collection'];
$inventaire = $this->transformerouinon($truk["ccb_ce_inventaire"]);
$inventaire_auteur = $this->transformerouinon($truk["ccb_ce_inventaire_auteur"]);
$traitement = $this->transformerouinon($truk["ccb_ce_traitement"]);
$update = 'UPDATE coel_collection_botanique '.
'SET '.
'ccb_ce_inventaire = "'.$inventaire.'", '.
'ccb_ce_inventaire_auteur = "'.$inventaire_auteur.'" '.
'ccb_ce_traitement = "'.$traitement.'" '.
'WHERE ccb_id_collection = "'.$id_collection.'"';
$this->bdd->executer($update);
}
}
private function desontologiserEtat() {
$requete_table = "ALTER TABLE coel_collection_botanique ".
"CHANGE `ccb_ce_unite_rangement_etat` `ccb_ce_unite_rangement_etat` int(1) NULL DEFAULT NULL COMMENT 'liste de 1 à 5 correspondant à une liste déroulante entre très mauvais et très bon', ".
"CHANGE `ccb_ce_etat_general` `ccb_ce_etat_general` int(1) NULL DEFAULT NULL COMMENT 'liste de 1 à 5 correspondant à une liste déroulante entre très mauvais et très bon';";
$infos_truk = $this->bdd->requeter($requete_table);
$requete = "SELECT ccb_id_collection, ccb_ce_unite_rangement_etat, ccb_ce_etat_general ".
"FROM coel_collection_botanique ".
"WHERE (ccb_ce_unite_rangement_etat IS NOT NULL AND ccb_ce_unite_rangement_etat != '') OR (ccb_ce_etat_general IS NOT NULL AND ccb_ce_etat_general != '')";
$infos_truk = $this->bdd->recupererTous($requete);
foreach ($infos_truk as $truk) {
$id_collection = $truk['ccb_id_collection'];
$inventaire = $this->transformerBonMauvaisEtat($truk["ccb_ce_unite_rangement_etat"]);
$inventaire_auteur = $this->transformerBonMauvaisEtat($truk["ccb_ce_etat_general"]);
$update = 'UPDATE coel_collection_botanique '.
'SET '.
'ccb_ce_unite_rangement_etat = "'.$inventaire.'", '.
'ccb_ce_etat_general = "'.$inventaire_auteur.'" '.
'WHERE ccb_id_collection = "'.$id_collection.'"';
$this->bdd->executer($update);
}
}
private function desontologiserPeriode() {
$requete_table = "ALTER TABLE coel_collection ADD ".
" cc_periode_constitution_debut int(4) AFTER cc_truk_periode_constitution, ADD cc_periode_constitution_fin int(4) AFTER cc_periode_constitution_debut;";
$infos_truk = $this->bdd->requeter($requete_table);
$requete = "SELECT cc_id_collection, substr(`ccb_recolte_date_debut`, 1, 4) AS annee_debut, ccb_ce_recolte_date_debut_type as type_debut, ".
"substr(`ccb_recolte_date_fin`, 1, 4) AS annee_fin, ccb_ce_recolte_date_fin_type as type_fin,".
" cc_truk_periode_constitution AS siecle FROM `coel_collection_botanique`, `coel_collection`
WHERE `ccb_id_collection`=`cc_id_collection` ";
$infos_truk = $this->bdd->recupererTous($requete);
foreach ($infos_truk as $truk) {
$id_collection = $truk['ccb_id_collection'];
$periode = $this->transformerPeriode($truk);
$update = 'UPDATE coel_collection '.
'SET '.
'cc_periode_constitution_debut = "'.$periode[0].'", '.
'cc_periode_constitution_fin = "'.$periode[1].'" '.
'WHERE cc_id_collection = "'.$id_collection.'"';
$this->bdd->executer($update);
}
$requete = "SELECT cc_id_collection, '0000' AS annee_debut, '' as type_debut, ".
"'0000' AS annee_fin, '' as type_fin,".
" cc_truk_periode_constitution AS siecle FROM `coel_collection`
WHERE `cc_periode_constitution_debut` is null and `cc_truk_periode_constitution` != ''";
$infos_truk = $this->bdd->recupererTous($requete);
foreach ($infos_truk as $truk) {
$id_collection = $truk['cc_id_collection'];
$periode = $this->transformerPeriode($truk);
$update = 'UPDATE coel_collection '.
'SET '.
'cc_periode_constitution_debut = "'.$periode[0].'", '.
'cc_periode_constitution_fin = "'.$periode[1].'" '.
'WHERE cc_id_collection = "'.$id_collection.'"';
$this->bdd->executer($update);
}
/*supprimer ccb_recolte_date_debut, ccb_ce_recolte_date_debut_type, ccb_recolte_date_fin, ccb_ce_recolte_date_fin_type, cc_truk_periode_constitution
*
* $requete_table = "ALTER TABLE coel_collection_botanique ".
"CHANGE `ccb_ce_unite_rangement_etat` `ccb_ce_unite_rangement_etat` int(1) NULL DEFAULT NULL COMMENT 'liste de 1 à 5 correspondant à une liste déroulante entre très mauvais et très bon', ".
"CHANGE `ccb_ce_etat_general` `ccb_ce_etat_general` int(1) NULL DEFAULT NULL COMMENT 'liste de 1 à 5 correspondant à une liste déroulante entre très mauvais et très bon';";
$infos_truk = $this->bdd->requeter($requete_table);
*/
}
private function desontologiserUniteBase() {
$requete_table = "ALTER TABLE coel_collection_botanique ADD ".
" ccb_nb_planches_herbiers int(20) AFTER `ccb_truk_unite_base`, ADD ccb_nb_especes int(20) AFTER ccb_nb_planches_herbiers;";
$infos_truk = $this->bdd->requeter($requete_table);
$requete = "SELECT ccb_id_collection, ccb_truk_unite_base ".
"FROM coel_collection_botanique ".
"WHERE ccb_truk_unite_base IS NOT NULL AND ccb_truk_unite_base != ''";
 
$infos_truk = $this->bdd->recupererTous($requete);
foreach($infos_truk as $truk) {
$id_collection = $truk['ccb_id_collection'];
// Séparation de chaque catégorie d'unite de truk
$categories_truk = explode(';;', $truk['ccb_truk_unite_base']);
// Iteration sur toutes les catégories de truk trouvées
foreach($categories_truk as $categorie_truk) {
// extraction du numéro d'ontologie de la liste concernée
$categorie_truk_unite_infos = explode('##', $categorie_truk);
// Seules les infos de planche d'herbier nous interessent (donc numéro d'ontologie 2270)
if($categorie_truk_unite_infos[0] == '2270') {
$truk_unite_infos = $categorie_truk_unite_infos[1];
$truk_unite_infos = explode('||', $truk_unite_infos);
$nb_planches_herbiers = $truk_unite_infos[0];
$nb_especes = $truk_unite_infos[5];
$update = 'UPDATE coel_collection_botanique '.
'SET '.
'ccb_nb_planches_herbiers = "'.$nb_planches_herbiers.'", '.
'ccb_nb_especes = "'.$nb_especes.'" '.
'WHERE ccb_id_collection = "'.$id_collection.'"';
$this->bdd->executer($update);
}
}
}
}
private function desontologiserUniteRangement() {
$requete_table = "ALTER TABLE coel_collection_botanique ADD ".
" ccb_nb_liasses int(20) AFTER `ccb_truk_unite_rangement`, ADD ccb_format_liasses varchar(50) AFTER ccb_nb_liasses ,".
" ADD ccb_nb_cartons_herbier int(20) AFTER `ccb_format_liasses`, ADD ccb_format_cartons_herbier varchar(50) AFTER ccb_nb_cartons_herbier , ".
"ADD ccb_autres_unites_rangement text AFTER ccb_format_cartons_herbier;";
//print_r($requete_table);
$infos_truk = $this->bdd->requeter($requete_table);
$requete = "SELECT ccb_id_collection, ccb_truk_unite_rangement ".
"FROM coel_collection_botanique ".
"WHERE ccb_truk_unite_rangement IS NOT NULL AND ccb_truk_unite_rangement != '' ";
 
