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/tags/v5.12-baouque/donnees
New file
Property changes:
Added: svn:ignore
+*
/tags/v5.12-baouque/nettoyerBdd.sh
New file
0,0 → 1,67
#!/bin/bash
##############################################################################################################
# But : Script supprimant toutes les tables de la base de données eFlore.
# Auteur : Jean-Pascal Milcent <jpm@tela-botanica.org> (translate bat file to shell script)
# License : GPL v3
# Création : 15 avril 2013
# Version: 0.1
# 2013-04-15 - Création
# $Id$
##############################################################################################################
# Constante
APPDIR_ABSOLU=`pwd`;
#
CHEMIN_PHP="/opt/lampp/bin"
CHEMIN_TBF_CLI="$APPDIR_ABSOLU/scripts"
MEMORY_LIMIT="3500M"
echo -e "\033[31m`tput blink`ATTENTION :`tput sgr0` Nécessite la création préalable de la base de données \033[31mtb_eflore\033[00m"
echo "Nettoyage et chargement en cours...";
# BASEFLORE : doit être placé apèrs BDTFX (dépendance !)
echo "BASEVEG :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php baseveg -a supprimerTous
echo "BDNT :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php bdnt -a supprimerTous
echo "BDTFX :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php bdtfx -a supprimerTous
echo "BASEFLOR :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php baseflor -a supprimerTous
echo "BDTXA :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php bdtxa -a supprimerTous
echo "BIBLIO_BOTA :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php biblio_bota -a supprimerTous
# echo "BONNIER :";
# Pas encore utilisé !
echo "CHORODEP :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php chorodep -a supprimerTous
echo "COSTE :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php coste -a supprimerTous
echo "EFLORE :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php eflore -a supprimerTous
# echo "FOURNIER :";
# Pas encore utilisé !
echo "INSEE-D :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php insee_d -a supprimerTous
echo "ISO-3166-1 :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php iso_3166_1 -a supprimerTous
echo "ISO-639-1 :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php iso_639_1 -a supprimerTous
echo "NVJFL :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php nvjfl -a supprimerTous
echo "NVPS :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php nvps -a supprimerTous
echo "NVA :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php nva -a supprimerTous
echo "PHOTOFLORA :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php photoflora -a supprimerTous
# echo "PROMETHEUS :";
# Ontologie botanique.
# Pas encore utilisé !
echo "SPTB :";
# Statut de protection Tela Botanica
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php sptb -a supprimerTous
echo "CEL :";
echo -e "\033[31m`tput blink`ATTENTION :`tput sgr0` Nécessite la création préalable de la base de données \033[31mtb_cel\033[00m"
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php cel -a supprimerTous
echo "TAPIRLINK :";
echo -e "\033[31m`tput blink`ATTENTION :`tput sgr0` Nécessite la création préalable de la base de données \033[31mtb_hit_indexation\033[00m"
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php tapirlink -a supprimerTous
Property changes:
Added: svn:eol-style
+native
\ No newline at end of property
Added: svn:executable
+*
\ No newline at end of property
/tags/v5.12-baouque/initialiserBdd.sh
New file
0,0 → 1,91
#!/bin/bash
##############################################################################################################
# But : Script permettant d'initialiser en une seule commande l'ensemble de la base de données eFlore.
# Auteur : Jean-Pascal Milcent <jpm@tela-botanica.org> (translate bat file to shell script)
# Exemple : /opt/lampp/bin/php -d memory_limit=3500M ./cli.php bdtxa -a supprimerTous
# License : GPL v3
# Création : 07 decembre 2011
# Version: 0.1
# 2011-12-07 - Création
# $Id$
##############################################################################################################
# Constante
APPDIR_ABSOLU=`pwd`;
#
CHEMIN_PHP="/opt/lampp/bin"
CHEMIN_TBF_CLI="$APPDIR_ABSOLU/scripts"
MEMORY_LIMIT="3500M"
echo -e "\033[31m`tput blink`ATTENTION :`tput sgr0` Nécessite la création préalable de la base de données \033[31mtb_eflore\033[00m"
echo "Nettoyage et chargement en cours...";
# BASEFLORE : doit être placé apèrs BDTFX (dépendance !)
echo "BASEVEG :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php baseveg -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php baseveg -a chargerTous
echo "BDNT :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php bdnt -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php bdnt -a chargerTous
echo "BDTFX :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php bdtfx -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php bdtfx -a chargerTous
echo "BASEFLOR :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php baseflor -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php baseflor -a chargerTous
echo "BDTXA :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php bdtxa -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php bdtxa -a chargerTous
echo "BIBLIO_BOTA :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php biblio_bota -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php biblio_bota -a chargerTous
# echo "BONNIER :";
# Pas encore utilisé !
echo "CHORODEP :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php chorodep -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php chorodep -a chargerTous
echo "COSTE :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php coste -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php coste -a chargerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php coste -a chargerTxt
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php coste -a chargerIndex
echo "EFLORE :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php eflore -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php eflore -a chargerTous
# echo "FOURNIER :";
# Pas encore utilisé !
echo "INSEE-D :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php insee_d -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php insee_d -a chargerTous
echo "ISO-3166-1 :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php iso_3166_1 -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php iso_3166_1 -a chargerTous
echo "ISO-639-1 :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php iso_639_1 -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php iso_639_1 -a chargerTous
echo "NVJFL :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php nvjfl -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php nvjfl -a chargerTous
echo "NVPS :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php nvps -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php nvps -a chargerTous
echo "NVA :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php nva -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php nva -a chargerTous
echo "PHOTOFLORA :";
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php photoflora -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php photoflora -a chargerTous
# echo "PROMETHEUS :";
# Ontologie botanique.
# Pas encore utilisé !
echo "SPTB :";
# Statut de protection Tela Botanica
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php sptb -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php sptb -a chargerTous
echo "CEL :";
echo -e "\033[31m`tput blink`ATTENTION :`tput sgr0` Nécessite la création préalable de la base de données \033[31mtb_cel\033[00m"
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php cel -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php cel -a chargerTous
echo "TAPIRLINK :";
echo -e "\033[31m`tput blink`ATTENTION :`tput sgr0` Nécessite la création préalable de la base de données \033[31mtb_hit_indexation\033[00m"
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php tapirlink -a supprimerTous
$CHEMIN_PHP/php -d memory_limit=$MEMORY_LIMIT $CHEMIN_TBF_CLI/cli.php tapirlink -a chargerTous
 
 
Property changes:
Added: svn:eol-style
+native
\ No newline at end of property
Added: svn:executable
+*
\ No newline at end of property
/tags/v5.12-baouque/livraison.sh
New file
0,0 → 1,21
#!/bin/bash
##############################################################################################################
# But : Script permettant d'initialiser en une seule commande l'ensemble de la base de données eFlore.
# Auteur : Jean-Pascal Milcent <jpm@tela-botanica.org> (translate bat file to shell script)
# License : GPL v3
# Création : 07 decembre 2011
# Version: 0.1
# 2011-12-07 - Création
# $Id$
##############################################################################################################
 
# ATTENTION NE PAS UTILISER !!!
 
# compresser les services en excluant les fichiers svn et les fichiers de config et framework
#tar cvzf services.tar.gz services/ --exclude=".svn" --exclude="*.ini" --exclude="framework.php" --exclude="*.sh"
# envoyer sur tela
#scp services.tar.gz root@tela-botanica.org:/home/telabotap/www/eflore-test/.
 
# se connecter sur tela botanica en ssh et effectuer le déploiement
#ssh root@tela-botanica.org "cd /home/telabotap/www/eflore-test/; cd services; tar cvzf ../backup/services.tar.gz .; cd ../; rm -Rf services; tar xvzf services.tar.gz; cd services; cp ../configurations/services/* . -R; chown #telabotap:users /home/telabotap/www/eflore-test/services -R; chmod 755 /home/telabotap/www/eflore-test/services -R; exit";
#echo "Done !"
Property changes:
Added: svn:eol-style
+native
\ No newline at end of property
Added: svn:executable
+*
\ No newline at end of property
/tags/v5.12-baouque/chargerDonnees.sh
New file
0,0 → 1,50
#!/bin/bash
##############################################################################################################
# But : téléchargement automatique en local des données des projets depuis le serveur de Tela Botanica par ftp
# Auteur : Jean-Pascal Milcent <jpm@tela-botanica.org> (translate bat file to shell script)
# License : GPL v3
# Création : 07 decembre 2011
# Version: 0.1
# 2014-03-20 : changement dossier distant suite à passage sur Agathis.
# 2011-12-07 : Création.
##############################################################################################################
# Constante
NBREPARAM=$#
APPDIR_ABSOLU=`pwd`;
DOSSIER_LOCAL="$APPDIR_ABSOLU/donnees/"
DOSSIER_DISTANT="/"
# Aide
E_OPTERR=65
if [ "$1" = '--help' ]
then # Le script a besoin d'au moins un argument sur la ligne de commande
echo "Usage $0 -[parameters -u, -p ]"
echo "Paramétres : "
echo " -h: indiquer l'hote ftp"
echo " -u: indiquer le nom de l'utilisateur ftp"
echo " -p: indiquer le mot de passe de l'utilisateur ftp"
exit $E_OPTERR
fi
 
# Récupération des paramètres et des options de la ligne de commande
TEMP=`getopt -o u:p:h: -l help: -- "$@"`
if [ $? != 0 ] ; then echo "Terminating..." >&2 ; exit 1 ; fi
eval set -- "$TEMP"
while [ ! -z "$1" ] ; do
#echo $1" # "$2
case "$1" in
-h) HOST=$2;;
-u) FTP_USER=$2;;
-p) FTP_PASSWD=$2;;
--) shift ; break ;;
*) echo "Internal error!" ; exit 1 ;;
esac
shift 2
done
 
# Transfert sur le serveur par FTP
if [ $NBREPARAM -eq 0 ]; then
echo "Pas de transfert sur le serveur. Utiliser --help pour voir les options de transfert."
else
echo "Téléchargement en cours :";
lftp ftp://$FTP_USER:$FTP_PASSWD@$HOST -e "set ftp:passive off; mirror -e --no-symlinks -x '.*cel\/images\/.*' -x '.*osm\/.*' -x '.*plantscan\/.*' -x '.*coste\/cles\/.*' -x '.*coste\/descriptions\/.*' -x '.*coste\/images\/.*' -x '.*coste\/ressources\/.*' $DOSSIER_DISTANT $DOSSIER_LOCAL ; quit"
fi;
Property changes:
Added: svn:eol-style
+native
\ No newline at end of property
Added: svn:executable
+*
\ No newline at end of property
/tags/v5.12-baouque/services/apidoc.json
New file
0,0 → 1,18
{
"name": "eFlore",
"version": "0.1",
"description": "Documentation des web services d'eFlore",
"title": "eFlore - API",
"url" : "http://api.tela-botanica.org/service:eflore:0.1",
"template": {
"withCompare": false,
"withGenerator": true
},
"header": {
"title": "eFlore",
"filename": "apidoc-header.md"
},
"footer": {
"filename": "apidoc-footer.md"
}
}
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/insee-d/ZoneGeo.php
New file
0,0 → 1,446
<?php
/**
* Description :
* Classe ZoneGeo.php fournit des informations sur ensemble structuré des termes et concepts représentant les éléments
* d'un domaine de connaissances .
* Le but étant de fournir un ensemble minimal d'information comprenant :
* un identifiant (numérique ou alphanumérique sous forme de ChatMot si possible), un nom, une region et
* éventuellement une relation hiérarchique avec un autre terme (=classe).
* Si l'url finit par /zone-geo on retourne une liste de termes (seulement les 100 premières par défaut).
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /observations?param1=val1&param2=val2&...
*
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, masque.code, masque.nom, masque.region , recherche,
* distinct, retour.format, navigation.depart et navigation.limite.
*
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package framework-v3
* @author Delphine Cauquil <delphine@tela-botanica.org>
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-${year} Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
class ZoneGeo extends Commun {
 
protected $service = 'zone-geo';
 
/**
* Permet de stocker la requete formulée : /zone-geo | /zone-geo/#id | /zone-geo/#id/champ | /zone-geo/#id/relations
* Est remplit au cours de l'analyse des ressources (traiterRessources()), par défaut, a la valeur du service.
* Est utilisée principalement pr déterminer le format du tableau à retourner. */
protected $format_reponse = 'zone-geo';
 
/** Tri des résultats */
protected $tri = 'dep';
protected $ordre = 'ASC';
/**
* Permet de trier selon les clefs des tableaux reçus, et que ça marche (en
* fait faut faire des alias de colonnes correspondant aux clefs de sortie
* mais bon bref...)
*/
protected $corres_tri = array('code' => 'dep', 'nom' => 'nccenr');
 
/** Variables constituant les parametres de la requete SQL (champ, condition, group by, limit) remplie
* selon ressources et paramètres */
protected $requete_champ = ' * ';
protected $requete_condition = '';
protected $limite_requete = array(
'depart' => 0,
'limite' => 100
);
 
/** Stockage des ressources et paramétres */
protected $table_ressources = array();
protected $table_param = array();
 
/**
* Precise la contenance plus ou moins précise du tableau à retourner :
* - min = les données présentes dans la table
* - max = les données de la table + les informations complémentaires (pour les identifiants et les codes)
* - oss = la liste des nom_sci (uniquement pour noms et taxons)
*/
protected $retour_format = 'max';
 
/**
* Si "objet", renverra un objet dont les clefs sont les codes de départements;
* Si "liste", renverra une liste qui a le mérite de conserver l'ordre !
*/
protected $retour_type = 'objet';
 
/** Valeur du paramètre de requete recherche :
* - stricte : le masque est passé tel quel à l'opérateur LIKE.
* - etendue : ajout automatique du signe % à la place des espaces et en fin de masque avec utilisation de LIKE.
* - floue : recherche tolérante vis-à-vis d'approximations ou d'erreurs (fautes d'orthographe par exemple) */
protected $recherche;
 
/** Permet de stocker le tableau de résultat (non encodé en json) */
protected $table_retour = array();
 
/** Stocke le nombre total de résultats de la requete principale. Est calculée lors de l'assemblage de la requete */
protected $total_resultat;
 
// +-----------------------------------------------------------------------------------------------------+
public function traiterParametres() {
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres)) {
$this->table_param = $this->parametres;
 
// masque : filtre la liste en fonction d'un masque de recherche portant sur le code, le nom ou la region.
// masque.code : filtre uniquement sur le code. masque.nom : filtre uniquement sur le nom.
// masque.region : filtre uniquement sur la region.
if (isset($this->parametres['recherche']) && $this->parametres['recherche'] != '') {
$this->recherche = $this->parametres['recherche'];
}
 
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) {
switch ($param) {
case 'masque' :
$this->ajouterLeFiltreMasque('masque', $valeur);
break;
case 'masque.code' :
$this->ajouterLeFiltreMasque('dep', $valeur);
break;
case 'masque.nom' :
if ($valeur !== '') {
$this->ajouterLeFiltreMasque('nccenr', $valeur);
}
break;
case 'masque.region' :
$this->ajouterLeFiltreMasque('region', $valeur);
break;
case 'retour.format' :
$this->retour_format = $valeur;
break;
case 'retour.type' :
if (in_array($valeur, array('objet', 'liste')))
$this->retour_type = $valeur;
break;
case 'retour.tri' :
if ($valeur != '' ) {
if (in_array($valeur, array_keys($this->corres_tri))) {
$this->tri = $this->corres_tri[$valeur];
} else {
$this->tri = $valeur; // au petit bonheur la chance
}
}
break;
case 'retour.ordre' :
if (in_array(strtoupper($valeur), array('ASC', 'DESC')))
$this->ordre = $valeur;
break;
case 'navigation.depart' :
if ($valeur != '')
$this->limite_requete['depart'] = $valeur;
break;
case 'navigation.limite' :
if ($valeur != '')
$this->limite_requete['limite'] = $valeur;
break;
case 'recherche' :
break;
default :
$p = 'Erreur dans les paramètres de recherche de votre requête : '.
'</br> Le paramètre " '.$param.' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $p);
}
}
}
}
 
public function ajouterLeFiltreMasque($nom_champ, $valeur) {
if ($nom_champ == 'dep' || $nom_champ == 'region') {
$this->requete_condition[] = $nom_champ.' = '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
} else {
if ($this->recherche == 'floue') {
if ($nom_champ == 'masque') {
$this->requete_condition[] = '( dep = '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR region = '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR ( SOUNDEX(nccenr) = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE(nccenr)) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\')) '
.')) ';
} else {
$this->requete_condition[] = '(SOUNDEX('.$nom_champ.') = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE('.$nom_champ.')) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\'))) ';
}
} else {
if ($this->recherche == 'etendue') {
$valeur = str_replace(' ','%', $valeur);
$valeur .= '%';
}
 
if ($nom_champ == 'masque') {
$this->requete_condition[] = ' (dep = '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR nccenr LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR region = '.$this->getBdd()->proteger($valeur).')';
} else {
$this->requete_condition[] = $nom_champ.' LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
}
}
}
}
 
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
public function traiterRessources() {
if (isset($this->ressources) && !empty($this->ressources)) {
$this->table_ressources = $this->ressources;
if (isset($this->table_ressources[0]) && !empty($this->table_ressources[0])) {
//requete = /zone-geo/#id
$this->traiterRessourceId();
if (isset($this->table_ressources[1]) && !empty($this->table_ressources[1])) {
//dans le cas /zone-geo/#id/#champ ou /zone-geo/#id/relations
$this->traiterRessourceChampOuRelations();
}
}
}
}
 
//requete : /zone-geo/#id (ex : /zone-geo/7)
public function traiterRessourceId() {
if (is_numeric($this->table_ressources[0])) {
$this->requete_condition[] = ' dep = '.$this->getBdd()->proteger($this->table_ressources[0]);
$this->format_reponse .= '/id';
} else {
$r = 'Erreur dans les ressources de votre requête : </br> La ressource " '.$this->table_ressources[0].
' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $r);
}
}
 
 
public function traiterRessourceChampOuRelations() {
//requete = /zone-geo/#id/relations :
if ($this->table_ressources[1] == 'relations') {
$this->format_reponse .= '/relations';
$this->requete_condition[] = 'region = (SELECT region FROM '.$this->table.' WHERE '
.implode(' AND ', $this->requete_condition).')';
//requete = /zone-geo/#id/#champ :
} else {
$this->format_reponse .= '/champ';
}
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
public function assemblerLaRequete() {
//assemblage de la requete :
$requete = ' SELECT '.$this->requete_champ.
' FROM '.$this->table
.$this->formerRequeteCondition()
. ' ORDER BY ' . $this->tri . ' ' . $this->ordre
.$this->formerRequeteLimite();
return $requete;
}
 
public function formerRequeteCondition() {
$condition = '';
if ($this->requete_condition != null) {
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
}
return $condition;
}
 
 
//ajout d'une limite seulement pour les listes (pas plus de 100 resultats retournés pr les requetes
// suivantes : /zone-geo et /zone-geo/#id/relations)
public function formerRequeteLimite() {
if ($this->format_reponse != 'zone-geo' && $this->format_reponse != 'zone-geo/id/relations') {
$this->requete_limite = '';
} else {
$this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat();
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
}
return $this->requete_limite;
}
 
public function recupererTotalResultat() {
//on récupère le nombre total de résultats de la requete (ex : le nombre d'id contenu dans la liste /zone-geo)
$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '
.$this->table
.$this->formerRequeteCondition();
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
 
if ($res) {
$total = $res['nombre'];
} else {
$t = 'Fonction recupererTotalResultat() : <br/>Données introuvables dans la base';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $t);
}
return $total;
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// determine en fct du service appelé (/zone-geo | /zone-geo/#id | /zone-geo/#id/champ |
// /zone-geo/#id/relations) le format du tableau à retourner.
public function retournerResultatFormate($resultat) {
$this->recupererTableConfig('correspondance_champs');
switch ($this->format_reponse) {
case 'zone-geo' : $reponse = $this->formaterZoneGeo($resultat); break;
case 'zone-geo/id' : $reponse = $this->formaterZoneGeoId($resultat[0]); break;
case 'zone-geo/id/champ' : $reponse = $this->formaterZoneGeoIdChamp($resultat[0]); break;
case 'zone-geo/id/relations' : $reponse = $this->formaterZoneGeoIdRelations($resultat); break;
default : break;
}
return $reponse;
}
 
public function formaterZoneGeo($resultat) {
//on remplit la table $table_retour_json['entete']
$this->table_retour['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$this->table_retour['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$this->table_retour['total'] = $this->total_resultat;
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/zone-geo');
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') { $this->table_retour['href.precedent'] = $url['precedent']; }
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') { $this->table_retour['href.suivant'] = $url['suivant']; }
$table_retour_json['entete'] = $this->table_retour;
 
//on remplit la table $table_retour_json['resultat']
$this->table_retour = array();
if (isset($this->table_param['masque_nom'])) $resultat = $this->trierRechercheFloue($this->table_param['masque_nom'], $resultat, 'nccenr');
foreach ($resultat as $tab) {
foreach ($tab as $key => $valeur) {
if ($valeur != '') {
switch ($key) {
case 'dep' : $num = $valeur; $this->table_retour['code'] = $valeur; break;
case 'nccenr' : $this->table_retour['nom'] = $valeur; break;
default : break;
}
}
}
if ($this->retour_format == 'max') {
$this->table_retour['href'] = $this->ajouterHref('zone-geo', $num);
}
if ($this->retour_type == 'objet') {
$resultat_json[$num] = $this->table_retour;
} elseif ($this->retour_type == 'liste') {
$resultat_json[] = $this->table_retour;
}
$this->table_retour = array();
}
$table_retour_json['resultat'] = $resultat_json;
return $table_retour_json;
}
 
public function formaterZoneGeoId($resultat) {
foreach ($resultat as $key => $valeur) {
if ($valeur != '') {
$this->afficherDonnees($key, $valeur);
}
}
unset($this->table_retour['href']);
return $this->table_retour;
}
 
public function formaterZoneGeoIdRelations($resultat) {
if ($resultat == '') {
$retour = null;
} else {
//on remplit la table $table_retour_json['entete']
$this->table_retour['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$this->table_retour['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$this->table_retour['total'] = $this->total_resultat;
//formuler les urls
$url = $this->formulerUrl(count($resultat), '/zone-geo');
if ($url['precedent'] != '') { $this->table_retour['href.precedent'] = $url['precedent']; }
if ($url['suivant'] != '') { $this->table_retour['href.suivant'] = $url['suivant']; }
$retour['entete'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
 
//on remplit la table $table_retour_json['resultat']
foreach ($resultat as $tab) {
foreach ($tab as $key => $valeur) {
switch ($key) {
case 'dep' : $num = $valeur; $this->table_retour['code'] = $valeur; break;
case 'nccenr' : $this->table_retour['nom'] = $valeur; break;
default : break;
}
}
if ($this->retour_format == 'max') $this->table_retour['href'] = $this->ajouterHref('zone-geo', $num);
$resultat_json[$num] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
$retour['resultat'] = $resultat_json;
}
return $retour;
}
 
public function formaterZoneGeoIdChamp($resultat) {
//on recupère tous les resultats possibles
$reponse = $this->formaterZoneGeoId($resultat);
$this->table_retour = array();
//on recupère les résultats demandés à partir du tableau de résultat complet
$this->table_retour['id'] = $reponse['code'];
$champs = explode(' ', $this->table_ressources[1]);
 
foreach ($champs as $champ) {
if ($this->verifierValiditeChamp($champ)) {
if (strrpos($champ, '.*') !== false) {
$this->afficherPointEtoile($champ, $reponse);
 
} else {
if (isset($reponse[$champ])) {
$this->table_retour[$champ] = $reponse[$champ];
} else {
$this->table_retour[$champ] = null;
}
}
}
}
return $this->table_retour;
}
 
public function verifierValiditeChamp($champ) {
preg_match('/^([^.]+)(\.([^.]+))?$/', $champ, $match);
$champs_possibles = $this->correspondance_champs;
$champs_possibles[] = 'nom.*';
 
if (in_array($match[1], $champs_possibles)) {
$validite = true;
} elseif (in_array($match[0], $champs_possibles)) {
$validite = true;
} else {
$champs_possibles = implode('</li><li>', $champs_possibles);
$c = 'Erreur dans votre requête : </br> Le champ "'.$champ_possibles.'" n\'existe pas. '.
'Les champs disponibles sont : <li>'.$champs_possibles.'</li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $c);
}
return $validite;
}
 
public function afficherPointEtoile($champ, $reponse) {
preg_match('/^([^.]+\.)\*$/', $champ, $match);
foreach ($reponse as $chp => $valeur) {
if (strrpos($chp, $match[1]) !== false) {
if ($valeur != '') {
$this->table_retour[$chp] = $valeur;
} else {
$this->table_retour[$chp] = null;
}
}
}
}
 
public function afficherDonnees($champ, $valeur) {
if ($this->retour_format == 'max') {
if ($champ == 'region' || $champ == 'chef_lieu') {
$projet = 'insee-'.substr($champ, 0, 1);
$this->table_retour[$champ.'.code'] = $valeur;
$this->table_retour[$champ.'.href'] = $this->ajouterHrefAutreProjet('zone-geo', '', $valeur, $projet);
} elseif ($champ == 'tncc') {
$url = $this->ajouterHref('ontologies', $valeur);
$res = $this->consulterHref($url);
$this->table_retour['type_nom'] = $res->nom;
$this->table_retour['type_nom.code'] = $valeur;
$this->table_retour['type_nom.href'] = $url;
} else {
$this->table_retour[$this->correspondance_champs[$champ]] = $valeur;
}
} else {
$this->table_retour[$this->correspondance_champs[$champ]] = $valeur;
}
}
 
}
 
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/iso-3166-1/ZoneGeo.php
New file
0,0 → 1,401
<?php
/**
* Description :
* Classe ZoneGeo.php fournit des informations sur un ensemble de lieux à une échelle donnée.
* Le but étant de fournir un ensemble minimal d'information comprenant :
* un identifiant (numérique ou alphanumérique sous forme de ChatMot si possible), un nom, une region et
* éventuellement une relation hiérarchique avec un autre terme (=classe).
* Si l'url finit par /zone-geo on retourne une liste de zones (seulement les 100 premières par défaut).
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /zone-geo?param1=val1&param2=val2&...
*
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, masque.code, masque.nom, masque.region , recherche,
* distinct, retour.format, navigation.depart et navigation.limite.
*
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package framework-v3
* @author Delphine Cauquil <delphine@tela-botanica.org>
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-${year} Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
class ZoneGeo extends Commun {
 
protected $service = 'zone-geo';
 
/**
* Permet de stocker la requete formulée : /zone-geo | /zone-geo/#id | /zone-geo/#id/champ | /zone-geo/#id/relations
* Est remplit au cours de l'analyse des ressources (traiterRessources()), par défaut, a la valeur du service.
* Est utilisée principalement pr déterminer le format du tableau à retourner. */
protected $format_reponse = 'zone-geo';
 
/** Variables constituant les parametres de la requete SQL (champ, condition, group by, limit) remplie
* selon ressources et paramètres */
protected $requete_champ = ' * ';
protected $requete_condition = '';
protected $limite_requete = array(
'depart' => 0,
'limite' => 100
);
 
/** Stockage des ressources et paramétres */
protected $table_ressources = array();
protected $table_param = array();
/**
* Precise la contenance plus ou moins précise du tableau à retourner :
* - min = les données présentes dans la table
* - max = les données de la table + les informations complémentaires (pour les identifiants et les codes)
* - oss = la liste des nom_sci (uniquement pour noms et taxons)
*/
protected $retour_format = 'max';
/** Valeur du paramètre de requete recherche :
* - stricte : le masque est passé tel quel à l'opérateur LIKE.
* - etendue : ajout automatique du signe % à la place des espaces et en fin de masque avec utilisation de LIKE.
* - floue : recherche tolérante vis-à-vis d'approximations ou d'erreurs (fautes d'orthographe par exemple) */
protected $recherche;
 
/** Permet de stocker le tableau de résultat (non encodé en json) */
protected $table_retour = array();
/** Stocke le nombre total de résultats de la requete principale. Est calculée lors de l'assemblage de la requete */
protected $total_resultat;
 
// +-----------------------------------------------------------------------------------------------------+
public function traiterParametres() {
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres)) {
$this->table_param = $this->parametres;
 
// masque : filtre la liste en fonction d'un masque de recherche portant sur le code, le nom ou la region.
// masque.code : filtre uniquement sur le code. masque.nom : filtre uniquement sur le nom.
// masque.region : filtre uniquement sur la region.
if (isset($this->parametres['recherche']) && $this->parametres['recherche'] != '') {
$this->recherche = $this->parametres['recherche'];
}
 
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) {
switch ($param) {
case 'masque' :
$this->ajouterLeFiltreMasque('masque', $valeur);
break;
case 'masque.code' :
$this->ajouterLeFiltreMasque('codet', $valeur);
break;
case 'masque.nom' :
$this->ajouterLeFiltreMasque('nom', $valeur);
break;
case 'masque.statut' :
$this->ajouterLeFiltreMasque('codet_statut', $valeur);
break;
case 'retour.format' :
$this->retour_format = $valeur;
break;
case 'navigation.depart' :
$this->limite_requete['depart'] = $valeur;
break;
case 'navigation.limite' :
$this->limite_requete['limite'] = $valeur;
break;
case 'recherche' :
break;
default :
$p = 'Erreur dans les paramètres de recherche de votre requête : '.
'</br> Le paramètre " '.$param.' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $p); break;
}
}
}
}
 
public function ajouterLeFiltreMasque($nom_champ, $valeur) {
if ($nom_champ == 'codet') {
$this->requete_condition[] .= $nom_champ.' = '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
} else {
if ($this->recherche == 'floue') {
if ($nom_champ == 'masque') {
$this->requete_condition[] = ' ( codet = '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR (SOUNDEX(nom_francais) = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE(nom_francais)) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\')) OR '
.'SOUNDEX(nom_anglais) = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE(nom_anglais)) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\'))) '
.' OR ( SOUNDEX(codet_statut) = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE(codet_statut)) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\')) '
.')) ';
} elseif ($nom_champ == 'nom') {
$this->requete_condition[] = '(SOUNDEX(nom_francais) = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE(nom_francais)) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\'))) OR
(SOUNDEX(nom_anglais) = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE(nom_anglais)) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\'))) ';
} else {
$this->requete_condition[] = '(SOUNDEX('.$nom_champ.') = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE('.$nom_champ.')) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\'))) ';
}
} else {
if ($this->recherche == 'etendue') {
$valeur = str_replace(' ','%', $valeur);
$valeur .= '%';
}
 
if ($nom_champ == 'masque') {
$this->requete_condition[] = '(codet = '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR nom_francais LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR nom_anglais LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR codet_statut LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur).')';
} elseif ($nom_champ == 'nom') {
$this->requete_condition[] = '(nom_francais LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur).' OR '
.'nom_anglais LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur).') ';
} else {
$this->requete_condition[] = $nom_champ.' LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
}
}
}
}
 
// +-----------------------------------------------------------------------------------------------------+
public function traiterRessources() {
if (isset($this->ressources) && !empty($this->ressources)) {
$this->table_ressources = $this->ressources;
if (isset($this->table_ressources[0]) && !empty($this->table_ressources[0])) {
//requete = /zone-geo/#id
$this->traiterRessourceId();
if (isset($this->table_ressources[1]) && !empty($this->table_ressources[1])) {
//requete = /zone-geo/#id/#champ ou /zone-geo/#id/relations
$this->traiterRessourceChampOuRelations();
}
}
}
}
 
public function traiterRessourceId() {
//requete : /zone-geo/#id (ex : /zone-geo/7)
if ($this->table_ressources[0]) {
$this->requete_condition[] = ' codet = '.$this->getBdd()->proteger($this->table_ressources[0]);
$this->format_reponse .= '/id';
} else {
$r = 'Erreur dans les ressources de votre requête : </br> La ressource " '.$this->table_ressources[0].
' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $r);
}
}
 
 
public function traiterRessourceChampOuRelations() {
if ($this->table_ressources[1] == 'relations') {
$r = 'Erreur dans les ressources de votre requête : </br> La ressource " '.$this->table_ressources[1].
' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $r);
} else {
$this->format_reponse .= '/champ';
}
}
 
// +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
public function assemblerLaRequete() {
//assemblage de la requete :
$requete = ' SELECT '.$this->requete_champ.
' FROM '.$this->table
.$this->formerRequeteCondition()
.$this->formerRequeteLimite();
return $requete;
}
 
//ajout d'une limite seulement pour les listes (pas plus de 100 resultats retournés pr les requetes
// suivantes : /zone-geo et /zone-geo/#id/relations)
public function formerRequeteLimite() {
if ($this->format_reponse != 'zone-geo') {
$this->requete_limite = '';
} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat())) {
//cas ou la requete presente un navigation.depart supérieur au nb total de resultats.
$this->limite_requete['depart'] =
(($nb - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($nb - $this->limite_requete['limite']);
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
} else {
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
}
return $this->requete_limite;
}
 
public function formerRequeteCondition() {
$condition = '';
if ($this->requete_condition != null) {
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
}
return $condition;
}
 
public function recupererTotalResultat() {
//on récupère le nombre total de résultats de la requete (ex : le nombre d'id contenu dans la liste /zone-geo)
$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '
.$this->table
.$this->formerRequeteCondition();
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
 
if ($res) {
$total = $res['nombre'];
} else {
$t = 'Fonction recupererTotalResultat() : <br/>Données introuvables dans la base';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $t);
}
return $total;
}
 
// +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// determine en fct du service appelé (/zone-geo | /zone-geo/#id | /zone-geo/#id/champ |
// /zone-geo/#id/relations) le format du tableau à retourner. Encode en json
public function retournerResultatFormate($resultat) {
$this->recupererTableConfig('correspondance_champs');
switch ($this->format_reponse) {
case 'zone-geo' : $reponse = $this->formaterZoneGeo($resultat); break;
case 'zone-geo/id' : $reponse = $this->formaterZoneGeoId($resultat[0]); break;
case 'zone-geo/id/champ' : $reponse = $this->formaterZoneGeoIdChamp($resultat[0]); break;
default : break;
}
return $reponse;
}
 
public function formaterZoneGeo($resultat) {
//on remplit la table $table_retour_json['entete']
$this->table_retour['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$this->table_retour['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$this->table_retour['total'] = $this->total_resultat;
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/zone-geo');
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') {
$this->table_retour['href.precedent'] = $url['precedent'];
}
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') {
$this->table_retour['href.suivant'] = $url['suivant'];
}
$table_retour_json['entete'] = $this->table_retour;
 
//on remplit la table $table_retour_json['resultat']
$this->table_retour = array();
if (isset($this->table_param['masque_nom'])) $resultat = $this->trierRechercheFloue($this->table_param['masque_nom'], $resultat, 'nom_francais');
foreach ($resultat as $tab) {
foreach ($tab as $key => $valeur) {
$valeur = rtrim($valeur);
if ($valeur != '') {
switch ($key) {
case 'codet' : $num = $valeur; $this->table_retour['code'] = $valeur; break;
case 'nom_francais' : $this->table_retour['nom'] = $valeur; break;
case 'nom_anglais' : if ($tab['nom_francais'] == '') $this->table_retour['nom'] = $valeur; break;
case 'codet_statut' : $this->table_retour['statut'] = $valeur; break;
default : break;
}
}
}
if ($this->retour_format == 'max') {
$this->table_retour['href'] = $this->ajouterHref('zone-geo', $num);
}
$resultat_json[$num] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
$table_retour_json['resultat'] = $resultat_json;
return $table_retour_json;
}
 
public function formaterZoneGeoId($resultat) {
foreach ($resultat as $key => $valeur) {
if ($valeur != '') {
$this->afficherDonnees($key, $valeur);
}
}
unset($this->table_retour['href']);
return $this->table_retour;
}
 
public function formaterZoneGeoIdChamp($resultat) {
//on recupère tous les resultats possibles
$reponse = $this->formaterZoneGeoId($resultat);
$this->table_retour = array();
//on recupère les résultats demandés à partir du tableau de résultat complet
$this->table_retour['id'] = $reponse['code'];
 
$champs = explode(' ', $this->table_ressources[1]);
foreach ($champs as $champ) {
if ($champ == 'nom') $champ = 'nom.fr';
if ($this->verifierValiditeChamp($champ)) {
if (strrpos($champ, '.*') !== false) {
$this->afficherPointEtoile($champ, $reponse);
} else {
if (isset($reponse[$champ])) {
$this->table_retour[$champ] = $reponse[$champ];
} else {
$this->table_retour[$champ] = null;
}
}
}
}
return $this->table_retour;
}
 
public function verifierValiditeChamp($champ) {
preg_match('/^([^.]+)(\.([^.]+))?$/', $champ, $match);
$champs_possibles = $this->correspondance_champs;
$champs_possibles[] = 'nom.*';
 
if (in_array($match[1], $champs_possibles)) {
$validite = true;
} elseif (in_array($match[0], $champs_possibles)) {
$validite = true;
} else {
$champs_possibles = implode('</li><li>', $champs_possibles);
$c = 'Erreur dans votre requête : </br> Le champ "'.$champ_possibles.'" n\'existe pas. '.
'Les champs disponibles sont : <li>'.$champs_possibles.'</li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $c);
}
return $validite;
}
 
public function afficherPointEtoile($champ, $reponse) {
preg_match('/^([^.]+\.)\*$/', $champ, $match);
foreach ($reponse as $chp => $valeur) {
if (strrpos($chp, $match[1]) !== false) {
if ($valeur != '') {
$this->table_retour[$chp] = $valeur;
} else {
$this->table_retour[$chp] = null;
}
}
}
}
 
public function afficherDonnees($champ, $valeur) {
if ($this->retour_format == 'max') {
if ($champ == 'codet_statut') {
$this->table_retour[$this->correspondance_champs[$champ]] = $valeur;
$this->table_retour[$this->correspondance_champs[$champ].'.href'] =
$this->ajouterHref('ontologies', 'masque.nom=Codet '.$valeur, '?');
} else {
$this->table_retour[$this->correspondance_champs[$champ]] = $valeur;
}
} else {
$this->table_retour[$this->correspondance_champs[$champ]] = $valeur;
}
}
 
// +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
/** Permet de retourner l'url http://tela-botanica.org/service:eflore:0.1/[projet]/[version_projet]/[service]/[ressource]:[valeur]
* @param $service : correspond au nom de la ressource à laquelle on souhaite acceder
* @param $val : correspond au paramètre de la ressource (ex :
* @param $projet : est remplit dans les cas suivants :
* - si le projet dans lequel se trouve l'information est différent de celui du service appelé
* - si on souhaite rappeler le meme projet avec la meme ressource mais un parametre de ressource différent
*/
public function ajouterHref($service, $val, $separation = '/') {
$val = $this->encoderUrl($val);
if ($this->version_projet == '+') {
$url = Config::get('url_service_base').Config::get('nom_projet').'/'.$service.$separation.$val;
} else {
$url = Config::get('url_service_base').Config::get('nom_projet').'/'.$this->version_projet.'/'.$service.$separation.$val;
}
return $url;
}
 
public function encoderUrl($url) {
$url = str_replace(' ', '%20', $url);
$url = str_replace('?', urlencode('?'), $url);
return $url;
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/commun/Commun.php
New file
0,0 → 1,600
<?php
/**
* Classe Commun.php est une classe abstraite qui contient les méthodes de base communes à tous les
* sous-services des projets.
*
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package eflore-projets
* @author Jennifer DHÉ <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @author Delphine CAUQUIL <delphine@tela-botanica.org>
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
abstract class Commun {
 
/** Objet Bdd. */
private $Bdd = null;
/** Objet Rest Client. */
private $RestClient = null;
 
/** par défaut : configuration du projet, section [NomDuService] */
protected $config;
 
/** Contients les paramètres. Doit remplacer table_param. */
protected $parametres = array();
/** Contients les ressources. Doit remplacer table_ressources. */
protected $ressources = array();
/** Le nom du service courrant. */
protected $serviceNom = null;
 
//Classe commune à tous les services web d'un projet. Contient par exemple les fonctions permettant de
//renvoyer la réponse http...
protected $entete_http; // Entete de la réponse correspondant au code de réponse de la requete http */
protected $corps_http; // Tableau de résultat à retourner au format json ou la description de l'erreur si elle existe */
protected $service; // Nom du service appelé
/** Stocke la version du projet demandée dans la requete
* - "*" : (/#projet/* /meta-donnees) Renvoi les meta-données de toutes les versions du projet
* - "numero de la version" : (/#projet/2.00/meta-donnees) Renvoi les meta-données de la version 2.00 du projet */
protected $version_projet = '+';
protected $table_version; //Stocke les noms des tables de toutes les versions du projet disponibles
/** tableau contenant tous les champs d'une table (est rempli par la fonction Commun::recupererNomChamp($table)) */
protected $champs_table = array();
 
public function __construct($bdd = null, $config = null) {
$this->Bdd = is_null($bdd) ? $this->getBdd() : $bdd;
$this->config = is_null($config) ? Config::get($this->serviceNom) : $config;
$this->init();
}
 
// ajustements post-constructeur
protected function init() {}
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->ressources = $ressources;
$this->parametres = $parametres;
$this->chargerNomDuService();
 
$this->traiterParametres();
$this->traiterVersionProjet();
 
$resultats = '';
foreach ($this->table_version as $version) {
$this->table = $version; //on stocke le nom de la table correspondant à la version du projet en cours
$this->recupererNomChamp($this->table); //on récupère les noms des champs disponibles (Ds Commun.php)
$this->traiterRessources(); //dans CommunNomsTaxons.php
$requete = $this->assemblerLaRequete();// dans Noms ou Taxons...
$resultat = $this->getBdd()->recupererTous($requete . ' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__ . ' (' .$this->table . ')');
$versionResultat = $this->traiterResultat($resultat, $version, $requete);
if (count($this->table_version) > 1) {
$resultats[$version] = $versionResultat;
} else {
$resultats = $versionResultat;
}
}
 
return $resultats;
}
 
private function chargerNomDuService() {
$this->serviceNom = get_class($this);
}
 
public function traiterResultat($resultat, $version) {
$versionResultat = null;
if ($resultat == '') {
//cas ou la requete comporte des erreurs
$message = 'La requête SQL formée comporte une erreur!';
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
} elseif ($resultat) {
$versionResultat = $this->retournerResultatFormate($resultat, $version);
} else {
$message = 'Les données recherchées sont introuvables.';
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
}
return $versionResultat;
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// Méthodes concernant les paramètres
/**
* Permet de récupérer une liste des noms des champs de la table passée en paramètre
* @param $table : Nom de la table dont on souhaite connaitre les champs
*/
public function recupererNomChamp($table) {
$resultat = @$this->getBdd()->recupererTous('SHOW FIELDS FROM '.$table);
if (!$resultat) {
$m = "La table recherchée n'existe pas";
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $m);
}
 
foreach ($resultat as $info) $this->champs_table[] = $info['Field'];
}
 
/**
* Fonction permettant de creer la table dont le nom est passé en paramètre (champs_api, champs_bdtfx,
* correspondance_champs...). Les données de chaque table sont présentes dans le fichier de configuration config.ini
* @param String $table : Peut contenir plusieurs nom de table dont on souhaite récupérer les données : table,table,table.
* Ex : recupererTableConfig('champs_api,champs_bdtfx')
*/
public function recupererTableConfig($table) {
$tables = explode(',', $table);
foreach ($tables as $tab) {
$tableau = explode(',', Config::get($tab));
$tableau = array_map('trim', $tableau);
foreach ($tableau as $champ) {
list($code, $rang) = explode('=', $champ);
$tab_tampon[$code] = $rang;
}
$this->$tab = $tab_tampon;
$tab_tampon = array();
}
}
 
public function renvoyerErreur($entete, $message) {
throw new Exception($message, $entete);
}
 
/**
* Permet de remplir la variable version_projet et de retirer cette donnée du tableau des ressources
* @param $ressources
*/
public function traiterVersionProjet() {
if (isset($this->parametres['version.projet'])) {
if (preg_match('/^[0-9]+(?:[._][0-9]+|)$/', $this->parametres['version.projet'])) {
$this->version_projet = $this->parametres['version.projet'];
$this->version_projet = 'v'.str_replace('.', '_', $this->version_projet);
} else {
$this->version_projet = $this->parametres['version.projet'];
}
}
//si la liste des noms est demandée pr toutes les versions, on affiche seulement la dernière version :
if ($this->version_projet == '*' && $this->ressources == array()) {
$message = "L'affichage de plusieurs versions ne fonctionne que pour les ressources de type /ressources/#id";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE;
throw new Exception($message, $code);
}
//on recupère les versions du projet disponible dans la table des meta-donnees (utilisation service MetaDonnees)
$table_num_version = $this->recupererVersionDisponible();
//on recupere la liste des noms des tables de la bdd correspondant aux differentes versions du projet en fct de la ou les versions demandées
$this->recupererListeNomTablePrChaqueVersion($table_num_version);
}
 
/**
* Recupération des versions disponibles par appel du service metaDonnees
* Verification de l'existance du service recherché dans la requete (si précisé : hors *)
* @return array : tableau contenant le numéro de chaque version disponible
*/
public function recupererVersionDisponible() {
$versions_dispo = '';
$req_version = 'SELECT version FROM '.Config::get('bdd_table_meta');
$res_version = $this->getBdd()->recupererTous($req_version);
if ($res_version == '') { //cas ou la requete comporte des erreurs
$e = "La requête SQL de versionnage formée comporte une erreur : $req_version";
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
} elseif ($res_version) {
foreach ($res_version as $version) {
$versions_dispo[] = $version['version'];
}
} else {
$m = 'Versions introuvables dans la table des méta-données';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $m);
}
return $versions_dispo;
}
 
public function recupererListeNomTablePrChaqueVersion($table_num_version) {
switch ($this->serviceNom) {
case 'Ontologies' :
$prefixe_table = 'bdd_table_ontologies';
break;
default:
$prefixe_table = 'bdd_table';
}
switch ($this->version_projet) {
case '+' :
$derniere_version = $table_num_version[count($table_num_version) - 1];
$this->table_version[] = Config::get($prefixe_table).'_v'.str_replace('.', '_', $derniere_version);
break;
case '*' :
foreach ($table_num_version as $num_version) {
$this->table_version[] = Config::get($prefixe_table).'_v'.str_replace('.', '_', $num_version);
}
break;
default :
$this->table_version[] = Config::get($prefixe_table).'_'.$this->version_projet;
break;
}
}
 
//valeur * signifie pas de limites
public function definirNavigationLimite($valeur){
if (isset($this->parametres['navigation.limite']) ) {
if ((preg_match('/^([0-9]+)$/', $valeur) && $valeur != 0 ) || $valeur == '*' ){
$this->limite_requete['limite'] = $valeur;
} else {
$e = "Erreur : valeur erronnée pour le paramètre navigation.limite.";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
}
}
 
public function definirNavigationDepart($valeur){
if (isset($this->parametres['navigation.depart'])) {
if(preg_match('/^([0-9]+)$/', $valeur)){
$this->limite_requete['depart'] = $valeur;
} else {
$e = "Erreur : valeur erronnée pour le paramètre navigation.depart.";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
} else {
$e = "indiquez également la valeur pour le paramètre navigation.limite.";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
}
/**
* Est appelée pour former l'url complete des resultats precedants ou suivants.
* @param int : Permet de connaitre le nombre de noms obtenus par la requete
* @return string Retourne l'url complete des resultats precedents ou suivant sous la forme d'un tableau
*/
public function formulerUrl($nb_resultat, $id = null) {
$url = array();
$debut_url = Config::get('url_service').$id.'?';
//on recréé l'url sans les parametres de navigation qui seront rajoutés ci-apres. On les enlève dc de la table des parametres
foreach($this->parametres as $cle => $val) {
$param_url[str_replace('_', '.', $cle)] = $val;
}
 
$this->recupererLesLimitesSuivantes($nb_resultat, $param_url);
if (isset($param_url['navigation.depart']) && isset($param_url['navigation.limite'])) {
$url['suivant'] = $debut_url.http_build_query($param_url);
}
 
$this->recupererLesLimitesPrecedentes($param_url);
if (isset($param_url['navigation.depart']) && isset($param_url['navigation.limite'])) {
$url['precedent'] = $debut_url.http_build_query($param_url);
}
return $url;
}
 
public function supprimerNavigation(&$param_url) {
unset($param_url['navigation.depart']);
unset($param_url['navigation.limite']);
}
 
/**
* Description :
* Permet de former les limites de la requete retournant les résultats suivants.
* Cette url sera afficher dans l'entete de la reponse retournée en format JSON (retour.format=defaut).
* @param int : $nb_resultat : Permet de connaitre le nombre de résultats obtenus par la requete
* @return string : la fin de l'url decrivant les limites des resultats suivants. Si aucun résultats ne suient,
* une chaine de caractère vide est retournée
*/
public function recupererLesLimitesSuivantes($nb_resultat, &$param_url_suiv) {
$this->supprimerNavigation($param_url);
$depart = $this->limite_requete['depart'];
$limite = $this->limite_requete['limite'];
$depart_suivant = $depart + $limite;
$limite_suivant = $limite;
if ($nb_resultat > $depart_suivant) {
$param_url_suiv['navigation.depart'] = $depart_suivant;
$param_url_suiv['navigation.limite'] = $limite_suivant;
} else {
$param_url_suiv['navigation.depart'] = null;
$param_url_suiv['navigation.limite'] = null;
}
}
 
/**
* Description :
* Permet de former les limites de la requete retournant les résultats precedents.
* Cette url sera afficher dans l'entete de la taxons/105reponse retournée en format JSON (retour.format=defaut)
* @return string : la fin de l'url decrivant les limites des resultats precedents.
* Si aucun résultats ne precedent, une chaine de caractère vide est retournée
*/
public function recupererLesLimitesPrecedentes(&$param_url) {
$this->supprimerNavigation($param_url);
$depart = $this->limite_requete['depart'];
$limite = $this->limite_requete['limite'];
if ($depart == 0) {
$url_precedente = '';
} else {
if (($depart - $limite) < 0) {
$depart_precedent = 0;
} else {
$depart_precedent = $depart - $limite;
}
$param_url['navigation.depart'] = $depart_precedent;
$param_url['navigation.limite'] = $limite;
}
}
 
static function getDureeCache() {
$dureecache = 0;
$dureecache = Config::get('dureecache');
if ($dureecache == null || !is_numeric($dureecache) || $dureecache < 0) {
$dureecache = 0;
}
return (int) $dureecache;
}
 
public function ajouterHref($service, $val) {
// http://tela-botanica.org/service:eflore:0.1/[projet]/[version_projet]/[service]/[ressource]:[valeur]
if ($this->version_projet == '+') {
$url = Config::get('url_service_base').Config::get('nom_projet').'/'.$service.'/'.$val;
} else {
$url = Config::get('url_service_base').Config::get('nom_projet').'/'.$service.'/'.$val.'?version.projet='.ltrim($this->version_projet, 'v');
}
return $url;
}
 
static function s_ajouterHref($service, $val, $version_projet = '') {
// http://tela-botanica.org/service:eflore:0.1/[projet]/[version_projet]/[service]/[ressource]:[valeur]
return Config::get('url_service_base').Config::get('nom_projet').'/'.$service.'/'.$val . ($version_projet != '+') ? ('?version.projet='.ltrim($version_projet, 'v')) : '';
}
 
public function ajouterHrefAutreProjet($service, $ressource, $valeur, $projet = null, $param = null) {
//on enleve les GA et Co, les meta ou les "_"
$this->transliterer($service, $valeur);
//on définit les nom des projets, des services et des ressources de l'url (dans les méta-donnees)
$tab = array(
'langue' => array('service' => 'langues', 'projet' => 'iso-639-1', 'ressource' => ''),
'couverture_spatiale' => array('service' => 'zone-geo', 'projet' => 'iso-3166-1', 'ressource' => ''),
'type' => array('service' => 'ontologies', 'projet' => 'eflore', 'ressource' => 'contactType:'),
'datum' => array('service' => 'ontologies', 'projet' => 'eflore', 'ressource' => 'datum:')
);
if (array_key_exists($service, $tab)) {
extract($tab[$service]);
} else {
if (strpos(Config::get('nom_projet'), 'bd') === 0 && $projet == null) {
$projet = 'bdnt';
$service = 'ontologies';
$ressource = '';
}
}
$param = ($param) ? "?".$param : "";
$url = Config::get('url_service_base').$projet.'/'.$service.'/'.$ressource.$valeur.$param;
return $url;
}
 
static function s_ajouterHrefAutreProjet($service, $ressource, $valeur, $projet = null, $param = null) {
//on enleve les GA et Co, les meta ou les "_"
self::s_transliterer($service, $valeur);
//on définit les nom des projets, des services et des ressources de l'url (dans les méta-donnees)
$tab = array(
'langue' => array('service' => 'langues', 'projet' => 'iso-639-1', 'ressource' => ''),
'couverture_spatiale' => array('service' => 'zone-geo', 'projet' => 'iso-3166-1', 'ressource' => ''),
'type' => array('service' => 'ontologies', 'projet' => 'eflore', 'ressource' => 'contactType:'),
'datum' => array('service' => 'ontologies', 'projet' => 'eflore', 'ressource' => 'datum:')
);
if (array_key_exists($service, $tab)) {
extract($tab[$service]);
} else {
if (strpos(Config::get('nom_projet'), 'bd') === 0 && $projet == null) {
$projet = 'bdnt';
$service = 'ontologies';
$ressource = '';
}
}
$param = ($param) ? "?".$param : "";
$url = Config::get('url_service_base').$projet.'/'.$service.'/'.$ressource.$valeur.$param;
return $url;
}
 
/**Permet de consulter une url et retourne le résultat ou une erreur
* @param $url */
public function consulterHref($url) {
$res = $this->getRestClient()->consulter($url);
$entete = $this->getRestClient()->getReponseEntetes();
//Si le service meta-donnees fonctionne correctement, l'entete comprend la clé wrapper_data
if (isset($entete['wrapper_data'])) {
$res = json_decode($res);
return $res;
} else {
$u = 'L\'url <a href="'.$url.'">'.$url.'</a> lancée via RestClient renvoie une erreur';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $u);
}
}
 
public function transliterer(&$service, &$val) {
if (preg_match('/^.+:(.+)$/', $val, $match)) {
$val = $match[1];
}
$service = str_replace(array('_Ga','_Co','_meta'), '', $service);
if ($service == 'rang') {
$ressource = 'rangTaxo';
} elseif (preg_match('/^(statut)(?:_|-)([^_-]+)$/', $service, $match)) {
$service = $match[1].ucfirst($match[2]);
} elseif (strrpos($service, 'datum') !== false) {
$service = 'datum';
}
}
 
static function s_transliterer(&$service, &$val) {
if (preg_match('/^.+:(.+)$/', $val, $match)) {
$val = $match[1];
}
$service = str_replace(array('_Ga','_Co','_meta'), '', $service);
if ($service == 'rang') {
$ressource = 'rangTaxo';
} elseif (preg_match('/^(statut)(?:_|-)([^_-]+)$/', $service, $match)) {
$service = $match[1].ucfirst($match[2]);
} elseif (strrpos($service, 'datum') !== false) {
$service = 'datum';
}
}
 
// prend en arguments la valeur de la recherche, les résultats approchés, le paramétre recherche
// retourne le tableau trié en fonction de la ressemblance entre le résultat approché et la valeur recherchée
public function trierRechercheFloue($nom_demande, $tab_approchee, $nom) {
$trie = '';
$resultat = array();
foreach ($tab_approchee as $id => $tab) {
$nom_demande_ss = strtolower(Chaine::supprimerAccents($nom_demande));
$nom_flou_ss = strtolower(Chaine::supprimerAccents($tab[$nom]));
$stat = array();
// Prime pour la ressemblance globale :
$score = 500 - levenshtein($nom_flou_ss, $nom_demande_ss);
// On affine
$score = $score + (similar_text($nom_demande_ss, $nom_flou_ss) * 3);
$stat['score'] = $score;
foreach ($tab as $key => $valeur) {
$stat[$key] = $valeur;
}
$resultat[] = $stat;
}
 
 
// Vérification que nous avons bien trouvé un nom approché
if (count($resultat) > 0) {
$trie = Tableau::trierMD($resultat, array('score' => SORT_DESC));
}
return $trie;
}
 
protected function recupererTableauConfig($param) {
$tableau = array();
$tableauPartiel = explode(',', Config::get($param));
$tableauPartiel = array_map('trim', $tableauPartiel);
foreach ($tableauPartiel as $champ) {
if (strpos($champ, '=') === false) {
$tableau[] = $champ;
} else {
list($cle, $val) = explode('=', $champ);
$tableau[$cle] = $val;
}
}
return $tableau;
}
 
static function s_recupererTableauConfig($param) {
$tableau = array();
$tableauPartiel = array_map('trim', explode(',', Config::get($param)));
foreach ($tableauPartiel as $champ) {
if (strpos($champ, '=') === false) {
$tableau[] = $champ;
} else {
list($cle, $val) = explode('=', $champ);
$tableau[$cle] = $val;
}
}
return $tableau;
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// Méthodes d'accès aux objets du Framework
/**
* Méthode de connection à la base de données sur demande.
* Tous les services web n'ont pas besoin de s'y connecter.
*/
protected function getBdd() {
if (! isset($this->Bdd)) {
$this->Bdd = new Bdd();
}
return $this->Bdd;
}
 
/**
* Méthode permettant de faire appel à un client REST en fonction des besoins du service.
*/
protected function getRestClient() {
if (! isset($this->RestClient)) {
$this->RestClient = new RestClient();
}
return $this->RestClient;
}
 
 
/**
* Génération de fichiers pour les cartes
*/
static function convertirEnPNGAvecRsvg($idFichier, $chemin, $svg) {
// test répertoire de cache
if(!is_dir($chemin)) {
mkdir($chemin, 0777, true);
}
if(!is_dir($chemin)) {
error_log(__FILE__ . ": can't create cache {$chemin}");
return NULL;
}
 
// test présence du binaire de conversion (rsvg)
/*
// `which` no possible using safe-mode...
$i = $s = NULL;
exec('which rsvg-convert', $s, $i);
if($i != 0) {
error_log(__FILE__ . ": no rsvg-convert binary");
return NULL;
}
*/
// conversion svg => png
// troncage du nom de fichier si celui-ci est trop long
// (passé 255 caractères, le risque de collision est très faible)
$cheminReduit = substr($chemin.$idFichier, 0, 240);
$fichierPng = $cheminReduit.'.png';
$fichierSvg = $cheminReduit.'.svg';
file_put_contents($fichierSvg, $svg);
$i = $s = NULL;
$rsvg = exec("rsvg-convert $fichierSvg -d 75 -p 75 -o $fichierPng", $s, $i);
if($i != 0) {
error_log(__FILE__ . ": `rsvg-convert $fichierSvg -o $fichierPng` returned $i: " . implode(', ', $s));
return NULL;
}
 
self::indexerFichierPng($fichierPng);
return file_get_contents($fichierPng);
}
 
static function indexerFichierPng($fichierPng) {
$img = imagecreatefrompng($fichierPng);
imagetruecolortopalette($img, false, 32);
$blanc = imagecolorallocate($img, 255, 255, 255);
imagefill($img, 0, 0, $blanc);
imagepng($img, $fichierPng, 9, PNG_ALL_FILTERS);
}
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// Fonctions appelées par plusieurs web services
public function obtenirNumNomTaxonsSuperieurs($referentiel, $nn_demande) {
$nn_taxons_sup = array();
// TODO: ceci ramène trop de champs alors que l'on a besoin que du numéro nomenclatural
// et il y a peut-être un meilleur moyen que ramener la hierarchie des taxons supérieurs
// mais pour le moment ça marche et c'est assez rapide
$url = $this->ajouterHrefAutreProjet('taxons', $nn_demande, '/relations/superieurs',$referentiel);
$classification = $this->consulterHref($url);
$classification = is_object($classification) ? get_object_vars($classification) : array();
if(isset($classification[$nn_demande])) {
$classification_nn_demande = get_object_vars($classification[$nn_demande]);
$tab_nn_demandes = array_keys($classification_nn_demande);
$nn_taxons_sup = $tab_nn_demandes;
}
return $nn_taxons_sup;
}
 
 
static function extraireComplementsOntologies($ontologie) {
if (!$ontologie['complements']) return $ontologie;
$complements = explode(',', trim($ontologie['complements']));
foreach ($complements as $complement) {
@list($cle, $val) = explode('=', trim($complement));
// TODO: dirty workaround. Les compléments aux ontologies utilisent
// des séparateurs variables.
// cf disabledtestSeparateurToutesOntologies() dans tests/0.1/eflore/EfloreOntologiesTest.php
// ainsi nous testons $cle et $val
if($cle && $val) $ontologie[trim($cle)] = trim($val);
}
return $ontologie;
}
}
?>
Property changes:
Added: svn:executable
+*
\ No newline at end of property
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/commun/Aide.php
New file
0,0 → 1,223
<?php
 
/**
* Description :
* Classe Aide.php fournit des informations sur les services des projets : leur état (up ou down), une description,
* le lien vers le wikini
* La ressource /projets donne la liste de tous les projets concernés par cette api.
*
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package framework-v3
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-${year} Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
class Aide extends RestService {
 
protected $retour_format = 'max';
protected $url_wikini = 'http://www.tela-botanica.org/wikini/eflore/wakka.php?wiki=';
protected $url_liste_projet = '';
protected $table_retour = array();
protected $corps_http = '';
protected $entete_http = '';
protected $projet = '';
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->url_liste_projet = Config::get('url_service_base').'commun/aide/projets';
$this->projet = Config::get('nom_projet');
$this->traiterRessources($ressources);
return $this->formerReponseHTTP($this->table_retour);
}
//-----------------------------------------traiter reponse http-------------------------------------------------------------
public function formerReponseHTTP($resultat_formate, $mime = 'application/json', $encodage= 'utf-8') {
// Si aucune erreur n'a été établie (donc un tableau de résultat a bien ete renvoyé...)
if ($this->corps_http == '' && $this->entete_http == '') {
$this->entete_http = RestServeur::HTTP_CODE_OK;
$this->corps_http = $resultat_formate;
}
if ($this->entete_http != RestServeur::HTTP_CODE_OK) {
$mime = 'text/html';
}
// Gestion du type de contenu
if (!is_null($mime) && !is_null($encodage)) {
if(strpos($_SERVER['SCRIPT_NAME'], 'phpunit') === FALSE) header("Content-Type: $mime; charset=$encodage");
} else if (!is_null($mime) && is_null($encodage)) {
if(strpos($_SERVER['SCRIPT_NAME'], 'phpunit') === FALSE) header("Content-Type: $mime");
}
// Envoie de l'entête
RestServeur::envoyerEnteteStatutHttp($this->entete_http);
// Envoie du corps
return $this->corps_http;
}
public function renvoyerErreur($e, $c) {
$this->entete_http = $e;
$this->corps_http = $c;
}
//---------------------------------traiter Ressources------------------------------------------------------------------
 
public function traiterRessources($ressources) {
if (isset($ressources) && !empty($ressources)) {
//-----------------------service /aide/projets------------------------------------
if ($ressources[0] == 'projets') {
$this->afficherInfosTousProjets();
} else {
$r = 'Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles :
<br/><li> /aide </li><li> /aide/projets </li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $r);
}
} else {
//-----------------------service /aide------------------------------------
$this->afficherInfosProjet();
$this->formaterAideListeProjetEtRessources();
}
 
}
 
public function afficherInfosTousProjets() {
$req = 'show tables';
$tables = $this->getBdd()->recupererTous($req);
foreach ($tables as $table) {
if (preg_match('/^(.+)_meta$/', array_shift($table), $projet)) {
if (isset($projet[1])) {
$projets[] = $projet[1];
} else {
$e = "erreur.";
trigger_error($e, E_USER_ERROR);
}
}
}
foreach ($projets as $projet) {
$this->table_retour[$projet] = $this->recupererInfoProjet($projet);
}
}
 
public function recupererInfoProjet($projet) {
$res_return = null;
$projet = str_replace('_', '-', $projet);
$url = Config::get('url_service_base').$projet.'/aide';
$intitule = 'PROJET '.strtoupper($projet);
$res = $this->consulterHref($url);
if ($res) {
$res_return = $res->$intitule;
}
return $res_return;
}
public function formaterAideListeProjetEtRessources() {
$projets = 'LISTE DES PROJETS';
$services = 'Ressources';
$this->table_retour[$projets]['liste des projets en place']['href'] = $this->url_liste_projet;
$this->table_retour[$projets]['liste de tous les projets']['wikini'] = $this->url_wikini.'EfloreIntegrationProjets';
}
 
public function afficherInfosProjet() {
$res = array();
$ressources = $this->recupererListeDesRessources();
if (isset($ressources['href']) && $ressources['href'] != '') {
$this->table_retour['PROJET '.strtoupper($this->projet)]['projet.href'] = $ressources['href'];
}
$etats = $this->verifierEtatDesRessources($ressources['WS']);
$this->table_retour['PROJET '.strtoupper($this->projet)]['projet.services'] = $etats['projet.services'];
}
 
public function recupererListeDesRessources() {
$resultat = null;
$req = 'SELECT url_projet, version, web_services FROM '.Config::get('bdd_table_meta').' ORDER BY CAST(version as DECIMAL)';
$res = $this->getBdd()->recuperer($req);
if ($res == '') {
$r = 'La requête SQL formée comporte une erreur !!';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $r);
Debug::printr($req);
} elseif ($res) {
$resultat['WS'] = $res['web_services'];
$resultat['href'] = $res['url_projet'];
} else {
$d = 'Les données recherchées sont introuvables dans la version '.$res[0]['version'].'de la table de méta données';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $d);
Debug::printr($req);
}
return $resultat;
}
 
public function verifierEtatDesRessources($ressources) {
$ressources = explode(';', $ressources);
$etats = array();
foreach ($ressources as $key => $ressApi) {
list($ress, $api) = explode(':', $ressApi);
$this->translitererRess($ress);
$url = Config::get('url_service').'/'.$ress;
$wikini = $this->url_wikini.'EfloreApi'.str_replace('.', '', $api).$this->creerChaMot($ress);
$url_service = Config::get('url_service').'/'.$ress;
$etat = array(
'service.nom' => $ress,
'service.href' => $url_service,
'service.wikini' => $wikini,
'service.etat' => 'UP');
 
$res = $this->consulterHref($url);
if (!$res) {
$etat['service.etat'] = 'DOWN';
}
$etats['projet.services'][] = $etat;
}
return $etats;
}
/**Permet de consulter une url et retourne le résultat ou une erreur
* @param $url */
public function consulterHref($url) {
$res = $this->getRestClient()->consulter($url);
$entete = $this->getRestClient()->getReponseEntetes();
//Si le service meta-donnees fonctionne correctement, l'entete comprend la clé wrapper_data
if (isset($entete['wrapper_data'])) {
$res = json_decode($res);
return $res;
} else {
$u = 'L\'url <a href="'.$url.'">'.$url.'</a> lancée via RestClient renvoie une erreur';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $u);
}
}
public function translitererRess(&$ress) {
$ress = strtolower($ress);
if ($ress == 'metadonnees') {
$ress = 'meta-donnees';
}
}
public function creerChaMot($nom) {
$chaine = new Chaine();
$nom = $chaine->supprimerAccents($nom);
$nom_modif = '';
$nom_dec = preg_split('/-/', $nom);
foreach ($nom_dec as $dec) {
$nom_modif .= ucfirst($dec);
}
return trim($nom_modif);
}
}
 
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/commun/MetaDonnees.php
New file
0,0 → 1,522
<?php
/**
* Description :
* Classe MetaDonnees.php fournit des informations sur le projet.
* Le but étant de fournir un ensemble minimal d'information comprenant :
* la version, la langue, le nom, le créateur et l'éditeur du projet.
* Si l'url finit par /meta-donnees on retourne une liste de termes (seulement les 100 premières par défaut).
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /meta-donnees?param1=val1&param2=val2&...
*
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, , recherche,
* distinct, retour.format, navigation.depart et navigation.limite.
*
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package framework-v3
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-${year} Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
class MetaDonnees extends Commun {
 
protected $requete_champ = '*';
protected $requete_condition = null;
protected $retour_format = 'max';
protected $table_retour = array();
protected $format_reponse = 'metaDonnees';
protected $table_ressources;
static $cache_ontologies = array();
 
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->ressources = $ressources;
$this->parametres = $parametres;
$this->service = 'meta-donnees';
 
$resultats = '';
// on traite en premier la version dans le cas ou un langage est demandé pr une version
$this->traiterVersionProjet();
$this->traiterParametres($parametres);
$this->traiterRessources($ressources);
if ($this->corps_http == '' && $this->entete_http == '') {
$requete_meta = $this->assemblerLaRequete();
$resultat_meta = $this->getBdd()->recupererTous($requete_meta);
$resultats = $this->formerResultat($resultat_meta, $requete_meta);
}
return $resultats;
}
 
public function formerResultat($resultat_meta, $requete_meta) {
if ($resultat_meta == '') {
$e = 'La requête formée comporte une erreur!';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE,$e);
Debug::printr($requete);
} elseif ($resultat_meta) {
$resultat_formate = $this->retournerResultatFormate($resultat_meta);
} else {
$m = "Données introuvables dans la base $this->table";
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $m);
Debug::printr($requete_meta);
}
return $resultat_formate;
}
 
//--------------------FONCTIONS TRAITEMENT DES PARAMETRES---------------------------------------------------------------
 
public function traiterParametres($parametres) {
if (isset($parametres) && !empty($parametres)) {
foreach ($parametres as $param => $val) {
switch ($param) {
case 'version.projet' : $this->ajouterFiltreVersion($val); break;
case 'retour.langue' : $this->rechercherLangueDispo($val); break;
case 'retour.format' : $this->retour_format = $val; break;
default :
$e = 'Erreur dans les paramètres de recherche de votre requête : </br> Le paramètre " '
.$param.' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
break;
}
}
}
}
 
