/tags/v0.1-20130829/services/modules/0.1/baseflor/GraphiquesBaseflor.php |
---|
New file |
0,0 → 1,121 |
<?php |
/** |
* Classe GraphiquesBaseflor.php transforme les données écologiques de la table baseflor |
* en graphique svg |
* graphiques/#typegraphique/#bdnt.nn:#num_nomen --> renvoie un graphique avec les données connues |
* |
* |
* @package eflore-projets |
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org> |
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org> |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt> |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt> |
* @version 1.0 |
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org) |
*/ |
class GraphiquesBaseflor extends CommunGraphiques{ |
public function definirTable($version){ |
$this->table = Config::get('bdd_table')."_v".$version; |
} |
//+--------------------------traitement ressources ou paramètres -------------------------------------------+ |
public function traiterReferentieletNum(){ |
if (!empty($this->ressources[1])) { |
if(preg_match('/^(.+)\.nn:([0-9]+)$/', $this->ressources[1], $retour) == 1){ |
switch ($retour[1]) { |
case 'bdtfx' : |
$this->requete_condition[]= "num_nomen = ".$retour[2]." AND bdnt = 'bdtfx' "; |
break; |
case 'bdafx' : |
$this->requete_condition[] = "num_nomen = ".$retour[2]." AND bdnt = 'bdafx' "; |
break; |
case 'bdbfx' : |
$this->requete_condition[] = "num_nomen = ".$retour[2]." AND bdnt = 'bdbfx' "; |
break; |
default : |
$e = "Le référentiel {$retour[1]} n'existe pas."; |
throw new Exception( $e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
break; |
} |
}else { |
$e = "Erreur dans l'url de votre requête :". |
" précisez le référentiel et le numéro nomenclatural sous la forme {bdnt}.nn:{nn}."; |
throw new Exception( $e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} else { |
throw new Exception( "Erreur dans l'url de votre requête :". |
" précisez le référentiel et le numéro nomenclatural sous la forme {bdnt}.nn:{nn}.", |
RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} |
public function traiterTypeGraphique(){ |
if (!empty($this->ressources[0])) { |
switch ($this->ressources[0]) { |
case 'climat' : |
$this->requete_champs = ' ve_lumiere , ve_temperature, ve_continentalite, ve_humidite_atmos' ; |
$this->nomGraphique= 'climat'; |
break; |
case 'sol' : |
$this->requete_champs = ' ve_humidite_edaph , ve_reaction_sol, ve_nutriments_sol, ve_salinite,' |
.'ve_texture_sol, ve_mat_org_sol' ; |
$this->nomGraphique = 'sol'; |
break; |
default : |
$e = "Erreur dans l'url de votre requête :". |
"</br> precisez le graphique -> \"sol\" ou \"climat\"."; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
break; |
} |
}else { |
throw new Exception("Erreur dans l'url de votre requête :". |
"</br> precisez le graphique -> \"sol\" ou \"climat\".", RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} |
//+-------------------------- formatage du résultat -------------------------------------------+ |
/// ++++ svg +++++ /// |
public function changerValeursSVG(){ |
$Dompath = new DOMXPath($this->dom); |
foreach ($this->valeurs_en_pourcentage as $cle => $val){ |
$val = preg_replace('/,/','.', $val); |
$grad_id = array_search($val,$this->graduations_id); |
$element = $Dompath->query("//*[@id='".$grad_id."']")->item(0); |
if($element != null) { |
$pos_x = $element->getAttribute('x1'); |
$curseur = $Dompath->query("//*[@id='".$cle."']")->item(0); |
$curseur->setAttribute('cx', $pos_x); |
$curseur->setAttribute('class', 'curseur'); |
$this->ajouterInfoAuSurvol($curseur); |
$changement = true; |
} |
} |
$this->ajusterFormatSVG(); |
} |
public function ajouterInfoAuSurvol($curseur){ |
$champs = $curseur->getAttribute('id'); |
$valeurTexte = $this->recupererOntologies($this->valeurs_champs[$champs], $champs ); |
$valeurTexte = $this->traiterIntermediaires($valeurTexte->nom, $champs, $champs); |
$curseur->setAttribute('title',$this->valeurs_champs[$champs].": ".$valeurTexte ); |
} |
} |
?> |
/tags/v0.1-20130829/services/modules/0.1/baseflor/InformationsBaseflor.php |
---|
New file |
0,0 → 1,531 |
<?php |
/** |
* Classe InformationsBaseflor.php permet de faire des requetes de baseflor en fonction d'un référentiel |
*( BDTFX, BDAFX, BDBFX ) et d'un numéro nomenclatural ( différent de 0 ). |
* fin d'url possibles : |
* /informations/#bdnt.nn:#num_nomen --> retourne tous les champs pour un BDNT et un num_nomen |
* /informations/#bdnt.nn:#num_nomen?champs=description --> retourne champs description pour un BDNT et un num_nomen |
* /informations/#bdnt.nn:#num_nomen?champs=ecologie --> retourne champs ecologiques pour un BDNT et un num_nomen |
* /informations/#bdnt.nn:#num_nomen/relations/catminat --> donne les num nomen et les bdnt pour tous |
* les taxons qui ont le même code catminat ( code milieu ) que celui entré |
* |
* Encodage en entrée : utf8 |
* Encodage en sortie : utf8 |
* @package eflore-projets |
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org> |
* @author Delphine CAUQUIL <delphine@tela-botanica.org> |
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org> |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt> |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt> |
* @version 1.0 |
* @copyright 1999-2012 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org) |
*/ |
class InformationsBaseflor extends Commun{ |
protected $table = ""; |
private $format_reponse = 'informations'; |
private $retour_format = 'max'; |
private $champs_ontologiques = array(); |
protected $serviceNom = 'informations'; |
private $Bdd; |
private $requete_condition = ""; |
private $champs_recherches = '*'; |
private $resultat_json; |
private $nb_ressources; |
protected $limite_requete = array( 'depart' => 0, 'limite' => 10); |
public function consulter($ressources, $parametres) { |
$this->ressources = $ressources; |
$this->parametres = $parametres; |
$this->nb_ressources = count($ressources); |
$this->traiterParametres(); |
$this->definirTables(); |
$this->traiterRessources(); |
$resultats = null; |
foreach ($this->table_version as $version) { |
$this->table = $version; |
$requete = $this->assemblerLaRequete(); |
$resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete); |
$versionResultat = $this->analyserResultat($resultat); |
if (count($this->table_version) > 1) { |
$resultats[$version] = $versionResultat; |
} else { |
$resultats = $versionResultat; |
} |
} |
return $resultats; |
} |
public function __construct(Conteneur $Conteneur) { |
$this->Bdd = $Conteneur->getBdd(); |
} |
public function analyserResultat($resultat) { |
$versionResultat = null; |
if ($resultat == '') { |
$message = 'La requête SQL formée comporte une erreur!'; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE; |
throw new Exception($message, $code); |
} elseif ($resultat) { |
$versionResultat = $this->retournerResultatFormate($resultat); |
} |
return $versionResultat; |
} |
//+--------------------------traitement ressources ou paramètres -------------------------------------------+ |
public function traiterParametres() { |
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres)) { |
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) { |
switch ($param) { |
case 'categorie' : |
if($this->nb_ressources != 1 ) { |
$e = "Nombre de ressource != 1 pour informations/#id/relations/catminat"; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
if ($valeur == "description") { |
$this->champs_recherches = "num_nomen, BDNT, chorologie, inflorescence," |
." sexualite, ordre_maturation, " |
."pollinisation, fruit, dissemination, couleur_fleur, macule, floraison, type_bio, " |
."form_vegetale "; |
$this->requete_condition[] = "( chorologie != '' OR inflorescence != '' ". |
"OR sexualite != '' OR ordre_maturation != '' OR pollinisation != '' ". |