$infos_truk = $this->bdd->recupererTous($requete);
// Récupération de la liste des termes d'ontologies pour les types de rangement
$requete_onto = "SELECT * FROM coel_meta_liste_valeur ".
"WHERE cmlv_ce_parent = 1044";
$infos_onto = $this->bdd->recupererTous($requete_onto);
// Pour associer facilement chaque id d'ontologie à sa signification
$ontologie_rangement = array();
foreach($infos_onto as $onto) {
$ontologie_rangement[$onto['cmlv_id_valeur']] = $onto;
}
foreach($infos_truk as $truk) {
 
$id_collection = $truk['ccb_id_collection'];
$unite_rangement_des = array('cartons' => array(), 'liasses' => array(), 'autres' => array());
// Séparation de chaque catégorie d'unite de truk
$categories_unite_rangement = explode(';;', $truk['ccb_truk_unite_rangement']);
// Pour éviter de modifier une collection où seul un "squelette" de truk serait présent
$collection_a_modifier = false;
// Iteration sur toutes les catégories de rangement trouvées
foreach($categories_unite_rangement as $unite_rangement) {
// extraction du numéro d'ontologie de la liste concernée
list($id_ontologie_rangement, $infos_unite_rangement) = explode('##', $unite_rangement);
$tableau_unite_rangement = $this->parserUniteRangement($infos_unite_rangement);
if($tableau_unite_rangement['nombre'] > 0) {
$collection_a_modifier = true;
switch($id_ontologie_rangement) {
// Liasses : 2256
case "2256":
$unite_rangement_des['liasses'] = $tableau_unite_rangement;
break;
// Cartons d'herbier : 2255
case "2255":
$unite_rangement_des['cartons'] = $tableau_unite_rangement;
break;
// Autres
default:
$unite_rangement_des['autres'][] = $this->formaterLigneAutreUniteRangement($id_ontologie_rangement, $ontologie_rangement, $tableau_unite_rangement);
}
}
}
// Pas la peine de modifier une collection qui ne content ni liasse, ni carton d'herbier, ni autre
// (on ne le sait qu'à ce moment là après analyse par le script car la colonne ccb_truk_unite_rangement
// est tout de même quelquefois remplie par une syntaxe d'ontologie vide quand il n'y a rien)
if($collection_a_modifier) {
$update = "UPDATE coel_collection_botanique ".
"SET ";
$champs = array();
if(!empty($unite_rangement_des['liasses'])) {
$champs[] = "ccb_nb_liasses = ".$this->bdd->proteger($unite_rangement_des['liasses']['nombre']).", ".
"ccb_format_liasses = ".$this->bdd->proteger($unite_rangement_des['liasses']['format'])." ";
}
if(!empty($unite_rangement_des['cartons'])) {
$champs[] = "ccb_nb_cartons_herbier = ".$this->bdd->proteger($unite_rangement_des['cartons']['nombre']).", ".
"ccb_format_cartons_herbier = ".$this->bdd->proteger($unite_rangement_des['cartons']['format'])." ";
}
if(!empty($unite_rangement_des['autres'])) {
// Pour éviter de casser les sauts de lignes il faut les remplacer après avoir protégé la valeur
$champs[] = "ccb_autres_unites_rangement = ".str_replace('NEWLINE', "\r\n", $this->bdd->proteger(implode('NEWLINE', $unite_rangement_des['autres'])));
}
$update .= implode(', ', $champs)." ".
"WHERE ccb_id_collection = '".$id_collection."'";
 
$this->bdd->executer($update);
}
}
}
private function parserUniteRangement($unite_rangement) {
$tableau_unite_rangement = explode('||', $unite_rangement);
return array(
'nombre' => $tableau_unite_rangement[0],
'precision' => $tableau_unite_rangement[1],
'format' => $tableau_unite_rangement[2]
);
}
private function formaterLigneAutreUniteRangement($id_ontologie, $ontologie_rangement, $tableau_unite_rangement) {
$nom_rangement = $id_ontologie;
// Des fois on a un numéro d'ontologie des fois un nom de type de rangement
if(!is_numeric($id_ontologie)) {
$nom_rangement = $id_ontologie;
} else if(!empty($ontologie_rangement[$id_ontologie])) {
$nom_rangement = $ontologie_rangement[$id_ontologie]['cmlv_nom'];
} else {
$nom_rangement = 'Type de rangement inconnu';
}
// Le nombre d'unités est directement accolé au type
$tab_autre_ligne_rangement = array($nom_rangement);
if(!empty($tableau_unite_rangement['nombre'])) {
$tab_autre_ligne_rangement[0] .= ' : '.$tableau_unite_rangement['nombre'];
}
// La précision est soit exacte soit approximative
if(!empty($tableau_unite_rangement['precision'])) {
$precision = $tableau_unite_rangement['precision'] == 'E' ? 'exacte' : 'appromixative';
$tab_autre_ligne_rangement[] = 'Précision '.$precision;
}
// Le format est une suite de de type YxZ ou Y et Z sont des longueurs et largeurs
// eventuellement séparés par des virgules s'il y a différents formats
if(!empty($tableau_unite_rangement['format'])) {
$tab_autre_ligne_rangement[] = 'Format '.$tableau_unite_rangement['format'];
}
// On retourne une ligne de la forme "type de rangement : nombre - Précision précision - Format format"
return implode(' - ', $tab_autre_ligne_rangement);
}
private function transformerPeriode($donnees) {
// initialisation
$siecle = array("2233"=>"15",
"2234"=>"16",
"2235"=>"17",
"2236"=>"18",
"2237"=>"19",
"2238"=>"20");
$type = array("2316"=>"Date inconnue",
"2317"=>"Date exacte",
"2318"=>"Antérieure à",
"2319"=>"Postérieure à",
"2320"=>"Date estimée",
"2321"=>"Date inconnue",
"2322"=>"Date exacte",
"2323"=>"Antérieure à",
"2324"=>"Postérieure à",
"2325"=>"Date estimée",
"2326"=>"Encore en activité");
$periode_debut = ""; $periode_fin = "";
if ($donnees["annee_debut"] == "") $donnees["annee_debut"] = "0000";
if($donnees["annee_fin"] == "") $donnees["annee_fin"] = "0000";
// si une date de début ET une date de fin sont indiquées
if ($donnees["annee_debut"] !== "0000" && $donnees["annee_fin"] !== "0000") {
$periode_debut = $donnees["annee_debut"];
$periode_fin = $donnees["annee_fin"];
// si un (ou plusieurs) siècles sont indiqué(s)
} else if($donnees["siecle"] != "") {
// initialisation années début et fin de siècle
$siecles = explode(";;", $donnees["siecle"]);
$siecle_debut = $siecle[$siecles[0]]."01";
$siecle_fin = $siecle[array_pop($siecles)]."99";
// si les centaines de l'année de début et du siècle sont égales
if (substr($donnees["annee_debut"],0,2) == substr($siecle_debut,0,2)) {
$periode_debut = $donnees["annee_debut"];
} else if ($donnees["annee_debut"] != "0000" && $donnees["annee_debut"] < $siecle_debut) {
$periode_debut = $donnees["annee_debut"];
} else {
$periode_debut = $siecle_debut;
}
if (substr($donnees["annee_fin"],0,2) == substr($siecle_fin,0,2)) {
$periode_fin = $donnees["annee_fin"];
} else if ($donnees["annee_fin"] != "0000" && $donnees["annee_fin"] > $siecle_fin) {
$periode_fin = $donnees["annee_fin"];
} else {
$periode_fin = $siecle_fin;
}
} else {
if ($donnees["annee_debut"] !== "0000") $periode_debut = $donnees["annee_debut"];
if($donnees["annee_fin"] !== "0000") $periode_fin = $donnees["annee_fin"];
}
//print_r($donnees); echo $periode_debut." - ".$periode_fin;
return array($periode_debut,$periode_fin);
}
private function transformerBonMauvaisEtat($cle) {
if ($cle==0) $cle="NULL";
$valeur = $cle;
$ontologies = array("2265" => "1",
"2266" => "2",
"2267" => "3",
"2268" => "4",
"2269" => "5",
);
if (isset($ontologies[$cle])) $valeur = $ontologies[$cle];
return $valeur;
}
private function transformerouinon($cle) {
$valeur = $cle;
$ontologies = array("2092" => "non",
"2093" => "oui",
"2094" => "enPartie",
"2239" => "neSaitPas",
"2240" => "peutEtre",
"2241" => "oui",
"2242" => "non",
"2339" => "oui",
"2340" => "non",
"2341" => "enGrandePartie",
"2342" => "neSaitPas)",
"2343" => "parfois",
"2344" => "oui",
"2345" => "non",
"30744" => "indetermine",
"30745" => "oui",
"30746" => "non");
if (isset($ontologies[$cle])) $valeur = $ontologies[$cle];
return $valeur;
}
}
?>
/tags/v1.11-okuzgozu/scripts/modules/communes/communes.ini
New file
0,0 → 1,5
[tables]
bdd_nom_coel = "tb_coel"
table_structures_coel = "coel_structure"
bdd_nom_floradata = "tb_cel"
table_communes = "cel_zones_geo"
Property changes:
Added: svn:mime-type
+text/plain
\ No newline at end of property
/tags/v1.11-okuzgozu/scripts/modules/communes/Communes.php
New file
0,0 → 1,258
<?php
 