/** Détermine quelles métadonnées doivent etre retournées :
* - "*" : (/#projet/* /meta-donnees) Renvoi les meta-données de toutes les versions du projet
* - "numero de la version" : (/#projet/2.00/meta-donnees) Renvoi les meta-données de la version 2.00 du projet
* - non renseignée : (/#projet/meta-donnees) Renvoi les meta-données de la dernière version du projet
* Cette info est stockée dans par la classe RestServeur dans la variable $ressources ($ressources[0])
*/
public function ajouterFiltreVersion($val) {
if (preg_match('/(?:[0-9]+(?:_|[.])[0-9]+|[*]| )/', $val)) {
$this->version_projet = ($val == ' ') ? '+' : $val;
}
switch ($this->version_projet) {
case '+' :
$this->requete_condition[] = 'version = (SELECT MAX(version) FROM '.Config::get('bdd_table_meta').')';
break;
case '*' :
break;
default :
if (is_numeric($this->version_projet)) {
$versions_dispo = $this->rechercherVersionsDispos();
if (in_array($val, $versions_dispo)) {
$this->requete_condition[] = 'version = '.$this->getBdd()->proteger($val);
} else {
$e = 'La version demandée n\'existe pas actuellement. </br>Les versions disponibles sont : '
.implode(', ', $versions_dispo);
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
}
}
break;
}
}
 
/**
* Vérifie que le numéro de la version passée en paramètre correspond à une version existante.
* Si oui remplit la condition de la requete SQL
*/
public function rechercherVersionsDispos() {
$val = str_replace('_', '.', $this->version_projet);
$req_version = 'SELECT version FROM '.Config::get('bdd_table_meta');
$res_version = $this->getBdd()->recupererTous($req_version);
foreach ($res_version as $version) {
$versions_dispo[] = $version['version'];
}
return $versions_dispo;
}
 
/** Vérifie que les meta-donnees existe dans la langue passée en paramètre, Si oui remplit la condition de la requete SQL */
public function rechercherLangueDispo($val) {
//on recherche les langues_meta disponibles pour la version demandée : (d'ou ajout de la condition)
$req_langue = 'SELECT langue_meta FROM '
.Config::get('bdd_table_meta')
.$this->formerRequeteCondition();
$res_langue = $this->getBdd()->recupererTous($req_langue);
foreach ($res_langue as $langue) {
$langue_dispo[] = $langue['langue_meta'];
}
if (in_array($val, $langue_dispo)) {
$this->requete_condition[] = 'langue_meta = '.$this->getBdd()->proteger($val);
} else {
$e = 'La langue demandée n\'existe pas actuellement. </br>Les langues disponibles sont : '
.implode($langue_dispo);
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
}
}
//----------------------FONCTIONS TRAITEMENT DES RESSOURCES-------------------------------------------------------------
 
public function traiterRessources($ressources) {
// /meta-donnees (liste des meta-données. Toutes les info de la table sont affichées) ou /meta-donnees/#champ
if (isset($ressources) && !empty($ressources)) {
$this->table_ressources = $ressources;
if (isset($ressources) && !empty($ressources)) {
$this->format_reponse = 'metaDonnees/champ';
}
}
}
 
//------------------------------Fonction d'assemblage de la requete------------------------------------------------------
 
public function assemblerLaRequete() {
$req = 'SELECT '.$this->requete_champ.' FROM '.Config::get('bdd_table_meta').$this->formerRequeteCondition();
return $req;
}
 
public function formerRequeteCondition() {
$condition = '';
if ($this->requete_condition != null) {
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
}
return $condition;
}
 
//--------------------------------------Fonction de formatage des resultats ---------------------------------------------
 
public function retournerResultatFormate($resultat) {
switch ($this->format_reponse) {
case 'metaDonnees/champ' : $reponse = $this->formaterMetaDonneesChamp($resultat); break;
case 'metaDonnees' : $reponse = $this->formaterMetaDonnees($resultat); break;
default : break;
}
return $reponse;
}
 
//--------------------------------------Fonction de formatage des resultats de /metaDonnees/----------------------------
 
public function formaterMetaDonnees($resultat) {
foreach ($resultat as $version) {
foreach ($version as $key => $val) {
if ($val != '') {
$this->afficherDonnees($key, $val);
}
}
if ($this->retour_format == 'max' && $this->version_projet == '*') {
$this->table_retour['href'] = Config::get('url_service_base').Config::get('nom_projet')
.'/'.$version['version'].'/'.$this->serviceNom;
}
$table[] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
return $table;
}
 
 
public function afficherDonnees($key, $valeur) {
if ($valeur != '') {
$tab = array();
if ($this->retour_format == 'min') {
if (in_array($key, array('editeur','createurs', 'contributeurs','couverture_spatiale','couverture_temporelle'))) {
//Pour les données comprenant plusieurs infos (...=...,...=...;...)
$tab = $this->recupererTableauResultat($valeur);
$this->afficherConcatenationValeur($key, $tab);
} else {
$this->table_retour[$key] = trim($valeur);
}
} else {
if (in_array($key, array('editeur','createurs', 'contributeurs','couverture_spatiale','couverture_temporelle','langue','langue_meta'))) {
$tab = $this->recupererTableauResultat($valeur);
$this->afficherConcatenationValeur($key, $tab);
$this->afficherDonneesMax($key,$valeur,$tab);
} else {
$this->table_retour[$key] = trim($valeur);
}
}
}
}
 
/**
* Recupère à partir de la valeur du champ les différentes informations séparées par ';' (stocke ds un tableau)
* pour éditeurs, créateurs, contributeurs,...
* (ex : nom=Tela Botanica,guid=urn:lsid:tela-botanica.org,courriel=accueil@tela-botanica.org,...
*/
public function recupererTableauResultat($val) {
$tab = array();
$num_entite = 0;
// découpe chaque participant
$tab_entites = explode(';', $val);
foreach ($tab_entites as $entite) {
$tab[$num_entite] = array();
if ($entite != '') { // découpe les informations du participant
$entite_detail = explode(',', $entite);
foreach ($entite_detail as $detail) {
if ($detail != '') {
if (preg_match('/^([^=]+)=([^=]*)$/', $detail, $match)) {
$tab[$num_entite][$match[1]] = $match[2];
} else {
$tab[$num_entite][] = $detail;
}
}
}
}
$num_entite++;
}
return $tab;
}
 
 
/** Retourne :
* - le nom de l'editeur
* - les coordonnées de l'éditeur sous la forme [latitude]N,[longitude]S [datum]
* - la couverture temporelle sous la forme xxxx à xxxx
* - la concaténation des noms pour les contributeurs et les créateurs (machin chouette, truc bidule...)
* - la liste des liste des couvertures spatiales (le nom et pas le code) (France, allemagne..) */
public function afficherConcatenationValeur($champ, $tab) {
if (strrpos($champ, '.coordonnees') !== false) {
if (isset($tab[0]['latitude']) && isset($tab[0]['longitude']) && isset($tab[0]['datum'])) {
$this->table_retour[$champ] = $tab[0]['latitude'].' N, '.$tab[0]['longitude'].' S ['.$tab[0]['datum'].']';
}
} else {
$concat = '';
foreach ($tab as $entite) {
foreach ($entite as $key => $val) {
if ($champ == 'couverture_spatiale') {
$concat .= ', '.$this->ajouterSignification($champ, $val);
} else {
if (strrpos($key, '.prenom') !== false) {
$concat .= ', '.$val;
} elseif (strrpos($key, 'nom') !== false) {
 
$concat .= ' '.$val;
break;
}
}
}
}
$res = trim($concat, ',');
$res = trim($res);
if ($champ == 'couverture_temporelle') $res = str_replace(' ', ' à ',$res);
$this->table_retour[$champ] = $res;
}
}
 
 
public function afficherDonneesMax($champ,$valeur,$tab) {
switch ($champ) {
case 'couverture_temporelle' : $this->afficherInfosPrecises($champ, 'start,end', $valeur, $tab); break;
case 'langue' : $this->afficherInfosPrecises($champ,'signification,code,href', $valeur); break;
case 'langue_meta' : $this->afficherInfosPrecises($champ,'signification,code,href', $valeur); break;
case 'couverture_spatiale' : $this->afficherInfosPrecises($champ, 'details', $valeur, $tab); break;
case 'createurs' : $this->afficherInfosPrecises($champ, 'details', $valeur, $tab); break;
case 'contributeurs' : $this->afficherInfosPrecises($champ, 'details', $valeur, $tab); break;
case 'editeur' : $this->afficherEditeur($champ, $tab); break;
default : $this->table_retour[$champ] = $valeur; break;
}
}
 
 
public function afficherEditeur($key, $tab) {
// infos générales sur l'éditeur
foreach ($tab[0] as $k => $val) {
if ((strrpos($k, 'contact.') === false) && (strrpos($k, '.wgs84') === false)) {
$this->table_retour[$key.'.'.$k] = $val;
}
}
//on récupère dans un premier temps les tableaux des coordonnées.
$table_coordonnees = $this->recupererTableCoordonnees($tab);
//on affiche les informations sur les coordonnees : concaténation + détails
if ($table_coordonnees[0] != array()) {
$this->afficherConcatenationValeur($key.'.coordonnees', $table_coordonnees);
if (isset($table_coordonnees[0]['datum'])) {
$this->afficherInfosPrecises($key.'.coordonnees.datum',
'signification,code,href',$table_coordonnees[0]['datum'],
$table_coordonnees);
}
}
$table_contact = $this->recupererTableContact($tab);
//on affiche le premier contact en dehors de la table de détail:
if ($table_contact[0] != array()) {
$this->table_retour[$key.'.contact'] = '';
foreach ($table_contact as $info => $valeur) {
$this->table_retour[$key.'.contact'] .= $valeur['contact.prenom']." ".$valeur['contact.nom'];
}
//on affiche les détails des autres contacts :
$this->afficherTableDetails($key.'.contact', $table_contact);
}
}
 
 
 
public function afficherInfosPrecises($champ, $pts, $val, $tab = null) {
//permet d'afficher les informations précises telles que les .details, .start, .end...
$pts = explode(',', $pts);
foreach ($pts as $pt) {
switch ($pt) {
case 'start' :
if (isset($this->table_retour[$champ.'.start'])) {
$this->table_retour[$champ.'.start'] = $tab['start'];
}
break;
case 'end' :
if (isset($this->table_retour[$champ.'.end'])) {
$this->table_retour[$champ.'.end'] = $tab['end'];
}
break;
case 'code' :
$this->table_retour[$champ.'.code'] = $val;
break;
case 'href' :
$this->table_retour[$champ.'.href'] = $this->ajouterHrefAutreProjet($champ, '', $val);
break;
case 'signification' :
$this->table_retour[$champ] = $this->ajouterSignification($champ, $val);
break;
case 'details' :
if ($champ == 'couverture_spatiale') {
$this->afficherCouvertureSpatiale($champ, $tab);
} else {
$this->afficherTableDetails($champ, $tab);
}
break;
default :
$this->table_retour[$champ.'.'.$pt] = $tab[$pt];
}
}
}
 
 
 
public function afficherCouvertureSpatiale($key, $tab) {
$res = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
foreach ($tab as $iso) {
foreach ($iso as $val) {
$this->afficherInfosPrecises($key, 'signification,code,href',$val);
$res[$key.'.detail'][] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
}
$this->table_retour = $res;
}
 
public function afficherTableDetails($champ, $tab) {
$res = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
foreach ($tab as $num_entite => $entite) { // $t et $type valent p ou o
$t = '';
$type = '.';
foreach ($entite as $key => $infos) {
list($type, $info) = explode('.', trim($key));
if ($type == 'contact') $type = 'p';
if ($type != $t) { // cherche et ajoute la signification du type
$this->afficherInfosPrecises('type', 'signification,code,href', trim($type));
foreach ($this->table_retour as $k => $val) {
$res[$champ.'.details'][$num_entite][$type.'.'.$k] = $val;
}
$table_retour = array();
$this->table_retour = array(); // rempli par afficherInfosPrecises
$t = $type;
}
$res[$champ.'.details'][$num_entite][$key] = $infos;
}
}
$this->table_retour = $res;
}
 
public function ajouterSignification($champ, $val, $nom = 'nom') {
$url = $this->ajouterHrefAutreProjet($champ, '', $val);
if (in_array($champ, array('langue', 'langue_meta', 'couverture_spatiale'))) {
$url .= '/'.$nom;
}
if(array_key_exists($url, self::$cache_ontologies)) {
return self::$cache_ontologies[$url];
}
$signification = $this->consulterHref($url);
if (isset($signification->$nom)) {
$res = $signification->$nom;
} else {
$nom = 'nom.fr';
$res = $signification->$nom;
}
self::$cache_ontologies[$url] = $res;
return $res ;
}
 
 
public function recupererTableContact(&$tab) {
$res = array();
foreach ($tab[0] as $key => $val) {
if (strrpos($key, 'contact.') !== false) {
while (array_key_exists($key, $res)) { $key = ' '.$key; }
$res[$key] = $val;
unset($tab[0][$key]); //suppression des premiers contacts qui seront affichés après
}
}
$resultat[0] = $res;
return $resultat;
}
 
 
public function recupererTableCoordonnees(&$tab) {
$res = array();
foreach ($tab[0] as $key => $val) {
if (strrpos($key, 'latitude') !== false || strrpos($key, 'longitude') !== false) {
list ($coord, $datum) = explode('.', $key);
$res[$coord] = $val;
$res['datum'] = $datum;
}
}
$resultat[0] = $res;
return $resultat;
}
 
//-------------------------------------Fonction de formatage des resultats de /metaDonnees/#champs+champs----------------
 
public function formaterMetaDonneesChamp($resultat) {
$this->recupererNomChamp(Config::get('bdd_table_meta'));
//On récupère dans un premier temps toutes les données existantes puis on pioche les champs recherchés
$table_Meta = $this->formaterMetaDonnees($resultat);
foreach ($table_Meta as $version) {
//on affiche les informations par defaut : la version, la langue_meta et le guid :
$this->afficherVersionLangueMetaGuid($version);
$tab_ress = explode(' ', $this->table_ressources[0]);
foreach ($tab_ress as $champ) {//on recupere le radical pour comparaison avec les nom des champs de la bdd :
$this->afficherChampRecherche($champ, $version);
}
$table[] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
return $table;
}
 
public function afficherChampRecherche(&$champ, &$version) {
preg_match('/^([^.]+)(?:[.][^.]+)?$/', $champ, $match);
if (preg_match('/(.+)[.][*]$/', $champ, $match_2)) {
$this->afficherPointEtoile($match_2, $version, $champ);
} elseif (array_key_exists($champ, $version)) {
$this->table_retour[$champ] = $version[$champ];
} elseif (in_array($match[1], $this->champs_table)) {
//si le champ est vide dans cette version on retourne null (comparaison avec les champs existants)
$this->table_retour[$champ] = null;
} else {
$champs = implode('</li><li>', array_keys($version));
$e = 'Erreur dans votre requête : </br> Le champ "'.$champ.'" n\'existe pas'.
'. Les champs disponibles sont : <li>'.$champs.'</li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
 
public function afficherPointEtoile($match, $version, $ressource) {
$existe = false;
foreach ($version as $key => $valeur) {
if (strrpos($key, $match[1].'.') !== false) {
$this->table_retour[$key] = $valeur;
$existe = true;
}
}
if (!$existe) {
$champs = implode('</li><li>', array_keys($version));
$e = 'Erreur dans votre requête : </br> Le champ " '.$ressource.' " n\'existe pas dans la version '
.$version['version'].'. Les champs disponibles sont : <li>'.$champs.'</li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
 
public function afficherVersionLangueMetaGuid(&$version) {
$this->table_retour['version'] = $version['version'];
$this->table_retour['langue_meta'] = $version['langue_meta'];
$this->table_retour['guid'] = $version['guid'];
}
}
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/commun/Ontologies.php
New file
0,0 → 1,440
<?php
/**
* Description :
* Classe Ontologies.php fournit des informations sur ensemble structuré des termes et concepts représentant les éléments
* d'un domaine de connaissances .
* Le but étant de fournir un ensemble minimal d'information comprenant :
* un identifiant (numérique ou alphanumérique sous forme de ChatMot si possible), un nom, une description et
* éventuellement une relation hiérarchique avec un autre terme (=classe).
* Si l'url finit par /ontologies on retourne une liste de termes (seulement les 100 premières par défaut).
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /ontologies?param1=val1&param2=val2&...
*
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, masque.code, masque.nom, masque.description , recherche,
* distinct, retour.format, navigation.depart et navigation.limite.
*
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package eflore-projets
* @author Jennifer DHÉ <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @author Delphine CAUQUIL <delphine@tela-botanica.org>
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 0.1
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
class Ontologies extends Commun {
 
protected $requete_condition = null; //Représente la partie de la requete SQL ajoutant une condition (WHERE ...)
/** Permet de stocker la requete formulée: /ontologies | /ontologies/#id | /ontologies/#id/champ | /ontologies/#id/relations */
protected $format_reponse = 'ontologies';
/** Permet de stocker les limite de la requete SQL (par défaut seul les 100 premiers résultats seront retournés).
* Stocke également les valeurs des paramètres navigation.depart et navigation.limite passés dans la requete*/
protected $limite_requete = array( 'depart' => 0, 'limite' => 100);
/** Stocke le nombre total de résultats de la requete principale. Est calculée lors de l'assemblage de la requete */
protected $total_resultat;
protected $retour_format = 'max';
 
// beaucoup plus flexible dans le cas de requêtes SQL complexes
protected $mesChamps = '';
protected $mesJoinsEtConditions = '';
 
public function traiterParametres() {
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres)) {
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) {
switch ($param) {
case 'masque' : $this->ajouterLeFiltreMasque('masque', $valeur); break;
case 'masque.code' : $this->ajouterLeFiltreMasque('code', $valeur); break;
case 'masque.nom' : $this->ajouterLeFiltreMasque('nom', $valeur); break;
case 'masque.description' : $this->ajouterLeFiltreMasque('description', $valeur); break;
case 'retour.format' : $this->retour_format = $valeur; break;
case 'retour.champs' : $this->parametres['retour_champs'] = $valeur; break;
case 'navigation.depart' : $this->limite_requete['depart'] = $valeur; break;
case 'navigation.limite' : $this->limite_requete['limite'] = $valeur; break;
case 'recherche' : break;
case 'version.projet' : break;
default :
$e = 'Erreur dans les parametres de recherche de votre requête : </br> Le paramètre " '
.$param.' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e); break;
}
}
}
}
 
public function ajouterLeFiltreMasque($nom_champ, $valeur) {
if ($nom_champ == 'code') {
$this->requete_condition[] = $nom_champ.' = '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
} else {
if (isset($this->parametres['recherche']) && $this->parametres['recherche'] == 'floue') {
if ($nom_champ == 'masque') {
$this->requete_condition[] = '( code = '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR ( SOUNDEX(nom) = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE(nom)) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\')) '
.') OR ( SOUNDEX(description) = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE(description)) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\')) ))';
} else {
$this->requete_condition[] = '(SOUNDEX('.$nom_champ.') = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE('.$nom_champ.')) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\')))';
}
} else {
if (isset($this->parametres['recherche']) && $this->parametres['recherche'] == 'etendue') {
$valeur = str_replace(' ','%', $valeur);
$valeur .= '%';
}
if ($nom_champ == 'masque') {
$this->requete_condition[] = '(code = '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR nom LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR description LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur).')';
} else {
$this->requete_condition[] = $nom_champ.' LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
}
}
}
}
 
 
public function traiterRessources() {
if (isset($this->ressources) && !empty($this->ressources)) {
if (isset($this->ressources[0]) && !empty($this->ressources[0])) {
//requete = /ontologies/#id
$this->traiterRessourceId();
if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {
//requete = /ontologies/#id/relations
$this->traiterRessourceRelations();
}
}
}
}
 
 
public function traiterRessourceId() {
$this->requete_condition = array();
//requete : /ontologies/#id (ex : /ontologies/7)
if (is_numeric($this->ressources[0])) {
$this->requete_condition[] = ' id = '.$this->getBdd()->proteger($this->ressources[0]);
$this->format_reponse .= '/id';
//requete : /ontologies/#classe:#code (ex : /ontologies/rangTaxo:290)
} elseif (strrpos($this->ressources[0], ':') !== false) {
// plusieurs couples #classe:#code séparés par des virgules
if(strrpos($this->ressources[0], ',') !== false) {
$this->traiterMultipleRessourceId();
return;
}
 
// ou un unique couple #classe:#code
$this->format_reponse .= '/id';
preg_match('/^([^:]+):([^:]+)$/', $this->ressources[0], $match);
$this->requete_condition[] =
' id IN (SELECT id FROM '.$this->table.' WHERE code = '.$this->getBdd()->proteger($match[2])
.' AND classe_id = (SELECT id FROM '.$this->table.' WHERE code = '.$this->getBdd()->proteger($match[1]).'))';
// TODO: optimiser, à voir: traiterMultipleRessourceId() ci-dessous
// SELECT a.*
// FROM $this->table a
// LEFT JOIN $this->table b ON a.id = b.id LEFT JOIN $this->table c ON b.classe_id = c.id
// WHERE b.code = $this->getBdd()->proteger($match[2])
// AND c.code = $this->getBdd()->proteger($match[1]);
} else {
$e = 'Erreur dans les paramètres de recherche de votre requête : </br> Le paramètre " '
.$this->ressources[0].' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
 
// Requète : /ontologies/#classe:#code,[...] (ex : /ontologies/numStatus:2,numStatus:3,genreNombre:10)
public function traiterMultipleRessourceId() {
$this->format_reponse .= '/ids'; // noter le "s"
$this->mesChamps = Array(
// 'a.*' // pourquoi pas, mais alors des unset() seront nécessaire
'a.id',
'a.classe_id AS `classe.id`',
'a.nom',
'a.description',
'a.code',
'a.complements',
'c.nom AS classe', // évite très simplement (un très couteux) ajouterClasseCorrespondante()
'concat(c.code,":", b.code) AS requete'); // permet aux appelants de récupérer la valeur qu'ils recherchent
$this->mesChamps = implode(', ', $this->mesChamps);
 
$this->mesJoinsEtConditions =
// alias de la table première
" a "
. " LEFT JOIN {$this->table} b ON a.id = b.id LEFT JOIN {$this->table} c ON b.classe_id = c.id"
. " WHERE ";
 
$or_stack = false;
$tab = explode(',', $this->ressources[0]);
foreach($tab as $couple) {
preg_match('/^([^:]+):([^:]+)$/', $couple, $match);
if($or_stack) {
// une fois qu'un set de condition et présent,
// les autres sont `OR`-ed.
$this->mesJoinsEtConditions .= " OR ";
}
$this->mesJoinsEtConditions .=
sprintf("(b.code = %s AND c.code = %s)",
$this->getBdd()->proteger($match[2]),
$this->getBdd()->proteger($match[1]));
$or_stack = true;
}
}
 
public function traiterRessourceRelations() {
//requete = /ontologies/#id/relations :
if ($this->ressources[1] == 'relations') {
$this->format_reponse .= '/relations';
$this->requete_condition = array('classe_id = (SELECT classe_id FROM '.$this->table.' WHERE '
.implode(' AND ', $this->requete_condition).')');
}
}
 
//+--------------------------FONCTION ASSEMBLAGE DE LA REQUETE-------------------------------------------+
 
public function assemblerLaRequete() {
$requete = ' SELECT '.$this->formerRequeteChamp().
' FROM '.$this->table
.$this->retournerRequeteCondition()
.$this->formerRequeteLimite(); //print_r($requete);
return $requete;
}
 
public function formerRequeteChamp() {
if($this->mesChamps) return $this->mesChamps;
 
$champ[] = 'id';
if ($this->format_reponse == 'ontologies') {
$champ[] = 'nom, code ';
}
if (isset($this->parametres['retour_champs']) || $this->format_reponse == 'ontologies/id/champs') {
$champs_recherches = explode(',', $this->parametres['retour_champs']);
$champs_possibles = $this->rechercherChampsPossibles();
foreach ($champs_recherches as $champ_recherche) {
if ($this->verifierValiditeChamp($champ_recherche, $champs_possibles)) {
$champ[] = (preg_match('/classe/', $champ_recherche)) ? 'classe_id' : $champ_recherche;
}
}
}
if (count($champ) == 1) {
$champ = array(' * ');
}
return implode(', ', $champ);
}
 
public function rechercherChampsPossibles() {
$this->recupererNomChamp($this->table);
$champs_possibles = $this->champs_table;
$champs_possibles[] = 'classe.id';
$champs_possibles[] = 'classe';
$champs_possibles[] = 'classe.href';
return $champs_possibles;
}
 
public function verifierValiditeChamp($champ, $champs_possibles) {
$validite = false;
preg_match('/^([^.]+)(:?\.([^.]+))?$/', $champ, $match);
if (in_array($match[1], $champs_possibles)) {
$validite = true;
} else {
$champs = implode('</li><li>', $champs_possibles);
$e = 'Erreur dans votre requête : </br> Le champ "'.$champ
.'" n\'existe pas. Les champs disponibles sont : <li>'.$champs.'</li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
return $validite;
}
 
public function retournerRequeteCondition() {
if($this->mesJoinsEtConditions) return $this->mesJoinsEtConditions;
 
$condition = '';
if ($this->requete_condition !== null) {
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
}
return $condition;
}
 
public function formerRequeteLimite() {
$this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat();
if (in_array($this->format_reponse , array('textes/id', 'textes/id/relations'))) {
$this->requete_limite = '';
} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat)) {
$this->limite_requete['depart'] =
(($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']);
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
} else {
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
}
return $this->requete_limite;
}
 
 
public function recupererTotalResultat() {
//on récupère le nombre total de résultats de la requete (ex : le nombre d'id contenu dans la liste /ontologies)
$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '
.$this->table
.$this->retournerRequeteCondition();
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($res) {
$total = $res['nombre'];
} else {
$e = 'Données introuvables dans la base';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
Debug::printr($requete);
}
return $total;
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
public function retournerResultatFormate($resultat) {
// determine en fct du service appelé (/ontologies | /ontologies/#id | /ontologies/#id/champ |
// /ontologies/#id/relations) le format du tableau à retourner. Encode en json
switch ($this->format_reponse) {
case 'ontologies' : $reponse = $this->formaterOntologies($resultat); break;
case 'ontologies/id' : $reponse = $this->formaterOntologiesId($resultat[0]); break;
case 'ontologies/ids' : $reponse = $this->formaterMultipleOntologiesId($resultat); break;
case 'ontologies/id/relations' : $reponse = $this->formaterOntologiesIdRelations($resultat); break;
default : break;
}
return $reponse;
}
 
 
public function formaterOntologies($resultat) {
$this->ajouterEnteteResultat($resultat);
$table_retour_json['entete'] = $this->ajouterEnteteResultat($resultat);
if (isset($this->parametres['masque_code']) || isset($this->parametres['masque'])) {
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres['masque_code'], $resultat, 'code');
} elseif (isset($this->parametres['masque_nom'])) {
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres['masque_nom'], $resultat, 'nom');
} elseif (isset($this->parametres['masque_description'])) {
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres['masque_description'], $resultat, 'description');
}
//on remplit la table $table_retour_json['resultat']
foreach ($resultat as $tab) {
$num = $tab['id'];
unset($tab['id']);
foreach ($tab as $param => $valeur) {
$resultat_json[$num][$param] = $valeur;
}
if ($this->retour_format == 'max') $resultat_json[$num]['href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $num);
}
$table_retour_json['resultat'] = $resultat_json;
return $table_retour_json;
}
 
public function ajouterEnteteResultat($resultat) {
//on remplit la table $table_retour_json['entete']
$entete['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$entete['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$entete['total'] = $this->total_resultat;
//formuler les urls
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/ontologies');
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') { $entete['href.precedent'] = $url['precedent']; }
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') { $entete['href.suivant'] = $url['suivant']; }
return $entete;
}
 
public function __anonyme1($val) { return $val != ''; }
 
public function formaterOntologiesId($resultat) {
$table_retour = array_filter($resultat, array($this, '__anonyme1'));
$this->calculerClassID($table_retour);
return $table_retour;
}
 
public function formaterMultipleOntologiesId($resultats) {
$result = Array();
foreach($resultats as $k => $resultat) {
$id = $resultat['requete'];
$result[$id] = array_filter($resultat, array($this, '__anonyme1'));
unset($result[$id]['requete']);
$this->calculerClassID($result[$id]);
}
return $result;
}
 
public function calculerClassID(&$resultat) {
// commenté: pourquoi restreindre le choix des champs au format "max",
// ça ne semble pas logique...
// if ($this->retour_format != 'max') return;
 
// question: pourquoi ne pas passer les infos relatives aux ontologies 0 ?
// et que signifie ce commentaire: "pas de parent"
if (@$resultat['classe_id'] == '0') return;
 
$valeur = isset($resultat['classe_id']) ? $resultat['classe_id'] : $resultat['classe.id'];
if(! isset($resultat['classe.id'])) {
$resultat['classe.id'] = $resultat['classe_id'];
unset($resultat['classe_id']);
}
 
// max-format et pas de champs spécifiques demandés ?
// Alors on rempli "classe" et "classe.href"
// Mais ne pas recalculer (surtout la classe) si ce n'est pas nécessaire
// (c'est le cas si l'on a demandé plusieurs critère [provenons de formaterMultipleOntologiesId()])
if (! isset($this->parametres['retour_champs'])) {
if(! isset($resultat['classe'])) {
$nom_classe = $this->ajouterClasseCorrespondante($valeur);
if (isset($nom_classe)) $resultat['classe'] = $nom_classe;
}
if(! isset($resultat['classe.href'])) {
$resultat['classe.href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $valeur);
}
return;
}
 
// cas où des champs sont demandés
$champs = explode(',', $this->parametres['retour_champs']);
if(in_array('classe', $champs) && ! isset($resultat['classe'])) {
$this->ajouterClasseCorrespondante($valeur);
}
 
if(in_array('classe.id', $champs) && ! isset($resultat['classe.id'])) {
$resultat['classe.id'] = $valeur;
}
 
if(in_array('classe.href', $champs) && ! isset($resultat['classe.href'])) {
$resultat['classe.href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $valeur);
}
 
if(in_array('classe.*', $champs) && (! isset($resultat['classe.href']) || ! isset($resultat['classe.id']))) {
$resultat['classe.id'] = $valeur;
$resultat['classe.href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $valeur);
}
}
 
/** Recherche par interrogation de la base, le nom de la classe à partir de son identifiant (classe.id) */
public function ajouterClasseCorrespondante($classe_id) {
$nom = null;
if ($classe_id != 0) {
$nom = '';
$req = 'SELECT nom FROM '.$this->table.' WHERE id = '.$this->getBdd()->proteger($classe_id);
$res = $this->getBdd()->recuperer($req);
if ($res) {
$nom = $res['nom'];
} else {
$e = "Données introuvables dans la table $this->table";
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
Debug::printr($req);
}
}
return $nom;
}
 
public function formaterOntologiesIdRelations($resultat) {
$retour = null;
if ($resultat != '') {
$retour['entete'] = $this->ajouterEnteteResultat($resultat);
//on remplit la table $table_retour_json['resultat']
foreach ($resultat as $tab) {
$num = $tab['id'];
$retour['resultat'][$num]['nom'] = $tab['nom'];
if ($this->retour_format == 'max') {
$retour['resultat'][$num]['href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $num);
}
}
}
return $retour;
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/osm/NomCommune.php
New file
0,0 → 1,145
<?php
// declare(encoding='UTF-8');
/**
* Classe permettant d'obtenir le nom et le code INSEE d'une commune à partir de ces coordonnées (latitude et longitude).
* La latitude et longitude doivent être exprimée par un nombre décimal.
* Ce service fonctionne uniquement pour les communes de France métropolitaine (Corse comprise) dont les contours ont été tracés dans OpenStreetMap.
* Source des données : OpenStreetMap http://wiki.openstreetmap.org
* Projet France limites administratives : http://wiki.openstreetmap.org/wiki/WikiProject_France/Limites_administratives
* Paramètres du service :
* - lat : latitude
* - lon : longitude
* Exemple :
* http://localhost/service-test:eflore:0.1/osm/nom-commune?lon=3.83619&lat=44.74231
*
* @category php 5.2
* @package carto-osm
* @author Mohcen BENMOUNAH <mohcen@tela-botanica.org>
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @copyright Copyright (c) 2010, Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
* @license http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
* @license http://www.gnu.org/licenses/gpl.html Licence GNU-GPL
* @version $Id$
*/
class NomCommune {
 
const PATTERN_LAT = '/^[0-9]+(?:[.][0-9]+|)$/';
const PATTERN_LON = '/^[-]?[0-9]+(?:[.][0-9]+|)$/';
const LAT_MAX = 51.071667;
const LAT_MIN = 41.316667;
const LON_MAX = 9.513333;
const LON_MIN = -5.140278;
const MIME_JSON = 'application/json';
 
private $parametres = array();
private $bdd = null;
 
private $lat = null;
private $lon = null;
 
public function __construct(Bdd $bdd) {
$this->bdd = $bdd;
}
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->parametres = $parametres;
$this->verifierParametres();
$this->lat = $this->parametres['lat'];
$this->lon = $this->parametres['lon'];
 
$communesProches = $this->trouverCommunesProches();
$communeTrouveeInfos = $this->localiserPointLatLon($communesProches);
$corps = $this->formaterResultats($communeTrouveeInfos);
 
$resultat = new ResultatService();
$resultat->mime = self::MIME_JSON;
$resultat->corps = $corps;
return $resultat;
}
 
private function verifierParametres() {
extract($this->parametres);
$messages = array();
if (! array_key_exists('lat', $this->parametres)) {
$messages[] = "Vous devez indiquer une latitude en degré décimal à l'aide du paramètres d'url : lat";
} else if (!preg_match(self::PATTERN_LAT, $lat)) {
$messages[] = "La valeur de latitude doit être un nombre décimal positif dont le séparateur décimal est un point. Ex. : 44 ou 43.03";
} else if ($lat > self::LAT_MAX) {
$messages[] = "La valeur de latitude indiquée est supérieure à {".self::LAT_MAX."} qui est le point le plus au Nord de la France métropolitaine.";
} else if ($lat < self::LAT_MIN) {
$messages[] = "La valeur de latitude indiquée est infèrieure à {".self::LAT_MIN."} qui est le point le plus au Sud de la France métropolitaine.";
}
if (! array_key_exists('lon', $this->parametres)) {
$messages[] = "Vous devez indiquer une longitude en degré décimal à l'aide du paramètres d'url : lon";
} else if (!preg_match(self::PATTERN_LON, $lon)) {
$messages[] = "La valeur de longitude doit être un nombre décimal dont le séparateur décimal est un point. Ex. : -4.03 ou 3.256";
} else if ($lon > self::LON_MAX) {
$messages[] = "La valeur de longitude indiquée est supérieure à {".self::LON_MAX."} qui est le point le plus à l'Est de la France métropolitaine.";
} else if ($lon < self::LON_MIN) {
$messages[] = "La valeur de longitude indiquée est infèrieure à {".self::LON_MIN."} qui est le point le plus à l'Ouest de la France métropolitaine.";
}
if (count($messages) != 0) {
$message = implode('<br />', $messages);
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE;
throw new Exception($message, $code);
}
}
 
/**
* requête qui récupère les 20 communes les plus proches du point recherché
* La distance(AB = \sqrt{(x_B-x_A)^2 + (y_B-y_A)^2}) est calculée sans la racine
* (calcul en plus qui change pas le résultat). La distance n'est donc pas juste mais permet de récupérer
* le bon ordre.
*/
private function trouverCommunesProches() {
$requete = 'SELECT id_osm, '.
"(({$this->lon} - X(centre)) * ({$this->lon} -X(centre)) + ({$this->lat} - Y(centre)) * ({$this->lat} - Y(centre))) AS distance ".
'FROM osm_communes '.
'ORDER BY distance ASC '.
'LIMIT 20 '.
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$resultat = $this->bdd->recupererTous($requete);
 
if ($resultat == false) {
$msgTpl = "Service '%s' : aucune commune dont le centroïde correspond aux coordonnées : %s, %s.";
$msg = sprintf($msgTpl, get_class($this), $this->lat, $this->lon);
throw new Exception($msg, RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE);
}
return $resultat;
}
 
private function formaterResultats($communeTrouveeInfos) {
return array(
'nom' => $communeTrouveeInfos['nom'],
'codeINSEE' => $communeTrouveeInfos['code_insee'],
'wikipedia' => $this->formaterUrlWikipedia($communeTrouveeInfos['wikipedia'])
);
}
 
private function localiserPointLatLon($communesProches) {
$zonesIds = array();
foreach ($communesProches as $commune) {
$zonesIds[] = $commune['id_osm'];
}
$idsOsmClauseIn = implode(',', $this->bdd->proteger($zonesIds));
$requete = "SELECT id_osm, code_insee, nom, wikipedia ".
'FROM osm_communes '.
"WHERE st_within(GEOMFROMTEXT('POINT($this->lon $this->lat)'), polygone) = 1 ".
"AND id_osm IN ($idsOsmClauseIn) ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$resultat = $this->bdd->recuperer($requete);
if ($resultat === false) {
$msgTpl = "Service '%s' : aucune commune correspondant aux coordonnées : %s, %s.";
$msg = sprintf($msgTpl, get_class($this), $this->lat, $this->lon);
throw new Exception($msg, RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE);
}
return $resultat;
}
 
private function formaterUrlWikipedia($infoWikipedia) {
list($lang, $page) = explode(':', $infoWikipedia);
$pageEncode = rawurlencode($page);
$urlTpl = 'https://%s.wikipedia.org/wiki/%s';
return sprintf($urlTpl, $lang, $pageEncode);
}
}
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/osm/ZoneAdmin.php
New file
0,0 → 1,237
<?php
// declare(encoding='UTF-8');
/**
* Classe permettant d'obtenir le nom et les codes d'une zone administrative à partir de ces coordonnées (latitude et longitude).
* La latitude et longitude doivent être exprimée par un nombre décimal.
* Ce service fonctionne uniquement pour les zones administratives dont les contours ont été tracés dans OpenStreetMap.
* Source des données : OpenStreetMap <http://wiki.openstreetmap.org>
* Tag:boundary=administrative : <http://wiki.openstreetmap.org/wiki/Tag:boundary%3Dadministrative>
* Paramètres du service :
* - lat : latitude
* - lon : longitude
* Exemple :
* http://localhost/service-test:eflore:0.1/osm/nom-commune?lon=3.83619&lat=44.74231
*
* @category php 5.2
* @package eFlore
* @subpackage Services
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @author Mohcen BENMOUNAH <mohcen@tela-botanica.org>
* @copyright Copyright (c) 2010, Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt>
* @license GNU-GPL <http://www.gnu.org/licenses/gpl.html>
*/
class ZoneADmin {
 
const PATTERN_LAT = '/^[-]?[0-9]+(?:[.][0-9]+|)$/';
const PATTERN_LON = '/^[-]?[0-9]+(?:[.][0-9]+|)$/';
const MIME_JSON = 'application/json';
 
private $parametres = array();
private $bdd = null;
 
private $lat = null;
private $lon = null;
private $zone = null;
private $niveaux = null;
private $pays = null;
private $masque = null;
private $limite = 1;
 
public function __construct(Bdd $bdd) {
$this->bdd = $bdd;
}
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->parametres = $parametres;
$this->verifierParametres();
$this->masque = isset($this->parametres['masque']) ? $this->parametres['masque'] : null;
$this->limite = isset($this->parametres['limite']) ? intval($this->parametres['limite']) : $this->limite;
$this->lat = isset($this->parametres['lat']) ? $this->parametres['lat'] : null;
$this->lon = isset($this->parametres['lon']) ? $this->parametres['lon'] : null;
$this->zone = isset($this->parametres['zone']) ? $this->parametres['zone'] : null;
$this->niveaux = isset($this->parametres['niveau']) ? explode(',', $this->parametres['niveau']) : null;
$this->pays = isset($this->parametres['pays']) ? $this->parametres['pays'] : null;
if($this->masque != null) {
$corps = $this->rechercherZoneGeoParNom($this->masque, $this->niveaux, $this->limite, $this->pays);
} else {
$zoneTrouveeInfos = $this->localiserPointLatLon();
$corps = $this->formaterResultats($zoneTrouveeInfos);
}
 
$resultat = new ResultatService();
$resultat->mime = self::MIME_JSON;
$resultat->corps = $corps;
return $resultat;
}
 
private function verifierParametres() {
extract($this->parametres);
$messages = array();
if(array_key_exists('masque', $this->parametres)) {
if (empty($masque)) {
$messages[] = "S'il est présent le paramètre recherche ne peut pas être vide";
}
} else {
if (! array_key_exists('lat', $this->parametres)) {
$messages[] = "Vous devez indiquer une latitude en degré décimal à l'aide du paramètres d'url : lat";
} else if (!preg_match(self::PATTERN_LAT, $lat)) {
$messages[] = "La valeur de latitude doit être un nombre décimal dont le séparateur décimal est un point. Ex. : 44 ou 43.03";
}
if (! array_key_exists('lon', $this->parametres)) {
$messages[] = "Vous devez indiquer une longitude en degré décimal à l'aide du paramètres d'url : lon";
} else if (!preg_match(self::PATTERN_LON, $lon)) {
$messages[] = "La valeur de longitude doit être un nombre décimal dont le séparateur décimal est un point. Ex. : -4.03 ou 3.256";
}
}
if (count($messages) != 0) {
$message = implode('<br />', $messages);
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE;
throw new Exception($message, $code);
}
}
 
private function formaterResultats($zonesTrouveesInfos) {
$retour = array();
foreach ($zonesTrouveesInfos as $infos) {
$donnees = array();
foreach ($infos as $champ => $valeur) {
if ($valeur != '' && $champ != 'niveau') {
if ($champ == 'wikipedia') {
$valeur = $this->formaterUrlWikipedia($valeur);
}
$donnees[$champ] = $valeur;
}
}
$retour[$infos['niveau']] = $donnees;
}
ksort($retour);
return $retour;
}
 
private function localiserPointLatLon() {
$osmIdsInClause = $this->getOsmIdsDesCentresAProximites();
$zone = isset($this->zone) ? $this->bdd->proteger($this->zone) : null;
 
$requete = 'SELECT id_zone_geo AS codeZoneGeo, intitule, code_iso_3166_1 AS codeIso31661, '.
'code_iso_3166_2 AS codeIso31662, code_insee AS codeInsee, code_nuts as codeNuts, '.
'nom_en AS nomEn, nom_es AS nomEs, wikipedia, niveau '.
'FROM osm_zones_admin '.
"WHERE st_within(GEOMFROMTEXT('POINT($this->lon $this->lat)'), polygone) = 1 ".
(isset($zone) ? "AND zone = $zone " : '').
"AND osm_id IN ($osmIdsInClause) ".
' -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
$resultat = $this->bdd->recupererTous($requete);
if ($resultat === false) {
$msgTpl = "Service '%s' : aucune zone correspondant aux coordonnées : %s, %s.";
$msg = sprintf($msgTpl, get_class($this), $this->lat, $this->lon);
throw new Exception($msg, RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE);
}
return $resultat;
}
 
private function getOsmIdsDesCentresAProximites() {
$requete = $this->construireRequeteUnion();
$resultats = $this->bdd->recupererTous($requete);
if ($resultats === false) {
$msgTpl = "Service '%s' : aucun centroïde correspondant aux coordonnées : %s, %s.";
$msg = sprintf($msgTpl, get_class($this), $this->lat, $this->lon);
throw new Exception($msg, RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE);
}
$osmIds = array();
foreach ($resultats as $info) {
$osmIds[] = $info['osm_id'];
}
$osmIdsInClause = implode(',', $this->bdd->proteger($osmIds));
return $osmIdsInClause;
}
 
private function construireRequeteUnion() {
$zone = isset($this->zone) ? $this->bdd->proteger($this->zone) : null;
$niveaux = isset($this->niveaux) ? $this->niveaux : null;
$requeteTpl = 'SELECT osm_id, '.
"(($this->lon - centre_lng) * ($this->lon -centre_lng) + ($this->lat - centre_lat) * ($this->lat - centre_lat)) AS distance ".
'FROM osm_zones_admin '.
'WHERE niveau = %s '.
(isset($zone) ? "AND zone = $zone " : '').
'ORDER BY distance ASC '.
"LIMIT %s ";
$niveaux = isset($niveaux) ? $niveaux : array(2,3,4,5,6,7,8);
$requetesAUnir = array();
foreach ($niveaux as $niveau) {
$requetesAUnir[] = sprintf($requeteTpl, $this->bdd->proteger($niveau), ($niveau * 2));
}
$requete = '('.implode(') UNION (', $requetesAUnir).') -- '.__FILE__.' : '.__LINE__;
return $requete;
}
 
private function formaterUrlWikipedia($infoWikipedia) {
list($lang, $page) = explode(':', $infoWikipedia);
$pageEncode = rawurlencode($page);
$urlTpl = 'https://%s.wikipedia.org/wiki/%s';
return sprintf($urlTpl, $lang, $pageEncode);
}
public function rechercherZoneGeoParNom($masque, $niveaux = null, $limite = 1, $pays = null) {
$masque_fmt = str_replace(array(' ', '-'), '_', $masque);
// Cas d'une recherche pour autocompletion
$masque_fmt = ($limite > 1) ? $masque_fmt.'%' : $masque_fmt;
$champs = 'id_zone_geo, osm_id, intitule, centre_lat, centre_lng, '.
'zone, niveau, code_iso_3166_1 AS codeIso31661, code_iso_3166_2 AS codeIso31662, code_insee, '.
'nom, nom_fr, nom_en, nom_es, wikipedia';
$champs_tri = 'IF(ISNULL(nom_fr), 0, 1) as nom_fr_present, '.
'IF(ISNULL(nom_en), 0, 1) as nom_en_present, '.
'IF(ISNULL(nom_es), 0, 1) as nom_es_present, '.
'IF(ISNULL(intitule), 0, 1) as intitule_present, '.
'IF(ISNULL(nom), 0, 1) as nom_present, '.
'IF(zone = "north-america", 0, 1) as hors_amerique_du_nord ';
// les US ont beaucoup de villes qui possèdent des noms similaires
// à des villes européennes, ce qui entraine beaucoup de résultats vers les US
// au lieu de la ville originelle, on les "déclasse" donc artificiellement
$ordre = 'hors_amerique_du_nord DESC, niveau DESC, nom_present DESC, nom_fr_present DESC, nom_fr_present DESC, '.
'nom_es_present DESC, intitule_present DESC';
$niveau_str = array();
if($niveaux != null) {
foreach ($niveaux as $niveau) {
$niveau_str[] = $this->bdd->proteger($niveau);
}
}
$pays_str = '';
if($pays != null) {
$pays_str = '(code_iso_3166_1 = '.$this->bdd->proteger($pays).' OR '.
'code_iso_3166_2 LIKE '.$this->bdd->proteger($pays."%").')';
}
$requete = "SELECT $champs, $champs_tri FROM osm_zones_admin ".
"WHERE ".
(!empty($niveau_str) ? ("niveau IN (".implode(',', $niveau_str).") AND ") : "").
(!empty($pays_str) ? $pays_str.' AND ' : "").
"(nom LIKE ".$this->bdd->proteger($masque_fmt).' OR '.
"intitule LIKE ".$this->bdd->proteger($masque_fmt).' OR '.
"nom_fr LIKE ".$this->bdd->proteger($masque_fmt).' OR '.
"nom_en LIKE ".$this->bdd->proteger($masque_fmt).' OR '.
"nom_es LIKE ".$this->bdd->proteger($masque_fmt).') '.
"ORDER BY ".$ordre." LIMIT ".$limite;
 
$resultat = $this->bdd->recupererTous($requete);
if (empty($resultat)) {
$msgTpl = "Service '%s' : aucune zone correspondant au nom : %s .";
$msg = sprintf($msgTpl, get_class($this), $masque);
throw new Exception($msg, RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE);
} else {
$resultat = ($limite == 1) ? $resultat[0] : $resultat;
}
return $resultat;
}
}
Property changes:
Added: svn:mergeinfo
Merged /branches/v5.2-alpage/services/modules/0.1/osm/ZoneAdmin.php:r976,978
Merged /branches/v5.7-arrayanal/services/modules/0.1/osm/ZoneAdmin.php:r1050,1052,1064
Merged /branches/v5.1-acheb/services/modules/0.1/osm/ZoneAdmin.php:r927
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/liste-rouge/Categorie.php
New file
0,0 → 1,69
<?php
// declare(encoding='UTF-8');
/**
* Classe implémentant l'API d'eFlore concernant les statuts de protection
*
* @see http://www.tela-botanica.org/wikini/eflore/wakka.php?wiki=EfloreApi01ListeRouge
*
* @package eFlore/services
* @author Aurélien PERONNET <aurelien@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
class Categorie extends Commun {
protected $parametres = array();
protected $ressources = array();
private $bdd;
public function __construct($config = null) {
$this->config = $config;
$this->bdd = $this->getBdd();
}
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->parametres = $parametres;
$this->ressources = $ressources;
$this->verifierParametres();
$resultat = new ResultatService();
$resultat->corps = $this->obtenirCategorieListeRouge();
return $resultat;
}
private function verifierParametres() {
$erreurs = array();
if (empty($this->parametres['masque.nn'])) {
$erreurs[] = 'renseignez une valeur pour masque.nn';
}
if(!is_numeric($this->parametres['masque.nn'])) {
$erreurs[] = 'la valeur pour masque.nn doit être un entier';
}
if (count($erreurs) > 0) {
$message = implode('<br />', $erreurs);
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE;
throw new Exception($message, $code);
}
}
public function obtenirCategorieListeRouge() {
$nn = $this->parametres['masque.nn'];
$nns = $this->obtenirNumNomTaxonsSuperieurs(Config::get('referentiel'), $nn);
$nns[] = $nn;
$nns = array_map(array($this->bdd, 'proteger') ,$nns);
$requete = "SELECT * FROM ".Config::get('bdd_table_liste_rouge').' '.
"WHERE num_nom_retenu IN (".implode(',',$nns).") ";
 
return $this->bdd->recupererTous($requete);
}
}
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/lbf/CommunNomsTaxons.php
New file
0,0 → 1,948
<?php
// declare(encoding='UTF-8');
/**
* Description :
* Classe CommunNomsTaxons.php
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package framework-v3
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
 
abstract class CommunNomsTaxons extends Commun {
 
/** Tableau de correspondance entre les noms des champs et les codes de l'ontologie.*/
private $relationsChampsCodesOntologie = null;
protected $table_retour; //Permet de stocker le tableau de résultat (non encodé en json)
protected $resultat_req; // Permet de stocker le résultat de la requete principale.
protected $compo_nom = null; //Stocke sous forme de tableau les composant du nom à ajouter au nom scientifique
protected $table;// Nom de la table dans laquelle on récupèrera les données dans les requetes SQL
protected $total_resultat = null;
/** Stocke le service appelé correspondant. Est utilisé principalement lors de l'affichage du href d'un synonyme
(ex id=12, basionyme num 25 est un synonyme) dans le service taxon */
protected $service_href = null;
protected $erreursParametres = null;
protected $sans_nom_sci = array('gen','sp','ssp','fam','au_ss','bib_ss');
private $bib_traitees = array();
private $ontologie = array();
 
//+------------------------------- PARAMÈTRES ---------------------------------------------------------------+
 
public function traiterParametres() {
$this->definirParametresParDefaut();
$this->verifierParametres();
 
if (isset($this->parametres) && count($this->parametres) > 0) {
foreach ($this->parametres as $param => $val) {
switch ($param) {
case 'ns.structure' :
$this->remplirTableCompositionNom($val);
if (in_array($val,$this->sans_nom_sci)){
$this->requete_champ = implode(', ',$this->compo_nom);
}else {
$this->requete_champ .= ' ,'.implode(', ',$this->compo_nom);
}
break;
case 'navigation.depart' :
$this->limite_requete['depart'] = $val;
break;
case 'navigation.limite' :
$this->limite_requete['limite'] = $val;
break;
}
}
$this->traiterParametresSpecifiques();
}
}
 
protected function definirParametresParDefaut() {
if (empty($this->parametres['recherche'])) {
$this->parametres['recherche'] = 'stricte';
}
if (empty($this->parametres['ns.format'])) {
$this->parametres['ns.format'] = 'txt';
}
if (empty($this->parametres['retour.format'])) {
$this->parametres['retour.format'] = 'max';
}
if (empty($this->parametres['ns.structure']) &&
$this->parametres['retour.format'] != 'oss') {
$this->parametres['ns.structure'] = 'au,an,bib';
}
}
 
 
public function verifierParametres() {
//$this->verifierParametresAPI();
 
$this->verifierParametre('recherche', 'stricte|floue|etendue|complete');
$this->verifierParametre('ns.format', 'htm|txt');
$this->verifierParametre('retour.format', 'min|max|oss|perso');
$this->verifierParametreAvecValeurMultipe('ns.structure', 'an|au|bib|ad|gen|sp|ssp|fam|au_ss|bib_ss');
 
/*if (count($this->erreursParametres) > 0) {
$m = 'Erreur dans votre requête : '.implode('<br/>', $this->erreursParametres);
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $m);
}*/
}
 
public function verifierParametresAPI() {
$parametresApi = $this->recupererTableauConfig('parametresAPI');
while (!is_null($parametre = key($this->parametres))) {
if (!in_array($parametre, $parametresApi)) {
$this->erreursParametres[] = "Le paramètre '$parametre' n'est pas pris en compte par cette version de l'API.";
}
next($this->parametres);
}
}
 
public function verifierParametre($parametre, $valeursPermises) {
if (isset($this->parametres[$parametre]) && !empty($this->parametres[$parametre])) {
$valeur = $this->parametres[$parametre];
$this->verifierValeursPermises($parametre, $valeur, $valeursPermises);
}
}
 
public function verifierParametreAvecValeurMultipe($parametre, $valeursPermises) {
if (isset($this->parametres[$parametre]) && !empty($this->parametres[$parametre])) {
$valeursConcatenees = $this->parametres[$parametre];
$valeurs = explode(',', $valeursConcatenees);
foreach ($valeurs as $valeur) {
$this->verifierValeursPermises($parametre, $valeur, $valeursPermises);
}
}
}
 
private function verifierValeursPermises($parametre, $valeur, $valeursPermises) {
if (!in_array($valeur, explode('|', $valeursPermises))) {
$this->erreursParametres[] = "Le paramètre '$parametre' ne peut pas prendre la valeur '$valeur'. Valeurs permises : $valeursPermises";
}
}
 
public function traiterParametresCommuns() {
 
}
 
public function ajouterFiltreMasque($nom_champ, $valeur) {
$orig_val = $valeur;
$valeur = explode(',',$valeur);
$conditions = array();
if ($nom_champ == 'annee' || $nom_champ == 'rang') {
foreach ($valeur as $val) {
$conditions[] = "$nom_champ = ".$this->getBdd()->proteger($val);
}
} else {
if ($this->parametres['recherche'] == 'etendue') {
foreach ($valeur as $val) {
$val = $this->modifierValeur($val);
$conditions[] = "$nom_champ LIKE ".$this->getBdd()->proteger($val);
}
 
} elseif ($this->parametres['recherche'] == 'floue') {
foreach ($valeur as $val) {
$val = $this->getBdd()->proteger($val);
$conditions[] = "( SOUNDEX($nom_champ) = SOUNDEX($val))".
" OR ( SOUNDEX(REVERSE($nom_champ)) = SOUNDEX(REVERSE($val)))";
}
// utile pour la détermination à partir d'un nom retenu (concat(nom_sci,auteur)) lors
// d'un import depuis le CEL
} elseif ($this->parametres['recherche'] == 'concat' && $nom_champ == 'nom_sci') {
$conditions[] = "CONCAT(nom_sci, ' ', auteur) = " . $this->getBdd()->proteger($orig_val);
 
} else {
foreach ($valeur as $val) {
$conditions[] = "$nom_champ LIKE ".$this->getBdd()->proteger($val);
}
}
}
$this->requete_condition[]= '('.implode(' OR ', $conditions ).')';
$this->masque[$nom_champ] = $nom_champ.'='.implode(',',$valeur);
}
 
private function modifierValeur($valeur) {
$valeur = $this->remplacerCaractereHybrideEtChimere($valeur);
$valeur = $this->preparerChainePourRechercheEtendue($valeur);
return $valeur;
}
 
private function remplacerCaractereHybrideEtChimere($valeur) {
$caracteres = array('×', '%D7', '+', '%2B');
$remplacements = array('x ','x ', '+', '+');
$valeur = str_replace($caracteres, $remplacements, $valeur);
return $valeur;
}
 
private function preparerChainePourRechercheEtendue($valeur) {
$valeur = str_replace(' ', '% ', trim($valeur));
$valeur = $valeur.'%';
return $valeur;
}
 
//+-------------------------------Fonctions d'analyse des ressources-------------------------------------+
 
private function etreRessourceId() {
$ok = false;
if ($this->estUnIdentifiant() && count($this->ressources) == 1) {
$ok = true;
}
return $ok;
}
 
public function traiterRessources() {
if (isset($this->ressources) && count($this->ressources) > 0) {
if ($this->ressources[0] == 'relations') {
$this->traiterRessourceIdRelations();
} elseif ($this->estUnIdentifiant()) { //l'identifiant peut etre de type /#id ou /nt:#id
$this->traiterRessourcesIdentifiant(); // dans le service noms ou taxons
} elseif ($this->ressources[0] == 'stats') { //ressource = noms/stats
$this->traiterRessourcesStats();
} else {
$e = 'Erreur dans votre requete </br> Ressources disponibles : <br/>
<li> /'.$this->service.'/#id (id : L\'identifiant du nom rechercher)</li>
<li> /'.$this->service.'/nt:#id (id : Numero du taxon recherche)</li>
<li> /'.$this->service.'/stats </li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
}
 
public function traiterRessourcesStats() {
$this->format_reponse = $this->service.'/stats';
 
$e = "Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : $this->service/stats/[annees|rangs|initiales]";
if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {
switch ($this->ressources[1]) {
case 'annees' :
$this->traiterRessourceStatsAnnees();
break;
case 'rangs' :
$this->traiterRessourceStatsRangs();
break;
case 'initiales' :
$this->traiterRessourceStatsInitiales();
break;
default :
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
break;
}
} else {
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
 
/** Vérifie si la première valeur de la table de ressource est un identifiant :
* un numerique ou un numéro taxonomique sous la forme nt:xx */
public function estUnIdentifiant() {
return (is_numeric($this->ressources[0]) || (strrpos($this->ressources[0],'nt:') !== false
&& is_numeric(str_replace('nt:','',$this->ressources[0]))));
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// Fonction d'analyse des parametres
 
/** Permet de remplir le tableau compo_nom. Il comprendra en fct du paramètre ns.structure les éléments à rajouter
* au nom_sci (annee, auteur, biblio ou addendum). */
public function remplirTableCompositionNom($valeur) {
$structure_nom = explode(',', $valeur);
 
foreach ($structure_nom as $structure) {
$structure = trim($structure);
$patterns = array('/^an$/', '/^au$/', '/^bib$/', '/^ad$/', '/^sp$/', '/^gen$/', '/^ssp$/','/^fam$/',
'/^au_ss$/','/^bib_ss$/');
$champs = array('annee', 'auteur', 'biblio_origine', 'nom_addendum', 'epithete_sp', 'genre',
'epithete_infra_sp','famille','auteur', 'biblio_origine');
 
// avec str_replace() 'sp' est inclu dans 'ssp', et la conversion pour 'ssp' est mauvaise
$this->compo_nom[$structure] = preg_replace($patterns, $champs, $structure);
}
}
 
public function mettreAuFormat() {
if ($this->parametres['ns.format'] == 'htm') {
if (strrpos($this->requete_champ, 'nom_sci_html as nom_sci') === false) {
$this->requete_champ = str_replace('nom_sci', 'nom_sci_html as nom_sci', $this->requete_champ);
}
}
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// Fonctions de formatage
 
/** Fonction permettant de creer la table dont le nom est passé en paramètre (champs_api, champs_bdtfx,
* correspondance_champs...). Les données de chaque table sont présentes dans le fichier de configuration config.ini
* @param String $table : Peut contenir plusieurs nom de table dont on souhaite récupérer les données : table,table,table. */
public function recupererTableSignification($table) {
$tables = explode(',', $table);
foreach ($tables as $tab) {
if ($tab == 'champs_comp') {
$champ_bdnff_api = array_keys($this->champs_api); //on recupère le nom des champ ds la bdd
$this->champs_comp = array_diff($this->champs_table, $champ_bdnff_api);
} elseif ($tab == 'champs_api') {
foreach ($this->correspondance_champs as $key => $val) {
preg_match('/(hybride[.]parent_0[12](?:[.]notes)?|nom_sci[.][^.]+|[^.]+)(?:[.](id|code))?/', $val, $match);
$val = $match[1];
$this->champs_api[$key] = $val;
}
} else {
$this->$tab = $this->recupererTableauConfig($tab);
}
}
}
 
public function formaterEnOss($resultat) {
$table_nom = array();
$oss = '';
foreach ($resultat as $tab) {
if (isset($tab['nom_sci']) ) {
if (!in_array($tab['nom_sci'], $table_nom)) {
$table_nom[] = $tab['nom_sci'];
$oss[] = $tab['nom_sci'].' '.$this->ajouterCompositionNom($tab);
}
}else {
$res = $this->ajouterCompositionNom($tab);
if($res) {
$oss[] = $res;
}
}
 
}
 
if (isset($this->masque)) $masque = implode('&', $this->masque);
else $masque = 'Pas de masque';
$table_retour_oss = array($masque, $oss);
return $table_retour_oss;
}
 
public function afficherEnteteResultat($url_service) {
$arr = array(
'depart' => $this->limite_requete['depart'],
'limite' => $this->limite_requete['limite'],
'total' => $this->total_resultat);
 
if (isset($this->masque))
$arr['masque'] = implode('&', $this->masque);
 
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, $url_service);
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') {
$arr['href.precedent'] = $url['precedent'];
}
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') {
$arr['href.suivant'] = $url['suivant'];
}
return $arr;
}
 
public function afficherNomHrefRetenu($tab, $num) {
$this->resultat_req = $tab;
$this->afficherDonnees('num_nom', $num);
if ($this->parametres['retour.format'] == 'min') { // sinon est affiché ds afficherDonnees(num_nom, $val) ci-dessus
$this->table_retour['nom_sci'] = $tab['nom_sci'];
$this->table_retour['nom_sci_complet'] = $tab['nom_sci'].' '.$this->ajouterCompositionNom($tab);
}
if ($tab['num_nom_retenu'] != '') {
$retenu = ($tab['num_nom_retenu'] == $num) ? 'true' : 'false';
} else {
$retenu = 'absent';
}
$this->table_retour['retenu'] = $retenu;
// Pourquoi ce unset ? JPM - 28-03-2013
unset($this->table_retour['id']);
}
 
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// Fonction de formatage pour les services /#id/
 
public function formaterId($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$this->resultat_req = $resultat;
 
foreach ($resultat as $cle => $valeur) {
if ($valeur != '') {
$this->afficherDonnees($cle, $valeur);
}
}
if (isset($this->parametres['retour.champs']) && $this->format_reponse == 'noms/id') {
$retour = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
$champs = explode(',', $this->parametres['retour.champs']);
$this->ajouterChampsPersonnalises($champs, $retour);
}
unset($this->table_retour['href']);
return $this->table_retour;
}
 
public function formaterIdChamp($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$reponse_id = $this->formaterId($resultat);
$this->table_retour = array();
$champs = explode(' ', $this->ressources[1]);
$this->ajouterChampsPersonnalises($champs, $reponse_id);
return $this->table_retour;
}
 
protected function ajouterChampsPersonnalises($champs, $reponse_id) {
$champs_a_libeller = array('nom_retenu', 'rang', 'basionyme', 'hybride', 'hybride.parent_01',
'hybride.parent_02', 'presence', 'tax_sup', 'statut_origine', 'statut_culture', 'statut_introduction');
$champs_forces = array('rang'); // même s'ils sont dans "à libeller", on les prend quand même en brut, en plus
if (! is_null($champs) && is_array($champs) && count($champs) > 0) {
foreach ($champs as $champ) {
if ($this->verifierValiditeChamp($champ)) {
if (strrpos($champ, '.*') !== false) {
$this->afficherPointEtoile($champ, $reponse_id);
} elseif (in_array($champ, $champs_a_libeller)) {
$this->table_retour[$champ.'.libelle'] =
(isset($reponse_id[$champ.'.libelle'])) ? $reponse_id[$champ.'.libelle'] : null;
} else {
$champ = $this->trouverChampBddCorrespondant($champ);
$this->table_retour[$champ] = (isset($reponse_id[$champ])) ? $reponse_id[$champ] : null;
}
// champs bruts en plus, ajouté pour obtenir le rang, mais retourne rang.code avec du kk dedans :-/
if (in_array($champ, $champs_forces)) {
$champ = $this->trouverChampBddCorrespondant($champ);
$this->table_retour[$champ] = (isset($reponse_id[$champ])) ? $reponse_id[$champ] : null;
}
}
}
}
}
 
public function afficherPointEtoile($champ, $reponse) {
preg_match('/^([^.]+\.)\*$/', $champ, $match);
if ($match[1] == 'nom_sci') {
$this->afficherNomSciPointEpithete($this->resultat_req);
} else {
foreach ($reponse as $chp => $valeur) {
if (strrpos($chp, $match[1]) !== false) {
if ($valeur != '') {
$this->table_retour[$chp] = $valeur;
} else {
$this->table_retour[$chp] = null;
}
}
}
}
}
 
public function decomposerNomChamp($champ) {
$decomposition = false;
if (preg_match('/^(?:([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+))(?:\.(.+))?$/', $champ, $match)) {
$radical_champ = $match[1];
$suffixe = (isset($match[2])) ? $match[2] : "";
$decomposition = array($radical_champ, $suffixe);
}
return $decomposition;
}
 
public function verifierValiditeChamp($champ) {
$decomposition = $this->decomposerNomChamp($champ);
$validite_ressource = true;
if ($decomposition) {
list($radical, $suffixe) = $decomposition;
$champs_complementaire = array('nom_retenu_complet', 'basionyme_complet');
// on verifie si le nom du champ existe bien
if (!$this->estChampApi($radical) && !$this->estChampComplementaire($radical)) {
if (!in_array($radical, $champs_complementaire)) {
$validite_ressource = false;
$e = 'Le champ "'.$radical.'" n\'existe pas dans la base. <br/><br/>';
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
} elseif ($this->estUnPoint($champ)) {
$validite_ressource = $this->verifierValiditeSuffixe($suffixe, $radical);
}
}
return $validite_ressource;
}
 
public function estChampApi($radical_champ) {
$champ_api_ok = false;
if (in_array($radical_champ, $this->champs_api) || in_array($radical_champ, $this->correspondance_champs)) {
$champ_api_ok = true;
}
return $champ_api_ok;
}
 
public function estChampComplementaire($radical_champ) {
$champ_complementaire_ok = in_array($radical_champ, $this->champs_comp) ? true : false;
return $champ_complementaire_ok;
}
 
public function verifierValiditeSuffixe($suffixe, $radical_champ) {
$validite_ressource = true;
if ($this->correspondAUnId($radical_champ) || $radical_champ == 'id') {
$this->verificationSuffixesIdentifiant($suffixe, $radical_champ, $validite_ressource);
} elseif ($this->correspondAUnCode($radical_champ)) {
$this->verificationSuffixesCodes($suffixe, $radical_champ, $validite_ressource);
} elseif ($radical_champ == 'nom_sci') {
if ($suffixe != '*') {
$validite_ressource = false;
$m = 'Erreur : Le suffixe demandé n\'existe pas pour le champ "'.$radical_champ.'".<br/>
Les suffixes possibles sont les suivants : <li> * </li>';
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $m);
}
} else {
$validite_ressource = false;
$m = 'Erreur : Le paramètre "'.$radical_champ.'" ne peut pas présenter de suffixe. <br/><br/>';
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $m);
}
return $validite_ressource;
}
 
public function verificationSuffixesCodes(&$suffixe, &$radical_champ, &$validite_ressource ) {
if (!in_array($suffixe, array('*', 'code', 'href', 'details'))) {
$validite_ressource = false;
$e = 'Erreur : Le suffixe demandé n\'existe pas pour le champ "'.$radical_champ.'.<br/> Les suffixes '
.'possibles sont les suivants : <li> .* </li><li> .code </li><li> .href </li><li> .details </li>';
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
 
public function verificationSuffixesIdentifiant(&$suffixe, &$radical_champ, &$validite_ressource) {
if ((strrpos($radical_champ, 'parent') !== false && !in_array($suffixe, array('*', 'id', 'href', 'details', 'notes')))
|| !in_array($suffixe, array('*', 'id', 'href', 'details')) && strrpos($radical_champ, 'parent') === false) {
$validite_ressource = false;
$e = 'Erreur : Le suffixe demandé n\'existe pas pour le champ "'.$radical_champ.'".<br/> Les suffixes '
.'possibles sont les suivants : <li> .* </li><li> .id </li><li> .href </li><li> .details </li>'
.'<li> .notes (seulement pour les hybride.parent)';
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
 
 
//------------------------------fonction de formatage pour les services /stats/-----------------------------------------
 
public function formaterStatsAnnee($resultat) {
foreach ($resultat as $cle_annee) {
$annee = ($cle_annee['annee'] != '') ? $cle_annee['annee'] : 'ND';
$nb = $cle_annee['nombre'];
$retour_stats_annee[$annee] = $nb;
}
return $retour_stats_annee;
}
 
public function formaterStatsRang($resultat) {
foreach ($resultat as $rangs) {
if ($rangs['rang'] != 0) {
$rang = $rangs['rang'];
if ($this->parametres['retour.format'] == 'max') {
$retour_rang[$rang]['rang'] = $this->ajouterSignificationCode('rang',$rang);
}
$nombre = $rangs['nombre'];
$retour_rang[$rang]['nombre'] = $nombre;
}
}
return $retour_rang;
}
 
public function formaterStatsInitiales($resultat) {
$rang = null;
$table_rang = array();
foreach ($resultat as $tuple) {
if ($tuple['rang'] != 0) {
$this->memoriserRang($table_rang, $tuple, $rang);
if ($tuple['lettre'] == 'x ') {
$this->ajouterHybrideChimere('hybride', $rang, $tuple);
} elseif ($tuple['lettre'] == '+ ') {
$this->ajouterHybrideChimere('chimere', $rang, $tuple);
} else {
$l = substr($tuple['lettre'], 0, 1);
if (isset($this->table_retour[$rang][$l])) {
$this->table_retour[$rang][substr($tuple['lettre'], 0, 1)] += floatval($tuple['nb']);
} else {
$this->table_retour[$rang][substr($tuple['lettre'], 0, 1)] = floatval($tuple['nb']);
}
}
}
}
return $this->table_retour;
}
 
public function memoriserRang(&$table_rang, $tuple, &$rang) {
if (is_array($table_rang)) {
if (!in_array($tuple['rang'], $table_rang)) {
$rang = $tuple['rang'];
$table_rang[] = $rang;
if ($this->parametres['retour.format'] == 'max') {
$rang = $this->ajouterSignificationCode('rang', $rang);
}
}
}
}
 
public function ajouterHybrideChimere($groupe, &$rang, &$tuple) {
if (isset($this->table_retour[$rang][str_replace('hybride', 'hyb', $groupe)])) {
$this->table_retour[$rang][$groupe] += floatval($tuple['nb']);
} else {
$this->table_retour[$rang][$groupe] = floatval($tuple['nb']);
}
}
 