"OR fruit != '' OR dissemination != '' OR couleur_fleur != '' OR macule != '' ". |
"OR floraison != '' OR type_bio != '' OR form_vegetale != '' )"; |
} elseif ($valeur == "ecologie") { |
$this->champs_recherches = " num_nomen, BDNT, ve_lumiere , ve_temperature," |
." ve_continentalite, ve_humidite_atmos, ve_humidite_edaph, ve_reaction_sol," |
." ve_nutriments_sol, ve_salinite, ve_texture_sol, ve_mat_org_sol, " |
." vi_lumiere, vi_temperature, vi_continentalite, vi_humidite_edaph," |
." vi_reaction_sol, vi_nutriments_sol, vi_salinite "; |
$this->requete_condition[] = "( ve_lumiere != '' OR ve_temperature != '' ". |
"OR ve_continentalite != '' OR ve_humidite_atmos != '' ". |
"OR ve_humidite_edaph != '' OR ve_reaction_sol != '' ". |
"OR ve_nutriments_sol != '' OR ve_salinite != '' ". |
"OR ve_texture_sol != '' OR ve_mat_org_sol != '' )"; |
} else { |
$e = "Valeur de paramètre inconnue pour 'categorie'. Ce paramètre n'est pas autorisé pour informations/#id/relations/catminat"; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
break; |
case 'retour.format' : |
if ($valeur == 'min' || $valeur == 'max' && $this->nb_ressources == 1) { |
$this->retour_format = $valeur; |
} else { |
$e = "Valeur de paramètre inconnue pour 'retour.format'. Ce paramètre n'est pas autorisé pour informations/#id/relations/catminat"; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
break; |
case 'navigation.depart' : |
$this->definirNavigationDepart($valeur); |
break; |
case 'navigation.limite' : |
$this->definirNavigationLimite($valeur); |
break; |
case 'version.projet' : |
$this->traiterVersion($valeur); |
break; |
default : |
$e = 'Erreur dans les parametres de votre requête : </br> Le paramètre " ' |
.$param.' " n\'existe pas.'; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
break; |
} |
} |
} |
} |
public function traiterRessources() { |
if(preg_match('/^(.+)\.nn:([0-9]+)$/', $this->ressources[0], $retour)){ |
$id = $retour[2]; |
$ref = $retour[1]; |
if ($ref == 'bdtfx' || $ref == 'bdafx' || $ref == 'bdbfx') { |
if($this->nb_ressources == 1) { |
$this->requete_condition[] = "num_nomen = ".$id." AND BDNT = '".strtoupper($ref)."' "; |
} else { |
$this->definirParametresRequeteRelations($ref, $id); |
} |
} else { |
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> Le référentiel " ' |
.$ref.' " n\'existe pas.'; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} else { |
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> La ressource demandée n\'existe pas.'; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} |
function definirParametresRequeteRelations($ref, $id){ |
if ($this->ressources[1] == 'relations'){ |
switch ($this->ressources[2]) { |
case 'catminat' : |
$this->requete_condition[] = "catminat_code = ( SELECT catminat_code from ".$this->table_version[0]." WHERE " |
." num_nomen = ".$id." AND BDNT = '".$ref. "' ) AND num_nomen != ".$id." "; |
$this->champs_recherches = " catminat_code, num_nomen, BDNT, idiotaxon "; |
break; |
default : |
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> Le type de relation " ' |
.$this->ressources[2].' " n\'existe pas.'; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
break; |
} |
} else { |
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> Le type de ressources " ' |
.$this->ressources[1].' " n\'existe pas.'; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} |
//+++------------------------------traitement des versions----------------------------------------++ |
public function traiterVersion($valeur) { |
if (preg_match('/^[0-9]+(?:[._][0-9]+)*$/', $valeur) || $valeur == '+') { |
$this->version_projet = $valeur; |
} elseif ($valeur == '*') { |
$this->version_projet = ($this->nb_ressources == 1) ? $valeur : '+' ; |
} else { |
$e = "Erreur : La version est inconnue."; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} |
public function definirTables() { |
$table_num_version = $this->recupererVersionDisponible(); |
$prefixe_table = config::get('bdd_table'); |
if ( in_array($this->version_projet,$table_num_version) ) { |
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.$this->version_projet; |
} elseif ($this->version_projet == '+') { |
$derniere_version = $table_num_version[count($table_num_version) - 1]; |
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.str_replace('.', '_', $derniere_version); |
} elseif ($this->version_projet == '*') { |
foreach ($table_num_version as $num_version) { |
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.str_replace('.', '_', $num_version); |
} |
} else { |
$e = "Erreur : La version est inconnue."; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} |
//+--------------------------formatages de resultats -------------------------------------------+ |
public function retournerResultatFormate($resultat) { |
$resultat_json = $resultat[0]; |
if ($this->retour_format == 'max'){ |
if ($this->nb_ressources == 1) { |
if ($this->parametres['categorie'] == 'ecologie') { |
$this->formaterResultatsChampsEcologie($resultat_json); |
} elseif ($this->parametres['categorie'] == 'description') { |
$this->formaterResultatsChampsDescription($resultat_json); |
}else { |
$this->formaterResultatsTousChamps($resultat_json); |
} |
} else { |
$this->formaterResultatsRelations($resultat); |
} |
} else { |
$this->resultat_json = $resultat_json; |
} |
return $this->resultat_json; |
} |
public function formaterResultatsRelations($resultat) { |
$this->resultat_json['entete'] = $this->ajouterEnteteResultat(); |
$resultat_json = array(); |
foreach ($resultat as $cle => $res){ |
$resultat_json[$cle] = $res ; |
$resultat_json[$cle]['href'] = $this->ajouterHref('informations',strtolower($res['BDNT']).".nn:".$res['num_nomen']); |
} |
$this->resultat_json['resultat'] = $resultat_json; |
} |
public function ajouterEnteteResultat() { |
$entete['depart'] = $this->limite_requete['depart']; |
$entete['limite'] = $this->limite_requete['limite']; |
$entete['total'] = $this->total_resultat; |
$entete['version'] = $this->version_projet; |
if ($this->limite_requete['limite'] != '*') { |
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/informations/'.$this->ressources[0].'/relations/catminat'); |
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') { |
$entete['href.precedent'] = $url['precedent']; |
} |
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') { |
$entete['href.suivant'] = $url['suivant']; |
} |
} |
return $entete; |
} |
public function formaterResultatsTousChamps($resultat) { |
$this->resultat_json = $resultat; |
$this->traiterTypeBio(); |
$graphique_presence = $this->traiterEcologie() ; |
if ($graphique_presence) { |
$graphique = $this->ajouterLiensGraphique($graphique_presence); |
} |
} |
public function formaterResultatsChampsEcologie($resultat) { |
$this->resultat_json = $resultat; |
$graphique_presence = $this->traiterEcologie() ; |
if ($graphique_presence) { |
$graphique = $this->ajouterLiensGraphique($graphique_presence); |
} |
} |
public function formaterResultatsChampsDescription($resultat) { |
$this->resultat_json = $resultat; |
$this->traiterTypeBio(); |
} |
//vérifie la présence de données écologiques pour les graphiques et récupère leur ontologie |
public function traiterEcologie() { |
$donnees_presence = false; |
$this->champs_ontologiques = $this->recupererTableauConfig('champs_ontologiques'); |
foreach ($this->champs_ontologiques as $cle => $valeur){ |
if ($this->resultat_json[$cle] != ""){ |
$donnees_presence[$this->getNomGraphique($valeur)] = true; |
$this->recupererOntologies($this->resultat_json[$cle], $cle); |
unset($this->resultat_json[$cle]); |
} |
} |
return $donnees_presence; |
} |
//donne le nom du graphique correspondant à un champ écologique |
public function getNomGraphique($code_ecolo) { |
$graphique = null; |
if (in_array($code_ecolo, explode(',',Config::get('Paramètres.climat')))) { |
$graphique = 'climat'; |