/**
* Exemple lancement:
* /opt/lampp/bin/php -d memory_limit=3500M cli.php communes -a majCoordonnees
*/
 
class Communes extends Script {
private $bdd = null;
private $structures = array();
private $communes = array();
private $nonTrouvees = array();
public function __construct($script_nom, $parametres) {
parent::__construct($script_nom, $parametres);
$this->bdd = new Bdd();
}
public function executer() {
try {
$this->initialiserScript();
$cmd = $this->getParametre('a');
switch ($cmd) {
case "majCoordonnees" :
$this->mettreAJourCoordonneesCommunes(); break;
default :
$this->traiterErreur('Erreur : la commande "%s" n\'existe pas!', array($cmd));
}
} catch (Exception $erreur) {
$this->traiterErreur($erreur->getMessage());
}
}
private function initialiserScript() {
$fichierIni = $this->getScriptChemin().'communes.ini';
if (file_exists($fichierIni)) {
Config::charger($fichierIni);
} else {
$erreur = "Veuillez configurer le projet en créant le fichier 'communes.ini' ".
"dans le dossier du module de script du projet à partir du fichier 'config.defaut.ini'.";
throw new Exception($erreur);
}
}
private function mettreAJourCoordonneesCommunes() {
$this->recupererStructures();
$departements = $this->determinerDepartementsStructures();
$this->recupererCommunes($departements);
$this->chercherCoordonneesVillesStructures();
$this->mettreAJourDonneesStructures();
$this->afficherResultatScript();
}
private function recupererStructures() {
$this->bdd->requeter("USE ".Config::get("tables.bdd_nom_coel"));
$requete = sprintf(
"SELECT cs_id_structure, cs_nom, cs_code_postal, cs_ville FROM %s"
. " JOIN coel_meta_liste_valeur ON cs_ce_truk_pays = cmlv_id_valeur"
. " WHERE cmlv_abreviation IN ('FR', 'RE', 'YT', 'GP', 'MQ', 'GF', 'NC')"
. " AND (cs_latitude IS NULL OR cs_latitude='0' OR Length(Trim(cs_latitude)) = 0)"
. " AND (cs_longitude IS NULL OR cs_longitude='0' OR Length(Trim(cs_longitude)) = 0)"
. " ORDER BY cs_ville",
Config::get("tables.table_structures_coel"));
 
$this->structures = $this->bdd->recupererTous($requete);
}
private function determinerDepartementsStructures() {
$departements = array();
foreach ($this->structures as $index => $structure) {
$codeDepartement = '';
if (strlen($structure['cs_code_postal']) == 5) {
if (substr($structure['cs_code_postal'], 0, 2) > "95") {
$codeDepartement = substr($structure['cs_code_postal'], 0, 3);
} else {
$codeDepartement = substr($structure['cs_code_postal'], 0, 2);
}
}
$this->structures[$index]['departement'] = $codeDepartement;
if (strlen($codeDepartement) > 0 && !in_array($codeDepartement, $departements)) {
$departements[] = $codeDepartement;
}
}
return $departements;
}
private function recupererCommunes($departements) {
foreach ($departements as $index => $codeDepartement) {
$departements[$index] = "'$codeDepartement'";
}
$listeDepartements = implode(',', $departements);
$this->bdd->requeter("USE ".Config::get("tables.bdd_nom_floradata"));
$requete = "SELECT code, nom, wgs84_latitude, wgs84_longitude FROM ".Config::get("tables.table_communes")." ".
"ORDER BY code;";
$communes = $this->bdd->recupererTous($requete);
// reorganiser le tableau en series des tableaux contenant les communes par departement
$communes[0]['recherche'] = self::transformerChainePourRecherche($communes[0]['nom']);
$communesDepartement = array($communes[0]);
$numeroDepartement = substr($communes[0]['code'], 0, 2) > '95' ? substr($communes[0]['code'], 0, 3)
: substr($communes[0]['code'], 0, 2);
for ($index = 1; $index < count($communes); $index ++) {
$numeroDept = substr($communes[$index]['code'],0,2) > '95' ? substr($communes[$index]['code'],0,3)
: substr($communes[$index]['code'],0,2);
if ($numeroDept != $numeroDepartement) {
$this->communes[$numeroDepartement] = $communesDepartement;
$communesDepartement = array();
$numeroDepartement = $numeroDept;
}
$communes[$index]['recherche'] = self::transformerChainePourRecherche($communes[$index]['nom']);
$communesDepartement[] = $communes[$index];
}
$this->communes[$numeroDepartement] = $communesDepartement;
}
private static function transformerChainePourRecherche($chaine, $charset='utf-8') {
$str = htmlentities($chaine, ENT_NOQUOTES, $charset);
$str = preg_replace('#&([A-za-z])(?:acute|cedil|circ|grave|orn|ring|slash|th|tilde|uml);#', '\1', $str);
$str = preg_replace('#&([A-za-z]{2})(?:lig);#', '\1', $str);
$str = preg_replace('#&[^;]+;#', '', $str);
for ($position = 0; $position < strlen($str); $position ++) {
if ($str[$position] == "," || $str[$position] == "-" || $str[$position] == "'") {
$str[$position] = " ";
}
}
return strtolower($str);
}
private function chercherCoordonneesVillesStructures() {
foreach ($this->structures as $index => $structure) {
if (strlen(trim($structure['cs_ville'])) > 0) {
if (strlen(trim($structure['departement'])) > 0) {
$this->structures[$index] = $this->retrouverCoordonneesDansDepartement($structure);
} else {
$this->structures[$index] = $this->retrouverCoordonneesDansListeCommunes($structure);
}
} else {
$this->nonTrouvees[] = $structure;
}
}
}
private function retrouverCoordonneesDansDepartement($structure) {
$villeRecherche = self::transformerChainePourRecherche(($structure['cs_ville']));
$communeTrouvee = null;
// comparaison dans un premier temps si les deux chaines de caracteres sont identiques
// dans un second temps on applique la recherche de sous chaines identiques
foreach ($this->communes[$structure['departement']] as $commune) {
if ($commune['recherche'] == $villeRecherche) {
$communeTrouvee = $commune;
break;
}
}
if (is_null($communeTrouvee)) {
foreach ($this->communes[$structure['departement']] as $commune) {
if (strstr($commune['recherche'], $villeRecherche) !== false) {
$communeTrouvee = $commune;
break;
} else if (strstr($villeRecherche, $commune['recherche']) !== false) {
$communeTrouvee = $commune;
break;
}
}
}
if (!is_null($communeTrouvee)) {
$structure['cs_ville'] = $communeTrouvee['nom'];
$structure['latitude'] = $communeTrouvee['wgs84_latitude'];
$structure['longitude'] = $communeTrouvee['wgs84_longitude'];
} else {
$this->nonTrouvees[] = $structure;
}
return $structure;
}
private function retrouverCoordonneesDansListeCommunes($structure) {
$villeRecherche = self::transformerChainePourRecherche(($structure['cs_ville']));
$communeTrouvee = null;
$codeDepartement = "";
// meme comportement que la methode precedente, mais la recherche est etendue a toutes les communes
// si une commune est trouvee, on lui attribuera le code departement au code postal par defaut
foreach ($this->communes as $departement => $communes) {
foreach ($communes as $commune) {
if ($commune['recherche'] == $villeRecherche) {
$communeTrouvee = $commune;
$codeDepartement = $departement;
break;
}
}
if (is_null($communeTrouvee)) {
foreach ($communes as $commune) {
if (strstr($commune['recherche'], $villeRecherche) !== false) {
$communeTrouvee = $commune;
$codeDepartement = $departement;
break;
} else if (strstr($villeRecherche, $commune['recherche']) !== false) {
$communeTrouvee = $commune;
$codeDepartement = $departement;
break;
}
}
}
}
if (!is_null($communeTrouvee)) {
$structure['cs_ville'] = $communeTrouvee['nom'];
$structure['latitude'] = $communeTrouvee['wgs84_latitude'];
$structure['longitude'] = $communeTrouvee['wgs84_longitude'];
$structure['cs_code_postal'] = $codeDepartement;
} else {
$this->nonTrouvees[] = $structure;
}
return $structure;
}
private function mettreAJourDonneesStructures() {
$this->bdd->requeter("USE ".Config::get("tables.bdd_nom_coel"));
$updates = array();
// pour faire une seule requete de mise a jour, on va pas utiliser l'ordre UPDATE qui n'accepte
// qu'une seule condition, mais l'ordre INSERT en rajoutant a la fin ON DUPLICATE KEY UPDATE
// avec les correspondances au niveau des codes postaux et villes
foreach ($this->structures as $structure) {
if (isset($structure['latitude']) && isset($structure['longitude'])) {
$updates[] = "({$structure['cs_id_structure']},'{$structure['cs_code_postal']}',".
$this->bdd->proteger($structure['cs_ville']).",'{$structure['latitude']}',".
"'{$structure['longitude']}')";
}
}
 