//-----------------------------Fonctions d'affichage utiliser dans les fonctions de formatage---------------------------
 
public function afficherDonnees($champApi, $valeur) {
$champBdd = $this->trouverChampBddCorrespondant($champApi);
 
if ($this->parametres['retour.format'] == 'min') {
if ($champApi == 'nom_sci') {
$valeur = $valeur.' '.$this->ajouterCompositionNom($this->resultat_req);
}
if ($champApi == 'nom_sci_html') {
$valeur = $valeur.' '.$this->ajouterCompositionNom($this->resultat_req, 'htm');
}
$this->table_retour[$champBdd] = $valeur;
// on essaye de permettre l'obtention du nom_sci_complet, y compris en retour.format == 'min',
// tout en évitant les appels aux ontologies
/*if ($this->correspondAUnId($champBdd) || $champBdd == 'id' && $valeur != '0') {
preg_match('/^([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+)(?:\.id)?$/', $champBdd, $match);
if(strpos($this->parametres['retour.format'], $match[1]) !== false) $this->afficherSignification($match[1], $valeur);
}*/
} else {
$this->afficherToutesLesInfos($champBdd, $valeur);
}
}
 
public function trouverChampBddCorrespondant($champApi) {
if (array_key_exists($champApi, $this->champs_api)) {
$champBdd = $this->correspondance_champs[$champApi];
} else {
$champBdd = $champApi;
}
return $champBdd;
}
 
public function afficherToutesLesInfos($nom_champ_api, $valeur) {
if ($this->presentePlusieursId($nom_champ_api, $valeur)) {
preg_match('/^([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+)(?:\.id)?$/', $nom_champ_api, $match);
$this->afficherInfosPrecises($match[1], 'details', $valeur);
$this->table_retour[$nom_champ_api] = $valeur;
 
} elseif (strrpos($nom_champ_api, 'parent') !== false && strrpos($nom_champ_api, 'notes') !== false) {
$this->table_retour[$nom_champ_api] = $valeur;
 
} elseif (($this->correspondAUnId($nom_champ_api) || $nom_champ_api == 'id' && $valeur != '0')) {
preg_match('/^([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+)(?:\.id)?$/', $nom_champ_api, $match);
$this->afficherInfosPrecises($match[1], 'id,signification,href', $valeur);
 
} elseif ($this->correspondAUnCode($nom_champ_api)) {
preg_match('/^([^.]+)(?:\.code)?$/', $nom_champ_api, $match);
$this->afficherInfosPrecises($match[1], 'code,signification,href', $valeur);
 
} elseif ($nom_champ_api == 'nom_sci_html') {
$this->table_retour['nom_sci_html'] = $valeur;
$this->table_retour['nom_sci_html_complet'] = $valeur.' '.$this->ajouterCompositionNom($this->resultat_req, 'htm');
}elseif ($nom_champ_api != 'nom_sci') {
$this->table_retour[$nom_champ_api] = $valeur;
}
}
 
public function presentePlusieursId($ressource, $valeur = null) {
if ($valeur) {
$presente = strrpos($ressource, 'proparte') !== false && strrpos($valeur, ',') !== false;
} else { //pour la vérification du champ, on ignore alors la valeur de la ressource
$presente = strrpos($ressource, 'proparte') !== false;
}
return $presente;
}
 
public function afficherInfosPrecises($champ, $suffixe, $valeur) {
$suffixes = explode(',', $suffixe);
//on initialise au service appelé. Sera potentiellement modifié dans la fonction afficherSignification()
$this->service_href = $this->service;
foreach ($suffixes as $suffixe) {
switch ($suffixe) {
case 'id' :
$this->table_retour[str_replace('id.id', 'id', $champ.'.id')] = $valeur;
break;
case 'details' :
$this->afficherTableDetails($champ, $valeur);
break;
case 'signification' :
$this->afficherSignification($champ, $valeur);
break;
case 'href' :
$url = $this->creerUrl($champ, $valeur);
$this->table_retour[str_replace('id.href', 'href', $champ.'.href')] = $url;
break;
case 'code' :
$this->table_retour[$champ.'.code'] = $this->obtenirCode($champ, $valeur);
break;
case 'notes' :
$this->table_retour[$champ.'.notes'] = $this->resultat_req[str_replace('.', '_', $champ).'_notes'];
break;
default : break;
}
}
}
 
public function afficherTableDetails($nom_champ_api, $valeur) {
$tab_id = explode(',', $valeur);
$tab_res = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
foreach ($tab_id as $id) {
$this->afficherInfosPrecises($nom_champ_api, 'id,signification,href', $id);
$tab_res[$nom_champ_api.'.details'][] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
$this->table_retour = $tab_res;
}
 
private function obtenirCode($champ, $valeur) {
$code = $this->transformerChampEnCode($champ);
return "bdnt.$code:$valeur";
}
 
private function transformerChampEnCode($champ) {
if (is_null($this->relationsChampsCodesOntologie)) {
$this->relationsChampsCodesOntologie = Outils::recupererTableauConfig('ChampsCodesOntologie');
}
 
$code = $champ;
if (array_key_exists($champ, $this->relationsChampsCodesOntologie)) {
$code = $this->relationsChampsCodesOntologie[$champ];
}
return $code;
}
 
public function creerUrl($champ, $valeur) {
if ($this->correspondAUnId($champ) || $champ == 'id') {
$service = $this->service_href;
$url = $this->ajouterHref($service, $valeur);
} else {
$code = $this->transformerChampEnCode($champ);
$url = $this->ajouterHrefAutreProjet('ontologies', "$code:", $valeur, 'bdnt');
}
return $url;
}
 
public function afficherSignification($champ, $valeur) {
if ($champ == 'id' && isset($this->resultat_req['nom_sci']) && $this->resultat_req['num_nom'] == $valeur) {
//si le nom_sci du num_nom que l'on veut afficher est déjà dans la table de résultat :
$this->table_retour['nom_sci'] = $this->resultat_req['nom_sci'];
$this->table_retour['nom_sci_complet'] = $this->resultat_req['nom_sci'] . (($suff = $this->ajouterCompositionNom($this->resultat_req)) ? ' ' . $suff : '');
} elseif ($this->correspondAUnId($champ) || $champ == 'id') {
$nom = $this->recupererNomSci($valeur);
if ($nom != array()) {
$this->table_retour[$champ.'.libelle'] = $nom['nom_sci'];
$this->table_retour[$champ.'_html'] = $nom['nom_sci_html'];
$this->table_retour[$champ.'_complet'] = $nom['nom_sci_complet'];
$this->table_retour[$champ.'_html_complet'] = $nom['nom_sci_complet_html'];
$this->service_href = $nom['service'];
}
} elseif ($this->correspondAUnCode($champ)) {
$this->table_retour[$champ.'.libelle'] = $this->ajouterSignificationCode($champ, $valeur);
}
}
 
/** Permet d'afficher les élements nomenclatural du nom_sci lors de l'appel dans le service noms/id/champ du champ^nom_sci.*/
public function afficherNomSciPointEpithete($resultat) {
$tab_nom_sci = array('nom_supra_generique', 'genre', 'epithete_infra_generique', 'epithete_sp',
'type_epithete', 'epithete_infra_sp', 'cultivar_groupe', 'cultivar', 'nom_commercial');
foreach ($tab_nom_sci as $compo_nom) {
if (isset($resultat[$compo_nom]) && !empty($resultat[$compo_nom])) {
$this->table_retour['nom_sci.'.$compo_nom] = $resultat[$compo_nom];
}
}
}
 
public function ajouterSignificationCode($champ, $valeur) {
if($this->termeOntologieEstEnCache($champ, $valeur)) {
$nom_code = $this->obtenirTermeOntologieParCache($champ, $valeur);
} else {
$code = $this->transformerChampEnCode($champ);
if (preg_match('/^([^_-]+)(?:_|-)([^_-]+)$/', $code, $match)) {
$code = $match[1].ucfirst($match[2]);
}
$requete = sprintf('SELECT * FROM %s WHERE id IN (SELECT id FROM %s WHERE code = "%s" AND classe_id = (SELECT id FROM %s WHERE code = "%s")) LIMIT 0, 100 -- %s:%s', Config::get('bdd_table_ontologies'), Config::get('bdd_table_ontologies'), $valeur, Config::get('bdd_table_ontologies'), $code, __FILE__, __LINE__);
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
$nom_code = $valeur;
if (is_array($res)) {
$nom_code = $res['nom'];
}
$this->mettreEnCacheOntologie($champ, $valeur, $nom_code);
}
return $nom_code;
}
 
public function recupererNomSci($id) {
$nom = array();
if ($id != 0) {
if ($this->compo_nom == null) {
$req = 'SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html FROM '.$this->table.' WHERE num_nom = '.$id;
} else { //on ajoute à la requete sql, les champs de ns.structure
//print_r($this->compo_nom);
$req = 'SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html, '.implode(', ', $this->compo_nom)
.' FROM '.$this->table
.' WHERE num_nom = '.$id;
}
if ($this->parametres['ns.format'] == 'htm') {
$req = str_replace('nom_sci', 'nom_sci_html as nom_sci', $req);
}
$res = $this->getBdd()->recuperer($req . ' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__);
if ($res) {
$nom['nom_sci'] = $res['nom_sci'];
$nom['nom_sci_html'] = $res['nom_sci_html'];
$nom['nom_sci_complet'] = $res['nom_sci'].' '.$this->ajouterCompositionNom($res);
$nom['nom_sci_complet_html'] = $res['nom_sci_html'].' '.$this->ajouterCompositionNom($res, 'htm');
$nom['service'] = ($res['num_nom_retenu'] == $id && $this->service == 'taxons') ? 'taxons' : 'noms';
}
}
return $nom;
}
 
/** Permet de retourner une chaine de caractère composée des parametres du nom (ns.structure : annnée, auteur,
* bibilio et addendum). A ajouter au nom scientifique */
public function ajouterCompositionNom($tab_res, $format = '') {
$format = ($format == '') ? $this->parametres['ns.format'] : $format;
 
$nom = '';
if (isset($this->compo_nom)) {
if ($format == 'htm') {
$format = array(
'au' => '<span class="auteur">%s</span>',
'an' => '[<span class="annee">%s</span>]',
'an_bib' => '[<span class="annee">%s</span>, <span class="biblio">%s</span>]',
'bib' => '[<span class="biblio">%s</span>]',
'ad' => '[<span class="adendum">%s</span>]');
} else {
$format = array(
'au' => '%s',
'an' => '[%s]',
'an_bib' => '[%s, %s]',
'bib' => '[%s]',
'ad' => '[%s]',
'gen' => '%s',
'sp' => '%s',
'ssp' => '%s',
'fam' => '%s',
'au_ss' => '%s',
'bib_ss' => '%s');
}
$compo_nom = array();
 
foreach ($this->compo_nom as $key => $champ) {
if (isset($tab_res[$champ]) && !empty($tab_res[$champ])) {
$compo_nom[$key] = $tab_res[$champ];
}
}
$nom_complet = $this->formerNomComplet($compo_nom, $format);
$nom = implode(' ', $nom_complet);
}
return rtrim($nom, ' ');
}
 
 
public function formerNomComplet($compo_nom, $format) {
$nom_complet = array();
extract($compo_nom);
if (isset($au)) $nom_complet[] = sprintf($format['au'], $au);
if (isset($an)) {
if (isset($bib)) {
$nom_complet[] = sprintf($format['an_bib'], $an, $bib);
} else {
$nom_complet[] = sprintf($format['an'], $an);
}
} elseif (isset($bib)) {
$nom_complet[] = sprintf($format['bib'], $bib);
}
if (isset($ad)) $nom_complet[] = sprintf($format['ad'], $ad);
if (isset($gen)) $nom_complet[] = sprintf($format['gen'], $gen);
if (isset($ssp)) $nom_complet[] = sprintf($format['ssp'], $ssp);
if (isset($sp)) $nom_complet[] = sprintf($format['sp'], $sp);
if (isset($fam)) $nom_complet[] = sprintf($format['fam'], $fam);
if (isset($au_ss)) $nom_complet[] = sprintf($format['au_ss'], $au_ss);
if (isset($bib_ss)) {
$bibl = $this->tronquerBiblio($bib_ss);
//simule un 'select distinct' sur les biblio tronquées
if (!isset($this->bib_traitees[$bibl])) {
$nom_complet[] = sprintf($format['bib_ss'],$bibl );
$this->bib_traitees[$bibl] = 1;
}
}
return $nom_complet;
}
 
public function tronquerBiblio($valeur){
$bib = '';
if(strpos($valeur,',') !== false) {
$bib = explode(',',$valeur);
}
if(strpos($bib[0],';') !== false) {
 
$bib[0] = strstr($bib[0],';');
$bib[0] = str_replace('; ','',$bib[0]);
}
return $bib[0];
}
 
 
 
public function correspondAUnCode($key) {
return (strrpos($key, '.code') !== false) || (in_array($key.'.code', $this->correspondance_champs));
}
 
public function correspondAUnId($key) {
return (strrpos($key, '.id') !== false) || (in_array($key.'.id', $this->correspondance_champs));
}
 
public function estUnPoint($key) {
if (strrpos($key, 'hybride.parent') !== false) {
$key = str_replace('hybride.parent', 'hybride_parent', $key);
}
return (strrpos($key, '.') !== false);
}
 
public function recupererMasquePrincipal() {
$masque = null;
$tab_masque = array(
'masque' => 'nom_sci',
'masque_sg' => 'nom_supra_generique',
'masque_gen' => 'genre',
'masque_sp' => 'epithete_sp',
'masque_ssp' => 'epithete_infra_sp',
'masque_au' => 'auteur',
'masque_an' => 'annee',
'masque_bib' => 'biblio_origine',
'masque_ad' => 'addendum',
'masque_rg' => 'rang');
$liste_masque = array();
 
if (isset($this->masque['num_nom'])) {
$liste_masque[] = $this->masque['num_nom'];
}
 
foreach ($tab_masque as $key => $filtre) {
if (isset($this->masque[$filtre])) {
if (!isset($masque) && !in_array($filtre, array('rang', 'annee'))) {
$masque = array($key, $filtre);
}
$liste_masque[] = $this->masque[$filtre];
}
}
$this->masque = $liste_masque;
return $masque;
}
 
private function mettreEnCacheOntologie($categorie, $valeur, $correspondance) {
if(!isset($this->ontologie[$categorie])) {
$this->ontologie[$categorie] = array();
}
if(!isset($this->ontologie[$categorie][$valeur])) {
$this->ontologie[$categorie][$valeur] = array();
}
$this->ontologie[$categorie][$valeur] = $correspondance;
}
 
private function termeOntologieEstEnCache($categorie, $valeur) {
return array_key_exists($categorie, $this->ontologie) && array_key_exists($valeur, $this->ontologie[$categorie]);
}
 
private function obtenirTermeOntologieParCache($categorie, $valeur) {
return $this->ontologie[$categorie][$valeur];
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/lbf/Noms.php
New file
0,0 → 1,720
<?php
// declare(encoding='UTF-8');
/**
* Classe permettant de fournir des informations sur les noms scientifiques.
* Si l'url finit par /noms on retourne une liste de noms latin et leurs identifiants (seulement les 100 premeiers noms par défaut).
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /noms?param1=val1&param2=val2&...
*
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, masque.gen (nom de genre), masque.sp (épithète d'espèce), masque.ssp (épithète infra-spécifique),
* masque.au (auteur du nom), masque.an (année de publication du nom), masque.bib (réf biblio de la publi d'origine du nom), masque.ad (nomen addendum),
* masque.nn (identifiant du nom), recherche, rang, distinct, retour.format, nl.format, nl.structure, navigation.depart et navigation.limite.
* Les différentes requetes :
* - noms | noms/relations/#projet/#id_projet | noms/#id | noms/#id/#champ+#champ
* - noms/#id/relations | noms/#id/relations/synonymie | noms/#id/relations/homonymie | noms/#id/relations/flores
* - noms/stats/rangs | noms/stats/annees | noms/stats/initiales
*
* @package bdtfx
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version $Id$
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
* @see http://www.tela-botanica.org/wikini/eflore/wakka.php?wiki=EfloreApi01Noms
*/
 
class Noms extends CommunNomsTaxons {
 
protected $format_reponse = 'noms'; // Permet de stocker la requete formulée
protected $service = 'noms';
protected $serviceNom = 'noms';
protected $requete_champ = 'num_nom, nom_sci, num_nom_retenu';
protected $requete_condition = null;
protected $requete_group_by = '';
/** Permet de stocker les limite de la requete SQL (par défaut seul les 100 premiers résultats seront retournés).*/
protected $limite_requete = array('depart' => 0, 'limite' => 100);
protected $distinct = null; // Valeur du paramètre de requete distinct (=0|1)
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
return parent::consulter($ressources, $parametres);
}
 
//+----------------FONCTION D'ANALYSE DES PARAMETRES---------------------------------------------------------+
 
public function traiterParametresSpecifiques() {
foreach ($this->parametres as $param => $val) {
switch ($param) {
case 'masque' :
$champ = isset($this->parametres['recherche']) && ($this->parametres['recherche'] == 'etendue') ?
'CONCAT(nom_sci," ",auteur)' : 'nom_sci';
$this->ajouterFiltreMasque($champ, $val);
break;
case 'masque.sg' :
$this->ajouterFiltreMasque('nom_supra_generique', $val);
break;
case 'masque.gen' :
$this->ajouterFiltreMasque('genre', $val);
break;
case 'masque.sp' :
$this->ajouterFiltreMasque('epithete_sp', $val);
break;
case 'masque.ssp' :
$this->ajouterFiltreMasque('epithete_infra_sp',$val);
break;
case 'masque.au' :
$this->ajouterFiltreMasque('auteur', $val);
break;
case 'masque.an' :
$this->ajouterFiltreMasque('annee', $val);
break;
case 'masque.bib' :
$this->ajouterFiltreMasque('biblio_origine',$val);
break;
case 'masque.ad' :
$this->ajouterFiltreMasque('nom_addendum', $val);
break;
case 'masque.nn' :
$this->requete_condition []= 'num_nom IN ('.$val.')';
$this->masque['num_nom'] = "num_nom=$val";
break;
case 'masque.nt' :
$this->requete_condition []= 'num_taxonomique IN ('.$val.')';
$this->masque['num_tax'] = "num_taxonomique=$val";
break;
case 'masque.rg' :
$this->ajouterFiltreMasque('rang', $val);
break;
case 'retour.champs' :
$this->verifierParamChamps($param, $val);
break;
case 'distinct' :
$this->ajouterNomDistinct($val);
break;
case 'masque.fam' :
$this->ajouterFiltreMasque('famille', $val);
break;
case 'masque.prga' :
$this->ajouterFiltreMasque('presence_ga', $val);
break;
case 'masque.prco' :
$this->ajouterFiltreMasque('presence_co', $val);
break;
case 'masque.sto' :
$this->ajouterFiltreMasque('statut_origine', $val);
break;
case 'masque.sti' :
$this->ajouterFiltreMasque('statut_introduction', $val);
break;
case 'masque.stc' :
$this->ajouterFiltreMasque('statut_culture', $val);
break;
case 'masque.and' :
$this->requete_condition []= " annee >= ".$this->getBdd()->proteger($val);
break;
case 'masque.anf' :
$this->requete_condition []= " annee <= ".$this->getBdd()->proteger($val);
break;
}
 
}
}
 
public function verifierParamChamps($param, $val) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$champs_demandes = explode(',', $val);
$champs_verifies = array();
$champs_api = array_flip($this->champs_api);
$champs_supp = array('nom_retenu_complet'=>'num_nom_retenu', 'num_basionyme_complet'=>'num_basionyme');
$champs_api = array_merge($champs_api, $champs_supp);
foreach ($champs_demandes as $champ) {
if (array_key_exists($champ, $champs_api)) {
$champs_verifies[] = $champs_api[$champ];
}
}
if (count($champs_verifies) > 0) {
$this->requete_champ .= ', '.implode(',', $champs_verifies);
}
}
 
/** Permet de rajouter à la requete sql le parametre distinct. N'est utilisé qu'avec le format oss */
public function ajouterNomDistinct($distinct) {
if (isset($distinct)) {
if ($distinct == 1 && $this->parametres['retour.format'] == 'oss') {
$this->distinct = ' distinct ';
} elseif ($distinct == 1 && $this->parametres['retour.format'] != 'oss') {
$e = 'Erreur dans votre requête </br> L\'utilisation du paramètre distinct ne se fait que sous
le format oss';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
}
 
//-----------------FONCTION D'ANALYSE DES RESSOURCES--------------------------------------------------------------------
 
public function traiterRessourcesIdentifiant() {
//on initialise la condition de la requete sql et le format de réponse
$this->requete_condition = array(); //on vide la table dans le cas de plusieurs version
$this->requete_condition[] = 'num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($this->ressources[0]);
$this->format_reponse = $this->service.'/id';
if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {
if ($this->ressources[1] == 'relations') {
$this->traiterRessourceIdRelations();
} else {
$e = 'Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : <br/>
<li> noms/#id/relations </li> <li> noms/#id/#champ+#champ </li>
<li> noms/#id/relations/synonymie </li> <li> noms/#id/relations/flores </li>
<li> noms/#id/relations/homonymie </li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
} else { // requete de type noms/#id : rajout du nom_sci pour récupérer le format html par la fct mettreAuFormat()
$this->requete_champ = ' *, nom_sci ';
}
}
 
public function traiterRessourceRelations() {
$this->format_reponse .= '/relations';
$projet = $this->ressources[1];
$num_nom = $this->ressources[2];
if (strrpos($num_nom, 'nn.coste') !== false) {
list($p, $nn) = explode('=', $num_nom);
$num_nom = $nn;
}
$champ = "flore_$projet"."_num";
if (isset($this->ressources[3])) {
$type = $this->ressources[3];
if (!in_array($type, array('homonymie', 'synonymie', 'flores'))) {
$e = "Les types disponibles pour les noms sont homonymie, synonymie et flores";
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
$this->requete_champ = ' num_nom ';
$this->requete_condition = array();
$this->requete_condition[] = "$champ = ".$this->getBdd()->proteger($num_nom);
}
 
public function traiterRessourceIdRelations() {
$this->format_reponse .= '/relations';
if (isset($this->ressources[2]) && !empty($this->ressources[2])) {
// requete de type noms/#id/relations/#relation
switch ($this->ressources[2]) {
case 'synonymie' :
$this->traiterRessourceIdSynonymie();
break;
case 'flores' :
$this->traiterRessourceIdFlores();
break;
case 'homonymie' :
$this->traiterRessourceIdHomonymie();
break;
default :
$e = 'Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : <br/>
<li> noms/#id/relations </li> <li> noms/#id/relations/synonymie </li>
<li> noms/#id/relations/flores </li> <li> noms/#id/relations/homonymie </li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
break;
}
}
}
 
public function traiterRessourceIdSynonymie() {
// SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu, num_basionyme FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X LIMIT 0,100;
$this->format_reponse .= '/synonymie';
if (strrpos($this->requete_champ, ', num_basionyme') === false) {
$this->requete_champ .= ', num_basionyme ';
}
if (strrpos($this->requete_champ, ', num_type') === false) {
$this->requete_champ .= ', num_type ';
}
if (strrpos($this->requete_champ, ', num_type') === false) {
$this->requete_champ .= ', num_type ';
}
$this->requete_condition[0] = 'num_nom_retenu = '.
'(SELECT num_nom_retenu FROM '.$this->table.' WHERE '.$this->requete_condition[0].')';
}
 
public function traiterRessourceIdHomonymie() {
// SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu FROM bdtfx_v2_00 WHERE nom_sci = (SELECT nom_sci FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
$this->format_reponse .= '/homonymie';
$this->requete_condition[0] = 'nom_sci = (SELECT nom_sci FROM '.$this->table
.' WHERE '.$this->requete_condition[0].')';
}
 
public function traiterRessourceIdFlores() {
$champ_flores = '';
foreach ($this->champs_table as $champ) {
if (preg_match('/^flore_.*$/', $champ)) {
$champ_flores .= ', '.$champ;
}
}
$this->format_reponse .= '/flores';
$this->requete_champ = 'num_nom'.$champ_flores;
}
 
public function traiterRessourceStatsRangs() {
// SELECT count(*) as nombre, rang FROM bdtfx_v2_00 [WHERE rang = 290] GROUP BY rang ORDER BY rang;
$this->format_reponse .= '/rangs';
$this->requete_champ = 'count(*) as nombre, rang ';
$this->requete_group_by = ' GROUP BY rang ORDER BY rang ';
}
 
public function traiterRessourceStatsAnnees() {
// SELECT count(*) as nombre, annee FROM bdtfx_v2_00 GROUP BY annee ORDER BY annee;
$this->format_reponse .= '/annees';
$this->requete_champ = 'count(*) as nombre, annee ';
$this->requete_condition = null;
$this->requete_group_by = ' GROUP BY annee ORDER BY annee ';
}
 
public function traiterRessourceStatsInitiales() {
// SELECT count(left( nom_sci, 2 )) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre GROUP BY rang, left(nom_sci, 2);
$this->format_reponse .= '/initiales';
$this->requete_champ = 'count(left( nom_sci, 2 )) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre ';
$this->requete_group_by = ' GROUP BY rang, left(nom_sci, 2)';
}
 
 
 
//-----------------------------FONCTIONS DASSEMBLAGE DE LA REQUETE-----------------------------------------------------
 
public function assemblerLaRequete() {
if ( strrpos($this->format_reponse, 'noms/stats/') === false ) {
$this->mettreAuFormat(); //Ds CommunNomsTaxons.php
}
$requete = 'SELECT '.$this->retournerChamps().' '.
"FROM {$this->table} ".
$this->retournerRequeteCondition().' '.
$this->requete_group_by.' '.
$this->retournerOrderBy().' '.
$this->formerRequeteLimite() .
' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__ ;
return $requete;
}
 
public function retournerChamps() {
$sql = '';
if ($this->distinct) {
$sql .= $this->distinct.' ';
}
if ($this->requete_champ) {
$sql .= $this->requete_champ.' ';
}
 
// Champs "virtuels" pour tier sur l'ensemble des résultats
if (isset($this->parametres['retour.tri'])) {
list($champ, $ordre) = $this->decouperParametreRetourTri();
if ($champ == 'retenu') {
$sql .= ", IF(num_nom = num_nom_retenu, '0', '1') AS nom_retenu_tri ";
}
}
 
return $sql;
}
 
public function decouperParametreRetourTri() {
$tri = array('', '');
if (isset($this->parametres['retour.tri'])) {
if (preg_match('/^(retenu)(?:,(ASC|DESC)|)$/', $this->parametres['retour.tri'], $match))
$tri[0] = $match[1];
$tri[1] = isset($match[2]) ? $match[2] : '';
}
return $tri;
}
 
public function retournerRequeteCondition() {
$condition = '';
if ($this->requete_condition) {
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
}
return $condition;
}
 
public function retournerOrderBy() {
$orderBy = array();
 
// Tri sur l'ensemble des résultats
if (isset($this->parametres['retour.tri'])) {
list($champ, $ordre) = $this->decouperParametreRetourTri();
if ($champ == 'retenu') {
$orderBy[] = "nom_retenu_tri $ordre";
}
}
// Tri par défaut
if ($this->format_reponse == 'noms') {
$orderBy[] = 'nom_sci ASC';
}
 
$sql = '';
if (count($orderBy) > 0) {
$sql = 'ORDER BY '.implode(', ', $orderBy).' ';
}
return $sql;
}
 
public function formerRequeteLimite() {
if ($this->format_reponse != 'noms' && $this->format_reponse != 'noms/id/relations/synonymie'
&& $this->format_reponse != 'noms/id/relations/homonymie') {
$this->requete_limite = '';
} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat())) {
$this->limite_requete['depart'] =
(($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']);
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
} else {
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
}
return $this->requete_limite;
}
 
/** Recupere le nombre total de résultat d'une requete lancée. */
public function recupererTotalResultat() {
$total = null;
$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '.$this->table.$this->retournerRequeteCondition().$this->requete_group_by;
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($res) {
$total = $res['nombre'];
} else {
$e = 'Fct recupererTotalResultat() : <br/>Données introuvables dans la base';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
}
return $total;
}
 
 
//-------------------FONCTIONS POUR LE FORMATAGE EN JSON----------------------------------------------------------------
 
public function retournerResultatFormate($resultat) {
 
switch ($this->format_reponse) {
case 'noms/relations' :
$reponse = $this->formaterRelations($resultat[0]);
break;
case 'noms/id' : //ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterId($resultat[0]);
break;
case 'noms/id/relations' :
$reponse = $this->formaterIdRelations($resultat[0]);
break;
case 'noms/id/relations/synonymie' :
$reponse = $this->formaterIdSynonymie($resultat);
break;
case 'noms/id/relations/homonymie' :
$reponse = $this->formaterIdHomonymie($resultat);
break;
case 'noms/id/relations/flores' : //ds CommunsNomsTaxons
$reponse = $this->formaterIdFlores($resultat[0]);
break;
case 'noms/stats/annees' : //ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterStatsAnnee($resultat);
break;
case 'noms/stats/rangs' : //ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterStatsRang($resultat);
break;
case 'noms/stats/initiales' : //ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterStatsInitiales($resultat);
break;
case 'noms' :
$reponse = $this->formaterNoms($resultat);
break;
}
return $reponse;
}
 
//+---------------------concerne les resultats pour des requetes de type noms/id-----------------------------+
 
public function formaterRelations($resultat) {
$num_nom = $resultat['num_nom'];
if (isset($this->ressources[3])) {
$url = Config::get('url_service').$this->service."/$num_nom/relations";
} else {
$type = $this->ressources[3];
$url = Config::get('url_service')."/$this->service/$num_nom/relations/$type";
}
$res = $this->consulterHref($url);
return $res;
}
 
public function formaterIdRelations($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$this->resultat_req = $resultat;
$retour_id_rel = array ('entete' => array()); //on initialise pr que l'entete apparaisse en premier lors de l'affichage
 
//on recupère le resultat de chaque relation (appel du WS correspondant)
$flores = $this->ajouterRelations('flores');
if (isset($flores)) $retour_id_rel['resultat']['flores'] = $flores;
$homonymes = $this->ajouterRelations('homonymie');
if (isset($homonymes)) $retour_id_rel['resultat']['homonymes'] = $homonymes;
$synonymes = $this->ajouterRelations('synonymie');
if (isset($synonymes)) $retour_id_rel['resultat']['synonymes'] = $synonymes;
 
//on renvoit null si il n'existe aucune relations (on efface l'entete en premier lieu)
if (!isset($retour_id_rel['resultat'])) {
$retour_id_rel = null;
} else { //on rajoute l'entete si des relations existent
$this->afficherDonnees('num_nom', $this->ressources[0]);
$retour_id_rel['entete'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
return $retour_id_rel;
}
 
/**
* Recupere les relations (type de la relation passée en paramètres :[type_relation] = synonymie, homonymie ou
* flores) par l'appel du web service [version]/noms/#id/relations/[type_relation]
*/
public function ajouterRelations($relation) {
$version = str_replace(Config::get('bdd_table').'_', '', $this->table);
$res = null;
$parametres_url = '';
if ($this->parametres != array()) $parametres_url = '?'.http_build_query($this->parametres, '', '&');
$url = Config::get('url_service').'/'.$this->service.'/'
.$this->ressources[0].'/relations/'
.$relation.$parametres_url; Debug::printr($url);
 
$relation = $this->consulterHref($url);
 
$res = $relation->resultat;
return $res;
}
 
 
public function formaterIdSynonymie($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$retour_id_syn = array();
if ($resultat[0]['num_nom_retenu'] == '') return array('nom_retenu N.D.');
 
// 1 ou + résultat(s)
$retour_id_syn['entete'] = $this->afficherEnteteResultat('/'.$this->service.'/'.$this->ressources[0].'/relations/synonymie');
$retour_id_syn['entete']['id'] = $this->ressources[0];
$retour_id_syn['resultat'] = array();
 
// résultat contient aussi l'original
if(count($resultat) > 1) {
//on remplit d'abord l'entete du resultat
$this->table_retour['id'] = $this->ressources[0];
$this->afficherEnteteResultat('/'.$this->service.'/'.$this->ressources[0].'/relations/synonymie');
$retour_id_syn['entete'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
foreach ($resultat as $tab) {
//pour chaque basionyme, on recupère le résultat : num_nom, nom_sci, num_basionyme et num_nom_retenu :
$this->resultat_req = $tab;
$num = $tab['num_nom'];
$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num);
$this->afficherDonnees('num_basionyme', $tab['num_basionyme']);
$this->afficherDonnees('num_type', $tab['num_type']);
$this->afficherDonnees('num_type', $tab['num_type']);
$retour_id_syn['resultat'][$num] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
if (!isset($retour_id_syn['resultat']) && !in_array('nom_retenu N.D.', $retour_id_syn)) {
$retour_id_syn = null; //on initialise le resultat à null
}
}
return $retour_id_syn;
}
 
public function formaterIdHomonymie($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
if (count($resultat) != 1) {
$this->table_retour['id'] = $this->ressources[0];
$this->afficherEnteteResultat($resultat, '/'.$this->service.'/'.$this->ressources[0].'/relations/homonymie');
$retour_id_hom['entete'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
foreach ($resultat as $homonyme) {
$this->resultat_req = $homonyme;
$id = $homonyme['num_nom'];
$this->afficherDonnees('num_nom', $id);
if ($homonyme['num_nom_retenu'] != '') {
$retenu = ($id == $homonyme['num_nom_retenu']) ? 'true' : 'false';
} else {
$retenu = 'absent';
}
$this->table_retour['retenu'] = $retenu;
$retour_id_hom['resultat'][$id] = $this->table_retour;
unset($retour_id_hom['resultat'][$id]['id']);
$this->table_retour = array();
}
} else {
$retour_id_hom = null;
}
return $retour_id_hom;
}
 
public function obtenirSynonymesParNumNomAvecInfosFlore($num_nom, $version='1_02') {
 
$champs_flore = 'flore_bonnier_num, flore_bonnier_rem,'.
'flore_cnrs_num, flore_cnrs_rem '.
'flore_fe_num, flore_fe_rem '.
'flore_coste_num, flore_coste_rem '.
'flore_fh_num, flore_fh_rem '.
'flore_fournier_num, flore_fournier_rem';
 
$requete = 'SELECT num_nom, nom_sci, '.$champs_flore.' '.
'FROM '.$this->table.' '.
'WHERE num_nom_retenu = '.
'('.
'SELECT num_nom_retenu FROM '.$this->table.' WHERE num_nom = "'.$num_nom.'"'.
')';
 
return $this->getBdd()->recupererTous($requete . ' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__ );
}
 
public function formaterIdFlores($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp,noms_projets');
$this->resultat_req = $resultat;
$id = array_shift($resultat);
$reponse['entete']['id'] = $id;
$synonymes_flores = $this->obtenirSynonymesParNumNomAvecInfosFlore($this->ressources[0]);
if(is_array($synonymes_flores)) {
foreach ($synonymes_flores as $synonyme) {
$nom_sci = $synonyme['nom_sci'];
$num_nom = $synonyme['num_nom'];
unset($synonyme['nom_sci']);
unset($synonyme['num_nom']);
foreach ($synonyme as $flores => $valeur) {
if ($valeur != '' && $valeur != '0') {
$this->afficherInfosFlore($synonyme, $flores, $valeur, $nom_sci, $num_nom);
}
}
}
}
 
if ($this->table_retour != array()) {
$reponse['resultat'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
} else {
$reponse = null;
}
return $reponse;
}
 
public function getNomCompletFlore($flore) {
return Config::get($flore.'_texte');
}
 
public function afficherInfosFlore(&$resultat, $flores, $valeur, $nom_sci, $num_nom) {
$flore = substr($flores,0,strrpos($flores, '_'));
$projet = $this->noms_projets[$flore];
 
//TODO voir si l'on peut factoriser les affectations à la table retour
// et simplifier ce gros pavé
if (strrpos($flores, 'num') !== false) {
if (preg_match('/^([0-9]+)(?:[.]syn[^a-z]*|(.*))?$/', $valeur, $match)) {
$this->table_retour[$num_nom][$flore]['id'] = $match[1];
if ($projet == 'coste') {
$this->table_retour[$num_nom][$flore]['href'] = $this->ajouterHrefAutreProjet('noms', 'nn_coste:', $match[1], $projet);
}
if (isset($match[2]) && $match[2] != '') $this->table_retour[$num_nom][$flore]['cle'] = $match[2];
$this->table_retour[$num_nom][$flore]['nom_flore'] = $this->getNomCompletFlore($flore);
$this->table_retour[$num_nom][$flore]['nom_sci'] = $nom_sci;
}
if (isset($resultat[$flore.'_rem']) && !empty($resultat[$flore.'_rem'])) {
$this->table_retour[$num_nom][$flore]['remarque'] = $resultat[$flore.'_rem'];
$this->table_retour[$num_nom][$flore]['nom_flore'] = $this->getNomCompletFlore($flore);
$this->table_retour[$num_nom][$flore]['nom_sci'] = $nom_sci;
unset($resultat[$flore.'_rem']);
}
} elseif (strrpos($flores,'belge') !== false) {
if (preg_match('/^([0-9]+) (R|S)?$/', $valeur, $match)) {
if (isset($match[2])) $type = ($match[2] == 'R') ? 'taxons' : 'synonyme';
$this->table_retour[$num_nom][$flore]['page'] = $match[1];
$this->table_retour[$num_nom][$flore]['type'] = $type;
$this->table_retour[$num_nom][$flore]['nom_flore'] = $this->getNomCompletFlore($flore);
$this->table_retour[$num_nom][$flore]['nom_sci'] = $nom_sci;
}
}
}
 
//+---------------------concerne les resultats pour des requetes de type /noms avec ou sans paramètres-------+
 
public function formaterNoms($resultat) {
if ($this->parametres['retour.format'] == 'oss') {
$reponse = $this->formaterEnOss($resultat); //Ds CommunNomsTaxons.php
} else {
$reponse = $this->formaterEnJsonMax($resultat);
}
return $reponse;
}
 
public function formaterEnJsonMax($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
 
// TODO : améliorer le tri des résultats
// ATTENTION : ce comportement est étrange
$masque = $this->recupererMasquePrincipal();
if ($masque && isset($this->parametres[$masque[0]] /* à éclaircir */ ) && !isset($this->parametres['retour.tri'])) {
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres[$masque[0]], $resultat, $masque[1]);
}
 
// Tri à la mode du CeL : lexicographique puis noms retenus (retour.tri = "alpharet")
if (isset($this->parametres['retour.tri']) && ($this->parametres['retour.tri'] == "alpharet")) {
usort($resultat, array($this, 'genrePuisNomsRetenusEnTete'));
}
 
$table_retour_json['entete'] = $this->afficherEnteteResultat('/'.$this->service);
$table_retour_json['resultat'] = $this->remplirJsonResultat($resultat);
return $table_retour_json;
}
 
// Trie les éléments du tableau de résultats : le genre en tête, puis les noms retenus, puis le reste
// mais à partir du jeu de données retourné par SQL (indépendents du statut "retenu")
private function genrePuisNomsRetenusEnTete($a, $b) {
// On pourrait utiliser l'indice ['retenu'] mais il contient parfois "absent", qui est dur à traiter
$aEstRetenu = ($a['num_nom'] == $a['num_nom_retenu']);
$bEstRetenu = ($b['num_nom'] == $b['num_nom_retenu']);
$retour = 0;
 
// les noms retenus en premier ("inférieurs")
if ($aEstRetenu) {
if (! $bEstRetenu) {
$retour = -1;
}
} else {
if ($bEstRetenu) {
$retour = 1;
}
}
 
// en cas d'égalité on conserve le tri lexicographique - devrait faire sortir le genre en première position
// car il ne contient pas le nom d'auteur
if ($retour == 0) {
$retour = strcasecmp($a['nom_sci'], $b['nom_sci']);
}
 
return $retour;
}
 
public function remplirJsonResultat($resultat) {
$champs = null;
if (array_key_exists('retour.champs', $this->parametres)) {
$champs = explode(',', $this->parametres['retour.champs']);
}
 
// Structure des données: objet ou liste ?
$modeListe = false;
if (array_key_exists('retour.structure', $this->parametres)) {
$modeListe = ($this->parametres['retour.structure'] === "liste");
}
 
$noms = array();
foreach ($resultat as $tab) {
$this->table_retour = array();
$num = $tab['num_nom'];
$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num); // ajoute le nom_sci, href et si le nom est retenu dans $this->table_retour
$retour = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
if ($champs != null) {
$reponse_id = $this->formaterId($tab);
$this->table_retour = array();
$this->ajouterChampsPersonnalises($champs, $reponse_id);
$retour = array_merge($retour, $this->table_retour);
}
if ($modeListe) {
$retour['num_nom'] = intval($num);
$noms[] = $retour;
} else {
$noms[$num] = $retour;
}
}
 
return $noms;
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/lbf/Taxons.php
New file
0,0 → 1,522
<?php
 
// declare(encoding='UTF-8');// ou ISO-8859-15
/**
* Description :
* Classe Taxons.php permettant de fournir des informations sur les noms scientifiques retenu.
* Si l'url finit par /taxons on retourne une liste de noms latin et leurs identifiants (seulement les 100 premeiers noms par défaut).
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /taxons?param1=val1&param2=val2&...
*
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, recherche, rang, distinct, retour.format, nl.format,
* nl.structure, navigation.depart et navigation.limite.
*
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package framework-v3
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-${year} Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
 
class Taxons extends CommunNomsTaxons {
/** Permet de stocker la requete formulée taxons | taxons/#id | taxons/#id/#champ+#champ ...*/
protected $format_reponse = 'taxons';
protected $service = 'taxons';
protected $requete_champ = 'num_nom, nom_sci, num_nom_retenu, num_taxonomique ';
protected $requete_condition = null;
protected $requete_group_by = ' ';
/** Permet de stocker les limite de la requete SQL (par défaut seul les 100 premiers résultats seront retournés).*/
protected $limite_requete = array('depart' => 0, 'limite' => 100);
protected $num_nom_taxon; //Stocke le num_nom du nom retenu du num_nom recherché
protected $presence_num_tax = true;
public function consulter($ressources, $parametres) {
return parent::consulter($ressources, $parametres);
}
public function traiterParametresSpecifiques() {
$this->requete_condition[] = 'num_nom = num_nom_retenu';
foreach ($this->parametres as $param => $val) {
switch ($param) {
case 'masque' :
$this->ajouterFiltreMasque('nom_sci', $val);
break;
case 'masque.nt' :
$this->requete_condition[] = "num_taxonomique IN ($val)";
$this->masque[] = "num_tax=$val";
break;
case 'masque.rg':
$this->requete_condition[] = 'rang = '.$this->getBdd()->proteger($val);
$this->masque[] = "rang=$val";
break;
}
}
}
//------------------------------------------Fonction ressources---------------------------------------------------------------------
public function gererNumTax() {
if (!in_array('num_taxonomique', $this->champs_table)) {
$this->presence_num_tax = false;
$this->requete_champ = str_replace(', num_taxonomique ', '', $this->requete_champ);
} else {
$this->presence_num_tax = true;
}
}
public function traiterRessourcesIdentifiant() {
$this->format_reponse = 'taxons/id';
$this->traiterRessourceNtId();
$this->num_nom_taxon = $this->recupererNumNomTaxon(); //on recupere le taxon correspondant au num_nom recherché
if ($this->entete_http == '') {
$this->requete_condition[0] = 'num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($this->num_nom_taxon);
if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {
//---------------- requete de type taxons/#id/#champ+#champ--------------------------------------
if ($this->ressources[1] != 'relations') { // SELECT *, nom_sci FROM bftfx_v2_00 WHERE num_nom = X;
$this->requete_champ = ' *, nom_sci ';
$this->format_reponse .= '/champ';
//---------------- requete de type taxons/#id/relations/#relation--------------------------------
} elseif ($this->ressources[1] == 'relations') {
$this->traiterRessourceIdRelations();
} else {
$e = 'Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : <br/>
<li> #id/relations </li> <li> #id/#champ+#champ </li> <li> #id/relations </li>
<li> #id/relations/inferieurs </li> <li> #id/relations/superieurs </li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
} else { //--------------- requete de type taxons/#id-----------------------------------------------------
$this->requete_champ = ' *, nom_sci ';
}
}
}
public function traiterRessourceNtId() {
if (strrpos($this->ressources[0], 'nt:') !== false) {
if ($this->presence_num_tax) {
// SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = num_nom_retenu AND num_taxonomique = X;
$this->requete_condition[0] = ' num_taxonomique = '
.str_replace('nt:', '', $this->ressources[0]).' ';
} else {
$e = 'Erreur dans votre requête : </br> Le numéro taxonomique n\'existe pas dans ce projet';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
} else {
// SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = (SELECT num_nom_retenu FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
$this->requete_condition[0] = 'num_nom = '.$this->ressources[0];
}
}
/** Permet de récupérer le num_nom du taxon recherché. Soit le numéro taxonomique est demandé (avec nt: )
* soit un num_nom dont on recherche le num_nom_retenu */
public function recupererNumNomTaxon() {
$identifiant = '';
if ($this->entete_http == '') {
//on récupere l'identifiant du taxon correspondant au num_nom ou num_taxonomique demandé pour pouvoir l'afficher
$req_tax = 'SELECT num_nom_retenu FROM '.$this->table.' WHERE '.$this->requete_condition[0];
$res_tax = $this->getBdd()->recuperer($req_tax . ' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__ );
//on recherche ensuite les identifiants des taxons supérieurs ou inférieurs
if ($res_tax && $res_tax != '') {
$identifiant = $res_tax['num_nom_retenu'];
} else {
$e = 'Le numéro de taxon ou l\'identifiant de nom correspondant au num_nom '
.$this->ressources[0].' n\'existe pas dans la base.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
Debug::printr($req_tax);
}
}
return $identifiant;
}
public function traiterRessourceIdRelations() {
//----------------- requete de type taxons/#id/relations-------------------------------------------
// SELECT *, nom_sci FROM bftfx_v2_00 WHERE num_nom = X;
$this->format_reponse .= '/relations';
if (isset($this->ressources[2]) && !empty($this->ressources[2])) {
//------------- requete de type taxons/#id/relations/#relation--------------------------------
switch ($this->ressources[2]) {
case 'superieurs' :
$rel = 'recupererIdSup';
$this->format_reponse .= '/superieurs';
$this->traiterRessourceIdRelationInfSup($rel);
break;
case 'inferieurs' :
$rel = 'recupererIdInf';
$this->format_reponse .= '/inferieurs';
$this->traiterRessourceIdRelationInfSup($rel);
break;
case 'hierarchie' :
$rel = 'recupererIdHierarchie';
$this->format_reponse .= '/hierarchie';
$this->traiterRessourceIdRelationHierarchie($rel);
break;
default :
$e = 'Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : <br/>
<li> taxons/#id/relations </li><li> #id/relations/inferieurs </li>
<li> #id/relations/superieurs </li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
break;
}
}
}
public function traiterRessourceIdRelationInfSup($rel) {
//Appel de la fct récupérerIdSup ou recupererIdInf : retourne les num_nom des noms inferieurs ou superieurs
$res_relation = $this->$rel();
//analyse du résultat retourné par la requete de recherche des identifiants correspondant aux taxons inf|sup :
if ($res_relation == '') { //dans le cas ou la requete comporte des erreurs
$e = 'Fct traiterRessourceIdRelationInfSup : La requête forme comporte une erreur!';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
} elseif ($res_relation) {
//dans le cas ou une ou plusieurs relations est retournée, on récupère les identifiants ss la forme (id, id, id)
foreach ($res_relation as $ligne) $res[] = $ligne['num_nom'];
$res = implode(',',$res);
$this->requete_condition[0] = "num_nom IN ($res)";
$this->requete_champ .= ', rang, num_tax_sup ';
} else { //dans le cas ou aucune relation n'existe
$res = array($this->num_nom_taxon => null);
$this->corps_http = json_encode($res);
$this->entete_http = RestServeur::HTTP_CODE_OK;
}
}
public function traiterRessourceIdRelationHierarchie($rel) {
//Appel de la fct récupérerIdSup ou recupererIdInf : retourne les num_nom des noms inferieurs ou superieurs
$res_relation = $this->$rel();
//analyse du résultat retourné par la requete de recherche des identifiants correspondant aux taxons inf|sup :
if ($res_relation == '') {
//dans le cas ou la requete comporte des erreurs
$e = 'Fct traiterRessourceIdRelationInfSup : La requête forme comporte une erreur!';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
} elseif ($res_relation) {
//dans le cas ou une ou plusieurs relations est retournée, on récupère les identifiants ss la forme (id, id, id)
foreach ($res_relation as $ligne) $res[] = $ligne['num_nom'];
$res = implode(',',$res);
$this->requete_condition[0] = "num_nom IN ($res)";
$this->requete_champ .= ', rang, num_tax_sup ';
} else { //dans le cas ou aucune relation n'existe
$res = array($this->num_nom_taxon => null);
$this->corps_http = json_encode($res);
$this->entete_http = RestServeur::HTTP_CODE_OK;
}
}
public function recupererIdHierarchie() {
$req_relation = 'SELECT num_nom FROM '.$this->table.' '.
' WHERE hierarchie LIKE CONCAT('.
'(SELECT hierarchie FROM '.
$this->table.' '.
'WHERE num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($this->num_nom_taxon).')'.
', '.$this->getBdd()->proteger($this->num_nom_taxon.'-%').
')';
$res_relation = $this->getBdd()->recupererTous($req_relation . ' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__ );
return $res_relation;
}
public function recupererIdInf() {
//SELECT num_nom FROM bfdtx_v2_00 WHERE num_tax_sup = (SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
$req_relation = 'SELECT num_nom FROM '.$this->table
.' WHERE num_nom = num_nom_retenu AND num_tax_sup = (SELECT num_nom FROM '
.$this->table
.' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition).')';
$res_relation = $this->getBdd()->recupererTous($req_relation . ' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__ );
return $res_relation;
}
public function recupererIdSup() {
//SELECT num_nom FROM bfdtx_v2_00 WHERE num_nom = (SELECT num_tax_sup FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
$this->requete_condition[] = "num_nom = num_nom_retenu" ;
$req_relation = 'SELECT num_tax_sup as num_nom FROM '.$this->table
.' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
$res_relation = $this->getBdd()->recupererTous($req_relation . ' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__ );
return $res_relation;
}
 
public function traiterRessourceStatsInitiales() {
// SELECT count(nom_sci) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre FROM bdtfx_v2_00 GROUP BY rang, left(nom_sci, 2);
$this->format_reponse = 'taxons/stats/initiales';
$this->requete_champ = 'count(nom_sci) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre ';
$this->requete_group_by = ' GROUP BY rang, left(nom_sci, 2) ';
}
public function traiterRessourceStatsRangs() {
// SELECT count(*) as nombre, rang FROM bdtfx_v2_00 [WHERE rang = 290] GROUP BY rang ORDER BY rang;
$this->format_reponse = 'taxons/stats/rangs';
$this->requete_champ = 'count(*) as nombre, rang ';
$this->requete_group_by = ' GROUP BY rang ORDER BY rang ';
}
public function traiterRessourceStatsAnnees() {
// SELECT count(*) as nombre, annee FROM bdtfx_v2_00 GROUP BY annee ORDER BY annee;
$this->format_reponse = 'taxons/stats/annees';
$this->requete_champ = 'count(*) as nombre, annee ';
$this->requete_group_by = ' GROUP BY annee ORDER BY annee ';
}
//-----------------------------FONCTIONS DASSEMBLAGE DE LA REQUETE-----------------------------------------------------
public function assemblerLaRequete() {
if ($this->format_reponse != 'taxons/stats/initiales') {
$this->mettreAuFormat(); //on remplace les nom_sci par les nom_sci_html
}
$requete = ' SELECT '.$this->requete_champ.
' FROM '.$this->table
.$this->retournerRequeteCondition()
.$this->requete_group_by
.$this->formerRequeteLimite() .
' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__ ;
return $requete;
}
public function formerRequeteLimite() {
if ($this->format_reponse != 'taxons' && $this->format_reponse != 'taxons/id/relations/homonymie') {
$this->requete_limite = '';
} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat())) {
$this->limite_requete['depart'] = (($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']);
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
} else {
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
}
return $this->requete_limite;
}
public function retournerRequeteCondition() {
$condition = '';
if ($this->requete_condition) {
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
}
return $condition;
}
public function recupererTotalResultat() {
$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '.$this->table.$this->retournerRequeteCondition().$this->requete_group_by;
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($res) {
$total = $res['nombre'];
}
return $total;
}
 
//-------------------------FONCTIONS DE FORMATION DU RESULTAT-----------------------------------------------------------
/** Permet de récupérer le résultat à retourner propre à chaque requete et de l'encoder en json*/
public function retournerResultatFormate($resultat, $version) {
$reponse = null;
switch ($this->format_reponse) {
case 'taxons/id' ://ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterId($resultat[0]);
break;
case 'taxons/id/champ' ://ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterIdChamp($resultat[0]);
break;
case 'taxons/id/relations' :
$reponse = $this->formaterIdRelations($resultat[0],$version);
break;
case 'taxons/id/relations/superieurs' :
$reponse = $this->formaterIdSuperieur($resultat, $version);
break;
case 'taxons/id/relations/inferieurs' :
$reponse = $this->formaterIdInferieur($resultat);
break;
case 'taxons/id/relations/hierarchie' :
// le formatage de la hiérarchie est identique aux relations inférieures
$reponse = $this->formaterIdInferieur($resultat);
break;
case 'taxons/stats/annees' : //ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterStatsAnnee($resultat);
break;
case 'taxons/stats/rangs' ://ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterStatsRang($resultat);
break;
case 'taxons/stats/initiales' ://ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterStatsInitiales($resultat);
break;
case 'taxons' :
$reponse = $this->formatertaxons($resultat);
break;
}
return $reponse;
}
//----------------------concerne les resultats pour des requetes de type /noms avec ou sans paramètres--------------
public function formaterTaxons($resultat) {
if ($this->parametres['retour.format'] == 'oss') {
$reponse = $this->formaterEnOss($resultat);
} else {
$reponse = $this->formaterEnJsonMax($resultat);
}
return $reponse;
}
public function formaterEnJsonMax($resultat) {
//print_r($resultat);
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$masque = $this->recupererMasquePrincipal();
if (isset($masque)) $resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres[$masque[0]], $resultat, $masque[1]);
$table_retour_json['entete'] = $this->afficherEnteteResultat('/'.$this->service);
//on remplit la table $table_retour_json['resultat']
$tab_tax_inf = $this->recupererListeTaxonInf($resultat);
foreach ($resultat as $tab) {
$num = $tab['num_nom'];
if (isset($this->parametres['masque.nt'])) $this->afficherDonnees('num_taxonomique', $tab['num_taxonomique']);
$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num);
$this->afficherTaxonInfNb($num, $tab_tax_inf);
$resultat_json[$num] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array(); //on vide le tableau table_retour
}
$table_retour_json['resultat'] = $resultat_json;
return $table_retour_json;
}
//--------------------concerne les resultats pour des requetes de type noms/id----------------------------------------
 
public function formaterIdRelations($resultat, $version) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$this->resultat_req = $resultat;
$retour_id_rel = array ('entete' => array()); //on initialise pr que l'entete apparaisse en premier
 
$superieurs = $this->ajouterRelations('superieurs'); //, $version);
if (isset($superieurs)) $retour_id_rel['resultat']['superieurs'] = $superieurs;
$inferieurs = $this->ajouterRelations('inferieurs', $version);
if (isset($inferieurs)) $retour_id_rel['resultat']['inferieurs'] = $inferieurs;
if (!isset($retour_id_rel['resultat'])) { //on renvoit un tableau null si il n'existe aucune relations
$retour_id_rel = 'null';
} else { //on rajoute l'entete si des relations existent
$this->afficherDonnees('num_nom', $this->num_nom_taxon); //$this->afficherEnteteResultat($resultat, '/'.$this->service.'/'.$this->ressources[0].'/relations/synonymie');
$retour_id_rel['entete'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
return $retour_id_rel;
}
public function ajouterRelations($relation, $version) {
$version = str_replace(Config::get('bdd_table').'_', '', $version);
$res = null;
$taxon = $this->num_nom_taxon;
$parametres_url = '';
if ($this->parametres != array()) $parametres_url = '?'.http_build_query($this->parametres, '', '&');
$url = Config::get('url_service').'/'
.$this->service.'/'.$version.'/'
.$this->ressources[0].'/relations/'
.$relation.$parametres_url;
$relation = $this->consulterHref($url);
if (isset($relation->resultat)) {
$res = $relation->resultat;
} elseif (isset($relation->$taxon)) { //pour les relations inf et sup
$res = $relation->$taxon;
}
return $res;
}
public function formaterIdSuperieur($resultat, $version) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$tab_relation = null; //si il n'existe aucune relation
$taxon_sup_traites = array();
if (($resultat) != '' ) {
//on recupere d'abord les rangs supérieurs
$sup = $resultat[0];
do {
$sup = $this->recupererIdSuperieur($sup['num_tax_sup'], $version);
if(!in_array($sup['num_nom'], $taxon_sup_traites)) {
$taxon_sup_traites[] = $sup['num_nom'];
} else {
$sup = null;
}
if ($sup['rang'] == '0') $sup['rang'] = '10'; //erreur dans la base
if (isset($sup)) $resultat[] = $sup;
} while ($sup != null);
krsort($resultat);
//on les affiche ensuite
foreach ($resultat as $tab) {
$this->resultat_req = $tab;
$num = $tab['num_nom'];
$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num);
$this->afficherDonnees('rang', $tab['rang']);
$tab_inf[$num] = $this->table_retour;
$tab_inf[$num]['num_nom'] = $tab['num_nom'];
$this->table_retour = array();
}
$tab_relation[$this->num_nom_taxon] = $tab_inf;
}
return $tab_relation;
}
public function recupererIdSuperieur($id, $version) {
$req = 'SELECT num_nom, num_nom_retenu, num_tax_sup, rang, nom_sci FROM '
.$version.' WHERE num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($id);
$res = $this->getBdd()->recupererTous($req . ' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__ );
if ($res) {
$resultat = $res[0];
} else {
$resultat = null; //on return null si il n'y a pas de taxon superieur
}
return $resultat;
}
public function formaterIdInferieur($resultat) {
// Attention à l'ordre, on doit d'abord récupérer correpondance_champs avant champs_api
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$tab_relation = null;
if (($resultat) != array()) {
foreach ($resultat as $tab) {
$this->resultat_req = $tab;
$num = $tab['num_nom'];
$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num);
if(!empty($tab['rang'])) {
$this->afficherDonnees('rang', $tab['rang']);
}
$tab_inf[$num] = $this->table_retour;
$tab_inf[$num]['nom_sci'] = $tab['nom_sci'];
$tab_inf[$num]['num_nom'] = $tab['num_nom'];
$this->table_retour = array();
}
$tab_relation[$this->num_nom_taxon] = $tab_inf;
}
return $tab_relation;
}
public function afficherTaxonInfNb($num, $tab_tax_inf) {
foreach ($tab_tax_inf as $taxNb) {
if ($taxNb['num_tax_sup'] == $num) {
$this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'] = $taxNb['nb'];
}
}
if (!isset($this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'])) {
$this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'] = '0';
}
}
public function recupererListeTaxonInf($resultat) {
// SELECT num_tax_sup, count(*) as nb FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_tax_sup IN (id, id, id) AND num_nom = num_nom_retenu GROUP BY num_tax_sup';
foreach ($resultat as $tab) {
$tab_num[] = $tab['num_nom']; //on regroupe ici les id des taxons dont on cherche le nb de taxon inf
}
$req = 'SELECT num_tax_sup, count(*) as nb FROM '.$this->table
.' WHERE num_tax_sup IN ('.implode(',',$tab_num)
.') AND num_nom = num_nom_retenu GROUP BY num_tax_sup';
$res = $this->getBdd()->recupererTous($req . ' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__ );
if ($res) {
$resultat = $res;
} else {
$resultat = array(); //on retourne un tableau vide s'il n'y a pas de taxon inférieurs
}
return $resultat;
}
}
 
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/apd/CommunNomsTaxons.php
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<?php
// declare(encoding='UTF-8');
/**
* Description :
* Classe CommunNomsTaxons.php
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package framework-v3
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
 
abstract class CommunNomsTaxons extends Commun {
 
/** Tableau de correspondance entre les noms des champs et les codes de l'ontologie.*/
private $relationsChampsCodesOntologie = null;
protected $table_retour; //Permet de stocker le tableau de résultat (non encodé en json)
protected $resultat_req; // Permet de stocker le résultat de la requete principale.
protected $compo_nom = null; //Stocke sous forme de tableau les composant du nom à ajouter au nom scientifique
protected $table;// Nom de la table dans laquelle on récupèrera les données dans les requetes SQL
protected $total_resultat = null;
/** Stocke le service appelé correspondant. Est utilisé principalement lors de l'affichage du href d'un synonyme
(ex id=12, basionyme num 25 est un synonyme) dans le service taxon */
protected $service_href = null;
protected $erreursParametres = null;
protected $sans_nom_sci = array('gen','sp','ssp','fam','au_ss','bib_ss');
private $bib_traitees = array();
private $ontologie = array();
 
//+------------------------------- PARAMÈTRES ---------------------------------------------------------------+
 
public function traiterParametres() {
$this->definirParametresParDefaut();
$this->verifierParametres();
 
if (isset($this->parametres) && count($this->parametres) > 0) {
foreach ($this->parametres as $param => $val) {
switch ($param) {
case 'ns.structure' :
$this->remplirTableCompositionNom($val);
if (in_array($val,$this->sans_nom_sci)){
$this->requete_champ = implode(', ',$this->compo_nom);
}else {
$this->requete_champ .= ' ,'.implode(', ',$this->compo_nom);
}
break;
case 'navigation.depart' :
$this->limite_requete['depart'] = $val;
break;
case 'navigation.limite' :
$this->limite_requete['limite'] = $val;
break;
}
}
$this->traiterParametresSpecifiques();
}
}
 
protected function definirParametresParDefaut() {
if (empty($this->parametres['recherche'])) {
$this->parametres['recherche'] = 'stricte';
}
if (empty($this->parametres['ns.format'])) {
$this->parametres['ns.format'] = 'txt';
}
if (empty($this->parametres['retour.format'])) {
$this->parametres['retour.format'] = 'max';
}
if (empty($this->parametres['ns.structure']) &&
$this->parametres['retour.format'] != 'oss') {
$this->parametres['ns.structure'] = 'au,an,bib';
}
}
 
 
public function verifierParametres() {
//$this->verifierParametresAPI();
 
$this->verifierParametre('recherche', 'stricte|floue|etendue|complete');
$this->verifierParametre('ns.format', 'htm|txt');
$this->verifierParametre('retour.format', 'min|max|oss|perso');
$this->verifierParametreAvecValeurMultipe('ns.structure', 'an|au|bib|ad|gen|sp|ssp|fam|au_ss|bib_ss');
 
/*if (count($this->erreursParametres) > 0) {
$m = 'Erreur dans votre requête : '.implode('<br/>', $this->erreursParametres);
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $m);
}*/
}
 
public function verifierParametresAPI() {
$parametresApi = $this->recupererTableauConfig('parametresAPI');
while (!is_null($parametre = key($this->parametres))) {
if (!in_array($parametre, $parametresApi)) {
$this->erreursParametres[] = "Le paramètre '$parametre' n'est pas pris en compte par cette version de l'API.";
}
next($this->parametres);
}
}
 
public function verifierParametre($parametre, $valeursPermises) {
if (isset($this->parametres[$parametre]) && !empty($this->parametres[$parametre])) {
$valeur = $this->parametres[$parametre];
$this->verifierValeursPermises($parametre, $valeur, $valeursPermises);
}
}
 
public function verifierParametreAvecValeurMultipe($parametre, $valeursPermises) {
if (isset($this->parametres[$parametre]) && !empty($this->parametres[$parametre])) {
$valeursConcatenees = $this->parametres[$parametre];
$valeurs = explode(',', $valeursConcatenees);
foreach ($valeurs as $valeur) {
$this->verifierValeursPermises($parametre, $valeur, $valeursPermises);
}
}
}
 
private function verifierValeursPermises($parametre, $valeur, $valeursPermises) {
if (!in_array($valeur, explode('|', $valeursPermises))) {
$this->erreursParametres[] = "Le paramètre '$parametre' ne peut pas prendre la valeur '$valeur'. Valeurs permises : $valeursPermises";
}
}
 
public function traiterParametresCommuns() {
 
}
 
public function ajouterFiltreMasque($nom_champ, $valeur) {
$valeur = explode(',',$valeur);
$conditions = array();
if ($nom_champ == 'annee' || $nom_champ == 'rang') {
foreach ($valeur as $val) {
$conditions[] = "$nom_champ = ".$this->getBdd()->proteger($val);
}
} else {
if ($this->parametres['recherche'] == 'etendue') {
foreach ($valeur as $val) {
$val = $this->modifierValeur($val);
$conditions[] = "$nom_champ LIKE ".$this->getBdd()->proteger($val);
}
 
} elseif ($this->parametres['recherche'] == 'floue') {
foreach ($valeur as $val) {
$val = $this->getBdd()->proteger($val);
$conditions[] = "( SOUNDEX($nom_champ) = SOUNDEX($val))".
" OR ( SOUNDEX(REVERSE($nom_champ)) = SOUNDEX(REVERSE($val)))";
}
} else {
foreach ($valeur as $val) {
$conditions[] = "$nom_champ LIKE ".$this->getBdd()->proteger($val);
}
}
}
$this->requete_condition[]= '('.implode(' OR ', $conditions ).')';
$this->masque[$nom_champ] = $nom_champ.'='.implode(',',$valeur);
}
 
private function modifierValeur($valeur) {
$valeur = $this->remplacerCaractereHybrideEtChimere($valeur);
$valeur = $this->preparerChainePourRechercheEtendue($valeur);
return $valeur;
}
 
private function remplacerCaractereHybrideEtChimere($valeur) {
$caracteres = array('×', '%D7', '+', '%2B');
$remplacements = array('x ','x ', '+', '+');
$valeur = str_replace($caracteres, $remplacements, $valeur);
return $valeur;
}
 
private function preparerChainePourRechercheEtendue($valeur) {
$valeur = str_replace(' ', '% ', trim($valeur));
$valeur = $valeur.'%';
return $valeur;
}
 
//+-------------------------------Fonctions d'analyse des ressources-------------------------------------+
 
private function etreRessourceId() {
$ok = false;
if ($this->estUnIdentifiant() && count($this->ressources) == 1) {
$ok = true;
}
return $ok;
}
 
public function traiterRessources() {
if (isset($this->ressources) && count($this->ressources) > 0) {
if ($this->ressources[0] == 'relations') {
$this->traiterRessourceRelations();
} elseif ($this->estUnIdentifiant()) { //l'identifiant peut etre de type /#id ou /nt:#id
$this->traiterRessourcesIdentifiant(); // dans le service noms ou taxons
} elseif ($this->ressources[0] == 'stats') { //ressource = noms/stats
$this->traiterRessourcesStats();
} else {
$e = 'Erreur dans votre requete </br> Ressources disponibles : <br/>
<li> /'.$this->service.'/#id (id : L\'identifiant du nom rechercher)</li>
<li> /'.$this->service.'/nt:#id (id : Numero du taxon recherche)</li>
<li> /'.$this->service.'/stats </li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
}
 
public function traiterRessourcesStats() {
$this->format_reponse = $this->service.'/stats';
 
$e = "Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : $this->service/stats/[annees|rangs|initiales]";
if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {
switch ($this->ressources[1]) {
case 'annees' :
$this->traiterRessourceStatsAnnees();
break;
case 'rangs' :
$this->traiterRessourceStatsRangs();
break;
case 'initiales' :
$this->traiterRessourceStatsInitiales();
break;
default :
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
break;
}
} else {
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
 
/** Vérifie si la première valeur de la table de ressource est un identifiant :
* un numerique ou un numéro taxonomique sous la forme nt:xx */
public function estUnIdentifiant() {
return (is_numeric($this->ressources[0]) || (strrpos($this->ressources[0],'nt:') !== false
&& is_numeric(str_replace('nt:','',$this->ressources[0]))));
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// Fonction d'analyse des parametres
 
/** Permet de remplir le tableau compo_nom. Il comprendra en fct du paramètre ns.structure les éléments à rajouter
* au nom_sci (annee, auteur, biblio ou addendum). */
public function remplirTableCompositionNom($valeur) {
$structure_nom = explode(',', $valeur);
foreach ($structure_nom as $structure) {
$structure = trim($structure);
$patterns = array('/^an$/', '/^au$/', '/^bib$/', '/^ad$/', '/^sp$/', '/^gen$/', '/^ssp$/','/^fam$/',
'/^au_ss$/','/^bib_ss$/');
$champs = array('annee', 'auteur', 'biblio_origine', 'nom_addendum', 'epithete_sp', 'genre',
'epithete_infra_sp','famille','auteur', 'biblio_origine');
 
// avec str_replace() 'sp' est inclu dans 'ssp', et la conversion pour 'ssp' est mauvaise
$this->compo_nom[$structure] = preg_replace($patterns, $champs, $structure);
}
}
 
public function mettreAuFormat() {
if ($this->parametres['ns.format'] == 'htm') {
if (strrpos($this->requete_champ, 'nom_sci_html as nom_sci') === false) {
$this->requete_champ = str_replace('nom_sci', 'nom_sci_html as nom_sci', $this->requete_champ);
}
}
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// Fonctions de formatage
 