} elseif (in_array($code_ecolo, explode(',', Config::get('Paramètres.sol')) )) { |
$graphique = 'sol'; |
} |
return $graphique; |
} |
public function traiterTypeBio() { |
if ($this->resultat_json['type_bio'] != ""){ |
$tab_ontologie = $this->recupererOntologiePrTypeBio($this->resultat_json['type_bio']); |
unset($this->resultat_json['type_bio']); |
$this->resultat_json= array_merge($this->resultat_json,$tab_ontologie); |
} |
} |
public function ajouterLiensGraphique($graphique_presence) { |
if ($graphique_presence['climat']) { |
$this->resultat_json['graphique_climat']['libelle'] = 'climat'; |
$this->resultat_json['graphique_climat']['href'] = |
$this->ajouterHref('graphiques/climat', strtolower($this->resultat_json['BDNT']).'.nn:'.$this->resultat_json['num_nomen']); |
} |
if ($graphique_presence['sol']) { |
$this->resultat_json['graphique_sol']['libelle'] = 'sol'; |
$this->resultat_json['graphique_sol']['href'] = |
$this->ajouterHref('graphiques/sol', strtolower($this->resultat_json['BDNT']).'.nn:'.$this->resultat_json['num_nomen']); |
} |
} |
//+--------------------------traitement ontologies -------------------------------------------+ |
public function recupererOntologies($valeur, $champs){ |
$url = Config::get('url_service_base').Config::get('nom_projet'). |
'/ontologies/'.$this->champs_ontologiques[$champs].':'.urlencode(urlencode($valeur)); |
$val = $this->getBdd()->recuperer(sprintf( |
"SELECT a.nom FROM baseflor_ontologies a LEFT JOIN baseflor_ontologies b ON a.id = b.id LEFT JOIN baseflor_ontologies c ON b.classe_id = c.id WHERE". |
" b.code = BINARY '%s' AND c.code = BINARY '%s' LIMIT 0, 100", |
$valeur, |
$this->champs_ontologiques[$champs]), |
Bdd::MODE_OBJET); |
$this->resultat_json[$champs.'.libelle'] = isset($val->nom) ? $val->nom : NULL; // eg: VEMO:0 |
$this->resultat_json[$champs.'.code'] = $valeur; |
$this->resultat_json[$champs.'.href'] = $url; |
} |
//+-------------ontologie pour le champs type biologique (lire le .txt)---+ |
public function recupererOntologiePrTypeBio($type_a_traiter){ |
$resultat_typeBio = ""; |
if ($type_a_traiter != "") { |
$types_prim_sec = $this->separerTypesPrimairesSecondaires($type_a_traiter); |
$types_sstypes = $this->classerPrimSecEnTypesSsTypes($types_prim_sec); |
$resultat_typeBio = $this->formaterJsonTypeBio($types_sstypes, $type_a_traiter ); |
} |
return $resultat_typeBio; |
} |
public function classerPrimSecEnTypesSsTypes($types_prim_sec) { |
$types_sstypes = ''; |
foreach ($types_prim_sec as $cle => $tb) { |
$types_sstypes[$cle]= $this->separerTypes_SousTypes($tb, $cle); |
} |
switch (count($types_sstypes)) { |
case 1 : |
$types_sstypes = $types_sstypes['principal']; |
break; |
case 2 : |
$types_sstypes = array_merge($types_sstypes['principal'],$types_sstypes['secondaire']); |
break; |
} |
return $types_sstypes; |
} |
public function formaterJsonTypeBio( $types_sstypes, $type_a_traiter) { |
$resultat_typeBio['type_bio.code'] = $type_a_traiter; |
foreach ($types_sstypes as $cle => $tb) { |
if (($cle == 'type.principal') || ($cle == 'type.secondaire')) { |
$i = 0; |
foreach ($tb as $types) { |
$url = Config::get('url_service_base').Config::get('nom_projet'). |
'/ontologies/TB:'.urlencode(urlencode($types)); |
$val = $this->consulterHref($url); |
$libelle[$cle][$i]= $val->nom; |
$detail[$cle][$i]['libelle'] = $val->nom; |
$detail[$cle][$i]['code'] = $val->code; |
$detail[$cle][$i]['href'] = $url; |
$i++; |
} |
} |
if ($cle == 'sous_type.principal' || $cle == 'sous_type.secondaire' ) { |
$i = 0; |
foreach ($tb as $sstypes) { |
$url = Config::get('url_service_base').Config::get('nom_projet'). |
'/ontologies/ssTT:'.urlencode(urlencode($sstypes)); |
$val = $this->consulterHref($url); |
$libelle[$cle][$i]=$val->nom; |
$detail[$cle][$i]['libelle'] = $val->nom; |
$detail[$cle][$i]['code'] = $val->code; |
$detail[$cle][$i]['href'] = $url; |
$i++; |
} |
} |
} |
//var_dump($libelle); exit; |
$resultat_typeBio['type_bio.libelle']= $this->formaterTypeBioPrLibelle($libelle); |
$resultat_typeBio['type_bio.detail'] = $detail; |
return $resultat_typeBio; |
} |
public function formaterTypeBioPrLibelle($info) { |
$libelle = implode(', ',$info['type.principal'])." "; |
$libelle .= isset($info['sous_type.principal']) ? " (".implode(', ',$info['sous_type.principal']).") " : ""; |
$libelle .= isset($info['type.secondaire']) ? ", ".implode(', ',$info['type.secondaire'])." " : ""; |
$libelle .= isset($info['sous_type.secondaire']) ? "(".implode(', ',$info['sous_type.secondaire']).") " : ""; |
return $libelle; |
} |
//séparation des principaux et des secondaires |
public function separerTypesPrimairesSecondaires($type) { |
$types = array(); |
if (preg_match("/(.+)\((.+)\)\-{0,1}(.+){0,1}/", $type,$retour)) { |
$types['principal'] = isset($retour[3]) ? $retour[1].'-'. $retour[3] : $retour[1] ; |
$types['secondaire'] = $retour[2]; |
} else { |
$types['principal'] = $type; |
} |
return $types; |
} |
public function separerTypes_SousTypes($type_a_traiter, $typePrimOuSec) { |
$types = array(); |
if (preg_match("/^([a-zA-Zé]+)\-(.+)$|^([a-zA-Zé,]+[^\-])$/", $type_a_traiter, $retour)) { |
//type |
$type = array(); |
$type[0] = (isset($retour[3])) ? $retour[3] : $retour[1] ; |
$type = explode(",", $type[0]); |
for ($i = 0 ; $i < count($type); $i++) { |
$types['type.'.$typePrimOuSec][$i] = $type[$i]; |
} |
//sous types |
$ss_types = array(); |
if (isset($retour[2]) && $retour[2] != '') { |
$ss_types[0] = $retour[2] ; |
$ss_types = explode("-", $ss_types[0]); |
for ($i = 0 ; $i < count($ss_types); $i++) { |
$types['sous_type.'.$typePrimOuSec][$i] = $ss_types[$i]; |
} |
} |
} |
return $types; |
} |
//+--------------------------FONCTIONS D'ASSEMBLAGE DE LA REQUETE-------------------------------------------+ |
public function assemblerLaRequete() { |
$requete = ' SELECT '.$this->champs_recherches.' FROM '.$this->table.' ' |
.$this->retournerRequeteCondition().' '; |
if ($this->nb_ressources != 1 ) { |
$requete .= $this->delimiterResultatsRequete(); |
} |
return $requete; |
} |
public function calculerTotalResultat() { |
$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '.$this->table.' '.$this->retournerRequeteCondition(); |
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete); |
if ($res) { |
$this->total_resultat = $res['nombre']; |
} else { |
$this->total_resultat = 0; |
$e = 'Données introuvables dans la base'; |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e); |
} |
} |
public function delimiterResultatsRequete() { |
$this->calculerTotalResultat(); |
$requete_limite = ''; |
if ($this->limite_requete['limite'] != '*') { |
if ( ($this->limite_requete['depart'] <= $this->total_resultat)){ |
if (($this->limite_requete['limite'] + $this->limite_requete['depart'] ) |
< $this->total_resultat ){ |
$requete_limite = 'LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', ' |
.$this->limite_requete['limite']; |
} |
} else { |
$e = "Erreur : la valeur pour le paramètre navigation.départ est supérieure". |
" au nombre total de résultats."; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE); |
} |
} |
return $requete_limite; |
} |
public function retournerRequeteCondition() { |
$condition = ''; |
if (empty($this->requete_condition) == false) { |
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition); |
} |
return $condition; |
} |
} |
?> |
/tags/v0.1-20130829/services/modules/0.1/baseflor/CommunGraphiques.php |
---|
New file |
0,0 → 1,400 |
<?php |
/** |
* Classe CommunGraphiques.php regroupement de fonctions pour les graphiques |
* graphiques/#typegraphique/#bdnt.nn:#num_nomen --> renvoie un graphique avec les données connues |
* |
* |
* @package eflore-projets |
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org> |
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org> |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt> |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt> |