if(!$updates) return;
 
$sql = "INSERT INTO ".Config::get("tables.table_structures_coel")." (cs_id_structure, cs_code_postal, ".
"cs_ville, cs_latitude, cs_longitude) VALUES ".implode(",", $updates)." ".
"ON DUPLICATE KEY UPDATE cs_code_postal=VALUES(cs_code_postal), cs_ville=VALUES(cs_ville), ".
"cs_latitude=VALUES(cs_latitude), cs_longitude=VALUES(cs_longitude);";
$this->bdd->requeter($sql);
}
private function afficherResultatScript() {
$nombreUpdates = count($this->structures) - count($this->nonTrouvees);
$message = "Mise à jour des coordonnées des communes terminée. Les structures qui n'avaient pas de ".
"coordonnées se sont vues attribuer les coordonnées de la commune dans laquelle elles sont situées.\n\n".
"Mises à jour effectuées pour $nombreUpdates structures.\n";
if (count($this->nonTrouvees) > 0) {
$message .= "Des problèmes ont été rencontrées pour les structures suivantes : \n";
foreach ($this->nonTrouvees as $structure) {
$message .= " - {$structure['cs_nom']} ({$structure['cs_ville']}, {$structure['cs_code_postal']})\n";
}
$message .= "Veuillez vérifier le nom de la commune saisi ou aller dans la fiche structure ".
"pour y rajouter les coordonnées longitude/latitude\n";
} else {
$message .= "Vous pourrez toujours par la suite aller dans la fiche structure ".
"pour affiner la précision les coordonnées longitude/latitude au niveau des locaux.\n";
}
print($message);
}
}
 
?>
/tags/v1.11-okuzgozu/scripts/modules/import/Import.php
New file
0,0 → 1,656
<?php
/**
* Exemple lancement:
* /opt/lampp/bin/php -d memory_limit=3500M cli.php import -n
*/
class Import extends Script {
private $bdd = null;
private $auteurs = array();
protected $parametres_autorises = array(
'-n' => array(true, false, 'Nom du fichier à importer.'),
'-u' => array(false, false, 'Infos utilisateur sous forme de JSON contenant : id, session et ip'));
protected $table_publication = null;
protected $table_auteur = null;
protected $table_publication_a_auteur = null;
protected $table_meta = null;
protected $table_structure = 'coel_structure'; // @TODO configurer
protected $table_collection = 'coel_collection'; // @TODO configurer
protected $table_collection_bota = 'coel_collection_botanique'; // @TODO configurer
protected $id_table_publication = null;
protected $id_table_publication_personne = null;
protected $id_role_auteur = null;
protected $colonnes_obligatoires = array();
protected $colonnes_acceptees = array();
protected $cache_auteur = array();
protected $auteurs_a_publis = array();
protected $publis_a_auteurs = array();
protected $id_utilisateur = 0;
protected $id_session = 0;
protected $ip_utilisateur = "127.0.01";
const ETAT_AJOUTER = 1;
public function __construct($script_nom, $parametres) {
parent::__construct($script_nom, $parametres);
$this->bdd = new Bdd();
}
public function executer() {
try {
$this->initialiserScript();
$cmd = $this->getParametre('a');
$fichier = $this->getParametre('n');
$utilisateur = $this->getParametre('u');
$this->traiterInfosUtilisateur($utilisateur);
switch ($cmd) {
case "collections" :
$resultat = $this->chargerCollections($fichier); break;
case "publi" :
$resultat = $this->chargerPubli($fichier); break;
default :
$this->traiterErreur('Erreur : la commande "%s" n\'existe pas!', array($cmd));
}
} catch (Exception $erreur) {
$this->traiterErreur($erreur->getMessage());
}
// renvoi du résultat vers la sortie php
// car le script est surtout destiné à être appelé par un web service
echo $resultat;
exit;
}
private function traiterInfosUtilisateur($utilisateur) {
$utilisateur_infos = json_decode($utilisateur, true);
if(!empty($utilisateur_infos)) {
$this->id_utilisateur = !empty($utilisateur_infos['id']) ? $utilisateur_infos['id'] : $this->id_utilisateur;
$this->id_session = !empty($utilisateur_infos['session']) ? $utilisateur_infos['session'] : $this->id_session;
$this->ip_utilisateur = !empty($utilisateur_infos['ip']) ? $utilisateur_infos['ip'] : $this->ip_utilisateur;
}
}
private function initialiserScript() {
$fichierIni = $this->getScriptChemin().'import.ini';
if (file_exists($fichierIni)) {
Config::charger($fichierIni);
} else {
$erreur = "Veuillez configurer le projet en créant le fichier 'import.ini' ".
"dans le dossier du module de script du projet à partir du fichier 'import.defaut.ini'.";
throw new Exception($erreur);
}
$this->colonnes_obligatoires= Config::get('champs_obligatoires');
$this->colonnes_acceptees = Config::get('champs');
$tables = Config::get('tables');
$this->table_publication = $tables['publication'];
$this->table_auteur = $tables['auteur'];
$this->table_publication_a_auteur = $tables['publication_a_auteur'];
$this->table_meta = $tables['meta'];
$this->id_table_publication = $tables['id_table_publication'];
$this->id_table_publication_personne = $tables['id_table_publication_personne'];
$this->id_role_auteur = $tables['id_role_auteur'];
}
 
/**
* Importe des collections botaniques à partir de deux fichiers : $fichier-collections.csv et
* $fichier-collections-bota.csv
* Il faut donc fournir en paramètre seulement le début du nom de fichier. Ex :
* fichiers:
* - rhone-alpes-collections.csv
* - rhone-alpes-collections-bota.csv
* commande :
* - php cli.php import -a collections -n rhone-alpes
*/
private function chargerCollections($fichier) {
 
$separateur = "\t"; // @TODO configurer
$fichierCollections = Config::get('dossiertmp').$fichier . '-collections.csv';
$fichierCollectionsBota = Config::get('dossiertmp').$fichier . '-collections-bota.csv';
 
// vérification existence fichiers
if(!file_exists($fichierCollections)) {
throw new Exception("Le fichier ".Config::get('dossiertmp').$fichierCollections." n'existe pas.");
}
if(!file_exists($fichierCollectionsBota)) {
throw new Exception("Le fichier ".Config::get('dossiertmp').$fichierCollectionsBota." n'existe pas.");
}
 
//ouvrir le fichier - collection
$pointeurCollections = fopen($fichierCollections, "r");
// Chargement de la première colonne (qui contient les noms de colonnes à importer)
$colonnes = fgetcsv($pointeurCollections, 0, $separateur);
$colonnesParNom = array_flip($colonnes);
//var_dump($colonnes);
//var_dump($colonnesParNom);
 