/** Fonction permettant de creer la table dont le nom est passé en paramètre (champs_api, champs_bdtfx,
* correspondance_champs...). Les données de chaque table sont présentes dans le fichier de configuration config.ini
* @param String $table : Peut contenir plusieurs nom de table dont on souhaite récupérer les données : table,table,table. */
public function recupererTableSignification($table) {
$tables = explode(',', $table);
foreach ($tables as $tab) {
if ($tab == 'champs_comp') {
$champ_bdnff_api = array_keys($this->champs_api); //on recupère le nom des champ ds la bdd
$this->champs_comp = array_diff($this->champs_table, $champ_bdnff_api);
} elseif ($tab == 'champs_api') {
foreach ($this->correspondance_champs as $key => $val) {
preg_match('/(hybride[.]parent_0[12](?:[.]notes)?|nom_sci[.][^.]+|[^.]+)(?:[.](id|code))?/', $val, $match);
$val = $match[1];
$this->champs_api[$key] = $val;
}
} else {
$this->$tab = $this->recupererTableauConfig($tab);
}
}
}
 
public function formaterEnOss($resultat) {
$table_nom = array();
$oss = '';
foreach ($resultat as $tab) {
if (isset($tab['nom_sci']) ) {
if (!in_array($tab['nom_sci'], $table_nom)) {
$table_nom[] = $tab['nom_sci'];
$oss[] = $tab['nom_sci'].' '.$this->ajouterCompositionNom($tab);
}
}else {
$res = $this->ajouterCompositionNom($tab);
if($res) {
$oss[] = $res;
}
}
 
}
 
if (isset($this->masque)) $masque = implode('&', $this->masque);
else $masque = 'Pas de masque';
$table_retour_oss = array($masque, $oss);
return $table_retour_oss;
}
 
public function afficherEnteteResultat($url_service) {
$this->table_retour['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$this->table_retour['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$this->table_retour['total'] = $this->total_resultat;
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, $url_service);
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') {
$this->table_retour['href.precedent'] = $url['precedent'];
}
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') {
$this->table_retour['href.suivant'] = $url['suivant'];
}
}
 
public function afficherNomHrefRetenu($tab, $num) {
$this->resultat_req = $tab;
$this->afficherDonnees('num_nom', $num);
if ($this->parametres['retour.format'] == 'min') { // sinon est affiché ds afficherDonnees(num_nom, $val) ci-dessus
$this->table_retour['nom_sci'] = $tab['nom_sci'];
$this->table_retour['nom_sci_complet'] = $tab['nom_sci'].' '.$this->ajouterCompositionNom($tab);
}
if ($tab['num_nom_retenu'] != '') {
$retenu = ($tab['num_nom_retenu'] == $num) ? 'true' : 'false';
} else {
$retenu = 'absent';
}
$this->table_retour['retenu'] = $retenu;
unset($this->table_retour['id']);
}
 
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// Fonction de formatage pour les services /#id/
 
public function formaterId($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$this->resultat_req = $resultat;
 
foreach ($resultat as $cle => $valeur) {
if ($valeur != '') {
$this->afficherDonnees($cle, $valeur);
}
}
if (isset($this->parametres['retour.champs']) && $this->format_reponse == 'noms/id') {
$retour = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
$champs = explode(',', $this->parametres['retour.champs']);
$this->ajouterChampsPersonnalises($champs, $retour);
}
unset($this->table_retour['href']);
return $this->table_retour;
}
 
public function formaterIdChamp($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$reponse_id = $this->formaterId($resultat);
$this->table_retour = array();
$champs = explode(' ', $this->ressources[1]);
$this->ajouterChampsPersonnalises($champs, $reponse_id);
return $this->table_retour;
}
 
protected function ajouterChampsPersonnalises($champs, $reponse_id) {
$champs_a_libeller = array('nom_retenu', 'rang', 'num_basionyme', 'hybride', 'hybride.parent_01',
'hybride.parent_02', 'presence', 'tax_sup', 'statut_origine', 'statut_culture', 'statut_introduction');
$champs_forces = array('rang'); // même s'ils sont dans "à libeller", on les prend quand même en brut, en plus
if (! is_null($champs) && is_array($champs) && count($champs) > 0) {
foreach ($champs as $champ) {
if ($this->verifierValiditeChamp($champ)) {
if (strrpos($champ, '.*') !== false) {
$this->afficherPointEtoile($champ, $reponse_id);
} elseif (in_array($champ, $champs_a_libeller)) {
$this->table_retour[$champ.'.libelle'] =
(isset($reponse_id[$champ.'.libelle'])) ? $reponse_id[$champ.'.libelle'] : null;
} else {
$champ = $this->trouverChampBddCorrespondant($champ);
$this->table_retour[$champ] = (isset($reponse_id[$champ])) ? $reponse_id[$champ] : null;
}
// champs bruts en plus, ajouté pour obtenir le rang, mais retourne rang.code avec du kk dedans :-/
if (in_array($champ, $champs_forces)) {
$champ = $this->trouverChampBddCorrespondant($champ);
$this->table_retour[$champ] = (isset($reponse_id[$champ])) ? $reponse_id[$champ] : null;
}
}
}
}
}
 
public function afficherPointEtoile($champ, $reponse) {
preg_match('/^([^.]+\.)\*$/', $champ, $match);
if ($match[1] == 'nom_sci') {
$this->afficherNomSciPointEpithete($this->resultat_req);
} else {
foreach ($reponse as $chp => $valeur) {
if (strrpos($chp, $match[1]) !== false) {
if ($valeur != '') {
$this->table_retour[$chp] = $valeur;
} else {
$this->table_retour[$chp] = null;
}
}
}
}
}
 
public function decomposerNomChamp($champ) {
$decomposition = false;
if (preg_match('/^(?:([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+))(?:\.(.+))?$/', $champ, $match)) {
$radical_champ = $match[1];
$suffixe = (isset($match[2])) ? $match[2] : "";
$decomposition = array($radical_champ, $suffixe);
}
return $decomposition;
}
 
public function verifierValiditeChamp($champ) {
$decomposition = $this->decomposerNomChamp($champ);
$validite_ressource = true;
if ($decomposition) {
list($radical, $suffixe) = $decomposition;
$champs_complementaire = array('nom_retenu_complet', 'basionyme_complet');
// on verifie si le nom du champ existe bien
if (!$this->estChampApi($radical) && !$this->estChampComplementaire($radical)) {
if (!in_array($radical, $champs_complementaire)) {
$validite_ressource = false;
$e = 'Le champ "'.$radical.'" n\'existe pas dans la base. <br/><br/>';
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
} elseif ($this->estUnPoint($champ)) {
$validite_ressource = $this->verifierValiditeSuffixe($suffixe, $radical);
}
}
return $validite_ressource;
}
 
public function estChampApi($radical_champ) {
$champ_api_ok = false;
if (in_array($radical_champ, $this->champs_api) || in_array($radical_champ, $this->correspondance_champs)) {
$champ_api_ok = true;
}
return $champ_api_ok;
}
 
public function estChampComplementaire($radical_champ) {
$champ_complementaire_ok = in_array($radical_champ, $this->champs_comp) ? true : false;
return $champ_complementaire_ok;
}
 
public function verifierValiditeSuffixe($suffixe, $radical_champ) {
$validite_ressource = true;
if ($this->correspondAUnId($radical_champ) || $radical_champ == 'id') {
$this->verificationSuffixesIdentifiant($suffixe, $radical_champ, $validite_ressource);
} elseif ($this->correspondAUnCode($radical_champ)) {
$this->verificationSuffixesCodes($suffixe, $radical_champ, $validite_ressource);
} elseif ($radical_champ == 'nom_sci') {
if ($suffixe != '*') {
$validite_ressource = false;
$m = 'Erreur : Le suffixe demandé n\'existe pas pour le champ "'.$radical_champ.'".<br/>
Les suffixes possibles sont les suivants : <li> * </li>';
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $m);
}
} else {
$validite_ressource = false;
$m = 'Erreur : Le paramètre "'.$radical_champ.'" ne peut pas présenter de suffixe. <br/><br/>';
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $m);
}
return $validite_ressource;
}
 
public function verificationSuffixesCodes(&$suffixe, &$radical_champ, &$validite_ressource ) {
if (!in_array($suffixe, array('*', 'code', 'href', 'details'))) {
$validite_ressource = false;
$e = 'Erreur : Le suffixe demandé n\'existe pas pour le champ "'.$radical_champ.'.<br/> Les suffixes '
.'possibles sont les suivants : <li> .* </li><li> .code </li><li> .href </li><li> .details </li>';
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
 
public function verificationSuffixesIdentifiant(&$suffixe, &$radical_champ, &$validite_ressource) {
if ((strrpos($radical_champ, 'parent') !== false && !in_array($suffixe, array('*', 'id', 'href', 'details', 'notes')))
|| !in_array($suffixe, array('*', 'id', 'href', 'details')) && strrpos($radical_champ, 'parent') === false) {
$validite_ressource = false;
$e = 'Erreur : Le suffixe demandé n\'existe pas pour le champ "'.$radical_champ.'".<br/> Les suffixes '
.'possibles sont les suivants : <li> .* </li><li> .id </li><li> .href </li><li> .details </li>'
.'<li> .notes (seulement pour les hybride.parent)';
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
 
 
//------------------------------fonction de formatage pour les services /stats/-----------------------------------------
 
public function formaterStatsAnnee($resultat) {
foreach ($resultat as $cle_annee) {
$annee = ($cle_annee['annee'] != '') ? $cle_annee['annee'] : 'ND';
$nb = $cle_annee['nombre'];
$retour_stats_annee[$annee] = $nb;
}
return $retour_stats_annee;
}
 
public function formaterStatsRang($resultat) {
foreach ($resultat as $rangs) {
if ($rangs['rang'] != 0) {
$rang = $rangs['rang'];
if ($this->parametres['retour.format'] == 'max') {
$retour_rang[$rang]['rang'] = $this->ajouterSignificationCode('rang',$rang);
}
$nombre = $rangs['nombre'];
$retour_rang[$rang]['nombre'] = $nombre;
}
}
return $retour_rang;
}
 
public function formaterStatsInitiales($resultat) {
$rang = null;
$table_rang = array();
foreach ($resultat as $tuple) {
if ($tuple['rang'] != 0) {
$this->memoriserRang($table_rang, $tuple, $rang);
if ($tuple['lettre'] == 'x ') {
$this->ajouterHybrideChimere('hybride', $rang, $tuple);
} elseif ($tuple['lettre'] == '+ ') {
$this->ajouterHybrideChimere('chimere', $rang, $tuple);
} else {
$l = substr($tuple['lettre'], 0, 1);
if (isset($this->table_retour[$rang][$l])) {
$this->table_retour[$rang][substr($tuple['lettre'], 0, 1)] += floatval($tuple['nb']);
} else {
$this->table_retour[$rang][substr($tuple['lettre'], 0, 1)] = floatval($tuple['nb']);
}
}
}
}
return $this->table_retour;
}
 
public function memoriserRang(&$table_rang, $tuple, &$rang) {
if (is_array($table_rang)) {
if (!in_array($tuple['rang'], $table_rang)) {
$rang = $tuple['rang'];
$table_rang[] = $rang;
if ($this->parametres['retour.format'] == 'max') {
$rang = $this->ajouterSignificationCode('rang', $rang);
}
}
}
}
 
public function ajouterHybrideChimere($groupe, &$rang, &$tuple) {
if (isset($this->table_retour[$rang][str_replace('hybride', 'hyb', $groupe)])) {
$this->table_retour[$rang][$groupe] += floatval($tuple['nb']);
} else {
$this->table_retour[$rang][$groupe] = floatval($tuple['nb']);
}
}
 
//-----------------------------Fonctions d'affichage utiliser dans les fonctions de formatage---------------------------
 
public function afficherDonnees($champApi, $valeur) {
$champBdd = $this->trouverChampBddCorrespondant($champApi);
if ($this->parametres['retour.format'] == 'min') {
if ($champApi == 'nom_sci') {
$valeur = $valeur.' '.$this->ajouterCompositionNom($this->resultat_req);
}
if ($champApi == 'nom_sci_html') {
$valeur = $valeur.' '.$this->ajouterCompositionNom($this->resultat_req, 'htm');
}
$this->table_retour[$champBdd] = $valeur;
} else {
$this->afficherToutesLesInfos($champBdd, $valeur);
}
}
 
public function trouverChampBddCorrespondant($champApi) {
if (array_key_exists($champApi, $this->champs_api)) {
$champBdd = $this->correspondance_champs[$champApi];
} else {
$champBdd = $champApi;
}
return $champBdd;
}
 
public function afficherToutesLesInfos($nom_champ_api, $valeur) {
if ($this->presentePlusieursId($nom_champ_api, $valeur)) {
preg_match('/^([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+)(?:\.id)?$/', $nom_champ_api, $match);
$this->afficherInfosPrecises($match[1], 'details', $valeur);
$this->table_retour[$nom_champ_api] = $valeur;
 
} elseif (strrpos($nom_champ_api, 'parent') !== false && strrpos($nom_champ_api, 'notes') !== false) {
$this->table_retour[$nom_champ_api] = $valeur;
 
} elseif (($this->correspondAUnId($nom_champ_api) || $nom_champ_api == 'id' && $valeur != '0')) {
preg_match('/^([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+)(?:\.id)?$/', $nom_champ_api, $match);
$this->afficherInfosPrecises($match[1], 'id,signification,href', $valeur);
 
} elseif ($this->correspondAUnCode($nom_champ_api)) {
preg_match('/^([^.]+)(?:\.code)?$/', $nom_champ_api, $match);
$this->afficherInfosPrecises($match[1], 'code,signification,href', $valeur);
 
} elseif ($nom_champ_api == 'nom_sci_html') {
$this->table_retour['nom_sci_html'] = $valeur;
$this->table_retour['nom_sci_html_complet'] = $valeur.' '.$this->ajouterCompositionNom($this->resultat_req, 'htm');
}elseif ($nom_champ_api != 'nom_sci') {
$this->table_retour[$nom_champ_api] = $valeur;
}
}
 
public function presentePlusieursId($ressource, $valeur = null) {
if ($valeur) {
$presente = strrpos($ressource, 'proparte') !== false && strrpos($valeur, ',') !== false;
} else { //pour la vérification du champ, on ignore alors la valeur de la ressource
$presente = strrpos($ressource, 'proparte') !== false;
}
return $presente;
}
 
public function afficherInfosPrecises($champ, $suffixe, $valeur) {
$suffixes = explode(',', $suffixe);
//on initialise au service appelé. Sera potentiellement modifié dans la fonction afficherSignification()
$this->service_href = $this->service;
foreach ($suffixes as $suffixe) {
switch ($suffixe) {
case 'id' :
$this->table_retour[str_replace('id.id', 'id', $champ.'.id')] = $valeur;
break;
case 'details' :
$this->afficherTableDetails($champ, $valeur);
break;
case 'signification' :
$this->afficherSignification($champ, $valeur);
break;
case 'href' :
$url = $this->creerUrl($champ, $valeur);
$this->table_retour[str_replace('id.href', 'href', $champ.'.href')] = $url;
break;
case 'code' :
$this->table_retour[$champ.'.code'] = $this->obtenirCode($champ, $valeur);
break;
case 'notes' :
$this->table_retour[$champ.'.notes'] = $this->resultat_req[str_replace('.', '_', $champ).'_notes'];
break;
default : break;
}
}
}
 
public function afficherTableDetails($nom_champ_api, $valeur) {
$tab_id = explode(',', $valeur);
$tab_res = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
foreach ($tab_id as $id) {
$this->afficherInfosPrecises($nom_champ_api, 'id,signification,href', $id);
$tab_res[$nom_champ_api.'.details'][] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
$this->table_retour = $tab_res;
}
 
private function obtenirCode($champ, $valeur) {
$code = $this->transformerChampEnCode($champ);
return "bdnt.$code:$valeur";
}
 
private function transformerChampEnCode($champ) {
if (is_null($this->relationsChampsCodesOntologie)) {
$this->relationsChampsCodesOntologie = Outils::recupererTableauConfig('ChampsCodesOntologie');
}
 
$code = $champ;
if (array_key_exists($champ, $this->relationsChampsCodesOntologie)) {
$code = $this->relationsChampsCodesOntologie[$champ];
}
return $code;
}
 
public function creerUrl($champ, $valeur) {
if ($this->correspondAUnId($champ) || $champ == 'id') {
$service = $this->service_href;
$url = $this->ajouterHref($service, $valeur);
} else {
$code = $this->transformerChampEnCode($champ);
$url = $this->ajouterHrefAutreProjet('ontologies', "$code:", $valeur, 'bdnt');
}
return $url;
}
 
public function afficherSignification($champ, $valeur) {
if ($champ == 'id' && isset($this->resultat_req['nom_sci']) && $this->resultat_req['num_nom'] == $valeur) {
//si le nom_sci du num_nom que l'on veut afficher est déjà dans la table de résultat :
$this->table_retour['nom_sci'] = $this->resultat_req['nom_sci'];
$this->table_retour['nom_sci_complet'] = $this->resultat_req['nom_sci'].' '.
$this->ajouterCompositionNom($this->resultat_req);
} elseif ($this->correspondAUnId($champ) || $champ == 'id') {
$nom = $this->recupererNomSci($valeur);
if ($nom != array()) {
$this->table_retour[$champ.'.libelle'] = $nom['nom_sci'];
$this->table_retour[$champ.'_html'] = $nom['nom_sci_html'];
$this->table_retour[$champ.'_complet'] = $nom['nom_sci_complet'];
$this->table_retour[$champ.'_html_complet'] = $nom['nom_sci_complet_html'];
$this->service_href = $nom['service'];
}
} elseif ($this->correspondAUnCode($champ)) {
$this->table_retour[$champ.'.libelle'] = $this->ajouterSignificationCode($champ, $valeur);
}
}
 
/** Permet d'afficher les élements nomenclatural du nom_sci lors de l'appel dans le service noms/id/champ du champ^nom_sci.*/
public function afficherNomSciPointEpithete($resultat) {
$tab_nom_sci = array('nom_supra_generique', 'genre', 'epithete_infra_generique', 'epithete_sp',
'type_epithete', 'epithete_infra_sp', 'cultivar_groupe', 'cultivar', 'nom_commercial');
foreach ($tab_nom_sci as $compo_nom) {
if (isset($resultat[$compo_nom]) && !empty($resultat[$compo_nom])) {
$this->table_retour['nom_sci.'.$compo_nom] = $resultat[$compo_nom];
}
}
}
 
public function ajouterSignificationCode($champ, $valeur) {
if($this->termeOntologieEstEnCache($champ, $valeur)) {
$nom_code = $this->obtenirTermeOntologieParCache($champ, $valeur);
} else {
$code = $this->transformerChampEnCode($champ);
if (preg_match('/^([^_-]+)(?:_|-)([^_-]+)$/', $code, $match)) {
$code = $match[1].ucfirst($match[2]);
}
$url = Config::get('url_ontologie').$code.':'.$valeur.'/nom';
$res = $this->consulterHref($url); //dans commun.php
$nom_code = $valeur;
if (is_object($res)) {
$nom_code = $res->nom;
}
$this->mettreEnCacheOntologie($champ, $valeur, $nom_code);
}
return $nom_code;
}
 
public function recupererNomSci($id) {
$nom = array();
if ($id != 0) {
if ($this->compo_nom == null) {
$req = 'SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html FROM '.$this->table.' WHERE num_nom = '.$id;
} else { //on ajoute à la requete sql, les champs de ns.structure
//print_r($this->compo_nom);
$req = 'SELECT nom_sci, num_nom_retenu, nom_sci_html, '.implode(', ', $this->compo_nom)
.' FROM '.$this->table
.' WHERE num_nom = '.$id;
}
if ($this->parametres['ns.format'] == 'htm') {
$req = str_replace('nom_sci', 'nom_sci_html as nom_sci', $req);
}
$res = $this->getBdd()->recuperer($req);
if ($res) {
$nom['nom_sci'] = $res['nom_sci'];
$nom['nom_sci_html'] = $res['nom_sci_html'];
$nom['nom_sci_complet'] = $res['nom_sci'].' '.$this->ajouterCompositionNom($res);
$nom['nom_sci_complet_html'] = $res['nom_sci_html'].' '.$this->ajouterCompositionNom($res, 'htm');
$nom['service'] = ($res['num_nom_retenu'] == $id && $this->service == 'taxons') ? 'taxons' : 'noms';
}
}
return $nom;
}
 
/** Permet de retourner une chaine de caractère composée des parametres du nom (ns.structure : annnée, auteur,
* bibilio et addendum). A ajouter au nom scientifique */
public function ajouterCompositionNom($tab_res, $format = '') {
$format = ($format == '') ? $this->parametres['ns.format'] : $format;
 
$nom = '';
if (isset($this->compo_nom)) {
if ($format == 'htm') {
$format = array(
'au' => '<span class="auteur">%s</span>',
'an' => '[<span class="annee">%s</span>]',
'an_bib' => '[<span class="annee">%s</span>, <span class="biblio">%s</span>]',
'bib' => '[<span class="biblio">%s</span>]',
'ad' => '[<span class="adendum">%s</span>]');
} else {
$format = array(
'au' => '%s',
'an' => '[%s]',
'an_bib' => '[%s, %s]',
'bib' => '[%s]',
'ad' => '[%s]',
'gen' => '%s',
'sp' => '%s',
'ssp' => '%s',
'fam' => '%s',
'au_ss' => '%s',
'bib_ss' => '%s');
}
$compo_nom = array();
 
foreach ($this->compo_nom as $key => $champ) {
if (isset($tab_res[$champ]) && !empty($tab_res[$champ])) {
$compo_nom[$key] = $tab_res[$champ];
}
}
$nom_complet = $this->formerNomComplet($compo_nom, $format);
$nom = implode(' ', $nom_complet);
}
return rtrim($nom, ' ');
}
 
 
public function formerNomComplet($compo_nom, $format) {
$nom_complet = array();
extract($compo_nom);
if (isset($au)) $nom_complet[] = sprintf($format['au'], $au);
if (isset($an)) {
if (isset($bib)) {
$nom_complet[] = sprintf($format['an_bib'], $an, $bib);
} else {
$nom_complet[] = sprintf($format['an'], $an);
}
} elseif (isset($bib)) {
$nom_complet[] = sprintf($format['bib'], $bib);
}
if (isset($ad)) $nom_complet[] = sprintf($format['ad'], $ad);
if (isset($gen)) $nom_complet[] = sprintf($format['gen'], $gen);
if (isset($ssp)) $nom_complet[] = sprintf($format['ssp'], $ssp);
if (isset($sp)) $nom_complet[] = sprintf($format['sp'], $sp);
if (isset($fam)) $nom_complet[] = sprintf($format['fam'], $fam);
if (isset($au_ss)) $nom_complet[] = sprintf($format['au_ss'], $au_ss);
if (isset($bib_ss)) {
$bibl = $this->tronquerBiblio($bib_ss);
//simule un 'select distinct' sur les biblio tronquées
if (!isset($this->bib_traitees[$bibl])) {
$nom_complet[] = sprintf($format['bib_ss'],$bibl );
$this->bib_traitees[$bibl] = 1;
}
}
return $nom_complet;
}
 
public function tronquerBiblio($valeur){
$bib = '';
if(strpos($valeur,',') !== false) {
$bib = explode(',',$valeur);
}
if(strpos($bib[0],';') !== false) {
 
$bib[0] = strstr($bib[0],';');
$bib[0] = str_replace('; ','',$bib[0]);
}
return $bib[0];
}
 
 
 
public function correspondAUnCode($key) {
return (strrpos($key, '.code') !== false) || (in_array($key.'.code', $this->correspondance_champs));
}
 
public function correspondAUnId($key) {
return (strrpos($key, '.id') !== false) || (in_array($key.'.id', $this->correspondance_champs));
}
 
public function estUnPoint($key) {
if (strrpos($key, 'hybride.parent') !== false) {
$key = str_replace('hybride.parent', 'hybride_parent', $key);
}
return (strrpos($key, '.') !== false);
}
 
public function recupererMasquePrincipal() {
$masque = null;
$tab_masque = array(
'masque' => 'nom_sci',
'masque_sg' => 'nom_supra_generique',
'masque_gen' => 'genre',
'masque_sp' => 'epithete_sp',
'masque_ssp' => 'epithete_infra_sp',
'masque_au' => 'auteur',
'masque_an' => 'annee',
'masque_bib' => 'biblio_origine',
'masque_ad' => 'addendum',
'masque_rg' => 'rang');
$liste_masque = array();
 
if (isset($this->masque['num_nom'])) {
$liste_masque[] = $this->masque['num_nom'];
}
 
foreach ($tab_masque as $key => $filtre) {
if (isset($this->masque[$filtre])) {
if (!isset($masque) && !in_array($filtre, array('rang', 'annee'))) {
$masque = array($key, $filtre);
}
$liste_masque[] = $this->masque[$filtre];
}
}
$this->masque = $liste_masque;
return $masque;
}
 
private function mettreEnCacheOntologie($categorie, $valeur, $correspondance) {
if(!isset($this->ontologie[$categorie])) {
$this->ontologie[$categorie] = array();
}
if(!isset($this->ontologie[$categorie][$valeur])) {
$this->ontologie[$categorie][$valeur] = array();
}
$this->ontologie[$categorie][$valeur] = $correspondance;
}
 
private function termeOntologieEstEnCache($categorie, $valeur) {
return array_key_exists($categorie, $this->ontologie) && array_key_exists($valeur, $this->ontologie[$categorie]);
}
 
private function obtenirTermeOntologieParCache($categorie, $valeur) {
return $this->ontologie[$categorie][$valeur];
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/apd/Noms.php
New file
0,0 → 1,648
<?php
// declare(encoding='UTF-8');
/**
* Classe permettant de fournir des informations sur les noms scientifiques.
* Si l'url finit par /noms on retourne une liste de noms latin et leurs identifiants (seulement les 100 premeiers noms par défaut).
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /noms?param1=val1&param2=val2&...
*
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, masque.gen (nom de genre), masque.sp (épithète d'espèce), masque.ssp (épithète infra-spécifique),
* masque.au (auteur du nom), masque.an (année de publication du nom), masque.bib (réf biblio de la publi d'origine du nom), masque.ad (nomen addendum),
* masque.nn (identifiant du nom), recherche, rang, distinct, retour.format, nl.format, nl.structure, navigation.depart et navigation.limite.
* Les différentes requetes :
* - noms | noms/relations/#projet/#id_projet | noms/#id | noms/#id/#champ+#champ
* - noms/#id/relations | noms/#id/relations/synonymie | noms/#id/relations/homonymie | noms/#id/relations/flores
* - noms/stats/rangs | noms/stats/annees | noms/stats/initiales
*
* @package bdtfx
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version $Id$
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
* @see http://www.tela-botanica.org/wikini/eflore/wakka.php?wiki=EfloreApi01Noms
*/
 
class Noms extends CommunNomsTaxons {
 
protected $format_reponse = 'noms'; // Permet de stocker la requete formulée
protected $service = 'noms';
protected $serviceNom = 'noms';
protected $requete_champ = 'num_nom, nom_sci, num_nom_retenu';
protected $requete_condition = null;
protected $requete_group_by = '';
/** Permet de stocker les limite de la requete SQL (par défaut seul les 100 premiers résultats seront retournés).*/
protected $limite_requete = array('depart' => 0, 'limite' => 100);
protected $distinct = null; // Valeur du paramètre de requete distinct (=0|1)
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
return parent::consulter($ressources, $parametres);
}
 
//+----------------FONCTION D'ANALYSE DES PARAMETRES---------------------------------------------------------+
 
public function traiterParametresSpecifiques() {
foreach ($this->parametres as $param => $val) {
switch ($param) {
case 'masque' :
$champ = isset($this->parametres['recherche']) && ($this->parametres['recherche'] == 'etendue') ?
'CONCAT(nom_sci," ",auteur)' : 'nom_sci';
$this->ajouterFiltreMasque($champ, $val);
break;
case 'masque.sg' :
$this->ajouterFiltreMasque('nom_supra_generique', $val);
break;
case 'masque.gen' :
$this->ajouterFiltreMasque('genre', $val);
break;
case 'masque.sp' :
$this->ajouterFiltreMasque('epithete_sp', $val);
break;
case 'masque.ssp' :
$this->ajouterFiltreMasque('epithete_infra_sp',$val);
break;
case 'masque.au' :
$this->ajouterFiltreMasque('auteur', $val);
break;
case 'masque.an' :
$this->ajouterFiltreMasque('annee', $val);
break;
case 'masque.bib' :
$this->ajouterFiltreMasque('biblio_origine',$val);
break;
case 'masque.ad' :
$this->ajouterFiltreMasque('nom_addendum', $val);
break;
case 'masque.nn' :
$this->requete_condition []= 'num_nom IN ('.$val.')';
$this->masque['num_nom'] = "num_nom=$val";
break;
case 'masque.nt' :
$this->requete_condition []= 'num_taxonomique IN ('.$val.')';
$this->masque['num_tax'] = "num_taxonomique=$val";
break;
case 'masque.rg' :
$this->ajouterFiltreMasque('rang', $val);
break;
case 'retour.champs' :
$this->verifierParamChamps($param, $val);
break;
case 'distinct' :
$this->ajouterNomDistinct($val);
break;
case 'masque.fam' :
$this->ajouterFiltreMasque('famille', $val);
break;
case 'masque.sto' :
$this->ajouterFiltreMasque('statut_origine', $val);
break;
case 'masque.sti' :
$this->ajouterFiltreMasque('statut_introduction', $val);
break;
case 'masque.stc' :
$this->ajouterFiltreMasque('statut_culture', $val);
break;
case 'masque.and' :
$this->requete_condition []= " annee >= ".$this->getBdd()->proteger($val);
break;
case 'masque.anf' :
$this->requete_condition []= " annee <= ".$this->getBdd()->proteger($val);
break;
case 'masque.prgua' :
$this->ajouterFiltreMasque('presence_Guadeloupe', $val);
break;
case 'masque.prmar' :
$this->ajouterFiltreMasque('presence_Martinique', $val);
break;
case 'masque.prstm' :
$this->ajouterFiltreMasque('presence_Saint_Martin', $val);
break;
case 'masque.prdes' :
$this->ajouterFiltreMasque('presence_La_Desirade', $val);
break;
case 'masque.prstb' :
$this->ajouterFiltreMasque('presence_Saint_Barthelemy', $val);
break;
case 'masque.prmga' :
$this->ajouterFiltreMasque('presence_Marie_Galante', $val);
break;
case 'masque.prsai' :
$this->ajouterFiltreMasque('`presence_Les-Saintes`', $val);
break;
}
}
}
 
public function verifierParamChamps($param, $val) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$champs_demandes = explode(',', $val);
$champs_verifies = array();
$champs_api = array_flip($this->champs_api);
$champs_supp = array('nom_retenu_complet'=>'num_nom_retenu', 'basionyme_complet'=>'num_basionyme');
$champs_api = array_merge($champs_api, $champs_supp);
foreach ($champs_demandes as $champ) {
if (array_key_exists($champ, $champs_api)) {
$champs_verifies[] = $champs_api[$champ];
}
}
if (count($champs_verifies) > 0) {
$this->requete_champ .= ', '.implode(',', $champs_verifies);
}
}
 
/** Permet de rajouter à la requete sql le parametre distinct. N'est utilisé qu'avec le format oss */
public function ajouterNomDistinct($distinct) {
if (isset($distinct)) {
if ($distinct == 1 && $this->parametres['retour.format'] == 'oss') {
$this->distinct = ' distinct ';
} elseif ($distinct == 1 && $this->parametres['retour.format'] != 'oss') {
$e = 'Erreur dans votre requête </br> L\'utilisation du paramètre distinct ne se fait que sous
le format oss';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
}
 
//-----------------FONCTION D'ANALYSE DES RESSOURCES--------------------------------------------------------------------
 
public function traiterRessourcesIdentifiant() {
//on initialise la condition de la requete sql et le format de réponse
$this->requete_condition = array(); //on vide la table dans le cas de plusieurs version
$this->requete_condition[] = 'num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($this->ressources[0]);
$this->format_reponse = $this->service.'/id';
if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {
if ($this->ressources[1] == 'relations') {
$this->traiterRessourceIdRelations();
} else {
$e = 'Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : <br/>
<li> noms/#id/relations </li> <li> noms/#id/#champ+#champ </li>
<li> noms/#id/relations/synonymie </li>
<li> noms/#id/relations/homonymie </li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
} else { // requete de type noms/#id : rajout du nom_sci pour récupérer le format html par la fct mettreAuFormat()
$this->requete_champ = ' *, nom_sci ';
}
}
 
public function traiterRessourceRelations() {
$this->format_reponse .= '/relations';
$projet = $this->ressources[1];
$num_nom = $this->ressources[2];
if (strrpos($num_nom, 'nn.coste') !== false) {
list($p, $nn) = explode('=', $num_nom);
$num_nom = $nn;
}
$champ = "flore_$projet"."_num";
if (isset($this->ressources[3])) {
$type = $this->ressources[3];
if (!in_array($type, array('homonymie', 'synonymie'))) {
$e = "Les types disponibles pour les noms sont homonymie, synonymie";
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
$this->requete_champ = ' num_nom ';
$this->requete_condition = array();
$this->requete_condition[] = "$champ = ".$this->getBdd()->proteger($num_nom);
}
 
public function traiterRessourceIdRelations() {
$this->format_reponse .= '/relations';
if (isset($this->ressources[2]) && !empty($this->ressources[2])) {
// requete de type noms/#id/relations/#relation
switch ($this->ressources[2]) {
case 'synonymie' :
$this->traiterRessourceIdSynonymie();
break;
case 'homonymie' :
$this->traiterRessourceIdHomonymie();
break;
default :
$e = 'Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : <br/>
<li> noms/#id/relations </li> <li> noms/#id/relations/synonymie </li>
<li> noms/#id/relations/homonymie </li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
break;
}
}
}
 
public function traiterRessourceIdSynonymie() {
// SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu, basionyme FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X LIMIT 0,100;
$this->format_reponse .= '/synonymie';
if (strrpos($this->requete_champ, ', num_basionyme') === false) {
$this->requete_champ .= ', num_basionyme ';
}
if (strrpos($this->requete_champ, ', num_type') === false) {
$this->requete_champ .= ', num_type ';
}
$this->requete_condition[0] = 'num_nom_retenu = '.
'(SELECT num_nom_retenu FROM '.$this->table.' WHERE '.$this->requete_condition[0].')';
}
 
public function traiterRessourceIdHomonymie() {
// SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu FROM bdtfx_v2_00 WHERE nom_sci = (SELECT nom_sci FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
$this->format_reponse .= '/homonymie';
$this->requete_condition[0] = 'nom_sci = (SELECT nom_sci FROM '.$this->table
.' WHERE '.$this->requete_condition[0].')';
}
 
public function traiterRessourceStatsRangs() {
// SELECT count(*) as nombre, rang FROM bdtfx_v2_00 [WHERE rang = 290] GROUP BY rang ORDER BY rang;
$this->format_reponse .= '/rangs';
$this->requete_champ = 'count(*) as nombre, rang ';
$this->requete_group_by = ' GROUP BY rang ORDER BY rang ';
}
 
public function traiterRessourceStatsAnnees() {
// SELECT count(*) as nombre, annee FROM bdtfx_v2_00 GROUP BY annee ORDER BY annee;
$this->format_reponse .= '/annees';
$this->requete_champ = 'count(*) as nombre, annee ';
$this->requete_condition = null;
$this->requete_group_by = ' GROUP BY annee ORDER BY annee ';
}
 
public function traiterRessourceStatsInitiales() {
// SELECT count(left( nom_sci, 2 )) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre GROUP BY rang, left(nom_sci, 2);
$this->format_reponse .= '/initiales';
$this->requete_champ = 'count(left( nom_sci, 2 )) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre ';
$this->requete_group_by = ' GROUP BY rang, left(nom_sci, 2)';
}
 
//-----------------------------FONCTIONS DASSEMBLAGE DE LA REQUETE-----------------------------------------------------
 
public function assemblerLaRequete() {
if ( strrpos($this->format_reponse, 'noms/stats/') === false ) {
$this->mettreAuFormat(); //Ds CommunNomsTaxons.php
}
$requete = 'SELECT '.$this->retournerChamps().' '.
"FROM {$this->table} ".
$this->retournerRequeteCondition().' '.
$this->requete_group_by.' '.
$this->retournerOrderBy().' '.
$this->formerRequeteLimite();
return $requete;
}
 
public function retournerChamps() {
$sql = '';
if ($this->distinct) {
$sql .= $this->distinct.' ';
}
if ($this->requete_champ) {
$sql .= $this->requete_champ.' ';
}
 
// Champs "virtuels" pour tier sur l'ensemble des résultats
if (isset($this->parametres['retour.tri'])) {
list($champ, $ordre) = $this->decouperParametreRetourTri();
if ($champ == 'retenu') {
$sql .= ", IF(num_nom = num_nom_retenu, '0', '1') AS nom_retenu_tri ";
}
}
 
return $sql;
}
 
public function decouperParametreRetourTri() {
$tri = array('', '');
if (isset($this->parametres['retour.tri'])) {
if (preg_match('/^(retenu)(?:,(ASC|DESC)|)$/', $this->parametres['retour.tri'], $match))
$tri[0] = $match[1];
$tri[1] = isset($match[2]) ? $match[2] : '';
}
return $tri;
}
 
public function retournerRequeteCondition() {
$condition = '';
if ($this->requete_condition) {
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
}
return $condition;
}
 
public function retournerOrderBy() {
$orderBy = array();
 
// Tri sur l'ensemble des résultats
if (isset($this->parametres['retour.tri'])) {
list($champ, $ordre) = $this->decouperParametreRetourTri();
if ($champ == 'retenu') {
$orderBy[] = "nom_retenu_tri $ordre";
}
}
// Tri par défaut
if ($this->format_reponse == 'noms') {
$orderBy[] = 'nom_sci ASC';
}
 
$sql = '';
if (count($orderBy) > 0) {
$sql = 'ORDER BY '.implode(', ', $orderBy).' ';
}
return $sql;
}
 
public function formerRequeteLimite() {
if ($this->format_reponse != 'noms' && $this->format_reponse != 'noms/id/relations/synonymie'
&& $this->format_reponse != 'noms/id/relations/homonymie') {
$this->requete_limite = '';
} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat())) {
$this->limite_requete['depart'] =
(($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']);
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
} else {
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
}
return $this->requete_limite;
}
 
/** Recupere le nombre total de résultat d'une requete lancée. */
public function recupererTotalResultat() {
$total = null;
$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '.$this->table.$this->retournerRequeteCondition().$this->requete_group_by;
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($res) {
$total = $res['nombre'];
} else {
$e = 'Fct recupererTotalResultat() : <br/>Données introuvables dans la base';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
}
return $total;
}
 
 
//-------------------FONCTIONS POUR LE FORMATAGE EN JSON----------------------------------------------------------------
 
public function retournerResultatFormate($resultat) {
switch ($this->format_reponse) {
case 'noms/relations' :
$reponse = $this->formaterRelations($resultat[0]);
break;
case 'noms/id' : //ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterId($resultat[0]);
break;
case 'noms/id/relations' :
$reponse = $this->formaterIdRelations($resultat[0]);
break;
case 'noms/id/relations/synonymie' :
$reponse = $this->formaterIdSynonymie($resultat);
break;
case 'noms/id/relations/homonymie' :
$reponse = $this->formaterIdHomonymie($resultat);
break;
case 'noms/stats/annees' : //ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterStatsAnnee($resultat);
break;
case 'noms/stats/rangs' : //ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterStatsRang($resultat);
break;
case 'noms/stats/initiales' : //ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterStatsInitiales($resultat);
break;
case 'noms' :
$reponse = $this->formaterNoms($resultat);
break;
}
return $reponse;
}
 
//+---------------------concerne les resultats pour des requetes de type noms/id-----------------------------+
 
public function formaterRelations($resultat) {
$num_nom = $resultat['num_nom'];
if (isset($this->ressources[3])) {
$url = Config::get('url_service').$this->service."/$num_nom/relations";
} else {
$type = $this->ressources[3];
$url = Config::get('url_service')."/$this->service/$num_nom/relations/$type";
}
$res = $this->consulterHref($url);
return $res;
}
 
public function formaterIdRelations($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$this->resultat_req = $resultat;
$retour_id_rel = array ('entete' => array()); //on initialise pr que l'entete apparaisse en premier lors de l'affichage
 
//on recupère le resultat de chaque relation (appel du WS correspondant)
$homonymes = $this->ajouterRelations('homonymie');
if (isset($homonymes)) $retour_id_rel['resultat']['homonymes'] = $homonymes;
$synonymes = $this->ajouterRelations('synonymie');
if (isset($synonymes)) $retour_id_rel['resultat']['synonymes'] = $synonymes;
 
//on renvoit null si il n'existe aucune relations (on efface l'entete en premier lieu)
if (!isset($retour_id_rel['resultat'])) {
$retour_id_rel = null;
} else { //on rajoute l'entete si des relations existent
$this->afficherDonnees('num_nom', $this->ressources[0]);
$retour_id_rel['entete'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
return $retour_id_rel;
}
 
/**
* Recupere les relations (type de la relation passée en paramètres :[type_relation] = synonymie, homonymie ou
* ) par l'appel du web service [version]/noms/#id/relations/[type_relation]
*/
public function ajouterRelations($relation) {
$version = str_replace(Config::get('bdd_table').'_', '', $this->table);
$res = null;
$parametres_url = '';
if ($this->parametres != array()) $parametres_url = '?'.http_build_query($this->parametres, '', '&');
$url = Config::get('url_service').'/'.$this->service.'/'.
$this->ressources[0].'/relations/'.
$relation.$parametres_url;
 
$relation = $this->consulterHref($url);
 
$res = $relation->resultat;
return $res;
}
 
 
public function formaterIdSynonymie($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$retour_id_syn = array();
if ($resultat[0]['num_nom_retenu'] == '') {
$retour_id_syn[] = 'nom_retenu N.D.';
} elseif (count($resultat) != 1) {
//on remplit d'abord l'entete du resultat
$this->table_retour['id'] = $this->ressources[0];
$this->afficherEnteteResultat('/'.$this->service.'/'.$this->ressources[0].'/relations/synonymie');
$retour_id_syn['entete'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
foreach ($resultat as $tab) {
//pour chaque basionyme, on recupère le résultat : num_nom, nom_sci, basionyme et num_nom_retenu :
$this->resultat_req = $tab;
$num = $tab['num_nom'];
$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num);
$this->afficherDonnees('basionyme', $tab['num_basionyme']);
$retour_id_syn['resultat'][$num] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
if (!isset($retour_id_syn['resultat']) && !in_array('nom_retenu N.D.', $retour_id_syn)) {
$retour_id_syn = null; //on initialise le resultat à null
}
}
return $retour_id_syn;
}
 
public function formaterIdHomonymie($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
if (count($resultat) != 1) {
$this->table_retour['id'] = $this->ressources[0];
$this->afficherEnteteResultat($resultat, '/'.$this->service.'/'.$this->ressources[0].'/relations/homonymie');
$retour_id_hom['entete'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
foreach ($resultat as $homonyme) {
$this->resultat_req = $homonyme;
$id = $homonyme['num_nom'];
$this->afficherDonnees('num_nom', $id);
if ($homonyme['num_nom_retenu'] != '') {
$retenu = ($id == $homonyme['num_nom_retenu']) ? 'true' : 'false';
} else {
$retenu = 'absent';
}
$this->table_retour['retenu'] = $retenu;
$retour_id_hom['resultat'][$id] = $this->table_retour;
unset($retour_id_hom['resultat'][$id]['id']);
$this->table_retour = array();
}
} else {
$retour_id_hom = null;
}
return $retour_id_hom;
}
 
public function obtenirSynonymesParNumNomAvecInfosFlore($num_nom, $version='1_02') {
 
$champs_flore = 'flore_bonnier_num, flore_bonnier_rem,'.
'flore_cnrs_num, flore_cnrs_rem '.
'flore_fe_num, flore_fe_rem '.
'flore_coste_num, flore_coste_rem '.
'flore_fh_num, flore_fh_rem '.
'flore_fournier_num, flore_fournier_rem';
 
$requete = 'SELECT num_nom, nom_sci, '.$champs_flore.' '.
'FROM '.$this->table.' '.
'WHERE num_nom_retenu = '.
'('.
'SELECT num_nom_retenu FROM '.$this->table.' WHERE num_nom = "'.$num_nom.'"'.
')';
 
return $this->getBdd()->recupererTous($requete);
}
 
//+---------------------concerne les resultats pour des requetes de type /noms avec ou sans paramètres-------+
 
public function formaterNoms($resultat) {
if ($this->parametres['retour.format'] == 'oss') {
$reponse = $this->formaterEnOss($resultat); //Ds CommunNomsTaxons.php
} else {
$reponse = $this->formaterEnJsonMax($resultat);
}
return $reponse;
}
 
public function formaterEnJsonMax($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
 
// TODO : améliorer le tri des résultats
// ATTENTION : ce comportement est étrange
$masque = $this->recupererMasquePrincipal();
if (isset($masque) && !isset($this->parametres['retour.tri'])) {
// fonction du pauvre pour palier aux "." remplacés accidentellement par des "_"
$index = str_replace('masque_','masque.',$masque[0]);
//$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres[$index], $resultat, $masque[1]);
}
 
// Tri à la mode du CeL : lexicographique puis noms retenus (retour.tri = "alpharet")
if (isset($this->parametres['retour.tri']) && ($this->parametres['retour.tri'] == "alpharet")) {
usort($resultat, array($this, 'genrePuisNomsRetenusEnTete'));
}
 
$table_retour_json['entete'] = $this->remplirJsonEntete();
$table_retour_json['resultat'] = $this->remplirJsonResultat($resultat);
return $table_retour_json;
}
 
// Trie les éléments du tableau de résultats : le genre en tête, puis les noms retenus, puis le reste
// mais à partir du jeu de données retourné par SQL (indépendents du statut "retenu")
private function genrePuisNomsRetenusEnTete($a, $b) {
// On pourrait utiliser l'indice ['retenu'] mais il contient parfois "absent", qui est dur à traiter
$aEstRetenu = ($a['num_nom'] == $a['num_nom_retenu']);
$bEstRetenu = ($b['num_nom'] == $b['num_nom_retenu']);
$retour = 0;
 
// les noms retenus en premier ("inférieurs")
if ($aEstRetenu) {
if (! $bEstRetenu) {
$retour = -1;
}
} else {
if ($bEstRetenu) {
$retour = 1;
}
}
 
// en cas d'égalité on conserve le tri lexicographique - devrait faire sortir le genre en première position
// car il ne contient pas le nom d'auteur
if ($retour == 0) {
$retour = strcasecmp($a['nom_sci'], $b['nom_sci']);
}
 
return $retour;
}
 
public function remplirJsonResultat($resultat) {
$champs = null;
if (array_key_exists('retour.champs', $this->parametres)) {
$champs = explode(',', $this->parametres['retour.champs']);
}
 
// Structure des données: objet ou liste ?
$modeListe = false;
if (array_key_exists('retour.structure', $this->parametres)) {
$modeListe = ($this->parametres['retour.structure'] === "liste");
}
 
$noms = array();
foreach ($resultat as $tab) {
$this->table_retour = array();
$num = $tab['num_nom'];
$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num); // ajoute le nom_sci, href et si le nom est retenu dans $this->table_retour
$retour = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
if ($champs != null) {
$reponse_id = $this->formaterId($tab);
$this->table_retour = array();
$this->ajouterChampsPersonnalises($champs, $reponse_id);
$retour = array_merge($retour, $this->table_retour);
}
if ($modeListe) {
$retour['num_nom'] = intval($num);
$noms[] = $retour;
} else {
$noms[$num] = $retour;
}
}
 
return $noms;
}
 
public function remplirJsonEntete() {
$entete = array();
if (isset($this->masque)) {
$this->table_retour['masque'] = implode('&', $this->masque);
}
parent::afficherEnteteResultat('/'.$this->service);
return $this->table_retour;
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/apd/Taxons.php
New file
0,0 → 1,521
<?php
 
// declare(encoding='UTF-8');// ou ISO-8859-15
/**
* Description :
* Classe Taxons.php permettant de fournir des informations sur les noms scientifiques retenu.
* Si l'url finit par /taxons on retourne une liste de noms latin et leurs identifiants (seulement les 100 premeiers noms par défaut).
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /taxons?param1=val1&param2=val2&...
*
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, recherche, rang, distinct, retour.format, nl.format,
* nl.structure, navigation.depart et navigation.limite.
*
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package framework-v3
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-${year} Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
 
class Taxons extends CommunNomsTaxons {
/** Permet de stocker la requete formulée taxons | taxons/#id | taxons/#id/#champ+#champ ...*/
protected $format_reponse = 'taxons';
protected $service = 'taxons';
protected $requete_champ = 'num_nom, nom_sci, num_nom_retenu, num_taxonomique, rang ';
protected $requete_condition = null;
protected $requete_group_by = ' ';
/** Permet de stocker les limite de la requete SQL (par défaut seul les 100 premiers résultats seront retournés).*/
protected $limite_requete = array('depart' => 0, 'limite' => 100);
protected $num_nom_taxon; //Stocke le num_nom du nom retenu du num_nom recherché
protected $presence_num_tax = true;
public function consulter($ressources, $parametres) {
return parent::consulter($ressources, $parametres);
}
public function traiterParametresSpecifiques() {
$this->requete_condition[] = 'num_nom = num_nom_retenu';
foreach ($this->parametres as $param => $val) {
switch ($param) {
case 'masque' :
$this->ajouterFiltreMasque('nom_sci', $val);
break;
case 'masque.nt' :
$this->requete_condition[] = "num_taxonomique IN ($val)";
$this->masque[] = "num_taxonomique=$val";
break;
case 'masque.rg':
$this->requete_condition[] = 'rang = '.$this->getBdd()->proteger($val);
$this->masque[] = "rang=$val";
break;
}
}
}
//------------------------------------------Fonction ressources---------------------------------------------------------------------
public function gererNumTax() {
if (!in_array('num_taxonomique', $this->champs_table)) {
$this->presence_num_tax = false;
$this->requete_champ = str_replace(', num_taxonomique ', '', $this->requete_champ);
} else {
$this->presence_num_tax = true;
}
}
public function traiterRessourcesIdentifiant() {
$this->format_reponse = 'taxons/id';
$this->traiterRessourceNtId();
$this->num_nom_taxon = $this->recupererNumNomTaxon(); //on recupere le taxon correspondant au num_nom recherché
if ($this->entete_http == '') {
$this->requete_condition[0] = 'num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($this->num_nom_taxon);
if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {
//---------------- requete de type taxons/#id/#champ+#champ--------------------------------------
if ($this->ressources[1] != 'relations') { // SELECT *, nom_sci FROM bftfx_v2_00 WHERE num_nom = X;
$this->requete_champ = ' *, nom_sci ';
$this->format_reponse .= '/champ';
//---------------- requete de type taxons/#id/relations/#relation--------------------------------
} elseif ($this->ressources[1] == 'relations') {
$this->traiterRessourceIdRelations();
} else {
$e = 'Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : <br/>
<li> #id/relations </li> <li> #id/#champ+#champ </li> <li> #id/relations </li>
<li> #id/relations/inferieurs </li> <li> #id/relations/superieurs </li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
} else { //--------------- requete de type taxons/#id-----------------------------------------------------
$this->requete_champ = ' *, nom_sci ';
}
}
}
public function traiterRessourceNtId() {
if (strrpos($this->ressources[0], 'nt:') !== false) {
if ($this->presence_num_tax) {
// SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = num_nom_retenu AND num_taxonomique = X;
$this->requete_condition[0] = ' num_taxonomique = '
.str_replace('nt:', '', $this->ressources[0]).' ';
} else {
$e = 'Erreur dans votre requête : </br> Le numéro taxonomique n\'existe pas dans ce projet';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
} else {
// SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = (SELECT num_nom_retenu FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
$this->requete_condition[0] = 'num_nom = '.$this->ressources[0];
}
}
/** Permet de récupérer le num_nom du taxon recherché. Soit le numéro taxonomique est demandé (avec nt: )
* soit un num_nom dont on recherche le num_nom_retenu */
public function recupererNumNomTaxon() {
$identifiant = '';
if ($this->entete_http == '') {
//on récupere l'identifiant du taxon correspondant au num_nom ou num_taxonomique demandé pour pouvoir l'afficher
$req_tax = 'SELECT num_nom_retenu FROM '.$this->table.' WHERE '.$this->requete_condition[0];
$res_tax = $this->getBdd()->recuperer($req_tax);
//on recherche ensuite les identifiants des taxons supérieurs ou inférieurs
if ($res_tax && $res_tax != '') {
$identifiant = $res_tax['num_nom_retenu'];
} else {
$e = 'Le numéro de taxon ou l\'identifiant de nom correspondant au num_nom '
.$this->ressources[0].' n\'existe pas dans la base.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
Debug::printr($req_tax);
}
}
return $identifiant;
}
public function traiterRessourceIdRelations() {
//----------------- requete de type taxons/#id/relations-------------------------------------------
// SELECT *, nom_sci FROM bftfx_v2_00 WHERE num_nom = X;
$this->format_reponse .= '/relations';
if (isset($this->ressources[2]) && !empty($this->ressources[2])) {
//------------- requete de type taxons/#id/relations/#relation--------------------------------
switch ($this->ressources[2]) {
case 'superieurs' :
$rel = 'recupererIdSup';
$this->format_reponse .= '/superieurs';
$this->traiterRessourceIdRelationInfSup($rel);
break;
case 'inferieurs' :
$rel = 'recupererIdInf';
$this->format_reponse .= '/inferieurs';
$this->traiterRessourceIdRelationInfSup($rel);
break;
case 'hierarchie' :
$rel = 'recupererIdHierarchie';
$this->format_reponse .= '/hierarchie';
$this->traiterRessourceIdRelationHierarchie($rel);
break;
default :
$e = 'Erreur dans votre requête </br> Ressources disponibles : <br/>
<li> taxons/#id/relations </li><li> #id/relations/inferieurs </li>
<li> #id/relations/superieurs </li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
break;
}
}
}
public function traiterRessourceIdRelationHierarchie($rel) {
//Appel de la fct récupérerIdSup ou recupererIdInf : retourne les num_nom des noms inferieurs ou superieurs
$res_relation = $this->$rel();
//analyse du résultat retourné par la requete de recherche des identifiants correspondant aux taxons inf|sup :
if ($res_relation == '') {
//dans le cas ou la requete comporte des erreurs
$e = 'Fct traiterRessourceIdRelationInfSup : La requête forme comporte une erreur!';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
} elseif ($res_relation) {
//dans le cas ou une ou plusieurs relations est retournée, on récupère les identifiants ss la forme (id, id, id)
foreach ($res_relation as $ligne) $res[] = $ligne['num_nom'];
$res = implode(',',$res);
$this->requete_condition[0] = "num_nom IN ($res)";
$this->requete_champ .= ', rang, num_tax_sup ';
} else { //dans le cas ou aucune relation n'existe
$res = array($this->num_nom_taxon => null);
$this->corps_http = json_encode($res);
$this->entete_http = RestServeur::HTTP_CODE_OK;
}
}
public function recupererIdHierarchie() {
$req_relation = 'SELECT num_nom FROM '.$this->table.' '.
' WHERE hierarchie LIKE CONCAT('.
'(SELECT hierarchie FROM '.
$this->table.' '.
'WHERE num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($this->num_nom_taxon).')'.
', '.$this->getBdd()->proteger($this->num_nom_taxon.'-%').
')';
$res_relation = $this->getBdd()->recupererTous($req_relation);
return $res_relation;
}
public function traiterRessourceIdRelationInfSup($rel) {
//Appel de la fct récupérerIdSup ou recupererIdInf : retourne les num_nom des noms inferieurs ou superieurs
$res_relation = $this->$rel();
//analyse du résultat retourné par la requete de recherche des identifiants correspondant aux taxons inf|sup :
if ($res_relation == '') { //dans le cas ou la requete comporte des erreurs
$e = 'Fct traiterRessourceIdRelationInfSup : La requête forme comporte une erreur!';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
} elseif ($res_relation) {
//dans le cas ou une ou plusieurs relations est retournée, on récupère les identifiants ss la forme (id, id, id)
foreach ($res_relation as $ligne) $res[] = $ligne['num_nom'];
$res = implode(',',$res);
$this->requete_condition[0] = "num_nom IN ($res)";
$this->requete_champ .= ', rang, num_tax_sup ';
} else { //dans le cas ou aucune relation n'existe
$res = array($this->num_nom_taxon => null);
$this->corps_http = json_encode($res);
$this->entete_http = RestServeur::HTTP_CODE_OK;
}
}
public function recupererIdInf() {
//SELECT num_nom FROM bfdtx_v2_00 WHERE num_tax_sup = (SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
$req_relation = 'SELECT num_nom FROM '.$this->table
.' WHERE num_nom = num_nom_retenu AND num_tax_sup = (SELECT num_nom FROM '
.$this->table
.' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition).')';
$res_relation = $this->getBdd()->recupererTous($req_relation);
return $res_relation;
}
public function recupererIdSup() {
//SELECT num_nom FROM bfdtx_v2_00 WHERE num_nom = (SELECT num_tax_sup FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
$this->requete_condition[] = "num_nom = num_nom_retenu" ;
$req_relation = 'SELECT num_tax_sup as num_nom FROM '.$this->table
.' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
$res_relation = $this->getBdd()->recupererTous($req_relation);
return $res_relation;
}
 
public function traiterRessourceStatsInitiales() {
// SELECT count(nom_sci) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre FROM bdtfx_v2_00 GROUP BY rang, left(nom_sci, 2);
$this->format_reponse = 'taxons/stats/initiales';
$this->requete_champ = 'count(nom_sci) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre ';
$this->requete_group_by = ' GROUP BY rang, left(nom_sci, 2) ';
}
public function traiterRessourceStatsRangs() {
// SELECT count(*) as nombre, rang FROM bdtfx_v2_00 [WHERE rang = 290] GROUP BY rang ORDER BY rang;
$this->format_reponse = 'taxons/stats/rangs';
$this->requete_champ = 'count(*) as nombre, rang ';
$this->requete_group_by = ' GROUP BY rang ORDER BY rang ';
}
public function traiterRessourceStatsAnnees() {
// SELECT count(*) as nombre, annee FROM bdtfx_v2_00 GROUP BY annee ORDER BY annee;
$this->format_reponse = 'taxons/stats/annees';
$this->requete_champ = 'count(*) as nombre, annee ';
$this->requete_group_by = ' GROUP BY annee ORDER BY annee ';
}
//-----------------------------FONCTIONS DASSEMBLAGE DE LA REQUETE-----------------------------------------------------
public function assemblerLaRequete() {
if ($this->format_reponse != 'taxons/stats/initiales') {
$this->mettreAuFormat(); //on remplace les nom_sci par les nom_sci_html
}
$requete = ' SELECT '.$this->requete_champ.
' FROM '.$this->table
.$this->retournerRequeteCondition()
.$this->requete_group_by
.$this->formerRequeteLimite();
return $requete;
}
public function formerRequeteLimite() {
if ($this->format_reponse != 'taxons' && $this->format_reponse != 'taxons/id/relations/homonymie') {
$this->requete_limite = '';
} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat())) {
$this->limite_requete['depart'] = (($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']);
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
} else {
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
}
return $this->requete_limite;
}
public function retournerRequeteCondition() {
$condition = '';
if ($this->requete_condition) {
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
}
return $condition;
}
public function recupererTotalResultat() {
$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '.$this->table.$this->retournerRequeteCondition().$this->requete_group_by;
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($res) {
$total = $res['nombre'];
}
return $total;
}
 
//-------------------------FONCTIONS DE FORMATION DU RESULTAT-----------------------------------------------------------
/** Permet de récupérer le résultat à retourner propre à chaque requete et de l'encoder en json*/
public function retournerResultatFormate($resultat, $version) {
switch ($this->format_reponse) {
case 'taxons/id' ://ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterId($resultat[0]);
break;
case 'taxons/id/champ' ://ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterIdChamp($resultat[0]);
break;
case 'taxons/id/relations' :
$reponse = $this->formaterIdRelations($resultat[0],$version);
break;
case 'taxons/id/relations/superieurs' :
$reponse = $this->formaterIdSuperieur($resultat, $version);
break;
case 'taxons/id/relations/inferieurs' :
$reponse = $this->formaterIdInferieur($resultat);
break;
case 'taxons/id/relations/hierarchie' :
// le formatage de la hiérarchie est identique aux relations inférieures
$reponse = $this->formaterIdInferieur($resultat);
break;
case 'taxons/stats/annees' : //ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterStatsAnnee($resultat);
break;
case 'taxons/stats/rangs' ://ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterStatsRang($resultat);
break;
case 'taxons/stats/initiales' ://ds CommunNomsTaxons
$reponse = $this->formaterStatsInitiales($resultat);
break;
case 'taxons' :
$reponse = $this->formatertaxons($resultat);
break;
}
return $reponse;
}
//----------------------concerne les resultats pour des requetes de type /noms avec ou sans paramètres--------------
public function formaterTaxons($resultat) {
if ($this->parametres['retour.format'] == 'oss') {
$reponse = $this->formaterEnOss($resultat);
} else {
$reponse = $this->formaterEnJsonMax($resultat);
}
return $reponse;
}
public function formaterEnJsonMax($resultat) {
//print_r($resultat);
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$masque = $this->recupererMasquePrincipal();
if (isset($masque)) $resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres[$masque[0]], $resultat, $masque[1]);
if (isset($this->masque)) $this->table_retour['masque'] = implode('&', $this->masque);
$this->afficherEnteteResultat('/'.$this->service);
$table_retour_json['entete'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
//on remplit la table $table_retour_json['resultat']
$tab_tax_inf = $this->recupererListeTaxonInf($resultat);
foreach ($resultat as $tab) {
$num = $tab['num_nom'];
if (isset($this->parametres['masque.nt'])) $this->afficherDonnees('num_taxonomique', $tab['num_taxonomique']);
$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num);
$this->afficherTaxonInfNb($num, $tab_tax_inf);
$resultat_json[$num] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array(); //on vide le tableau table_retour
}
$table_retour_json['resultat'] = $resultat_json;
return $table_retour_json;
}
//--------------------concerne les resultats pour des requetes de type noms/id----------------------------------------
 
public function formaterIdRelations($resultat, $version) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$this->resultat_req = $resultat;
$retour_id_rel = array ('entete' => array()); //on initialise pr que l'entete apparaisse en premier
 
$superieurs = $this->ajouterRelations('superieurs'); //, $version);
if (isset($superieurs)) $retour_id_rel['resultat']['superieurs'] = $superieurs;
$inferieurs = $this->ajouterRelations('inferieurs', $version);
if (isset($inferieurs)) $retour_id_rel['resultat']['inferieurs'] = $inferieurs;
if (!isset($retour_id_rel['resultat'])) { //on renvoit un tableau null si il n'existe aucune relations
$retour_id_rel = 'null';
} else { //on rajoute l'entete si des relations existent
$this->afficherDonnees('num_nom', $this->num_nom_taxon); //$this->afficherEnteteResultat($resultat, '/'.$this->service.'/'.$this->ressources[0].'/relations/synonymie');
$retour_id_rel['entete'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
return $retour_id_rel;
}
public function ajouterRelations($relation, $version) {
$version = str_replace(Config::get('bdd_table').'_', '', $version);
$res = null;
$taxon = $this->num_nom_taxon;
$parametres_url = '';
if ($this->parametres != array()) $parametres_url = '?'.http_build_query($this->parametres, '', '&');
$url = Config::get('url_service').'/'
.$this->service.'/'.$version.'/'
.$this->ressources[0].'/relations/'
.$relation.$parametres_url;
$relation = $this->consulterHref($url);
if (isset($relation->resultat)) {
$res = $relation->resultat;
} elseif (isset($relation->$taxon)) { //pour les relations inf et sup
$res = $relation->$taxon;
}
return $res;
}
public function formaterIdSuperieur($resultat, $version) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$tab_relation = null; //si il n'existe aucune relation
$taxon_sup_traites = array();
if (($resultat) != '' ) {
//on recupere d'abord les rangs supérieurs
$sup = $resultat[0];
do {
$sup = $this->recupererIdSuperieur($sup['num_tax_sup'], $version);
if(!in_array($sup['num_nom'], $taxon_sup_traites)) {
$taxon_sup_traites[] = $sup['num_nom'];
} else {
$sup = null;
}
if ($sup['rang'] == '0') $sup['rang'] = '10'; //erreur dans la base
if (isset($sup)) $resultat[] = $sup;
} while ($sup != null);
krsort($resultat);
//on les affiche ensuite
foreach ($resultat as $tab) {
$this->resultat_req = $tab;
$num = $tab['num_nom'];
$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num);
$this->afficherDonnees('rang', $tab['rang']);
$tab_inf[$num] = $this->table_retour;
$tab_inf[$num]['num_nom'] = $tab['num_nom'];
$this->table_retour = array();
}
$tab_relation[$this->num_nom_taxon] = $tab_inf;
}
return $tab_relation;
}
public function recupererIdSuperieur($id, $version) {
$req = 'SELECT num_nom, num_nom_retenu, num_tax_sup, rang, nom_sci FROM '
.$version.' WHERE num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($id);
$res = $this->getBdd()->recupererTous($req);
if ($res) {
$resultat = $res[0];
} else {
$resultat = null; //on return null si il n'y a pas de taxon superieur
}
return $resultat;
}
public function formaterIdInferieur($resultat) {
// Attention à l'ordre, on doit d'abord récupérer correpondance_champs avant champs_api
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$tab_relation = null;
if (($resultat) != array()) {
foreach ($resultat as $tab) {
$this->resultat_req = $tab;
$num = $tab['num_nom'];
$this->afficherNomHrefRetenu($tab, $num);
$this->afficherDonnees('rang', $tab['rang']);
$tab_inf[$num] = $this->table_retour;
$tab_inf[$num]['nom_sci'] = $tab['nom_sci'];
$tab_inf[$num]['num_nom'] = $tab['num_nom'];
$this->table_retour = array();
}
$tab_relation[$this->num_nom_taxon] = $tab_inf;
}
return $tab_relation;
}
public function afficherTaxonInfNb($num, $tab_tax_inf) {
foreach ($tab_tax_inf as $taxNb) {
if ($taxNb['num_tax_sup'] == $num) {
$this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'] = $taxNb['nb'];
}
}
if (!isset($this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'])) {
$this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'] = '0';
}
}
public function recupererListeTaxonInf($resultat) {
// SELECT num_tax_sup, count(*) as nb FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_tax_sup IN (id, id, id) AND num_nom = num_nom_retenu GROUP BY num_tax_sup';
foreach ($resultat as $tab) {
$tab_num[] = $tab['num_nom']; //on regroupe ici les id des taxons dont on cherche le nb de taxon inf
}
$req = 'SELECT num_tax_sup, count(*) as nb FROM '.$this->table
.' WHERE num_tax_sup IN ('.implode(',',$tab_num)
.') AND num_nom = num_nom_retenu GROUP BY num_tax_sup';
$res = $this->getBdd()->recupererTous($req);
if ($res) {
$resultat = $res;
} else {
$resultat = array(); //on retourne un tableau vide s'il n'y a pas de taxon inférieurs
}
return $resultat;
}
}
 
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/nasa-srtm/Altitude.php
New file
0,0 → 1,156
<?php
/**
* @api {get} /nasa-srtm/altitude?lat=:lat&lon=:lon Donne l'altitude.
* @apiExample Exemple d'usage :
* curl -i "http://api.tela-botanica.org/service:eflore:0.1/nasa-srtm/altitude?lon=3.86589&lat=44.73702"
* @apiName GetNasaSrtm
* @apiGroup nasa-srtm
* @apiGroupDescription Le web service nasa-srtm/altitude détermine l'altitude d'un point à partir de ses coordonnees.
* Les coordonnees sont definies dans des fichiers au format HGT dans un dossier specifique
* (dont le chemin est defini dans le fichier de configuration propre au web service).
* Les ressources utilisees sont les donnees issues du programme SRTM-3 de la NASA qui couvre
* l'ensemble terrestre du monde. La precision des points dont on renvoie l'altitude est de 90 metres.
* Chaque fichier couvre un secteur de 1 degre sur 1 degre et contient un tableau de 1201 lignes
* (axe des latitudes) sur 1201 colonnes (axe des longitudes) contenant l'altitude en metres
* correspondant a des point precis. L'ecart entre chaque entree des tableaux est constant, ce qui
* permet de calculer la latitude et la longitude de chaque point. L'altitude du point le plus proche
* de celui passe en parametres sera renvoyee au client.
*
* @apiParam {Number} lat Latitude au format décimal (séparateur ".").
* @apiParam {Number} lon Longitude au format décimal (séparateur ".").
*
* @apiSuccess {Number} altitude Altitude en mètre du point correspondant aux coordonées passées en paramètre.
* @apiSuccess {Number} latitude Latitude au format décimal (séparateur ".").
* @apiSuccess {Number} longitude Longitude au format décimal (séparateur ".").
*
* @category eFlore
* @package Services
* @subpackage Nasa-srtm
* @version 0.1
* @author Mathias CHOUET <mathias@tela-botanica.org>
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @author Aurelien PERONNET <aurelien@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @copyright 1999-2014 Tela Botanica <accueil@tela-botanica.org>
*/
class Altitude {
 
private $parametres = array();
private $ressources = array();
private $coordonnees = null;
private $fichierSrtm = '';
 
const LONGUEUR_COTE = 1201;
const OFFSET = 2;
 