* @version 1.0 |
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org) |
*/ |
abstract class CommunGraphiques extends Commun{ |
protected $parametres = array(); |
protected $ressources = array(); |
protected $Bdd; |
protected $config; |
protected $cache; |
protected $metadonnees; |
protected $version; |
protected $serviceNom = 'Graphiques'; |
protected $graduations_id = array(); |
protected $champs_ontologiques = array(); |
protected $nomGraphique = array(); |
protected $table = ''; |
protected $requete_condition = ""; |
protected $requete_champs; |
protected $convertisseur; |
protected $cheminGraphBase; |
protected $valeurs_en_pourcentage = array(); |
protected $dom; |
protected $largeurSVG = "500"; |
protected $hauteurSVG; |
protected $valeurs_champs; |
public function consulter($ressources, $parametres) { |
$this->ressources = $ressources; |
$this->parametres = $parametres; |
$this->verifierParametres(); |
$this->initialiserConfiguration(); |
$resultats = ''; |
$this->traiterRessources(); |
$requete = $this->assemblerLaRequete(); |
$resultat = $this->resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete); |
$versionResultat = $this->obtenirResultat($resultat); |
return $versionResultat; |
} |
//+--------------------------initialisation de paramètres -------------------------------------------+ |
private function initialiserConfiguration() { |
$conteneur = new Conteneur(); |
$this->Bdd = $conteneur->getBdd(); |
$this->config = $conteneur->getParametre('Graphiques'); |
$this->convertisseur = $this->config['convertisseur']; |
$this->graduations_id = $this->getParametreTableau('graduations_id'); |
$this->champs_ontologiques = $this->getParametreTableau('champs_ontologiques'); |
$this->cheminGraphBase = $this->config['chemin']; |
$cacheOptions = array('mise_en_cache' => $this->config['cache_miseEnCache'], |
'stockage_chemin' => $this->config['cache_stockageChemin'], |
'duree_de_vie' => $this->config['cache_dureeDeVie']); |
$this->cache = $conteneur->getCacheSimple($cacheOptions); |
$this->definirVersion(); |
$this->definirFormat(); |
$this->definirTable($this->version); |
} |
abstract function definirTable($version); |
private function getParametreTableau($cle) { |
$tableau = array(); |
$parametre = Config::get($cle); |
if (empty($parametre) === false) { |
$tableauPartiel = explode(',', $parametre); |
$tableauPartiel = array_map('trim', $tableauPartiel); |
foreach ($tableauPartiel as $champ) { |
if (strpos($champ, '=') !== false && strlen($champ) >= 3) { |
list($cle, $val) = explode('=', $champ); |
$tableau[trim($cle)] = trim($val); |
} else { |
$tableau[] = trim($champ); |
} |
} |
} |
return $tableau; |
} |
//+--------------------------traitement ressources ou paramètres -------------------------------------------+ |
//+---- paramètres ----+ |
private function verifierParametres() { |
if (isset($this->parametres)) { |
$parametres_dispo = array('retour', 'retour.format', 'version.projet'); |
$parametres = array_keys($this->parametres); |
foreach ($parametres as $param) { |
if (!in_array($param, $parametres_dispo)) { |
$erreur = "Erreur : Le paramètre $param est inconnu."; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE; |
throw new Exception($erreur, $code); |
} |
} |
} |
} |
//on n'affiche qu'une version de graphique à la fois ( la dernière ou celle demandée ) |
private function definirVersion() { |
$this->chargerVersions(); |
if (!isset($this->parametres['version.projet']) ) { |
$this->version = $this->metadonnees[0]['version']; |
} elseif ($this->parametres['version.projet'] == '+') { |
$this->version = $this->metadonnees[0]['version']; |
} else { |
if($this->verifierVersion($this->parametres['version.projet'])) { |
$this->version = $this->parametres['version.projet']; |
}else { |
$erreur = "Erreur : La version est inconnue."; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE; |
throw new Exception($erreur, $code); |
} |
} |
} |
private function verifierVersion($version){ |
$retour = false; |
foreach ($this->metadonnees as $vers) { |
if ($vers['version'] == $version ) { |
$retour = true; |
} |
} |
return $retour; |
} |
private function definirFormat() { |
if (isset($this->parametres['retour.format']) ){ |
if (preg_match("/^[0-9]+$/", $this->parametres['retour.format'])){ |
if ($this->parametres['retour.format'] > 0) { |
$this->largeurSVG = $this->parametres['retour.format']; |
} else { |
$erreur = "Erreur : valeur pour retour.format négative ou égale à 0."; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE; |
throw new Exception($erreur, $code); |
} |
}else { |
$erreur = "Erreur : valeur inconnue. Entrez la largeur voulue (en pixels) pour le paramètre retour.format."; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE; |
throw new Exception($erreur, $code); |
} |
} |
if (!isset($this->parametres['retour']) ){ |
$this->parametres['retour'] = 'image/svg+xml'; |
}else { |
if (( $this->parametres['retour'] != 'image/svg+xml')&& ( $this->parametres['retour'] != 'image/png')){ |
$erreur = "Erreur : valeur inconnue. Choisissez le format de retour pour le paramètre retour : image/svg%2Bxml ou image/png."; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE; |
throw new Exception($erreur, $code); |
} |
} |
} |
private function chargerVersions() { |
$requete = "SELECT version ". |
"FROM ".Config::get('bdd_table_meta')." ". |
"ORDER BY date_creation DESC "; |
$resultats = $this->Bdd->recupererTous($requete); |
if (!is_array($resultats) || count($resultats) <= 0) { |
$message = "Les méta-données n'ont pu être chargée pour la ressource demandée"; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE; |
throw new Exception($message, $code); |
} |
$this->metadonnees = $resultats; |
} |
//+----- ressources -----+ |
public function traiterRessources() { |
if(isset($this->ressources)) { |
$this->traiterTypeGraphique(); |
$this->traiterReferentielEtNum(); |
} else { |
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> ressources insuffisantes.'; |
throw new Exception( $e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} |
abstract function traiterReferentielEtNum(); |
abstract function traiterTypeGraphique(); |
//+--------------------------FONCTIONS D'ASSEMBLAGE DE LA REQUETE-------------------------------------------+ |
public function assemblerLaRequete() { |
$requete = ' SELECT '.$this->requete_champs.' FROM '.$this->table.' '.$this->retournerRequeteCondition(); |
return $requete; |
} |
public function retournerRequeteCondition() { |
$condition = ''; |
if ($this->requete_condition !== "") { |
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition); |
} |
return $condition; |
} |
//+-------------------------- formatage du résultat -------------------------------------------+ |
public function obtenirResultat($resultat) { |
if ($resultat == ""){ |
$message = 'La requête SQL formée comporte une erreur!'; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE; |
throw new Exception($message, $code); |
}elseif ($resultat) { |
if ((count($this->ressources)) != 0) { |
//$Atraiter = array_filter($resultat[0],function($var){return ($var != '');}); |
foreach ($resultat[0] as $champs => $valeur) { |
if ($valeur !== '') { |
$Atraiter[$champs] = $valeur; |
} |
} |
if (!empty($Atraiter)) { |
$this->traiterValeursEcologiques($Atraiter); |
$svg = $this->genererSVG(); |
$resultat = new ResultatService(); |
$resultat->corps = ($this->parametres['retour'] == 'image/png') ? $this->convertirEnPNG($svg) : $svg; |
$resultat->mime = $this->parametres['retour']; |
} else { |
$resultat = null; |
} |
} |
} else { |
$resultat = null; |
} |
return $resultat; |
} |
//+----- modification svg -----+ |
public function traiterValeursEcologiques($valeur){ |
$this->valeurs_champs = $valeur; |