// vérifier le nom des colonnes
// @TODO on verra plus tard
/*if(count($colonnes) < 2 || !array_intersect(array_keys($this->colonnes_obligatoires), $colonnes)) {
// Vérification des colonnes obligatoires et en même temps du séparateur
$erreur = "Le fichier ne contient pas les colonnes obligatoires : ".implode(',', array_keys($this->colonnes_obligatoires))."\n";
$erreur .= "ou bien n'est pas séparé par le caractère ';' ";
throw new Exception($erreur);
}*/
 
$idCollectionsParIdTemp = array();
// parcours du fichier "-collections.csv"
while($ligne = fgetcsv($pointeurCollections, 0, $separateur)) {
//var_dump($ligne);
$nomStructure = $ligne[$colonnesParNom['cc_ce_structure']];
if (empty($nomStructure) || is_numeric($nomStructure)) {
echo "- omission de la structure pour cause de nom chelou [$nomStructure]\n";
continue;
}
// tester l'existence de la structure
$idStructure = $this->verifierExistenceStructureParNom($nomStructure);
// si oui récupérer l'id
//sinon créer la structure et récupérer son id
if ($idStructure === false) {
$idStructure = $this->creerStructure($nomStructure);
}
// remplacer le nom de la structure par son id
// créer les collections et récupérer leur id
// @TODO vérifier qu'elles existent pour ne pas insérer de doublons en relançant le script !!
$idCollection = $this->creerCollection($idStructure, $ligne, $colonnesParNom);
$idCollectionsParIdTemp[$ligne[$colonnesParNom['id']]] = $idCollection;
}
 
// mettre à jour le GUID des collections et des structures
$this->mettreAJourGUIDCollections();
$this->mettreAJourGUIDStructures();
 
//ouvrir le fichier collection botanique
$pointeurCollectionsBota = fopen($fichierCollectionsBota, "r");
// Chargement de la première colonne (qui contient les noms de colonnes à importer)
$colonnesBota = fgetcsv($pointeurCollectionsBota, 0, $separateur);
$colonnesBotaParNom = array_flip($colonnesBota);
//var_dump($colonnesBota);
//var_dump($colonnesBotaParNom);
 
// vérifier les colonnes
// @TODO on verra plus tard
 
// parcours du fichier "-collections-bota.csv"
while($ligne = fgetcsv($pointeurCollectionsBota, 0, $separateur)) {
// remplacer les noms des collections par leur id (créé précédemment)
$ligne[$colonnesBotaParNom['ccb_id_collection']] = $idCollectionsParIdTemp[$ligne[$colonnesBotaParNom['ccb_id_collection']]];
// créer/importer
// @TODO vérifier qu'elles existent pour ne pas insérer de doublons en relançant le script !!
$this->creerCollectionBota($ligne, $colonnesBotaParNom);
}
}
 
/**
* Si une structure ayant pour nom $nomStructure existe, retourne son
* identifiant numérique, sinon retourne false
*/
protected function verifierExistenceStructureParNom($nomStructure) {
$idStructure = false;
$nsp = $this->bdd->proteger($nomStructure);
$requete = "SELECT cs_id_structure FROM " . $this->table_structure
. " WHERE cs_nom = $nsp";
 
$resultat = $this->bdd->recupererTous($requete);
// var_dump($resultat);
if (count($resultat) > 0) {
$idStructure = $resultat[0]['cs_id_structure'];
}
return $idStructure;
}
 
/**
* Crée une structure portant le nom $nomStructure, sans rien fournir d'autre, et
* retourne l'identifiant numérique du novueau tuple
*/
protected function creerStructure($nomStructure) {
$nsp = $this->bdd->proteger($nomStructure);
$requete = "INSERT INTO " . $this->table_structure . " (cs_nom)"
. " VALUES ($nsp)";
//echo "REQ INS: $requete\n";
$this->bdd->executer($requete);
$idStructure = $this->bdd->recupererIdDernierAjout();
 
return $idStructure;
}
 
/**
* Crée une collection en la rattachant à la structure d'id $idStrucutre; la remplit
* avec les données issues de $ligne en se servant de $colonnesParNom pour accéder
* aux valeurs par clés textuelles; retourne l'identifiant numérique du novueau tuple
*/
protected function creerCollection($idStructure, $ligne, $colonnesParNom) {
//echo "Insertion ! : "; var_dump($ligne); echo "<br/>";
$nom = $this->bdd->proteger($ligne[$colonnesParNom['cc_nom']]);
$desc = $this->bdd->proteger($ligne[$colonnesParNom['cc_description']]);
$type = $this->bdd->proteger($ligne[$colonnesParNom['cc_ce_type']]);
$pcd = $this->bdd->proteger($ligne[$colonnesParNom['cc_periode_constitution_debut']]);
$pcf = $this->bdd->proteger($ligne[$colonnesParNom['cc_periode_constitution_fin']]);
$tcl = $this->bdd->proteger($ligne[$colonnesParNom['cc_truk_couverture_lieu']]);
$cst = $this->bdd->proteger($ligne[$colonnesParNom['cc_ce_specimen_type']]);
 
$requete = "INSERT INTO " . $this->table_collection
. " (cc_ce_structure, cc_nom, cc_description, cc_ce_type, cc_periode_constitution_debut, cc_periode_constitution_fin, cc_truk_couverture_lieu, cc_ce_specimen_type)"
. " VALUES ($idStructure, $nom, $desc, $type, $pcd, $pcf, $tcl, $cst)";
//echo "REQ INS: $requete\n";
$this->bdd->executer($requete);
$idCollection = $this->bdd->recupererIdDernierAjout();
return $idCollection;
}
 
/**
* Reconstruit les GUID des structures à partir de leurs ID
*/
protected function mettreAJourGUIDStructures() {
$requete = "UPDATE coel_structure SET cs_guid = CONCAT('urn:lsid:tela-botanica.org:str', cs_id_structure)";
$this->bdd->executer($requete);
}
 
/**
* Reconstruit les GUID des collections à partir de leurs ID
*/
protected function mettreAJourGUIDCollections() {
$requete = "UPDATE coel_collection SET cc_guid = CONCAT('urn:lsid:tela-botanica.org:coll', cc_id_collection)";
$this->bdd->executer($requete);
}
 
/**
* Crée une collection botanique; la remplit avec les données issues de $ligne en se
* servant de $colonnesParNom pour accéder aux valeurs par clés textuelles
*/
protected function creerCollectionBota($ligne, $colonnesBotaParNom) {
//echo "Insertion ! : "; var_dump($ligne); echo "<br/>";
$id = $this->bdd->proteger($ligne[$colonnesBotaParNom['ccb_id_collection']]);
$ceg = $this->bdd->proteger($ligne[$colonnesBotaParNom['ccb_ce_etat_general']]);
$ne = $this->bdd->proteger($ligne[$colonnesBotaParNom['ccb_nbre_echantillon']]);
$spec = $this->bdd->proteger($ligne[$colonnesBotaParNom['ccb_specialite']]);
$ac = $this->bdd->proteger($ligne[$colonnesBotaParNom['ccb_annotation_classement']]);
$ct = $this->bdd->proteger($ligne[$colonnesBotaParNom['ccb_ce_traitement']]);
$ci = $this->bdd->proteger($ligne[$colonnesBotaParNom['ccb_ce_inventaire']]);
$ii = $this->bdd->proteger($ligne[$colonnesBotaParNom['ccb_inventaire_info']]);
$aur = $this->bdd->proteger($ligne[$colonnesBotaParNom['ccb_autres_unite_rangement']]);
$nph = $this->bdd->proteger($ligne[$colonnesBotaParNom['ccb_nb_planches_herbiers']]);
$tcpt = $this->bdd->proteger($ligne[$colonnesBotaParNom['ccb_truk_conservation_papier_type']]);
 