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->ressources = $ressources;
$this->parametres = $parametres;
$retour = null;
try {
$this->traiterCoordonnees();
$this->rechercherFichierSrtm();
$this->recupererAltitude();
$retour = $this->coordonnees;
} catch (Exception $erreur) {
$retour = $erreur->getMessage();
}
return $retour;
}
 
private function traiterCoordonnees() {
if ($this->estParametreExistant('lat') && $this->estParametreExistant('lon')) {
$longitude = $this->parametres['lon'];
$latitude = $this->parametres['lat'];
if ($this->estUnFloat($longitude) && $this->estUnFloat($latitude)) {
$this->verifierValiditeCoordonnees($longitude, $latitude);
} else {
$message = "La valeur des coordonnées longitude ou latitude n'est pas correcte. ".
" Elle doit être pour les deux paramètres une valeur décimale.";
throw new Exception($message, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
} else {
$message = "Tous les paramètres passés dans l'URL ne correspondent pas à ceux attendus. ".
"Le web service nécessite de lui fournir une longitude et une latitude pour son bon fonctionnement.";
throw new Exception($message, RestServeur::HTTP_CODE_CONTENU_REQUIS);
}
}
 
private function estParametreExistant($nomParametre) {
return in_array($nomParametre, array_keys($this->parametres));
}
 
private function estUnFloat($variable) {
return (preg_match("/^(-)?\d+(\.\d+)?$/", $variable) == 1);
}
 
private function verifierValiditeCoordonnees($longitude, $latitude) {
$longitude = floatval($longitude);
$latitude = floatval($latitude);
$longitudeMax = Config::get("limite_longitude");
$latitudeMax = Config::get("limite_latitude");
if (abs($longitude) > $longitudeMax || abs($latitude) > $latitudeMax) {
$message = "Les coordonnées passées en paramètres désignent un point qui se trouve ".
"en dehors des limites du monde. Elles doivent être comprises entre -{$longitudeMax} ".
"et $longitudeMax sur l'axe des longitudes, et entre -{$latitudeMax} et {$latitudeMax} ".
"sur l'axe des latitudes.";
throw new Exception($message, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
} else {
$this->coordonnees = new StdClass();
$this->coordonnees->longitude = $longitude;
$this->coordonnees->latitude = $latitude;
}
}
 
private function rechercherFichierSrtm() {
$nomFichierSrtm = $this->construireNomFichierSrtm();
if (!file_exists($nomFichierSrtm)) {
$message = "Erreur interne : la ressource « $nomFichierSrtm » demandée n'a pas pu être trouvée sur le serveur.";
throw new Exception($message, restServeur::HTTP_CODE_ERREUR);
} else {
$this->fichierSrtm = $nomFichierSrtm;
}
}
 
private function construireNomFichierSrtm() {
$latitudeEntier = abs(floor($this->coordonnees->latitude));
if ($latitudeEntier < 10) {
$latitudeEntier = "0".$latitudeEntier;
}
$suffixeLatitude = $this->coordonnees->latitude < 0 ? "S" : "N";
$longitudeEntier = abs(floor($this->coordonnees->longitude));
if ($longitudeEntier < 10) {
$longitudeEntier = "00".$longitudeEntier;
} elseif ($longitudeEntier < 100) {
$longitudeEntier = "0".$longitudeEntier;
}
$suffixeLongitude = $this->coordonnees->longitude < 0 ? "W" : "E";
$dossierSrtm = Config::get('dossier_srtm').DS;
$nomFichierSrtm = $dossierSrtm.$suffixeLatitude.$latitudeEntier.$suffixeLongitude.$longitudeEntier.".hgt.zip";
return $nomFichierSrtm;
}
 
private function recupererAltitude() {
$zip = zip_open($this->fichierSrtm);
$fichier = zip_read($zip);
$donnees = zip_entry_read($fichier, zip_entry_filesize($fichier));
zip_close($zip);
 
$xDepart = floor($this->coordonnees->longitude);
$yDepart = floor($this->coordonnees->latitude);
$longitude = $this->coordonnees->longitude;
$latitude = $this->coordonnees->latitude;
$positionX = (self::LONGUEUR_COTE-1) * ($longitude - $xDepart);
$positionY = (self::LONGUEUR_COTE-1) * (1 - $latitude + $yDepart);
$positionX = ($positionX + 0.5 > ceil($positionX)) ? ceil($positionX) : floor($positionX);
$positionY = ($positionY + 0.5 > ceil($positionY)) ? ceil($positionY) : floor($positionY);
 
$binaire = substr($donnees, ($positionY * self::LONGUEUR_COTE + $positionX) * self::OFFSET, self::OFFSET);
$this->coordonnees->altitude = current(unpack("n*", $binaire));
if (!$this->coordonnees->altitude) {
$this->coordonnees->altitude = 0;
}
}
}
Property changes:
Added: svn:mergeinfo
Merged /branches/v5.9-aulnaie/services/modules/0.1/nasa-srtm/Altitude.php:r1122
Merged /branches/v5.2-alpage/services/modules/0.1/nasa-srtm/Altitude.php:r976,978
Merged /branches/v5.8-aspergeraie/services/modules/0.1/nasa-srtm/Altitude.php:r1085-1086
Merged /branches/v5.7-arrayanal/services/modules/0.1/nasa-srtm/Altitude.php:r1050,1052
Merged /branches/v5.8-aspergeraie/services/services/modules/0.1/nasa-srtm/Altitude.php:r1085-1086
Merged /branches/v5.1-acheb/services/modules/0.1/nasa-srtm/Altitude.php:r927
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/bibliobota/Publications.php
New file
0,0 → 1,330
<?php
// declare(encoding='UTF-8');
/**
* Classe implémentant l'API d'eFlore Publications pour le projet Biblio bota.
*
* @see http://www.tela-botanica.org/wikini/eflore/wakka.php?wiki=EfloreApi01Publications
*
* @package eFlore/services
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @author Aurélien PERONNET <aurelien@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
// TODO : Config et Outils sont des classes statiques qui doivent poser des pb pour les tests...
class Publications extends Commun {
 
protected $parametres;
protected $ressources;
private $Bdd;
protected $config;
private $nbrePublications;
private $masque_taxon;
protected $service = 'publications';
public function __construct(Bdd $bdd = null, Array $config = null, Utilisateurs $utilisateurs = null, Url $url = null) {
$this->Bdd = is_null($bdd) ? new Bdd() : $bdd;
$this->UrlNavigation = is_null($url) ? new Url($this->config['url_service']) : $url;
}
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
$resultat = new ResultatService();
$this->parametres = $parametres;
$this->ressources = $ressources;
 
$this->definirValeurParDefautDesParametres();
$this->verifierParametres();
$this->recupererParametresMasque();
$this->chargerNbrePublicationsTotal();
$publications = $this->getPublications($this->masque_taxon);
$resultat->corps = $this->formaterPublications($publications);
 
return $resultat;
}
 
public function getPublications($cherche) {
$depart = $this->parametres['navigation.depart'];
$limite = $this->parametres['navigation.limite'];
$tab_mots = preg_split('~ ~', $cherche, -1, PREG_SPLIT_NO_EMPTY);
$sql = 'SELECT DISTINCT B_C_CRAI, B_C_NOMCOMPLET, B_C_ABREGE, ' .
' B_F_NUMERO, B_F_TITRE, B_F_DATE, B_F_CRAICOLL, '.
' B_SER_SOUSTITRE, '.
' B_A_PAGEDEBUT, B_A_PAGEFIN, B_A_CRAIFASC, B_A_CRAISERIE, ' .
' B_D_ID, B_D_LABEL, ' .
' B_S_IDSTR, B_S_NOM, ' .
' B_AS_LIBELLE, '.
' biblio_serie.*, biblio_item.*, biblio_item_typlog.*, biblio_item_typphy.* '.
'FROM biblio_item '.
' LEFT JOIN biblio_aut_saisie ON (b_i_auteursaisie = b_as_id) '.
' LEFT JOIN biblio_article ON (b_i_iditem = b_a_idart) '.
' LEFT JOIN biblio_fasc ON '.
' (B_F_CRAICOLL = B_A_CRAICOLL '.
' AND B_F_CRAISERIE = B_A_CRAISERIE '.
' AND B_F_NUMERO = B_A_CRAIFASC)' .
' LEFT JOIN biblio_serie ON ' .
' (b_f_craicoll = b_ser_craicoll ' .
' AND b_f_craiserie = b_ser_idserie) '.
' LEFT JOIN biblio_collection ON (b_ser_craicoll = b_c_crai) '.
' LEFT JOIN biblio_str ON (B_C_LKSTR = B_S_IDSTR) '.
' LEFT JOIN biblio_domaine_lier ON (b_i_iditem = b_dl_iditem) ' .
' LEFT JOIN biblio_domaine ON (b_dl_iddom = b_d_id) ' .
' LEFT JOIN biblio_item_typphy ON (b_i_typphy = b_ip_id) ' .
' LEFT JOIN biblio_item_typlog ON (b_i_typlog = b_il_id) ' .
' WHERE B_I_TYPLOG = 1 AND B_I_TYPPHY = 2 AND B_I_CACHER = 0 '.
' AND B_D_ID = 1 ';
foreach ($tab_mots as $mot) {
$sql .= " AND (B_I_TITRE LIKE '%$mot%' ".
" OR B_I_RESUMCLE LIKE '%$mot%' ".
" OR B_I_COMMENT LIKE '%$mot%') ";
}
$sql .= 'ORDER BY B_I_AUTEURS LIMIT '.$depart.', '.$limite;
 
$publications = $this->Bdd->recupererTous($sql);
return $publications;
}
function formaterPublications($publications) {
$resultats = array();
foreach($publications as $publication) {
$id_a = $publication['B_I_IDITEM'];
$titre = $publication['B_I_TITRE'];
$auteurs = $publication['B_I_AUTEURS'];
$geo = $publication['B_I_GEO'];
$langue = $publication['B_I_LANGUE'];
$resum = $publication['B_I_RESUMCLE'];
$image = $publication['B_I_IMAGE'];
$comment = $publication['B_I_COMMENT'];
// Table Auteur Saisie
$saisie = $publication['B_AS_LIBELLE'];
// Table Domaine
$domaine_id = $publication['B_D_ID'];
$domaine_nom = $publication['B_D_LABEL'];
// Table Collection
$coll_nom = $publication['B_C_NOMCOMPLET'];
$coll_abreviation = $publication['B_C_ABREGE'];
// Table S�rie
$serie_titre = $publication['B_SER_SOUSTITRE'];
// Table Fascicule
$craicoll = $publication['B_F_CRAICOLL'];
$date = $publication['B_F_DATE'];
$fascicule_titre = $publication['B_F_TITRE'];
// Table Article
$craifasc = $publication['B_A_CRAIFASC'];
$craiserie = $publication['B_A_CRAISERIE'];
$page_debut = $publication['B_A_PAGEDEBUT'];
$page_fin = $publication['B_A_PAGEFIN'];
// Table Structure
$nomstr = $publication['B_S_NOM'];
// Formatage de la chaine de publication
$chainePublication = "";
if (isset($domaine_nom)) {
$chainePublication .= '<span class="texte_inactif">['.$domaine_nom.']</span>';
}
if (isset($auteurs)) {
$chainePublication .= $auteurs;
}
if (isset($titre)) {
$chainePublication .= " - <strong>$titre</strong>";
}
if (isset($date)) {
$chainePublication .= " - $date";
}
 
if (isset($mots_cles)) {
$chainePublication .= " - <em>$mots_cles</em>";
}
if (isset($page_debut)) {
$chainePublication .= ", p. $page_debut";
if (isset($page_fin)) {
$chainePublication .= "- $page_fin";
}
}
if (isset($geo)) {
$chainePublication .= " - Départ./Région : <em>$geo</em>";
}
if (isset($structure)) {
$chainePublication .= " - $structure";
}
if (isset($coll_nom)) {
$chainePublication .= ", $coll_nom";
}
if (isset($craiserie)) {
$chainePublication .= ", $craiserie";
}
if (isset($lien)) {
$chainePublication .= ", <a class=\"lien_ext\" href=\"$lien_url\">$fascicule_titre</a>";
} else {
$chainePublication .= ", $fascicule_titre";
}
if (isset($saisie_auteur)) {
$chainePublication .= " - <span class=\"texte_inactif\">Saisie : $saisie_auteur - Art. n°$article_id</span>";
}
$resultats[$id_a]['reference_html'] = $chainePublication;
}
$retour = array('entete' => $this->construireEntete(), 'resultats' => $resultats);
return $retour;
}
private function definirValeurParDefautDesParametres() {
if (isset($this->parametres['navigation.depart']) == false) {
$this->parametres['navigation.depart'] = 0;
}
if (isset($this->parametres['navigation.limite']) == false) {
$this->parametres['navigation.limite'] = 10;
}
}
 
private function verifierParametres() {
$erreurs = array();
if ($this->verifierValeurParametreNavigationDepart() == false) {
$erreurs[] = "Le paramètre 'navigation.depart' doit possèder un valeur numérique.";
}
if ($this->verifierValeurParametreNavigationLimite() == false) {
$erreurs[] = "Le paramètre 'navigation.limite' doit possèder un valeur numérique supérieure à 0.";
}
 
if (count($erreurs) > 0) {
$message = implode('<br />', $erreurs);
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE;
throw new Exception($message, $code);
}
}
 
private function verifierValeurParametreNavigationDepart() {
$depart = $this->parametres['navigation.depart'];
$ok = is_numeric($depart) ? true : false;
return $ok;
}
 
private function verifierValeurParametreNavigationLimite() {
$limite = $this->parametres['navigation.limite'];
$ok = (is_numeric($limite) && $limite != 0) ? true : false;
return $ok;
}
 
private function recupererParametresMasque() {
if (isset($this->parametres['masque.taxon'])) {
$this->masque_taxon = $this->parametres['masque.taxon'];
} else {
$this->masque_taxon = "";
}
}
 
private function chargerNbrePublicationsTotal() {
$tab_mots = preg_split('~ ~', $this->masque_taxon, -1, PREG_SPLIT_NO_EMPTY);
$requete = 'SELECT COUNT(B_I_IDITEM) AS nbre '.
'FROM biblio_item '.
' LEFT JOIN biblio_aut_saisie ON (b_i_auteursaisie = b_as_id) '.
' LEFT JOIN biblio_article ON (b_i_iditem = b_a_idart) '.
' LEFT JOIN biblio_fasc ON '.
' (B_F_CRAICOLL = B_A_CRAICOLL '.
' AND B_F_CRAISERIE = B_A_CRAISERIE '.
' AND B_F_NUMERO = B_A_CRAIFASC)' .
' LEFT JOIN biblio_serie ON ' .
' (b_f_craicoll = b_ser_craicoll ' .
' AND b_f_craiserie = b_ser_idserie) '.
' LEFT JOIN biblio_collection ON (b_ser_craicoll = b_c_crai) '.
' LEFT JOIN biblio_str ON (B_C_LKSTR = B_S_IDSTR) '.
' LEFT JOIN biblio_domaine_lier ON (b_i_iditem = b_dl_iditem) ' .
' LEFT JOIN biblio_domaine ON (b_dl_iddom = b_d_id) ' .
' LEFT JOIN biblio_item_typphy ON (b_i_typphy = b_ip_id) ' .
' LEFT JOIN biblio_item_typlog ON (b_i_typlog = b_il_id) ' .
' WHERE B_I_TYPLOG = 1 AND B_I_TYPPHY = 2 AND B_I_CACHER = 0 '.
' AND B_D_ID = 1 ';
foreach ($tab_mots as $mot) {
$requete .= " AND (B_I_TITRE LIKE '%$mot%' ".
" OR B_I_RESUMCLE LIKE '%$mot%' ".
" OR B_I_COMMENT LIKE '%$mot%') ";
}
$resultats = $this->Bdd->recuperer($requete);
$this->nbrePublications = (int) $resultats['nbre'];
}
 
private function construireEntete() {
$entete = array('masque' => '', 'depart' => 0, 'limite' => 10, 'total' => 0);
 
$entete['masque'] = $this->recupererMasque();
$entete['depart'] = (int) $this->parametres['navigation.depart'];
$entete['limite'] = (int) $this->parametres['navigation.limite'];
$entete['total'] = $this->nbrePublications;
if ($hrefPrecedent = $this->recupererHrefPrecedent()) {
$entete['href.precedent'] = $hrefPrecedent;
}
if ($hrefSuivant = $this->recupererHrefSuivant()) {
$entete['href.suivant'] = $hrefSuivant;
}
return $entete;
}
 
private function recupererMasque() {
$masqueEntete = '';
if ($this->masque_taxon) {
$masqueEntete = "masque.taxon=$this->masque_taxon";
}
return $masqueEntete;
}
private function recupererHrefPrecedent() {
$departActuel = $this->parametres['navigation.depart'];
$limite = $this->parametres['navigation.limite'];
$departPrecedent = $departActuel - $limite;
$url = null;
if ($departPrecedent >= 0) {
$url = $this->obtenirUrlNavigation($departPrecedent, $limite, array('masque.taxon' => $this->masque_taxon));
}
return $url;
}
 
private function recupererHrefSuivant() {
$departActuel = $this->parametres['navigation.depart'];
$limite = $this->parametres['navigation.limite'];
$departSuivant = $departActuel + $limite;
$url = null;
if ($departSuivant < $this->nbrePublications) {
$url = $this->obtenirUrlNavigation($departSuivant, $limite, array('masque.taxon' => $this->masque_taxon));
}
return $url;
}
 
private function obtenirUrlNavigation($depart, $limite, $parametresAdditionnels) {
$parametres = array(
'navigation.depart' => $depart,
'navigation.limite' => $limite);
if ($parametresAdditionnels != null) {
$parametres = array_merge($parametres, $parametresAdditionnels);
}
$this->UrlNavigation->setRequete($parametres);
$url = $this->UrlNavigation->getURL();
return $url;
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/wikipedia/Textes.php
New file
0,0 → 1,80
<?php
// declare(encoding='UTF-8');
/**
* Classe implémentant l'API d'eFlore Textes pour le projet WIKIPEDIA.
*
* @see http://www.tela-botanica.org/wikini/eflore/wakka.php?wiki=EfloreApi01Textes
*
* @package eFlore/services
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2012 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
class Textes extends Commun{
 
protected $parametres = array();
protected $ressources = array();
protected $service = 'textes';
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->parametres = $parametres;
$this->ressources = $ressources;
 
$this->analyserRessources();
$resultat = $this->executerSousService();
 
return $resultat;
}
 
private function analyserRessources() {
$nbreRessources = count($this->ressources);
if ($nbreRessources == 0) {
$message = "A implémenter : listes des pages trouvées";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
} else if ($nbreRessources == 1) {
if ($this->etreRessourceIdentifiants(0)) {
$this->sousService = 'Page';
} else {
$message = "La ressource n°1 '{$this->ressources[0]} indiquée n'est pas valable.";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE;
throw new Exception($message, $code);
}
} else if ($nbreRessources > 1) {
$message = "Les ressources indiquées ne sont pas valables.";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE;
throw new Exception($message, $code);
}
}
 
private function etreRessourceIdentifiants($position) {
$ok = true;
if (isset($this->ressources[$position])) {
$ids = $this->ressources[$position];
$supraSpPattern = "[A-Z][a-z]+";
$spPattern = "{$supraSpPattern}_[a-z]+";
$pagePattern = "/^(?:$supraSpPattern|$spPattern)$/i";
$ok = preg_match($pagePattern, $ids) ? true : false;
}
return $ok;
}
 
private function executerSousService() {
if (isset($this->sousService)) {
$classe = $this->sousService.'Textes';
require_once dirname(__FILE__).DS.'textes'.DS.$classe.'.php';
$sousService = new $classe($this->ressources, $this->parametres, new Conteneur());
$resultat = $sousService->consulter();
} else {
$message = "L'analyse des ressources n'a pu aboutir à déterminer le sous service à exécuter.";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
}
return $resultat;
}
 
 
}
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/wikipedia/NomCommune.php
New file
0,0 → 1,127
<?php
// declare(encoding='UTF-8');
/**
* Classe permettant d'obtenir le nom et le code INSEE des communes les plus proches d'un point (latitude et longitude).
* La latitude et longitude doivent être exprimée par un nombre décimal.
* Ce service fonctionne uniquement sur les communes des DROM-COM présentent
* sur Wikipedia FR à cette adrese : http://fr.wikipedia.org/
* Source des données : Wikipedia http://fr.wikipedia.org/
* Paramètres du service :
* - lat : latitude
* - lon : longitude
* Exemple :
* http://localhost/service:eflore:0.1/wikipedia/nom-commune?lat=44.71546&lon=3.84216
*
* @category php 5.2
* @package lion1906
* @author Mohcen BENMOUNAH <mohcen@tela-botanica.org>
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @copyright Copyright (c) 2010, Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
* @license http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
* @license http://www.gnu.org/licenses/gpl.html Licence GNU-GPL
* @version $Id$
*/
class NomCommune {
 
const PATTERN_LAT = '/^[0-9]+(?:[.][0-9]+|)$/';
const PATTERN_LON = '/^[-]?[0-9]+(?:[.][0-9]+|)$/';
const NBRE_COMMUNE_PAR_DEFAUT = 10;
const NBRE_COMMUNE_MAX = 100;
const MIME_JSON = 'application/json';
private $bdd = null;
 
public function __construct(Bdd $bdd) {
$this->bdd = $bdd;
}
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->parametres = $parametres;
$this->ressources = $ressources;
 
$this->definirParametresParDefaut();
$this->verifierParametres();
 
$nomINSEEs = $this->trouverCommunesProches();
$corps = $this->formaterResultats($nomINSEEs);
 
$resultat = new ResultatService();
$resultat->mime = self::MIME_JSON;
$resultat->corps = $corps;
return $resultat;
}
 
private function definirParametresParDefaut() {
if (array_key_exists('nbre', $this->parametres) === false) {
$this->parametres['nbre'] = self::NBRE_COMMUNE_PAR_DEFAUT;
}
}
 
private function verifierParametres() {
extract($this->parametres);
$messages = array();
if (! array_key_exists('lat', $this->parametres)) {
$messages[] = "Vous devez indiquer une latitude en degré décimal à l'aide du paramètres d'url : lat";
} else if (!preg_match(self::PATTERN_LAT, $lat)) {
$messages[] = "La valeur de latitude doit être un nombre décimal dont le séparateur décimal est un point. Ex. : 44 ou 43.03";
}
if (! array_key_exists('lon', $this->parametres)) {
$messages[] = "Vous devez indiquer une longitude en degré décimal à l'aide du paramètres d'url : lon";
} else if (!preg_match(self::PATTERN_LON, $lon)) {
$messages[] = "La valeur de longitude doit être un nombre décimal dont le séparateur décimal est un point. Ex. : -4.03 ou 3.256";
}
if (array_key_exists('nbre', $this->parametres)) {
if (!preg_match('/^[0-9]+$/', $nbre)) {
$messages[] = "Le nombre de commune le plus proche à retourner doit être un entier positif. Ex. : 10";
} else if ($nbre > self::NBRE_COMMUNE_MAX) {
$messages[] = "Le nombre de commune le plus proche à retourner doit être un entier positif inférieur à {self::NBRE_COMMUNE_MAX}. Ex. : 10";
}
}
 
if (count($messages) != 0) {
$message = implode('<br />', $messages);
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE;
throw new Exception($message, $code);
}
}
 
private function formaterResultats($nomINSEEs) {
$communes_trouvees = null;
if (isset($nomINSEEs) && !empty($nomINSEEs)) {
foreach ($nomINSEEs as $nomINSEE) {
$communes_trouvees[] = array('nom' => $nomINSEE['nom'], 'codeINSEE' => $nomINSEE['code_insee']);
}
if (!is_null($communes_trouvees)) {
if ($this->parametres['nbre'] == 1 && count($communes_trouvees) == 1) {
$communes_trouvees = $communes_trouvees[0];
}
} else {
$message = "Le service '".get_class($this)."' n'a trouvé aucune commune correspondant aux coordonnées : {$parametres['lat']}, {$parametres['lon']}.";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
}
} else {
$message = "Le service '".get_class($this)."' n'a trouvé aucune commune dont le centroïde correspond aux coordonnées : {$parametres['lat']}, {$parametres['lon']}.";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
}
return $communes_trouvees;
}
 
/**
* requête qui récupère les 20 communes les plus proches du point recherché
* La distance(AB = \sqrt{(x_B-x_A)^2 + (y_B-y_A)^2}) est calculée sans la racine
* (calcul en plus qui change pas le résultat).
*/
private function trouverCommunesProches() {
$lat = $this->parametres['lat'];
$lon = $this->parametres['lon'];
$requete = "SELECT (({$lat} - X(centroide)) * ({$lat} - X(centroide)) + ({$lon} - Y(centroide)) * ({$lon} - Y(centroide))) AS distance, ".
"code_insee, nom ".
'FROM wikipedia_communes_v2011 '.
'ORDER BY distance '.
"LIMIT {$this->parametres['nbre']} ";
$resultat = $this->bdd->recupererTous($requete);
return $resultat;
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/wikipedia/textes/PageTextes.php
New file
0,0 → 1,132
<?php
class PageTextes {
 
private $parametres = array();
private $ressources = array();
 
const MIME_JSON = 'application/json';
const PRESENCE_CHOROLOGIE = '1';
 
private $retourFormatsSupportes = array(self::MIME_JSON);
private $txtFormatsSupportes = array('txt', 'htm');
private $serviceUrl = null;
private $idPage = null;
private $wpBot = null;
private $infosPage = null;
 
public function __construct($ressources, $parametres, Conteneur $conteneur) {
$this->parametres = $parametres;
$this->ressources = $ressources;
 
$this->wpBot = $conteneur->getWikipediaBot();
$url = $conteneur->getParametre('url_service').DS.$this->ressources[0];
$this->serviceUrl = $conteneur->getUrl($url);
}
 
public function consulter() {
$this->idPage = $this->ressources[0];
 
$this->definirValeurParDefautDesParametres();
$this->verifierParametres();
 
$resultat = $this->obtenirResultat();
 
return $resultat;
}
 
private function definirValeurParDefautDesParametres() {
if (isset($this->parametres['retour']) == false) {
$this->parametres['retour'] = self::MIME_JSON;
}
if (isset($this->parametres['txt.format']) == false) {
$this->parametres['txt.format'] = 'txt';
}
}
 
private function verifierParametres() {
$erreurs = array();
 
if (isset($this->parametres['retour']) == false) {
$erreurs[] = "Le paramètre type de retour 'retour' est obligatoire.";
}
if ($this->verifierValeurParametreTxtFormat() == false) {
$erreurs[] = "Le format du texte '{$this->parametres['txt.format']}' n'est pas supporté.";
}
 
if (count($erreurs) > 0) {
$message = implode('<br />', $erreurs);
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE;
throw new Exception($message, $code);
}
}
 
private function verifierValeurParametreRetour() {
return in_array($this->parametres['retour'], $this->retourFormatsSupportes);
}
 
private function verifierValeurParametreTxtFormat() {
return in_array($this->parametres['txt.format'], $this->txtFormatsSupportes);
}
 
private function obtenirResultat() {
$this->chargerPageWp();
 
$resultat = new ResultatService();
$resultat->corps = $this->infosPage;
$resultat->mime = $this->parametres['retour'];
 
return $resultat;
}
 
private function chargerPageWp() {
$options = array('langue' => 'fr');
$this->wpBot = new WikipediaBot($options);
$this->wpBot->chargerPage($this->idPage);
 
$this->infosPage['id'] = $this->idPage;
$this->infosPage['titre'] = $this->wpBot->getPageTitre();
$this->infosPage['texte'] = $this->getTxt();
 
$this->infosPage['mime'] = $this->getTypeMime();
$this->infosPage['href'] = $this->getHref();
}
 
private function getTxt() {
$txt = '';
if (isset($this->parametres['txt.section.position'])) {
$positionSection = $this->parametres['txt.section.position'];
$txt = $this->wpBot->getSectionParNumero($positionSection);
} else if (isset($this->parametres['txt.section.titre'])) {
$titreSection = $this->parametres['txt.section.titre'];
if ($titreSection == 'taxobox') {
$txt = $this->wpBot->extraireTaxobox();
} else {
$txt = $this->wpBot->getSectionParTitre($titreSection);
}
} else {
$txt = $this->wpBot->getPageTxt();
}
if ($this->parametres['txt.format'] == 'htm') {
$txt = $this->wpBot->rendre($txt);
}
return $txt;
}
 
private function getTypeMime() {
$mime = '';
if ($this->parametres['txt.format'] == 'htm') {
$mime = 'txt/html';
} else if ($this->parametres['txt.format'] == 'txt') {
$mime = 'text/plain';
}
return $mime;
}
 
private function getHref() {
$href = '';
$this->serviceUrl->setRequete($this->parametres);
$href = $this->serviceUrl->getUrl();
return $href;
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/iso-639-1/Langues.php
New file
0,0 → 1,388
<?php
/**
* Description :
* Classe Langues.php fournit des informations sur ensemble structuré des termes et concepts représentant les éléments
* d'un domaine de connaissances .
* Le but étant de fournir un ensemble minimal d'information comprenant :
* un identifiant (numérique ou alphanumérique sous forme de ChatMot si possible), un nom, une region et
* éventuellement une relation hiérarchique avec un autre terme (=classe).
* Si l'url finit par /langues on retourne une liste de termes (seulement les 100 premières par défaut).
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /observations?param1=val1&param2=val2&...
*
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, masque.code, masque.nom, masque.region , recherche,
* distinct, retour.format, navigation.depart et navigation.limite.
*
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package framework-v3
* @author Delphine Cauquil <delphine@tela-botanica.org>
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-${year} Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
class Langues extends Commun {
 
protected $service = 'langues';
 
/**
* Permet de stocker la requete formulée : /langues | /langues/#id | /langues/#id/champ | /langues/#id/relations
* Est remplit au cours de l'analyse des ressources (traiterRessources()), par défaut, a la valeur du service.
* Est utilisée principalement pr déterminer le format du tableau à retourner. */
protected $format_reponse = 'langues';
 
/** Variables constituant les parametres de la requete SQL (champ, condition, group by, limit) remplie
* selon ressources et paramètres */
protected $requete_champ = ' * ';
protected $requete_condition = '';
protected $limite_requete = array(
'depart' => 0,
'limite' => 100
);
 
/** Stockage des ressources et paramétres */
protected $table_ressources = array();
protected $table_param = array();
/**
* Precise la contenance plus ou moins précise du tableau à retourner :
* - min = les données présentes dans la table
* - max = les données de la table + les informations complémentaires (pour les identifiants et les codes)
* - oss = la liste des nom_sci (uniquement pour noms et taxons)
*/
protected $retour_format = 'max';
protected $retour_langue = 'fr';
/** Valeur du paramètre de requete recherche :
* - stricte : le masque est passé tel quel à l'opérateur LIKE.
* - etendue : ajout automatique du signe % à la place des espaces et en fin de masque avec utilisation de LIKE.
* - floue : recherche tolérante vis-à-vis d'approximations ou d'erreurs (fautes d'orthographe par exemple) */
protected $recherche;
 
/** Permet de stocker le tableau de résultat (non encodé en json) */
protected $table_retour = array();
/** Stocke le nombre total de résultats de la requete principale. Est calculée lors de l'assemblage de la requete */
protected $total_resultat;
 
// +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
public function traiterParametres() {
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres)) {
$this->table_param = $$this->parametres;
 
// masque : filtre la liste en fonction d'un masque de recherche portant sur le code, le nom ou la region.
// masque.code : filtre uniquement sur le code. masque.nom : filtre uniquement sur le nom.
// masque.region : filtre uniquement sur la region.
if (isset($parametres['recherche']) && $parametres['recherche'] != '') {
$this->recherche = $parametres['recherche'];
}
 
foreach ($parametres as $param => $valeur) {
switch ($param) {
case 'masque' :
$this->ajouterLeFiltreMasque('masque', $valeur);
break;
case 'masque.code' :
$this->ajouterLeFiltreMasque('id', $valeur);
break;
case 'masque.nom' :
$this->ajouterLeFiltreMasque('nom', $valeur);
break;
case 'retour.langue' :
$this->retour_langue = $valeur;break;
case 'retour.format' :
$this->retour_format = $valeur;
break;
case 'navigation.depart' :
$this->limite_requete['depart'] = $valeur;
break;
case 'navigation.limite' :
$this->limite_requete['limite'] = $valeur;
break;
case 'recherche' :
break;
default :
$p = 'Erreur dans les paramètres de recherche de votre requête : '.
'</br> Le paramètre " '.$param.' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $p);
}
}
}
}
 
public function ajouterLeFiltreMasque($nom_champ, $valeur) {
if ($nom_champ == 'id') {
$this->requete_condition[] = $nom_champ.' = '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
} else {
if ($this->recherche == 'floue') {
if ($nom_champ == 'masque') {
$this->requete_condition[] = '( id = '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR ( SOUNDEX(nom) = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE(nom)) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\')) '
.')) ';
} else {
$this->requete_condition[] = '(SOUNDEX('.$nom_champ.') = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE('.$nom_champ.')) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\'))) ';
}
} else {
if ($this->recherche == 'etendue') {
$valeur = str_replace(' ','%', $valeur);
$valeur .= '%';
}
 
if ($nom_champ == 'masque') {
$this->requete_condition[] = '(dep = '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR nccenr LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR region = '.$this->getBdd()->proteger($valeur).')';
} else {
$this->requete_condition[] = $nom_champ.' LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
}
}
}
}
 
// +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
public function traiterRessources() {
if (isset($this->ressources) && !empty($this->ressources)) {
$this->table_ressources = $this->ressources;
if (isset($this->table_ressources[0]) && !empty($this->table_ressources[0])) {
//requete = /langues/#id
$this->traiterRessourceId();
if (isset($this->table_ressources[1]) && !empty($this->table_ressources[1])) {
//requete = /langues/#id/#champ ou /langues/#id/relations
$this->traiterRessourceChampOuRelations();
}
}
}
}
 
public function traiterRessourceId() {
//requete : /langues/#id (ex : /langues/7)
if (preg_match('/^[a-z]{2}$/', $this->table_ressources[0])) {
$this->requete_condition[] = ' id = '.$this->getBdd()->proteger($this->table_ressources[0]);
$this->format_reponse .= '/id';
} else {
$r = 'Erreur dans les ressources de votre requête : </br> La ressource " '.$this->table_ressources[0].
' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $r);
}
}
 
 
public function traiterRessourceChampOuRelations() {
//requete = /langues/#id/relations :
if ($this->table_ressources[1] == 'relations') {
$r = 'Erreur dans les ressources de votre requête : </br> La ressource " '.$this->table_ressources[1].
' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $r);
//requete = /langues/#id/#champ :
} else {
$this->format_reponse .= '/champ';
}
}
 
// +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
public function assemblerLaRequete() {
$requete = ' SELECT '.$this->requete_champ.
' FROM '.$this->table
.$this->formerRequeteCondition()
.$this->formerRequeteLimite();
return $requete;
}
 
public function formerRequeteCondition() {
$condition = '';
if ($this->requete_condition != null) {
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
}
return $condition;
}
 
 
//ajout d'une limite seulement pour les listes (pas plus de 100 resultats retournés pr les requetes
// suivantes : /langues et /langues/#id/relations)
public function formerRequeteLimite() {
if (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat())) {
//cas ou la requete presente un navigation.depart supérieur au nb total de resultats.
$this->limite_requete['depart'] =
(($nb - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($nb - $this->limite_requete['limite']);
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
} else {
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
}
return $this->requete_limite;
}
 
public function recupererTotalResultat() {
//on récupère le nombre total de résultats de la requete (ex : le nombre d'id contenu dans la liste /langues)
$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '.
$this->table.
$this->formerRequeteCondition();
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
 
if ($res) {
$total = $res['nombre'];
} else {
$t = 'Fonction recupererTotalResultat() : <br/>Données introuvables dans la base';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $t);
}
return $total;
}
 
// +-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// determine en fct du service appelé (/langues | /langues/#id | /langues/#id/champ |
// /langues/#id/relations) le format du tableau à retourner. Encode en json
public function retournerResultatFormate($resultat) {
$this->recupererTableConfig('correspondance_champs');
switch ($this->format_reponse) {
case 'langues' :
$reponse = $this->formaterLangues($resultat);
break;
case 'langues/id' :
$reponse = $this->formaterLanguesId($resultat[0]);
break;
case 'langues/id/champ' :
$reponse = $this->formaterLanguesIdChamp($resultat[0]);
break;
}
return $reponse;
}
 
public function formaterLangues($resultat) {
//on remplit la table $table_retour_json['entete']
$this->table_retour['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$this->table_retour['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$this->table_retour['total'] = $this->total_resultat;
//formuler les urls precedentes et suivantes affichées dans l'entete du resultat
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/langues');
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') {
$this->table_retour['href.precedent'] = $url['precedent'];
}
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') {
$this->table_retour['href.suivant'] = $url['suivant'];
}
 
$table_retour_json['entete'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
if ($this->retour_langue == 'fr') {$nom = 'nom'; } else {$nom = 'nom_'.$this->retour_langue;}
if (isset($this->table_param['masque_nom'])) $resultat = $this->trierRechercheFloue($this->table_param['masque_nom'], $resultat, $nom);
//on remplit la table $table_retour_json['resultat']
foreach ($resultat as $tab) {
foreach ($tab as $key => $valeur) {
if ($valeur != '') {
//TODO : vérifier d'où venez $id
if ($key == 'id') {// ATTENTION : au départ valait $id!
$num = $valeur;
$this->table_retour['code'] = $valeur;
break;
} elseif ($key == 'nom_'.$this->retour_langue || ($this->retour_langue == 'fr' && $key == 'nom')) {
$this->table_retour['nom'] = $valeur;
break;
} else {
switch ($key) {
case 'id' :
$num = $valeur; $this->table_retour['code'] = $valeur;
break;
case 'nom' :
$this->table_retour['nom'] = $valeur;
break;
}
}
}
}
if ($this->retour_format == 'max') {
$this->table_retour['href'] = $this->ajouterHref('langues', $num);
}
$resultat_json[$num] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
$table_retour_json['resultat'] = $resultat_json;
return $table_retour_json;
}
 
public function formaterLanguesId($resultat) {
foreach ($resultat as $key => $valeur) {
if ($valeur != '') {
$this->afficherDonnees($key, $valeur);
}
}
unset($this->table_retour['href']);
return $this->table_retour;
}
 
 
public function formaterLanguesIdChamp($resultat) {
//on recupère tous les resultats possibles
$reponse = $this->formaterLanguesId($resultat);
$this->table_retour = array();
//on recupère les résultats demandés à partir du tableau de résultat complet
$this->table_retour['id'] = $reponse['code'];
$champs = explode(' ', $this->table_ressources[1]);
 
foreach ($champs as $champ) {
if ($champ == 'nom') $champ = 'nom.fr';
if ($this->verifierValiditeChamp($champ)) {
if (strrpos($champ, '.*') !== false) {
$this->afficherPointEtoile($champ, $reponse);
 
} else {
if (isset($reponse[$champ])) {
$this->table_retour[$champ] = $reponse[$champ];
} else {
$this->table_retour[$champ] = null;
}
}
}
}
return $this->table_retour;
}
 
public function verifierValiditeChamp($champ) {
preg_match('/^([^.]+)(:?\.([^.]+))?$/', $champ, $match);
$champs_possibles = $this->correspondance_champs;
$champs_possibles[] = 'nom';
$champs_possibles[] = 'iso-639-2';
$champs_possibles[] = 'iso-639-3';
 
if (in_array($match[1], $champs_possibles)) {
$validite = true;
} elseif (in_array($match[0], $champs_possibles)) {
$validite = true;
} else {
$champs_possibles = implode('</li><li>', $champs_possibles);
$c = 'Erreur dans votre requête : </br> Le champ "'.$champ_possibles.'" n\'existe pas. '.
'Les champs disponibles sont : <li>'.$champs_possibles.'</li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $c);
}
return $validite;
}
 
public function afficherPointEtoile($champ, $reponse) {
preg_match('/^([^.]+\.)\*$/', $champ, $match);
foreach ($reponse as $chp => $valeur) {
if (strrpos($chp, $match[1]) !== false) {
if ($valeur != '') {
$this->table_retour[$chp] = $valeur;
} else {
$this->table_retour[$chp] = null;
}
}
}
}
 
public function afficherDonnees($champ, $valeur) {
if ($this->retour_format == 'max') {
if (strpos($champ, 'iso_639_') !== false) {
$projet = substr(str_replace('_', '-', $champ),5);
$this->table_retour[$projet.'.code'] = $valeur;
$this->table_retour[$projet.'.href'] = $this->ajouterHrefAutreProjet('langues', '', $valeur, $projet);
} else {
$this->table_retour[$this->correspondance_champs[$champ]] = $valeur;
}
} else {
$this->table_retour[$this->correspondance_champs[$champ]] = $valeur;
}
}
 
}
 
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/baseveg/precisions_sur_niveaux.txt
New file
0,0 → 1,16
Précisions pour les ontologies : voir le fichier log dans le script de baseveg.
 
 
niveaux existants :
ORD,ALL,ASS,CLA,SUBCLA,SUBORD,SUBASS,SUBCLA,SUBALL,BC,DC,GRPT
A ce jour je ne connais pas le sens de BC et DC.
synonymes :
"syn" suivi de un ou plusieurs des termes suivants :
incl,=,= ?,illeg,pp,pmaxp,pminp,compl,ambig,non,inval,nn,ined
on rencontre parfois des textes entre [ ] comme dans : " syn incl illeg [pro race hyperatlantique] ".
catminat : certains codes comme 01/A6.0.1.0.1/01 comportent des lettres (probablement pour bdafx (algues)).
ces cas ont été ignorés.
Property changes:
Added: svn:eol-style
+native
\ No newline at end of property
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/baseveg/syntaxons/SyntaxonsRelationsToutes.php
New file
0,0 → 1,89
<?php
/**
*
* syntaxons/relations -> retourne toutes les relations d'un syntaxon en fonction du numéro catminat
*
* * @package eflore-projets
* @author mathilde Salthun-Lassalle
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2012 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*
*/
 
 
 
class SyntaxonsRelationsToutes extends SyntaxonsCommun {
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->ressources = $ressources;
$this->parametres = $parametres;
$this->traiterParametres();
$resultats = null;
$resultat = $this->retournerResultatRelations();
// puisque notre implémentation de retournerResultatFormate() n'utilise pas NULL
// et que le prototype de Commun::traiterResultat() doit être respecté, nous passons
// NULL comme second paramètre.
$versionResultat = $this->traiterResultat($resultat, NULL);
$resultats = $versionResultat;
return $resultats;
}
 
// si je ne réinstancie pas la classe entre les appels à la méthode consulter, çà ne marche pas !
private function retournerResultatRelations () {
$resultat_relation = array();
$classe = new SyntaxonsRelation(new Conteneur());
$ressources_syn = array_merge($this->ressources, array('synonymie') );
$synonymie = $classe->consulter($ressources_syn,$this->parametres);
if ($synonymie != 'Les données recherchées sont introuvables') {
$resultat_relation['synonymie'] = $synonymie['resultat'];
}
$ressources_niv = array_merge($this->ressources, array('niveaux-sup') );
$classe = new SyntaxonsRelation(new Conteneur());
$niveaux = $classe->consulter($ressources_niv,$this->parametres);
if ($niveaux != 'Les données recherchées sont introuvables') {
$resultat_relation['niveaux_superieurs'] = $niveaux['resultat'];
}
return $resultat_relation;
}
//+-------------------------------------traitement des ressources et des paramètres----------------------------------------+//
 
public function traiterParametres() {
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres) ) {
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) {
if ($param != 'version.projet' || $param != 'retour.champs' ) {
$e = 'Erreur dans les parametres de votre requête : </br> Le paramètre " '
.$param.' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
}
}
 
//+--------------------------formatages de resultats -------------------------------------------+
public function retournerResultatFormate($resultat) {
$resultat_json = array();
$resultat_json['entete']['catminat'] = str_replace('-','/',$this->ressources[0]);
$resultat_json['resultat'] = $resultat;
return $resultat_json;
}
 
}
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/baseveg/syntaxons/SyntaxonsCode.php
New file
0,0 → 1,107
<?php
/**
*
* /syntaxons?masque.catminat=#catminat&masque.niveau=#niveau etc.--> retourne les syntaxons répondant à ces critères
* /syntaxons/cle:#cle --> retourne les informations de ce syntaxon ( peut être un synonyme )
*
* Remarque : le code fixe n'est pas tout à fait unique puisque certaines valeurs (ex. 1489)
* apparaissent 2 ou 3 fois avec des codes catminat ou des syntaxons sensiblement différents.
* C'est pourquoi il n'est pas utilisé.
*
*
* @package eflore-projets
* @author mathilde Salthun-Lassalle
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2012 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*
*/
 
class SyntaxonsCode extends SyntaxonsCommun {
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->ressources = $ressources;
$this->parametres = $parametres;
$this->traiterRessources();
$this->traiterParametres();
$this->definirTables();
$resultats = null;
$requete = '';
foreach ($this->table_version as $version) {
$this->table = $version;
$requete = $this->assemblerLaRequete();
$resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete);
$versionResultat = $this->traiterResultat($resultat, $version);
if (count($this->table_version) > 1) {
$resultats[$version] = $versionResultat;
} else {
$resultats = $versionResultat;
}
}
return $resultats;
}
function __construct(Conteneur $conteneur) {
parent::__construct($conteneur);
}
 
//+-------------------------------------traitement des ressources et des paramètres----------------------------------------+//
public function traiterRessources() {
$catminat='';
if(preg_match("/catminat:(([0-9]{2}\-$)|([0-9]{2}\-[0-9]\.$)|([0-9]{2}\-(?:[0-9]\.){1,5}[0-9]$)|([0-9]{2}\-(?:[0-9]\.){4,5}[0-9]\-[0-9]+(?:bis|ter|quater){0,1}$))/",$this->ressources[0], $retour)) {
$this->catminat = str_replace('-', '/',$retour[1]);
$this->requete_condition[] = ' code_catminat = \''.$this->catminat.'\' ' ;
$this->requete_condition[] = ' niveau NOT LIKE \'syn%\' ';
} elseif (preg_match("/cle:([0-9]+)/",$this->ressources[0], $retour)) {
$this->champs_recherches = ' * ';
$this->requete_condition[] = ' cle = '.$retour[1].' ' ;
}elseif ($this->ressources[0]) {
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> La ressource demandée n\'existe pas.';
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
return $catminat;
}
public function traiterParametres() {
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres) ) {
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) {
switch ($param) {
case 'version.projet' :
$this->traiterVersion($valeur);
break;
default :
$e = 'Erreur dans les parametres de votre requête : </br> Le paramètre " '
.$param.' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e); break;
}
}
}
}
//+--------------------------formatages de resultats -------------------------------------------+
public function retournerResultatFormate($resultat) {
$resultat_json = array();
foreach ($resultat as $cle => $res) {
$resultat[$cle] = array_merge($resultat[$cle],$this->traiterOntologieNiveau($res['niveau']));
unset($resultat[$cle]['niveau']);
$resultat[$cle] = $this->enleverValeursVides($resultat[$cle]);
}
$resultat_json['resultat'] = $resultat;
return $resultat_json;
}
 
}
 
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/baseveg/syntaxons/SyntaxonsTous.php
New file
0,0 → 1,152
<?php
/**
*
* /syntaxons --> retourne l'ensemble des tuples de la table
* /syntaxons?masque.catminat=#catminat&masque.niveau=#niveau etc.--> retourne les syntaxons répondant à ces critères
*
* * @package eflore-projets
* @author mathilde Salthun-Lassalle
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2012 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*
*/
 
class SyntaxonsTous extends SyntaxonsCommun {
 
function __construct(Conteneur $conteneur) {
parent::__construct($conteneur);
$this->champs_recherches = 'cle, code_catminat, syntaxon, code_fixe_nom, code_natura_2000, niveau ';
}
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->ressources = $ressources;
$this->parametres = $parametres;
$this->traiterParametres();
$this->definirTables();
$resultats = null;
foreach ($this->table_version as $version) {
$this->table = $version;
$requete = $this->assemblerLaRequete();
$resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete);
// puisque notre implémentation de retournerResultatFormate() n'utilise pas NULL
// et que le prototype de Commun::traiterResultat() doit être respecté, nous passons
// NULL comme second paramètre.
$versionResultat = $this->traiterResultat($resultat, NULL);
if (count($this->table_version) > 1) {
$resultats[$version] = $versionResultat;
} else {
$resultats = $versionResultat;
}
}
return $resultats;
}
//+-------------------------------------traitement des ressources et des paramètres----------------------------------------+//
public function traiterParametres() {
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres) ) {
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) {
switch ($param) {
case 'navigation.depart' :
$this->definirNavigationDepart($valeur);
break;
case 'navigation.limite' :
$this->definirNavigationLimite($valeur);
break;
case 'version.projet' :
$this->traiterVersion($valeur);
break;
case 'masque.catminat' :
$this->traiterCatminat($valeur);
break;
case 'masque.niveau' :
$this->traiterNiveau($valeur);
break;
case 'masque.retenu' :
$this->traiterRetenu($valeur);
break;
case 'masque.fixe' :
$this->requete_condition[] = ' code_fixe_nom = \''.$valeur.'\' ';
break;
case 'retour.champs' :
$this->champs_recherches .= ','.$valeur.' ';
break;
default :
$e = 'Erreur dans les parametres de votre requête : </br> Le paramètre " '
.$param.' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e); break;
}
}
}
}
public function traiterRetenu($valeur) {
$valeur = trim($valeur);
if( $valeur == 'true') {
$this->requete_condition[] = ' niveau NOT LIKE \'syn%\' ';
} elseif ( $valeur == 'false') {
$this->requete_condition[] = ' niveau LIKE \'syn%\' ';
}
}
public function traiterCatminat($valeur) {
$valeur = trim($valeur);
$valeur = str_replace('-', '/', $valeur);
$this->requete_condition[] = ' code_catminat = '.$this->getBdd()->proteger($valeur).'';
}
public function traiterNiveau($valeur) {
$valeur = strtoupper(trim($valeur));
if (in_array($valeur,$this->niv)) {
$this->requete_condition[] = ' niveau = '.$this->getBdd()->proteger($valeur).'';
//$this->requete_condition[] = ' code_catminat = '.$this->catminat.'';
} else {
$e = "Erreur : valeur inconnue pour masque.niveau."
." valeurs possibles : ALL|ORD|CLA|SUBCLA|SUBORD|SUBALL|ASS|SUBASS|BC|DC|GRPT";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
}
//+--------------------------formatages de resultats -------------------------------------------+
public function retournerResultatFormate($resultat) {
$resultat_json = array();
$resultat_json['entete'] = $this->ajouterEnteteResultat();
foreach ($resultat as $cle => $res) {
$resultat[$cle]['href'] = $this->ajouterHref('syntaxons','cle:'.$res['cle']);
$resultat[$cle] = array_merge($resultat[$cle],$this->traiterOntologieNiveau($res['niveau']));
unset($resultat[$cle]['niveau']);
}
$resultat_json['resultat'] = $resultat;
return $resultat_json;
}
public function ajouterEnteteResultat() {
$entete['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$entete['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$entete['total'] = $this->total_resultat;
$entete['version'] = $this->version_projet;
$ressources = (empty($this->ressources)) ? '/syntaxons' : '/syntaxons/' ;
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, $ressources.implode('/',$this->ressources));
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') {
$entete['href.precedent'] = $url['precedent'];
}
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') {
$entete['href.suivant'] = $url['suivant'];
}
return $entete;
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/baseveg/syntaxons/SyntaxonsRelation.php
New file
0,0 → 1,256
<?php
/**
*
* syntaxons/relations -> retourne toutes les relations d'un syntaxon en fonction du numéro catminat
*
* /syntaxons/catminat:#code_catminat/relations/niveaux_sup --> retourne les niveaux supérieurs d'un syntaxon
* /syntaxons/catminat:#code_catminat/relations/synonymie --> retourne tous les synonymes pour un code catminat
*
* @package eflore-projets
* @author mathilde Salthun-Lassalle
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2012 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*
*/
 
class SyntaxonsRelation extends SyntaxonsCommun{
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->ressources = $ressources;
$this->parametres = $parametres;
$this->traiterRessources();
$this->traiterParametres();
$this->definirTables();
$resultats = null;
$requete = '';
foreach ($this->table_version as $version) {
$this->table = $version;
$requete = $this->assemblerLaRequete();
$resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete);
$versionResultat = $this->traiterResultat($resultat, $this->version_projet);
if (count($this->table_version) > 1) {
$resultats[$version] = $versionResultat;
} else {
$resultats = $versionResultat;
}
}
return $resultats;
}
 
 
function __construct(Conteneur $conteneur) {
parent::__construct($conteneur);
$this->champs_recherches = 'cle, code_catminat, syntaxon, code_fixe_nom, code_natura_2000, niveau ';
}
 
//surchargée car le web-service est appelé par SyntaxonsRelationsToutes.
//ne doit pas renvoyer une erreur mais un résultat vide.
public function traiterResultat($resultat, $version) {
$versionResultat = null;
if ($resultat == '') {
$message = 'La requête SQL formée comporte une erreur!';
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
} elseif ($resultat) {
$versionResultat = $this->retournerResultatFormate($resultat);
} else {
$versionResultat = 'Les données recherchées sont introuvables';
}
return $versionResultat;
}
 
//+-------------------------------------traitement des ressources et des paramètres----------------------------------------+//
public function traiterRessources() {
$catminat='';
if(preg_match("/catminat:(([0-9]{2}\-$)|([0-9]{2}\-[0-9]\.$)|([0-9]{2}\-(?:[0-9]\.){1,5}[0-9]$)|([0-9]{2}\-(?:[0-9]\.){4,5}[0-9]\-[0-9]+(?:bis|ter|quater){0,1}$))/",$this->ressources[0], $retour)) {
$this->catminat = str_replace('-', '/',$retour[1]);
$this->traiterRessourcesRelations();
}elseif ($this->ressources[0]) {
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> La ressource demandée n\'existe pas.';
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
return $catminat;
}
public function traiterRessourcesRelations(){
if($this->ressources[1] == 'relations') {
switch($this->ressources[2]) {
case 'niveaux-sup':
$catminat_sup = $this->chercherCatminatSuperieurs();
if (!empty($catminat_sup)) {
if (count($catminat_sup)>1) {
$this->requete_condition[] = ' code_catminat in ('.implode(',',$catminat_sup).')';
} else {
$this->requete_condition[] = ' code_catminat = '.$catminat_sup[0].' ';
}
} else {
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : le code catminat est trop court.';
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
break;
case 'synonymie' :
$this->requete_condition[] = " niveau LIKE 'syn%' and code_catminat = '".$this->catminat."' " ;
break;
default :
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> La ressource demandée n\'existe pas.';
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
} else {
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> La ressource demandée n\'existe pas.';
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
}
//ne renvoie que les supérieurs ( sans la valeur initiale )
public function chercherCatminatSuperieurs() {
$catminat_sup = array();
$catminat_slash = explode('/',$this->catminat);
$catminat_slash = $this->enleverValeursVides($catminat_slash);
$taille_slash = count($catminat_slash);
if ($taille_slash > 1) {
$catminat_sup[0] = "'".array_shift($catminat_slash)."/'";
$niveaux = array_shift($catminat_slash);
$unites = explode('.',trim($niveaux)); //attention explode peut renvoyer des cases vides (voir la doc php)
$unites = $this->enleverValeursVides($unites);
$taille = ($taille_slash == 3) ? count($unites) : count($unites)-1 ;
for ($i=0; $i< $taille ; $i++) {
$sup = "'".trim($catminat_sup[$i],"'");
if ($i == 0) {
$sup .= $unites[$i].".'";
} elseif ($i == 1) {
$sup .= $unites[$i]."'";
} else {
$sup .= ".".$unites[$i]."'";
}
$catminat_sup[] = $sup;
}
}
return $catminat_sup;
}
public function traiterParametres() {
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres) ) {
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) {
switch ($param) {
case 'navigation.depart' :
$this->definirNavigationDepart($valeur);
break;
case 'navigation.limite' :
$this->definirNavigationLimite($valeur);
break;
case 'version.projet' :
$this->traiterVersion($valeur);
break;
case 'masque.catminat' :
$this->traiterCatminat($valeur);
break;
case 'masque.niveau' :
$this->traiterNiveau($valeur);
break;
case 'masque.fixe':
$this->requete_condition[] = ' code_fixe_nom = \''.$valeur.'\' ';
break;
case 'retour.champs' :
$this->champs_recherches .= ','.$valeur.' ';
break;
case 'masque.retenu' :
$this->traiterRetenu($valeur);
break;
default :
$e = 'Erreur dans les parametres de votre requête : </br> Le paramètre " '
.$param.' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e); break;
}
}
}
}
public function traiterRetenu($valeur) {
if ($this->ressources[2] == 'niveaux-sup') {
$valeur = trim($valeur);
if( $valeur == 'true') {
$this->requete_condition[] = ' niveau NOT LIKE \'syn%\' ';
} elseif ( $valeur == 'false') {
$this->requete_condition[] = ' niveau LIKE \'syn%\' ';
}
} else {
$e = 'Erreur dans les parametres de votre requête : </br> Le paramètre " masque.retenu " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
public function traiterCatminat($valeur) {
if ($this->ressources[2] == 'niveaux-sup') {
$valeur = trim($valeur);
$valeur = str_replace('-', '/', $valeur);
$this->requete_condition[] = ' code_catminat = '.$this->getBdd()->proteger($valeur).'';
} else {
$e = 'Erreur dans les parametres de votre requête : </br> Le paramètre " masque.catminat " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e); break;
}
}
public function traiterNiveau($valeur) {
if ($this->ressources[2] == 'niveaux-sup') {
$valeur = strtoupper(trim($valeur));
if (in_array($valeur,$this->niv)) {
$this->requete_condition[] = ' niveau = '.$this->getBdd()->proteger($valeur).'';
} else {
$e = "Erreur : valeur inconnue pour masque.niveau."
." valeurs possibles : ALL|ORD|CLA|SUBCLA|SUBORD|SUBALL|ASS|SUBASS|BC|DC|GRPT";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
} else {
$e = 'Erreur dans les parametres de votre requête : </br> Le paramètre " masque.niveau " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
//+--------------------------formatages de resultats -------------------------------------------+//
public function retournerResultatFormate($resultat) {
$resultat_json = array();
$resultat_json['entete'] = $this->ajouterEnteteResultat();
foreach ($resultat as $cle => $res) {
$resultat[$cle]['href'] = $this->ajouterHref('syntaxons','cle:'.$res['cle']);
$resultat[$cle] = array_merge($resultat[$cle],$this->traiterOntologieNiveau($res['niveau']));
unset($resultat[$cle]['niveau']);
}
$resultat_json['resultat'] = $resultat;
return $resultat_json;
}
public function ajouterEnteteResultat() {
$entete['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$entete['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$entete['total'] = $this->total_resultat;
$entete['version'] = $this->version_projet;
$ressources = (empty($this->ressources)) ? '/syntaxons' : '/syntaxons/' ;
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, $ressources.implode('/',$this->ressources));
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') {
$entete['href.precedent'] = $url['precedent'];
}
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') {
$entete['href.suivant'] = $url['suivant'];
}
return $entete;
}
 
}
 
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/baseveg/syntaxons/SyntaxonsCommun.php
New file
0,0 → 1,195
<?php
/**
*
* fonctions et paramètres communs aux traitement des syntaxons
* - traitement de l'ontologie
* - fonction utiles pour les paramètres de configuration entre autres
* - traitement des tables et de leur version
* - traitement de la requête
*
* @package eflore-projets
* @author mathilde Salthun-Lassalle
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2012 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
require_once(dirname(__FILE__) . '/../../baseflor/Informations.php');
 
class SyntaxonsCommun extends Commun {
protected $table = "";
protected $format_reponse = 'syntaxons';
protected $serviceNom = 'syntaxons';
protected $Bdd;
protected $syn;
protected $niv;
protected $limite_requete = array('depart' => 0, 'limite' => 100);
protected $requete_condition = array();
protected $total_resultat;
protected $champs_recherches = ' * ';
protected $table_version;
protected $version_projet = '+' ;
static $cache = array();
public function __construct(Conteneur $conteneur) {
$this->Bdd = $conteneur->getBdd();
$this->syn = $this->getParametreTableauSpe('Paramètres.synonymes');
$this->niv = $this->getParametreTableauSpe('Paramètres.niveaux');
}
 
 
//+---------------------------------------------------outils------------------------------------------------//
protected function getParametreTableauSpe($cle) {
$tableau = array();
$parametre = Config::get($cle);
if (empty($parametre) === false) {
$tableauPartiel = explode(',', $parametre);
$tableauPartiel = array_map('trim', $tableauPartiel);
foreach ($tableauPartiel as $champ) {
$tableau[] = trim($champ,"'");// spécificité pour le = ? des synonymes
}
}
return $tableau;
}
//la fonction php array_filters ne marche pas sur le serveur
protected function enleverValeursVides($tableau) {
$tab = array();
foreach ($tableau as $cle => $valeur) {
if ($valeur != '' && is_int($cle)) {
$tab[] = $valeur;
} elseif ($valeur != '' && is_string($cle)) {
$tab[$cle] = $valeur;
}
}
return $tab;
}
//+++------------------------------traitement des versions----------------------------------------++
protected function traiterVersion($valeur) {
if (preg_match('/^[0-9]+(?:[._][0-9]+)*$/', $valeur) || $valeur == '+' || $valeur == '*') {
$this->version_projet = $valeur;
} else {
$e = "Erreur : La version est inconnue.";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
}
protected function definirTables() {
$table_num_version = $this->recupererVersionDisponible();
$prefixe_table = config::get('bdd_table');
if ( in_array($this->version_projet,$table_num_version) ) {
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.$this->version_projet;
} elseif ($this->version_projet == '+') {
$derniere_version = $table_num_version[count($table_num_version) - 1];
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.str_replace('.', '_', $derniere_version);
} elseif ($this->version_projet == '*') {
foreach ($table_num_version as $num_version) {
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.str_replace('.', '_', $num_version);
}
} else {
$e = "Erreur : La version est inconnue.";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
}
//+------------------------------------ontologies----------------------------------------------------+
protected function recupererOntologiesNiveau($valeur, $code){
$ontologie = array();
$url = Config::get('url_service_base').Config::get('nom_projet').
'/ontologies/'.$code.':'.urlencode(urlencode($valeur));
if(array_key_exists($url, self::$cache)) {
$val = self::$cache[$url];
} else {
$val = $this->consulterHref($url);
self::$cache[$url] = $val;
}
$ontologie['niveau.code'] = $valeur;
$ontologie['niveau.libelle'] = $val->nom;
$ontologie['niveau.href'] = $url;
return $ontologie;
}
protected function recupererOntologiesNiveauSyn($niveau){
$ontologie = array();
$synonymes = explode(' ',$niveau[1]);
$libelle = array();
$detail = array();
foreach ($synonymes as $syn) {
if ($syn == '=') {
$syn = 'equi';
} elseif ($syn == '= ?') {
$syn = 'prob';
}
if ($syn != '' && $syn != '?') {
$detail[] = $this->recupererOntologiesNiveau($syn, 'syn');
$dernier = end($detail);
$libelle[] = $dernier['niveau.libelle'].' ';
}
}
$ontologie['niveau.code'] = $niveau[0];
$ontologie['niveau.libelle'] = 'synonyme '.implode(' - ',$libelle);
if (isset($niveau[2])) {
$ontologie['niveau.libelle'] .= ' '.$niveau[2];
}
$ontologie['niveau.detail'] = $detail;
return $ontologie;
}
protected function traiterOntologieNiveau($niveau) {
$ontologie = array();
if ( preg_match('/syn {0,1}(['.implode($this->syn).']*)( *\[.+\])*/',$niveau,$retour)) {
$ontologie = $this->recupererOntologiesNiveauSyn($retour);
} else {
$ontologie = $this->recupererOntologiesNiveau($niveau, 'UP');
}
return $ontologie;
}
//+--------------------------FONCTIONS D'ASSEMBLAGE DE LA REQUETE-------------------------------------------+
protected function assemblerLaRequete() {
$requete = ' SELECT '.$this->champs_recherches.' FROM '.$this->table.' '
.Informations::retournerRequeteCondition($this->requete_condition).' '.$this->delimiterResultatsRequete();
return $requete;
}
protected function delimiterResultatsRequete() {
$this->total_resultat = Informations::calculerTotalResultat(
$this->getBdd(),
$this->table,
Array(),
$this->requete_condition);
 
$requete_limite = '';
if (($this->limite_requete['depart'] <= $this->total_resultat) ){
if (($this->limite_requete['limite'] + $this->limite_requete['depart'] )
< $this->total_resultat ){
$requete_limite = 'LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '
.$this->limite_requete['limite'];
}
} else {
$e = "Erreur : la valeur pour le paramètre navigation.départ est supérieure".
" au nombre total de résultats.";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE);
}
return $requete_limite;
}
 
}
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/baseveg/Ontologies.php
New file
0,0 → 1,345
<?php
/**
Classe Ontologies.php fournit des informations sur ensemble structuré des termes et concepts représentant les éléments
* d'un domaine de connaissances pour le projet baseveg.
*/
 
class BasevegOntologies extends Commun {
 
protected $requete_condition = null;
/** Permet de stocker la requete formulée: /ontologies | /ontologies/#id | /ontologies/#id/champ | /ontologies/#id/relations */
protected $format_reponse = 'ontologies';
/** Permet de stocker les limite de la requete SQL (par défaut seul les 100 premiers résultats seront retournés).
* Stocke également les valeurs des paramètres navigation.depart et navigation.limite passés dans la requete*/
protected $limite_requete = array( 'depart' => 0, 'limite' => 100);
/** Stocke le nombre total de résultats de la requete principale. Est calculée lors de l'assemblage de la requete */
protected $total_resultat;
protected $retour_format = 'max';
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->ressources = $ressources;
$this->parametres = $parametres;
$this->service = 'ontologies';
$this->traiterParametres();
$resultats = '';
$this->table = 'baseveg_ontologies';
$this->recupererNomChamp($this->table);
$this->traiterRessources();
$requete = $this->assemblerLaRequete();
$resultat = $this->getBdd()->recupererTous($requete);
$versionResultat = $this->traiterResultat($resultat, '');
$resultats = $versionResultat;
return $resultats;
}
public function traiterParametres() {
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres)) {
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) {
switch ($param) {
case 'masque' : $this->ajouterLeFiltreMasque('masque', $valeur); break;
case 'masque.code' : $this->ajouterLeFiltreMasque('code', $valeur); break;
case 'masque.nom' : $this->ajouterLeFiltreMasque('nom', $valeur); break;
case 'masque.description' : $this->ajouterLeFiltreMasque('description', $valeur); break;
case 'retour.format' : $this->retour_format = $valeur; break;
case 'navigation.depart' : $this->limite_requete['depart'] = $valeur; break;
case 'navigation.limite' : $this->limite_requete['limite'] = $valeur; break;
default :
$e = 'Erreur dans les parametres de recherche de votre requête : </br> Le paramètre " '
.$param.' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e); break;
}
}
}
}
 
public function ajouterLeFiltreMasque($nom_champ, $valeur) {
if ($nom_champ == 'code') {
$this->requete_condition[] = $nom_champ.' = '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
} else {
if (isset($this->parametres['recherche']) && $this->parametres['recherche'] == 'floue') {
if ($nom_champ == 'masque') {
$this->requete_condition[] = '( code = '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR ( SOUNDEX(nom) = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE(nom)) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\')) '
.') OR ( SOUNDEX(description) = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE(description)) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\')) ))';
} else {
$this->requete_condition[] = '(SOUNDEX('.$nom_champ.') = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE('.$nom_champ.')) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\')))';
}
} else {
if (isset($this->parametres['recherche']) && $this->parametres['recherche'] == 'etendue') {
$valeur = str_replace(' ','%', $valeur);
$valeur .= '%';
}
if ($nom_champ == 'masque') {
$this->requete_condition[] = '(code = '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR nom LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur)
.' OR description LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur).')';
} else {
$this->requete_condition[] = $nom_champ.' LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
}
}
}
}
 
 
public function traiterRessources() {
if (isset($this->ressources) && !empty($this->ressources)) {
if (isset($this->ressources[0]) && !empty($this->ressources[0])) {
//requete = /ontologies/#id
$this->traiterRessourceId();
if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {
//requete = /ontologies/#id/relations
$this->traiterRessourceRelations();
}
}
}
}
 
 
public function traiterRessourceId() {
$this->requete_condition = array();
//requete : /ontologies/#id (ex : /ontologies/7)
if (is_numeric($this->ressources[0])) {
$this->requete_condition[] = ' id = '.$this->getBdd()->proteger($this->ressources[0]);
$this->format_reponse .= '/id';
//requete : /ontologies/#classe:#code (ex : /ontologies/rangTaxo:290)
} elseif (strrpos($this->ressources[0], ':') !== false) {
$this->format_reponse .= '/id';
preg_match('/^([^:]+):([^:]+)$/', $this->ressources[0], $match);
$this->requete_condition[] =
' id = (SELECT id FROM '.$this->table.' WHERE code = BINARY '.$this->getBdd()->proteger($match[2])
.' AND classe_id = (SELECT id FROM '.$this->table.' WHERE code = BINARY '.$this->getBdd()->proteger($match[1]).'))';
} else {
$e = 'Erreur dans les paramètres de recherche de votre requête : </br> Le paramètre " '
.$this->ressources[0].' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
}
 
 
public function traiterRessourceRelations() {
//requete = /ontologies/#id/relations :
if ($this->ressources[1] == 'relations') {
$this->format_reponse .= '/relations';
$this->requete_condition = array('classe_id = (SELECT classe_id FROM '.$this->table.' WHERE '
.implode(' AND ', $this->requete_condition).')');
}
}
 