foreach($this->valeurs_champs as $cle => $val){ |
if (preg_match("/ve_humidite_edaph/", $cle)) { |
$this->valeurs_en_pourcentage[$cle] = round($val/13,1); |
} elseif (preg_match("/ve_salinite/", $cle)) { |
$this->valeurs_en_pourcentage[$cle] = round(($val+1)/11,1); |
} else { |
$this->valeurs_en_pourcentage[$cle] = round($val/10,1); |
} |
} |
} |
public function donnerHauteur($ancienne_largeur, $ancienne_hauteur) { |
$nouvelle_largeur = $this->largeurSVG; |
$ancienne_largeur = str_replace('px','',$ancienne_largeur); |
$ancienne_hauteur = str_replace('px','',$ancienne_hauteur); |
$rapport = $nouvelle_largeur / $ancienne_largeur ; |
$nouvelle_hauteur = $ancienne_hauteur * $rapport; |
$this->hauteurSVG = $nouvelle_hauteur; |
} |
public function ajusterFormatSVG(){ |
$svg = $this->dom->getElementsByTagName("svg")->item(0); |
$largeur = $svg->getAttribute('width'); |
$hauteur = $svg->getAttribute('height'); |
$this->donnerHauteur($largeur , $hauteur); |
$svg->setAttribute('width',round($this->largeurSVG).'px'); |
$svg->setAttribute('height',round($this->hauteurSVG).'px'); |
} |
public function genererSVG(){ |
$svg = null; |
$this->dom = new DOMDocument('1.0', 'UTF-8'); |
$this->dom->validateOnParse = true; |
$fichierSvg = $this->cheminGraphBase."".$this->nomGraphique.".svg"; |
$this->dom->load($fichierSvg); |
$this->changerValeursSVG(); |
$svg = $this->dom->saveXML(); |
return $svg; |
} |
abstract function changerValeursSVG(); |
public function recupererOntologies($valeur, $champs){ |
$url = $this->ajouterHref('ontologies',$this->champs_ontologiques[$champs].':'.urlencode(urlencode($valeur))); |
try { |
$val = $this->getBdd()->recuperer(sprintf( |
"SELECT a.nom FROM baseflor_ontologies a LEFT JOIN baseflor_ontologies b ON a.id = b.id LEFT JOIN baseflor_ontologies c ON b.classe_id = c.id WHERE". |
" b.code = BINARY '%s' AND c.code = BINARY '%s' LIMIT 0, 100", |
$valeur, |
$this->champs_ontologiques[$champs]), |
Bdd::MODE_OBJET); |
} catch (Exception $e) { |
$val = ""; |
} |
return $val; |
} |
public function traiterIntermediaires($valeurTexte,$champsOntologie, $champsTable){ |
if (preg_match("/(?:I|i)nterm(?:é|e)diaire(?:s)*/", $valeurTexte )) { |
$prec = $this->recupererOntologies(($this->valeurs_champs[$champsTable]-1), $champsOntologie ); |
$suiv = $this->recupererOntologies(($this->valeurs_champs[$champsTable]+1), $champsOntologie ); |
$valeurTexte = "Intermédiaires entre $prec->nom et $suiv->nom "; |
} |
return $valeurTexte; |
} |
/// +---- convertir png ----+ |
public function convertirEnPNG($svg) { |
$png = null; |
if (isset($this->convertisseur)) { |
if ($this->convertisseur == 'imagick') { |
if (extension_loaded('imagick')) { |
$png = $this->convertirEnPNGAvecImageMagick($svg); |
} else { |
$message = "Impossible de générer l'image sur le serveur. Extension ImageMagick absente."; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_ERREUR; |
throw new Exception($message, $code); |
} |
} else if ($this->convertisseur == 'rsvg') { |
$png = $this->convertirGraphiqueEnPNGAvecRsvg($svg); |
} else { |
$message = "Le convertisseur indiqué '{$this->convertisseur}' ne fait pas partie de la liste ". |
"des convertisseurs disponibles : imagick, rsvg."; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_ERREUR; |
throw new Exception($message, $code); |
} |
} else { |
$message = "Veuillez indiquer le convertisseur de svg à utiliser pour le service."; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_ERREUR; |
throw new Exception($message, $code); |
} |
return $png; |
} |
public function convertirEnPNGAvecImageMagick($svg) { |
$convertisseur = new Imagick(); |
$convertisseur->setBackgroundColor(new ImagickPixel('#F8F8F8')); |
$convertisseur->readImageBlob($svg); |
$convertisseur->setImageFormat('png32'); |
$convertisseur->resizeImage($this->largeurSVG,$this->hauteurSVG, imagick::FILTER_LANCZOS, 0, true); |
$png = $convertisseur->getImageBlob(); |
$convertisseur->clear(); |
$convertisseur->destroy(); |
return $png; |
} |
public function convertirGraphiqueEnPNGAvecRsvg($svg) { |
$idFichier = $this->getIdFichier(); |
$fichierPng = $this->config['cache_stockageChemin'].$idFichier.'.png'; |
$fichierSvg = $this->config['cache_stockageChemin'].$idFichier.'.svg'; |
file_put_contents($fichierSvg, $svg); |
$commande = "rsvg-convert $fichierSvg -w ".$this->largeurSVG ." -h ".$this->hauteurSVG ." -o $fichierPng"; |
//echo $commande; exit; |
$rsvg = exec($commande); |
$this->indexerGraphiqueFichierPng($fichierPng); |
$png = file_get_contents($fichierPng); |
return $png; |
} |
public function indexerGraphiqueFichierPng($fichierPng) { |
$img = imagecreatefrompng($fichierPng); |
imagetruecolortopalette($img, false, 32); |
imagepng($img, $fichierPng, 9, PNG_ALL_FILTERS); |
} |
public function getIdFichier(){ |
$idfichier = str_replace(".","-",$this->ressources[1]); |
$idfichier = str_replace(':','-',$idfichier); |
$idfichier .= "-".$this->ressources[0]; |
return $idfichier; |
} |
} |
?> |
/tags/v0.1-20130829/services/modules/0.1/baseflor/Graphiques.php |
---|
New file |
0,0 → 1,42 |
<?php |
/** |
* Classe Graphiques.php détermine le type de graphiques à afficher en fonction des données des tables |
* baseflor et baseflor_rang_sup_ecologie |
* fin d'url possibles : |
* graphiques/#typegraphique/#bdnt.nn:#num_nomen --> renvoie une graphique avec les données connues |
* |
* |
* @package eflore-projets |
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org> |
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org> |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt> |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt> |
* @version 1.0 |
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org) |
*/ |
class Graphiques extends Commun{ |
private $Graph_tables = array('GraphiquesBaseflor', 'GraphiquesTaxonsSup'); |
public function consulter($ressources, $parametres) { |
$versionResultat = null; |
foreach ($this->Graph_tables as $graph_tab) { |
$Graph = new $graph_tab(); |
$versionResultat = $Graph->consulter($ressources, $parametres); |
if($versionResultat != null) {break;} |
} |
if ($versionResultat == null) { |
$message = 'Les données recherchées sont introuvables.'; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE; |
throw new Exception($message, $code); |
} |
return $versionResultat; |
} |
} |
?> |
/tags/v0.1-20130829/services/modules/0.1/baseflor/Informations.php |
---|
New file |
0,0 → 1,290 |
<?php |
/** |
* Classe Informations.php interroge la table Index |
* et redirige vers une autre classe si besoin |
* d'interroger une autre table (comme baseflor ou baseflor_rang_sup) |
* elle traite également le retour du web service : /informations |
* |
* Encodage en entrée : utf8 |
* Encodage en sortie : utf8 |
* @package eflore-projets |
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org> |
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org> |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt> |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt> |
* @version 1.0 |
* @copyright 1999-2012 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org) |
* |
* |
*/ |
class Informations extends Commun { |
protected $limite_requete = array( 'depart' => 0, 'limite' => 10); |
private $tables; |
private $champs_recherches = '*'; |
private $requete_jointure = ""; |
private $requete_condition = ""; |
private $total_resultat; |
protected $serviceNom = 'informations'; |
private $masque; |
public function consulter($ressources, $parametres) { |
$this->ressources = $ressources; |
$this->parametres = $parametres; |
$versionResultat = null; |
if (empty($this->ressources)){ |
$this->traiterParametres(); |
} |
$this->definirTables(array ('index' => config::get('bdd_table_index'), |
'baseflor' => config::get('bdd_table'), |
'rangSup' => config::get('bdd_table_rang_sup') |
) |
); |
$this->traiterRessources(); |