// @TODO comment gérer la colonne "Nombre de parts" ? Faut la mettre dans quoi ?
$requete = "INSERT INTO " . $this->table_collection_bota
. " (ccb_id_collection, ccb_ce_etat_general, ccb_nbre_echantillon, ccb_specialite, ccb_annotation_classement, ccb_ce_traitement, ccb_ce_inventaire,"
. " ccb_inventaire_info, ccb_autres_unites_rangement, ccb_nb_planches_herbiers, ccb_truk_conservation_papier_type)"
. " VALUES ($id, $ceg, $ne, $spec, $ac, $ct, $ci, $ii, $aur, $nph, $tcpt)";
//echo "REQ INS: $requete\n";
$this->bdd->executer($requete);
}
 
private function chargerPubli($fichier) {
// vérification existence fichier
if(!file_exists(Config::get('dossiertmp').$fichier)) {
$erreur = "Le fichier ".Config::get('dossiertmp').$fichier." n'existe pas.";
throw new Exception($erreur);
}
$pointeur = fopen(Config::get('dossiertmp').$fichier, "r");
// Chargement de la première colonne (qui contient les noms de colonnes à importer
$colonnes = fgetcsv($pointeur, 0, ";");
 
// Vérification des colonnes obligatoires et en même temps du séparateur
if(count($colonnes) < 2 || !array_intersect(array_keys($this->colonnes_obligatoires), $colonnes)) {
$erreur = "Le fichier ne contient pas les colonnes obligatoires : ".implode(',', array_keys($this->colonnes_obligatoires))."\n";
$erreur .= "ou bien n'est pas séparé par le caractère ';' ";
throw new Exception($erreur);
}
//TODO: vérifier si les deux index ci dessous ne font pas double emploi
// Création d'un index des colonnes qui seront importées dans la fiche en les associant
// au numéro de colonne dans la feuille csv
$index_colonnes_importees = array_intersect(array_keys($this->colonnes_acceptees), $colonnes);
$colonnes_importees = array();
foreach($index_colonnes_importees as $index_colonne_importee) {
$colonnes_importees[] = $this->colonnes_acceptees[$index_colonne_importee];
}
$index_colonnes_refusees = array_keys(array_diff($colonnes, array_keys($this->colonnes_acceptees)));
// Création d'un index associant chaque numéro de colonne importée à son rôle
// pour y apporter des traitement spécifiques
$index_colonnes_importees = $colonnes;
foreach($index_colonnes_refusees as $colonne_refusee) {
unset($index_colonnes_importees[$colonne_refusee]);
}
$roles_a_num_colonnes = array_flip($index_colonnes_importees);
// Ajout de la colonne nom complet aux champs de la requête
$colonnes_importees[] = 'cpu_fmt_nom_complet';
 
$nb_publis_inserees = 0;
$lignes = array();
while($ligne = fgetcsv($pointeur, 0, ";")) {
$ligne_inseree = array();
// Traitement des champs suivant leur role
foreach($ligne as $index => &$valeur) {
if(!in_array($index, $index_colonnes_refusees)) {
$ligne_inseree[] = $this->traiterChamp($valeur, $index_colonnes_importees[$index]);
}
}
// Ajout du nom complet formaté de la publication
$nom_complet = $this->bdd->proteger($this->formaterNomComplet($ligne, $index_colonnes_importees));
$ligne_inseree[] = $nom_complet;
$id_publication = $this->insererPublication($colonnes_importees, $ligne_inseree);
// TODO: quoi faire en cas d'échec pour une publication ?
if(!empty($id_publication)) {
$nb_publis_inserees++;
// Pour aller plus vite on pourrait éventuellement faire une grosse requete d'ajout des publications
// à personne à la fin, mais ça nous priverait de faire une transaction (TODO: faire une transaction)
$nb_auteurs_lies = $this->insererLiensPublicationAuteurs($id_publication, $ligne[$roles_a_num_colonnes['auteur']]);
}
 
}
return $nb_publis_inserees;
}
private function insererPublication(&$colonnes, &$publication) {
$requete = "INSERT INTO ".$this->table_publication." ".
"(".implode(',', $colonnes).") ".
"VALUES (".implode(",", $publication).")";
$insertion = $this->bdd->executer($requete);
$id_publi = $this->bdd->recupererIdDernierAjout();
 
// Historisation de l'ajout
$histo = $this->creerXmlHisto(array_combine($colonnes, $publication));
$id_meta = $this->historiser($this->id_table_publication, $id_publi, $histo);
// Affectation des méta données concernat l'ajout à la publication
$requete_affectation_meta = "UPDATE ".$this->table_publication." ".
"SET cpu_ce_meta = ".$id_meta." ".
"WHERE cpu_id_publication = ".$id_publi;
 