//+--------------------------FONCTION ASSEMBLAGE DE LA REQUETE-------------------------------------------+
 
public function assemblerLaRequete() {
$requete = ' SELECT '.$this->formerRequeteChamp().
' FROM '.$this->table
.$this->retournerRequeteCondition()
.$this->formerRequeteLimite(); //print_r($requete);
return $requete;
}
 
public function formerRequeteChamp() {
$champ[] = 'id';
if ($this->format_reponse == 'ontologies') {
$champ[] = 'nom, code ';
}
if (isset($this->parametres['retour_champs']) || $this->format_reponse == 'ontologies/id/champs') {
$champs_recherches = explode(',', $this->parametres['retour_champs']);
$champs_possibles = $this->rechercherChampsPossibles();
foreach ($champs_recherches as $champ_recherche) {
if ($this->verifierValiditeChamp($champ_recherche)) {
$champ[] = (preg_match('/classe/', $champ_recherche)) ? 'classe_id' : $champ_recherche;
}
}
}
if (count($champ) == 1) {
$champ = array(' * ');
}
return implode(', ', $champ);
}
 
public function rechercherChampsPossibles() {
$this->recupererNomChamp($this->table);
$champs_possibles = $this->champs_table;
$champs_possibles[] = 'classe.id';
$champs_possibles[] = 'classe';
$champs_possibles[] = 'classe.href';
return $champs_possibles;
}
 
public function verifierValiditeChamp($champ, $champs_possibles) {
$validite = false;
preg_match('/^([^.]+)(:?\.([^.]+))?$/', $champ, $match);
if (in_array($match[1], $champs_possibles)) {
$validite = true;
} else {
$champs = implode('</li><li>', $champs_possibles);
$e = 'Erreur dans votre requête : </br> Le champ "'.$champ
.'" n\'existe pas. Les champs disponibles sont : <li>'.$champs.'</li>';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e);
}
return $validite;
}
 
public function retournerRequeteCondition() {
$condition = '';
if ($this->requete_condition !== null) {
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
}
return $condition;
}
 
public function formerRequeteLimite() {
$this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat();
if (in_array($this->format_reponse , array('textes/id', 'textes/id/relations'))) {
$this->requete_limite = '';
} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat)) {
$this->limite_requete['depart'] =
(($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']);
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
} else {
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
}
return $this->requete_limite;
}
 
 
public function recupererTotalResultat() {
//on récupère le nombre total de résultats de la requete (ex : le nombre d'id contenu dans la liste /ontologies)
$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '.$this->table.' '
.$this->retournerRequeteCondition();
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($res) {
$total = $res['nombre'];
} else {
$e = 'Données introuvables dans la base';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
Debug::printr($requete);
}
return $total;
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
public function retournerResultatFormate($resultat) {
// determine en fct du service appelé (/ontologies | /ontologies/#id | /ontologies/#id/champ |
// /ontologies/#id/relations) le format du tableau à retourner. Encode en json
switch ($this->format_reponse) {
case 'ontologies' : $reponse = $this->formaterOntologies($resultat); break;
case 'ontologies/id' : $reponse = $this->formaterOntologiesId($resultat[0]); break;
case 'ontologies/id/relations' : $reponse = $this->formaterOntologiesIdRelations($resultat); break;
default : break;
}
return $reponse;
}
 
 
public function formaterOntologies($resultat) {
$this->ajouterEnteteResultat($resultat);
$table_retour_json['entete'] = $this->ajouterEnteteResultat($resultat);
if (isset($this->parametres['masque_code']) || isset($this->parametres['masque'])) {
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres['masque_code'], $resultat, 'code');
} elseif (isset($this->parametres['masque_nom'])) {
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres['masque_nom'], $resultat, 'nom');
} elseif (isset($this->parametres['masque_description'])) {
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres['masque_description'], $resultat, 'description');
}
//on remplit la table $table_retour_json['resultat']
foreach ($resultat as $tab) {
$num = $tab['id'];
unset($tab['id']);
foreach ($tab as $param => $valeur) {
$resultat_json[$num][$param] = $valeur;
}
if ($this->retour_format == 'max') $resultat_json[$num]['href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $num);
}
$table_retour_json['resultat'] = $resultat_json;
return $table_retour_json;
}
 
public function ajouterEnteteResultat($resultat) {
//on remplit la table $table_retour_json['entete']
$entete['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$entete['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$entete['total'] = $this->total_resultat;
//formuler les urls
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/ontologies');
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') { $entete['href.precedent'] = $url['precedent']; }
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') { $entete['href.suivant'] = $url['suivant']; }
return $entete;
}
 
 
public function formaterOntologiesId($resultat) {
$table_retour = array();
foreach ($resultat as $key => $valeur) {
if ($valeur != '') {
$table_retour = array_merge($table_retour, $this->afficherDonnees($key, $valeur));
}
}
return $table_retour;
}
 
public function afficherDonnees($champ, $valeur) {
$retour[$champ] = $valeur;
if ($this->retour_format == 'max') {
if ($champ == 'classe_id') {
unset($retour[$champ]); // remplacer par classe.id
if ($valeur != "0") { // pas de parent
if (isset($this->parametres['retour_champs'])) {
switch ($this->parametres['retour_champs']) {
case 'classe' : $retour['classe'] = $this->ajouterClasseCorrespondante($valeur); break;
case 'classe.id' : $retour['classe.id'] = $valeur; break;
case 'classe.href' : $retour['classe.href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $valeur); break;
case 'classe.*' : $retour['classe.id'] = $valeur; $retour['classe.href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $valeur); break;
}
} else {
$nom_classe = $this->ajouterClasseCorrespondante($valeur);
if (isset($nom_classe)) $retour['classe'] = $nom_classe;
$retour['classe.id'] = $valeur;
$retour['classe.href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $valeur);
}
}
}
}
return $retour;
}
 
/** Recherche par interrogation de la base, le nom de la classe à partir de son identifiant (classe.id) */
public function ajouterClasseCorrespondante($classe_id) {
if ($classe_id == 0) return NULL;
 
$nom = '';
$req = 'SELECT nom FROM '.$this->table.' WHERE id = '.$this->getBdd()->proteger($classe_id);
$res = $this->getBdd()->recuperer($req . ' -- ' . __FILE__ . ':' . __LINE__);
if ($res) {
$nom = $res['nom'];
} else {
$e = "Données introuvables dans la table $this->table";
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
Debug::printr($req);
}
return $nom;
}
 
public function formaterOntologiesIdRelations($resultat) {
$retour = null;
if ($resultat != '') {
$retour['entete'] = $this->ajouterEnteteResultat($resultat);
//on remplit la table $table_retour_json['resultat']
foreach ($resultat as $tab) {
$num = $tab['id'];
$retour['resultat'][$num]['nom'] = $tab['nom'];
if ($this->retour_format == 'max') {
$retour['resultat'][$num]['href'] = $this->ajouterHref('ontologies', $num);
}
}
}
return $retour;
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/baseveg/Syntaxons.php
New file
0,0 → 1,85
<?php
/**
* Classe Syntaxons.php permet de faire des requetes de baseveg autour du code CATMINAT ou des niveaux de syntaxons
* Un syntaxon est une unité de végétation ( groupement )
* Cette classe analyse les ressources pour rediriger vers la classe du web service correpondant
*
* @see http://www.tela-botanica.org/wikini/eflore/wakka.php?wiki=EfloreApi01Syntaxons
*
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package eflore-projets
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org>
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2012 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
class Syntaxons extends Commun {// héritage de commun à cause du cache !
private $sousService;
public function consulter($ressources, $parametres) {
spl_autoload_register(array($this, 'chargerSyntaxons'));
$this->parametres = $parametres;
$this->ressources = $ressources;
$this->analyserRessources();
$resultat = $this->executerSousService();
return $resultat;
}
private function analyserRessources() {
$nb_ressources = count($this->ressources);
switch ($nb_ressources) {
case 0 : // syntaxons/
$this->sousService = 'SyntaxonsTous';
break;
case 1 : // syntaxons/#type_code:#code
$this->sousService = 'SyntaxonsCode';
break;
case 2 : // syntaxons/code catminat/relations
$this->sousService = 'SyntaxonsRelationsToutes';
break;
case 3 : // syntaxons/code catminat/relations /#type_relation
$this->sousService = 'SyntaxonsRelation';
break;
default:
$message = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> La ressource demandée n\'existe pas.';
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
break;
}
}
private function executerSousService() {
if (isset($this->sousService)) {
$classe = $this->sousService;
//require_once dirname(__FILE__).DS.'syntaxons'.DS.$classe.'.php';
$sousService = new $classe(new Conteneur());
$resultat = $sousService->consulter($this->ressources, $this->parametres);
} else {
$message = "L'analyse des ressources n'a pu aboutir à déterminer le sous service à executer.";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
}
return $resultat;
}
 
private function chargerSyntaxons($classe) {
$base = dirname(__FILE__).DS;
$chemin = $base.DS.'syntaxons'.DS;
$fichierATester = $chemin.$classe.'.php';
if (file_exists($fichierATester)) {
include_once $fichierATester;
return null;
}
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/coste/Noms.php
New file
0,0 → 1,711
<?php
 
 
/**
* Description :
* Classe Noms.php permettant de fournir des informations sur les noms scientifiques.
* Si l'url finit par /noms on retourne une liste de noms latin et leurs identifiants (seulement les 100 premeiers noms par défaut).
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /noms?param1=val1&param2=val2&...
*
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, masque.gen (nom de genre), masque.sp (épithète d'espèce), masque.ssp (épithète infra-spécifique),
* masque.au (auteur du nom), masque.an (année de publication du nom), masque.bib (réf biblio de la publi d'origine du nom), masque.ad (nomen addendum),
* masque.nn (identifiant du nom), recherche, rang, distinct, retour.format, nl.format, nl.structure, navigation.depart et navigation.limite.
*
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package framework-v3
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-${year} Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
 
class Noms extends CommunNomsTaxons {
/** Permet de stocker la requete formulée :
* - noms | noms/#id | noms/#id/#champ+#champ
* - noms/#id/relations | noms/#id/relations/synonymie | noms/#id/relations/homonymie | noms/#id/relations/flores
* - noms/stats/rangs | noms/stats/annees | noms/stats/initiales */
protected $format_reponse = 'noms';
protected $service = 'noms';
/** Valeur du paramètre de requete recherche : stricte etendue floue */
protected $recherche = false;
/** Valeur du paramètre de requete distinct (=0|1) */
protected $distinct = null;
/** Représente la première partie de la requete SQL (entre le SELECT et le WHERE) */
protected $requete_champ = 'num_nom, nom_sci, num_nom_retenu';
/** Représente la partie de la requete SQL ajoutant une condition (WHERE ...) */
protected $requete_condition = '';
/** Représente la partie GROUP BY de la requete SQL (GROUP BY ...) */
protected $requete_group_by = '';
/** Permet de stocker les limite de la requete SQL (par défaut seul les 100 premiers résultats seront retournés).*/
protected $limite_requete = array(
'depart' => 0,
'limite' => 100
);
public function consulter($ressources, $parametres) {
$resultat_formate = '';
$res_version = '';
$this->initialiserRestClient(); //création d'un objet RestClient
$this->traiterParametres($parametres);
//On récupère les différentes versions existantes ds la table des meta-données (WS metaDonnees) et on traite la version demandée :
$this->traiterVersionProjet($ressources);
if ($this->corps_http == '' && $this->entete_http == '') {
foreach ($this->table_version as $version) {
$this->table = $version; //on stocke le nom de la table correspondant à la version du projet en cours
$this->recupererNomChamp($this->table); //on récupère les noms des champs disponibles (Ds Commun.php)
$this->traiterRessources($ressources); //dans CommunNomsTaxons.php
$requete = $this->assemblerLaRequete();
$resultat = $this->getBdd()->recupererTous($requete);
if ($resultat == '') { //cas ou la requete comporte des erreurs
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE,
'La requ&ecirc;te SQL form&eacute;e comporte une erreur !!');
} elseif ($resultat) {
$res_version[$version] = $resultat;
} else {
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE,
'Les donn&eacute;es recherch&eacute;es sont introuvables dans la version '.$version);
}
}
}
if ($this->corps_http == '' && $this->entete_http == '') {
$resultat_formate = $this->retournerResultatFormate($res_version);
}
$this->formerReponseHTTP($resultat_formate);
}
//-----------------FONCTION D'ANALYSE DES PARAMETRES--------------------------------------------------------------------
 
/**
*
* Permet d'analyser les paramètres
* @param array $parametres
*/
public function traiterParametres($parametres) {
$this->table_param = $parametres;
if (isset($parametres) && !empty($parametres)) {
//définition de $recherche permettant d'ajouter les % ds la requete sql (cas recherche étendue) utilisé dans la fct ajouterLeFiltreMasque()
if (isset($parametres['recherche']) && $parametres['recherche'] != '') {
$this->recherche = $parametres['recherche'];
}
foreach ($parametres as $param => $val) {
switch ($param) {
case 'ns_format' : $this->html = $val; break;
case 'ns_structure' : $this->remplirTableCompositionNom($val); //ds CommunNomsTaxons.php
$this->requete_champ .= ' ,'.implode(', ',$this->compo_nom); break;
case 'masque' : $this->ajouterLeFiltreMasque('nom_sci', $val); break;
case 'masque_sg' : $this->ajouterLeFiltreMasque('nom_supra_generique', $val); break;
case 'masque_gen' : $this->ajouterLeFiltreMasque('genre', $val); break;
case 'masque_sp' : $this->ajouterLeFiltreMasque('epithete_sp', $val); break;
case 'masque_ssp' : $this->ajouterLeFiltreMasque('epithete_infra_sp',$val); break;
case 'masque_au' : $this->ajouterLeFiltreMasque('auteur', $val); break;
case 'masque_an' : $this->ajouterLeFiltreMasque('annee', $val); break;
case 'masque_bib' : $this->ajouterLeFiltreMasque('biblio_origine',$val); break;
case 'masque_ad' : $this->ajouterLeFiltreMasque('nom_addendum', $val); break;
case 'masque_nn' : $this->requete_condition .= ' AND num_nom IN ('.$val.')'; break;
case 'masque_rg' : $this->ajouterLeFiltreMasque('rang', $val); break;
case 'navigation_depart': $this->limite_requete['depart'] = $val; break;
case 'navigation_limite': $this->limite_requete['limite'] = $val; break;
case 'retour_format' : $this->retour_format = $val; break;
case 'distinct' : $this->distinct = $val; break;
case 'recherche' : break;
default : $this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE,
'Erreur dans les parametres de recherche de votre requ&ecirc;te :
</br> Le parametre " '.$param.' " n\'existe pas.'); break;
}
}
$this->ajouterNomDistinct();
if ($this->recherche == 'floue') {
$this->rechercheFloue();
}
}
}
/**
*
* fonction d'ajout dans la requete SQL des conditions (WHERE ...) en fonctions des parametres demandés
* @param $nom_champ
* @param $valeur
* @param $masque
*/
public function ajouterLeFiltreMasque($nom_champ, $valeur) {
if ($nom_champ == 'annee' || $nom_champ == 'rang') {
$this->requete_condition .= ' AND '.$nom_champ.' = '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
} else {
if ($this->recherche == 'etendue') {
$valeur = str_replace(' ','%', $valeur);
$valeur .= '%';
}
$this->requete_condition .= ' AND '.$nom_champ.' LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
}
}
/**
* Permet de rajouter à la requete sql le parametre distinct. N'est utilisé qu'avec le format oss
*/
public function ajouterNomDistinct() {
if (isset($this->distinct)) {
if (($this->distinct == 1) && ($this->retour_format == 'oss')) {
if ($this->compo_nom == '') {
$this->requete_champ = ' DISTINCT nom_sci ';
} else {
$this->requete_champ = ' DISTINCT nom_sci, '.implode(', ',$this->compo_nom);
}
} elseif (($this->distinct == 1) && ($this->retour_format != 'oss')) {
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE,'Erreur dans votre requ&ecirc;te </br>
L\'utilisation du parametre distinct ne se fait que sous le format oss');
}
}
}
/**
*
* Permet d'ajouter à notre requete une condition de recherche floue à l'aide de l'alhorithme soundex.
* On remplace ainsi les filtres exceptés le masque année et le filtre rang
*/
public function rechercheFloue() {
foreach ($this->ordre_masque as $masque) {
if (array_key_exists($masque, $this->table_param)) {
$radical = $this->table_param[$masque];
switch ($masque) {
case 'masque' : $this->ajoutSoundex('nom_sci', $radical); break;
case 'masque_sg' : $this->ajoutSoundex('nom_supra_generique', $radical); break;
case 'masque_gen' : $this->ajoutSoundex('genre', $radical); break;
case 'masque_sp' : $this->ajoutSoundex('epithete_sp', $radical); break;
case 'masque_ssp' : $this->ajoutSoundex('epithete_infra_sp', $radical); break;
case 'masque_au' : $this->ajoutSoundex('auteur', $radical); break;
default : break;
}
}
}
}
/** Ajoute à la requete SQL l'expression pour la recherche floue en fonction du masque demandé */
public function ajoutSoundex($champ, $radical) {
$this->requete_condition = str_replace(' AND '.$champ.' LIKE \''.$radical.'\'',
' AND (SOUNDEX('.$champ.') = SOUNDEX(\''.$radical.'\')'.
' OR SOUNDEX(REVERSE('.$champ.')) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$radical.'\'))) ',
$this->requete_condition
);
}
//-----------------FONCTION D'ANALYSE DES RESSOURCES--------------------------------------------------------------------
 
 
public function traiterRessourcesIdentifiant() {
//on initialise la condition de la requete sql et le format de réponse
$this->requete_condition = ' num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($this->table_ressources[0]);
$this->format_reponse = $this->service.'/id';
if (isset($this->table_ressources[1]) && !empty($this->table_ressources[1])) {
// requete de type noms/#id/#champ+#champ
if (($this->table_ressources[1] != 'relations')) {
$this->requete_champ = ' *, nom_sci ';
$this->format_reponse .= '/champ';
// requete de type noms/#id/relations/#relations
} elseif ($this->table_ressources[1] == 'relations') {
$this->traiterRessourceIdRelations();
} else {
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE,
'Erreur dans votre requ&ecirc;te </br> Ressources disponibles : <br/>
<li> noms/#id/relations </li> <li> noms/#id/#champ+#champ </li>
<li> noms/#id/relations/synonymie </li> <li> noms/#id/relations/flores </li>
<li> noms/#id/relations/homonymie </li>');
}
} else {
// requete de type noms/#id : rajout du nom_sci pour récupérer le format html par la fct mettreAuFormat()
// SELECT *, nom_sci FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X;
$this->requete_champ = ' *, nom_sci ';
}
}
public function traiterRessourceIdRelations() {
$this->format_reponse .= '/relations';
if (isset($this->table_ressources[2]) && !empty($this->table_ressources[2])) {
// requete de type noms/#id/relations/#relation
switch ($this->table_ressources[2]) {
case 'synonymie' : $this->traiterRessourceIdSynonymie(); break;
case 'flores' : $this->traiterRessourceIdFlores(); break;
case 'homonymie' : $this->traiterRessourceIdHomonymie(); break;
default : $this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE,
'Erreur dans votre requ&ecirc;te </br> Ressources disponibles : <br/>
<li> noms/#id/relations </li> <li> noms/#id/relations/synonymie </li>
<li> noms/#id/relations/flores </li> <li> noms/#id/relations/homonymie </li>'); break;
}
}
}
public function traiterRessourceIdSynonymie() {
// SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu, basionyme FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X LIMIT 0,100;
$this->format_reponse .= '/synonymie';
if (strrpos($this->requete_champ, ', basionyme') === false) $this->requete_champ .= ', basionyme ';
$this->requete_condition = ' num_nom_retenu = (SELECT num_nom_retenu FROM '.$this->table
.' WHERE '.$this->requete_condition.')';
}
public function traiterRessourceIdHomonymie() {
// SELECT num_nom, nom_sci, num_nom_retenu FROM bdtfx_v2_00 WHERE nom_sci =
// (SELECT nom_sci FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
$this->format_reponse .= '/homonymie';
$this->requete_condition = 'nom_sci = (SELECT nom_sci FROM '.$this->table
.' WHERE '.$this->requete_condition.')';
}
public function traiterRessourceIdFlores() {
$champ_flores = '';
foreach ($this->champs_table as $champ) {
if (preg_match('/^flore_.*$/', $champ)) {
$champ_flores .= ', '.$champ;
}
}
$this->format_reponse .= '/flores';
$this->requete_champ = 'num_nom'.$champ_flores;
}
public function traiterRessourceStatsRangs() {
// SELECT count(*) as nombre, rang FROM bdtfx_v2_00 [WHERE rang = 290] GROUP BY rang ORDER BY rang;
$this->format_reponse .= '/rangs';
$this->requete_champ = 'count(*) as nombre, rang ';
$this->requete_group_by = ' GROUP BY rang ORDER BY rang ';
}
public function traiterRessourceStatsAnnees() {
// SELECT count(*) as nombre, annee FROM bdtfx_v2_00 GROUP BY annee ORDER BY annee;
$this->format_reponse .= '/annees';
$this->requete_champ = 'count(*) as nombre, annee ';
$this->requete_condition = '';
$this->requete_group_by = ' GROUP BY annee ORDER BY annee ';
}
public function traiterRessourceStatsInitiales() {
// SELECT count(left( nom_sci, 2 )) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre GROUP BY rang, left(nom_sci, 2);
$this->format_reponse .= '/initiales';
$this->requete_condition = '';
$this->requete_champ = 'count(left( nom_sci, 2 )) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre ';
$this->requete_group_by = ' GROUP BY rang, left(nom_sci, 2)';
}
//-----------------------------FONCTIONS DASSEMBLAGE DE LA REQUETE-----------------------------------------------------
public function assemblerLaRequete() {
if ( strrpos($this->format_reponse, 'noms/stats/') === false ) {
$this->mettreAuFormat(); //Ds CommunNomsTaxons.php
}
if ($this->requete_condition != '') {
$this->requete_condition = ltrim($this->requete_condition, ' AND, WHERE');
$this->requete_condition = ' WHERE '.$this->requete_condition;
}
if ($this->format_reponse != 'noms' && $this->format_reponse != 'noms/id/relations/synonymie' && $this->format_reponse != 'noms/id/relations/homonymie') {
$this->requete_limite = '';
} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat())) {
$this->limite_requete['depart'] =
(($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']);
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
} else {
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
}
$requete = ' SELECT '.$this->requete_champ.
' FROM '.$this->table
.$this->requete_condition
.$this->requete_group_by
.$this->requete_limite;
return $requete;
}
 
/**
* Recupere le nombre total de résultat d'une requete lancée.
* Est utilisée lors de l'affichage du total dans le résultat retourné et pr déterminer les limites et départ
* @return nombre total de résultat
*/
public function recupererTotalResultat() {
$total = null;
$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '.$this->table.$this->requete_condition.$this->requete_group_by;
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($res) {
$total = $res['nombre'];
} else {
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE,
'Fct recupererTotalResultat() : <br/>Donn&eacute;es introuvables dans la base');
}
return $total;
}
//-------------------FONCTIONS POUR LE FORMATAGE EN JSON----------------------------------------------------------------
/**
* Permet de récupérer le résultat à retourner propre à chaque requete et de l'encoder en json
* @param array $resultat
* @param array $ressources
* @return le résultat encoder en json
*/
public function retournerResultatFormate($resultat) {
switch ($this->format_reponse) {
case 'noms/id' : $reponse = $this->formaterId($resultat); break; //ds CommunNomsTaxons
case 'noms/id/champ' : $reponse = $this->formaterIdChamp($resultat); break; //ds CommunNomsTaxons
case 'noms/id/relations' : $reponse = $this->formaterIdRelations($resultat); break;
case 'noms/id/relations/synonymie' : $reponse = $this->formaterIdSynonymie($resultat); break;
case 'noms/id/relations/homonymie' : $reponse = $this->formaterIdHomonymie($resultat); break;
case 'noms/id/relations/flores' : $reponse = $this->formaterIdFlores($resultat); break; //ds CommunsNomsTaxons
case 'noms/stats/annees' : $reponse = $this->formaterStatsAnnee($resultat); break; //ds CommunNomsTaxons
case 'noms/stats/rangs' : $reponse = $this->formaterStatsRang($resultat); break; //ds CommunNomsTaxons
case 'noms/stats/initiales' : $reponse = $this->formaterStatsInitiales($resultat); break; //ds CommunNomsTaxons
case 'noms' : $reponse = $this->formaterNoms($resultat); break;
default : break;
}
return json_encode($reponse);
}
//----------------------concerne les resultats pour des requetes de type noms/id----------------------------------------
/**
* Formate et retourne toutes les relations correpondant au nom recherché : les flores, les synonyme et les homonymes
* @param array $resultat
*/
public function formaterIdRelations($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$res = array();
foreach ($resultat as $version => $res_version) {
$res_version = $res_version[0];
$this->resultat_req = $res_version;
$retour_id_rel = array ('entete' => array()); //on initialise pr que l'entete apparaisse en premier lors de l'affichage
//on recupère le resultat de chaque relation (appel du WS correspondant)
$flores = $this->ajouterRelations('flores', $version);
if (isset($flores)) $retour_id_rel['resultat']['flores'] = $flores;
$homonymes = $this->ajouterRelations('homonymie', $version);
if (isset($homonymes)) $retour_id_rel['resultat']['homonymes'] = $homonymes;
$synonymes = $this->ajouterRelations('synonymie', $version);
if (isset($synonymes)) $retour_id_rel['resultat']['synonyme'] = $synonymes;
//on renvoit un tableau null si il n'existe aucune relations (on efface l'entete en premier lieu)
if (!isset($retour_id_rel['resultat'])) {
$retour_id_rel = null;
//on rajoute l'entete si des relations existent
} else {
$this->afficherDonnees('num_nom', $this->table_ressources[0]);
$retour_id_rel['entete'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
//recuperation du resultat de chaque version
$res = $this->afficherVersionOuPas($version, $retour_id_rel, $res);
}
return $res;
}
/**
* Recupere les relations (type de la relation passée en paramètres :[type_relation] = synonymie, homonymie ou
* flores) par l'appel du web service [version]/noms/#id/relations/[type_relation]
* @param String $relation
* @param String $version (numéro de la version)
*/
public function ajouterRelations($relation, $version) {
$version = str_replace(Config::get('bdd_table').'_v', '', $version);
$res = null;
$parametres_url = '';
if ($this->table_param != array()) $parametres_url = '?'.http_build_query($this->table_param, '', '&');
$url = Config::get('url_service').'/'.$version.'/'.$this->service.'/'.$this->table_ressources[0].'/relations/'
.$relation.$parametres_url;
$relation = $this->rest_client->consulter($url);
$entete = $this->rest_client->getReponseEntetes();
//Si le service meta-donnees fonctionne correctement, l'entete comprend la clé wrapper_data
if (isset($entete['wrapper_data'])) {
$relation = json_decode($relation);
if (isset($relation->resultat)) {
$res = $relation->resultat;
}
} else {
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE,
'Le service '.$this->service.' de ce projet comporte des erreurs. url lancée : '.$url);
}
return $res;
}
/**
* Formate et retourne toutes les synonymes correpondants au nom recherché
* @param array $resultat
*/
public function formaterIdSynonymie($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$res = array();
foreach ($resultat as $version => $res_version) {
$retour_id_syn = array();
if ($res_version[0]['num_nom_retenu'] == '') {
$retour_id_syn[] = 'nom_retenu N.D.';
} elseif (count($res_version) != 1) {
//on remplit d'abord l'entete du resultat
$this->table_retour['id'] = $this->table_ressources[0];
$this->afficherEnteteRangBorneTotalUrls($res_version, '/'.$this->service.'/'.$this->table_ressources[0].'/relations/synonymie');
$retour_id_syn['entete'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
//on remplit ensuite les resultats
foreach ($res_version as $tab) {
//pour chaque basionyme, on recupère le résultat : num_nom, nom_sci, basionyme et num_nom_retenu :
$this->resultat_req = $tab;
foreach ($tab as $key => $val) {
if ($val != '') {
switch ($key) {
case 'num_nom_retenu' : $retenu = ($val == $num) ? 'true' : 'false';
$this->table_retour['retenu'] = $retenu; break;
case 'basionyme' : $this->afficherDonnees($key, $val); break;
case 'num_nom' : $num = $val;
$this->afficherDonnees($key, $val);
unset($this->table_retour['id']); break;
default : break;
}
}
}
$retour_id_syn['resultat'][$num] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
}
if (!isset($retour_id_syn['resultat']) && !in_array('nom_retenu N.D.', $retour_id_syn)) {
$retour_id_syn = null; //on initialise le resultat à null
}
$res = $this->afficherVersionOuPas($version, $retour_id_syn, $res);
}
return $res;
}
/**
* Formate et retourne toutes les homonymes correpondants au nom recherché
* @param array $resultat
*/
public function formaterIdHomonymie($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$res = array();
foreach ($resultat as $version => $res_version) {
if (count($res_version) != 1) {
$this->table_retour['id'] = $this->table_ressources[0];
$this->afficherEnteteRangBorneTotalUrls($res_version, '/'.$this->service.'/'.$this->table_ressources[0].'/relations/homonymie');
$retour_id_hom['entete'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
foreach ($res_version as $homonyme) {
$this->resultat_req = $homonyme;
$id = $homonyme['num_nom'];
$this->afficherDonnees('num_nom', $id);
if ($homonyme['num_nom_retenu'] != '') {
$retenu = ($id == $homonyme['num_nom_retenu']) ? 'true' : 'false';
$this->table_retour['retenu'] = $retenu;
}
$retour_id_hom['resultat'][$id] = $this->table_retour;
unset($retour_id_hom['resultat'][$id]['id']);
$this->table_retour = array();
}
} else {
$retour_id_hom = null;
}
$res = $this->afficherVersionOuPas($version, $retour_id_hom, $res);
}
return $res;
}
public function formaterIdFlores($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp,noms_projets');
$res = array();
foreach ($resultat as $version => $res_version) {
$res_version = $res_version[0];
$this->resultat_req = $res_version;
$id = array_shift($res_version);
//-----formatage de l'entete du résultat
$reponse['entete']['id'] = $id;
//-----formatage du résultat
$total = 0;
foreach ($res_version as $flores => $valeur) {
if ($valeur != '' && $valeur != '0') {
$this->afficherInfosFlore($res_version, $flores, $valeur);
$total++;
}
}
$reponse['entete']['total'] = $total;
if ($this->table_retour != array()) {
$reponse['resultat'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
} else {
$reponse = null;
}
//Si les infos de plrs versions sont renvoyés, on ajoute au tableau de resultat le numéro de la version
$res = $this->afficherVersionOuPas($version, $reponse, $res);
}
return $res;
}
public function afficherInfosFlore(&$resultat, $flores, $valeur) {
$flore = substr($flores,0,strrpos($flores, '_'));
if (strrpos($flores, 'num') !== false) {
$projet = $this->noms_projets[$flore];
if (preg_match('/^([0-9]+)(?:[.]syn[^a-z]*|(.*))?$/', $valeur, $match)) {
$this->table_retour[$flore]['id'] = $match[1];
$this->table_retour[$flore]['href'] = $this->ajouterHrefAutreProjet('noms', $match[1], $projet);
if (isset($match[2]) && $match[2] != '') $this->table_retour[$flore]['cle'] = $match[2];
}
if (isset($resultat[$flore.'_rem']) && !empty($resultat[$flore.'_rem'])) {
$this->table_retour[$flore]['remarque'] = $resultat[$flore.'_rem'];
unset($resultat[$flore.'_rem']);
}
} elseif (strrpos($flores,'belge') !== false) {
$projet = $this->noms_projets[$flore];
if (preg_match('/^([0-9]+) (R|S)?$/', $valeur, $match)) {
if (isset($match[2])) $type = ($match[2] == 'R') ? 'taxons' : 'synonyme';
$this->table_retour[$flore]['page'] = $match[1];
$this->table_retour[$flore]['type'] = $type;
//$this->table_retour[$flore]['href'] = $this->ajouterHrefAutreProjet('noms', $match[1], $projet);
}
}
}
//----------------------concerne les resultats pour des requetes de type /noms avec ou sans paramètres------------------
 
/**
*
* Est utilisée pour les requetes de type /noms avec ou sans parametres. Détermine le format json ou oss.
* @param retourne le résultat sous forme de tableau, à encoder en json.
*/
public function formaterNoms($resultat) {
if ($this->retour_format == 'oss') {
$reponse = $this->formaterEnOss($resultat); //Ds CommunNomsTaxons.php
} else {
$reponse = $this->formaterEnJsonMax($resultat);
}
return $reponse;
}
 
/**
*
* Permet de créer un tableau ($table_retour_json) au format defaut puis de l'encoder en json (json_encode).
* Le format comprend deux parties, une partie entete (contenu dans le tableau $entete_json) et une partie
* resultat (contenu dans le tableau $resultat_json).
* @param string $resultat : résultat de la requete (liste des noms et leur identifiant)
* @return une chaine encodé json (format par default)
*/
public function formaterEnJsonMax($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$res = array();
foreach ($resultat as $version => $res_version) {
//on remplit la table $table_retour_json['entete']
$masque = $this->ordonnerMasque();
if ($masque != '') $this->table_retour['masque'] = $masque;
$this->afficherEnteteRangBorneTotalUrls($res_version, '/'.$this->service);
$table_retour_json['entete'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
//on remplit la table $table_retour_json['resultat']
foreach ($res_version as $tab) {
$this->resultat_req = $tab;
foreach ($tab as $key => $val) {
if ($val != '') {
switch ($key) {
case 'num_nom' : $num = $val;
$this->afficherDonnees($key, $val); break;
case 'nom_sci' : if ($this->retour_format == 'min') {
// sinon est affiché ds afficherDonnees(num_nom, $val) ci-dessus
$this->table_retour[$key] = $val.$this->ajouterCompositionNom($tab);
} break;
case 'num_nom_retenu' :
$retenu = ($val == $num) ? 'true' : 'false';
$this->table_retour['retenu'] = $retenu; break;
default : break;
}
unset($this->table_retour['id']);
}
}
$resultat_json[$num] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
$table_retour_json['resultat'] = $resultat_json;
$res = $this->afficherVersionOuPas($version, $table_retour_json, $res);
}
return $res;
}
 
}
?>
Property changes:
Added: svn:executable
+*
\ No newline at end of property
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/coste/Taxons.php
New file
0,0 → 1,732
<?php
 
// declare(encoding='UTF-8');// ou ISO-8859-15
/**
* Description :
* Classe Taxons.php permettant de fournir des informations sur les noms scientifiques retenu.
* Si l'url finit par /taxons on retourne une liste de noms latin et leurs identifiants (seulement les 100 premeiers noms par défaut).
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /taxons?param1=val1&param2=val2&...
*
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, recherche, rang, distinct, retour.format, nl.format,
* nl.structure, navigation.depart et navigation.limite.
*
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package framework-v3
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-${year} Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
 
class Taxons extends CommunNomsTaxons {
/**
* Valeur du paramètre de requete recherche stricte, etendue, floue */
protected $recherche = false;
/** Permet de stocker la requete formulée :
* - taxons | taxons/#id | taxons/#id/#champ+#champ
* - taxons/#id/relations | taxons/#id/relations/synonymie | taxons/#id/relations/homonymie
* | taxons/#id/relations/flores | taxons/#id/relations/superieurs | taxons/#id/relations/inferieurs
* - taxons/stats/rangs | taxons/stats/annees | taxons/stats/initiales */
protected $format_reponse = 'taxons';
/** Représente la première partie de la requete SQL (entre le SELECT et le WHERE)*/
protected $requete_champ = 'num_nom, nom_sci, num_nom_retenu, num_tax ';
/** Représente la partie de la requete SQL ajoutant une condition (WHERE ...)*/
protected $requete_condition = 'num_nom = num_nom_retenu ';
/** Représente la partie GROUP BY de la requete SQL (GROUP BY ...) */
protected $requete_group_by = ' ';
/** Permet de stocker les limite de la requete SQL (par défaut seul les 100 premiers résultats seront retournés). */
protected $limite_requete = array('depart' => 0, 'limite' => 100);
/** Stocke le num_nom du nom retenu du num_nom recherché */
protected $num_nom_taxon;
protected $service = 'taxons';
protected $presence_num_tax = true;
public function consulter($ressources, $parametres) {
$resultat_formate = '';
$this->initialiserRestClient(); //création d'un objet RestClient
$this->traiterParametres($parametres);
$this->traiterVersionProjet($ressources) ;
if ($this->corps_http == '' && $this->entete_http == '') {
foreach ($this->table_version as $version) {
$this->table = $version; //on stocke ici la table correspondant à la version du projet analysée
$this->recupererNomChamp($this->table);
$this->gererNumTax();
$this->traiterRessources($ressources);
if ($this->corps_http == '' && $this->entete_http == '') {
$requete = $this->assemblerLaRequete();
$resultat = $this->getBdd()->recupererTous($requete);
if ($resultat == '') { //cas ou la requete comporte des erreurs
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE,
'Fct consulter() : La requete form&eacute;e comporte une erreur !!');
} elseif ($resultat) {
$res_version[$version] = $resultat;
} else { //cas ou la requete renvoi un tableau vide
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE,
'Donn&eacute;es introuvables dans la base '.$version.' <br/>
L\'identifiant demande n\'est pas un taxon et aucun taxon ne lui a ete attribue');
}
}
}
}
if ($this->corps_http == '' && $this->entete_http == '') {
$resultat_formate = $this->retournerResultatFormate($res_version);
}
$this->formerReponseHTTP($resultat_formate);
}
 
 
/**
*
* Permet d'analyser les paramètres
* @param array $parametres
*/
public function traiterParametres($parametres) {
$this->table_param = $parametres;
if (isset($parametres) && ($parametres)) {
if (isset($parametres['recherche']) && $parametres['recherche'] != '') {
$this->recherche = $parametres['recherche'];
}
foreach ($parametres as $param => $val) {
switch ($param) {
case 'ns_format' : $this->html = $val; break;
case 'ns_structure' : $this->remplirTableCompositionNom($val);
$this->requete_champ .= ' ,'.implode(', ',$this->compo_nom); break;
case 'masque' : $this->ajouterFiltreMasque($val); break;
case 'masque_nt' : $this->ajouterFiltreMasqueNt($val); break;
case 'masque_rg' : $this->requete_condition .= ' AND rang = '.$this->getBdd()->proteger($val); break;
case 'navigation_depart': $this->limite_requete['depart'] = $val; break;
case 'navigation_limite': $this->limite_requete['limite'] = $val; break;
case 'retour_format' : $this->retour_format = $val; break;
case 'recherche' : break;
default : $this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE,
'Erreur dans les parametres de recherche de votre
requete : </br> Le parametre " '.$param.' " n\'existe pas.');
break;
}
}
}
}
public function ajouterFiltreMasque($val) {
if ($this->recherche == 'etendue') {
$val = str_replace(' ','%', $val);
$val .= '%';
$this->requete_condition .= ' AND nom_sci LIKE '.$this->getBdd()->proteger($val);
} elseif ($this->recherche == 'floue') {
$this->requete_condition .= ' AND (SOUNDEX(nom_sci) = SOUNDEX(\''.$val.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE(nom_sci)) = SOUNDEX(REVERSE(\''
.$val.'\'))) ';
} else {
$this->requete_condition .= ' AND nom_sci LIKE '.$this->getBdd()->proteger($val);
}
}
public function ajouterFiltreMasqueNt($val) {
if (strrpos($val, ',') !== false) {
$ids_taxon = explode(",", $val);
} else {
$ids_taxon[] = $val;
}
foreach ($ids_taxon as $id) {
$this->requete_condition .= ' OR num_tax = '.$this->getBdd()->proteger($id);
}
$this->requete_condition = str_replace('num_nom = num_nom_retenu OR ',
'num_nom = num_nom_retenu AND (' , $this->requete_condition).')';
}
/**
* Permet d'ajouter à la requete_champ les parametres demandés qui composeront le nom_sci.
* Permet de remplir le tableau compo_nom qui regroupe les parametres demandés qui composeront le nom_sci.
* (parametres à ajouter aux nom_sci sous la forme : Auteur [annee, biblio] [addendum])
* @param la valeur du parametre nl.structure
*/
public function recupererParametreNom($valeur) {
$structure_nom = explode(",",$valeur);
foreach ($structure_nom as $structure) {
switch ($structure) {
case 'au' : $this->compo_nom['au'] = 'auteur'; break;
case 'an' : $this->compo_nom['an'] = 'annee'; break;
case 'bib' : $this->compo_nom['bib'] = 'biblio_origine'; break;
case 'ad' : $this->compo_nom['ad'] = 'nom_addendum'; break;
default : $this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE,
'Erreur : Le parametre "'.$structure.'" n\'existe pas. <br/><br/>
Les parametres du nom possibles sont :
<li> au (auteur)</li><li> an (annee)</li>
<li> bib (bibliographie)</li><li> ad (nom_addendum)</li>');
break;
}
}
if (isset($this->compo_nom)) {
$this->requete_champ .= ' ,'.implode(', ',$this->compo_nom);
}
}
//------------------------------------------Fonction ressources---------------------------------------------------------------------
public function gererNumTax() {
if (!in_array('num_tax', $this->champs_table)) {
$this->presence_num_tax = false;
$this->requete_champ = str_replace(', num_tax ', '', $this->requete_champ);
} else {
$this->presence_num_tax = true;
}
}
public function traiterRessourcesIdentifiant() {
$this->format_reponse = 'taxons/id';
$this->num_nom_taxon = $this->recupererNumNomTaxon(); //on recupere le taxon correspondant au num_nom recherché
if ($this->entete_http == '') {
$this->requete_condition = ' num_nom = '.$this->num_nom_taxon;
if (isset($this->table_ressources[1]) && !empty($this->table_ressources[1])) {
//---------------- requete de type taxons/#id/#champ+#champ--------------------------------------
if ($this->table_ressources[1] != 'relations') {
// SELECT *, nom_sci FROM bftfx_v2_00 WHERE num_nom = X;
$this->requete_champ = ' *, nom_sci ';
$this->format_reponse .= '/champ';
//---------------- requete de type taxons/#id/relations/#relation--------------------------------
} elseif ($this->table_ressources[1] == 'relations') {
$this->traiterRessourceIdRelations();
} else {
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE,
'Erreur dans votre requete </br> Ressources disponibles : <br/>
<li> #id/relations </li> <li> #id/#champ+#champ </li> <li> #id/relations </li>
<li> #id/relations/inferieurs </li> <li> #id/relations/superieurs </li>');
}
} else {
//--------------- requete de type taxons/#id-----------------------------------------------------
$this->requete_champ = ' *, nom_sci ';
}
}
}
/**
* Permet de récupérer le num_nom du taxon recherché. Soit le numéro taxonomique est demandé (avec nt: )
* soit un num_nom dont on recherche le num_nom_retenu
*/
public function recupererNumNomTaxon() {
$identifiant = '';
if (strrpos($this->table_ressources[0], 'nt:') !== false) {
if ($this->presence_num_tax) {
// SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = num_nom_retenu AND num_tax = X;
$this->requete_condition = ' num_nom = num_nom_retenu AND num_tax = '
.str_replace('nt:', '', $this->table_ressources[0]).' ';
} else {
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE,
'Erreur dans votre requete : </br> Le numero taxonomique n\'existe pas dans ce projet' );
}
} else {
// SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = (SELECT num_nom_retenu FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
$this->requete_condition = ' num_nom = (SELECT num_nom_retenu FROM '
.$this->table.' WHERE num_nom = '.$this->table_ressources[0].')';
}
if ($this->entete_http == '') {
//on récupere l'identifiant du taxon correspondant au num_nom ou num_tax demandé pour pouvoir l'afficher
$res = '';
$req_tax = 'SELECT num_nom FROM '.$this->table.' WHERE '.$this->requete_condition;
$res_tax = $this->getBdd()->recuperer($req_tax);
//on recherche ensuite les identifiants des taxons supérieurs ou inférieurs
if ($res_tax == '') {
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE,
'Le numéro de taxon ou l\'identifiant de nom correspondant au num_nom '
.$this->table_ressources[0].' n\'existe pas dans la table '.$this->table);
} elseif ($res_tax) {
$identifiant = $res_tax['num_nom'];
} else {
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE,
'Le numéro de taxon ou l\'identifiant de nom correspondant au num_nom '
.$this->table_ressources[0].' n\'existe pas dans la table '.$this->table);
}
}
return $identifiant;
}
public function traiterRessourceIdRelations() {
//----------------- requete de type taxons/#id/relations-------------------------------------------
// SELECT *, nom_sci FROM bftfx_v2_00 WHERE num_nom = X;
$this->format_reponse .= '/relations';
if (isset($this->table_ressources[2])) {
//------------- requete de type taxons/#id/relations/#relation--------------------------------
switch ($this->table_ressources[2]) {
case 'superieurs' : $rel = 'recupererIdSup';
$this->format_reponse .= '/superieurs';
$this->traiterRessourceIdRelationInfSup($rel); break;
case 'inferieurs' : $rel = 'recupererIdInf';
$this->format_reponse .= '/inferieurs';
$this->traiterRessourceIdRelationInfSup($rel); break;
default : $this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE,
'Erreur dans votre requ&ecirc;te </br> Ressources disponibles : <br/>
<li> taxons/#id/relations </li> <li> taxons/#id/relations/flores </li>
<li> taxons/#id/relations/homonymie </li> <li> #id/relations/inferieurs </li>
<li> #id/relations/superieurs </li>'); break;
}
}
}
 
 
public function traiterRessourceIdRelationInfSup($rel) {
//Appel de la fct récupérerIdSup ou recupererIdInf : retourne les num_nom des noms inferieurs ou superieurs
$res_relation = $this->$rel();
//analyse du résultat retourné par la requete de recherche des identifiants correspondant aux taxons inf|sup :
if ($res_relation == '') { //dans le cas ou la requete comporte des erreurs
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE,
'Fct traiterRessourceIdHomonymie : La requete forme comporte une erreur !!');
} elseif ($res_relation) {
//dans le cas ou une ou plusieurs relations est retournée, on récupère les identifiants ss la forme (id, id, id)
foreach ($res_relation as $ligne) $res[] = $ligne['num_nom'];
$res = implode(',',$res);
$this->requete_condition = ' num_nom IN ('.$res.')';
$this->requete_champ .= ', rang, num_tax_sup ';
} else { //dans le cas ou aucune relation n'existe
$res = array($this->num_nom_taxon => null);
$this->corps_http = json_encode($res);
$this->entete_http = RestServeur::HTTP_CODE_OK;
}
}
public function recupererIdInf() {
//SELECT num_nom FROM bfdtx_v2_00 WHERE num_tax_sup = (SELECT num_nom FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
$req_relation = 'SELECT num_nom FROM '.$this->table
.' WHERE num_tax_sup = (SELECT num_nom FROM '
.$this->table
.' WHERE '.$this->requete_condition.')';
$res_relation = $this->getBdd()->recupererTous($req_relation);
return $res_relation;
}
public function recupererIdSup() {
//SELECT num_nom FROM bfdtx_v2_00 WHERE num_nom = (SELECT num_tax_sup FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_nom = X);
$req_relation = 'SELECT num_nom FROM '.$this->table
.' WHERE num_nom = (SELECT num_tax_sup FROM '
.$this->table
.' WHERE '.$this->requete_condition.')';
$res_relation = $this->getBdd()->recupererTous($req_relation);
return $res_relation;
}
 
public function traiterRessourceStatsInitiales() {
// SELECT count(nom_sci) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre FROM bdtfx_v2_00 GROUP BY rang, left(nom_sci, 2);
$this->format_reponse = 'taxons/stats/initiales';
$this->requete_champ = 'count(nom_sci) as nb, rang, left(nom_sci, 2) as lettre ';
$this->requete_group_by = ' GROUP BY rang, left(nom_sci, 2) ';
}
public function traiterRessourceStatsRangs() {
// SELECT count(*) as nombre, rang FROM bdtfx_v2_00 [WHERE rang = 290] GROUP BY rang ORDER BY rang;
$this->format_reponse = 'taxons/stats/rangs';
$this->requete_champ = 'count(*) as nombre, rang ';
$this->requete_group_by = ' GROUP BY rang ORDER BY rang ';
}
public function traiterRessourceStatsAnnees() {
// SELECT count(*) as nombre, annee FROM bdtfx_v2_00 GROUP BY annee ORDER BY annee;
$this->format_reponse = 'taxons/stats/annees';
$this->requete_champ = 'count(*) as nombre, annee ';
$this->requete_group_by = ' GROUP BY annee ORDER BY annee ';
}
//-----------------------------FONCTIONS DASSEMBLAGE DE LA REQUETE-----------------------------------------------------
public function assemblerLaRequete() {
if ($this->format_reponse != 'taxons/stats/initiales') {
$this->mettreAuFormat(); //on remplace les nom_sci par les nom_sci_html
}
if ($this->requete_condition != '') {
$this->requete_condition = ltrim($this->requete_condition, ' AND, WHERE');
$this->requete_condition = ' WHERE '.$this->requete_condition;
}
if ($this->format_reponse != 'taxons' && $this->format_reponse != 'taxons/id/relations/homonymie') {
$this->requete_limite = '';
} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat())) {
$this->limite_requete['depart'] = (($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']);
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
} else {
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
}
$requete = ' SELECT '.$this->requete_champ.
' FROM '.$this->table
.$this->requete_condition
.$this->requete_group_by
.$this->requete_limite;
return $requete;
}
/**
* Recupere le nombre total de résultat d'une requete lancée.
* Est utilisée lors de l'affichage du total dans le résultat retourné
* @return Le nombre total de résultat
*/
public function recupererTotalResultat() {
$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '.$this->table.$this->requete_condition.$this->requete_group_by;
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($res) {
$total = $res['nombre'];
} else {
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE,
'Fct recupererTotalResultat() : <br/>Donn&eacute;es introuvables dans la base');
}
return $total;
}
 
//-------------------------FONCTIONS DE FORMATION DU RESULTAT-----------------------------------------------------------
/**
* Permet de récupérer le résultat à retourner propre à chaque requete et de l'encoder en json
* @param array $resultat
* @param array $ressources
* @return le résultat encoder en json
*/
public function retournerResultatFormate($resultat) {
switch ($this->format_reponse) {
case 'taxons/id' : $reponse = $this->formaterId($resultat); break; //ds CommunNomsTaxons
case 'taxons/id/champ' : $reponse = $this->formaterIdChamp($resultat); break; //ds CommunNomsTaxons
case 'taxons/id/relations' : $reponse = $this->formaterIdRelations($resultat); break;
case 'taxons/id/relations/superieurs' : $reponse = $this->formaterIdSuperieur($resultat); break;
case 'taxons/id/relations/inferieurs' : $reponse = $this->formaterIdInferieur($resultat); break;
case 'taxons/stats/annees' : $reponse = $this->formaterStatsAnnee($resultat); break; //ds CommunNomsTaxons
case 'taxons/stats/rangs' : $reponse = $this->formaterStatsRang($resultat); break; //ds CommunNomsTaxons
case 'taxons/stats/initiales' : $reponse = $this->formaterStatsInitiales($resultat); break; //ds CommunNomsTaxons
case 'taxons' : $reponse = $this->formatertaxons($resultat); break;
default : break;
}
return json_encode($reponse);
}
//----------------------concerne les resultats pour des requetes de type /noms avec ou sans paramètres--------------
/**
*
* Est utilisée pour les requetes de type /noms avec ou sans parametres. Détermine le format json ou oss.
* @param retourne le résultat sous forme de tableau, à encoder en json.
*/
public function formaterTaxons($resultat) {
if ($this->retour_format == 'oss') {
$reponse = $this->formaterEnOss($resultat);
} else {
$reponse = $this->formaterEnJsonMax($resultat);
}
return $reponse;
}
/**
*
* Permet de créer un tableau ($table_retour_json) au format defaut puis de l'encoder en json (json_encode).
* Le format comprend deux parties, une partie entete (contenu dans le tableau $entete_json) et une partie
* resultat (contenu dans le tableau $resultat_json).
* @param string $resultat : résultat de la requete (liste des noms et leur identifiant)
* @return une chaine encodé json (format par default)
*/
public function formaterEnJsonMax($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$res = array();
foreach ($resultat as $version => $res_version) {
//on remplit la table $table_retour_json['entete']
if (isset($this->table_param['masque'])) $this->afficherDonnees('masque', $this->table_param['masque']);
if (isset($this->table_param['masque_nt'])) $this->afficherDonnees('masque.nt', $this->table_param['masque_nt']);
$this->afficherEnteteRangBorneTotalUrls($res_version, '/'.$this->service);
$table_retour_json['entete'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
//on remplit la table $table_retour_json['resultat']
$tab_tax_inf = $this->recupererListeTaxonInf($res_version);
foreach ($res_version as $tab) {
$this->resultat_req = $tab;
if (isset($this->table_param['masque_nt'])) $this->afficherDonnees('num_tax', $tab['num_tax']);
foreach ($tab as $key => $val) {
if ($val != '') {
switch ($key) {
case 'num_nom' : $num = $val;
$this->afficherDonnees($key, $val); break;
case 'num_nom_retenu' : $retenu = ($val == $num) ? 'true' : 'false';
$this->table_retour['retenu'] = $retenu; break;
default : break;
}
}
}
$this->afficherTaxonInfNb($num, $tab_tax_inf);
unset($this->table_retour['id']);
$resultat_json[$num] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array(); //on vide le tableau table_retour
}
$table_retour_json['resultat'] = $resultat_json;
$res = $this->afficherVersionOuPas($version, $table_retour_json, $res);
}
return $res;
}
//--------------------concerne les resultats pour des requetes de type noms/id----------------------------------------
 
public function formaterIdRelations($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$res = array();
foreach ($resultat as $version => $res_version) {
$this->resultat_req = $res_version;
$retour_id_rel = array ('entete' => array()); //on initialise pr que l'entete apparaisse en premier
//on affiche le resultat
$superieurs = $this->ajouterRelations('superieurs', $version);
if (isset($superieurs)) $retour_id_rel['resultat']['superieurs'] = $superieurs;
$inferieurs = $this->ajouterRelations('inferieurs', $version);
if (isset($inferieurs)) $retour_id_rel['resultat']['inferieurs'] = $inferieurs;
//on renvoit un tableau null si il n'existe aucune relations
if (!isset($retour_id_rel['resultat'])) {
$retour_id_rel = null;
 
//on rajoute l'entete si des relations existent
} else {
$this->afficherDonnees('num_nom', $this->num_nom_taxon); //$this->afficherEnteteRangBorneTotalUrls($resultat, '/'.$this->service.'/'.$this->table_ressources[0].'/relations/synonymie');
$retour_id_rel['entete'] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
//recuperation du resultat de chaque version
$res = $this->afficherVersionOuPas($version, $retour_id_rel, $res);
}
return $res;
}
public function ajouterRelations($relation, $version) {
$version = str_replace(Config::get('bdd_table').'_v', '', $version);
$res = null;
$taxon = $this->num_nom_taxon;
$parametres_url = '';
if ($this->table_param != array()) $parametres_url = '?'.http_build_query($this->table_param, '', '&');
$url = Config::get('url_service').'/'.$version.'/'
.$this->service.'/'.$this->table_ressources[0].'/relations/'
.$relation.$parametres_url;
$relation = $this->rest_client->consulter($url);
$entete = $this->rest_client->getReponseEntetes();
//Si le service meta-donnees fonctionne correctement, l'entete comprend la clé wrapper_data
if (isset($entete['wrapper_data'])) {
$relation = json_decode($relation);
if (isset($relation->resultat)) {
$res = $relation->resultat;
} elseif (isset($relation->$taxon)) { //pour les relations inf et sup
$res = $relation->$taxon;
}
} else {
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE,
'Le service '.$this->service.' de ce projet comporte des erreurs. url lancée : '.$url);
}
return $res;
}
 
public function formaterIdSuperieur($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$res = array();
foreach ($resultat as $version => $res_version) {
//on remplit le tableau de formatage
if (($res_version) != '' ) {
//on recupere d'abord les rangs supérieurs
$sup = $res_version[0];
do {
$sup = $this->recupererIdSuperieur($sup['num_tax_sup'], $version);
if ($sup['rang'] == '0') $sup['rang'] = '10'; //erreur dans la base
if (isset($sup)) $res_version[] = $sup;
} while ($sup != null);
krsort($res_version);
//on les affiche ensuite
foreach ($res_version as $tab) {
$this->resultat_req = $tab;
foreach ($tab as $key => $val) {
if ($val != '') {
switch ($key) {
case 'num_nom' : $num = $val;
$this->afficherDonnees($key, $num); break;
case 'num_nom_retenu' : $retenu = ($val == $num) ? 'true' : 'false';
$this->table_retour['retenu'] = $retenu; break;
case 'rang' : $this->afficherDonnees($key, $val); break;
default : break;
}
}
}
unset($this->table_retour['id']);
$tab_inf[$num] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
$tab_relation[$this->num_nom_taxon] = $tab_inf;
} else { //si il n'existe aucune relation
$tab_relation = null;
}
//recuperation du resultat de chaque version
$res = $this->afficherVersionOuPas($version, $tab_relation, $res);
}
return $res;
}
public function recupererIdSuperieur($id, $version) {
$req = 'SELECT num_nom, num_nom_retenu, num_tax_sup, rang FROM '
.$version.' WHERE num_nom = '.$this->getBdd()->proteger($id);
$res = $this->getBdd()->recupererTous($req);
if ($res) {
$resultat = $res[0];
} else {
$resultat = null; //on return null si il n'y a pas de taxon superieur
}
return $resultat;
}
public function formaterIdInferieur($resultat) {
$this->recupererTableSignification('champs_api,champs_comp,correspondance_champs');
$res = array();
foreach ($resultat as $version => $res_version) {
//on veut récupérer pour chacun des taxons inférieur le nb de taxons inf :
$tab_tax_inf = $this->recupererListeTaxonInf($res_version);
//on commence le formatage
if (($res_version) != '' ) {
foreach ($res_version as $tab) {
$this->resultat_req = $tab;
foreach ($tab as $key => $val) {
if ($val != '') {
switch ($key) {
case 'num_nom' : $num = $val;
$this->afficherDonnees($key, $num); break;
case 'num_nom_retenu' : $retenu = ($val == $num) ? 'true' : 'false';
$this->table_retour['retenu'] = $retenu; break;
default : break;
}
}
}
$this->afficherTaxonInfNb($num, $tab_tax_inf);
unset($this->table_retour['id']);
$tab_inf[$num] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array(); //on vide le tableau table_retour
}
$tab_relation[$this->num_nom_taxon] = $tab_inf;
} else {
$tab_relation = null;
}
//recuperation du resultat de chaque version
$res = $this->afficherVersionOuPas($version, $tab_relation, $res);
}
return $res;
}
public function afficherTaxonInfNb($num, $tab_tax_inf) {
foreach ($tab_tax_inf as $taxNb) {
if ($taxNb['num_tax_sup'] == $num) {
$this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'] = $taxNb['nb'];
}
}
if (!isset($this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'])) {
$this->table_retour['taxon_inferieur_nbre'] = '0';
}
}
public function recupererListeTaxonInf($resultat) {
// SELECT num_tax_sup, count(*) as nb FROM bdtfx_v2_00 WHERE num_tax_sup IN (id, id, id) AND num_nom = num_nom_retenu GROUP BY num_tax_sup';
foreach ($resultat as $tab) {
$tab_num[] = $tab['num_nom']; //on regroupe ici les id des taxons dont on cherche le nb de taxon inf
}
$req = 'SELECT num_tax_sup, count(*) as nb FROM '.$this->table
.' WHERE num_tax_sup IN ('.implode(',',$tab_num)
.') AND num_nom = num_nom_retenu GROUP BY num_tax_sup';
$res = $this->getBdd()->recupererTous($req);
if ($res) {
$resultat = $res;
} else {
$resultat = array(); //on return un tableau vide s'il n'y a pas de taxon inférieurs
}
return $resultat;
}
}
 
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/coste/Textes.php
New file
0,0 → 1,528
<?php
/*
* @copyright 2013 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
* @author Raphaël Droz <raphael@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
*
* pattern: /service:eflore:0.1/coste/textes/bdtfx.nn:182,631
* params: txt.format=(htm|txt) , retour.champs=(titre,texte,...) , retour.format=(min|max), ...
*
* Ce webservice est censé pouvoir:
* 1) retourner des informations (choisies) à propos d'un ou plusieurs taxon(s) donné(s)
* (à partir de son numéro nomenclatural
* 2) retourner des informations (choisies) à propos de taxons recherchés
* (à partir de divers critères)
*
* TODO: masque.titre => masque.tag
* TODO: clarifier l'attribut "tag" retourné (tag de la description ou des clefs de détermination)
*
*/
 
// affecte le nombre d'ids autorisés dans le dernier segment d'URL
// *et* la valeur maximale autorisée pour navigation.limite.
define('_COSTE_TEXTE_MAX_RESULT_LIMIT', 500);
 
// simplifie et accélère la sanitization de l'input:
// SELECT MAX(num_nom) FROM coste_v2_00;
define('_COSTE_TEXTE_MAX_COSTE_NN', 7015 + 1000);
// SELECT MAX(page) FROM coste_v2_00;
define('_COSTE_TEXTE_MAX_COSTE_PAGE', 4126);
// SELECT MAX(tome) FROM coste_v2_00;
define('_COSTE_TEXTE_MAX_COSTE_TOME', 3);
// SELECT MAX(num_taxonomique) FROM coste_v2_00;
define('_COSTE_TEXTE_MAX_BDTFX_NT', 37809);
// SELECT MAX(num_nom) FROM bdtfx_v2_00;
define('_COSTE_TEXTE_MAX_BDTFX_NN', 120816 + 100000);
 
/* restore_error_handler();
error_reporting(E_ALL); */
class Textes {
// paramètres autorisés
static $allow_params = array(
'txt.format', 'retour.format', 'retour.champs', 'retour.indexBy',
'recherche',
'masque.ns', 'masque.txt', 'masque.page', 'masque.tome', 'masque.famille', 'masque.nt',
'masque.titre', // masque sur titre de la page wiki correspondante (page "clef" OR page "description")
'navigation.depart', 'navigation.limite');
// et valeurs par défaut
static $default_params = array('txt.format' => 'txt', 'retour.format' => 'max', 'retour.indexBy' => 'coste',
'recherche' => 'stricte',
'retour.champs' => 'titre,texte,determination,tag',
'navigation.depart' => 0, 'navigation.limite' => 50);
 
// les champs de base de coste_v2_00
// mysql -N tb_eflore<<<"SHOW FIELDS FROM coste_v2_00"|egrep -v 'page_'|awk '{print $1}'|xargs -i -n1 printf "'%s' => 'c.%s',\n" {} {}
static $allow_champs = array(
'coste:nn' => 'c.num_nom',
'bdtfx:nn' => 'IF(c.flore_bdtfx_nn = "",NULL,c.flore_bdtfx_nn)',
'bdtfx:nt' => 'IF(c.flore_bdtfx_nt = "",NULL,c.flore_bdtfx_nt)',
'num_nom' => 'c.num_nom',
'num_nom_retenu' => 'c.num_nom_retenu',
'num_tax_sup' => 'c.num_tax_sup',
'rang' => 'c.rang',
'nom_sci' => 'c.nom_sci',
'nom_supra_generique' => 'c.nom_supra_generique',
'genre' => 'c.genre',
'epithete_infra_generique' => 'c.epithete_infra_generique',
'epithete_sp' => 'c.epithete_sp',
'type_epithete' => 'c.type_epithete',
'epithete_infra_sp' => 'c.epithete_infra_sp',
'cultivar_groupe' => 'c.cultivar_groupe',
'cultivar' => 'c.cultivar',
'nom_commercial' => 'c.nom_commercial',
'auteur' => 'c.auteur',
'annee' => 'c.annee',
'biblio_origine' => 'c.biblio_origine',
'notes' => 'c.notes',
'nom_addendum' => 'c.nom_addendum',
'nom_francais' => 'c.nom_francais',
'nom_coste' => 'c.nom_coste',
'auteur_coste' => 'c.auteur_coste',
'biblio_coste' => 'c.biblio_coste',
'num_nom_coste' => 'c.num_nom_coste',
'num_nom_retenu_coste' => 'c.num_nom_retenu_coste',
'num_tax_sup_coste' => 'c.num_tax_sup_coste',
'synonymie_coste' => 'c.synonymie_coste',
'tome' => 'c.tome',
'page' => 'c.page',
'nbre_taxons' => 'c.nbre_taxons',
'flore_bdtfx_nn' => 'c.flore_bdtfx_nn',
'flore_bdtfx_nt' => 'c.flore_bdtfx_nt',
'image' => 'c.image',
'image_auteur' => 'c.image_auteur',
'nom_sci_html' => 'c.nom_sci_html',
 
// handly duplicate (redirigé vers nom_sci ou nom_sci_html selon que txt.format vaut "txt" ou "htm"
'titre' => 'c.nom_sci',
 
// champs spécifiques (et étrangères)
'texte' => 'dsc.body',
'determination' => 'cle.body',
'tag' => 'dsc.tag',
'famille' => 'b.famille', // cf sqlAddJoins()
'*' => 'XXX' // spécial
);
 
// les champs suivants disparaissent de la liste utilisée pour former la requête SQL
// (ils sont exclue lorsque '*' est utilisée, ce sont généralement des synonymes)
static $special_champs = array('nom_sci_html', 'nom_sci', '*', 'flore_bdtfx_nn', 'flore_bdtfx_nt', 'num_nom');
 
// ces champs sont toujours dans les résultats (cf sqlSelectFields()
static $champs_obligatoires = array('coste:nn', 'bdtfx:nn', 'bdtfx:nt');
 
 
// le pattern utilisé pour la recherche dite "floue"
static $soundex_scheme = '(%1$s LIKE %2$s OR SOUNDEX(%1$s) = SOUNDEX(%2$s) OR SOUNDEX(REVERSE(%1$s)) = SOUNDEX(REVERSE(%2$s)))';
 
// contrainte du point d'entrée d'API webservice Tela lors d'un GET
public function consulter($ressources, $parametres, $db = NULL) {
if (!$db) {
// http_response_code(500);
throw new Exception('no DB', 500);
}
 
// parser la requête et filtrer les paramètres valides
// en cas d'accès HTTP
if (array_key_exists('QUERY_STRING', $_SERVER)) {
self::requestParse($uri, $params);
} else {// en cas d'accès phpunit
$uri = $ressources;
}
 
// renvoie du plain/text d'aide (cf fin de programme)
if (count($uri) == 1 && $uri[0] == 'aide') {
die(self::aide());
}
 
if (is_null($parametres)) {
$parametres = Array();
}
$params = self::requestFilterParams($parametres);
// les contraintes liées aux ids (passés comme composants d'URL)
// sont ajoutées aux params [sans être accepté comme paramètre d'URL]
$params['_ids'] = self::requestFilterIds($uri);
 
// XXX: temporaires, passage de $db aux fonctions
// de toolkits
$req = self::getCosteInfo($params, $db);
$res = $db->recupererTous($req);
$err = mysql_error();
if (!$res && $err) {
// http_response_code(400);
// if(defined('DEBUG') && DEBUG) header("X-Debug: $req");
throw new Exception('not found', 400);
}
 
// rapide formatage des résultats:
$matches = 0;
 
if ($res) {
// nombre de matches (sans LIMIT) utilisé pour l'en-tête
$matches = $db->recuperer('SELECT FOUND_ROWS() AS total');
$matches = intval($matches['total']);
}
 
// reformate les résultats pour les indexer par coste:nn par défaut
// cependant le paramètre retour.indexBy permet de choisir une indexation par num_nom de bdtfx
$clef_index = $params['retour.indexBy'] == 'coste' ? 'coste:nn' : 'bdtfx:nn';
$res2 = array();
foreach ($res as $v) {
if (!$v[$clef_index]) {
throw new Exception('format error: index NULL, use retour.indexBy=coste', 409);
}
$res2[$v[$clef_index]] = $v;
}
 
// l'appelant s'occupera du json_encode()
// même si ça démange d'exit'er ici
if(strpos($_SERVER['SCRIPT_NAME'], 'phpunit') === FALSE) header("Content-Type: application/json; charset=utf-8");
return array('entete' => array(
'depart' => $params['navigation.depart'],
'limite' => $params['navigation.limite'],
'total' => count($res2),
'match' => $matches),
'resultats' => $res2);
}
 
 
// la fonction centrale: récupère les infos à partir de paramètres
// et une optionnelle contrainte sur coste:nn ou bdtfx:nn
static function getCosteInfo(array $params, $db) {
// contraintes (WHERE):
$constraints = self::sqlAddConstraint($params, $db);
// XXX: que faire en l'absence de contrainte ? pour l'instant : "WHERE 1"
 
// champs:
$champs_valides_non_formattes = NULL;
$champs_valides = self::sqlSelectFields($params, $champs_valides_non_formattes);
 
// joins:
$other_join = self::sqlAddJoins($params, $champs_valides_non_formattes);
$requete_tpl = "SELECT SQL_CALC_FOUND_ROWS %s ".
"FROM tb_eflore.coste_v2_00 c ".
" LEFT JOIN tela_prod_wikini.florecoste_pages dsc ON c.page_wiki_dsc = dsc.tag AND dsc.latest = 'Y' ".
" LEFT JOIN tela_prod_wikini.florecoste_pages cle ON c.page_wiki_cle = cle.tag AND cle.latest = 'Y' ".
" %s ".
"WHERE %s ORDER BY c.num_nom LIMIT %u, %u -- %s ";
$req = sprintf($requete_tpl,
$champs_valides, // dans le SELECT (parmi champs coste_v2_00)
// autre join, si nécessaire
$other_join ? $other_join : '',
 
// where
$constraints ? implode(' AND ', $constraints) : '1',
 
// limit
$params['navigation.depart'],
$params['navigation.limite'],
__FILE__ . ':' . __LINE__);
 
return $req;
}
 
// SQL helpers
// le préfix de coste_v2_00 est "c"
// le préfix de florecoste_pages sur la description est est "dsc"
// le préfix de florecoste_pages sur la clef de détermination est est "cle"
static function sqlAddConstraint($params, $db) {
$stack = array();
if (!empty($params['masque.ns'])) {
if ($params['recherche'] == 'etendue') {
$stack[] = 'c.nom_sci LIKE '.$db->proteger('%' . trim($params['masque.ns']).'%');
} elseif($params['recherche'] == 'floue') {
$stack[] = sprintf(self::$soundex_scheme,
'c.nom_sci',
$db->proteger('%'.trim($params['masque.ns']).'%'));
} else {
$stack[] = 'c.nom_sci = '.$db->proteger(trim($params['masque.ns']));
}
}
 
// le masque sur texte est toujours un LIKE() "étendue", sauf si "floue" spécifié
if(!empty($params['masque.txt'])) {
if($params['recherche'] == 'floue') {
$stack[] = sprintf(self::$soundex_scheme,
'dsc.body',
$db->proteger('%'.trim($params['masque.txt']).'%'));
}
else {
$stack[] = 'dsc.body LIKE '.$db->proteger('%'.trim($params['masque.txt']).'%');
}
}
 
if(!empty($params['masque.titre'])) {
if($params['recherche'] == 'stricte') {
$stack[] = sprintf('(dsc.tag = %1$s OR cle.tag = %1$s)',
$db->proteger(trim($params['masque.titre'])));
}
else {
$stack[] = sprintf('(dsc.tag LIKE %1$s OR cle.tag LIKE %1$s)',
$db->proteger('%'.trim($params['masque.titre']).'%'));
}
}
 
if(array_key_exists('masque.famille', $params)) {
$stack[] = 'b.famille LIKE '.$db->proteger(trim($params['masque.famille']));
}
 
if(array_key_exists('masque.page', $params)) {
$stack[] = 'c.page = '.intval($params['masque.page']);
}
 
if(array_key_exists('masque.tome', $params)) {
$stack[] = 'c.tome = '.intval($params['masque.tome']);
}
 
if(array_key_exists('masque.nt', $params)) {
$stack[] = 'c.flore_bdtfx_nt = '.intval($params['masque.nt']);
}
 
// ajout de la contrainte sur coste:nn ou bdtfx:nn si un composant d'URL supplémentaire
// comportant un #id existe, cf self::requestFilterIds()
$o_stack = array();
if (array_key_exists('_ids', $params) && $params['_ids']) {
if ($params['_ids']['coste.nn']) {
$o_stack[] = sprintf("c.num_nom IN (%s)", implode(',', $params['_ids']['coste.nn']));
}
if ($params['_ids']['bdtfx.nn']) {
$o_stack[] = sprintf("c.flore_bdtfx_nn IN (%s)", implode(',', $params['_ids']['bdtfx.nn']));
}
if ($params['_ids']['bdtfx.nt']) {
$o_stack[] = sprintf("c.flore_bdtfx_nt IN (%s)", implode(',', $params['_ids']['bdtfx.nt']));
}
}
if ($o_stack) {
$stack[] = '(' . implode(' OR ', $o_stack) . ')';
}
 
return $stack;
}
 
 
// $unmerged contient la même liste de champs que celle renvoyée
// à la différence que celle-ci n'est pas reformatée et s'avère donc
// utilisable plus aisément dans sqlAddJoins() qui peut en avoir besoin
static function sqlSelectFields($params, &$unmerged) {
$champs = $params['retour.champs'];
// champs coste_v2_00
$c = self::addSQLToFieldSynonym(explode(',', $champs));
if (isset($c['*'])) {
$t = array_diff_key(self::$allow_champs, array_flip(self::$special_champs));
} else {
// just loop below
$t = $c;
}
 
// si aucun des champs fournis n'est valide
// on se rappelle nous-même après avoir réinitialisé retour.champs
// avec les champs par défaut
if(!$t) {
$params['retour.champs'] = self::$default_params['retour.champs'];
return self::sqlSelectFields($params);
}
 
if(array_key_exists('titre', $t))
$t['titre'] = $params['txt.format'] == 'txt' ? 'c.nom_sci' : 'c.nom_sci_html';
 
// champs obligatoires:
$t = array_merge($t, self::addSQLToFieldSynonym(self::$champs_obligatoires));
$unmerged = $t;
 
// XXX: PHP-5.3
$ret = array();
foreach($t as $k => $v) {
if (strpos($k, ':') !== FALSE) {
$ret[] = "$v AS \"$k\"";
} else {
$ret[] = "$v AS $k";
}
}
return implode(',',$ret);
}
 
static function sqlAddJoins($params, $champs) {
$j = '';
// ces tests doivent correspondre aux champs générés par sqlSelectFields()
// ou contraintes générées par sqlAddConstraint()
if(array_key_exists('masque.famille', $params) ||
array_key_exists('famille', $champs)) {
$j .= 'LEFT JOIN tb_eflore.bdtfx_v2_00 b ON c.flore_bdtfx_nn = b.num_nom';
}
 
return $j;
}
 
// d'un tableau de type array("coste:nn", "type_epithete")
// retourne
// un tableau de type array("coste:nn" => "c.num_nom", "type_epithete" => "c.type_epithete")
// basé sur self::$allow_champs
static function addSQLToFieldSynonym(Array $syno) {
return array_intersect_key(self::$allow_champs, array_flip($syno));
}
 
// request handler
static function requestParse(&$ressource, &$params) {
if (isset($_SERVER['REDIRECT_URL'])) {
$uri = explode('/', $_SERVER['REDIRECT_URL']);
} else {
$uri = explode('/', $_SERVER['REQUEST_URI']);
}
if (!empty($_SERVER['QUERY_STRING'])) {
parse_str($_SERVER['QUERY_STRING'], $params);
}
$ressource = array_slice($uri, array_search('textes', $uri) + 1, 3);
}
 
// supprime l'index du tableau des paramètres si sa valeur ne correspond pas
// au spectre passé par $values.
static function unsetIfInvalid(&$var, $index, $values) {
if(array_key_exists($index, $var) && !in_array($var[$index], $values))
unset($var[$index]);
}
 
static function requestFilterParams(Array $params) {
$p = array_intersect_key($params, array_flip(self::$allow_params));
self::unsetIfInvalid($p, 'txt.format', array('txt', 'htm'));
self::unsetIfInvalid($p, 'retour.format', array('min','max'));
self::unsetIfInvalid($p, 'retour.indexBy', array('coste', 'bdtfx'));
self::unsetIfInvalid($p, 'recherche', array('stricte','etendue','floue'));
 
if(isset($params['masque.ns'])) $p['masque.ns'] = trim($params['masque.ns']);
if(isset($params['masque.texte'])) $p['masque.texte'] = trim($params['masque.texte']);
 
if(isset($params['masque.famille'])) {
// mysql -N<<<"SELECT DISTINCT famille FROM bdtfx_v2_00;"|sed -r "s/(.)/\1\n/g"|sort -u|tr -d "\n"
$p['masque.famille'] = preg_replace('/[^a-zA-Z %_]/', '', iconv("UTF-8",
"ASCII//TRANSLIT",
$params['masque.famille']));
}
 
// TODO: use filter_input(INPUT_GET);
// renvoie FALSE ou NULL si absent ou invalide
$p['navigation.limite'] = filter_var(@$params['navigation.limite'],
FILTER_VALIDATE_INT,
array('options' => array(
'default' => NULL,
'min_range' => 1,
'max_range' => _COSTE_TEXTE_MAX_RESULT_LIMIT)));
$p['navigation.depart'] = filter_var(@$params['navigation.depart'],
FILTER_VALIDATE_INT,
array('options' => array(
'default' => NULL,
'min_range' => 0,
'max_range' => _COSTE_TEXTE_MAX_COSTE_NN)));
$p['masque.page'] = filter_var(@$params['masque.page'],
FILTER_VALIDATE_INT,
array('options' => array(
'default' => NULL,
'min_range' => 0,
'max_range' => _COSTE_TEXTE_MAX_COSTE_PAGE)));
$p['masque.tome'] = filter_var(@$params['masque.tome'],
FILTER_VALIDATE_INT,
array('options' => array(
'default' => NULL,
'min_range' => 0,
'max_range' => _COSTE_TEXTE_MAX_COSTE_TOME)));
$p['masque.nt'] = filter_var(@$params['masque.nt'],
FILTER_VALIDATE_INT,
array('options' => array(
'default' => NULL,
'min_range' => 0,
'max_range' => _COSTE_TEXTE_MAX_BDTFX_NT)));
 
// on filtre les NULL, FALSE et '', mais pas les 0, d'où le callback()
// TODO: PHP-5.3
$p = array_filter($p, create_function('$a','return !in_array($a, array("",false,null),true);'));
$p = array_merge(self::$default_params, $p);
 
return $p;
}
 
static function requestFilterIds($uri) {
if(count($uri) != 1) return NULL;
 
// getNN* renvoient le num_nom passé comme segment d'URI:
// - soit un id selon coste (num_nom dans coste_v2_00)
// - soit un id selon bdtfx (num_nom dans bdtfx_v2_00)
// ou bien l'extrait du pattern bdtfx.nn:(#id)
$ids_coste_nn = array_filter(array_map(array(__CLASS__, 'getNNCoste'), explode(',', $uri[0])));
$ids_bdtfx_nn = array_filter(array_map(array(__CLASS__, 'getNNBdtfx'), explode(',', $uri[0])));
$ids_bdtfx_nt = array_filter(array_map(array(__CLASS__, 'getNTBdtfx'), explode(',', $uri[0])));
 
// en cas d'échec (tous les id sont invalides), bail-out
if(!$ids_bdtfx_nt && !$ids_bdtfx_nn && !$ids_coste_nn) {
// http_response_code(500);
throw new Exception('not supported', 500);
}
 
return array(
'coste.nn' => array_slice($ids_coste_nn, 0, intval(_COSTE_TEXTE_MAX_RESULT_LIMIT / 2) ),
'bdtfx.nn' => array_slice($ids_bdtfx_nn, 0, intval(_COSTE_TEXTE_MAX_RESULT_LIMIT / 2) ),
'bdtfx.nt' => array_slice($ids_bdtfx_nt, 0, intval(_COSTE_TEXTE_MAX_RESULT_LIMIT / 2) )
);
}
 
static function aide() {
header("Content-Type: text/plain; charset=utf-8");
return sprintf("Service coste/textes:
 
Retourne des informations (choisies) à propos d'un taxon donné (à partir de son numéro nomenclatural
Retourne des informations (choisies) à propos de taxons recherchés (à partir de divers critères)
Les résultats sont indexés. La clef par défaut est le num_nom d'après coste (attribut \"coste:nn\")
Usage: coste/textes[/<liste-num_nom>]?<params>
 
* le paramètre \"retour.indexBy\" affecte le mode d'indexation (\"bdtfx\" ou \"coste\" (defaut))
* <liste-num_nom> étant une liste de numéros nomenclaturaux de taxons séparés par des virgules au format:
- <#id>: un numéro nomenclatural dans la base coste
- <bdtfx.nn:#id>: un numéro nomenclatural dans la base bdtfx
* retour.champs une liste de champs séparés par des virgules parmi *,%s
* les paramètres acceptés sont les suivants: %s
* les champs retournés par défaut sont les suivants: %s
* le paramètre \"recherche\" affecte les masques \"ns\" et \"texte\"
* le paramètre \"famille\" est traité via LIKE et accepte les caractères '_' et '%%'
* le paramètre \"retour.format\" est inutilisé pour l'instant.
 