$requete = $this->assemblerLaRequete(); |
// exemple: |
// SELECT * FROM baseflor_index_v2012_12_31 WHERE `bdnt.nn` = 'bdtfx.nn:XXXXX'; |
$resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete . ' -- ' . __FILE__ . ':' .__LINE__); |
$versionResultat = $this->renvoyerResultat($resultat); |
if ($versionResultat == null) { |
$message = 'Les données recherchées sont introuvables.'; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE; |
throw new Exception($message, $code); |
} |
return $versionResultat; |
} |
public function __construct() { |
$Conteneur = new Conteneur(); |
$this->Bdd = $Conteneur ->getBdd(); |
} |
public function renvoyerResultat($resultat) { |
$res_formate = array(); |
if (empty($this->ressources)) { |
$res_formate = $this->retournerResultatFormate($resultat); |
} else { |
$classe = empty($resultat[0]['baseflor']) ? 'InformationsTaxonsSup' : 'InformationsBaseflor'; |
$info = new $classe(new Conteneur()); |
$res_formate = $info->consulter($this->ressources, $this->parametres); |
} |
return $res_formate; |
} |
//+--------------------------traitement ressources ou paramètres -------------------------------------+ |
public function traiterRessources() { |
if (empty($this->ressources)) { |
$this->requete_jointure = array( |
'LEFT JOIN '. $this->tables['baseflor'].' ON ' |
.$this->tables['baseflor'].".cle =".$this->tables['index'].".baseflor", |
'LEFT JOIN '. $this->tables['rangSup'].' ON ' |
.$this->tables['rangSup'].".cle = ".$this->tables['index'].".RangSup"); |
$this->champs_recherches = " {$this->tables['baseflor']}.num_nomen as 'baseflor.nn', |
{$this->tables['baseflor']}.BDNT as 'baseflor.bdnt', |
{$this->tables['baseflor']}.catminat_code, |
{$this->tables['baseflor']}.num_taxon , |
{$this->tables['baseflor']}.idiotaxon , |
{$this->tables['rangSup']}.num_nomen as 'rangSup.nn', |
{$this->tables['rangSup']}.bdnt as 'rangSup.bdnt', |
{$this->tables['index']}.cle as 'index.cle' "; |
} else { |
if(preg_match('/^(.+)\.nn:([0-9]+)$/', $this->ressources[0], $retour)){ |
$this->champs_recherches = " baseflor, rangSup "; |
$this->requete_condition[] = " `bdnt.nn` = '{$retour[0]}' "; |
} else { |
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> La ressource demandée n\'existe pas.'; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
break; |
} |
} |
} |
public function traiterParametres() { |
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres) ) { |
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) { |
switch ($param) { |
case 'navigation.depart' : |
if(!isset($this->parametres['navigation.limite'])) |
throw new Exception("indiquez également la valeur pour le paramètre navigation.limite.", |
RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
$this->definirNavigationDepart($valeur); |
break; |
case 'navigation.limite' : |
if(!isset($this->parametres['navigation.depart'])) |
throw new Exception("indiquez également la valeur pour le paramètre navigation.depart.", |
RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
$this->definirNavigationLimite($valeur); |
break; |
case 'version.projet' : |
$this->traiterVersion($valeur); |
break; |
case 'masque.cat' : |
$this->masque = 'catminat='.str_replace('-','/',$valeur); |
$this->requete_condition[] = " catminat_code = '".str_replace('-','/',$valeur)."' "; |
break; |
default : |
$e = 'Erreur dans les parametres de votre requête : </br> Le paramètre " ' |
.$param.' " n\'existe pas.'; |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE, $e); break; |
} |
} |
} |
} |
//+++------------------------------traitement des versions----------------------------------------++ |
public function traiterVersion($valeur) { |
if (preg_match('/^[0-9]+(?:[._][0-9]+)*$/', $valeur) || $valeur == '*' || $valeur == '+') { |
$this->version_projet = $valeur; |
} else { |
$e = "Erreur : La version est inconnue."; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
if ($this->version_projet == '*' && empty($this->ressources)) { |
$message = "L'affichage de plusieurs versions ne fonctionne que pour les ressources de type /ressources/#id"; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE; |
throw new Exception($message, $code); |
} |
} |
public function definirTables($prefixe_table) { |
$table_num_version = $this->recupererVersionDisponible(); |
foreach ($prefixe_table as $nom => $prefixe ) { |
if ( in_array($this->version_projet,$table_num_version) ) { |
$tables[$nom] = $prefixe.'_v'.$this->version_projet; |
} elseif ($this->version_projet == '+') { |
$derniere_version = $table_num_version[count($table_num_version) - 1]; |
$tables[$nom] = $prefixe.'_v'.str_replace('.', '_', $derniere_version); |
} else { |
$e = "Erreur : La version est inconnue."; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} |
$this->tables = $tables; |
} |
//+--------------------------formatages de resultats -------------------------------------------+ |
public function retournerResultatFormate($resultat) { |
$resultat_json = array(); |
$resultat_json['entete'] = $this->ajouterEnteteResultat(); |
$resultat_json['resultats'] = array(); |
foreach ($resultat as $ligne => $tab) { |
$num = $tab['index.cle']; |
$resultat_json['resultats'][$num]['num_nomen'] = |
(empty ($tab['baseflor.nn'])) ? $tab['rangSup.nn'] : $tab['baseflor.nn']; |
$resultat_json['resultats'][$num]['bdnt'] = |
(empty ($tab['baseflor.bdnt'])) ? $tab['rangSup.bdnt'] : $tab['baseflor.bdnt']; |
$resultat_json['resultats'][$num]['catminat_code'] = |
(empty ($tab['catminat_code'])) ? '' : $tab['catminat_code']; |
$resultat_json['resultats'][$num]['idiotaxon'] = |
(empty ($tab['idiotaxon'])) ? '' : $tab['idiotaxon']; |
$resultat_json['resultats'][$num]['num_taxon'] = |
(empty ($tab['num_taxon'])) ? '' : $tab['num_taxon']; |
if ($resultat_json['resultats'][$num]['num_nomen'] != 0) { |
$bdnt = strtolower($resultat_json['resultats'][$num]['bdnt']); |
$nn = $resultat_json['resultats'][$num]['num_nomen']; |
$resultat_json['resultats'][$num]['href'] = |
$this->ajouterHref('informations',$bdnt.".nn:".$nn); |
} |
} |
return $resultat_json; |
} |
public function ajouterEnteteResultat() { |
$entete['depart'] = $this->limite_requete['depart']; |
$entete['limite'] = $this->limite_requete['limite']; |
$entete['total'] = $this->total_resultat; |
if ($this->masque) { |
$entete['masque'] = $this->masque; |
} |
$entete['version'] = $this->version_projet; |
$url = $this->formulerUrl($this->total_resultat, '/informations'); |
if (isset($url['precedent']) && $url['precedent'] != '') { |
$entete['href.precedent'] = $url['precedent']; |
} |
if (isset($url['suivant']) && $url['suivant'] != '') { |
$entete['href.suivant'] = $url['suivant']; |
} |
return $entete; |
} |
//+-------------------------------------assemblage de requête------------------------------------// |
public function assemblerLaRequete() { |
$requete = ' SELECT '.$this->champs_recherches.' FROM '.$this->tables['index'].' ' |
.$this->retournerRequeteJointure().' '.$this->retournerRequeteCondition(). |
' '.$this->delimiterResultatsRequete(); |
return $requete; |
} |
public function retournerRequeteCondition() { |
$condition = ''; |
if ($this->requete_condition !== "") { |
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition); |
} |
return $condition; |
} |
public function calculerTotalResultat() { |
$requete = 'SELECT count(*) as nombre FROM '.$this->tables['index'].' ' |
.$this->retournerRequeteJointure().' '.$this->retournerRequeteCondition(); |
$res = $this->getBdd()->recuperer($requete); |
if ($res) { |
$this->total_resultat = $res['nombre']; |
} else { |
$this->total_resultat = 0; |
$e = 'Données introuvables dans la base'; |
$this->renvoyerErreur(RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE, $e); |
} |
} |
public function delimiterResultatsRequete() { |
$this->calculerTotalResultat(); |
$requete_limite = ''; |