$this->bdd->executer($requete_affectation_meta);
return $id_publi;
}
protected function insererLiensPublicationAuteurs($id_publication, &$auteurs) {
$colonnes = array('cpuap_id_publication', 'cpuap_id_personne', 'cpuap_id_role', 'cpuap_ce_truk_type', 'cpuap_ordre', 'cpuap_ce_meta');
$requete = "INSERT IGNORE INTO ".$this->table_publication_a_auteur." ".
"(".implode(",", $colonnes).") VALUES ";
// L'ordre des auteurs commence à 1
$ordre_auteur = 1;
// Découpage des différents auteurs
$auteurs_tab = explode(',', $auteurs);
$auteurs_tab = array_filter($auteurs_tab);
// Les auteurs sont normalement cités dans l'ordre dans l'import
foreach($auteurs_tab as $auteur) {
// si les infos auteurs sont un tableau dans le cache alors l'id existe bien en base de données
if(is_array($this->cache_auteur[$auteur])) {
$id_auteur = $this->cache_auteur[$auteur]['cp_id_personne'];
$valeurs = array($id_publication, $id_auteur, $this->id_role_auteur, "NULL", $ordre_auteur, "0");
$requete_insertion = $requete." (".implode(',', $valeurs).") ";
$liaison = $this->bdd->executer($requete_insertion);
// Historisation de l'ajout
$histo = $this->creerXmlHisto(array_combine($colonnes, $liaison));
$cle_liaison = $id_publication.'-'.$this->id_role_auteur.'-'.$id_auteur;
$id_meta = $this->historiser($this->id_table_publication_personne, $cle_liaison, $histo);
// Affectation des méta données concernant l'ajout à la publication à auteur
$requete_affectation_meta = "UPDATE ".$this->table_publication_a_auteur." ".
"SET cpuap_ce_meta = ".$id_meta;
$this->bdd->executer($requete_affectation_meta);
}
// L'ordre des auteurs est conservé même pour ceux qui n'existe pas dans la bdd
$ordre_auteur++;
}
}
protected function creerXmlHisto($donnees) {
// Création du xml de l'enregistrement à historiser
$info = null;
$xml_tpl = '<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?>'."\n<resultset>\n<row>\n%s</row>\n</resultset>";
$xml = null;
foreach ($donnees as $cle => $valeur) {
// Pour éviter un éventuel double échappement des valeurs
$valeur = stripslashes($valeur);
$valeur = trim($valeur, "'");
if (!is_null($valeur) && $valeur != '') {
$xml .= "<$cle>$valeur</$cle>\n";
}
}
if ($xml !== null) {
$info = sprintf($xml_tpl, $xml);
$info = $this->bdd->proteger($info);
}
return $info;
}
protected function historiser($table_id, $ligne_cle, $info) {
date_default_timezone_set('Europe/Paris');
// Pré-traitement des variables
$info = (is_null($info)) ? 'NULL' : $info;
// Historisation (Ajout des méta-données)
$requete = 'INSERT INTO coel_meta_historique_ligne '.
' (cmhl_ce_table, cmhl_cle_ligne, cmhl_enregistrement, cmhl_date_modification, cmhl_ce_modifier_par, cmhl_ce_etat, cmhl_ip, cmhl_session_id) '.
'VALUES ('.
" $table_id, ".
' "'.$ligne_cle.'", '.
" $info, ".
' "'.date('Y-m-d H:i:s', time()).'", '.
" $this->id_utilisateur, ".
" ".self::ETAT_AJOUTER.", ".
' "'.$this->ip_utilisateur.'", '.
' "'.$this->id_session.'") ';
$resultat = $this->bdd->executer($requete);
return $this->bdd->recupererIdDernierAjout();
}
protected function formaterNomComplet($ligne, $roles) {
$roles = array_flip($roles);
// Intitulé de la publication complet : fmt_auteur, date_parution(année). titre. Editeur (nom), collection, fascicule, indication_nvt. pages.
// indication_nvt = serie_tome
$champs_nom_complet = array('auteur', 'annee', 'titre', 'editeur', 'intitule_revue', 'fascicule', 'serie_tome', 'pages');
$champs_fmt = array();
$fmt_nom_complet = "";
foreach($champs_nom_complet as $champ) {
$index = $roles[$champ];
if(!isset($ligne[$index])) {
$champs_fmt[$champ] = "";
} else {
$champs_fmt[$champ] = $ligne[$index];
}
}
$indication_nvt_pages = array($champs_fmt['serie_tome'], $champs_fmt['pages']);
$indication_nvt_pages = array_filter($indication_nvt_pages, 'strlen');
$indication_nvt_pages = trim(implode(". ", $indication_nvt_pages));
$indication_nvt_pages .= !empty($indication_nvt_pages) ? "." : "";
$annee_titre_editeur = array($champs_fmt['annee'], $champs_fmt['titre'], $champs_fmt['editeur']);
$annee_titre_editeur = array_filter($annee_titre_editeur, 'strlen');
$annee_titre_editeur = trim(implode(". ", $annee_titre_editeur));
$fmt_nom_complet = array($champs_fmt['auteur'],
$annee_titre_editeur,
$champs_fmt['intitule_revue'],
$champs_fmt['fascicule'],
$indication_nvt_pages);
$fmt_nom_complet = array_filter($fmt_nom_complet, 'strlen');
$fmt_nom_complet = implode(", ", $fmt_nom_complet);
return $fmt_nom_complet;
}
private function traiterChamp($valeur, $role) {
switch($role) {
case 'auteur':
$valeur = $this->traiterChampAuteur($valeur);
break;
case 'editeur':
$valeur = 'AUTRE##'.$valeur;
break;
}
return $this->bdd->proteger($valeur);
}
private function traiterChampAuteur($auteur_intitule) {
$auteurs_fmt = array();
$auteurs_tab = explode(',', $auteur_intitule);
foreach($auteurs_tab as $auteur) {
if(!empty(trim($auteur))) {
$auteurs_fmt[] = $this->obtenirInfosAuteur($auteur);
}
}
return implode(', ', $auteurs_fmt);
}
private function obtenirInfosAuteur($auteur_intitule) {
$retour = $auteur_intitule;
// Si on déjà recherché et trouvé (ou non l'auteur)
if(isset($this->cache_auteur[$auteur_intitule])) {
// On renvoie son nom complet formaté s'il existe en bdd ou sinon
// le nom qui a été donné dans la feuille csv
$retour = !empty($this->cache_auteur[$auteur_intitule]['cp_fmt_nom_complet']) ?
$this->cache_auteur[$auteur_intitule]['cp_fmt_nom_complet'] :
$auteur_intitule;
} else {
// Recherche de l'auteur sur un maximum du combinaisons possible des variations
// de son nom et prénom
$auteur = $this->fabriquerCombinaisonsAuteur($auteur_intitule);
$auteur_req = "(".implode(', ', $auteur).")";
$requete = "SELECT cp_id_personne, cp_fmt_nom_complet FROM ".$this->table_auteur." WHERE cp_fmt_nom_complet IN ".$auteur_req;
$infos_auteur = $this->bdd->recupererTous($requete);
// Stockage en cache de la ligne de bdd si trouvé,
// de la valeur brute sinon
if(!empty($infos_auteur)) {
$retour = $infos_auteur[0]['cp_fmt_nom_complet'];
$this->cache_auteur[$auteur_intitule] = $infos_auteur[0];
// Stocker le nom d'auteur sous les deux formes (fmt nom complet et tel que saisi), facilite la recherche
// plus tard lors de la liaison des publications aux auteurs
$this->cache_auteur[$infos_auteur[0]['cp_fmt_nom_complet']] = $infos_auteur[0];
} else {
$retour = $auteur_intitule;
$this->cache_auteur[$auteur_intitule] = $auteur_intitule;
}
}
return $retour;
}
private function fabriquerCombinaisonsAuteur($auteur) {
$auteur = trim($auteur);
$auteurs_formates = array($this->bdd->proteger($auteur));
// Séparation des élements de l'auteur des espaces pour obtenir
// les noms et prénoms (Ex. "Carl Von Linné" => "Carl", "Von", "Linné")
$auteur_tab = explode(' ', $auteur);
$auteur_tab = array_filter($auteur_tab);
$combinaisons = array();
foreach($auteur_tab as &$element_auteur) {
$combinaisons[] = array(
// élement tel quel (Ex: "Linné")
$element_auteur,
// possibilité de l'initiale seule (Ex: "L")
substr($element_auteur, 0, 1),
// possibilité de l'initiale avec un point du genre (Ex: "L.")
substr($element_auteur, 0, 1)."."
);
}
// Fabrication de toutes les combinaisons possibles des parties de noms ci-dessus
// pour deux et trois élements en faisant plusieurs produits cartésiens
// car le nom peut être combiné différement de celui en base de données
// (Ex. : "Carl Von Linné" VS "C. Von Linné" ou "C. V. Linné" ou encore "Von Linné C." etc...)
// C'est moche et pas très élégant mais bon ça marche dans 90% des cas
// On ne teste pas plus que 3 combinaisons, car ça serait très très couteux
// TODO: faire mieux et factoriser les appels ci dessous
if(count($auteur_tab) > 2) {
// Cas du nom à trois parties (genre "Carl Von Linné")
$possibilites_auteurs = $this->cartesian(array($combinaisons[0], $combinaisons[1], $combinaisons[2]));
$possibilites_auteurs = array_merge($possibilites_auteurs, $this->cartesian(array($combinaisons[0], $combinaisons[2], $combinaisons[1])));
$possibilites_auteurs = array_merge($possibilites_auteurs, $this->cartesian(array($combinaisons[1], $combinaisons[2], $combinaisons[0])));
$possibilites_auteurs = array_merge($possibilites_auteurs, $this->cartesian(array($combinaisons[1], $combinaisons[0], $combinaisons[2])));
$possibilites_auteurs = array_merge($possibilites_auteurs, $this->cartesian(array($combinaisons[2], $combinaisons[1], $combinaisons[0])));
$possibilites_auteurs = array_merge($possibilites_auteurs, $this->cartesian(array($combinaisons[2], $combinaisons[0], $combinaisons[1])));
} else {
// Cas du nom à trois parties (genre "Carl Linné")
$possibilites_auteurs = $this->cartesian(array($combinaisons[0], $combinaisons[1]));
$possibilites_auteurs = array_merge($possibilites_auteurs, $this->cartesian(array($combinaisons[1], $combinaisons[0])));
}
$auteurs_formates = array();
foreach($possibilites_auteurs as &$possibilite) {
$initiales = true;
// Suppression des possibilités ne contenant que des initiales avec ou sans point
foreach($possibilite as &$chars) {
$initiales = $initiales && mb_strlen($chars) <= 2;
}
 
if(!$initiales) {
$auteurs_formates[] = $this->bdd->proteger(implode(" ", $possibilite));
}
}
 
return $auteurs_formates;
}
 
// http://stackoverflow.com/questions/6311779/finding-cartesian-product-with-php-associative-arrays
function cartesian($input) {
// filter out empty values
$input = array_filter($input);
$result = array(array());
foreach ($input as $key => $values) {
$append = array();
foreach($result as $product) {
foreach($values as $item) {
$product[$key] = $item;
$append[] = $product;
}
}
$result = $append;
}
return $result;
}
}
?>
/tags/v1.11-okuzgozu/scripts/modules/import/import.ini
New file
0,0 → 1,26
dossiertmp = "/home/aurelien/web/tmp/coel/"
 
[tables]
bdd_nom_coel = "tb_coel"
publication = "coel_publication"
auteur = "coel_personne"
publication_a_auteur = "coel_publication_a_personne"
meta = "coel_meta"
id_role_auteur = 2360;
id_table_publication = 118
id_table_publication_personne = 119;
 
[champs]
editeur = cpu_ce_truk_editeur
intitule_revue = cpu_collection
serie_tome = cpu_indication_nvt
fascicule = cpu_fascicule
annee = cpu_date_parution
pages = cpu_truk_pages
titre = cpu_titre
auteur = cpu_fmt_auteur
mots_cles = cpu_resume_motcle
 