Exemples:
/service:eflore:0.1/coste/textes/bdtfx.nn:182?retour.champs=titre
# retourne l'Acer monspessulanum
/service:eflore:0.1/coste/textes/182?retour.champs=titre
# retourne la Roemeria violacea (bdtfx:nn = 56272)
/service:eflore:0.1/coste/textes/182,bdtfx.nn:182?retour.champs=titre
# retourne les deux précédents
/service:eflore:0.1/coste/textes?masque.titre=Cla001Thalamiflores&retour.champs=titre
# retourne la section de Coste relatives aux Thalamiflores
/service:eflore:0.1/coste/textes?masque.titre=Thalamiflores&recherche=floue&retour.champs=titre
# idem, en utilisant une recherche floue
/service:eflore:0.1/coste/textes?masque.titre=Cla001Thalamiflores&retour.champs=titre&retour.indexBy=bdtfx
# retourne une erreur de format car cette section de coste n'est associée à aucun taxon de la BDTFX
",
implode(',', array_keys(self::$allow_champs)),
implode(',', self::$allow_params),
self::$default_params['retour.champs']
);
}
 
static function getNNCoste($refnn) {
if(strpos($refnn, 'coste.nn:') == 0)
$refnn = intval(str_replace('coste.nn:', '', $refnn));
if (is_numeric($refnn)) {
if ($refnn >= 1 && $refnn < _COSTE_TEXTE_MAX_COSTE_NN) return $refnn;
}
return FALSE;
}
 
static function getNNBdtfx($refnn) {
if(strpos($refnn, 'bdtfx.nn:') !== 0) return FALSE;
$t = intval(str_replace('bdtfx.nn:', '', $refnn));
if($t >= 1 && $t < _COSTE_TEXTE_MAX_BDTFX_NN) return $t;
return FALSE;
}
 
static function getNTBdtfx($refnt) {
if(strpos($refnt, 'bdtfx.nt:') !== 0) return FALSE;
$t = intval(str_replace('bdtfx.nt:', '', $refnt));
if($t >= 1 && $t < _COSTE_TEXTE_MAX_BDTFX_NT) return $t;
return FALSE;
}
}
Property changes:
Added: svn:mergeinfo
Merged /branches/v5.8-aspergeraie/services/modules/0.1/coste/Textes.php:r1083
Merged /branches/v5.7-arrayanal/services/modules/0.1/coste/Textes.php:r1050,1052
Merged /branches/v5.1-acheb/services/modules/0.1/coste/Textes.php:r927
Merged /branches/v5.2-alpage/services/modules/0.1/coste/Textes.php:r976,978
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/coste/A_LIRE.txt
New file
0,0 → 1,6
 
!!!Attention à vérifier dans le config.ini de eflore-consultation que cette ligne existe bien avec le paramètre
num_taxonomique : ( utile pour le web service Images )!!!
 
nomsRechercheDeterminationTpl = "{ref:nomsTpl}?masque={valeur}&recherche={type}
&ns.format=txt&retour.champs=nom_retenu,nom_retenu.*,num_taxonomique&navigation.limite=3000"
Property changes:
Added: svn:eol-style
+native
\ No newline at end of property
Added: svn:executable
+*
\ No newline at end of property
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/coste/Images.php
New file
0,0 → 1,213
<?php
 
/**
* classe pour web service qui affiche les images de Coste.
* il n'existe qu'une seule version pour les images de Coste : 2.00
* retour en application/json
*
* exemple d'appel du service :
* .../service:eflore:0.1/coste/images?masque.nt=1053
* .../service:eflore:0.1/coste/images?masque.nn=39594,39601
* .../service:eflore:0.1/coste/images
*
* paramètres disponibles : navigation.depart, navigation.limite, masque.nn, masque.nt
*
* @package eFlore/services
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @author Mathilde Salthun-Lassalle <mathilde@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
class Images extends Commun {
protected $table ;
private $requete_condition = array(" image != '' ");
private $champs_recherches = " num_nom, image, flore_bdtfx_nn, flore_bdtfx_nt ";
private $total_resultat;
protected $limite_requete = array('depart' => 0, 'limite' => 100);
private $masque = array();
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->ressources = $ressources;
$this->parametres = $parametres;
$this->traiterRessources();
$this->traiterParametres();
$this->table = config::get('bdd_table').'_v2_00';
$requete = $this->assemblerLaRequete();
$resultat = $this->getBdd()->recupererTous($requete);
$resultats = $this->formaterResultat($resultat);
return $resultats;
}
//+-----------------------------------traitement ressources et paramètres --------------------------------+
public function traiterRessources() {
if (empty($this->ressources) ) {
if (isset($this->parametres['masque.nn']) == false
&& isset($this->parametres['masque.nt']) == false) {
$this->requete_condition[] = " flore_bdtfx_nt != '' AND flore_bdtfx_nn != '' ";
}
} else {
$e = "La ressource {$this->ressources[0]} n'existe pas.";
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE,$e);
}
}
public function traiterParametres() {
foreach ($this->parametres as $param => $val ) {
switch ($param) {
case 'masque.nt' :
$this->analyserMasque($val,'nt');
break;
case 'masque.nn' :
$this->analyserMasque($val,'nn');
break;
case 'referentiel' :
// ce paramètre est ignoré dans le cas de coste
// car seul le cel le prend en compte pour le moment
// on l'indique ici dans le switch car ce sont les mêmes url
// qui sont appelées pour le cel et coste (à retirer donc si ça change)
break;
case 'navigation.depart' :
$this->limite_requete['depart'] = $val;
break;
case 'navigation.limite' :
$this->limite_requete['limite'] = $val;
break;
default :
$e = 'Erreur dans les paramètres de recherche de votre requête : </br> Le parametre " '
.$param.' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE,$e);
break;
}
}
}
 
private function analyserMasque($valeur, $type_masque) {
$this->masque[] = "$type_masque=$valeur";
if (!$valeur) {
$e = 'renseignez une valeur pour masque.nn';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE,$e);
}
$arr = array_filter(array_map('intval', explode(',', $valeur)));
if(!$arr) $this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, "valeur incorrecte pour masque.".$type_masque);
$this->requete_condition[] = sprintf(" flore_bdtfx_%s IN (%s)", $type_masque, implode(',', array_unique($arr)));
}
 
//+-------------------------------------------formatage résultats---------------------------------------------+
 
public function formaterResultat($resultat) {
$versionResultat['entete'] = $this->formaterEnteteResultat();;
if ($resultat == '') {
$message = 'La requête SQL formée comporte une erreur!';
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE;
throw new Exception($message, $code);
} elseif ($resultat) {
$versionResultat = $this->retournerResultatFormate($resultat);
} else {
$versionResultat['resultats'] = array();
}
return $versionResultat;
}
public function retournerResultatFormate($resultat) {
$resultat_json = array();
foreach ($resultat as $tab) {
$num_coste = $tab['num_nom'];
unset($tab['num_nom']);
$resultat_json['resultats'][$num_coste]['num_nomenclatural'] = $tab['flore_bdtfx_nn'];
$resultat_json['resultats'][$num_coste]['num_taxonomique'] = $tab['flore_bdtfx_nt'];
$resultat_json['resultats'][$num_coste]['binaire.href'] = $this->formaterUrlImage($tab['image']);
$resultat_json['resultats'][$num_coste]['mime'] = "images/png";
}
return $resultat_json;
}
public function formaterUrlImage($fichier) {
$chemin = config::get('donnees')."2.00/img/$fichier";
return $chemin;
}
 
public function formaterEnteteResultat() {
$entete['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$entete['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$entete['total'] = $this->total_resultat;
$entete['masque'] = empty($this->masque) ? 'aucun' : implode('&', $this->masque);
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/images');
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') {
$entete['href.precedent'] = $url['precedent'];
}
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') {
$entete['href.suivant'] = $url['suivant'];
}
return $entete;
}
//+--------------------------FONCTIONS D'ASSEMBLAGE DE LA REQUETE-------------------------------------------+
public function assemblerLaRequete() {
$requete = ' SELECT '.$this->champs_recherches.' FROM '.$this->table.' '
.$this->retournerRequeteCondition().' '
.$this->delimiterResultatsRequete();
return $requete;
}
 
public function retournerRequeteCondition() {
$condition = '';
if (empty($this->requete_condition) == false) {
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
}
return $condition;
}
 
public function calculerTotalResultat() {
$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '.$this->table.' '
.$this->retournerRequeteCondition();
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
if ($res) {
$this->total_resultat = $res['nombre'];
} else {
$this->total_resultat = 0;
$e = 'Données introuvables dans la base';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e);
}
}
public function delimiterResultatsRequete() {
$this->calculerTotalResultat();
$requete_limite = '';
if ((count($this->ressources)) == 0) {
if (($this->limite_requete['depart'] < $this->total_resultat) &&
(($this->limite_requete['limite'] + $this->limite_requete['depart'] )
< $this->total_resultat )) {
$requete_limite = 'LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '
.$this->limite_requete['limite'];
}
}
return $requete_limite;
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/coste/CommunNomsTaxons.php
New file
0,0 → 1,785
<?php
 
abstract class CommunNomsTaxons extends Commun {
protected $table_param = array(); /** Permet de stocker le tableau des parametres (= $parametres) */
protected $table_ressources = array(); /** Permet de stocker le tableau des ressources (= $ressources) */
protected $table_retour; /** Permet de stocker le tableau de résultat (non encodé en json)*/
protected $resultat_req; /** Permet de stocker le résultat de la requete principale. */
/** Permet de stocker sous forme de tableau les composant du nom à ajouter au nom scientifique (fonction du paramètre ns.structure) */
protected $compo_nom;
protected $ordre_masque = array('masque', 'masque_sg', 'masque_gen', 'masque_sp', 'masque_ssp', 'masque_au',
'masque_an', 'masque_bib', 'masque_ad', 'masque_nn', 'masque_rg' );
protected $tab_nom_sci = array('nom_supra_generique', 'genre', 'epithete_infra_generique', 'epithete_sp',
'type_epithete', 'epithete_infra_sp', 'cultivar_groupe', 'cultivar', 'nom_commercial');
protected $retour_format = 'max';
protected $html = 'txt'; /** Valeur du paramètre de requete ns.format */
protected $table_version; /** Stocke les noms des tables de toutes les versions du projet disponibles */
/** Nom de la table dans laquelle on récupèrera les données (remplace Config::get('bdd_table') dans les requetes SQL */
protected $table;
protected $total_resultat = null;
/** Stocke le service appelé correspondant. Est utilisé principalement lors de l'affichage du href d'un synonyme
(ex id=12, basionyme num 25 est un synonyme) dans le service taxon */
protected $service_href = null;
//----------------------------------Fonctions d'analyse des ressources--------------------------------------------------
/** Permet de remplir la variable version_projet et de retirer cette donnée du tableau des ressources */
public function traiterVersionProjet(&$ressources) {
if (isset($ressources) && !empty($ressources)) {
if (preg_match('/(?:[0-9]+(?:_|[.])[0-9]+|[*])/', $ressources[0])) {
$this->version_projet = array_shift($ressources);
$this->version_projet = str_replace('_', '.', $this->version_projet);
} else {
if ($ressources[0] == ' ') array_shift($ressources); //si un + a été ajouté
$this->version_projet = '+';
}
}
//si la liste des noms est demandée pr toutes les versions, on affiche seulement la dernière version pour :
// - la liste des noms et taxons: /noms et /taxons
// - la liste des taxons inferieurs/supérieur : /taxons/relations/inferieurs et /taxons/relations/superieurs
// - la liste des relations : /taxons/relations ou /noms/relations
if ($this->version_projet == '*' && ($ressources == array()
|| (isset($ressources[1]) && $ressources[1] == 'relations' && isset($ressources[2]) && in_array($ressources[2], array('superieurs', 'inferieurs')))
|| (isset($ressources[1]) && $ressources[1] == 'relations' && !isset($ressources[2])) )) {
$this->version_projet = '+';
}
//on recupère les versions du projet disponible dans la table des meta-donnees (utilisation service MetaDonnees)
$table_num_version = $this->recupererVersionDisponible();
//on recupere la liste des noms des tables de la bdd correspondant aux differentes versions du projet en fct de la ou les versions demandées
$this->recupererListeNomTablePrChaqueVersion($table_num_version);
}
public function traiterRessources($ressources) {
$this->table_ressources = $ressources;
if (isset($ressources) && !empty($ressources)) {
if ($this->estUnIdentifiant()) { //l'identifiant peut etre de type /#id ou /nt:#id
$this->traiterRessourcesIdentifiant(); // dans le service noms ou taxons
} elseif ($this->table_ressources[0] == 'stats') { //ressource = noms/stats
$this->traiterRessourcesStats();
} else {
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE,
'Erreur dans votre requete </br> Ressources disponibles : <br/>
<li> /'.$this->service.'/#id (id : L\'identifiant du nom rechercher)</li>
<li> /'.$this->service.'/nt:#id (id : Numero du taxon recherche)</li>
<li> /'.$this->service.'/stats </li>' );
}
}
}
public function traiterRessourcesStats() {
$this->format_reponse = $this->service.'/stats';
if (isset($this->table_ressources[1]) && !empty($this->table_ressources[1])) {
switch ($this->table_ressources[1]) {
case 'annees' :
$this->traiterRessourceStatsAnnees();
break;
case 'rangs' :
$this->traiterRessourceStatsRangs();
break;
case 'initiales' :
$this->traiterRessourceStatsInitiales();
break;
default :
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE,
'Erreur dans votre requete </br> Ressources disponibles : <br/>
<li> /'.$this->service.'/stats/annees </li>
<li> /'.$this->service.'/stats/rangs </li>
<li> /'.$this->service.'/stats/initiales </li>' );
break;
}
} else {
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE,
'Erreur dans votre requete </br> Ressources disponibles : <br/>
<li> /'.$this->service.'/stats/annees </li>
<li> /'.$this->service.'/stats/rangs </li>
<li> /'.$this->service.'/stats/initiales </li>' );
}
}
/** Vérifie si la première valeur de la table de ressource est un identifiant : un numerique ou un numéro
* taxonomique sous la forme nt:xx */
public function estUnIdentifiant() {
return (is_numeric($this->table_ressources[0]) || (strrpos($this->table_ressources[0],'nt:') !== false
&& is_numeric(str_replace('nt:','',$this->table_ressources[0]))));
}
//---------------------------------------------Fonction d'analyse des parametres----------------------------------------
/** Permet de remplir le tableau compo_nom. Il comprendra en fct du paramètre ns.structure les éléments à rajouter
* au nom_sci (annee, auteur, biblio ou addendum).*/
public function remplirTableCompositionNom($valeur) {
$structure_nom = explode(",",$valeur);
foreach ($structure_nom as $structure) {
switch ($structure) {
case 'au' : $this->compo_nom['au'] = 'auteur'; break;
case 'an' : $this->compo_nom['an'] = 'annee'; break;
case 'bib' : $this->compo_nom['bib'] = 'biblio_origine'; break;
case 'ad' : $this->compo_nom['ad'] = 'nom_addendum'; break;
default : $this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE,
'Erreur : Le parametre "'.$structure.'" n\'existe pas. <br/><br/>
Les parametres du nom possibles sont : <li> au (auteur)</li><li> an (annee)</li>
<li> bib (bibliographie)</li><li> ad (nom_addendum)</li>');
break;
}
}
}
/** Permet de recupérer le nom scientigfique au format html. Le champ nom_sci de la requete sql est remplacé par
* le champ nom_sci_html */
public function mettreAuFormat() {
if ($this->html == 'htm') {
if (strrpos($this->requete_champ, 'nom_sci_html as nom_sci') === false) {
$this->requete_champ = str_replace('nom_sci', 'nom_sci_html as nom_sci', $this->requete_champ);
}
} elseif ($this->html != 'txt') {
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE,
'Erreur dans votre requete </br> ns.format = htm ou txt (par defaut)' );
}
}
 
//--------------------------------fonctions de formatage----------------------------------------------------------
 
/** Fonction permettant de creer la table dont le nom est passé en paramètre (champs_api, champs_bdtfx,
* correspondance_champs...). Les données de chaque table sont présentes dans le fichier de configuration config.ini
* @param String $table : Peut contenir plusieurs nom de table dont on souhaite récupérer les données : table,table,table.
* Ex : recupererTableSignification('champs_api,champs_bdtfx') */
public function recupererTableSignification($table) {
$tables = explode(',', $table);
foreach ($tables as $tab) {
if ($tab == 'champs_comp') {
$champ_bdnff_api = array_keys($this->champs_api); //on recupère le nom des champ ds la bdd
$this->champs_comp = array_diff($this->champs_table, $champ_bdnff_api);
} elseif ($tab == 'champs_api') {
foreach ($this->correspondance_champs as $key => $val) {
preg_match('/(hybride[.]parent_0[12](?:[.]notes)?|nom_sci[.][^.]+|[^.]+)(?:[.](id|code))?/', $val, $match);
$val = $match[1];
$this->champs_api[$key] = $val;
}
} else {
$tableau = explode(',', Config::get($tab));
$tableau = array_map('trim', $tableau);
foreach ($tableau as $champ) {
list($code, $rang) = explode('=', $champ);
$tab_tampon[$code] = $rang;
}
$this->$tab = $tab_tampon;
$tab_tampon = array();
}
}
}
public function formaterEnOss($resultat) {
$res = array();
$table_nom = array();
foreach ($resultat as $version => $res_version) {
$oss = '';
foreach ($res_version as $tab) {
if (isset($tab['nom_sci']) ) {
if (!in_array($tab['nom_sci'], $table_nom)) {
$table_nom[] = $tab['nom_sci'];
$oss [] = $tab['nom_sci'].$this->ajouterCompositionNom($tab);
}
}
}
$masque = $this->ordonnerMasque();
if ($masque == '') $masque = 'Pas de masque';
$table_retour_oss = array($masque, $oss);
//Si les infos de plrs versions sont renvoyés, on ajoute au tableau de resultat le numéro de la version
$res = $this->afficherVersionOuPas($version, $table_retour_oss, $res);
}
return $res;
}
/** Permet de récupérer le masque de rang superieur parmi les parametres de la requete.
* Sera affiche dans l'entete du fichier json (clé 'masque') et oss.
* @return string le masque de rang supérieur ou '' si aucun masque n'a été mis en parametre de
* requete (la clé masque ne sera alors pas affichée dans l'entete).*/
public function ordonnerMasque() {
$masque = '';
foreach ($this->ordre_masque as $key => $filtre) {
if (isset($this->table_param[$filtre])) {
$masque .= '&'.$filtre.'='.$this->table_param[$filtre];
}
}
$masque = ltrim($masque, '&'); //on enlève le & du début
$masque = str_replace('masque_','',$masque);
return $masque;
}
/** Affiche l'entete du résultat pour le service /noms et /noms/relations. L'entete comprend le rang (s'il est un
* filtre), le départ, la limite, le total des résultats et les urls suivante et precedente. */
public function afficherEnteteRangBorneTotalUrls($resultat, $url_service) {
if (isset($this->table_param['masque_rg'])) $this->afficherDonnees('rang', $this->table_param['masque_rg']);
$this->table_retour['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$this->table_retour['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$this->table_retour['total'] = $this->total_resultat;
//formuler les urls precedentes et suivantes
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, $url_service);
if ($url['precedent'] != '') { $this->table_retour['href.precedent'] = $url['precedent']; }
if ($url['suivant'] != '') { $this->table_retour['href.suivant'] = $url['suivant']; }
}
//----------------------------Fonction de formatage pour les services /#id/---------------------------------------------
/** Ajout du numero de la version au tableau de résultat à retourner :
* 'bdtfx_v2_00' : {'infos' : 'toto' ...}, 'bdtfx_v3_00' : {'infos' : 'tata' ...}
* @param string $num_version : numéro de version (sous la forme de l'intitulé du nom de la table bdd)
* @param array $tab : tableau contenant le resultat à retourner pour une version donnée
* @param array $res : tableau contenant le resultat à retourner pour toutes les versions disponibles */
public function afficherVersionOuPas($version, &$tab, &$res) {
if (count($this->table_version) > 1) {
$res[$version] = $tab;
$tab = array();
} else {
$res = $tab;
}
return $res;
}
public function formaterId($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$res = array();
foreach ($resultat as $version => $res_version) {
$res_version = $res_version[0];
$this->resultat_req = $res_version;
foreach ($res_version as $key => $valeur) {
if ($valeur != '') {
$this->afficherDonnees($key, $valeur);
}
}
unset($this->table_retour['href']);
//Si les infos de plrs versions sont renvoyés, on ajoute au tableau de resultat le numéro de la version
$res = $this->afficherVersionOuPas($version, $this->table_retour, $res);
}
return $res;
}
public function formaterIdChamp($resultat) {
$this->recupererTableSignification('correspondance_champs,champs_api,champs_comp');
$res = array();
foreach ($resultat as $version => $res_version) {
$res_version = $res_version[0];
$this->resultat_req = $res_version;
$this->table_retour['id'] = $res_version['num_nom'];
//on récupère les champs (le + est transformé en espace par le navigateur)
$tab_ress = explode(' ', $this->table_ressources[1]);
foreach ($tab_ress as $nom_champ_api) {
if ($this->verifierValiditeChamp($nom_champ_api)) {
switch ($nom_champ_api) {
case 'nom_sci' : $this->afficherNomSci($res_version); break;
case 'nom_sci.*' : $this->afficherNomSciPointEpithete($res_version); break;
case 'hybride.*' :
$this->afficherChamps('hybride.parent_01.*', $res_version['hybride_parent_01']);
$this->afficherChamps('hybride.parent_02.*', $res_version['hybride_parent_02']); break;
default :
$this->afficherChamps($nom_champ_api,
$res_version[$this->trouverChampBddCorrespondant($nom_champ_api)]); break;
}
}
}
//Si les infos de plrs versions sont renvoyés, on ajoute au tableau de resultat le numéro de la version
$res = $this->afficherVersionOuPas($version, $this->table_retour, $res);
}
return $res;
}
/** Les champs passés dans l'url lors de la requete /noms|taxons/#id/#champ+#champ son sous la forme de l'api.
* Les noms de l'api ne st pas les meme que ceux des champs de la base de données.
* Cette fct permet de récupérer le nom du champs de la base de données */
public function trouverChampBddCorrespondant($champ) {
$radical_champ = $champ;
if ($this->estUnPoint($champ) && strrpos($champ, '.notes') === false) {
preg_match('/^(?:([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+))(?:\.(.+))?$/', $champ, $match);
$radical_champ = $match[1];
}
// - Soit un champ de l'api est recherché (pour les champs du référentiel : les noms des champs ont été modifiés),
// - Soit un champ complementaire de la bdnff (les noms de ces champs complementaire sont les memes que ds la base)
if ($this->estChampApi($radical_champ)) {
$champ_bdd = array_search($radical_champ, $this->champs_api);
} elseif ($this->estDansBdnff($radical_champ)) {
$champ_bdd = $radical_champ;
} else {
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE,
'Fct trouverChampBddCorrespondant : Le parametre "'.$radical_champ.'" n\'existe pas. <br/><br/>');
}
return $champ_bdd;
}
/** Permet d'afficher des informations précisées des données liées. Utilisé par le service id/champ
* lors de l'appel d'un champ tel que : champ.id, champ.code, champ.*, champ.href. */
public function afficherChamps($champ, $valeur) {
$reponse = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
if ($valeur == '') {
$this->table_retour[$champ] = null;
} else {
preg_match('/^(?:([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+))(?:\.(.+))?$/', $champ, $match);
//si on a un point etoile
if (isset($match[2]) && $match[2] == '*') {
$this->afficherPointEtoile($match[1], $valeur);
//si le champ comprend plusieurs identifiants : pour le champ proparte (liste ou .details recherché, pas de .href)
} elseif ($this->presentePlusieursId($match[1], $valeur)) {
if (isset($match[2]) && $match[2] != 'id') {
$this->afficherInfosPrecises($match[1], $match[2], $valeur);
} else {
$this->table_retour[str_replace('.id', '', $champ)] = $valeur;
}
//si on est en présence d'une donnée liée (la donnée représente un identifiant ou un code)
} elseif ($this->correspondAUnId($match[1]) || $champ == 'id' || $this->correspondAUnCode($match[1])) {
if (isset($match[2])) { //si un .id, un .code ou un .href est demandé :
$this->afficherInfosPrecises($match[1], $match[2], $valeur);
} else {
$this->afficherInfosPrecises($match[1], 'signification', $valeur);
}
//sinon on affiche tel quel
} else {
$this->table_retour[$champ] = $valeur;
}
}
$this->table_retour = array_merge($reponse, $this->table_retour);
}
 
/**Vérifie la validité d'un champ passé dans la requete /#id/#champ+#champ */
public function verifierValiditeChamp($champ) {
preg_match('/^(?:([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+))(?:\.(.+))?$/', $champ, $match);
$radical_champ = $match[1];
$validite_ressource = true;
//on verifie si le nom du champ existe bien
if (!$this->estChampApi($radical_champ) && !$this->estDansBdnff($radical_champ)) {
$validite_ressource = false;
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE,
'Fct verifierValiditeChamp : Le parametre "'.$radical_champ.'" n\'existe pas. <br/><br/>');
} elseif ($this->estUnPoint($champ)) {
$suffixe = $match[2];
//On verifie les suffixes pour les identifiants
if ($this->correspondAUnId($radical_champ) || $radical_champ == 'id') {
$this->verificationSuffixesIdentifiant($suffixe, $radical_champ, $validite_ressource);
//On verifie les suffixes pour les codes
} elseif ($this->correspondAUnCode($radical_champ)) {
$this->verficationSuffixesCodes($suffixe, $radical_champ, $validite_ressource);
} elseif ($radical_champ == 'nom_sci' && $suffixe != '*') {
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE,
'Erreur : Le suffixe demand&eacute; n\'existe pas pour le champ "'.$radical_champ.'".<br/>
Les suffixes possibles sont les suivants : <li> * </li>');
} else {
$validite_ressource = false;
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE,
'Erreur : Le parametre "'.$radical_champ.'" ne peut pas pr&eacute;senter de suffixe. <br/><br/>');
}
}
return $validite_ressource;
}
public function verficationSuffixesCodes(&$suffixe, &$radical_champ, &$validite_ressource ) {
if (!in_array($suffixe, array('*', 'code', 'href', 'details'))) {
$validite_ressource = false;
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE,
'Erreur : Le suffixe demand&eacute; n\'existe pas pour le champ "'.$radical_champ.'.<br/>
Les suffixes possibles sont les suivants :
<li> .* </li><li> .code </li><li> .href </li><li> .details </li>');
}
}
public function verificationSuffixesIdentifiant(&$suffixe, &$radical_champ, &$validite_ressource) {
if ((strrpos($radical_champ, 'parent') !== false && !in_array($suffixe, array('*', 'id', 'href', 'details', 'notes')))
|| !in_array($suffixe, array('*', 'id', 'href', 'details')) && strrpos($radical_champ, 'parent') === false) {
$validite_ressource = false;
$this->renvoyerErreur( RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE,
'Erreur : Le suffixe demand&eacute; n\'existe pas pour le champ "'.$radical_champ.'".<br/>
Les suffixes possibles sont les suivants :
<li> .* </li><li> .id </li><li> .href </li><li> .details </li><li> .notes (seulement pour les hybride.parent)');
}
}
//------------------------------fonction de formatage pour les services /stats/-----------------------------------------
public function formaterStatsAnnee($resultat) {
$res = array();
foreach ($resultat as $version => $res_version) {
foreach ($res_version as $cle_annee) {
foreach ($cle_annee as $key => $val) {
switch($key) {
case 'annee' : $annee = ($val != '') ? $val : 'N.D.'; break;
case 'nombre': $nb = $val; break;
default : break;
}
}
$retour_stats_annee[$annee] = $nb;
}
//Si les infos de plrs versions sont renvoyés, on ajoute au tableau de resultat le numéro de la version
$res = $this->afficherVersionOuPas($version, $retour_stats_annee, $res);
}
return $res;
}
public function formaterStatsRang($resultat) {
$res = array();
foreach ($resultat as $version => $res_version) {
foreach ($res_version as $rangs) {
if ($rangs['rang'] != 0) {
foreach ($rangs as $key => $val) {
switch ($key) {
case 'rang' : $rang = $val; break;
case 'nombre' : $nombre = $val; break;
default : break;
}
}
$retour_rang[$rang] = array(
'rang' => $this->ajouterSignificationCode('rang', $rang),
'nombre' => $nombre
);
}
}
//Si les infos de plrs versions sont renvoyés, on ajoute au tableau de resultat le numéro de la version
$res = $this->afficherVersionOuPas($version, $retour_rang, $res);
}
return $res;
}
public function formaterStatsInitiales($resultat) {
$res = array();
$table_rang = array();
foreach ($resultat as $version => $res_version) {
foreach ($res_version as $tuple) {
if ($tuple['rang'] != 0) {
if (!isset($table_rang[$tuple['rang']])) {
$rang = $this->ajouterSignificationCode('rang', $tuple['rang']);
$table_rang[$tuple['rang']] = $rang;
} else {
$rang = $table_rang[$tuple['rang']];
}
if ($tuple['lettre'] == 'x ') {
if (isset($this->table_retour[$rang]['hyb'])) {
$this->table_retour[$rang]['hybride'] += floatval($tuple['nb']);
} else {
$this->table_retour[$rang]['hybride'] = floatval($tuple['nb']);
}
} elseif ($tuple['lettre'] == '+ ') {
if (isset($this->table_retour[$rang]['chimère'])) {
$this->table_retour[$rang]['chimère'] += floatval($tuple['nb']);
} else {
$this->table_retour[$rang]['chimère'] = floatval($tuple['nb']);
}
} else {
$l = substr($tuple['lettre'], 0, 1);
if (isset($this->table_retour[$rang][$l])) {
$this->table_retour[$rang][substr($tuple['lettre'], 0, 1)] += floatval($tuple['nb']);
} else {
$this->table_retour[$rang][substr($tuple['lettre'], 0, 1)] = floatval($tuple['nb']);
}
}
}
}
//Si les infos de plrs versions sont renvoyés, on ajoute au tableau de resultat le numéro de la version
$res = $this->afficherVersionOuPas($version, $this->table_retour, $res);
}
return $res;
}
//-----------------------------Fonctions d'affichage utiliser dans les fonctions de formatage---------------------------
/** Affiche les résultats en fonction du paramètre retour_format. */
public function afficherDonnees($key, $valeur) {
//on souhaite afficher le nom au format de l'api
if ($this->retour_format == 'min') {
if ($this->correspondAChampApi($key)) { //on affiche l'intitulé selon decrit dans l'api
if ($key == 'nom_sci') $valeur = $valeur.$this->ajouterCompositionNom($this->resultat_req);
$this->table_retour[$this->correspondance_champs[$key]] = $valeur;
} else {
$this->table_retour[$key] = $valeur;
}
} else {
if ($this->correspondAChampApi($key)) {
$nom_champ_api = $this->correspondance_champs[$key]; //on récupere le nom comme définit ds l'api
$this->afficherToutesLesInfos($nom_champ_api, $valeur);
} elseif ($this->estDansBdnff($key)) {
$this->table_retour[$key] = $valeur;
}
}
}
public function afficherToutesLesInfos($nom_champ_api, $valeur) {
if ($this->presentePlusieursId($nom_champ_api, $valeur)) {
preg_match('/^([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+)(?:\.id)?$/', $nom_champ_api, $match);
$this->afficherInfosPrecises($match[1], 'details', $valeur);
$this->table_retour[$nom_champ_api] = $valeur;
} elseif (strrpos($nom_champ_api, 'parent') !== false && strrpos($nom_champ_api, 'notes') !== false) {
$this->table_retour[$nom_champ_api] = $valeur;
} elseif (($this->correspondAUnId($nom_champ_api) || $nom_champ_api == 'id') && $valeur != '0') {
preg_match('/^([^.]+\.parent_0[12]|[^.]+)(?:\.id)?$/', $nom_champ_api, $match);
$this->afficherInfosPrecises($match[1], 'id,signification,href', $valeur);
} elseif ($this->correspondAUnCode($nom_champ_api)) {
preg_match('/^([^.]+)(?:\.code)?$/', $nom_champ_api, $match);
$this->afficherInfosPrecises($match[1], 'code,signification,href', $valeur);
}
}
public function presentePlusieursId($ressource, $valeur = null) {
if ($valeur) {
$presente = strrpos($ressource, 'proparte') !== false && strrpos($valeur, ',') !== false;
} else { //pour la vérification du champ, on ignore alors la valeur de la ressource
$presente = strrpos($ressource, 'proparte') !== false;
}
return $presente;
}
public function afficherTableDetails($nom_champ_api, $valeur) {
$tab_id = explode(',',$valeur);
$tab_res = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
foreach ($tab_id as $id) {
$this->afficherInfosPrecises($nom_champ_api, 'id,signification,href', $id);
$tab_res[$nom_champ_api.'.details'][] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
$this->table_retour = $tab_res;
}
public function afficherPointEtoile($champ, $valeur) {
if ($this->presentePlusieursId($champ, $valeur)) {
$this->afficherInfosPrecises($champ, 'details', $valeur);
$this->table_retour[$champ] = $valeur;
} elseif (strrpos($champ, 'parent') !== false) {
$this->afficherInfosPrecises($champ, 'id,href,notes', $valeur);
} elseif ($this->correspondAUnId($champ) || $champ == 'id') {
$this->afficherInfosPrecises($champ, 'id,href', $valeur);
} elseif ($this->correspondAUnCode($champ)) {
$this->afficherInfosPrecises($champ, 'code,href', $valeur);
}
}
public function afficherInfosPrecises($champ, $suffixe, $valeur) {
$suffixes = explode(',', $suffixe);
//on initialise au service appelé. Sera potentiellement modifié dans la fonction afficherSignification()
$this->service_href = $this->service;
foreach ($suffixes as $suff) {
switch ($suff) {
case 'id' :
$this->table_retour[str_replace('id.id', 'id', $champ.'.id')] = $valeur;
break;
case 'details' :
$this->afficherTableDetails($champ, $valeur);
break;
case 'signification' :
$this->afficherSignification($champ, $valeur);
break;
case 'href' :
if ($this->correspondAUnId($champ) || $champ == 'id') {
$service = $this->service_href;
$url = $this->ajouterHref($service, $valeur);
} else {
$service = 'ontologies';
$champ_url = $champ;
$url = $this->ajouterHrefAutreProjet($service, $val, $champ_url);
}
$this->table_retour[str_replace('id.href', 'href', $champ.'.href')] = $url;
break;
case 'code' :
$val = ( $champ == 'rang' ) ? 'bdnt.rangTaxo:'.$valeur : 'bdnt.'.rtrim($champ, '_Ga,_Co').':'.$valeur;
$this->table_retour[$champ.'.code'] = $val;
break;
case 'notes' :
$this->table_retour[$champ.'.notes'] = $this->resultat_req[str_replace('.', '_', $champ).'_notes'];
break;
default :
break;
}
}
}
public function afficherSignification($champ, $valeur) {
if ($champ == 'id' && isset($this->resultat_req['nom_sci']) && $this->resultat_req['num_nom'] == $valeur) {
//si le nom_sci du num_nom que l'on veut afficher est déjà dans la table de résultat :
$this->table_retour['nom_sci'] = $this->resultat_req['nom_sci'].$this->ajouterCompositionNom($this->resultat_req);
} elseif ($this->correspondAUnId($champ) || $champ == 'id') {
$nom = $this->recupererNomSci($valeur);
$champ = ($champ == 'id') ? 'nom_sci' : $champ;
if ($nom != array()) {
$this->table_retour[$champ] = $nom['nom_sci'];
$this->service_href = $nom['service'];
}
} elseif ($this->correspondAUnCode($champ)) {
$this->table_retour[$champ] = $this->ajouterSignificationCode($champ, $valeur);
}
}
/** Permet d'afficher les élements nomenclatural du nom_sci lors de l'appel dans le service noms/id/champ du champ^nom_sci.*/
public function afficherNomSciPointEpithete($resultat) {
foreach ($this->tab_nom_sci as $compo_nom) {
if (isset($resultat[$compo_nom]) && !empty($resultat[$compo_nom])) {
$this->table_retour['nom_sci.'.$compo_nom] = $resultat[$compo_nom];
}
}
}
/** utilisé dans le formatage de /noms/id et de /noms/id/champ seulement */
public function afficherNomSci($resultat) {
if ($this->html == 'htm') {
$this->table_retour['nom_sci'] = $resultat['nom_sci_html'].$this->ajouterCompositionNom($resultat);
} else {
$this->table_retour['nom_sci'] = $resultat['nom_sci'].$this->ajouterCompositionNom($resultat);
}
}
/** Permet d'afficher la signification d'un code pour le rang, la présence, et les differents statuts */
public function ajouterSignificationCode($champ, $valeur) {
$champ = ($champ == 'rang') ? 'rangTaxo' : rtrim($champ, '_Co,_Ga');
if (preg_match('/^([^_-]+)(?:_|-)([^_-]+)$/', $champ, $match)) {
$champ = $match[1].ucfirst($match[2]);
}
$url = Config::get('url_ontologie').$champ.':'.$valeur.'/nom';
$res = $this->consulterHref($url); //dans commun.php
$nom_code = $res->nom;
return $nom_code;
}
/** Recupere le nom_scientifique (formaté ou non en fonction du parametre ns.format) à partir du num_nom */
public function recupererNomSci($id) {
$nom = array();
if ($id != 0) {
if ($this->compo_nom == null) {
$req = 'SELECT nom_sci, num_nom_retenu FROM '.$this->table.' WHERE num_nom = '.$id;
} else { //on ajoute à la requete sql, les champs de ns.structure
$req = 'SELECT nom_sci, num_nom_retenu, '.implode(', ', $this->compo_nom)
.' FROM '.$this->table
.' WHERE num_nom = '.$id;
}
if ($this->html == 'htm') {
$req = str_replace('nom_sci', 'nom_sci_html as nom_sci', $req);
}
$res = $this->getBdd()->recuperer($req);
if ($res) {
$nom['nom_sci'] = $res['nom_sci'].$this->ajouterCompositionNom($res);
$nom['service'] = ($res['num_nom_retenu'] == $id && $this->service == 'taxons') ? 'taxons' : 'noms';
} else {
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE,
'Fct recupererNomSci() : Donnees introuvables dans la base pour l\'id '.$id);
}
}
return $nom;
}
 
/** Permet de retourner une chaine de caractère composée des parametres du nom (ns.structure : annnée, auteur,
* bibilio et addendum). A ajouter au nom scientifique */
public function ajouterCompositionNom($tab_res) {
$nom_complet = ' ';
$this->ajouterAuteur($tab_res, $nom_complet);
$this->ajouterAnneeEtBiblio($tab_res, $nom_complet);
$this->ajouterAnneeSansBilio($tab_res, $nom_complet);
$this->ajouterBiblioSansAnnee($tab_res, $nom_complet);
$this->ajouterAddendum($tab_res, $nom_complet);
return rtrim($nom_complet);
}
public function ajouterAuteur($tab_res, &$nom_complet) {
if (isset($this->compo_nom['au']) && isset($tab_res['auteur']) && $tab_res['auteur'] != '') {
if ($this->html == 'htm') {
$nom_complet .= '<span class="auteur">'.$tab_res['auteur'].'</span> ';
} else {
$nom_complet .= $tab_res['auteur'].' ';
}
}
}
public function ajouterAnneeEtBiblio($tab_res, &$nom_complet) {
if (isset($this->compo_nom['an']) && isset($this->compo_nom['bib'])
&& isset($tab_res['annee']) && ($tab_res['annee'] != '')
&& isset($tab_res['biblio_origine']) && ($tab_res['biblio_origine'] != '')) {
if ($this->html == 'htm') {
$nom_complet .= '[<span class="annee">'.$tab_res['annee'].'</span>, <span class="biblio">'
.$tab_res['biblio_origine'].'</span>]';
} else {
$nom_complet .= '['.$tab_res['annee'].', '.$tab_res['biblio_origine'].']';
}
}
}
 
public function ajouterAnneeSansBilio($tab_res, &$nom_complet) {
if (isset($this->compo_nom['an']) && !isset($this->compo_nom['bib'])
&& isset($tab_res['annee']) && ($tab_res['annee'] != '')) {
if ($this->html == 'htm') {
$nom_complet .= '[<span class="annee">'.$tab_res['annee'].'</span>]';
} else {
$nom_complet .= '['.$tab_res['annee'].']';
}
}
}
public function ajouterBiblioSansAnnee($tab_res, &$nom_complet) {
if (!isset($this->compo_nom['an']) && isset($this->compo_nom['bib']) && ($tab_res['biblio_origine'] != '')) {
if ($this->html == 'htm') {
$nom_complet .= '[<span class="biblio">'.$tab_res['biblio_origine'].'</span>]';
} else {
$nom_complet .= '['.$tab_res['biblio_origine'].']';
}
}
}
public function ajouterAddendum($tab_res, &$nom_complet) {
if (isset($this->compo_nom['ad']) && ($tab_res['nom_addendum'] != '')) {
if ($this->html == 'htm') {
$nom_complet .= '[<span class="adendum">'.$tab_res['nom_addendum'].'</span>]';
} else {
$nom_complet .= '['.$tab_res['nom_addendum'].']';
}
}
}
public function correspondAUnCode($key) {
return (strrpos($key, '.code') !== false) || (in_array($key.'.code', $this->correspondance_champs));
}
public function correspondAUnId($key) {
return (strrpos($key, '.id') !== false) || (in_array($key.'.id', $this->correspondance_champs));
}
public function estChampApi($champ) {
return (in_array($champ, $this->champs_api) || in_array($champ, $this->correspondance_champs));
}
public function correspondAChampApi($champ_bdd) {
return (array_key_exists($champ_bdd, $this->champs_api) || array_key_exists($champ_bdd, $this->correspondance_champs));
}
public function estDansBdnff($champ) {
return (in_array($champ, $this->champs_comp));
}
public function estUnPoint($key) {
if (strrpos($key, 'hybride.parent') !== false) {
$key = str_replace('hybride.parent', 'hybride_parent', $key);
}
return (strrpos($key, '.') !== false);
}
}
 
?>
Property changes:
Added: svn:executable
+*
\ No newline at end of property
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/photoflora/ALIRE.txt
New file
0,0 → 1,8
; l'utilisation d'une redirection transparente des appels à l'api photoflora peut se faire
; en incluant dans le .htaccess du site, la ligne suivante :
RewriteRule ^service:eflore:([0-9]\.[0-9])/photoflora/images$ http://photoflora.free.fr/eflore-photoflora/services/index.php/$1/projets/photoflora/images
; Attention ! Il faut l'inclure avant la ligne de redirection des services web eflore
 
; Free ne supporte pas la redirection .htacess, il faut donc donc la désactiver dans le .htaccess de la racine des services
; Photoflora étant hébergé chez free, il faut changer ce paramètre dans le fichier de config général en ce qui suit
serveur.baseURL = "/eflore-photoflora/services/index.php/"
Property changes:
Added: svn:eol-style
+native
\ No newline at end of property
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/photoflora/Images.php
New file
0,0 → 1,421
<?php
/**
* Web service particulier pour photoflora, qui ne doitpas être installé sur tela botanica
* mais sur photoflora.free.fr
* Une redirection htaccess est à faire, redirigeant /service:eflore:0.1/photoflora/image
* vers le site photoflora à l'adresse ou seront installé les services web et le minimum
* nécessaire pour les faire fonctionner (framework + base de code eflore-projet ou peut-être moins)
*
* La table des metadonnées est, elle, stockée sur Tela Botanica
* Le service est dans le même dépot que les autres par souci de commodité
*
*/
class Images {
 
const MIME_JPEG = 'image/jpeg';
const MIME_PNG = 'image/png';
const MIME_JSON = 'application/json';
const MIME_XML = 'text/xml';
 
//TODO déplacer ceci dans des parametres de config
const BDD_PF = 'photoflora';
private $efph_url_photo = 'http://photoflora.free.fr/photos/%s/max/%s';
private $efph_url_photo_bb = 'http://photoflorabb.free.fr/max/%s';
private $efph_url_photo_jlt = 'http://photoflorajlt.free.fr/max/%s';
 
private $efph_url_photo_min = 'http://photoflora.free.fr/photos/%s/min/%s';
private $efph_url_photo_bb_min = 'http://photoflora.free.fr/photos/bb/min/%s';
private $efph_url_photo_jlt_min = 'http://photoflora.free.fr/photos/jlt/min/%s';
 
private $parametres = array();
private $ressources = array();
private $Bdd;
 
private $format = 'min';
private $retour_mime = 'application/json';
private $nbreImages = '0';
 
public function __construct(Bdd $bdd = null, Array $config = null) {
$this->config = is_null($config) ? Config::get('Images') : $config;
$this->Bdd = is_null($bdd) ? new Bdd() : $bdd;
}
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
 
$this->parametres = $parametres;
$this->ressources = $ressources;
 
$this->definirValeurParDefautDesParametres();
 
$this->format = (isset($this->parametres['retour.format']) && $this->parametres['retour.format'] != '') ? $this->parametres['retour.format'] : $this->format;
$this->retour_mime = (isset($this->parametres['retour']) && $this->parametres['retour'] != '') ? $this->parametres['retour'] : $this->retour_mime;
$photographies = $this->getResultatTest();
if($this->retour_mime == self::MIME_JPEG) {
$photo = $this->obtenirPremiereImage();
$retour = $this->formaterRetourImageBinaire($photo);
echo $retour;
} elseif($this->retour_mime == self::MIME_JSON) {
$photographies = $this->obtenirImages();
$this->nbreImages = count($photographies);
$photographies_formatees = $this->formaterRetourJson($photographies);
$resultat = $photographies_formatees;
$entete = $this->construireEntete();
return array('entete' => $entete, 'resultats' => $resultat);
} elseif ($this->retour_mime == self::MIME_XML) {
$photographies = $this->obtenirImages();
$this->nbreImages = count($photographies);
$photographies_formatees = $this->formaterRetourXml($photographies);
header('Content-Type: '.self::MIME_XML);
echo $photographies_formatees;
exit;
}
}
 
private function construireEntete() {
$entete = array('masque' => '', 'depart' => 0, 'limite' => 100, 'total' => 0);
 
$entete['masque'] = $this->recupererMasque();
$entete['depart'] = (int) $this->parametres['navigation.depart'];
$entete['limite'] = (int) $this->parametres['navigation.limite'];
$entete['total'] = $this->nbreImages;
 
return $entete;
}
 
private function recupererMasque() {
$masqueEntete = '';
foreach ($this->parametres as $param => $cle) {
if ($param == 'masque') {
$masqueEntete = 'masque='.$cle.',';
} elseif (substr($param, 0, 7) == 'masque.') {
$masqueEntete .= substr($param, 7).'='.$cle.',';
}
}
$masqueEntete = rtrim($masqueEntete,',');
return $masqueEntete;
}
 
private function definirValeurParDefautDesParametres() {
if (isset($this->parametres['retour']) == false) {
$this->parametres['retour'] = self::MIME_JSON;
}
if (isset($this->parametres['retour.format']) == false) {
$this->parametres['retour.format'] = 'min';
}
if (isset($this->parametres['navigation.depart']) == false) {
$this->parametres['navigation.depart'] = 0;
}
if (isset($this->parametres['navigation.limite']) == false) {
$this->parametres['navigation.limite'] = 100;
}
}
 
public function obtenirPremiereImage() {
$this->parametres['navigation.depart'] = 0;
$this->parametres['navigation.limite'] = 1;
$images = $this->obtenirImages();
if (!is_array($images) || count($images) <= 0) {
$message = "Aucune image ne correspond au numéro numenclatural $refTax:$numNom";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
} else {
return $images[0];
}
}
 
public function obtenirImages() {
//TODO: tri par date, mais les dates dans la bdd photoflora sont des chaines en entités HTML
// donc un tri dessus n'a pas de sens
$requete = 'SELECT photos.*, taxons.NumTaxon, taxons.NumNomen, taxons.Combinaison, photographes.Nom, '.
' photographes.Prenom, photographes.Initiales, photographes.Mail '.
'FROM '.self::BDD_PF.'.photos, '.self::BDD_PF.'.photographes, '.self::BDD_PF.'.taxons '.
'WHERE '.
'photos.Auteur = photographes.ID '.
'AND photos.NumTaxon = taxons.NumTaxon '.
$this->construireWhereNumNom().' '.
$this->construireWhereNumTax().' '.
$this->construireWhereNomSci().' '.
$this->construireWhereAuteur().' '.
'ORDER BY photos.support LIMIT '.$this->parametres['navigation.depart'].','.$this->parametres['navigation.limite'];
$resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete);
return $resultat;
}
 
private function construireWhereNumNom() {
return (isset($this->parametres['masque.nn'])) ? 'AND taxons.NumNomen = '.$this->Bdd->proteger($this->parametres['masque.nn']).' ' : '';
}
 
private function construireWhereNumTax() {
return (isset($this->parametres['masque.nt'])) ? 'AND taxons.NumTaxon = '.$this->Bdd->proteger($this->parametres['masque.nt']).' ' : '';
}
 
private function construireWhereNomSci() {
return (isset($this->parametres['masque.ns'])) ? 'AND taxons.Combinaison LIKE '.$this->Bdd->proteger($this->parametres['masque.ns'].'%').' ' : '';
}
 
private function construireWhereAuteur() {
$requete_auteur = '';
if (isset($this->parametres['masque.auteur'])) {
$auteur_like = $this->Bdd->proteger($this->parametres['masque.auteur'].'%');
$requete_auteur = 'AND photos.auteur = '.
'(SELECT id FROM '.self::BDD_PF.'.photographes '.
'WHERE '.
'Nom LIKE '.$auteur_like.' OR '.
'Prenom LIKE '.$auteur_like.' OR '.
'Initiales LIKE '.$auteur_like.' OR '.
'Mail LIKE '.$auteur_like.') ';
}
return $requete_auteur;
}
 
private function formaterRetourImageBinaire($photo) {
$image = '';
$chemin = $url = $this->getUrlPhotoPourInitiales($photo['Initiales'], $photo['NumPhoto'], $this->format);
$image = file_get_contents($chemin);
if ($image === false) {
$message = "L'image demandée est introuvable sur le serveur : $chemin";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
}
return $image;
}
 
private function formaterRetourJson($photographies) {
$resultat = array();
if (is_array($photographies)) {
foreach ($photographies as $photo) {
$image = array();
$url = $this->getUrlPhotoPourInitiales($photo['Initiales'], $photo['NumPhoto'], $this->format);
$urlmax = $this->getUrlPhotoPourInitiales($photo['Initiales'], $photo['NumPhoto'], 'max');
$id = str_replace(array('.jpg','.jpeg', '.png'), '', $photo['NumPhoto']);
 
// Post-traitement des valeurs
$image['date'] = $this->donnerDate($this->formaterChaineEncodeeBddPhotoflora($photo['Date']));
$image['mime'] = $this->extraireMime($photo['NumPhoto']);
$image['auteur.libelle'] = $this->formaterChaineEncodeeBddPhotoflora($photo['Prenom'].' '.$photo['Nom']);
$image['binaire.href'] = $url;
$image['binaire.hrefmax'] = $urlmax;
$image['determination.libelle'] = $photo['Combinaison'].' ['.$photo['Prenom'].' '.$photo['Nom'].']';
$image['determination.nom_sci.libelle'] = $photo['Combinaison'];
$image['determination.nom_sci.code'] = "bdtfx.".$photo['NumNomen'];
$image['station.libelle'] = $this->formaterStation($photo['lieu']);
 
$resultat[$id] = $image;
}
}
return $resultat;
}
 
private function extraireMime($fichierImg) {
$mime = '';
if (strpos($fichierImg, '.jpg') || strpos($fichierImg, '.jpeg')) {
$mime = self::MIME_JPEG;
} else if (strpos($fichierImg, '.png')) {
$mime = self::MIME_PNG;
}
return $mime;
}
 
private function formaterStation($station) {
$station = $this->formaterChaineEncodeeBddPhotoflora($station);
$station = preg_replace('/^ : /', '', $station);
return $station;
}
 
private function callBackReplace($m) {
return mb_convert_encoding($m[1], "UTF-8", "HTML-ENTITIES");
}
 
private function formaterChaineEncodeeBddPhotoflora($chaine) {
return $chaine = preg_replace_callback("/(&#[0-9]+;)/", array($this, 'callBackReplace'), $chaine);
}
 
// TODO: garder ancien web service pour retour xml ou bien fusionner les deux ?
private function formaterRetourXml($photographies) {
// Formatage du xml
$xml = '<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>'."\n";
$xml .= '<rdf:RDF'."\n";
$xml .= ' xmlns:rdf="http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#"'."\n";
$xml .= ' xmlns:dc="http://purl.org/dc/elements/1.1/"'."\n";
$xml .= ' xmlns:dcterms="http://purl.org/dc/terms">'."\n";
foreach ($photographies as $photo) {
 
$url = $this->getUrlPhotoPourInitiales($photo['Initiales'], $photo['NumPhoto'], $this->format);
 
// Post-traitement des valeurs
$photo['lieu'] = preg_replace('/^[ ]*:[ ]*/', '', $photo['lieu']);
 
// Gestion du XML
$xml .= ' <rdf:Description about="'.$url.'"'."\n";
$xml .= ' dc:identifier="'.preg_replace('/\.\w+$/', '', $photo['NumPhoto']).'"'."\n";
$xml .= ' dc:title="'.$photo['Combinaison'].'"'."\n";
$xml .= ' dc:description="'.$photo['Objet'].'"'."\n";
$xml .= ' dc:creator="'.$photo['Prenom'].' '.$photo['Nom'].'"'."\n";
// $xml .= ' dc:contributor="Daniel MATHIEU (Détermination)"'."\n";
$xml .= ' dc:publisher="Photoflora"'."\n";
$xml .= ' dc:type="'.$this->donnerTxtSupport($photo['Support']).'"'."\n";
$xml .= ' dc:format="'.$this->donnerTypeMime($photo['NumPhoto']).'"'."\n";
$xml .= ' dcterms:spatial="'.$photo['lieu'].'"'."\n";
$xml .= ' dcterms:created="'.$photo['Date'].'"'."\n";
// $xml .= ' dcterms:dateSubmitted="2006-10-18 08:32:00"'."\n";
$xml .= ' dcterms:licence="Utilisation des photos non autorisée sans accord avec le gestionnaire du site et sous certaines conditions - Tous droits réservés - All rights reserved"/>'."\n";
}
$xml .= '</rdf:RDF>'."\n";
 
return $xml;
}
 
private function getUrlPhotoPourInitiales($initiales, $num_photo, $format) {
// Gestion des urls des photos
$url = '';
if ($initiales == 'bb') {
$base_url = ($format == 'max') ? $this->efph_url_photo_bb : $this->efph_url_photo_bb_min;
$url = sprintf($base_url, $num_photo);
} else if ($initiales == 'jlt') {
$base_url = ($format == 'max') ? $this->efph_url_photo_jlt : $this->efph_url_photo_jlt_min;
$url = sprintf($base_url, $num_photo);
} else {
$base_url = ($format == 'max') ? $this->efph_url_photo : $this->efph_url_photo_min;
$url = sprintf($base_url, $initiales, $num_photo);
}
 
return $url;
}
 
private function getResultatTest() {
$photographies = array();
$photographies[] = array('Initiales' => 'bb',
'NumPhoto' => 'bb047230.jpg',
'NumNomen' => '182',
'lieu' => 'Ristolas - Hautes Alpes (05) [France]',
'Combinaison' => '',
'Objet' => 'Vue générale, en fleur cv Musik - Canon EOS 350D DIGITAL - Expo : 1/160 sec. - Ouv. : f8 - ISO : 100 - flash : non - foc. : 60 - pix. : 8 Mp.',
'Prenom' => 'Benoit',
'Nom' => 'BOCK',
'Support' => 'Photographie numérique',
'Date' => 'Mai 2006');
 
return $photographies;
}
 
/**
* Fonction remplaçant les caractères posant problème dans le xml
*
* @param string le texte à nettoyer
* @return string le texte nettoyé
*/
function nettoyerXml($xml) {
// Remplacement des esperluettes
$xml = str_replace(' & ', ' &#38; ', $xml);
// Remplacement du caractère spécial de fin de ligne : VT
$xml = preg_replace('/ /', "\n", $xml);
return $xml;
}
 
/**
* Fonction fournissant les intitulés des types de support des images
*
* @param integer identifiant du support
* @return string le texte correspondant au type de support
*/
function donnerTxtSupport($support) {
switch ($support) {
case '0':
$support = 'Photographie num&#233;rique (6 mégapixels)';
break;
case '1':
$support = 'Diapositive';
break;
case '10':
$support = 'Scan de la flore de Coste';
break;
case '11':
$support = 'Scan de plante fraiche';
break;
default:
$support = 'Erreur code support : pr&#233;venir eflore_remarques@tela-botanica.org';
}
return $support;
}
 
/**
* Fonction fournissant les types MIME des fichiers images
*
* @param string le nom du fichier
* @return string le texte du type MIME du fichier
*/
function donnerTypeMime($fichier) {
if (preg_match('/\.(\w+)$/', $fichier, $match)) {
switch (strtolower($match[1])) {
case 'jpeg':
case 'jpg':
$type = 'image/jpeg';
break;
case 'png':
$type = 'image/png';
break;
default:
$type = 'Erreur Mime : prévenir eflore_remarques@tela-botanica.org';
}
} else {
$type = 'Erreur Mime : prévenir eflore_remarques@tela-botanica.org';
}
return $type;
}
 
/**
* Fonction fournissant une date au format Mysql
*
* @param string la date composé du nom du mois en français et de l'année sous 4 chiffres
* @return string la date dans le format Mysql
*/
function donnerDate($chaine) {
if (preg_match('/^(\w+) (\d{4})$/',$chaine, $match)) {
$mois = $match[1];
$annee = $match[2];
switch (strtolower($mois)) {
case 'janvier' :
$mois_sortie = '01';
break;
case 'février' :
$mois_sortie = '02';
break;
case 'mars' :
$mois_sortie = '03';
break;
case 'avril' :
$mois_sortie = '04';
break;
case 'mai' :
$mois_sortie = '05';
break;
case 'juin' :
$mois_sortie = '06';
break;
case 'juillet' :
$mois_sortie = '07';
break;
case 'aout' :
case 'août' :
$mois_sortie = '08';
break;
case 'septembre' :
$mois_sortie = '09';
break;
case 'octobre' :
$mois_sortie = '10';
break;
case 'novembre' :
$mois_sortie = '11';
break;
case 'decembre' :
$mois_sortie = '12';
break;
}
return $annee.'-'.$mois_sortie.'-01 01:01:01';
} else {
return '1970-01-01 01:01:01';
}
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/coord-transfo/Point.php
New file
0,0 → 1,69
<?php
// declare(encoding='UTF-8');
 
// Inclusion des dépendances à Proj4Php.
require 'vendor/autoload.php';
 
/**
* @api {get} /coord-transfo/point?x=:x&y=:y&epsg-src=:epsg-src&epsg-dest=:epsg-dest Transforme des coordonnées.
* @apiName GetCoordTransfo
* @apiGroup coord-transfo
* @apiGroupDescription Transforme les coordonnées X et Y d'un point en fonction d'un EPSG source (epsg-src) et d'un EPSG de
* destination (epsg-dest).
* Exemples d'EPSG fonctionnels :
* - Lambert 93 : 'EPSG:2154'
* - WGS84 : 'EPSG:4326'
*
* @apiParam {String} x info de l'axe des x (longitude).
* @apiParam {String} y info de l'axe des y (latitude).
* @apiParam {Number} epsg-src nombre entier correspondant au code EPSG du système de coordonnée source.
* @apiParam {Number} epsg-dest nombre entier correspondant au code EPSG du système de coordonnée de destination.
*
* @apiSuccess {String} x info de l'axe des x (longitude) transformé.
* @apiSuccess {String} y info de l'axe des y (latitude) transformé.
* @apiSuccess {String} EPSG nombre entier correspondant au code EPSG du système de coordonnée de destination.
*
* @category eFlore
* @package Services
* @subpackage Coord-transfo
* @version 0.1
* @author Mathias CHOUET <mathias@tela-botanica.org>
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @author Aurelien PERONNET <aurelien@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @copyright 1999-2014 Tela Botanica <accueil@tela-botanica.org>
*/
class Point {
 
private $parametres = array();
private $ressources = array();
 
private $coordonnees = array();
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->ressources = $ressources;
$this->parametres = $parametres;
 