if (($this->limite_requete['depart'] <= $this->total_resultat) ){ |
if ( $this->limite_requete['depart'] < $this->total_resultat ){ |
$requete_limite = 'LIMIT '.$this->limite_requete['depart'].', ' |
.$this->limite_requete['limite']; |
} |
} else { |
$e = "Erreur : la valeur pour le paramètre navigation.départ est supérieure". |
" au nombre total de résultats."; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE); |
} |
return $requete_limite; |
} |
public function retournerRequeteJointure() { |
$jointure = ''; |
if ($this->requete_jointure !== "") { |
$jointure = implode(' ', $this->requete_jointure); |
} |
return $jointure; |
} |
} |
/tags/v0.1-20130829/services/modules/0.1/baseflor/GraphiquesTaxonsSup.php |
---|
New file |
0,0 → 1,146 |
<?php |
/** |
* Classe GraphiquesTaxonsSup.php transforme les données écologiques de la table baseflor_rang_sup_ecologie |
* en graphique svg |
* graphiques/#typegraphique/#bdnt.nn:#num_nomen --> renvoie un graphique avec les données connues |
* |
* |
* @package eflore-projets |
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org> |
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org> |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt> |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt> |
* @version 1.0 |
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org) |
*/ |
class GraphiquesTaxonsSup extends CommunGraphiques{ |
public function definirTable($version){ |
$this->table = Config::get('bdd_table_rang_sup')."_v".$version; |
} |
//+---- ressources ----+ |
public function traiterReferentieletNum(){ |
if (!empty($this->ressources[1])) { |
if(preg_match('/^(.+)\.nn:([0-9]+)$/', $this->ressources[1], $retour) == 1){ |
switch ($retour[1]) { |
case 'bdtfx' : // pour le moment un seul referentiel disponible |
$this->requete_condition[]= "num_nomen = ".$retour[2]." AND bdnt = 'bdtfx' "; |
break; |
default : |
$e = "Le référentiel {$retour[1]} n'existe pas."; |
throw new Exception( $e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
break; |
} |
}else { |
$e = "Erreur dans l'url de votre requête :". |
" précisez le référentiel et le numéro nomenclatural sous la forme {bdnt}.nn:{nn}."; |
throw new Exception( $e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} else { |
throw new Exception( "Erreur dans l'url de votre requête :". |
" précisez le référentiel et le numéro nomenclatural sous la forme {bdnt}.nn:{nn}.", |
RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} |
public function traiterTypeGraphique(){ |
if (!empty($this->ressources[0])) { |
switch ($this->ressources[0]) { |
case 'climat' : |
$this->requete_champs = ' ve_lumiere_min, ve_lumiere_max, ve_temperature_min,'. |
' ve_temperature_max, ve_continentalite_min,'. |
' ve_continentalite_max, ve_humidite_atmos_min,'. |
' ve_humidite_atmos_max' ; |
$this->nomGraphique= 'climat_min_max'; |
break; |
case 'sol' : |
$this->requete_champs = ' ve_humidite_edaph_min , ve_humidite_edaph_max,'. |
' ve_reaction_sol_min, ve_reaction_sol_max, '. |
' ve_nutriments_sol_min, ve_nutriments_sol_max,'. |
' ve_salinite_min, ve_salinite_max,'. |
' ve_texture_sol_min, ve_texture_sol_max,'. |
've_mat_org_sol_min,ve_mat_org_sol_max ' ; |
$this->nomGraphique = 'sol_min_max'; |
break; |
default : |
$e = "Erreur dans l'url de votre requête :". |
"</br> précisez le graphique -> \"sol\" ou \"climat\"."; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
break; |
} |
}else { |
throw new Exception("Erreur dans l'url de votre requête :". |
"</br> precisez le graphique -> \"sol\" ou \"climat\".", RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} |
//+-------------------------- formatage du résultat -------------------------------------------+ |
public function changerValeursSVG(){ |
$this->ajouterValeursIntermediaires(); |
$Dompath = new DOMXPath($this->dom); |
foreach ($this->valeurs_en_pourcentage as $cle => $val){ |
$val = preg_replace('/,/','.', $val); |
$grad_id = array_search($val,$this->graduations_id); |
$champs = preg_replace('/_min|_max|_[0-9]/','', $cle); |
// dans le cas de mauvaises données, pour ne pas que tout le graphique |
$case = $Dompath->query("//*[@id='".$grad_id."_".$champs."']")->item(0); |
if($case != null) { |
$case->setAttribute('fill','#EA6624'); |
$case->setAttribute('stroke','#EA6624'); |
$this->ajouterInfoAuSurvol($champs,$case); |
} |
$changement = true; |
} |
$this->ajusterFormatSVG(); |
} |
public function ajouterValeursIntermediaires(){ |
$champs_ecolo = array_keys($this->champs_ontologiques); |
foreach ($champs_ecolo as $chps ){ |
$min = !empty($this->valeurs_en_pourcentage[$chps.'_min']) ? $this->valeurs_en_pourcentage[$chps.'_min'] : -1; |
$max = !empty($this->valeurs_en_pourcentage[$chps.'_max']) ? $this->valeurs_en_pourcentage[$chps.'_max'] : -1; |
if ($min < ($max-0.1) ){ |
$i = $min + 0.1; |
$num = 1; |
for ($i ; $i < $max; $i += 0.1) { |
$this->valeurs_en_pourcentage[$chps.'_'.$num] = $i; |
$num++; |
} |
} |
} |
} |
public function ajouterInfoAuSurvol($champs, $case){ |
$min = $this->valeurs_champs[$champs."_min"]; |
$max = $this->valeurs_champs[$champs."_max"]; |
if ($min != $max){ |
$valeurMin = $this->recupererOntologies($min, $champs ); |
$valeurMax = $this->recupererOntologies($max, $champs ); |
$valeurMin = $this->traiterIntermediaires($valeurMin->nom, $champs, $champs.'_min'); |
$valeurMax = $this->traiterIntermediaires($valeurMax->nom, $champs, $champs.'_max'); |
$case->setAttribute('title',"de $min: $valeurMin à $max: $valeurMax " ); |
} else { |
$valeurMin = $this->recupererOntologies($min, $champs ); |
$valeurMin = $this->traiterIntermediaires($valeurMin->nom, $champs, $champs.'_min'); |
$case->setAttribute('title',"$min: $valeurMin" ); |
} |
} |
} |
?> |
/tags/v0.1-20130829/services/modules/0.1/baseflor/InformationsTaxonsSup.php |
---|
New file |
0,0 → 1,268 |
<?php |
/** |
* Classe InformationsTaxonsSup.php permet de faire des requetes pour les rangs superieurs de baseflor |
* du référentiel BDTFX et avec un numéro nomenclatural ( différent de 0 ). |
* fin d'url possibles : |
* |
* /informations/#bdnt.nn:#num_nomen?champs=ecologie --> retourne champs ecologiques pour un BDNT et un num_nomen |
* |
* |
* Encodage en entrée : utf8 |
* Encodage en sortie : utf8 |
* @package eflore-projets |
* @author Mathilde SALTHUN-LASSALLE <mathilde@tela-botanica.org> |
* @author Delphine CAUQUIL <delphine@tela-botanica.org> |
* @author Jean-Pascal MILCENT <jpm@tela-botanica.org> |
* @license GPL v3 <http://www.gnu.org/licenses/gpl.txt> |
* @license CECILL v2 <http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL_V2-en.txt> |
* @version 1.0 |
* @copyright 1999-2011 Tela Botanica (accueil@tela-botanica.org) |
*/ |
class InformationsTaxonsSup extends Commun{ |
protected $table = ""; |
private $champs_ontologiques = array(); |
private $format_reponse = 'informations'; |
protected $serviceNom = 'informations'; |
private $retour_format = 'max'; |
private $Bdd; |
private $requete_condition = ""; |
private $champs_recherches = '*'; |
public function consulter($ressources, $parametres) { |
$this->ressources = $ressources; |
$this->parametres = $parametres; |
$this->traiterParametres(); |
$this->definirTables(); |
$this->traiterRessources(); |
$resultats = ''; |
foreach ($this->table_version as $version) { |
$this->table = $version; |
$requete = $this->assemblerLaRequete(); |
$resultat = $this->Bdd->recupererTous($requete); |
$versionResultat = $this->analyserResultat($resultat); |
if (count($this->table_version) > 1) { |
$resultats[$version] = $versionResultat; |
} else { |
$resultats = $versionResultat; |
} |
} |
return $resultats; |
} |
public function analyserResultat($resultat) { |
$versionResultat = null; |
if ($resultat == '') { |
$message = 'La requête SQL formée comporte une erreur!'; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_RESSOURCE_INTROUVABLE; |