[champs_obligatoires]
titre = cpu_titre
auteur = cpu_fmt_auteur
/tags/v1.11-okuzgozu/scripts/modules/201310-bulk-coord-update.php
New file
0,0 → 1,101
<?php
/*
cat >> /etc/php.d/php.ini // /etc/php5/cli/conf.d/ZZ-mycustom.ini <<EOF
pdo.dsn.testcoel = "mysql:dbname=tb_coel_test;host=localhost"
mysql.default_user = telabotap
mysql.default_password =
EOF
*/
if(PHP_SAPI !== 'cli') exit(1);
 
define('DOUBLE_CHECK', FALSE);
 
date_default_timezone_set('Europe/Paris');
$DIR = dirname(__FILE__); // XXX: PHP-5.3
define("_GEO_STORE_CACHE", $DIR . "/nominatim-coords.cache.ser");
 
require_once($DIR . '/../../jrest/services/Coel.php');
$db = new PDO('testcoel',
@$argv[1] ? $argv[1] : ini_get('mysql.default_user'),
@$argv[2] ? $argv[2] : ini_get('mysql.default_password'),
array(PDO::MYSQL_ATTR_INIT_COMMAND => "SET NAMES 'UTF8'")) or die('no db');
$cache = @unserialize(file_get_contents(_GEO_STORE_CACHE));
 
if(function_exists('pcntl_signal')) {
// SIGUSR1 handler to save the result during a run
function savecache($signal = FALSE) {
global $cache;
if($cache) {
ksort($cache, SORT_NUMERIC);
file_put_contents(_GEO_STORE_CACHE, serialize($cache));
}
echo "saved " . count($cache) . " results\n";
if($signal == SIGINT) exit;
}
declare(ticks = 1);
pcntl_signal(SIGUSR1, 'savecache');
pcntl_signal(SIGINT, 'savecache');
echo '$ kill -USR1 ' . posix_getpid() . ' # to flush results to disk' . "\n";
}
 
printf("cache already contains %d entries, will start in 4 seconds:\n", count($cache));
sleep(4);
 
// smooth:
$q = "SELECT * FROM coel_structure".
" WHERE cs_latitude IS NULL OR cs_latitude = '' OR cs_longitude IS NULL".
" OR cs_longitude = ''";
foreach($db->query($q)->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC) AS $params) {
$params_override = array('countrycodes' => 'fr,de,ae');
$id = $params['cs_id_structure'];
if(array_key_exists($id, $cache)) {
$db->query(sprintf("UPDATE coel_structure SET cs_latitude = %.9f, cs_longitude = %.9f WHERE cs_id_structure = %d",
$cache[$id]['lat'], $cache[$id]['lon'], $id));
continue;
}
if(array_key_exists($id, @$cache['failed'])) {
if(!DOUBLE_CHECK) continue;
 
// mode texte-libre (plus efficace pour les cas tordus)
$params_override['force-q'] = TRUE;
// cf (très) mauvaise gestion des CP par Nominatim
if($params['cs_ville']) {
unset($params['cs_code_postal']);
}
if($params['cs_adresse_01']) {
$params['cs_adresse_01'] = preg_replace(
'/.*(?:impasse|chemin|route|rue|avenue|boulevard|place|ville)(?:\s(?:du|des|de)\s)?(la\s)?/i',
'',
$params['cs_adresse_01']);
}
}
 
$lonlat = array();
if(Coel::coordGuess(Coel::addrReStruct($params), $lonlat, $params_override)) {
unset($cache['failed'][$id]);
$lat = $lonlat['lat'];
$lon = $lonlat['lon'];
$cache[$id] = $lonlat;
}
else {
$cache['failed'][$id] = FALSE;
}
 
echo "sleep\n";
sleep(1.5);
}
if($cache) {
ksort($cache, SORT_NUMERIC);
file_put_contents(_GEO_STORE_CACHE, serialize($cache));
echo "saved " . count($cache) . " results\n";
}
 
 
 
/* raw:
$q = "SELECT cs_id_structure AS id, cs_adresse_01 AS addr, cs_code_postal AS cp, cs_ville AS city".
" FROM coel_structure".
" WHERE cs_latitude IS NULL OR cs_latitude = '' OR cs_longitude IS NULL OR cs_longitude = ''";
$query = http_build_query(array('q' => implode(',',$q),'accept_language' => 'fr', 'format' => 'json', 'limit' => 1));
var_dump( json_decode(file_get_contents('http://nominatim.openstreetmap.org/search.php?' . $query)) );
*/
/tags/v1.11-okuzgozu/scripts/configurations/config.defaut.ini
New file
0,0 → 1,42
; Encodage : UTF-8
; +------------------------------------------------------------------------------------------------------+
; Info sur l'application
info.nom = Scripts de tests
; Abréviation de l'application
info.abr = SCRIPTS
; Version du Framework nécessaire au fonctionnement de cette application
info.framework.version = 0.3
; Encodage de l'application
encodage_appli = "UTF-8"
; Chemin de l'application (pour l'utiliser dans ce fichier)
chemin_scripts = "php:Framework::getCheminAppli()"
; +------------------------------------------------------------------------------------------------------+
; Débogage
; Indique si oui ou non on veut afficher le débogage.
debogage = true
; Indique si oui ou non on veut lancer le chronométrage
chronometrage = false
 
+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
; Paramètrage de la base de données.
; bdd_abstraction : abstraction de la base de données.
; bdd_protocole : Protocole de la base de données.
; bdd_serveur : Nom du serveur de bases de données.
; bdd_utilisateur : Nom de l'utilisateur de la base de données.
; bdd_mot_de_passe : Mot de passe de l'utilisateur de la base de données.
; bdd_nom : Nom de la base de données principale.
; bdd_encodage : Encodage de la base de données principale. Normalement le même que l'application mais au format base de
; données : voir ici : http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/en/charset-charsets.html
; et là: http://www.postgresql.org/docs/8.1/static/multibyte.html pour les correspondances
bdd_abstraction = pdo
bdd_protocole = mysql
bdd_serveur = localhost
bdd_utilisateur = "root"
bdd_mot_de_passe = ""
bdd_nom = ""
bdd_encodage = "utf8"
 
 
; Dossier de base contenant les données d'eFlore (Fichiers TSV et SQL)
dossierDonneesEflore = "/home/telabotap/www/eflore/donnees/"
Property changes:
Added: svn:mime-type
+text/plain
\ No newline at end of property
/tags/v1.11-okuzgozu/scripts/configurations
New file
Property changes:
Added: svn:ignore
+config.ini
/tags/v1.11-okuzgozu/scripts/framework.defaut.php
New file
0,0 → 1,6
<?php
// Inclusion du Framework
// Renomer ce fichier en "framework.php"
// Indiquer ci-dessous le chemin absolu vers le fichier autoload.inc.php de la bonne version du Framework
require_once '/home/www/commun/framework/0.3/Framework.php';
?>
/tags/v1.11-okuzgozu/scripts/cli.php
New file
0,0 → 1,37
<?php
// Encodage : UTF-8
// +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
/**
* Initialise le chargement et l'exécution des scripts
*
* Lancer ce fichier en ligne de commande avec :
* <code>/opt/lampp/bin/php cli.php mon_script -a test</code>
*
//Auteur original :
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @author Delphine CAUQUIL <delphine@tela-botanica.org>
* @copyright Tela-Botanica 1999-2008
* @licence GPL v3 & CeCILL v2
* @version $Id$
*/
// +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
 
// Le fichier Framework.php du Framework de Tela Botanica doit être appelée avant tout autre chose dans l'application.
// Sinon, rien ne sera chargé.
// Chemin du fichier chargeant le framework requis
$framework = dirname(__FILE__).DIRECTORY_SEPARATOR.'framework.php';
if (!file_exists($framework)) {
$e = "Veuillez paramétrer l'emplacement et la version du Framework dans le fichier $framework";
trigger_error($e, E_USER_ERROR);
} else {
// Inclusion du Framework
require_once $framework;
 
// Ajout d'information concernant cette application
Framework::setCheminAppli(__FILE__);// Obligatoire
Framework::setInfoAppli(Config::get('info'));
 
// Initialisation et lancement du script appelé en ligne de commande
Cli::executer();
}
?>
/tags/v1.11-okuzgozu/scripts/framework.php
New file
0,0 → 1,0
link ../../../framework/trunk/framework/Framework.php
Property changes:
Added: svn:special
+*
\ No newline at end of property