$retour = null;
try {
$this->transformerCoordonnees();
$retour = $this->coordonnees;
} catch (Exception $erreur) {
$retour = $erreur->getMessage();
}
return $retour;
}
 
private function transformerCoordonnees() {
$proj4 = new Proj4php();
$projSource = new Proj4phpProj('EPSG:'.$this->parametres['epsg-src'], $proj4);
$projDestination = new Proj4phpProj('EPSG:'.$this->parametres['epsg-dest'], $proj4);
$pointSrc = new proj4phpPoint($this->parametres['x'], $this->parametres['y']);
$pointDest = $proj4->transform($projSource, $projDestination, $pointSrc);
 
$this->coordonnees['x'] = round($pointDest->x, 5);
$this->coordonnees['y'] = round($pointDest->y, 5);
$this->coordonnees['EPSG'] = $this->parametres['epsg-dest'];
}
}
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/lion1906/NomCommune.php
New file
0,0 → 1,143
<?php
// declare(encoding='UTF-8');
/**
* Classe permettant d'obtenir le nom et le code INSEE des communes les plus proches d'un point (latitude et longitude).
* La latitude et longitude doivent être exprimée par un nombre décimal.
* Ce service fonctionne uniquement sur les communes de France métropolitaine (Corse comprise) présentent
* dans les données Lion1906 téléchargeable à cette adrese : http://www.lion1906.com/Pages/francais/utile/telechargements.html.
* Source des données : Lion1906.com http://www.lion1906.com
* Paramètres du service :
* - lat : latitude
* - lon : longitude
* Exemple :
* http://localhost/lion1906/services/0.1/nom-commune?lat=44.71546&lon=3.84216
*
* @category php 5.2
* @package lion1906
* @author Mohcen BENMOUNAH <mohcen@tela-botanica.org>
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @copyright Copyright (c) 2010, Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
* @license http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-fr.txt Licence CECILL
* @license http://www.gnu.org/licenses/gpl.html Licence GNU-GPL
* @version $Id$
*/
class NomCommune {
 
const PATTERN_LAT = '/^[0-9]+(?:[.][0-9]+|)$/';
const PATTERN_LON = '/^[-]?[0-9]+(?:[.][0-9]+|)$/';
const LAT_MAX = 51.071667;
const LAT_MIN = 41.316667;
const LON_MAX = 9.513333;
const LON_MIN = -5.140278;
const NBRE_COMMUNE_PAR_DEFAUT = 10;
const NBRE_COMMUNE_MAX = 100;
const MIME_JSON = 'application/json';
 
private $parametres = array();
private $ressources = array();
private $bdd = null;
 
public function __construct(Bdd $bdd) {
$this->bdd = $bdd;
}
 
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->parametres = $parametres;
$this->ressources = $ressources;
 
$this->definirParametresParDefaut();
$this->verifierParametres();
 
$nomINSEEs = $this->trouverCommunesProches();
$corps = $this->formaterResultats($nomINSEEs);
 
$resultat = new ResultatService();
$resultat->mime = self::MIME_JSON;
$resultat->corps = $corps;
return $resultat;
}
 
private function definirParametresParDefaut() {
if (array_key_exists('nbre', $this->parametres) === false) {
$this->parametres['nbre'] = self::NBRE_COMMUNE_PAR_DEFAUT;
}
}
 
private function verifierParametres() {
extract($this->parametres);
$messages = array();
if (! array_key_exists('lat', $this->parametres)) {
$messages[] = "Vous devez indiquer une latitude en degré décimal à l'aide du paramètres d'url : lat";
} else if (!preg_match(self::PATTERN_LAT, $lat)) {
$messages[] = "La valeur de latitude doit être un nombre décimal positif dont le séparateur décimal est un point. Ex. : 44 ou 43.03";
} else if ($lat > self::LAT_MAX) {
$messages[] = "La valeur de latitude indiquée est supérieure à {self::LAT_MAX} qui est le point le plus au Nord de la France métropolitaine.";
} else if ($lat < self::LAT_MIN) {
$messages[] = "La valeur de latitude indiquée est infèrieure à {self::LAT_MIN} qui est le point le plus au Sud de la France métropolitaine.";
}
if (! array_key_exists('lon', $this->parametres)) {
$messages[] = "Vous devez indiquer une longitude en degré décimal à l'aide du paramètres d'url : lon";
} else if (!preg_match(self::PATTERN_LON, $lon)) {
$messages[] = "La valeur de longitude doit être un nombre décimal dont le séparateur décimal est un point. Ex. : -4.03 ou 3.256";
} else if ($lon > self::LON_MAX) {
$messages[] = "La valeur de longitude indiquée est supérieure à {self::LON_MAX} qui est le point le plus à l'Est de la France métropolitaine.";
} else if ($lon < self::LON_MIN) {
$messages[] = "La valeur de longitude indiquée est infèrieure à {self::LON_MIN} qui est le point le plus à l'Ouest de la France métropolitaine.";
}
if (array_key_exists('nbre', $this->parametres)) {
if (!preg_match('/^[0-9]+$/', $nbre)) {
$messages[] = "Le nombre de commune le plus proche à retourner doit être un entier positif. Ex. : 10";
} else if ($nbre > self::NBRE_COMMUNE_MAX) {
$messages[] = "Le nombre de commune le plus proche à retourner doit être un entier positif inférieur à 100. Ex. : 10";
}
}
 
if (count($messages) != 0) {
$message = implode('<br />', $messages);
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE;
throw new Exception($message, $code);
}
}
 
private function formaterResultats($nomINSEEs) {
$communes_trouvees = null;
if (isset($nomINSEEs) && !empty($nomINSEEs)) {
foreach ($nomINSEEs as $nomINSEE) {
$communes_trouvees[] = array('nom' => $nomINSEE['nom'], 'codeINSEE' => $nomINSEE['insee']);
}
if (!is_null($communes_trouvees)) {
if ($this->parametres['nbre'] == 1 && count($communes_trouvees) == 1) {
$communes_trouvees = $communes_trouvees[0];
}
} else {
$message = "Le service '".get_class($this)."' n'a trouvé aucune commune correspondant aux coordonnées : {$parametres['lat']}, {$parametres['lon']}.";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
}
} else {
$message = "Le service '".get_class($this)."' n'a trouvé aucune commune dont le centroïde correspond aux coordonnées : {$parametres['lat']}, {$parametres['lon']}.";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
}
return $communes_trouvees;
}
 
/**
* requête qui récupère les 20 communes les plus proches du point recherché
* La distance(AB = \sqrt{(x_B-x_A)^2 + (y_B-y_A)^2}) est calculée sans la racine
* (calcul en plus qui change pas le résultat).
*/
private function trouverCommunesProches() {
$lat = $this->parametres['lat'];
$lon = $this->parametres['lon'];
$requete = 'SELECT '.
" (({$lat} - X(centroide)) * ({$lat} - X(centroide)) + ({$lon} - Y(centroide)) * ({$lon} - Y(centroide))) AS distance, ".
"insee, nom ".
'FROM lion1906_communes_v2008 '.
'ORDER BY distance '.
"LIMIT {$this->parametres['nbre']} ";
$resultat = $this->bdd->recupererTous($requete);
return $resultat;
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/nva/NomsVernaculaires.php
New file
0,0 → 1,653
<?php
/**
* Description :
* Classe NomsVernaculaires.php fournit une liste de noms vernaculaires et leur liaison à la bdtxa
* Le but étant de fournir un ensemble minimal d'information comprenant :
* un identifiant (numérique ou alphanumérique sous forme de ChatMot si possible), un nom, une langue et
* une relation avec un taxon de la bdtxa.
* Si l'url finit par /noms-vernaculaires on retourne une liste de noms (seulement les 100 premières par défaut).
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /observations?param1=val1&param2=val2&...
*
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, masque.code, masque.nom, masque.region , recherche,
* distinct, retour.format, navigation.depart et navigation.limite.
*
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package framework-v3
* @author Delphine Cauquil <delphine@tela-botanica.org>
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-${year} Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
class NomsVernaculaires extends Commun {
protected $champ_infos = array(
'taxon' => array('service' => 'taxons', 'ressource' => 'nt:', 'projet' => 'bdtxa', 'nom' => 'nom_sci'));
 
protected $service = 'noms-vernaculaires';
 
/**
* Permet de stocker la requete formulée : /noms-vernaculaires | /noms-vernaculaires/#id |
* /noms-vernaculaires/#id/champ | /noms-vernaculaires/#id/relations
* Est remplit au cours de l'analyse des ressources (traiterRessources()), par défaut, a la valeur du service.
* Est utilisée principalement pr déterminer le format du tableau à retourner. */
protected $format_reponse = 'noms-vernaculaires';
 
/** Variables constituant les parametres de la requete SQL (champ, condition, limit) remplie
* selon ressources et paramètres */
protected $requete_champ = array(' * ');
protected $requete_condition = '';
protected $limite_requete = array(
'depart' => 0,
'limite' => 100
);
protected $champ_tri = 'code_langue';
protected $direction_tri = 'asc';
/**
* Indique les champs supplémentaires à retourner
* - conseil_emploi = conseil d'emploi du nom vernaculaire
* - genre = genre et nombre du nom
* - taxon = nom retenu associé à ce nom
*/
protected $champs_supp = array();
 
/**
* Precise la contenance plus ou moins précise du tableau à retourner :
* - min = les données présentes dans la table
* - max = les données de la table + les informations complémentaires (pour les identifiants et les codes)
* - oss = la liste des nom_sci (uniquement pour noms et taxons) */
protected $retour_format = 'max';
/** Valeur du paramètre de requete recherche :
* - stricte : le masque est passé tel quel à l'opérateur LIKE.
* - etendue : ajout automatique du signe % à la place des espaces et en fin de masque avec utilisation de LIKE.
* - floue : recherche tolérante vis-à-vis d'approximations ou d'erreurs (fautes d'orthographe par exemple) */
protected $recherche;
/** Permet de stocker le tableau de résultat (non encodé en json) */
protected $table_retour = array();
/** Stocke le nombre total de résultats de la requete principale. Est calculée lors de l'assemblage de la requete */
protected $total_resultat;
protected $config;
public function __construct($config) {
$this->config = is_null($config) ? Config::get('NomsVernaculaires') : $config;
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// créer une condition en fonction du paramétre
public function traiterParametres() {
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres)) {
 
if (isset($this->parametres['recherche']) && $this->parametres['recherche'] != '') {
$this->recherche = $this->parametres['recherche'];
}
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) {
switch ($param) {
case 'masque' :
$this->ajouterFiltreMasque('nom_vernaculaire', $valeur);
break;
case 'masque.nt' :
$this->ajouterFiltreMasque('num_taxon', $valeur);
break;
case 'masque.nv' :
$this->ajouterFiltreMasque('nom_vernaculaire', $valeur);
break;
case 'masque.lg' :
$this->ajouterFiltreMasque('code_langue', $valeur);
break;
case 'retour.format' :
$this->retour_format = $valeur;
break;
case 'navigation.depart' :
$this->limite_requete['depart'] = $valeur;
break;
case 'navigation.limite' :
$this->limite_requete['limite'] = $valeur;
break;
case 'retour.champs' :
$this->champs_supp = explode(',',$valeur);
break;
case 'recherche' :
break;
case 'version.projet' :
break;
default :
$p = 'Erreur dans les paramètres de recherche de votre requête : '.
'</br> Le paramètre " '.$param.' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $p);
}
}
}
}
 
public function ajouterFiltreMasque($nom_champ, $valeur) {
if ($nom_champ == 'num_taxon') { // si il s'agit d'un chiffre
$this->requete_condition[] = $nom_champ.' = '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
} else {
if ($this->recherche == 'floue') {
$this->requete_condition[] = '(SOUNDEX('.$nom_champ.') = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE('.$nom_champ.')) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\'))) ';
} else {
if ($this->recherche == 'etendue') {
$valeur = '%'.str_replace(' ','% ', $valeur);
$valeur .= '%';
}
$this->requete_condition[] = 'nva.'.$nom_champ.' LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
}
}
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// en fonction de la présence des ressources modifie requete_champ et requete_condition
public function traiterRessources() {
if (isset($this->ressources) && !empty($this->ressources)) {
if (isset($this->ressources[0]) && !empty($this->ressources[0])) {
$this->traiterRessourceId(); // ajoute condition id=#valeur
if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {
$this->traiterRessourceChamp(); //modifie requete_champ ou requete_condition
}
}
} else { //rajoute distinct pour ne pas avoir plusieurs fois le même nom
$this->requete_champ = array('distinct(nva.num_nom_vernaculaire)', 'nva.nom_vernaculaire ');
}
}
 
//requete : /noms-vernaculaires/#id (ex : /noms-vernaculaires/7)
public function traiterRessourceId() {
if (is_numeric($this->ressources[0])) {
$this->requete_condition[] = ' nva.num_nom_vernaculaire = '.$this->getBdd()->proteger($this->ressources[0]);
$this->format_reponse .= '/id';
} elseif ($this->ressources[0] == 'attributions') {
$this->format_reponse .= '/attributions';
} else {
$r = 'Erreur dans les ressources de votre requête : </br> La ressource " '.$this->ressources[0].
' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $r);
}
}
 
 
public function traiterRessourceChamp() {
$this->format_reponse .= '/champ';
$this->analyserChamp();
}
 
public function analyserChamp() {
$this->requete_champ = array();
$this->recupererTableConfig('champs_possibles');// s'il y a plusieurs champs correspondant au champ demandé ils sont séparé par des |
$champs = explode(' ', $this->ressources[1]);
foreach ($champs as $champ) {
preg_match('/^([^.]+)(\.([^.]+))?$/', $champ, $match);
if (isset($this->champs_possibles[$match[1]])) {
$this->requete_champ[] = str_replace('|', ', ', $this->champs_possibles[$match[1]]);
} elseif (isset($this->champs_possibles[$match[0]])) {
$this->requete_champ[] = str_replace('|', ', ', $this->champs_possibles[$match[0]]);
} else {
$champs_possibles = implode('</li><li>', array_keys($this->champs_possibles));
$c = 'Erreur dans votre requête : </br> Le champ "'.$champ_possibles.'" n\'existe pas. '.
'Les champs disponibles sont : <li>'.$champs_possibles.'</li> et leurs déclinaisons (ex. ".code").';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $c);
}
}
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
public function assemblerLaRequete() {
$requete = ' SELECT '.$this->formerRequeteChamp().
', CASE nva.code_langue WHEN "fra" THEN 1 ELSE 0 END AS tri '.
' FROM '.str_replace('nva', 'nva_index', $this->table).' inva'.
' LEFT JOIN '.$this->table.' nva ON nva.num_nom_vernaculaire = inva.num_nom_vernaculaire '
.$this->formerRequeteCondition().
' ORDER BY tri DESC, nva.nom_vernaculaire ASC '
.$this->formerRequeteLimite();
return $requete;
}
 
public function formerRequeteChamp() {
if (in_array('*', $this->requete_champ)) {
$champ = ' * ';
} else {
$champ = implode(', ', $this->requete_champ);
}
return $champ;
}
 
public function formerRequeteCondition() {
$condition = '';
if ($this->requete_condition != null) {
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
}
return $condition;
}
 
//ajout d'une limite seulement pour les listes (pas plus de 100 resultats retournés pr les requetes
// suivantes : /noms-vernaculaires et /noms-vernaculaires/#id/relations)
public function formerRequeteLimite() {
if (in_array($this->format_reponse , array($this->service.'/id', $this->service.'/id/champs'))) {
$this->requete_limite = '';
} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat())) {
$this->limite_requete['depart'] =
(($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']);
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
} else {
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
}
return $this->requete_limite;
}
 
//on récupère le nombre total de résultats de la requete (ex : le nombre d'id contenu dans la liste /noms-vernaculaires)
public function recupererTotalResultat() {
$distinct = ($this->format_reponse == 'noms-vernaculaires/attributions') ? '*' : 'distinct nva.num_nom_vernaculaire';
$requete = 'SELECT count('.$distinct.') as nombre FROM '
.str_replace('nva', 'nva_index', $this->table).' inva '
.'INNER JOIN '.$this->table.' nva ON nva.num_nom_vernaculaire = '
.'inva.num_nom_vernaculaire '
.$this->formerRequeteCondition();
 
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
 
if ($res) {
$total = $res['nombre'];
} else {
$t = 'Fonction recupererTotalResultat() : <br/>Données introuvables dans la base '.$requete;
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $t);
}
return $total;
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// determine en fct du service appelé (/noms-vernaculaires | /noms-vernaculaires/#id | /noms-vernaculaires/#id/champ |
// /noms-vernaculaires/#id/relations) le format du tableau à retourner.
public function retournerResultatFormate($resultat) {
$this->recupererTableConfig('correspondance_champs');
switch ($this->format_reponse) {
case 'noms-vernaculaires' :
$reponse = ($this->retour_format == 'oss') ? $this->formaterEnOss($resultat) : $this->formaterNomsVernaculaires($resultat); break;
case 'noms-vernaculaires/attributions' : $reponse = $this->formaterNomsVernaculairesAttributions($resultat); break;
case 'noms-vernaculaires/id' : $reponse = $this->formaterNomsVernaculairesId($resultat); break;
case 'noms-vernaculaires/id/champ' : $reponse = $this->formaterNomsVernaculairesIdChamp($resultat); break;
default : break;
}
return $reponse;
}
public function ajouterJsonEnTeteNV() {
$table_retour_json['masque'] = $this->recupererMasque();
$table_retour_json['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$table_retour_json['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$table_retour_json['total'] = $this->total_resultat;
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/noms-vernaculaires');
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') {
$table_retour_json['href.precedent'] = $url['precedent'];
}
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') {
$table_retour_json['href.suivant'] = $url['suivant'];
}
return $table_retour_json;
}
public function ajouterJsonResultatNV($resultat) {
foreach ($resultat as $tab) {
foreach ($tab as $key => $valeur) {
if ($valeur != '') {
switch ($key) {
case 'num_nom_vernaculaire' : $num = $valeur; break;
case 'nom_vernaculaire' : $this->table_retour['nom'] = $valeur; break;
default : break;
}
}
}
if ($this->retour_format == 'max') $this->table_retour['href'] = $this->ajouterHref('noms-vernaculaires', $num);
$resultat_json[$num] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
return $resultat_json;
}
 
public function formaterNomsVernaculaires($resultat) {
$table_retour_json['entete'] = $this->ajouterJsonEnTeteNV();
$resultat = $this->hierarchiserResultat($resultat);
$table_retour_json['resultat'] = $this->ajouterJsonResultatNV($resultat);
return $table_retour_json;
}
public function hierarchiserResultat($resultat) {
//tri recherche floue
if (isset($this->parametres['masque.nv'])) {
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres['masque.nv'], $resultat, 'nom_vernaculaire');
}
if (isset($this->parametres['masque'])) {
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres['masque'], $resultat, 'nom_vernaculaire');
}
return $resultat;
}
public function recupererMasque() {
$tab_masque = array();
foreach ($this->parametres as $param=>$valeur) {
if (strstr($param, 'masque') != false) {
$tab_masque[] = $param.'='.$valeur;
}
}
$masque = implode('&', $tab_masque);
return $masque;
}
public function formaterEnOss($resultat) {
$table_nom = array();
$oss = '';
foreach ($resultat as $tab) {
if (isset($tab['nom_vernaculaire']) ) {
if (!in_array($tab['nom_vernaculaire'], $table_nom)) {
$table_nom[] = $tab['nom_vernaculaire'];
$oss [] = $tab['nom_vernaculaire'];
}
}
}
$masque = $this->recupererMasque();
if($masque == "") {
$masque = "Pas de masque";
}
$table_retour_oss = array($masque, $oss);
return $table_retour_oss;
}
public function formaterNomsVernaculairesAttributions($resultat) {
$table_retour_json['entete']['masque'] = $this->recupererMasque();
$table_retour_json['entete']['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$table_retour_json['entete']['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$table_retour_json['entete']['total'] = $this->total_resultat;
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/noms-vernaculaires/attributions');
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') {
$table_retour_json['entete']['href.precedent'] = $url['precedent'];
}
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') {
$table_retour_json['entete']['href.suivant'] = $url['suivant'];
}
foreach ($resultat as &$tab) {
unset($tab['tri']);
$id_nom = $tab['num_nom_vernaculaire'];
$resultat_json[$id_nom]['id'] = $id_nom;
$resultat_json[$id_nom]['nom_vernaculaire'] = $tab['nom_vernaculaire'];
$resultat_json[$id_nom]['code_langue'] = $tab['code_langue'];
$resultat_json[$id_nom]['taxon.code'] = 'bdtxa.nt:'.$tab['num_taxon'];
if ($this->retour_format == 'max') {
$resultat_json[$id_nom]['num_taxon'] = $tab['num_taxon'];
$resultat_json[$id_nom]['nom_retenu.code'] = $tab['num_taxon'];
$resultat_json[$id_nom]['taxon'] = $tab['num_taxon'];
$this->taxons[] = $tab['num_taxon']; // utilisé pour chercher les noms latins plus bas
$resultat_json[$id_nom]['href'] = $this->ajouterHref('noms-vernaculaires', $id_nom);
if($this->champs_supp != array()) {
$resultat_json[$id_nom] = $this->ajouterChampsOntologieLigneResultat($tab);
}
}
}
if ($this->retour_format == 'max') {
// On est obligé de faire un deuxième boucle pour demander tous les taxons présents en une
// fois et les attribuer aux noms car c'est beaucoup plus rapide
$noms_sci = $this->recupererNomTaxons();
foreach ($resultat_json as $num_nom => &$tab) {
$tab = $this->ajouterTaxonsAttributionsLigneResultat($tab, $noms_sci);
if($tab == null) {
unset($resultat_json[$num_nom]);
}
}
}
$table_retour_json['resultat'] = $resultat_json;
return $table_retour_json;
}
/**
* Ajoute les champs d'ontologie supplémentaires si necéssaire
* en faisant appels aux web services associés
* @param array $ligne_resultat
*
* @return array la ligne modifiée
*/
public function ajouterChampsOntologieLigneResultat($ligne_resultat) {
$intitule = '';
foreach($this->champ_infos as $cle => $champs_supplementaires) {
if(in_array($cle, $this->champs_supp)) {
extract($champs_supplementaires);
$valeur_recherche = '';
switch($cle) {
case 'taxon':
$valeur_recherche = $ligne_resultat['num_taxon'];
$intitule = 'taxon.code';
break;
}
$code_valeur = '';
if(trim($valeur_recherche) != '') {
$url = $this->ajouterHrefAutreProjet($service, $ressource, $valeur_recherche, $projet);
$code_valeur = $this->chercherSignificationCode($url, $nom);
}
$ligne_resultat[$intitule] = $code_valeur;
}
}
return $ligne_resultat;
}
/**
* Fonction qui ajoute les attributions à une ligne de résultats
*
* @param array $ligne_tableau_resultat
* @param array $nom_sci
*/
public function ajouterTaxonsAttributionsLigneResultat(&$ligne_tableau_resultat, &$noms_sci) {
if (isset($noms_sci[$ligne_tableau_resultat['num_taxon']])) {
$ligne_tableau_resultat['nom_retenu.code'] = $noms_sci[$ligne_tableau_resultat['num_taxon']]['id'];
$ligne_tableau_resultat['taxon'] = $noms_sci[$ligne_tableau_resultat['num_taxon']]['nom_sci'];
} else {
$ligne_tableau_resultat = null;
}
return $ligne_tableau_resultat;
}
private function trierLigneTableau($a, $b) {
$retour = 0;
if ($a[$this->champ_tri] == $b[$this->champ_tri]) {
$retour = 0;
}
if($this->champ_tri == 'code_langue') {
if ($a[$this->champ_tri] == 'fra' && $b[$this->champ_tri] != 'fra') {
$retour = ($this->direction_tri == 'asc') ? -1 : 1;
} else if ($a[$this->champ_tri] != 'fra' && $b[$this->champ_tri] == 'fra') {
$retour = ($this->direction_tri == 'asc') ? 1 : -1;
} else {
$retour = $this->comparerChaineSelonDirectionTri($a[$this->champ_tri], $b[$this->champ_tri]);
}
} else {
$retour = $this->comparerChaineSelonDirectionTri($a[$this->champ_tri], $b[$this->champ_tri]);
}
return $retour;
}
private function comparerChaineSelonDirectionTri($a, $b) {
if($this->direction_tri == 'asc') {
return ($a < $b) ? -1 : 1;
} else {
return ($a > $b) ? -1 : 1;
}
}
// formatage de la reponse /id ss la forme
// id, nom_vernaculaire, attributions
// langue
// num_nom (correspond à un taxon bdtxa)
public function formaterNomsVernaculairesId($resultat) {
foreach ($resultat as $taxon) { // pour chaque attribution à un taxon bdtxa
// on crée les variables qui serviront de clés et on les enléves du tableau
$num_nom = $taxon['num_nom_vernaculaire']; // unique pour un trinôme id, langue, taxon
unset($taxon['num_nom_vernaculaire']);
$langue = $taxon['code_langue'];
unset($taxon['code_langue']);
 
foreach ($this->correspondance_champs as $key => $correspondance) { // ordonne les infos pour affichage
if (isset($taxon[$key]) && $taxon[$key] != "") {
$this->afficherDonnees($correspondance, $taxon[$key], $langue, $num_nom);
}
}
foreach ($taxon as $key => $valeur) { // rajoute les champs non prévus dans l'api
if (!isset($this->correspondance_champs[$key]) && $valeur != "") {
$this->afficherDonnees($key, $valeur, $langue, $num_nom);
}
}
}
if ($this->retour_format == 'max') $this->afficherTaxons(); // va chercher les noms de tous les taxons
unset($this->table_retour['href']);
return $this->table_retour;
}
 
public function afficherDonnees($champ, $valeur, $langue = '', $num_nom = '') {
if ($champ == 'num_nom_vernaculaire' || $champ == 'nom_vernaculaire') {
$this->table_retour[$champ] = $valeur;
} elseif (preg_match('/^(.*)\.code$/', $champ, $match)) {
switch ($match[1]) {
case 'taxon' : if ($this->retour_format == 'max') {$this->taxons[$num_nom] = $valeur;}
$this->afficherPointCode($match[1], $langue, $num_nom, $valeur); break;
case 'langue' : //$this->afficherPointCode($match[1], 'iso-639-3', 'langues', $valeur);
break;
default : break;
}
 
} elseif ($langue != '') {
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ] = $valeur;
} else {
$this->table_retour[$champ] = $valeur;
}
}
 
public function afficherPointCode($nomChamp, $langue, $num_nom, $valeur) {
if (isset($this->champ_infos[$nomChamp])) {
extract($this->champ_infos[$nomChamp]);
}
 
if ($this->retour_format == 'max') {
$url = $this->ajouterHrefAutreProjet($service, $ressource, $valeur, $projet);
if ($service == 'taxons') {
$code_valeur = '';
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom]['nom_retenu.code'] = $code_valeur;
} else {
$code_valeur = $this->chercherSignificationCode($url, $nom);
}
if ($projet != '') $projet .= '.';
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$nomChamp] = $code_valeur;
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$nomChamp.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur;
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$nomChamp.'.href'] = $url;
} else {
if ($projet != '') $projet .= '.';
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$nomChamp.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur;
}
}
 
public function chercherSignificationCode($url, $nom) {
if (isset($this->signification_code[$url])) {
$valeur = $this->signification_code[$url];
} else {
$res = $this->consulterHref($url);
$valeur = $res->$nom;
$this->signification_code[$url] = $valeur;
}
return $valeur;
}
 
public function afficherTaxons() {
$resultat = $this->recupererNomTaxons();
foreach ($this->table_retour['attributions'] as $code_langue=>$langue) {
foreach ($langue as $num_nom=>$taxon) {
$num_tax = ltrim($taxon['taxon.code'], 'bdtxa.nt:');
if (isset($resultat[$num_tax])) {
$this->table_retour['attributions'][$code_langue][$num_nom]['nom_retenu.code'] = $resultat[$num_tax]['id'];
$this->table_retour['attributions'][$code_langue][$num_nom]['taxon'] = $resultat[$num_tax]['nom_sci'];
}
}
}
}
public function recupererNomTaxons() {
$taxons = array_unique($this->taxons);
$url = Config::get('url_service_base').'bdtxa/taxons?navigation.limite=500&ns.structure=au&masque.nt='.implode(',', $taxons);
$res = $this->consulterHref($url);
foreach ($res->resultat as $id=>$taxon) {
$resultat[$taxon->num_taxonomique]['id'] = 'bdtxa.nn:'.$id;
$resultat[$taxon->num_taxonomique]['nom_sci'] = $taxon->nom_sci_complet;
}
return $resultat;
}
 
public function formaterNomsVernaculairesIdChamp($resultat) {
$this->table_retour['id'] = $this->ressources[0];
$champs = explode(' ', $this->ressources[1]);
if (in_array('attributions', $champs) != false) {
$this->formaterNomsVernaculairesId($resultat);
unset($this->table_retour['nom_vernaculaire']);
} else {
$champ_attributions = array('num_taxon', 'zone_usage', 'num_statut', 'num_genre', 'notes');
foreach ($resultat as $taxon) {
foreach ($taxon as $key=>$valeur) {
if ($key == 'code_langue' && in_array('langue', $champs) != false) {
$this->table_retour['attributions']['langue'][] = $valeur;
} elseif (in_array($key, $champ_attributions) != false) {
$this->afficherPoint($this->correspondance_champs[$key] , $valeur, $taxon['code_langue'], $taxon['num_nom_vernaculaire']);
} elseif (in_array($key, $champs) != false) {
$this->table_retour[$key] = $valeur;
}
}
if (in_array('biblio', $champs) != false) $this->chargerBiblio($taxon['num_nom_vernaculaire'], $taxon['code_langue']);
}
if (in_array('biblio', $champs) != false && array_search('biblio.num_ref', $this->table_retour) != false) $this->table_retour['biblio'] = null;
}
return $this->table_retour;
}
 
public function afficherPoint($champ, $valeur, $langue, $num_nom) {
preg_match('/^(.*)\.code$/', $champ, $match);
$champ = $match[1];
if (isset($this->champ_infos[$champ])) {
extract($this->champ_infos[$champ]);
$url = $this->ajouterHrefAutreProjet($service, $ressource, $valeur, $projet);
$projet .= '.';
}
 
$champs = explode(' ', $this->ressources[1]);
if (in_array($champ.'.*', $champs) !== false && isset($projet)) {
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur;
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ.'.href'] = $url;
}
if (in_array($champ.'.code', $champs) !== false && isset($projet)) {
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur;
}
if (in_array($champ.'.href', $champs) !== false && isset($projet)) {
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ.'.href'] = $url;
}
if (in_array($champ, $champs) !== false) {
if (isset($url)) {
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ] = $this->chercherSignificationCode($url, $nom);
} else {
$this->table_retour['attributions'][$langue][$champ] = $valeur;
}
}
}
 
public function afficherLangue($nomChamp, $projet, $service, $valeur, $ressource = '', $nom = 'nom') {
if ($this->retour_format == 'max') {
$this->table_retour['attributions'][$nomChamp] = $nom;
$this->table_retour['attributions'][$nomChamp.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur;
$this->table_retour['attributions'][$nomChamp.'.href'] = $url;
} else {
$this->table_retour['attributions'][$nomChamp.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur;
}
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/nvps/NomsVernaculaires.php
New file
0,0 → 1,652
<?php
/**
* Description :
* Classe NomsVernaculaires.php fournit une liste de noms vernaculaires et leur liaison à la bdtfx
* Le but étant de fournir un ensemble minimal d'information comprenant :
* un identifiant (numérique ou alphanumérique sous forme de ChatMot si possible), un nom, une langue et
* une relation avec un taxon de la bdtfx.
* Si l'url finit par /noms-vernaculaires on retourne une liste de noms (seulement les 100 premières par défaut).
* L'url peut contenir des paramètres optionnels passés après le ? : /observations?param1=val1&param2=val2&...
*
* Les paramètres de requête disponibles sont : masque, masque.code, masque.nom, masque.region , recherche,
* distinct, retour.format, navigation.depart et navigation.limite.
*
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package framework-v3
* @author Delphine Cauquil <delphine@tela-botanica.org>
* @author Jennifer Dhé <jennifer.dhe@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-${year} Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
class NomsVernaculaires extends Commun {
protected $champ_infos = array(
'taxon' => array('service' => 'taxons', 'ressource' => 'nt:', 'projet' => 'bdtfx', 'nom' => 'nom_sci'));
 
protected $service = 'noms-vernaculaires';
 
/**
* Permet de stocker la requete formulée : /noms-vernaculaires | /noms-vernaculaires/#id |
* /noms-vernaculaires/#id/champ | /noms-vernaculaires/#id/relations
* Est remplit au cours de l'analyse des ressources (traiterRessources()), par défaut, a la valeur du service.
* Est utilisée principalement pr déterminer le format du tableau à retourner. */
protected $format_reponse = 'noms-vernaculaires';
 
/** Variables constituant les parametres de la requete SQL (champ, condition, limit) remplie
* selon ressources et paramètres */
protected $requete_champ = array(' * ');
protected $requete_condition = '';
protected $limite_requete = array(
'depart' => 0,
'limite' => 100
);
protected $champ_tri = 'code_langue';
protected $direction_tri = 'asc';
/**
* Indique les champs supplémentaires à retourner
* - conseil_emploi = conseil d'emploi du nom vernaculaire
* - genre = genre et nombre du nom
* - taxon = nom retenu associé à ce nom
*/
protected $champs_supp = array();
 
/**
* Precise la contenance plus ou moins précise du tableau à retourner :
* - min = les données présentes dans la table
* - max = les données de la table + les informations complémentaires (pour les identifiants et les codes)
* - oss = la liste des nom_sci (uniquement pour noms et taxons) */
protected $retour_format = 'max';
/** Valeur du paramètre de requete recherche :
* - stricte : le masque est passé tel quel à l'opérateur LIKE.
* - etendue : ajout automatique du signe % à la place des espaces et en fin de masque avec utilisation de LIKE.
* - floue : recherche tolérante vis-à-vis d'approximations ou d'erreurs (fautes d'orthographe par exemple) */
protected $recherche;
/** Permet de stocker le tableau de résultat (non encodé en json) */
protected $table_retour = array();
/** Stocke le nombre total de résultats de la requete principale. Est calculée lors de l'assemblage de la requete */
protected $total_resultat;
protected $config;
public function __construct($config) {
$this->config = is_null($config) ? Config::get('NomsVernaculaires') : $config;
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// créer une condition en fonction du paramétre
public function traiterParametres() {
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres)) {
 
if (isset($this->parametres['recherche']) && $this->parametres['recherche'] != '') {
$this->recherche = $this->parametres['recherche'];
}
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) {
switch ($param) {
case 'masque' :
$this->ajouterFiltreMasque('nom_vernaculaire', $valeur);
break;
case 'masque.nt' :
$this->ajouterFiltreMasque('num_taxon', $valeur);
break;
case 'masque.nv' :
$this->ajouterFiltreMasque('nom_vernaculaire', $valeur);
break;
case 'masque.lg' :
$this->ajouterFiltreMasque('code_langue', $valeur);
break;
case 'masque.cce' :
$this->ajouterFiltreMasque('num_statut', $valeur);
break;
case 'retour.format' :
$this->retour_format = $valeur;
break;
case 'navigation.depart' :
$this->limite_requete['depart'] = $valeur;
break;
case 'navigation.limite' :
$this->limite_requete['limite'] = $valeur;
break;
case 'retour.champs' :
$this->champs_supp = explode(',',$valeur);
break;
case 'recherche' :
break;
case 'version.projet' :
break;
default :
$p = 'Erreur dans les paramètres de recherche de votre requête : '.
'</br> Le paramètre " '.$param.' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $p);
}
}
}
}
 
public function ajouterFiltreMasque($nom_champ, $valeur) {
if ($nom_champ == 'num_taxon') { // si il s'agit d'un chiffre
$this->requete_condition[] = $nom_champ.' = '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
} else {
if ($this->recherche == 'floue') {
$this->requete_condition[] = '(SOUNDEX('.$nom_champ.') = SOUNDEX(\''.$valeur.'\')'
.' OR SOUNDEX(REVERSE('.$nom_champ.')) = SOUNDEX(REVERSE(\''.$valeur.'\'))) ';
} else {
if ($this->recherche == 'etendue') {
$valeur = '%'.str_replace(' ','% ', $valeur);
$valeur .= '%';
}
$this->requete_condition[] = $nom_champ.' LIKE '.$this->getBdd()->proteger($valeur);
}
}
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// en fonction de la présence des ressources modifie requete_champ et requete_condition
public function traiterRessources() {
if (isset($this->ressources) && !empty($this->ressources)) {
if (isset($this->ressources[0]) && !empty($this->ressources[0])) {
$this->traiterRessourceId(); // ajoute condition id=#valeur
if (isset($this->ressources[1]) && !empty($this->ressources[1])) {
$this->traiterRessourceChamp(); //modifie requete_champ ou requete_condition
}
}
} else { //rajoute distinct pour ne pas avoir plusieurs fois le même nom
$this->requete_champ = array('distinct(id)', 'nom_vernaculaire ');
}
}
 
//requete : /noms-vernaculaires/#id (ex : /noms-vernaculaires/7)
public function traiterRessourceId() {
if (is_numeric($this->ressources[0])) {
$this->requete_condition[] = ' id = '.$this->getBdd()->proteger($this->ressources[0]);
$this->format_reponse .= '/id';
} elseif ($this->ressources[0] == 'attributions') {
$this->format_reponse .= '/attributions';
} else {
$r = 'Erreur dans les ressources de votre requête : </br> La ressource " '.$this->ressources[0].
' " n\'existe pas.';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $r);
}
}
 
 
public function traiterRessourceChamp() {
$this->format_reponse .= '/champ';
$this->analyserChamp();
}
 
public function analyserChamp() {
$this->requete_champ = array();
$this->recupererTableConfig('champs_possibles');// s'il y a plusieurs champs correspondant au champ demandé ils sont séparé par des |
$champs = explode(' ', $this->ressources[1]);
foreach ($champs as $champ) {
preg_match('/^([^.]+)(\.([^.]+))?$/', $champ, $match);
if (isset($this->champs_possibles[$match[1]])) {
$this->requete_champ[] = str_replace('|', ', ', $this->champs_possibles[$match[1]]);
} elseif (isset($this->champs_possibles[$match[0]])) {
$this->requete_champ[] = str_replace('|', ', ', $this->champs_possibles[$match[0]]);
} else {
$champs_possibles = implode('</li><li>', array_keys($this->champs_possibles));
$c = 'Erreur dans votre requête : </br> Le champ "'.$champ_possibles.'" n\'existe pas. '.
'Les champs disponibles sont : <li>'.$champs_possibles.'</li> et leurs déclinaisons (ex. ".code").';
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $c);
}
}
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
public function assemblerLaRequete() {
$requete = ' SELECT '.$this->formerRequeteChamp().
' FROM '.$this->table
.$this->formerRequeteCondition()
.$this->formerRequeteLimite();
return $requete;
}
 
public function formerRequeteChamp() {
if (in_array('*', $this->requete_champ)) {
$champ = ' * ';
} else {
$champ = implode(', ', $this->requete_champ);
}
return $champ;
}
 
public function formerRequeteCondition() {
$condition = '';
if ($this->requete_condition != null) {
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
}
return $condition;
}
 
//ajout d'une limite seulement pour les listes (pas plus de 100 resultats retournés pr les requetes
// suivantes : /noms-vernaculaires et /noms-vernaculaires/#id/relations)
public function formerRequeteLimite() {
if (in_array($this->format_reponse , array($this->service.'/id', $this->service.'/id/champs'))) {
$this->requete_limite = '';
} elseif (($depart = $this->limite_requete['depart']) > ($this->total_resultat = $this->recupererTotalResultat())) {
$this->limite_requete['depart'] =
(($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']) < 0) ? 0 : ($this->total_resultat - $this->limite_requete['limite']);
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
} else {
$this->requete_limite = ' LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', '.$this->limite_requete['limite'];
}
return $this->requete_limite;
}
 
//on récupère le nombre total de résultats de la requete (ex : le nombre d'id contenu dans la liste /noms-vernaculaires)
public function recupererTotalResultat() {
$distinct = ($this->format_reponse == 'noms-vernaculaires/attributions') ? 'id' : 'distinct(id)';
$requete = 'SELECT count('.$distinct.') as nombre FROM '
.$this->table
.$this->formerRequeteCondition();
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete);
 
if ($res) {
$total = $res['nombre'];
} else {
$t = 'Fonction recupererTotalResultat() : <br/>Données introuvables dans la base '.$requete;
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $t);
}
return $total;
}
 
//+------------------------------------------------------------------------------------------------------+
// determine en fct du service appelé (/noms-vernaculaires | /noms-vernaculaires/#id | /noms-vernaculaires/#id/champ |
// /noms-vernaculaires/#id/relations) le format du tableau à retourner.
public function retournerResultatFormate($resultat) {
$this->recupererTableConfig('correspondance_champs');
switch ($this->format_reponse) {
case 'noms-vernaculaires' :
$reponse = ($this->retour_format == 'oss') ? $this->formaterEnOss($resultat) : $this->formaterNomsVernaculaires($resultat); break;
case 'noms-vernaculaires/attributions' : $reponse = $this->formaterNomsVernaculairesAttributions($resultat); break;
case 'noms-vernaculaires/id' : $reponse = $this->formaterNomsVernaculairesId($resultat); break;
case 'noms-vernaculaires/id/champ' : $reponse = $this->formaterNomsVernaculairesIdChamp($resultat); break;
default : break;
}
return $reponse;
}
public function ajouterJsonEnTeteNV() {
$table_retour_json['masque'] = $this->recupererMasque();
$table_retour_json['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$table_retour_json['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$table_retour_json['total'] = $this->total_resultat;
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/noms-vernaculaires');
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') {
$table_retour_json['href.precedent'] = $url['precedent'];
}
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') {
$table_retour_json['href.suivant'] = $url['suivant'];
}
return $table_retour_json;
}
public function ajouterJsonResultatNV($resultat) {
foreach ($resultat as $tab) {
foreach ($tab as $key => $valeur) {
if ($valeur != '') {
switch ($key) {
case 'id' : $num = $valeur; break;
case 'nom_vernaculaire' : $this->table_retour['nom'] = $valeur; break;
default : break;
}
}
}
if ($this->retour_format == 'max') $this->table_retour['href'] = $this->ajouterHref('noms-vernaculaires', $num);
$resultat_json[$num] = $this->table_retour;
$this->table_retour = array();
}
return $resultat_json;
}
 
public function formaterNomsVernaculaires($resultat) {
$table_retour_json['entete'] = $this->ajouterJsonEnTeteNV();
$resultat = $this->hierarchiserResultat($resultat);
$table_retour_json['resultat'] = $this->ajouterJsonResultatNV($resultat);
return $table_retour_json;
}
public function hierarchiserResultat($resultat) {
//tri recherche floue
if (isset($this->parametres['masque.nv'])) {
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres['masque.nv'], $resultat, 'nom_vernaculaire');
}
if (isset($this->parametres['masque'])) {
$resultat = $this->trierRechercheFloue($this->parametres['masque'], $resultat, 'nom_vernaculaire');
}
return $resultat;
}
public function recupererMasque() {
$tab_masque = array();
foreach ($this->parametres as $param=>$valeur) {
if (strstr($param, 'masque') != false) {
$tab_masque[] = $param.'='.$valeur;
}
}
$masque = implode('&', $tab_masque);
return $masque;
}
public function formaterEnOss($resultat) {
$table_nom = array();
$oss = '';
foreach ($resultat as $tab) {
if (isset($tab['nom_vernaculaire']) ) {
if (!in_array($tab['nom_vernaculaire'], $table_nom)) {
$table_nom[] = $tab['nom_vernaculaire'];
$oss [] = $tab['nom_vernaculaire'];
}
}
}
if (isset($this->masque)) $masque = implode('&', $this->masque);
else $masque = 'Pas de masque';
$table_retour_oss = array($masque, $oss);
return $table_retour_oss;
}
public function formaterNomsVernaculairesAttributions($resultat) {
//on remplie la table $table_retour_json['entete']
$table_retour_json['entete']['masque'] = $this->recupererMasque();
$table_retour_json['entete']['depart'] = $this->limite_requete['depart'];
$table_retour_json['entete']['limite'] = $this->limite_requete['limite'];
$table_retour_json['entete']['total'] = $this->total_resultat;
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/noms-vernaculaires/attributions');
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') {
$table_retour_json['entete']['href.precedent'] = $url['precedent'];
}
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') {
$table_retour_json['entete']['href.suivant'] = $url['suivant'];
}
foreach ($resultat as &$tab) {
$resultat_json[$tab['id']]['id'] = $tab['id'];
$resultat_json[$tab['id']]['nom_vernaculaire'] = $tab['nom_vernaculaire'];
$resultat_json[$tab['id']]['code_langue'] = $tab['code_langue'];
$resultat_json[$tab['id']]['taxon.code'] = 'bdtfx.nt:'.$tab['num_taxon'];
if ($this->retour_format == 'max') {
$resultat_json[$tab['id']]['num_taxon'] = $tab['num_taxon'];
$resultat_json[$tab['id']]['nom_retenu.code'] = $tab['num_taxon'];
$resultat_json[$tab['id']]['taxon'] = $tab['num_taxon'];
$this->taxons[] = $tab['num_taxon']; // utilisé pour chercher les noms latins plus bas
$resultat_json[$tab['id']]['href'] = $this->ajouterHref('noms-vernaculaires', $tab['id']);
if($this->champs_supp != array()) {
$resultat_json[$tab['id']] = $this->ajouterChampsOntologieLigneResultat($tab);
}
}
}
if ($this->retour_format == 'max') {
// On est obligé de faire un deuxième boucle pour demander tous les taxons présents en une
// fois et les attribuer aux noms car c'est beaucoup plus rapide
$noms_sci = $this->recupererNomTaxons();
foreach ($resultat_json as $num_nom => &$tab) {
$tab = $this->ajouterTaxonsAttributionsLigneResultat($tab, $noms_sci);
if($tab == null) {
unset($resultat_json[$num_nom]);
}
}
}
uasort($resultat_json, array($this,'trierLigneTableau'));
$table_retour_json['resultat'] = $resultat_json;
return $table_retour_json;
}
/**
* Ajoute les champs d'ontologie supplémentaires si necéssaire
* en faisant appels aux web services associés
* @param array $ligne_resultat
*
* @return array la ligne modifiée
*/
public function ajouterChampsOntologieLigneResultat($ligne_resultat) {
$intitule = '';
foreach($this->champ_infos as $cle => $champs_supplementaires) {
if(in_array($cle, $this->champs_supp)) {
extract($champs_supplementaires);
$valeur_recherche = '';
switch($cle) {
case 'taxon':
$valeur_recherche = $ligne_resultat['num_taxon'];
$intitule = 'taxon.code';
break;
}
$code_valeur = '';
if(trim($valeur_recherche) != '') {
$url = $this->ajouterHrefAutreProjet($service, $ressource, $valeur_recherche, $projet);
$code_valeur = $this->chercherSignificationCode($url, $nom);
}
$ligne_resultat[$intitule] = $code_valeur;
}
}
return $ligne_resultat;
}
/**
* Fonction qui ajoute les attributions à une ligne de résultats
*
* @param array $ligne_tableau_resultat
* @param array $nom_sci
*/
public function ajouterTaxonsAttributionsLigneResultat(&$ligne_tableau_resultat, &$noms_sci) {
if (isset($noms_sci[$ligne_tableau_resultat['num_taxon']])) {
$ligne_tableau_resultat['nom_retenu.code'] = $noms_sci[$ligne_tableau_resultat['num_taxon']]['id'];
$ligne_tableau_resultat['taxon'] = $noms_sci[$ligne_tableau_resultat['num_taxon']]['nom_sci'];
} else {
$ligne_tableau_resultat = null;
}
return $ligne_tableau_resultat;
}
private function trierLigneTableau($a, $b) {
$retour = 0;
if ($a[$this->champ_tri] == $b[$this->champ_tri]) {
$retour = 0;
}
if($this->champ_tri == 'code_langue') {
if ($a[$this->champ_tri] == 'fra' && $b[$this->champ_tri] != 'fra') {
$retour = ($this->direction_tri == 'asc') ? -1 : 1;
} else if ($a[$this->champ_tri] != 'fra' && $b[$this->champ_tri] == 'fra') {
$retour = ($this->direction_tri == 'asc') ? 1 : -1;
} else {
$retour = $this->comparerChaineSelonDirectionTri($a[$this->champ_tri], $b[$this->champ_tri]);
}
} else {
$retour = $this->comparerChaineSelonDirectionTri($a[$this->champ_tri], $b[$this->champ_tri]);
}
return $retour;
}
private function comparerChaineSelonDirectionTri($a, $b) {
if($this->direction_tri == 'asc') {
return ($a < $b) ? -1 : 1;
} else {
return ($a > $b) ? -1 : 1;
}
}
// formatage de la reponse /id ss la forme
// id, nom_vernaculaire, attributions
// langue
// num_nom (correspond à un taxon bdtfx)
public function formaterNomsVernaculairesId($resultat) {
foreach ($resultat as $taxon) { // pour chaque attribution à un taxon bdtfx
// on crée les variables qui serviront de clés et on les enléves du tableau
$num_nom = $taxon['id']; // unique pour un trinôme id, langue, taxon
$langue = $taxon['code_langue'];
unset($taxon['code_langue']);
 
foreach ($this->correspondance_champs as $key => $correspondance) { // ordonne les infos pour affichage
if (isset($taxon[$key]) && $taxon[$key] != "") {
$this->afficherDonnees($correspondance, $taxon[$key], $langue, $num_nom);
}
}
foreach ($taxon as $key => $valeur) { // rajoute les champs non prévus dans l'api
if (!isset($this->correspondance_champs[$key]) && $valeur != "") {
$this->afficherDonnees($key, $valeur, $langue, $num_nom);
}
}
}
if ($this->retour_format == 'max') $this->afficherTaxons(); // va chercher les noms de tous les taxons
unset($this->table_retour['href']);
return $this->table_retour;
}
 
public function afficherDonnees($champ, $valeur, $langue = '', $num_nom = '') {
if ($champ == 'id' || $champ == 'nom_vernaculaire') {
$this->table_retour[$champ] = $valeur;
} elseif (preg_match('/^(.*)\.code$/', $champ, $match)) {
switch ($match[1]) {
case 'taxon' : if ($this->retour_format == 'max') {$this->taxons[$num_nom] = $valeur;}
$this->afficherPointCode($match[1], $langue, $num_nom, $valeur); break;
case 'langue' : //$this->afficherPointCode($match[1], 'iso-639-3', 'langues', $valeur);
break;
default : break;
}
 
} elseif ($langue != '') {
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ] = $valeur;
} else {
$this->table_retour[$champ] = $valeur;
}
}
 
public function afficherPointCode($nomChamp, $langue, $num_nom, $valeur) {
if (isset($this->champ_infos[$nomChamp])) {
extract($this->champ_infos[$nomChamp]);
}
 
if ($this->retour_format == 'max') {
$url = $this->ajouterHrefAutreProjet($service, $ressource, $valeur, $projet);
if ($service == 'taxons') {
$code_valeur = '';
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom]['nom_retenu.code'] = $code_valeur;
} else {
$code_valeur = $this->chercherSignificationCode($url, $nom);
}
if ($projet != '') $projet .= '.';
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$nomChamp] = $code_valeur;
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$nomChamp.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur;
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$nomChamp.'.href'] = $url;
} else {
if ($projet != '') $projet .= '.';
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$nomChamp.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur;
}
}
 
public function chercherSignificationCode($url, $nom) {
if (isset($this->signification_code[$url])) {
$valeur = $this->signification_code[$url];
} else {
$res = $this->consulterHref($url);
$valeur = $res->$nom;
$this->signification_code[$url] = $valeur;
}
return $valeur;
}
 
public function afficherTaxons() {
$resultat = $this->recupererNomTaxons();
foreach ($this->table_retour['attributions'] as $code_langue=>$langue) {
foreach ($langue as $num_nom=>$taxon) {
$num_tax = ltrim($taxon['taxon.code'], 'bdtfx.nt:');
if (isset($resultat[$num_tax])) {
$this->table_retour['attributions'][$code_langue][$num_nom]['nom_retenu.code'] = $resultat[$num_tax]['id'];
$this->table_retour['attributions'][$code_langue][$num_nom]['taxon'] = $resultat[$num_tax]['nom_sci'];
}
}
}
}
public function recupererNomTaxons() {
$taxons = array_unique($this->taxons);
$url = Config::get('url_service_base').'bdtfx/taxons?navigation.limite=500&ns.structure=au&masque.nt='.implode(',', $taxons);
$res = $this->consulterHref($url);
foreach ($res->resultat as $id=>$taxon) {
$resultat[$taxon->num_taxonomique]['id'] = 'bdtfx.nn:'.$id;
$resultat[$taxon->num_taxonomique]['nom_sci'] = $taxon->nom_sci_complet;
}
return $resultat;
}
 
public function formaterNomsVernaculairesIdChamp($resultat) {
$this->table_retour['id'] = $this->ressources[0];
$champs = explode(' ', $this->ressources[1]);
if (in_array('attributions', $champs) != false) {
$this->formaterNomsVernaculairesId($resultat);
unset($this->table_retour['nom_vernaculaire']);
} else {
$champ_attributions = array('num_taxon', 'genre', 'notes');
foreach ($resultat as $taxon) {
foreach ($taxon as $key=>$valeur) {
if ($key == 'code_langue' && in_array('langue', $champs) != false) {
$this->table_retour['attributions']['langue'][] = $valeur;
} elseif (in_array($key, $champ_attributions) != false) {
$this->afficherPoint($this->correspondance_champs[$key] , $valeur, $taxon['code_langue'], $taxon['id']);
} elseif (in_array($key, $champs) != false) {
$this->table_retour[$key] = $valeur;
}
}
}
}
return $this->table_retour;
}
 
public function afficherPoint($champ, $valeur, $langue, $num_nom) {
preg_match('/^(.*)\.code$/', $champ, $match);
$champ = $match[1];
if (isset($this->champ_infos[$champ])) {
extract($this->champ_infos[$champ]);
$url = $this->ajouterHrefAutreProjet($service, $ressource, $valeur, $projet);
$projet .= '.';
}
 
$champs = explode(' ', $this->ressources[1]);
if (in_array($champ.'.*', $champs) !== false && isset($projet)) {
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur;
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ.'.href'] = $url;
}
if (in_array($champ.'.code', $champs) !== false && isset($projet)) {
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur;
}
if (in_array($champ.'.href', $champs) !== false && isset($projet)) {
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ.'.href'] = $url;
}
if (in_array($champ, $champs) !== false) {
if (isset($url)) {
$this->table_retour['attributions'][$langue][$num_nom][$champ] = $this->chercherSignificationCode($url, $nom);
} else {
$this->table_retour['attributions'][$langue][$champ] = $valeur;
}
}
}
 
public function afficherLangue($nomChamp, $projet, $service, $valeur, $ressource = '', $nom = 'nom') {
if ($this->retour_format == 'max') {
$this->table_retour['attributions'][$nomChamp] = $nom;
$this->table_retour['attributions'][$nomChamp.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur;
$this->table_retour['attributions'][$nomChamp.'.href'] = $url;
} else {
$this->table_retour['attributions'][$nomChamp.'.code'] = $projet.$ressource.$valeur;
}
}
 
 
}
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/baseflor/GraphiquesTaxonsSup.php
New file
0,0 → 1,146
<?php
/**
* Classe GraphiquesTaxonsSup.php transforme les données écologiques de la table baseflor_rang_sup_ecologie
* en graphique svg
* graphiques/#typegraphique/#bdnt.nn:#num_nomen --> renvoie un graphique avec les données connues
*
*
* @package eflore-projets
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
class GraphiquesTaxonsSup extends CommunGraphiques{
 
 
public function definirTable($version){
$this->table = Config::get('bdd_table_rang_sup')."_v".$version;
}
//+---- ressources ----+
public function traiterReferentieletNum(){
if (!empty($this->ressources[1])) {
if(preg_match('/^(.+)\.nn:([0-9]+)$/', $this->ressources[1], $retour) == 1){
switch ($retour[1]) {
case 'bdtfx' : // pour le moment un seul referentiel disponible
$this->requete_condition[]= "num_nomen = ".$retour[2]." AND bdnt = 'bdtfx' ";
break;
default :
$e = "Le référentiel {$retour[1]} n'existe pas.";
throw new Exception( $e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
break;
}
}else {
$e = "Erreur dans l'url de votre requête :".
" précisez le référentiel et le numéro nomenclatural sous la forme {bdnt}.nn:{nn}.";
throw new Exception( $e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
} else {
throw new Exception( "Erreur dans l'url de votre requête :".
" précisez le référentiel et le numéro nomenclatural sous la forme {bdnt}.nn:{nn}.",
RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
}
public function traiterTypeGraphique(){
if (!empty($this->ressources[0])) {
switch ($this->ressources[0]) {
case 'climat' :
$this->requete_champs = ' ve_lumiere_min, ve_lumiere_max, ve_temperature_min,'.
' ve_temperature_max, ve_continentalite_min,'.
' ve_continentalite_max, ve_humidite_atmos_min,'.
' ve_humidite_atmos_max' ;
$this->nomGraphique= 'climat_min_max';
break;
case 'sol' :
$this->requete_champs = ' ve_humidite_edaph_min , ve_humidite_edaph_max,'.
' ve_reaction_sol_min, ve_reaction_sol_max, '.
' ve_nutriments_sol_min, ve_nutriments_sol_max,'.
' ve_salinite_min, ve_salinite_max,'.
' ve_texture_sol_min, ve_texture_sol_max,'.
've_mat_org_sol_min,ve_mat_org_sol_max ' ;
$this->nomGraphique = 'sol_min_max';
break;
default :
$e = "Erreur dans l'url de votre requête :".
"</br> précisez le graphique -> \"sol\" ou \"climat\".";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
break;
}
}else {
throw new Exception("Erreur dans l'url de votre requête :".
"</br> precisez le graphique -> \"sol\" ou \"climat\".", RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
}
//+-------------------------- formatage du résultat -------------------------------------------+
public function changerValeursSVG(){
$this->ajouterValeursIntermediaires();
$Dompath = new DOMXPath($this->dom);
foreach ($this->valeurs_en_pourcentage as $cle => $val){
$val = preg_replace('/,/','.', $val);
$grad_id = array_search($val,$this->graduations_id);
$champs = preg_replace('/_min|_max|_[0-9]/','', $cle);
// dans le cas de mauvaises données, pour ne pas que tout le graphique
$case = $Dompath->query("//*[@id='".$grad_id."_".$champs."']")->item(0);
if($case != null) {
$case->setAttribute('fill','#EA6624');
$case->setAttribute('stroke','#EA6624');
$this->ajouterInfoAuSurvol($champs,$case);
}
$changement = true;
}
$this->ajusterFormatSVG();
}
public function ajouterValeursIntermediaires(){
$champs_ecolo = array_keys($this->champs_ontologiques);
foreach ($champs_ecolo as $chps ){
$min = !empty($this->valeurs_en_pourcentage[$chps.'_min']) ? $this->valeurs_en_pourcentage[$chps.'_min'] : -1;
$max = !empty($this->valeurs_en_pourcentage[$chps.'_max']) ? $this->valeurs_en_pourcentage[$chps.'_max'] : -1;
if ($min < ($max-0.1) ){
$i = $min + 0.1;
$num = 1;
for ($i ; $i < $max; $i += 0.1) {
$this->valeurs_en_pourcentage[$chps.'_'.$num] = $i;
$num++;
}
}
}
}
public function ajouterInfoAuSurvol($champs, $case){
$min = $this->valeurs_champs[$champs."_min"];
$max = $this->valeurs_champs[$champs."_max"];
if ($min != $max){
$valeurMin = $this->recupererOntologies($min, $champs );
$valeurMax = $this->recupererOntologies($max, $champs );
$valeurMin = $this->traiterIntermediaires($valeurMin->nom, $champs, $champs.'_min');
$valeurMax = $this->traiterIntermediaires($valeurMax->nom, $champs, $champs.'_max');
$case->setAttribute('title',"de $min: $valeurMin à $max: $valeurMax " );
} else {
$valeurMin = $this->recupererOntologies($min, $champs );
$valeurMin = $this->traiterIntermediaires($valeurMin->nom, $champs, $champs.'_min');
$case->setAttribute('title',"$min: $valeurMin" );
}
}
}
?>
/tags/v5.12-baouque/services/modules/0.1/baseflor/InformationsTaxonsSup.php
New file
0,0 → 1,274
<?php
 
/**
* Classe InformationsTaxonsSup.php permet de faire des requetes pour les rangs superieurs de baseflor
* du référentiel BDTFX et avec un numéro nomenclatural ( différent de 0 ).
* fin d'url possibles :
*
* /informations/#bdnt.nn:#num_nomen?champs=ecologie --> retourne champs ecologiques pour un BDNT et un num_nomen
*
*
* Encodage en entrée : utf8
* Encodage en sortie : utf8
* @package eflore-projets
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org>
* @author Delphine CAUQUIL <delphine@tela-botanica.org>
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org>
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt>
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt>
* @version 1.0
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org)
*/
 
class InformationsTaxonsSup extends Commun{
protected $table = "";
private $champs_ontologiques = array();
private $format_reponse = 'informations';
protected $serviceNom = 'informations';
private $retour_format = 'max';
private $Bdd;
private $requete_condition = "";
private $champs_recherches = '*';
public function consulter($ressources, $parametres) {
$this->ressources = $ressources;
$this->parametres = $parametres;
$this->traiterParametres();
$this->definirTables();
$this->traiterRessources();
$resultats = '';
foreach ($this->table_version as $version) {
$this->table = $version;
$requete = $this->assemblerLaRequete();
$resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete);
$versionResultat = $this->analyserResultat($resultat);
if (count($this->table_version) > 1) {
$resultats[$version] = $versionResultat;
} else {
$resultats = $versionResultat;
}
}
return $resultats;
}
public function analyserResultat($resultat) {
$versionResultat = null;
if ($resultat == '') {
$message = 'La requête SQL formée comporte une erreur!';
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE;
throw new Exception($message, $code);
} elseif ($resultat) {
$versionResultat = $this->retournerResultatFormate($resultat);
}
return $versionResultat;
}
public function __construct(Conteneur $Conteneur) {
$this->Bdd = $Conteneur->getBdd();
}
//+--------------------------traitement ressources ou paramètres -------------------------------------------+
public function traiterRessources() {
if(preg_match('/^(.+)\.nn:([0-9]+)$/', $this->ressources[0], $retour)==1){
switch ($retour[1]) {
case 'bdtfx' :
$this->requete_condition[] = "num_nomen = ".$retour[2]." AND bdnt = 'bdtfx' ";
break;
default :
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> Le référentiel " '
.$retour[1].' " n\'existe pas.';
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
break;
}
}
}
//+---- paramètres ----+
public function traiterParametres() {
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres) ) {
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) {
switch ($param) {
case 'categorie' :
if ($valeur == "ecologie"){
$this->champs_recherches = ' num_nomen, bdnt, ve_lumiere_min , ve_lumiere_max,'
.' ve_temperature_min, ve_temperature_max, ve_continentalite_min,'
.' ve_continentalite_max, ve_humidite_atmos_min, ve_humidite_atmos_max,'
.' ve_humidite_edaph_min, ve_humidite_edaph_max, ve_reaction_sol_min,'
.' ve_reaction_sol_max, ve_nutriments_sol_min, ve_nutriments_sol_max,'
.' ve_salinite_min, ve_salinite_max, ve_texture_sol_min,ve_texture_sol_max,'
.' ve_mat_org_sol_min, ve_mat_org_sol_max ';
} else {
$e = "Valeur de paramètre inconnue pour 'categorie'. Ce paramètre n'est pas autorisé pour informations/#id";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
break;
case 'retour.format' :
if ($valeur == 'min' || $valeur == 'max') {
$this->retour_format = $valeur;
break;
} else {
$e = "Valeur de paramètre inconnue pour 'retour.format'. Ce paramètre n'est pas autorisé pour informations/#id";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
case 'navigation.depart' :
$this->definirNavigationDepart($valeur);
break;
case 'navigation.limite' :
$this->definirNavigationLimite($valeur);
break;
case 'version.projet' :
$this->traiterVersion($valeur);
break;
default :
$e = 'Erreur dans les parametres de votre requête : </br> Le paramètre " '
.$param.' " n\'existe pas.';
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); break;
}
}
}
}
 
//+++------------------------------traitement des versions----------------------------------------++
public function traiterVersion($valeur) {
if (preg_match('/^[0-9]+(?:[._][0-9]+)*$/', $valeur) || $valeur == '*' || $valeur == '+') {
$this->version_projet = $valeur;
} else {
$e = "Erreur : La version est inconnue.";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
if ($this->version_projet == '*' && $this->ressources == array()) {
$message = "L'affichage de plusieurs versions ne fonctionne que pour les ressources de type /ressources/#id";
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE;
throw new Exception($message, $code);
}
}
 
public function definirTables() {
$table_num_version = $this->recupererVersionDisponible();
$prefixe_table = config::get('bdd_table_rang_sup');
if ( in_array($this->version_projet,$table_num_version) ) {
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.$this->version_projet;
} elseif ($this->version_projet == '+') {
$derniere_version = $table_num_version[count($table_num_version) - 1];
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.str_replace('.', '_', $derniere_version);
} elseif ($this->version_projet == '*') {
foreach ($table_num_version as $num_version) {
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.str_replace('.', '_', $num_version);
}
} else {
$e = "Erreur : La version est inconnue.";
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE);
}
}
//+--------------------------formatages de resultats -------------------------------------------+
public function retournerResultatFormate($resultat) {
$this->resultat_json = $resultat[0];
if ($this->retour_format == 'max') {
$graphique_presence = $this->traiterEcologie() ;
if ($graphique_presence) {
$this->ajouterLiensGraphique($graphique_presence);
}
}
return $this->resultat_json ;
}
public function traiterEcologie() {
$donnees_presence = false;
$this->champs_ontologiques = Commun::s_recupererTableauConfig('Paramètres.champs_ontologiques');
foreach ($this->champs_ontologiques as $cle => $valeur){
/* Les deux tests commentés ci-dessous étaient présents dans eflore-test (uniquement) jusqu'à juin 2013.
La valeur 0 pose question.
cf baseflor_v2012_12_31
cf services/modules/0.1/baseflor/CommunGraphiques.php traiterValeursEcologiques() */
if ($this->resultat_json[$cle.'_min'] != "") { // && $this->resultat_json[$cle.'_min'] != 0) {
$donnees_presence[$this->getNomGraphique($valeur)] = true;
$tab_ontologie = $this->recupererOntologies($this->resultat_json[$cle.'_min'], $cle.'_min');
unset($this->resultat_json[$cle.'_min']);
}
if ($this->resultat_json[$cle.'_max'] != "") { // && $this->resultat_json[$cle.'_max'] != 0) {
$this->recupererOntologies($this->resultat_json[$cle.'_max'], $cle.'_max');
unset($this->resultat_json[$cle.'_max']);
}
}
return $donnees_presence;
}
//donne le nom du graphique correspondant à un champ écologique
public function getNomGraphique($code_ecolo) {
$graphique = null;
if (in_array($code_ecolo, explode(',',Config::get('Paramètres.climat')))) {
$graphique = 'climat';
} elseif (in_array($code_ecolo, explode(',', Config::get('Paramètres.sol')) )) {
$graphique = 'sol';
}
return $graphique;
}
public function ajouterLiensGraphique($graphique_presence) {
if ($graphique_presence['climat']) {
$this->resultat_json['graphique_climat']['libelle'] = 'climat';
$this->resultat_json['graphique_climat']['href'] = $this->ajouterHref('graphiques/climat',
strtolower($this->resultat_json['bdnt']).'.nn:'.$this->resultat_json['num_nomen']);
}
if ($graphique_presence['sol']) {
$this->resultat_json['graphique_sol']['libelle'] = 'sol';
$this->resultat_json['graphique_sol']['href'] = $this->ajouterHref('graphiques/sol',
strtolower($this->resultat_json['bdnt']).'.nn:'.$this->resultat_json['num_nomen']);
}
}
//+--------------------------traitement ontologies -------------------------------------------+
public function recupererOntologies($valeur, $champs){
$chps_sans = preg_replace("/_min|_max/", '', $champs);
$url = Config::get('url_service_base').Config::get('nom_projet').
'/ontologies/'.$this->champs_ontologiques[$chps_sans].':'.urlencode(urlencode($valeur));
try {
$val = $this->getBdd()->recuperer(sprintf(
"SELECT a.nom FROM baseflor_ontologies a LEFT JOIN baseflor_ontologies b ON a.id = b.id LEFT JOIN baseflor_ontologies c ON b.classe_id = c.id WHERE".
" b.code = BINARY '%s' AND c.code = BINARY '%s' LIMIT 0, 100",
$valeur,
$this->champs_ontologiques[$chps_sans]),
Bdd::MODE_OBJET);
$this->resultat_json[$champs.'.libelle'] = $val->nom;
$this->resultat_json[$champs.'.code'] = $valeur;
$this->resultat_json[$champs.'.href'] = $url;
} catch (Exception $e) {
$this->resultat_json[$champs.'.libelle'] = '';
$this->resultat_json[$champs.'.code'] = '';
$this->resultat_json[$champs.'.href'] = '';
}
}
//+--------------------------FONCTIONS D'ASSEMBLAGE DE LA REQUETE-------------------------------------------+
public function assemblerLaRequete() {
$requete = ' SELECT '.$this->champs_recherches.' FROM '.$this->table.' '
.$this->retournerRequeteCondition();
return $requete;
}
public function retournerRequeteCondition() {
$condition = '';
if (empty($this->requete_condition) == false) {
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition);
}
return $condition;
}
}
?>