throw new Exception($message, $code); |
} elseif ($resultat) { |
$versionResultat = $this->retournerResultatFormate($resultat); |
} |
return $versionResultat; |
} |
public function __construct(Conteneur $Conteneur) { |
$this->Bdd = $Conteneur->getBdd(); |
} |
//+--------------------------traitement ressources ou paramètres -------------------------------------------+ |
public function traiterRessources() { |
if(preg_match('/^(.+)\.nn:([0-9]+)$/', $this->ressources[0], $retour)==1){ |
switch ($retour[1]) { |
case 'bdtfx' : |
$this->requete_condition[] = "num_nomen = ".$retour[2]." AND bdnt = 'bdtfx' "; |
break; |
default : |
$e = 'Erreur dans l\'url de votre requête : </br> Le référentiel " ' |
.$retour[1].' " n\'existe pas.'; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
break; |
} |
} |
} |
//+---- paramètres ----+ |
public function traiterParametres() { |
if (isset($this->parametres) && !empty($this->parametres) ) { |
foreach ($this->parametres as $param => $valeur) { |
switch ($param) { |
case 'categorie' : |
if ($valeur == "ecologie"){ |
$this->champs_recherches = ' num_nomen, bdnt, ve_lumiere_min , ve_lumiere_max,' |
.' ve_temperature_min, ve_temperature_max, ve_continentalite_min,' |
.' ve_continentalite_max, ve_humidite_atmos_min, ve_humidite_atmos_max,' |
.' ve_humidite_edaph_min, ve_humidite_edaph_max, ve_reaction_sol_min,' |
.' ve_reaction_sol_max, ve_nutriments_sol_min, ve_nutriments_sol_max,' |
.' ve_salinite_min, ve_salinite_max, ve_texture_sol_min,ve_texture_sol_max,' |
.' ve_mat_org_sol_min, ve_mat_org_sol_max '; |
} else { |
$e = "Valeur de paramètre inconnue pour 'categorie'. Ce paramètre n'est pas autorisé pour informations/#id"; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
break; |
case 'retour.format' : |
if ($valeur == 'min' || $valeur == 'max') { |
$this->retour_format = $valeur; |
break; |
} else { |
$e = "Valeur de paramètre inconnue pour 'retour.format'. Ce paramètre n'est pas autorisé pour informations/#id"; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
case 'version.projet' : |
$this->traiterVersion($valeur); |
break; |
default : |
$e = 'Erreur dans les parametres de votre requête : </br> Le paramètre " ' |
.$param.' " n\'existe pas.'; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); break; |
} |
} |
} |
} |
//+++------------------------------traitement des versions----------------------------------------++ |
public function traiterVersion($valeur) { |
if (preg_match('/^[0-9]+(?:[._][0-9]+)*$/', $valeur) || $valeur == '*' || $valeur == '+') { |
$this->version_projet = $valeur; |
} else { |
$e = "Erreur : La version est inconnue."; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
if ($this->version_projet == '*' && $this->ressources == array()) { |
$message = "L'affichage de plusieurs versions ne fonctionne que pour les ressources de type /ressources/#id"; |
$code = RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE; |
throw new Exception($message, $code); |
} |
} |
public function definirTables() { |
$table_num_version = $this->recupererVersionDisponible(); |
$prefixe_table = config::get('bdd_table_rang_sup'); |
if ( in_array($this->version_projet,$table_num_version) ) { |
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.$this->version_projet; |
} elseif ($this->version_projet == '+') { |
$derniere_version = $table_num_version[count($table_num_version) - 1]; |
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.str_replace('.', '_', $derniere_version); |
} elseif ($this->version_projet == '*') { |
foreach ($table_num_version as $num_version) { |
$this->table_version[] = $prefixe_table.'_v'.str_replace('.', '_', $num_version); |
} |
} else { |
$e = "Erreur : La version est inconnue."; |
throw new Exception($e, RestServeur::HTTP_CODE_MAUVAISE_REQUETE); |
} |
} |
//+--------------------------formatages de resultats -------------------------------------------+ |
public function retournerResultatFormate($resultat) { |
$this->resultat_json = $resultat[0]; |
if ($this->retour_format == 'max') { |
$graphique_presence = $this->traiterEcologie() ; |
if ($graphique_presence) { |
$this->ajouterLiensGraphique($graphique_presence); |
} |
} |
return $this->resultat_json ; |
} |
public function traiterEcologie() { |
$donnees_presence = false; |
$this->champs_ontologiques = $this->recupererTableauConfig('champs_ontologiques'); |
foreach ($this->champs_ontologiques as $cle => $valeur){ |
/* Les deux tests commentés ci-dessous étaient présents dans eflore-test (uniquement) jusqu'à juin 2013. |
La valeur 0 pose question. |
cf baseflor_v2012_12_31 |
cf services/modules/0.1/baseflor/CommunGraphiques.php traiterValeursEcologiques() */ |
if ($this->resultat_json[$cle.'_min'] != "") { // && $this->resultat_json[$cle.'_min'] != 0) { |
$donnees_presence[$this->getNomGraphique($valeur)] = true; |
$tab_ontologie = $this->recupererOntologies($this->resultat_json[$cle.'_min'], $cle.'_min'); |
unset($this->resultat_json[$cle.'_min']); |
} |
if ($this->resultat_json[$cle.'_max'] != "") { // && $this->resultat_json[$cle.'_max'] != 0) { |
$this->recupererOntologies($this->resultat_json[$cle.'_max'], $cle.'_max'); |
unset($this->resultat_json[$cle.'_max']); |
} |
} |
return $donnees_presence; |
} |
//donne le nom du graphique correspondant à un champ écologique |
public function getNomGraphique($code_ecolo) { |
$graphique = null; |
if (in_array($code_ecolo, explode(',',Config::get('Paramètres.climat')))) { |
$graphique = 'climat'; |
} elseif (in_array($code_ecolo, explode(',', Config::get('Paramètres.sol')) )) { |
$graphique = 'sol'; |
} |
return $graphique; |
} |
public function ajouterLiensGraphique($graphique_presence) { |
if ($graphique_presence['climat']) { |
$this->resultat_json['graphique_climat']['libelle'] = 'climat'; |
$this->resultat_json['graphique_climat']['href'] = $this->ajouterHref('graphiques/climat', |
strtolower($this->resultat_json['bdnt']).'.nn:'.$this->resultat_json['num_nomen']); |
} |
if ($graphique_presence['sol']) { |
$this->resultat_json['graphique_sol']['libelle'] = 'sol'; |
$this->resultat_json['graphique_sol']['href'] = $this->ajouterHref('graphiques/sol', |
strtolower($this->resultat_json['bdnt']).'.nn:'.$this->resultat_json['num_nomen']); |
} |
} |
//+--------------------------traitement ontologies -------------------------------------------+ |
public function recupererOntologies($valeur, $champs){ |
$chps_sans = preg_replace("/_min|_max/", '', $champs); |
$url = Config::get('url_service_base').Config::get('nom_projet'). |
'/ontologies/'.$this->champs_ontologiques[$chps_sans].':'.urlencode(urlencode($valeur)); |
try { |
$val = $this->getBdd()->recuperer(sprintf( |
"SELECT a.nom FROM baseflor_ontologies a LEFT JOIN baseflor_ontologies b ON a.id = b.id LEFT JOIN baseflor_ontologies c ON b.classe_id = c.id WHERE". |
" b.code = BINARY '%s' AND c.code = BINARY '%s' LIMIT 0, 100", |
$valeur, |
$this->champs_ontologiques[$chps_sans]), |
Bdd::MODE_OBJET); |
$this->resultat_json[$champs.'.libelle'] = $val->nom; |
$this->resultat_json[$champs.'.code'] = $valeur; |
$this->resultat_json[$champs.'.href'] = $url; |
} catch (Exception $e) { |
$this->resultat_json[$champs.'.libelle'] = ''; |
$this->resultat_json[$champs.'.code'] = ''; |
$this->resultat_json[$champs.'.href'] = ''; |
} |
} |
//+--------------------------FONCTIONS D'ASSEMBLAGE DE LA REQUETE-------------------------------------------+ |
public function assemblerLaRequete() { |
$requete = ' SELECT '.$this->champs_recherches.' FROM '.$this->table.' ' |
.$this->retournerRequeteCondition(); |
return $requete; |
} |
public function retournerRequeteCondition() { |
$condition = ''; |
if (empty($this->requete_condition) == false) { |
$condition = ' WHERE '.implode(' AND ', $this->requete_condition); |
} |
return $condition; |
} |
} |
?> |